Hello!

To see the file structure, click on "tree".

Note that updates take place every 10 minutes, commits may not be seen immediately.
Removed cluster 3 annotations
authorcooperl <cooperl@localhost>
Thu, 17 Oct 2024 18:42:42 +0000 (18:42 +0000)
committercooperl <cooperl@localhost>
Thu, 17 Oct 2024 18:42:42 +0000 (18:42 +0000)
svn path=/; revision=1092

po-associations/po_gene_Oryza_Zhang_2021.assoc

index 4e5fff04ea8dd431416bf6522db959f99c2e6943..e42fa8283c914446e847ce4a68f57695e947ba01 100644 (file)
@@ -840,81 +840,3 @@ RAP-DB     Os01g0714600    Os01g0714600            PO:0000349      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP
 RAP-DB Os06g0585900    Os06g0585900            PO:0000349      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Similar to cDNA clone:002-174-F06, full insert sequence         gene    NCBITaxon:39947 20240923        PO:cooperl              
 RAP-DB Os06g0236266    Os06g0236266            PO:0000349      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Conserved hypothetical protein          gene    NCBITaxon:39947 20240923        PO:cooperl              
 RAP-DB Os01g0615100    OsCPI2          PO:0000349      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       chymotrypsin protease inhibitor 2               gene    NCBITaxon:39947 20240923        PO:cooperl              
-RAP-DB Os07g0174900    OsLTPg16                PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       type G non-specific lipid transfer protein 16   OsLTPG16        gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os03g0115700    Os03g0115700            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os04g0125700    Os04g0125700            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Concanavalin A-like lectin/glucanase domain containing protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os05g0153300    Os05g0153300            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Lipase, class 3 domain containing protein               gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os09g0518750    Os09g0518750            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Conserved hypothetical protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os02g0131400    Os02g0131400            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       beta-glucosidase                gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os04g0452700    OsMST1          PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Monosaccharide transporter 1            gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os03g0641200    OsCAT3          PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       cationic amino acid transporter 4               gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os06g0283100    UGT             PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       UDP-glycosyltransferase         gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os07g0503300    OsUGT707A5              PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       UDP-dependent glycosyltransferase 707A5         gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os03g0571900    OsPEZ1          PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       phenolics efflux zero 1         gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os06g0495500    Os06g0495500            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Multi antimicrobial extrusion protein MatE family protein               gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os07g0575900    Os07g0575900            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       DUF946 plant family protein             gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os04g0494800    Os04g0494800            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       DUF642 family protein           gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os03g0771100    OsMYB36c                PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       MYB transcription factor 36c            gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os02g0114800    Os2R_MYB21              PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       R2R3-MYB Transcription Factor 21                gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os03g0570800    OsMATE12                PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       multidrug and toxic compound extrusion 12               gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os04g0115500    OsTIF1          PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       TAA1 transcriptional inhibition factor 1                gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os06g0543200    OsDLN168                PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       DLN motif protein 168           gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os07g0675100    OsPME22         PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       pectin methylesterase 22                gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os12g0514000    OsPLT15         PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       monosaccharide transporter PLT15                gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os01g0857400    OsGAT3          PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       gamma-aminobutyric acid transporter 3           gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os12g0245100    OsKIX_11                PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       KIX domain protein 11           gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os07g0557200    OsENT3          PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       equilibrative nucleoside transporter 3          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os10g0200700    Os10g0200700            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Conserved hypothetical protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os03g0849900    Os03g0849900            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Nucleotide-diphospho-sugar transferase domain containing protein                gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os06g0474500    Os06g0474500            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       DUF239 plant domain containing protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os09g0353700    OsLDOX7         PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       leucoanthocyanidin dioxygenase 7                gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os01g0917900    OsRING170               PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       RING-type E3 ubiquitin ligase 170               gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os02g0331400    Os02g0331400            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Similar to nodulin-like protein         gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os01g0551800    Os01g0551800            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Similar to protein ABIL1                gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os11g0462100    Os11g0462100            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Glycoside hydrolase, family 18 protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os12g0149000    Os12g0149000            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       DUF868 plant domain containing protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os08g0163500    Os08g0163500            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       DUF1005 family protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os06g0158800    OsSTA169                PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       DUF1191 family protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os05g0165500    Os05g0165500            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Conserved hypothetical protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os03g0375900    OsLAT4          PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Amino acid/polyamine transporter I family protein               gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os01g0385400    OsSLAC7         PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       SLOW ANION CHANNEL-ASSOCIATED 7         gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os12g0227400    Os12g0227400            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Allyl alcohol dehydrogenase             gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os04g0229100    OsCAD6          PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Cinnamyl alcohol dehydrogenase 6                gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os10g0320100    OsCYP75B3               PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Cytochrome P450 75B3            gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os03g0253200    OsWAG           PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       WAVY ROOT GROWTH1               gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os03g0168000    Os03g0168000            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Major facilitator superfamily, general substrate transporter domain containing protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os06g0667100    OsHAP5B         PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       heme-associated protein 5B              gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os10g0361000    LOX             PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Lipoxygenase            gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os12g0577200    Os12g0577200            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Conserved hypothetical protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os08g0269700    Os08g0269700            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Conserved hypothetical protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os08g0285600    Os08g0285600            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Similar to phytosulfokine receptor              gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os12g0637700    Os12g0637700            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Nodulin-like domain containing protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os02g0206700    Os02g0206700            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase family protein         gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os01g0595600    OsD14L2b                PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Dwarf14-like2b          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os04g0399300    OsNUDX6         PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Nudix Hydrolase 6               gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os03g0197800    OsIDD1          PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       indeterminate domain 1          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os02g0801200    Os02g0801200            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Similar to Cyclin B             gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os02g0666700    Os02g0666700            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin family protein               gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os02g0752200    Os02g0752200            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Similar to Beta-D-xylosidase            gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os01g0710700    Os01g0710700            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Lipase, class 3 family protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os03g0724300    Os03g0724300            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       LRR-receptor-like kinase (LRR-RLK) family protein               gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os04g0685000    OsOFP17         PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       ovate family protein 17         gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os02g0744600    OsCslA6         PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       cellulose synthase like A6              gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os03g0369000    prx46           PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       class III peroxidase 46         gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os12g0512100    OsPLT14         PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A        monosaccharide transporter PLT14               gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os08g0501900    Os08g0501900            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Non-protein coding transcript           gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os08g0111200    Os08g0111200            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Beta-glucosidase                gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os01g0342900    Os01g0342900            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Similar to Adenosine monophosphate binding protein 1 AMPBP1             gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os02g0700300    OsDLN66         PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       DLN motif protein 66            gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os01g0347600    Os01g0347600            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Ervatamin B             gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os05g0256500    OsMRLK23                PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       MALECTIN/MALECTIN-LIKE RECEPTOR-LIKE KINASE 23          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os03g0318400    Os03g0318400            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Peptidase A1 domain containing protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os11g0484700    OsLTPd12                PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       type D non-specific lipid transfer protein 12           gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os01g0112600    Os01g0112600            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Conserved hypothetical protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os02g0609200    Os02g0609200            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Similar to Atozi1 (Fragment)            gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os08g0402001    Os08g0402001            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Hypothetical conserved gene             gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os09g0427125    Os09g0427125            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Hypothetical conserved gene             gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os01g0692100    OsGSTU39                PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       TAU GLUTATHIONE S-TRANSFERASE 39                gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os08g0540900    Os08g0540900            PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Conserved hypothetical protein          gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os10g0185400    OsPMEI33                PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       pectin methylesterase inhibitor 33              gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl              
-RAP-DB Os08g0277200    OsCCR18         PO:0005772      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Cinnamoyl-CoA reductase 18              gene    NCBITaxon:39947 20241007        PO:cooperl