Hello!

To see the file structure, click on "tree".

Note that updates take place every 10 minutes, commits may not be seen immediately.
projects / associations / .git / commitdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | patch | inline | side by side (parent: d865b62)
removed duplicated lines from GO_ontology_IMP_gene_O.sativa.assoc
authormeiera <meiera@localhost>
Fri, 11 Sep 2015 23:56:55 +0000 (23:56 +0000)
committermeiera <meiera@localhost>
Fri, 11 Sep 2015 23:56:55 +0000 (23:56 +0000)
svn path=/; revision=541

go-associations/Test_PPPP_GO/GO_ontology_IMP_gene_O.sativa.assoc patch | blob | history

diff --git a/go-associations/Test_PPPP_GO/GO_ontology_IMP_gene_O.sativa.assoc b/go-associations/Test_PPPP_GO/GO_ontology_IMP_gene_O.sativa.assoc
index 8ac66cbf518b3e3bd5b8308577db0d52bf58ab13..e248a4b136025113daaa22c3a77f0350f611462b 100644 (file)
--- a/go-associations/Test_PPPP_GO/GO_ontology_IMP_gene_O.sativa.assoc
+++ b/go-associations/Test_PPPP_GO/GO_ontology_IMP_gene_O.sativa.assoc
@@ -1,69 +1,65 @@
 DB     DB-Object_ID    DB_Object_Symbol        GO term (Qualifier)     GO ID   PMID    Evidence        with/from       Aspect  DB_Object_Name  Synonym DB_Object_Type  Taxon   Date    Assigned_by     Annotation_Extension    Gene Product Form ID\r
-GR_gene        800010  AID1    vegetative to reproductive phase transition of meristem GO:0010228      PMID:15247409   IMP             BP      Os06g0181300    ANTHER INDEHISCENCE 1   Gene    taxon:4530      20150403        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        60058   APO1    inflorescence phyllotactic patterning   GO:0090643      PMID:15950602   IMP             BP      Os06g0665400    Aberrant Panicle Organization   Gene    taxon:4530      20150403        Ethan Johnson           \r
+GR_gene                DSG1    growth  GO:0040007              IMP             BP      Os09g0434200    Delayed Seed Germination        Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
+GR_gene                DSG1    seed germination        GO:0009845              IMP             BP      Os09g0434200    Delayed Seed Germination        Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
+GR_gene                HD3A    vegetative to reproductive phase transition of meristem GO:0010228      PMID: 26096631  IMP             BP      Os06g0157700    Heading Date    Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
+GR_gene                PLA1    inflorescence development       GO:0010229      PMID: 25243048  IMP             BP      Os10g0403001    PLASTOCHRON 1   Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
+GR_gene                PLA1    leaf morphogenesis      GO:0009965      PMID: 25243048  IMP             BP      Os10g0403000    PLASTOCHRON 1   Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
+GR_gene                PSD     growth  GO:0040007      PMID: 18850055  IMP             BP      Os07g0613300    Paused  Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
+GR_gene                SCR     cell division   GO:0051301      PMID: 26023934  IMP             BP      Os12g0122000    SCARECROW GENE  Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
+GR_gene                SDR4    seed dormancy process   GO:0010162      PMID: 26205956  IMP             BP      Os07g0585700    SEED DORMANCY 4 Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
+GR_gene                SDR4    seed germination        GO:0009845      PMID: 26205956  IMP             BP      Os07g0585700    SEED DORMANCY 4 Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
+GR_gene                VP1     embryo development      GO:0009790      PMID: 21679193  IMP             BP      Os01g0911700    VIVIPAROUS 1    Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
+GR_gene                WAF1    embryo development      GO:0009790      PMID: 20805329  IMP             BP      Os07g0164000    Wavy Leaf       Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        100117  RCN1    inflorescence morphogenesis     GO:0048281      PMID:12148532   IMP             BP      Os11g0152500    RICE TERMINAL FLOWER 1/CENTRORADIALIS HOMOLOG 1 Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        100118  RCN2    inflorescence morphogenesis     GO:0048281      PMID:12148532   IMP             BP      Os02g0531600    RICE TERMINAL FLOWER 1/CENTRORADIALIS HOMOLOG 2 Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        100119  PAIR1   chromosome      GO:0005694      PMID:15031413   IMP             CC      Os03g0106300    HOMOLOGOUS PAIRING ABERRATION IN RICE MEIOSIS 1 Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        100119  PAIR1   sporulation resulting in formation of a cellular spore  GO:0030435      PMID:15031413   IMP             BP      Os03g0106300    HOMOLOGOUS PAIRING ABERRATION IN RICE MEIOSIS 1 Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        100119  PAIR1   synapsis        GO:0007129      PMID:15031413   IMP             BP      Os03g0106300    HOMOLOGOUS PAIRING ABERRATION IN RICE MEIOSIS 1 Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        100120  PAIR2   synapsis        GO:0007129      PMID:14758540   IMP             BP      Os09g0506800    Homologous Pairing Aberration in Rice Meiosis   Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        101186  ZEP1    seed germination        GO:0009845      PMID:11244106   IMP             BP      Os04g0448900    Zeaxanthin Epoxidase    Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson   has participant [CHEBI:2365]    
+GR_gene        101251  DCL1    chromosome      GO:0005694      PMID:16126864   IMP             CC      Os03g0121901    DICER-LIKE 1    Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        101251  DCL1    miRNA binding   GO:0035198      PMID:16126864   IMP             MF      Os03g0121901    DICER-LIKE 1    Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        101251  DCL1    root development        GO:0048364      PMID:16126864   IMP             BP      Os03g0121901    DICER-LIKE 1    Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        101253  Log     cytokinin biosynthetic process  GO:0009691      PMID:17287810   IMP             BP      Os01g0588900    Lonely Guy      Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        101253  Log     inflorescence morphogenesis     GO:0048281      PMID:17287810   IMP             BP      Os01g0588900    Lonely Guy      Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        101258  TatC    transpiration   GO:0010148      PMID:11244106   IMP             BP      Os01g0501700    Sec-independent protein translocase subunit C   Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        20145   TDR     stamen development      GO:0048443      PMID:16896230   IMP             BP      Os02g0120500    Tapetum Degeneration Retardation        Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
 GR_gene        60058   APO1    flower morphogenesis    GO:0048439      PMID:15950602   IMP             BP      Os06g0665400    Aberrant Panicle Organization   Gene    taxon:4530      20150403        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        60058   APO1    inflorescence phyllotactic patterning   GO:0090643      PMID:15950602   IMP             BP      Os06g0665400    Aberrant Panicle Organization   Gene    taxon:4530      20150403        Ethan Johnson           \r
 GR_gene        60068   BC1     cell wall       GO:0005618      PMID:12953108   IMP             CC      Os03g0416200    BRITTLE CULM 1  Gene    taxon:4530      20150403        Ethan Johnson           \r
 GR_gene        60070   BC3     inflorescence development       GO:0010229      GR_gene:5651    IMP             BP      Os02g0738900    BRITTLE CULM 3  Gene    taxon:4530      20150403        Ethan Johnson           \r
 GR_gene        60070   BC3     inflorescence development       GO:0010229      GR_gene:5651    IMP             BP      Os02g0738900    BRITTLE CULM 3  Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        80030   CPT1    phototropism    GO:0009638      PMID:15598797   IMP             BP      Os02g0568200    Coleoptile Phototropism Gene    taxon:4530      20150403        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        80030   CPT1    phototropism    GO:0009638      PMID:15598797   IMP             BP      Os02g0568200    Coleoptile Phototropism Gene    taxon:4530      20150403        Ethan Johnson   occurs_in [PO:0025025]  \r
 GR_gene        60213   D35     gibberellin biosynthetic process        GO:0009686      PMID:15075394   IMP             BP      Os06g0569500    DWARF TANGINBOZU        Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        101251  DCL1    root development        GO:0048364      PMID:16126864   IMP             BP      Os03g0121901    DICER-LIKE 1    Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        101251  DCL1    chromosome      GO:0005694      PMID:16126864   IMP             CC      Os03g0121901    DICER-LIKE 1    Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        101251  DCL1    miRNA binding   GO:0035198      PMID:16126864   IMP             MF      Os03g0121901    DICER-LIKE 1    Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
 GR_gene        60233   DL      biosynthetic process    GO:0009058      PMID:14729915   IMP             BP      Os03g0215200    Drooping Leaf   Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
 GR_gene        60233   DL      carpel development      GO:0048440      PMID:14729915   IMP             BP      Os03g0215200    Drooping Leaf   Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        80029   DOS     leaf senescence GO:0010150      PMID:16778011   IMP             BP      Os01g0192000    delay of the onset of senescence        Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene                DSG1    seed germination        GO:0009845              IMP             BP      Os09g0434200    Delayed Seed Germination        Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene                DSG1    growth  GO:0040007              IMP             BP      Os09g0434200    Delayed Seed Germination        Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        80017   DWARF   leaf development        GO:0048366      PMID:12445121   IMP             BP      Os03g0602300    BRASSINOSTEROID-DEFICIENT DWARF 1       Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
 GR_gene        60339   FZP     flower development      GO:0009908      PMID:12835399   IMP             BP      Os07g0669500    FRIZZY PANICLE  Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        80062   GIF1    fruit development       GO:0010154      PMID:18820698   IMP             BP      Os04g0413500    Grain Incomplete Filling        Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        80062   GIF1    starch grain    GO:0043036      PMID:18820698   IMP             CC      Os04g0413500    Grain Incomplete Filling        Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene                HD3A    vegetative to reproductive phase transition of meristem GO:0010228      PMID: 26096631  IMP             BP      Os06g0157700    Heading Date    Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        101253  Log     inflorescence morphogenesis     GO:0048281      PMID:17287810   IMP             BP      Os01g0588900    Lonely Guy      Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        101253  Log     cytokinin biosynthetic process  GO:0009691      PMID:17287810   IMP             BP      Os01g0588900    Lonely Guy      Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        80009   LSI1    transmembrane transport GO:0055085      PMID:16572174   IMP             BP      Os02g0745100    LOW SILICON RICE 1      Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        80037   LSI2    growth  GO:0040007      PMID:17625566   IMP             BP      Os03g0107300    LOW SILICON RICE 2      Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        80041   MADS13  carpel formation        GO:0048462      PMID:10528264   IMP             BP      Os12g0207000    MADS Box Gene   Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        80041   MADS13  indeterminate inflorescence morphogenesis       GO:0048283      PMID:10528264   IMP             BP      Os12g0207000    MADS Box Gene   Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        80025   MADS18  vegetative to reproductive phase transition of meristem GO:0010228      PMID:15299121   IMP             BP      Os07g0605200    MADS BOX GENE 18        Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        80021   MADS22  flower morphogenesis    GO:0048439      PMID:15682279   IMP             BP      Os02g0761000    MADS BOX GENE 22        Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        80042   MEL1    chromosome condensation GO:0030261      PMID:17675402   IMP             BP      Os03g0800200    MEIOSIS ARRESTED AT LEPTOTENE 1 Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        80008   MOC1    biosynthetic process    GO:0009058      PMID:12687001   IMP             BP      Os06g0610300    Monoculm        Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        61178   MSP1    microsporocyte differentiation  GO:0010480      PMID:12897248   IMP             BP      Os01g0917500    MULTIPLE SPOROCYTE 1    Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        100119  PAIR1   chromosome      GO:0005694      PMID:15031413   IMP             CC      Os03g0106300    HOMOLOGOUS PAIRING ABERRATION IN RICE MEIOSIS 1 Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        100119  PAIR1   chromosome      GO:0005694      PMID:15031413   IMP             CC      Os03g0106300    HOMOLOGOUS PAIRING ABERRATION IN RICE MEIOSIS 1 Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson   part_of [GO:0005730]    \r
-GR_gene        100119  PAIR1   chromosome      GO:0005694      PMID:15031413   IMP             CC      Os03g0106300    HOMOLOGOUS PAIRING ABERRATION IN RICE MEIOSIS 1 Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson   part_of [GO:0005730]    \r
-GR_gene        100119  PAIR1   synapsis        GO:0007129      PMID:15031413   IMP             BP      Os03g0106300    HOMOLOGOUS PAIRING ABERRATION IN RICE MEIOSIS 1 Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        100119  PAIR1   sporulation resulting in formation of a cellular spore  GO:0030435      PMID:15031413   IMP             BP      Os03g0106300    HOMOLOGOUS PAIRING ABERRATION IN RICE MEIOSIS 1 Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        100120  PAIR2   synapsis        GO:0007129      PMID:14758540   IMP             BP      Os09g0506800    Homologous Pairing Aberration in Rice Meiosis   Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
-GR_gene                PLA1    leaf morphogenesis      GO:0009965      PMID: 25243048  IMP             BP      Os10g0403000    PLASTOCHRON 1   Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
-GR_gene                PLA1    inflorescence development       GO:0010229      PMID: 25243048  IMP             BP      Os10g0403001    PLASTOCHRON 1   Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        61182   PLA2    leaf formation  GO:0010338      PMID:16461585   IMP             BP      Os01g0907900    PLASTOCHRON2    Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        61182   PLA2    leaf development        GO:0048366      PMID:16461585   IMP             BP      Os01g0907900    PLASTOCHRON2    Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        61182   PLA2    shoot axis formation    GO:0010346      PMID:16461585   IMP             BP      Os01g0907900    PLASTOCHRON2    Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
-GR_gene                PSD     growth  GO:0040007      PMID: 18850055  IMP             BP      Os07g0613300    Paused  Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        100117  RCN1    inflorescence morphogenesis     GO:0048281      PMID:12148532   IMP             BP      Os11g0152500    RICE TERMINAL FLOWER 1/CENTRORADIALIS HOMOLOG 1 Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        100118  RCN2    inflorescence morphogenesis     GO:0048281      PMID:12148532   IMP             BP      Os02g0531600    RICE TERMINAL FLOWER 1/CENTRORADIALIS HOMOLOG 2 Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        80028   REH1    adventitious root development   GO:0048830      PMID:16085936   IMP             BP      Os02g0743400    rice EIR1-like  Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
-GR_gene                SCR     cell division   GO:0051301      PMID: 26023934  IMP             BP      Os12g0122000    SCARECROW GENE  Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
 GR_gene        60842   SD1     cell division   GO:0051301      PMID:11961544   IMP             BP      Os01g0883800    SEMIDWARF 1     Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson   occurs_in [PO:0020142]  \r
 GR_gene        60842   SD1     gibberellin 20-oxidase activity GO:0045544      PMID:11961544   IMP             MF      Os01g0883800    SEMIDWARF 1     Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
-GR_gene                SDR4    seed dormancy process   GO:0010162      PMID: 26205956  IMP             BP      Os07g0585700    SEED DORMANCY 4 Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
-GR_gene                SDR4    seed germination        GO:0009845      PMID: 26205956  IMP             BP      Os07g0585700    SEED DORMANCY 4 Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
 GR_gene        60864   SE5     vegetative to reproductive phase transition of meristem GO:0010228      PMID:10849355   IMP             BP      Os06g0603000    Photosensitivity        Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
 GR_gene        60882   SHL4    root development        GO:0048364      PMID:10409508   IMP             BP      Os03g0449200    SHOOTLESS 4     Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        60883   SHO1    leaf development        GO:0048366      GR_gene:1477    IMP             BP      Os04g0509300    SHOOT ORGANIZATION 1    Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        60883   SHO1    leaf development        GO:0048366      GR_gene:1477    IMP             BP      Os04g0509300    SHOOT ORGANIZATION 1    Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
 GR_gene        60883   SHO1    cell division   GO:0051301      GR_gene:1477    IMP             BP      Os04g0509300    SHOOT ORGANIZATION 1    Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        80036   SNB     flower structural organization  GO:0048461      PMID:17144896   IMP             BP      Os07g0235800    SUPERNUMERARY BRACT GENE        Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        101258  TatC    transpiration   GO:0010148      PMID:11244106   IMP             BP      Os01g0501700    Sec-independent protein translocase subunit C   Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
-GR_gene        20145   TDR     stamen development      GO:0048443      PMID:16896230   IMP             BP      Os02g0120500    Tapetum Degeneration Retardation        Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        61178   MSP1    microsporocyte differentiation  GO:0010480      PMID:12897248   IMP             BP      Os01g0917500    MULTIPLE SPOROCYTE 1    Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        61182   PLA2    leaf development        GO:0048366      PMID:16461585   IMP             BP      Os01g0907900    PLASTOCHRON2    Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        61182   PLA2    leaf formation  GO:0010338      PMID:16461585   IMP             BP      Os01g0907900    PLASTOCHRON2    Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        61182   PLA2    shoot axis formation    GO:0010346      PMID:16461585   IMP             BP      Os01g0907900    PLASTOCHRON2    Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        800010  AID1    vegetative to reproductive phase transition of meristem GO:0010228      PMID:15247409   IMP             BP      Os06g0181300    ANTHER INDEHISCENCE 1   Gene    taxon:4530      20150403        Ethan Johnson           \r
 GR_gene        80007   UDT1    anther wall tapetum morphogenesis       GO:0048655      PMID:16141453   IMP             BP      Os07g0549600    UNDEVELOPED TAPETUM 1   Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
-GR_gene                VP1     embryo development      GO:0009790      PMID: 21679193  IMP             BP      Os01g0911700    VIVIPAROUS 1    Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
-GR_gene                WAF1    embryo development      GO:0009790      PMID: 20805329  IMP             BP      Os07g0164000    Wavy Leaf       Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        80008   MOC1    biosynthetic process    GO:0009058      PMID:12687001   IMP             BP      Os06g0610300    Monoculm        Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        80009   LSI1    transmembrane transport GO:0055085      PMID:16572174   IMP             BP      Os02g0745100    LOW SILICON RICE 1      Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        80017   DWARF   leaf development        GO:0048366      PMID:12445121   IMP             BP      Os03g0602300    BRASSINOSTEROID-DEFICIENT DWARF 1       Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        80021   MADS22  flower morphogenesis    GO:0048439      PMID:15682279   IMP             BP      Os02g0761000    MADS BOX GENE 22        Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
 GR_gene        80022   WDA1    long-chain fatty acid biosynthetic process      GO:0042759      PMID:17138699   IMP             BP      Os10g0471100    WAX-DEFICIENT ANTHER 1  Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson   occurs_in [PO:0009066]  \r
 GR_gene        80022   WDA1    microsporogenesis       GO:0009556      PMID:17138699   IMP             BP      Os10g0471100    WAX-DEFICIENT ANTHER 1  Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
 GR_gene        80022   WDA1    pollen exine formation  GO:0010584      PMID:17138699   IMP             BP      Os10g0471100    WAX-DEFICIENT ANTHER 1  Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson   occurs_in [PO:0009066]  \r
-GR_gene        101186  ZEP1    seed germination        GO:0009845      PMID:11244106   IMP             BP      Os04g0448900    Zeaxanthin Epoxidase    Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson   has participant [CHEBI:2365]    
\ No newline at end of file
+GR_gene        80025   MADS18  vegetative to reproductive phase transition of meristem GO:0010228      PMID:15299121   IMP             BP      Os07g0605200    MADS BOX GENE 18        Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        80028   REH1    adventitious root development   GO:0048830      PMID:16085936   IMP             BP      Os02g0743400    rice EIR1-like  Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        80029   DOS     leaf senescence GO:0010150      PMID:16778011   IMP             BP      Os01g0192000    delay of the onset of senescence        Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        80030   CPT1    phototropism    GO:0009638      PMID:15598797   IMP             BP      Os02g0568200    Coleoptile Phototropism Gene    taxon:4530      20150403        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        80030   CPT1    phototropism    GO:0009638      PMID:15598797   IMP             BP      Os02g0568200    Coleoptile Phototropism Gene    taxon:4530      20150403        Ethan Johnson   occurs_in [PO:0025025]  \r
+GR_gene        80036   SNB     flower structural organization  GO:0048461      PMID:17144896   IMP             BP      Os07g0235800    SUPERNUMERARY BRACT GENE        Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        80037   LSI2    growth  GO:0040007      PMID:17625566   IMP             BP      Os03g0107300    LOW SILICON RICE 2      Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        80041   MADS13  carpel formation        GO:0048462      PMID:10528264   IMP             BP      Os12g0207000    MADS Box Gene   Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        80041   MADS13  indeterminate inflorescence morphogenesis       GO:0048283      PMID:10528264   IMP             BP      Os12g0207000    MADS Box Gene   Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        80042   MEL1    chromosome condensation GO:0030261      PMID:17675402   IMP             BP      Os03g0800200    MEIOSIS ARRESTED AT LEPTOTENE 1 Gene    taxon:4530      20150410        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        80062   GIF1    fruit development       GO:0010154      PMID:18820698   IMP             BP      Os04g0413500    Grain Incomplete Filling        Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
+GR_gene        80062   GIF1    starch grain    GO:0043036      PMID:18820698   IMP             CC      Os04g0413500    Grain Incomplete Filling        Gene    taxon:4530      20150406        Ethan Johnson           \r
Planteome associations