Hello!

To see the file structure, click on "tree".

Note that updates take place every 10 minutes, commits may not be seen immediately.
projects / associations / .git / commitdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | patch | inline | side by side (parent: d76b2a8)
fixed a few minor typos in file
authorcooperl <cooperl@localhost>
Tue, 10 Jan 2017 00:12:22 +0000 (00:12 +0000)
committercooperl <cooperl@localhost>
Tue, 10 Jan 2017 00:12:22 +0000 (00:12 +0000)
svn path=/; revision=802

go-associations/go_gene_zea_MaizeGDB.assoc patch | blob | history

diff --git a/go-associations/go_gene_zea_MaizeGDB.assoc b/go-associations/go_gene_zea_MaizeGDB.assoc
index a6ab68e96c151452f4343c8c7c0458b701c156eb..25a1d83ef1e84e71b88a16fe94ada4c7e731ccdb 100644 (file)
--- a/go-associations/go_gene_zea_MaizeGDB.assoc
+++ b/go-associations/go_gene_zea_MaizeGDB.assoc
@@ -58,9 +58,9 @@ MaizeGDB      223331  les22           GO:0004853      PMID:9668130    IMP             F       lesion22        GRMZM2G044074   gen
 MaizeGDB       886554  caf1            GO:0005515      PMID:16379013   IGI     MaizeGDB:crs2   F       crs2 associated factor1 GRMZM2G089222   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       886551  caf2            GO:0005515      PMID:16379013   IGI     MaizeGDB:crs2   F       crs2 associated factor2 AC199526.5_FG003        gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       12225   fl2             GO:0005515      PMID:17693529   IPI     MaizeGDB:zp22   F       floury2 GRMZM2G397687   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
-MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0005515      PMID:24865494   IPI     MaizeGDB:rop3   F       receptor for activated Ckinase1 GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
-MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0005515      PMID:24865494   IPI     MaizeGDB:rrph1  F       receptor for activated Ckinase1 GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
-MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0005515      PMID:24865494   IPI     MaizeGDB:srph1  F       receptor for activated Ckinase1 GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
+MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0005515      PMID:24865494   IPI     MaizeGDB:rop3   F       receptor for activated C kinase1        GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
+MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0005515      PMID:24865494   IPI     MaizeGDB:rrph1  F       receptor for activated C kinase1        GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
+MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0005515      PMID:24865494   IPI     MaizeGDB:srph1  F       receptor for activated C kinase1        GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       9030976 snrkII8         GO:0005515      PMID:23469147   IGI     MaizeGDB:nactf49        F       SnRK2 serine threonine gene kinase8     GRMZM2G138861|ZmOST1    gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       292668  pho1            GO:0005515      PMID:25151633   IPI     MaizeGDB:ae1    F       starch phosphorylase1   GRMZM2G074158   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       292668  pho1            GO:0005515      PMID:25151633   IPI     MaizeGDB:sbe1   F       starch phosphorylase1   GRMZM2G074158|SP        gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
@@ -75,12 +75,12 @@ MaizeGDB    652094  hsp101          GO:0005634      PMID:12119379   IDA             C       heatshock gene 101      GRMZM
 MaizeGDB       2775843 nactf49         GO:0005634      PMID:23469147   IDA             C       NAC-transcription factor49      GRMZM2G347043|ZmSNAC1   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       2775843 nactf49         GO:0005634      PMID:22610487   IMP             C       NAC-transcription factor49      GRMZM2G347043|ZmSNAC1   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       12495   o2              GO:0005634      PMID:22937104   IDA             C       opaque endosperm2       GRMZM2G015534   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
-MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0005634      PMID:24865494   IDA             C       receptor for activated Ckinase1 GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
+MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0005634      PMID:24865494   IDA             C       receptor for activated C kinase1        GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       9030976 snrkII8         GO:0005634      PMID:23469147   IDA             C       SnRK2 serine threonine gene kinase8     GRMZM2G138861|ZmOST1    gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       1232893 why1            GO:0005634      PMID:23840682   IDA             C       whirly1 GRMZM2G155662   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       12218   et1             GO:0005667      PMID:15165185   IMP             C       etched1 GRMZM2G157574   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       2774267 ccamk1          GO:0005737      PMID:22865912   IDA             C       calcium/calmodul independent gene kinase1       GRMZM2G062772   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
-MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0005737      PMID:24865494   IDA             C       receptor for activated Ckinase1 GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
+MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0005737      PMID:24865494   IDA             C       receptor for activated C kinase1        GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       9023910 txln1           GO:0005737      PMID:22937104   IDA             C       taxilin1        GRMZM2G015730   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       960724  mcf1            GO:0005739      PMID:23590975   IDA             C       mitochondrial carrier family gene1      GRMZM2G161299|CoAc2     gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       910015  mcf2            GO:0005739      PMID:23590975   IDA             C       mitochrondrial carrier family gene2     GRMZM2G420119|CoAc1     gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
@@ -120,7 +120,7 @@ MaizeGDB    886598  pmpm5           GO:0005886      PMID:22348040   IDA             C       proteolipid membrane pote
 MaizeGDB       907426  pmpm6           GO:0005886      PMID:22348040   IDA             C       proteolipid membrane potential regulator6       GRMZM2G020091|pmp3-6    gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       1203425 pmpm7           GO:0005886      PMID:22348040   IDA             C       proteolipid membrane potential regulator7       GRMZM2G099984|pmp3-7    gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       9023808 pmpm8           GO:0005886      PMID:22348040   IDA             C       proteolipid membrane potential regulator8       GRMZM2G066870|pmp3-8    gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
-MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0005886      PMID:24865494   IDA             C       receptor for activated Ckinase1 GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
+MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0005886      PMID:24865494   IDA             C       receptor for activated C kinase1        GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       403765  sut1            GO:0005886      PMID:22611232   IDA             C       sucrose transporter1    GRMZM2G034302   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       9030971 pox1            GO:0005887      PMID:20032108   IDA             C       guaiacol peroxidase1    GRMZM2G104394   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       895629  pox2            GO:0005887      PMID:20032108   IDA             C       guaiacol peroxidase2    GRMZM2G040638   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
@@ -133,8 +133,8 @@ MaizeGDB    9017732 cf1             GO:0006783      PMID:19825655   IMP             P       camouflage1     GRMZM2G026117
 MaizeGDB       223331  les22           GO:0006783      PMID:9668130    IMP             P       lesion22        GRMZM2G044074   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       12782   ys1             GO:0006826      PMID:19549626   IMP             P       yellow stripe1  GRMZM2G156599   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       9012838 tha5            GO:0006886      PMID:20409008   IGI     MaizeGDB:ploc2  P       thylakoid assembly5     GRMZM2G300408   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
-MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0006968      PMID:24865494   IGI     MaizeGDB:prp1   P       receptor for activated Ckinase1 GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
-MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0006968      PMID:24865494   IGI     MaizeGDB:prp5   P       receptor for activated Ckinase1 GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
+MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0006968      PMID:24865494   IGI     MaizeGDB:prp1   P       receptor for activated C kinase1        GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
+MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0006968      PMID:24865494   IGI     MaizeGDB:prp5   P       receptor for activated C kinase1        GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       12041   am1             GO:0007126      PMID:19204280   IDA             P       ameiotic1       GRMZM5G883855   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       12029   afd1            GO:0007127      PMID:16868028   IGI     MaizeGDB:rad51a|rad51b  P       absence of first division1      GRMZM2G059037|rec8      gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       12029   afd1            GO:0007127      PMID:16868028   IMP     MaizeGDB:rad51a|rad51b  P       absence of first division1      GRMZM2G059037|rec8      gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
@@ -213,7 +213,7 @@ MaizeGDB    12327   hm1             GO:0009620      PMID:12297630   IMP             P       Helminthosporium carbonum su
 MaizeGDB       12328   hm2             GO:0009620      PMID:9465077    IGI     MaizeGDB:hm1    P       Helminthosporium carbonum susceptibility2       GRMZM2G086773   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       2775815 nactf23         GO:0009620      PMID:23718541   IEP             P       NAC-transcription factor23      GRMZM2G068973|ZmNAC100  gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       2775867 nactf70         GO:0009620      PMID:23718541   IEP             P       NAC-transcription factor70      GRMZM2G312201|ZmNAC41   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
-MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0009620      PMID:24865494   IMP             P       receptor for activated Ckinase1 GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
+MaizeGDB       9031102 rack1           GO:0009620      PMID:24865494   IMP             P       receptor for activated C kinase1        GRMZM2G038032   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       415596  gst27           GO:0009635      PMID:22792398   IEP             P       glutathione transferase27       GRMZM2G077206   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       415596  gst27           GO:0009635      PMID:23144728   IEP             P       glutathione transferase27       GRMZM2G077206   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       2774270 gsht1           GO:0009635      PMID:22792398   IEP             P       glutathione transporter1        GRMZM2G421491   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
@@ -454,7 +454,7 @@ MaizeGDB    953725  bx6             GO:0051213      PMID:18192444   IDA             F       benzoxazinone synthesis6                g
 MaizeGDB       12102   c2              GO:0051555      PMID:11607312   IMP             P       colorless2      GRMZM2G422750   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       12750   whp1            GO:0051555      PMID:11607312   IMP             P       white pollen1   GRMZM2G151227   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       12558   pr1             GO:0051559      PMID:23113982   IMP             P       red aleurone1   GRMZM2G025832   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
-MaizeGDB       955007  gpm46           GO:0051775      PMID:17562699   IDA             P               GRMZM2G174738|ZmBt1-2   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
+MaizeGDB       955007  gpm46           GO:0051775      PMID:17562699   IDA             P       gpm46   GRMZM2G174738|ZmBt1-2   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       12091   bt1             GO:0051775      PMID:17562699   IDA             P       brittle endosperm1      GRMZM2G144081   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       9023910 txln1           GO:0060341      PMID:22937104   IPI     MaizeGDB:o2     P       taxilin1        GRMZM2G015730   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
 MaizeGDB       111820  abph1           GO:0060772      PMID:19321707   IMP             P       aberrant phyllotaxy1    GRMZM2G035688   gene    taxon:4577      20151010        MaizeGDB                
Planteome associations