Hello!

To see the file structure, click on "tree".

Note that updates take place every 10 minutes, commits may not be seen immediately.
Replace column 4 text with blank, wasn't supposed to have the ontology term there
authorelserj <elserj@localhost>
Fri, 26 Jan 2018 22:33:19 +0000 (22:33 +0000)
committerelserj <elserj@localhost>
Fri, 26 Jan 2018 22:33:19 +0000 (22:33 +0000)
svn path=/; revision=848

to-associations/to_gene_G.max_PPPP.assoc
to-associations/to_gene_M.truncatula_PPPP.assoc
to-associations/to_gene_O.sativa_PPPP.assoc
to-associations/to_gene_S.lycopersicum_PPPP.assoc
to-associations/to_gene_Z.mays_PPPP.assoc

index 67ed2d092d95fbfdb4c8dfc1634c8a67e4738f0c..7bfa630dfe205f7555247f394ec0f06c9af886d0 100644 (file)
@@ -1,51 +1,51 @@
-!gaf-version: 2.0
-!DB    DB_Object_ID     DB_Object_Symbol       Qualifier       TOid    DB:Reference     Evidence       With(or)From    Aspect  DB_Object_Name  DB_Object_Synonym        DB_Object_Type Taxon   Date    Assigned_by             
-SoyBase        Glyma01g36600   E2-1    flowering time trait    TO:0002616      PMID:25774204   IMP             T       Glyma01g36600   Early flowering gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma02g05450   Wp      flower color    TO:0000537      PMID:25774204   IMP             T       Glyma02g05450   Pink flowers    gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma02g05450   Wp      seed coat color TO:0000190      PMID:25774204   IMP             T       Glyma02g05450   Seed coat Grey  gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma02g39230   GmFAD3-2        oleic acid content      TO:0005002      PMID:25774204   IMP             T       Glyma02g39230   High seed oleic acid content    gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma03g32500   GmLPA1-1        seed phosphorus content TO:0002666      PMID:25774204   IMP             T       Glyma03g32500   low phytic acid concentration in seeds  gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma04g11010   GmCRY1  photoperiod-sensitive flowering time trait      TO:0000934      PMID:25774204   IMP             T       Glyma04g11010   Late flowering under short day  gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma04g11010   GmCRY1  blue light sensitivity  TO:0000159      PMID:25774204   IMP             T       Glyma04g11010   blue light insensitive  gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma05g27840   Eu1-1   enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma05g27840   Embryo urease activity  gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma06g18890.1 RS2     raffinose content       TO:0006004      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g18890.1 Seed raffinose concentration reduced    gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma06g18890.1 RS2     enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g18890.1 Seed raffinose synthase activity reduced        gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma06g18890.1 RS1-2   raffinose content       TO:0006004      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g18890.1 Seed raffinose concentration    gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma06g18890.1 RS1-2   enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g18890.1 Seed raffinose synthase activity reduced        gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma06g19820   AMDH2 BADH2     enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g19820   Seed amino aldehyde dehydrogenase activity reduced      gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma06g19820   AMDH2 BADH2     enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g19820   Seed 2-acetyl-1-pyroline conc. Increased        gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma06g21920   T       trichome morphology trait       TO:0000911      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g21920   Gray pubescence gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma06g21920   T       hilum color     TO:0000968      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g21920   tan hilum       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma06g23026   E1-1    photoperiod-sensitive flowering time trait      TO:0000934      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g23026   Early flowering under long days gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma06g23026   E1-1    photoperiod-sensitive flowering time trait      TO:0000934      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g23026   Photoperiod insensitivity       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma08g06630   ANR1    enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma08g06630   Anthocyanin Reductase activitiy reduced gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma08g06630   ANR1    anthocyanin content     TO:0000071Ê     PMID:25774204   IMP             T       Glyma08g06630   Epicatechin conc. Increased     gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma08g08970   Eu3-1   enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma08g08970   whole plant urease activity     gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-!SoyBase       Glyma09g36983           hilum color     TO:0000968      PMID:25774204   IMP             T       Glyma09g36983   Brown hilum     gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma09g36983   Glyma09g3698    seed coat color TO:0000190      PMID:25774204   IMP             T       Glyma09g36983   Brown seed coat color   gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma10g42470   GmFAD2-1        oleic acid content      TO:0005002      PMID:25774204   IMP             T       Glyma10g42470   High seed oleic acid content    gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma11g27480   GmAS1-A enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma11g27480   High asparagine synthase activity in seed coats gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma11g27480   GmAS1-A endosperm storage protein content       TO:0002653      PMID:25774204   IMP             T       Glyma11g27480   High seed protein content       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma11g37250   EU4-1   enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma11g37250   Urease activity gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma14g04380   Eu2-1   enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma14g04380   whole plant urease activity     gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma14g09510   GmASPGB1-A      enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma14g09510   High asparaginase activity in seed coats        gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma14g09510   GmASPGB1-1      endosperm storage protein content       TO:0002653      PMID:25774204   IMP             T       Glyma14g09510   high seed protein content       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma14g27990   GmFAB2-3        stearic acid content    TO:0005003      PMID:25774204   IMP             T       Glyma14g27990   High seed stearic acid content  gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma14g37350   GmFAD3-1        oleic acid content      TO:0005002      PMID:25774204   IMP             T       Glyma14g37350   High seed oleic acid content    gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma16g01980   GmLHY1  seedling hypocotyl length       TO:0006065      PMID:25774204   IMP             T       Glyma16g01980   increased hypocotyl length      gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma16g01980   GmLHY1  photoperiod sensitivity trait   TO:0000229      PMID:25774204   IMP             T       Glyma16g01980   Abnormal circadian rythmn       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma16g01980   GmLHY1  photoperiod-sensitive flowering time trait      TO:0000934      PMID:25774204   IMP             T       Glyma16g01980   Delayed flowering under short-day regimen       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma16g04830   GmFT5-A photoperiod-sensitive flowering time trait      TO:0000934      PMID:25774204   IMP             T       Glyma16g04830   Photoperiod insensitivity       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma16g04830   GmFT5-A flowering time trait    TO:0002616      PMID:25774204   IMP             T       Glyma16g04830   Early flowering gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma16g26660   GmFT2-A photoperiod-sensitive flowering time trait      TO:0000934      PMID:25774204   IMP             T       Glyma16g26660   Photoperiod insensitivity       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma16g26660   GmFT2-A flowering time trait    TO:0002616      PMID:25774204   IMP             T       Glyma16g26660   Early flowering gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma18g02210   MIPS1   seedling growth and development trait   TO:0000949      PMID:25774204   IMP             T       Glyma18g02210   emergence reduced       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma18g06950   GmFAD3-3        oleic acid content      TO:0005002      PMID:25774204   IMP             T       Glyma18g06950   High seed oleic acid content    gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma19g35230   GmLPA1-2        seed phosphorus content TO:0002666      PMID:25774204   IMP             T       Glyma19g35230   low phytic acid concentration in seeds  gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma19g41210   E3-1    flowering time trait    TO:0002616      PMID:25774204   IMP             T       Glyma19g41210   Early flowering gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma19g41210   E3-1    far red light sensitivity       TO:0000130      PMID:25774204   IMP             T       Glyma19g41210   Reduced far-red photo-reception gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma20g22160   PhyA2   photoperiod-sensitive flowering time trait      TO:0000934      PMID:25774204   IMP             T       Glyma20g22160   Photoperiod insensitivity       gene    taxon:3847      20150720        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma20g22160   PhyA2   photoperiod-sensitive flowering time trait      TO:0000934      PMID:25774204   IMP             T       Glyma20g22160   Late flowering in short day     gene    taxon:3847      20150720        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma20g24530   GmFAD2-2        oleic acid content      TO:0005002      PMID:25774204   IMP             T       Glyma20g24530   High seed oleic acid content    gene    taxon:3847      20150720        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma20g25000   Ln      vascular leaf anatomy and morphology trait      TO:0000419      PMID:25774204   IMP             T       Glyma20g25000   narrow leaflet  gene    taxon:3847      20150720        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
-SoyBase        Glyma20g25000   Ln      seed number     TO:0000445      PMID:25774204   IMP             T       Glyma20g25000   Increased number of seeds per plant     gene    taxon:3847      20150720        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+!gaf-version: 2.0                      
+!DB    DB_Object_ID     DB_Object_Symbol               TOid    DB:Reference     Evidence       With(or)From    Aspect  DB_Object_Name  DB_Object_Synonym        DB_Object_Type Taxon   Date    Assigned_by             
+SoyBase        Glyma01g36600   E2-1            TO:0002616      PMID:25774204   IMP             T       Glyma01g36600   Early flowering gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma02g05450   Wp              TO:0000537      PMID:25774204   IMP             T       Glyma02g05450   Pink flowers    gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma02g05450   Wp              TO:0000190      PMID:25774204   IMP             T       Glyma02g05450   Seed coat Grey  gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma02g39230   GmFAD3-2                TO:0005002      PMID:25774204   IMP             T       Glyma02g39230   High seed oleic acid content    gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma03g32500   GmLPA1-1                TO:0002666      PMID:25774204   IMP             T       Glyma03g32500   low phytic acid concentration in seeds  gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma04g11010   GmCRY1          TO:0000934      PMID:25774204   IMP             T       Glyma04g11010   Late flowering under short day  gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma04g11010   GmCRY1          TO:0000159      PMID:25774204   IMP             T       Glyma04g11010   blue light insensitive  gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma05g27840   Eu1-1           TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma05g27840   Embryo urease activity  gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma06g18890.1 RS2             TO:0006004      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g18890.1 Seed raffinose concentration reduced    gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma06g18890.1 RS2             TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g18890.1 Seed raffinose synthase activity reduced        gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma06g18890.1 RS1-2           TO:0006004      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g18890.1 Seed raffinose concentration    gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma06g18890.1 RS1-2           TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g18890.1 Seed raffinose synthase activity reduced        gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma06g19820   AMDH2 BADH2             TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g19820   Seed amino aldehyde dehydrogenase activity reduced      gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma06g19820   AMDH2 BADH2             TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g19820   Seed 2-acetyl-1-pyroline conc. Increased        gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma06g21920   T               TO:0000911      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g21920   Gray pubescence gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma06g21920   T               TO:0000968      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g21920   tan hilum       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma06g23026   E1-1            TO:0000934      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g23026   Early flowering under long days gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma06g23026   E1-1            TO:0000934      PMID:25774204   IMP             T       Glyma06g23026   Photoperiod insensitivity       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma08g06630   ANR1            TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma08g06630   Anthocyanin Reductase activitiy reduced gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma08g06630   ANR1            TO:0000071Ê     PMID:25774204   IMP             T       Glyma08g06630   Epicatechin conc. Increased     gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma08g08970   Eu3-1           TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma08g08970   whole plant urease activity     gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+!SoyBase       Glyma09g36983                   TO:0000968      PMID:25774204   IMP             T       Glyma09g36983   Brown hilum     gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma09g36983   Glyma09g3698            TO:0000190      PMID:25774204   IMP             T       Glyma09g36983   Brown seed coat color   gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma10g42470   GmFAD2-1                TO:0005002      PMID:25774204   IMP             T       Glyma10g42470   High seed oleic acid content    gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma11g27480   GmAS1-A         TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma11g27480   High asparagine synthase activity in seed coats gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma11g27480   GmAS1-A         TO:0002653      PMID:25774204   IMP             T       Glyma11g27480   High seed protein content       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma11g37250   EU4-1           TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma11g37250   Urease activity gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma14g04380   Eu2-1           TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma14g04380   whole plant urease activity     gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma14g09510   GmASPGB1-A              TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Glyma14g09510   High asparaginase activity in seed coats        gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma14g09510   GmASPGB1-1              TO:0002653      PMID:25774204   IMP             T       Glyma14g09510   high seed protein content       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma14g27990   GmFAB2-3                TO:0005003      PMID:25774204   IMP             T       Glyma14g27990   High seed stearic acid content  gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma14g37350   GmFAD3-1                TO:0005002      PMID:25774204   IMP             T       Glyma14g37350   High seed oleic acid content    gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma16g01980   GmLHY1          TO:0006065      PMID:25774204   IMP             T       Glyma16g01980   increased hypocotyl length      gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma16g01980   GmLHY1          TO:0000229      PMID:25774204   IMP             T       Glyma16g01980   Abnormal circadian rythmn       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma16g01980   GmLHY1          TO:0000934      PMID:25774204   IMP             T       Glyma16g01980   Delayed flowering under short-day regimen       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma16g04830   GmFT5-A         TO:0000934      PMID:25774204   IMP             T       Glyma16g04830   Photoperiod insensitivity       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma16g04830   GmFT5-A         TO:0002616      PMID:25774204   IMP             T       Glyma16g04830   Early flowering gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma16g26660   GmFT2-A         TO:0000934      PMID:25774204   IMP             T       Glyma16g26660   Photoperiod insensitivity       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma16g26660   GmFT2-A         TO:0002616      PMID:25774204   IMP             T       Glyma16g26660   Early flowering gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma18g02210   MIPS1           TO:0000949      PMID:25774204   IMP             T       Glyma18g02210   emergence reduced       gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma18g06950   GmFAD3-3                TO:0005002      PMID:25774204   IMP             T       Glyma18g06950   High seed oleic acid content    gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma19g35230   GmLPA1-2                TO:0002666      PMID:25774204   IMP             T       Glyma19g35230   low phytic acid concentration in seeds  gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma19g41210   E3-1            TO:0002616      PMID:25774204   IMP             T       Glyma19g41210   Early flowering gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma19g41210   E3-1            TO:0000130      PMID:25774204   IMP             T       Glyma19g41210   Reduced far-red photo-reception gene    taxon:3847      20150717        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma20g22160   PhyA2           TO:0000934      PMID:25774204   IMP             T       Glyma20g22160   Photoperiod insensitivity       gene    taxon:3847      20150720        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma20g22160   PhyA2           TO:0000934      PMID:25774204   IMP             T       Glyma20g22160   Late flowering in short day     gene    taxon:3847      20150720        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma20g24530   GmFAD2-2                TO:0005002      PMID:25774204   IMP             T       Glyma20g24530   High seed oleic acid content    gene    taxon:3847      20150720        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma20g25000   Ln              TO:0000419      PMID:25774204   IMP             T       Glyma20g25000   narrow leaflet  gene    taxon:3847      20150720        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
+SoyBase        Glyma20g25000   Ln              TO:0000445      PMID:25774204   IMP             T       Glyma20g25000   Increased number of seeds per plant     gene    taxon:3847      20150720        Planteome:Laurel_Cooper|Planteome:Ethan_Johnson         
index 0b321ec8050e793bddbc09853f11664c6d4d8b75..ec45be899f70a6903f378a092a89e25a9ecc9634 100644 (file)
@@ -1,9 +1,9 @@
-!gaf-version: 2.0
-!DB    DB_Object_ID     DB_Object_Symbol       Qualifier       TOid    PMID:25774204    Evidence       With(or)From    Aspect  DB_Object_Name  DB_Object_Synonym        DB_Object_Type Taxon   Date    Assigned_by             
-LIS    ABE72958.1      CPK3    root nodule number      TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       ABE72958.1      Increased number of root nodules        gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+!gaf-version: 2.0                      
+!DB    DB_Object_ID     DB_Object_Symbol               TOid    PMID:25774204    Evidence       With(or)From    Aspect  DB_Object_Name  DB_Object_Synonym        DB_Object_Type Taxon   Date    Assigned_by             
+LIS    ABE72958.1      CPK3            TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       ABE72958.1      Increased number of root nodules        gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   ADC33495.1      VPY                     PMID:25774204   IMP                     ADC33495.1      Aborted mycorrhizae formation   gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   ADC33495.1      VPY                     PMID:25774204   IMP                     ADC33495.1      Rhizobial Infection thread abnormal     gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    ADC33495.1      VPY     root nodule number      TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       ADC33495.1      root nodulation decreased       gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    ADC33495.1      VPY             TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       ADC33495.1      root nodulation decreased       gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   AFI56799.1      NAM                     PMID:25774204   IMP                     AFI56799.1      Ovules exposed by unfused carpel edges  gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !!LIS  AFI56799.1      NAM                     PMID:25774204   IMP                     AFI56799.1      abnomal ovules  gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   AFI56799.1      NAM                     PMID:25774204   IMP                     AFI56799.1      either sepal-like or petal-like structures      gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
@@ -14,100 +14,100 @@ LIS       ADC33495.1      VPY     root nodule number      TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       ADC33495.1
 !LIS   AFI56799.1      NAM                     PMID:25774204   IMP                     AFI56799.1      small flowers   gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   AFI56799.1      NAM                     PMID:25774204   IMP                     AFI56799.1      stigma sometimes absent gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   AFI56799.1      NAM                     PMID:25774204   IMP                     AFI56799.1      style sometimes absent  gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    AFI56799.1      NAM     carpel anatomy and morphology trait     TO:0006012      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      abnormal carpel gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    AFI56799.1      NAM     cotyledon anatomy and morphology trait  TO:0000749      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      fused cotyledons        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    AFI56799.1      NAM     embryo shape    TO:0000193      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      cylindrical embryos     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    AFI56799.1      NAM     female sterility        TO:0000358      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      sterile carpels gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    AFI56799.1      NAM     male sterility  TO:0000437      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      sterile stamens gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    AFI56799.1      NAM     shoot apical meristem development       TO:0006020      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      aborted shoot apical meristem   gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    AFI56799.1      NAM     stamen anatomy and morphology trait     TO:0000215      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      abnormal stamen gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    AFI56799.1      NAM     trichome anatomy and morphology trait   TO:0000911      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      abnormal carpel trichomes       gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    AFI56799.1      NAM     vascular leaf anatomy and morphology trait      TO:0000419      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      fused leaflets  gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    AFI56799.1      NAM     vascular leaf anatomy and morphology trait      TO:0000419      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      malformed juvenile vascular leaves      gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    CAD48198.1      ENOD40  tissue development trait        TO:0006015      PMID:25774204   IMP             T       CAD48198.1      Abnormal tissue development     gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    AFI56799.1      NAM             TO:0006012      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      abnormal carpel gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    AFI56799.1      NAM             TO:0000749      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      fused cotyledons        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    AFI56799.1      NAM             TO:0000193      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      cylindrical embryos     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    AFI56799.1      NAM             TO:0000358      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      sterile carpels gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    AFI56799.1      NAM             TO:0000437      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      sterile stamens gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    AFI56799.1      NAM             TO:0006020      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      aborted shoot apical meristem   gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    AFI56799.1      NAM             TO:0000215      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      abnormal stamen gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    AFI56799.1      NAM             TO:0000911      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      abnormal carpel trichomes       gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    AFI56799.1      NAM             TO:0000419      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      fused leaflets  gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    AFI56799.1      NAM             TO:0000419      PMID:25774204   IMP             T       AFI56799.1      malformed juvenile vascular leaves      gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    CAD48198.1      ENOD40          TO:0006015      PMID:25774204   IMP             T       CAD48198.1      Abnormal tissue development     gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   CAI29046.1      MtAOC                   PMID:25774204   IMP                     CAI29046.1      Arbuscle formation decreased    gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   CAI29046.1      MtAOC                   PMID:25774204   IMP                     CAI29046.1      Arbuscle structure normal       gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   CAI29046.1      MtAOC                   PMID:25774204   IMP                     CAI29046.1      Reduced root Jasmonic Acid levels       gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   CAI29046.1      MtAOC                   PMID:25774204   IMP                     CAI29046.1      mycorrhizae delayed colonization        gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   CAR57918.1      MtCCD1                  PMID:25774204   IMP                     CAR57918.1      Degenerate arbuscles    gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    CAR57918.1      MtCCD1  carotene content        TO:0000289      PMID:25774204   IMP             T       CAR57918.1      Apocarotenoid levels abnormal in roots  gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    CAR57918.1      MtCCD1          TO:0000289      PMID:25774204   IMP             T       CAR57918.1      Apocarotenoid levels abnormal in roots  gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr1g056530   HAP2.1                  PMID:25774204   IMP                     Medtr1g056530   nonfunctional root nodules      gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr1g056530   HAP2.1  root nodule anatomy and morphology trait        TO:0000898      PMID:25774204   IMP             T       Medtr1g056530   small root nodules      gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr1g056530   HAP2.1          TO:0000898      PMID:25774204   IMP             T       Medtr1g056530   small root nodules      gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr1g090320   LIN                     PMID:25774204   IMP                     Medtr1g090320   aborted infection threads       gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr1g090320   LIN                     PMID:25774204   IMP                     Medtr1g090320   decreased rhizobial infection   gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr1g090320   LIN                     PMID:25774204   IMP                     Medtr1g090320   nodule development arrested     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr1g101600   CBF4    root length     TO:0000227      PMID:25774204   IMP             T       Medtr1g101600   Higher Primary root length      gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr1g101600   CBF4    salt tolerance  TO:0006001      PMID:25774204   IMP             T       Medtr1g101600   Salt-stress tolerance increased gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr1g101600   CBF4            TO:0000227      PMID:25774204   IMP             T       Medtr1g101600   Higher Primary root length      gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr1g101600   CBF4            TO:0006001      PMID:25774204   IMP             T       Medtr1g101600   Salt-stress tolerance increased gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr2g005870   DMI1                    PMID:25774204   IMP                     Medtr2g005870   Infection thread aborted        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr2g005870   DMI1    root nodule number      TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr2g005870   root nodules absent     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr2g005870   DMI1            TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr2g005870   root nodules absent     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)                   PMID:25774204   IMP                     Medtr2g035020   Increased isoflavones in roots  gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)                   PMID:25774204   IMP                     Medtr2g035020   Reduced saponins in roots       gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)   germination rate        TO:0000430      PMID:25774204   IMP             T       Medtr2g035020   Seed germination delayed        gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)   plant structure growth and development trait    TO:0000928      PMID:25774204   IMP             T       Medtr2g035020   Plant growth stunted    gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)   root branching  TO:0000257      PMID:25774204   IMP             T       Medtr2g035020   Roots less branched     gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)   root length     TO:0000227      PMID:25774204   IMP             T       Medtr2g035020   Roots short     gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)           TO:0000430      PMID:25774204   IMP             T       Medtr2g035020   Seed germination delayed        gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)           TO:0000928      PMID:25774204   IMP             T       Medtr2g035020   Plant growth stunted    gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)           TO:0000257      PMID:25774204   IMP             T       Medtr2g035020   Roots less branched     gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)           TO:0000227      PMID:25774204   IMP             T       Medtr2g035020   Roots short     gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr3g021350   cyp716A12                       PMID:25774204   IMP                     Medtr3g021350   Impaired hemolytic saponin synthesis    gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr3g021350   cyp716A12       plant structure growth and development trait    TO:0000928      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g021350   Plant growth stunted    gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr3g098560   SGL1    flower anatomy and morphology trait     TO:0000499      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g098560   fused flowers   gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr3g098560   SGL1    leaf shape      TO:0000492      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g098560   simple, unifoliate (not compound) leaves        gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr3g098560   SGL1    petiole length  TO:0000766      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g098560   Short petiole   gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr3g021350   cyp716A12               TO:0000928      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g021350   Plant growth stunted    gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr3g098560   SGL1            TO:0000499      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g098560   fused flowers   gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr3g098560   SGL1            TO:0000492      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g098560   simple, unifoliate (not compound) leaves        gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr3g098560   SGL1            TO:0000766      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g098560   Short petiole   gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr3g099620   bHLH1                   PMID:25774204   IMP                     Medtr3g099620   Nodulation delayed      gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr3g099620   bHLH1   plant organ growth and development trait        TO:0000927      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g099620   reduced growth of aboveground plant organs      gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr3g099620   bHLH1   vascular bundle development trait       TO:0020109      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g099620   Assymetrical development of nodule vascular bundles     gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr3g099620   bHLH1           TO:0000927      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g099620   reduced growth of aboveground plant organs      gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr3g099620   bHLH1           TO:0020109      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g099620   Assymetrical development of nodule vascular bundles     gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr3g106420   FLOT2                   PMID:25774204   IMP                     Medtr3g106420   A decrease in plants that form pink nodules     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr3g106420   FLOT2                   PMID:25774204   IMP                     Medtr3g106420   Decreased rhizobial infection   gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr3g106420   FLOT2                   PMID:25774204   IMP                     Medtr3g106420   reduced acetylene reduction     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr3g106420   FLOT2   lateral root length     TO:0001012      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g106420   Long primary lateral roots      gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-!LIS   Medtr3g106420   FLOT2   root nodule number              PMID:25774204   IMP                     Medtr3g106420   More no-nodule plants   gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr3g106420   FLOT2   root nodule number      TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g106420   Fewer nodules per plant gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr3g106420   FLOT2   seminal root length     TO:0000586      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g106420   Decreased primary root length   gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr3g106420   FLOT2           TO:0001012      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g106420   Long primary lateral roots      gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+!LIS   Medtr3g106420   FLOT2                   PMID:25774204   IMP                     Medtr3g106420   More no-nodule plants   gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr3g106420   FLOT2           TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g106420   Fewer nodules per plant gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr3g106420   FLOT2           TO:0000586      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g106420   Decreased primary root length   gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr3g106430   FLOT4                   PMID:25774204   IMP                     Medtr3g106430   A decrease in plants that form pink nodules     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr3g106430   FLOT4                   PMID:25774204   IMP                     Medtr3g106430   aborted infection threads       gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr3g106430   FLOT4                   PMID:25774204   IMP                     Medtr3g106430   decreased rhizobial infection   gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr3g106430   FLOT4                   PMID:25774204   IMP                     Medtr3g106430   reduced acetylene reduction     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr3g106430   FLOT4   root nodule number      TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g106430   Fewer nodules per plant gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr3g106430   FLOT4   root number     TO:0000084      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g106430   Increased secondary roots       gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr3g106480   FLOT3   root length     TO:0000227      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g106480   Decreased root length   gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr3g106480   FLOT3   root weight     TO:0000279      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g106480   Reduced root weight     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr3g106430   FLOT4           TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g106430   Fewer nodules per plant gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr3g106430   FLOT4           TO:0000084      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g106430   Increased secondary roots       gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr3g106480   FLOT3           TO:0000227      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g106480   Decreased root length   gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr3g106480   FLOT3           TO:0000279      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g106480   Reduced root weight     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr4g070970   SUNN                    PMID:25774204   IMP                     Medtr4g070970   Wild type nodulation response to ethylene       gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr4g070970   SUNN                    PMID:25774204   IMP                     Medtr4g070970   nodulation occurs in abnormal places on root    gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr4g070970   SUNN                    PMID:25774204   IMP                     Medtr4g070970   nodulation under high nitrogen  gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr4g070970   SUNN    root length     TO:0000227      PMID:25774204   IMP             T       Medtr4g070970   short roots     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr4g070970   SUNN    root nodule number      TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr4g070970   increased number of root nodules        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr4g070970   SUNN            TO:0000227      PMID:25774204   IMP             T       Medtr4g070970   short roots     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr4g070970   SUNN            TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr4g070970   increased number of root nodules        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr4g084140   MtNAP1                  PMID:25774204   IMP                     Medtr4g084140   aborted infection threads       gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr4g084140   MtNAP1                  PMID:25774204   IMP                     Medtr4g084140   decreased rhizobial infection   gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr4g084140   MtNAP1                  PMID:25774204   IMP                     Medtr4g084140   reduced acetylene reduction     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr4g084140   MtNAP1  enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Medtr4g084140   low nitrogenase activity in nodules     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr4g084140   MtNAP1  root nodule anatomy and morphology trait        TO:0000898      PMID:25774204   IMP             T       Medtr4g084140   root nodules undeveloped and small      gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr4g084140   MtNAP1  root nodule number      TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr4g084140   Fewer root nodules      gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr4g084140   MtNAP1          TO:0000599      PMID:25774204   IMP             T       Medtr4g084140   low nitrogenase activity in nodules     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr4g084140   MtNAP1          TO:0000898      PMID:25774204   IMP             T       Medtr4g084140   root nodules undeveloped and small      gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr4g084140   MtNAP1          TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr4g084140   Fewer root nodules      gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr5g011250   ANS                     PMID:25774204   IMP                     Medtr5g011250   Reduced seed Oligomeric proanthocyanidin levels gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr5g011250   ANS     anthocyanin content     TO:0000071      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g011250   Reduced leaf Anthocyanin levels gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr5g011250   ANS             TO:0000071      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g011250   Reduced leaf Anthocyanin levels gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr5g014400   PALM1                   PMID:25774204   IMP                     Medtr5g014400   Distal lateral leaflets develop similarly to terminal leaflets  gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr5g014400   PALM1                   PMID:25774204   IMP                     Medtr5g014400   Rachis length decreased gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr5g014400   PALM1   leaf anatomy and morphology trait       TO:0000748      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g014400   Forms dissected leaves  gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr5g014400   PALM1   leaf anatomy and morphology trait       TO:0000748      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g014400   Palmate-like pentafoliate leaves        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr5g014400   PALM1   petiole length  TO:0000766      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g014400   Petiole length increased        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr5g014400   PALM1           TO:0000748      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g014400   Forms dissected leaves  gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr5g014400   PALM1           TO:0000748      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g014400   Palmate-like pentafoliate leaves        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr5g014400   PALM1           TO:0000766      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g014400   Petiole length increased        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr5g019040   NFP                     PMID:25774204   IMP                     Medtr5g019040   Infection thread aborted        gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr5g019040   NFP                     PMID:25774204   IMP                     Medtr5g019040   root nodules absent     gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr5g022030   CDPK1                   PMID:25774204   IMP                     Medtr5g022030   mycorrhizal symbioses decreased gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr5g022030   CDPK1   root cortical cell length       TO:0020108      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g022030   reduced root cell length        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr5g022030   CDPK1   root hair length        TO:0002665      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g022030   reduced root hair length        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr5g022030   CDPK1   root nodule anatomy and morphology trait        TO:0000898      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g022030   root nodulation decreased       gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr5g022030   CDPK1           TO:0020108      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g022030   reduced root cell length        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr5g022030   CDPK1           TO:0002665      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g022030   reduced root hair length        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr5g022030   CDPK1           TO:0000898      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g022030   root nodulation decreased       gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr5g026850   CYCLOPS                 PMID:25774204   IMP                     Medtr5g026850   inhibited mycorrhizal infection gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr5g026850   CYCLOPS                 PMID:25774204   IMP                     Medtr5g026850   inhibited rhizobial infection   gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr5g026850   CYCLOPS root nodule anatomy and morphology trait        TO:0000898      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g026850   arrested nodule development     gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr5g026850   CYCLOPS         TO:0000898      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g026850   arrested nodule development     gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr5g030920   nork                    PMID:25774204   IMP                     Medtr5g030920   mycorrhizal symbioses absent    gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr5g030920   nork    root nodule number      TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g030920   Root nodules absent in presence of Nod factor   gene    taxon:3880      20150701        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr5g030920   nork    root nodule number      TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g030920   Root nodules absent in presence of the rhizobial Sinorhizobium meliloti gene    taxon:3880      20150701        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr5g030920   nork            TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g030920   Root nodules absent in presence of Nod factor   gene    taxon:3880      20150701        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr5g030920   nork            TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g030920   Root nodules absent in presence of the rhizobial Sinorhizobium meliloti gene    taxon:3880      20150701        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr5g086120   LYK4                    PMID:25774204   IMP                     Medtr5g086120   Infection thread aborted        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr5g086120   LYK4    root nodule number      TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g086120   root nodules absent     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr5g086120   LYK4            TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g086120   root nodules absent     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr5g086130   LYK3                    PMID:25774204   IMP                     Medtr5g086130   Infection thread aborted        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr5g086130   LYK3    root nodule number      TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g086130   root nodules absent     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr5g086130   LYK3            TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr5g086130   root nodules absent     gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr6g071190   FCL1                    PMID:25774204   IMP                     Medtr6g071190   Leaf rachis malformed   gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr6g071190   FCL1    petiole length  TO:0000766      PMID:25774204   IMP             T       Medtr6g071190   Short petiole   gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr6g071190   FCL1    vascular leaf anatomy and morphology trait      TO:0000419      PMID:25774204   IMP             T       Medtr6g071190   Fused leaflets  gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr7g084970   FTa1    flowering time trait    TO:0002616      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g084970   Delayed flowering       gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr7g085040   FTc     flower development trait        TO:0000622      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g085040   Flower development normal under long days       gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr6g071190   FCL1            TO:0000766      PMID:25774204   IMP             T       Medtr6g071190   Short petiole   gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr6g071190   FCL1            TO:0000419      PMID:25774204   IMP             T       Medtr6g071190   Fused leaflets  gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr7g084970   FTa1            TO:0002616      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g084970   Delayed flowering       gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr7g085040   FTc             TO:0000622      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g085040   Flower development normal under long days       gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr7g085810   ERN                     PMID:25774204   IMP                     Medtr7g085810   Rhizobial colonization blocked  gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr7g085810   ERN                     PMID:25774204   IMP                     Medtr7g085810   Signal transduction for nodulation blocked      gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr7g101410   Skl1                    PMID:25774204   IMP                     Medtr7g101410   Reduced autocatylic ethylene production gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
@@ -116,24 +116,24 @@ LIS       Medtr7g085040   FTc     flower development trait        TO:0000622      PMID:25774204   IMP             T       M
 !LIS   Medtr7g101410   Skl1                    PMID:25774204   IMP                     Medtr7g101410   increased pathogenic fungal damage      gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr7g101410   Skl1                    PMID:25774204   IMP                     Medtr7g101410   increased persistant rhizobia infection gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr7g101410   Skl1                    PMID:25774204   IMP                     Medtr7g101410   radial swelling of primary infection zone       gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr7g101410   Skl1    gravity response trait  TO:0002693      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g101410   No loss of geotropism   gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr7g101410   Skl1    hypocotyl anatomy and morphology trait  TO:0000757      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g101410   lack of inhibition of hypocotyl growth  gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr7g101410   Skl1    hypocotyl anatomy and morphology trait  TO:0000757      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g101410   reduced apical hook angle       gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr7g101410   Skl1    root development trait  TO:0000656      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g101410   lack of inhibition of root growth       gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr7g101410   Skl1    root hair length        TO:0002665      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g101410   reduced ectopic root hairs      gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr7g101410   Skl1    root nodule number      TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g101410   Absence of nodules      gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr7g101410   Skl1    seedling cotyledon size TO:0000752      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g101410   large cotyledons        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr7g101410   Skl1            TO:0002693      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g101410   No loss of geotropism   gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr7g101410   Skl1            TO:0000757      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g101410   lack of inhibition of hypocotyl growth  gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr7g101410   Skl1            TO:0000757      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g101410   reduced apical hook angle       gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr7g101410   Skl1            TO:0000656      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g101410   lack of inhibition of root growth       gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr7g101410   Skl1            TO:0002665      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g101410   reduced ectopic root hairs      gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr7g101410   Skl1            TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g101410   Absence of nodules      gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr7g101410   Skl1            TO:0000752      PMID:25774204   IMP             T       Medtr7g101410   large cotyledons        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr8g020200   ELF4                    PMID:25774204   IMP                     Medtr8g020200   Circadian rhythm abnormal       gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr8g043970   DMI3                    PMID:25774204   IMP                     Medtr8g043970   mycorrhizal symbioses absent    gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr8g043970   DMI3    root nodule number      TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr8g043970   root nodule absent      gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr8g058380   CDC16   auxin sensitivity       TO:0000163      PMID:25774204   IMP             T       Medtr8g058380   Reduced auxin sensitivity by roots      gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr8g058380   CDC16   root nodule anatomy and morphology trait        TO:0000898      PMID:25774204   IMP             T       Medtr8g058380   Increased nodules       gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr8g043970   DMI3            TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr8g043970   root nodule absent      gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr8g058380   CDC16           TO:0000163      PMID:25774204   IMP             T       Medtr8g058380   Reduced auxin sensitivity by roots      gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr8g058380   CDC16           TO:0000898      PMID:25774204   IMP             T       Medtr8g058380   Increased nodules       gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr8g058710   chitIII-3                       PMID:25774204   IMP                     Medtr8g058710   Increased fungal spore germination      gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr8g058710   chitIII-3                       PMID:25774204   IMP                     Medtr8g058710   Increased fungal spore production       gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr8g058710   chitIII-3                       PMID:25774204   IMP                     Medtr8g058710   Increased mycorrhizal infections        gene    taxon:3880      20150706        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr8g106150   MtCre1                  PMID:25774204   IMP                     Medtr8g106150   aborted infection threads       gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr8g106150   MtCre1                  PMID:25774204   IMP                     Medtr8g106150   arrested root nodule development        gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
 !LIS   Medtr8g106150   MtCre1                  PMID:25774204   IMP                     Medtr8g106150   cytokinin response gene not induced by cytokinins       gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr8g106150   MtCre1  cytokinin sensitivity   TO:0000167      PMID:25774204   IMP             T       Medtr8g106150   root growth not inhibited by cytokinins gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr8g106150   MtCre1  root nodule number      TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr8g106150   Fewer root nodules      gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
-LIS    Medtr8g106150   MtCre1  root number     TO:0000084      PMID:25774204   IMP             T       Medtr8g106150   Increased secondary roots       gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr8g106150   MtCre1          TO:0000167      PMID:25774204   IMP             T       Medtr8g106150   root growth not inhibited by cytokinins gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr8g106150   MtCre1          TO:0000900      PMID:25774204   IMP             T       Medtr8g106150   Fewer root nodules      gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
+LIS    Medtr8g106150   MtCre1          TO:0000084      PMID:25774204   IMP             T       Medtr8g106150   Increased secondary roots       gene    taxon:3880      20150702        Planteome:Ethan_Johnson         
index 522f216989a10b9f36eb99fbeee7d0eb87754ef6..bb474f5e6aaaf80768f816680e180e2f2ebbb5bf 100644 (file)
-!gaf-version: 2.0
-!DB    DB_Object_ID     DB_Object_Symbol       Qualifier       TOid    DB:Reference     Evidence       With(or)From    Aspect  DB_Object_Name  DB_Object_Synonym        DB_Object_Type Taxon   Date    Assigned_by             
-GR_gene        GR:0800010      AID1    spikelet sterility      TO:0000436      PMID:15247409   IMP             T       Os06g0181300    spikelet sterility      gene    taxon:4530      20150413        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0800010      AID1    tiller number   TO:0000346      PMID:15247409   IMP             T       Os06g0181300    few tillers     gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0800010      AID1    days to flowering       TO:0000344      PMID:15247409   IMP             T       Os06g0181300    late flowering  gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060058      APO1    leaf number     TO:0000241      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    increased leaf number   gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060058      APO1    primary branching of inflorescence      TO:0000052      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    abnormal panicle phyllotaxy     gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060058      APO1    inflorescence branching TO:0000050      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    decreased panicle branching     gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060058      APO1    reproductive homeotic development trait TO:0002613      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    homeotic floral transformations gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060058      APO1    fertility related trait TO:0000420      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    reduced fertility       gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
+!gaf-version: 2.0                      
+!DB    DB_Object_ID     DB_Object_Symbol               TOid    DB:Reference     Evidence       With(or)From    Aspect  DB_Object_Name  DB_Object_Synonym        DB_Object_Type Taxon   Date    Assigned_by             
+GR_gene        GR:0800010      AID1            TO:0000436      PMID:15247409   IMP             T       Os06g0181300    spikelet sterility      gene    taxon:4530      20150413        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0800010      AID1            TO:0000346      PMID:15247409   IMP             T       Os06g0181300    few tillers     gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0800010      AID1            TO:0000344      PMID:15247409   IMP             T       Os06g0181300    late flowering  gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060058      APO1            TO:0000241      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    increased leaf number   gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060058      APO1            TO:0000052      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    abnormal panicle phyllotaxy     gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060058      APO1            TO:0000050      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    decreased panicle branching     gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060058      APO1            TO:0002613      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    homeotic floral transformations gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060058      APO1            TO:0000420      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    reduced fertility       gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0060058      APO1                    PMID:15950602   IMP                     Os06g0665400    smaller rachis meristem gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060058      APO1    primary branch number   TO:0000547      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    reduced primary branches        gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060058      APO1    spikelet number TO:0000456      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    less than half the number of spikelets  gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060058      APO1    secondary branch number TO:0000557      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    less than half the number of secondary branches gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060068      BC1     leaf flexibility        TO:0000825      PMID:12953108   IMP             T       Os03g0416200    leaves brittle at green stage   gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060068      BC1     leaf flexibility        TO:0000825      PMID:12953108   IMP             T       Os03g0416200    leaves brittle at mature stage  gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060068      BC1     brittle culm    TO:0000200      PMID:12953108   IMP             T       Os03g0416200    culms brittle at green stage    gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060068      BC1     brittle culm    TO:0000200      PMID:12953108   IMP             T       Os03g0416200    culms brittle at mature stage   gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060068      BC1     grain shattering        TO:0000473      PMID:12953108   IMP             T       Os03g0416200    panicles brittle at green stage gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060068      BC1     grain shattering        TO:0000473      PMID:12953108   IMP             T       Os03g0416200    panicles brittle at mature stage        gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060058      APO1            TO:0000547      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    reduced primary branches        gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060058      APO1            TO:0000456      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    less than half the number of spikelets  gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060058      APO1            TO:0000557      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    less than half the number of secondary branches gene    taxon:4530      20150415        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060068      BC1             TO:0000825      PMID:12953108   IMP             T       Os03g0416200    leaves brittle at green stage   gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060068      BC1             TO:0000825      PMID:12953108   IMP             T       Os03g0416200    leaves brittle at mature stage  gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060068      BC1             TO:0000200      PMID:12953108   IMP             T       Os03g0416200    culms brittle at green stage    gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060068      BC1             TO:0000200      PMID:12953108   IMP             T       Os03g0416200    culms brittle at mature stage   gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060068      BC1             TO:0000473      PMID:12953108   IMP             T       Os03g0416200    panicles brittle at green stage gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060068      BC1             TO:0000473      PMID:12953108   IMP             T       Os03g0416200    panicles brittle at mature stage        gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0060068      BC1                     PMID:12953108   IMP                     Os03g0416200    low content of alpha-cellulose in cell wall     gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060070      BC3     stem strength   TO:0000051      GR_REF:5651     IMP             T       Os02g0738900    weak culm       gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060070      BC3     brittle culm    TO:0000200      GR_REF:5651     IMP             T       Os02g0738900    brittle culm    gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060070      BC3     panicle size    TO:0006032      GR_REF:5651     IMP             T       Os02g0738900    short emergence of panicles     gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060070      BC3     panicle anatomy and morphology trait    TO:0000847      GR_REF:5651     IMP             T       Os02g0738900    incomplete emergence of panicles        gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060070      BC3             TO:0000051      GR_REF:5651     IMP             T       Os02g0738900    weak culm       gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060070      BC3             TO:0000200      GR_REF:5651     IMP             T       Os02g0738900    brittle culm    gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060070      BC3             TO:0006032      GR_REF:5651     IMP             T       Os02g0738900    short emergence of panicles     gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060070      BC3             TO:0000847      GR_REF:5651     IMP             T       Os02g0738900    incomplete emergence of panicles        gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0060073      BC6                     GR_REF:5933     IMP                     Os09g0422500    all parts of plant are extremely brittle        gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080018      BLE3    root length     TO:0000227      PMID:16808934   IMP             T       Os05g0245300    short roots     gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080018      BLE3    inflorescence branching TO:0000050      PMID:16808934   IMP             T       Os05g0245300    less branching  gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080018      BLE3    plant height    TO:0000207      PMID:16808934   IMP             T       Os05g0245300    Semi-dwarf      gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0101269      COIN    cold tolerance  TO:0000303      PMID:17549515   IMP             T       Os01g0104100    tolerance to cold temperature   gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0101269      COIN    salt tolerance  TO:0006001      PMID:17549515   IMP             T       Os01g0104100    tolerance to salt       gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0101269      COIN    drought tolerance       TO:0000276      PMID:17549515   IMP             T       Os01g0104100    tolerance to drought-like conditions    gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0101269      COIN    proline content TO:0006002      PMID:17549515   IMP             T       Os01g0104100    increase in cellular proline content    gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0020064      CPS1    plant height    TO:0000207      PMID:16861806   IMP             T       Os02g0278700    dwarf   gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0020065      CPS2    plant height    TO:0000207      PMID:16861806   IMP             T       Os02g0571100    dwarf   gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0020066      CPS4    plant height    TO:0000207      PMID:16861806   IMP             T       Os04g0178300    dwarfism        gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080030      CPT1    shoot phototropism      TO:0002651      PMID:15598797   IMP             T       Os02g0568200    complete loss of coleoptile phototropism        gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080030      CPT1    root phototropism       TO:0002652      PMID:15598797   IMP             T       Os02g0568200    Reduced root phototropism       gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060184      D1      grain size      TO:0000397      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    small grain     gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060184      D1      plant height    TO:0000207      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    dwarf   gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060184      D1      stem length     TO:0000576      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    short stems     gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060184      D1      leaf height     TO:0000541      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    short leaves    gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060184      D1      leaf size       TO:0002637      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    broad leaves    gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060184      D1      leaf color      TO:0000326      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    dark green leaves       gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060184      D1      panicle axis angle      TO:0000342      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    erect paincles  gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060184      D1      panicle compactness and shape   TO:0020001      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    compact panicles        gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060184      D1      glume width     TO:0020034      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    small glume     gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060184      D1      glume anatomy and morphology trait      TO:0000869      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    round glumes    gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060184      D1      basal internode diameter        TO:0000132      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    thick internodes        gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060192      D10     plant height    TO:0000207      GR_REF:5792     IMP             T       Os01g0746400    dwarf   gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060192      D10     tiller number   TO:0000346      GR_REF:5792     IMP             T       Os01g0746400    profuse tillers gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080018      BLE3            TO:0000227      PMID:16808934   IMP             T       Os05g0245300    short roots     gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080018      BLE3            TO:0000050      PMID:16808934   IMP             T       Os05g0245300    less branching  gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080018      BLE3            TO:0000207      PMID:16808934   IMP             T       Os05g0245300    Semi-dwarf      gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0101269      COIN            TO:0000303      PMID:17549515   IMP             T       Os01g0104100    tolerance to cold temperature   gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0101269      COIN            TO:0006001      PMID:17549515   IMP             T       Os01g0104100    tolerance to salt       gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0101269      COIN            TO:0000276      PMID:17549515   IMP             T       Os01g0104100    tolerance to drought-like conditions    gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0101269      COIN            TO:0006002      PMID:17549515   IMP             T       Os01g0104100    increase in cellular proline content    gene    taxon:4530      20150417        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0020064      CPS1            TO:0000207      PMID:16861806   IMP             T       Os02g0278700    dwarf   gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0020065      CPS2            TO:0000207      PMID:16861806   IMP             T       Os02g0571100    dwarf   gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0020066      CPS4            TO:0000207      PMID:16861806   IMP             T       Os04g0178300    dwarfism        gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080030      CPT1            TO:0002651      PMID:15598797   IMP             T       Os02g0568200    complete loss of coleoptile phototropism        gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080030      CPT1            TO:0002652      PMID:15598797   IMP             T       Os02g0568200    Reduced root phototropism       gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060184      D1              TO:0000397      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    small grain     gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060184      D1              TO:0000207      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    dwarf   gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060184      D1              TO:0000576      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    short stems     gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060184      D1              TO:0000541      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    short leaves    gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060184      D1              TO:0002637      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    broad leaves    gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060184      D1              TO:0000326      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    dark green leaves       gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060184      D1              TO:0000342      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    erect paincles  gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060184      D1              TO:0020001      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    compact panicles        gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060184      D1              TO:0020034      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    small glume     gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060184      D1              TO:0000869      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    round glumes    gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060184      D1              TO:0000132      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    thick internodes        gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060192      D10             TO:0000207      GR_REF:5792     IMP             T       Os01g0746400    dwarf   gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060192      D10             TO:0000346      GR_REF:5792     IMP             T       Os01g0746400    profuse tillers gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0060192      D10                     GR_REF:5792     IMP                     Os01g0746400    slender tillers gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060192      D10     panicle size    TO:0006032      GR_REF:5792     IMP             T       Os01g0746400    small panicles  gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060193      D11     plant height    TO:0000207      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    semidwarf       gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060193      D11     stem internode anatomy and morphology trait     TO:0000756      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    second internode reduced        gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060193      D11     panicle length  TO:0000040      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    long panicles   gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060193      D11     grain number per plant  TO:0000440      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    sparse grain set        gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060193      D11     grain shape     TO:0002730      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    round grains    gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060193      D11     grain size      TO:0000397      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    small grains    gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060186      D3      plant height    TO:0000207      PMID:15659436   IMP             T       Os06g0154200    dwarf   gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060186      D3      space per culm  TO:0000560      PMID:15659436   IMP             T       Os06g0154200    Many fine tillers       gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060186      D3      leaf size       TO:0002637      PMID:15659436   IMP             T       Os06g0154200    slender leaves  gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060213      D35     plant height    TO:0000207      PMID:15075394   IMP             T       Os06g0569500    Semi-dwarf      gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060192      D10             TO:0006032      GR_REF:5792     IMP             T       Os01g0746400    small panicles  gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060193      D11             TO:0000207      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    semidwarf       gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060193      D11             TO:0000756      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    second internode reduced        gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060193      D11             TO:0000040      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    long panicles   gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060193      D11             TO:0000440      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    sparse grain set        gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060193      D11             TO:0002730      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    round grains    gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060193      D11             TO:0000397      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    small grains    gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060186      D3              TO:0000207      PMID:15659436   IMP             T       Os06g0154200    dwarf   gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060186      D3              TO:0000560      PMID:15659436   IMP             T       Os06g0154200    Many fine tillers       gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060186      D3              TO:0002637      PMID:15659436   IMP             T       Os06g0154200    slender leaves  gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060213      D35             TO:0000207      PMID:15075394   IMP             T       Os06g0569500    Semi-dwarf      gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0060213      D35                     PMID:15075394   IMP                     Os06g0569500    Gibberellin biosynthesis defective      gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060226      D61     plant height    TO:0000207      PMID:11006334   IMP             T       Os01g0718300    dwarf   gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101251      DCL1    plant height    TO:0000207      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    dwarfism        gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101251      DCL1    leaf color      TO:0000326      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    dark green leaves       gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101251      DCL1    rolled leaf     TO:0006064      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    rolled leaves   gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101251      DCL1    shoot system anatomy and morphology trait       TO:0000077      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    twisted shoot   gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101251      DCL1    root development trait  TO:0000656      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    abnormal root development       gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101251      DCL1    adventitious root number        TO:0001006      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    few adventitious roots  gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101251      DCL1    chloroplast development trait   TO:0002715      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    ectopic chloroplast development in adventitious roots   gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060226      D61             TO:0000207      PMID:11006334   IMP             T       Os01g0718300    dwarf   gene    taxon:4530      20150420        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101251      DCL1            TO:0000207      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    dwarfism        gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101251      DCL1            TO:0000326      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    dark green leaves       gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101251      DCL1            TO:0006064      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    rolled leaves   gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101251      DCL1            TO:0000077      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    twisted shoot   gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101251      DCL1            TO:0000656      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    abnormal root development       gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101251      DCL1            TO:0001006      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    few adventitious roots  gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101251      DCL1            TO:0002715      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    ectopic chloroplast development in adventitious roots   gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0101251      DCL1                    PMID:16126864   IMP                     Os03g0121901    miRNA accumulation in leaves absent     gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060233      DL      leaf attitude   TO:0000824      PMID:14729915   IMP             T       Os03g0215200    drooping leaves gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060233      DL      leaf midvein anatomy and morphology trait       TO:0000822      PMID:14729915   IMP             T       Os03g0215200    loss of midrib formation        gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060233      DL              TO:0000824      PMID:14729915   IMP             T       Os03g0215200    drooping leaves gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060233      DL              TO:0000822      PMID:14729915   IMP             T       Os03g0215200    loss of midrib formation        gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0060233      DL                      PMID:14729915   IMP                     Os03g0215200    abnormal carpel development     gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080029      DOS     leaf senescence TO:0000249      PMID:16778011   IMP             T       Os01g0192000    delayed leaf senescence gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      DSG1    germination rate        TO:0000430              IMP             T       Os09g0434200    delayed germination     gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      DSG1    plant height    TO:0000207              IMP             T       Os09g0434200    dwarf   gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      DSG1    stress trait    TO:0000164              IMP             T       Os09g0434200    tolerant to high salt stress    gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      DSG1    stress trait    TO:0000164              IMP             T       Os09g0434200    tolerant to high drought stress gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      DSG1    coleoptile anatomy and morphology trait TO:0000753              IMP             T       Os09g0434200    abnormal growth of coleoptile   gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      DSG1    shoot internode anatomy and morphology trait    TO:0000755              IMP             T       Os09g0434200    internodes may display two or more shoot apices gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      DSG1    stem internode anatomy and morphology trait     TO:0000756              IMP             T       Os09g0434200    internodes may display two or more roots        gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      DSG1    plant phenological trait        TO:0000933              IMP             T       Os09g0434200    bushy plant     gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080017      DWARF   stem elongation TO:0006036      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    defects in stem elongation      gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080017      DWARF   leaf elongation rate    TO:0000360      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    defects in leaf elongation      gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080017      DWARF   cell growth and development trait       TO:0002686      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    failure in organization of cells in stem        gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080017      DWARF   cell growth and development trait       TO:0002686      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    failure in organization of cells in leaf        gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080017      DWARF   cell elongation trait   TO:0002687      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    failure in polar elongation of cells in stem    gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080017      DWARF   cell elongation trait   TO:0002687      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    failure in polar elongation of cells in leaf    gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080016      DWARF4  plant height    TO:0000207      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    slight dwarfism gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080016      DWARF4  leaf erect      TO:0000872      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    erect leaves    gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080016      DWARF4  grain yield trait       TO:0000396      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    enhanced grain yield    gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080016      DWARF4  panicle number  TO:0000152      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    increased panicle number        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080016      DWARF4  plant height    TO:0000207      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    dwarfism        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080016      DWARF4  leaf shape      TO:0000492      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    malformed leaves        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080016      DWARF4  leaf lamina anatomy and morphology trait        TO:0000829      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    tortuous leaf blades    gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060320      EUI1    internode length        TO:0000145      PMID:16399803   IMP             T       Os05g0482400    internode doubles in length     gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060320      EUI1    panicle length  TO:0000040      PMID:16399803   IMP             T       Os05g0482400    panicle length increase gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060333      FON1    floral organ number     TO:0006038      PMID:16511358   IMP             T       Os06g0717200    increased floral organ number   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060333      FON1    plant structure growth and development trait    TO:0000928      PMID:16511358   IMP             T       Os06g0717200    enlarged floral meristem        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080005      FOR1    floral organ number     TO:0006038      PMID:16511358   IMP             T       Os07g0568700    extra floral organs in spikelet gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060339      FZP     floral organ development trait  TO:0006022      PMID:12835399   IMP             T       Os07g0669500    do not form floret      gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060339      FZP     shoot branching TO:0002639      PMID:12835399   IMP             T       Os07g0669500    produce sequential rounds of branching  gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060339      FZP     glume number    TO:0006029      PMID:12835399   IMP             T       Os07g0669500    produce several rudimentary glumes per branch   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060366      GH2     lemma and palea color   TO:0000264      PMID:16443696   IMP             T       Os02g0187800    brownish green lemma at panicle exsertion       gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060366      GH2     lemma and palea color   TO:0000264      PMID:16443696   IMP             T       Os02g0187800    brownish green palea at panicle exsertion       gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060366      GH2     hull color      TO:0000706      PMID:16443696   IMP             T       Os02g0187800    golden hull at maturity gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060366      GH2     internode color TO:0000426      PMID:16443696   IMP             T       Os02g0187800    golden internode has intensified color  gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      Gi      photoperiod-sensitive flowering time trait      TO:0000934              IMP                     Os01g0182600    suppressor of flowering under long-day photoperiodism   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080024      GID2    plant height    TO:0000207      PMID:12649483   IMP             T       Os02g0580300    dwarf   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080024      GID2    leaf lamina width       TO:0002720      PMID:12649483   IMP             T       Os02g0580300    wide leaf blades        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080024      GID2    leaf color      TO:0000326      PMID:12649483   IMP             T       Os02g0580300    dark green leaves       gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080024      GID2    sterility related trait TO:0000485      PMID:12649483   IMP             T       Os02g0580300    mutant is sterile       gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080062      GIF1    fruit ripening trait    TO:0002633      PMID:18820698   IMP             T       Os04g0413500    slow grain filling      gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080062      GIF1    chalky endosperm        TO:0000266      PMID:18820698   IMP             T       Os04g0413500    increased grain chalkiness      gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080062      GIF1    dehulled grain weight   TO:0000590      PMID:18820698   IMP             T       Os04g0413500    reduced grain weight    gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080062      GIF1    starch grain shape      TO:0002656      PMID:18820698   IMP             T       Os04g0413500    abnormal starch granules        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080027      HTD1    plant height    TO:0000207      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    dwarf   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080027      HTD1    plant phenological trait        TO:0000933      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    bushy   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080027      HTD1    tillering ability       TO:0000329      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    High tillering due to high release of axillary buds     gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080027      HTD1    auxin sensitivity       TO:0000163      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    independent of IAA      gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080027      HTD1    auxin sensitivity       TO:0000163      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    independent of ABA      gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080027      HTD1    auxin sensitivity       TO:0000163      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    independent of GA       gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0020067      KS1     plant height    TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os04g0611800    dwarfism        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0020068      KS2     plant height    TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os04g0612000    dwarfism        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0020070      KS4     plant height    TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os04g0179700    dwarfism        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0020071      KS5     plant height    TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os02g0571300    dwarf   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0020072      KS6     plant height    TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os02g0571800    dwarf   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0020073      KS7     plant height    TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os02g0570400    dwarf   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060493      LAX     relative spikelet number        TO:0001033      PMID:7896104    IMP             T       Os01g0831000    sparse setting of spikelets     gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060493      LAX     spikelet anatomy and morphology trait   TO:0000657      PMID:7896104    IMP             T       Os01g0831000    deformed spikelets at low temperatures  gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060493      LAX     temperature response trait      TO:0000432      PMID:7896104    IMP             T       Os01g0831000    absence of spikelet at low temperature  gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080029      DOS             TO:0000249      PMID:16778011   IMP             T       Os01g0192000    delayed leaf senescence gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      DSG1            TO:0000430              IMP             T       Os09g0434200    delayed germination     gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      DSG1            TO:0000207              IMP             T       Os09g0434200    dwarf   gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      DSG1            TO:0000164              IMP             T       Os09g0434200    tolerant to high salt stress    gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      DSG1            TO:0000164              IMP             T       Os09g0434200    tolerant to high drought stress gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      DSG1            TO:0000753              IMP             T       Os09g0434200    abnormal growth of coleoptile   gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      DSG1            TO:0000755              IMP             T       Os09g0434200    internodes may display two or more shoot apices gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      DSG1            TO:0000756              IMP             T       Os09g0434200    internodes may display two or more roots        gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      DSG1            TO:0000933              IMP             T       Os09g0434200    bushy plant     gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080017      DWARF           TO:0006036      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    defects in stem elongation      gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080017      DWARF           TO:0000360      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    defects in leaf elongation      gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080017      DWARF           TO:0002686      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    failure in organization of cells in stem        gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080017      DWARF           TO:0002686      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    failure in organization of cells in leaf        gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080017      DWARF           TO:0002687      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    failure in polar elongation of cells in stem    gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080017      DWARF           TO:0002687      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    failure in polar elongation of cells in leaf    gene    taxon:4530      20150422        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080016      DWARF4          TO:0000207      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    slight dwarfism gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080016      DWARF4          TO:0000872      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    erect leaves    gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080016      DWARF4          TO:0000396      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    enhanced grain yield    gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080016      DWARF4          TO:0000152      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    increased panicle number        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080016      DWARF4          TO:0000207      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    dwarfism        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080016      DWARF4          TO:0000492      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    malformed leaves        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080016      DWARF4          TO:0000829      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    tortuous leaf blades    gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060320      EUI1            TO:0000145      PMID:16399803   IMP             T       Os05g0482400    internode doubles in length     gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060320      EUI1            TO:0000040      PMID:16399803   IMP             T       Os05g0482400    panicle length increase gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060333      FON1            TO:0006038      PMID:16511358   IMP             T       Os06g0717200    increased floral organ number   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060333      FON1            TO:0000928      PMID:16511358   IMP             T       Os06g0717200    enlarged floral meristem        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080005      FOR1            TO:0006038      PMID:16511358   IMP             T       Os07g0568700    extra floral organs in spikelet gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060339      FZP             TO:0006022      PMID:12835399   IMP             T       Os07g0669500    do not form floret      gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060339      FZP             TO:0002639      PMID:12835399   IMP             T       Os07g0669500    produce sequential rounds of branching  gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060339      FZP             TO:0006029      PMID:12835399   IMP             T       Os07g0669500    produce several rudimentary glumes per branch   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060366      GH2             TO:0000264      PMID:16443696   IMP             T       Os02g0187800    brownish green lemma at panicle exsertion       gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060366      GH2             TO:0000264      PMID:16443696   IMP             T       Os02g0187800    brownish green palea at panicle exsertion       gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060366      GH2             TO:0000706      PMID:16443696   IMP             T       Os02g0187800    golden hull at maturity gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060366      GH2             TO:0000426      PMID:16443696   IMP             T       Os02g0187800    golden internode has intensified color  gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      Gi              TO:0000934              IMP                     Os01g0182600    suppressor of flowering under long-day photoperiodism   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080024      GID2            TO:0000207      PMID:12649483   IMP             T       Os02g0580300    dwarf   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080024      GID2            TO:0002720      PMID:12649483   IMP             T       Os02g0580300    wide leaf blades        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080024      GID2            TO:0000326      PMID:12649483   IMP             T       Os02g0580300    dark green leaves       gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080024      GID2            TO:0000485      PMID:12649483   IMP             T       Os02g0580300    mutant is sterile       gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080062      GIF1            TO:0002633      PMID:18820698   IMP             T       Os04g0413500    slow grain filling      gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080062      GIF1            TO:0000266      PMID:18820698   IMP             T       Os04g0413500    increased grain chalkiness      gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080062      GIF1            TO:0000590      PMID:18820698   IMP             T       Os04g0413500    reduced grain weight    gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080062      GIF1            TO:0002656      PMID:18820698   IMP             T       Os04g0413500    abnormal starch granules        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080027      HTD1            TO:0000207      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    dwarf   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080027      HTD1            TO:0000933      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    bushy   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080027      HTD1            TO:0000329      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    High tillering due to high release of axillary buds     gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080027      HTD1            TO:0000163      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    independent of IAA      gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080027      HTD1            TO:0000163      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    independent of ABA      gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080027      HTD1            TO:0000163      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    independent of GA       gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0020067      KS1             TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os04g0611800    dwarfism        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0020068      KS2             TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os04g0612000    dwarfism        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0020070      KS4             TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os04g0179700    dwarfism        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0020071      KS5             TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os02g0571300    dwarf   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0020072      KS6             TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os02g0571800    dwarf   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0020073      KS7             TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os02g0570400    dwarf   gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060493      LAX             TO:0001033      PMID:7896104    IMP             T       Os01g0831000    sparse setting of spikelets     gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060493      LAX             TO:0000657      PMID:7896104    IMP             T       Os01g0831000    deformed spikelets at low temperatures  gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060493      LAX             TO:0000432      PMID:7896104    IMP             T       Os01g0831000    absence of spikelet at low temperature  gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0101253      Log                     PMID:17287810   IMP                     Os01g0588900    reduced number of active meristematic cells in shoot apical meristem    gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101253      Log     inflorescence development trait TO:0000621      PMID:17287810   IMP             T       Os01g0588900    arrest of inflorescence lateral meristem development    gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101253      Log     primary branch number   TO:0000547      PMID:17287810   IMP             T       Os01g0588900    few inflorescence branches      gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101253      Log     panicle size    TO:0006032      PMID:17287810   IMP             T       Os01g0588900    small panicles  gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101253      Log     meristem identity       TO:0006017      PMID:17287810   IMP             T       Os01g0588900    floral meristem flattens        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101253      Log     pistil number   TO:0002659      PMID:17287810   IMP             T       Os01g0588900    flower lacks pistil     gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0101253      Log                     PMID:17287810   IMP                     Os01g0588900    Defective in the cytokinin activation pathways leading to the active free base form     gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080009      LSI1    grain yield trait       TO:0000396      PMID:16572174   IMP             T       Os02g0745100    grain yield is reduced  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101253      Log             TO:0000621      PMID:17287810   IMP             T       Os01g0588900    arrest of inflorescence lateral meristem development    gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101253      Log             TO:0000547      PMID:17287810   IMP             T       Os01g0588900    few inflorescence branches      gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101253      Log             TO:0006032      PMID:17287810   IMP             T       Os01g0588900    small panicles  gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101253      Log             TO:0006017      PMID:17287810   IMP             T       Os01g0588900    floral meristem flattens        gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101253      Log             TO:0002659      PMID:17287810   IMP             T       Os01g0588900    flower lacks pistil     gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0101253      Log                     PMID:17287810   IMP                     Os01g0588900    Defective in the cytokinin activation pathways leading to the active free base form     gene    taxon:4530      20150424        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080009      LSI1            TO:0000396      PMID:16572174   IMP             T       Os02g0745100    grain yield is reduced  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0080009      LSI1                    PMID:16572174   IMP                     Os02g0745100    reduced silicon uptake  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080009      LSI1    animal damage resistance        TO:0000054      PMID:16572174   IMP             T       Os02g0745100    susceptible to pests    gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080009      LSI1    disease resistance      TO:0000112      PMID:16572174   IMP             T       Os02g0745100    susceptible to disease  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080037      LSI2    growth and development trait    TO:0000357      PMID:17625566   IMP             T       Os03g0107300    reduced growth  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080037      LSI2    pericarp color  TO:0000707      PMID:17625566   IMP             T       Os03g0107300    grain discoloration     gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080009      LSI1            TO:0000054      PMID:16572174   IMP             T       Os02g0745100    susceptible to pests    gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080009      LSI1            TO:0000112      PMID:16572174   IMP             T       Os02g0745100    susceptible to disease  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080037      LSI2            TO:0000357      PMID:17625566   IMP             T       Os03g0107300    reduced growth  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080037      LSI2            TO:0000707      PMID:17625566   IMP             T       Os03g0107300    grain discoloration     gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0080037      LSI2                    PMID:17625566   IMP                     Os03g0107300    low silicon in shoot    gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0080037      LSI2                    PMID:17625566   IMP                     Os03g0107300    low silicon in hull     gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080015      MADS1   lemma morphology trait  TO:1000023      PMID:16146529   IMP             T       Os03g0215400    leafy lemma     gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Laurel_Cooper         
-GR_gene        GR:0080015      MADS1   palea morphology trait  TO:1000024      PMID:16146529   IMP             T       Os03g0215400    leafy palea     gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Laurel_Cooper         
+GR_gene        GR:0080015      MADS1           TO:1000023      PMID:16146529   IMP             T       Os03g0215400    leafy lemma     gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Laurel_Cooper         
+GR_gene        GR:0080015      MADS1           TO:1000024      PMID:16146529   IMP             T       Os03g0215400    leafy palea     gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Laurel_Cooper         
 !GR_gene       GR:0080015      MADS1                   PMID:16146529   IMP                     Os03g0215400    open hull       gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080015      MADS1   stamen number   TO:0000225      PMID:16146529   IMP             T       Os03g0215400    reduced stamen number   gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080015      MADS1   carpel number   TO:0006013      PMID:16146529   IMP             T       Os03g0215400    increased carpel number gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080041      MADS13  female sterility        TO:0000358      PMID:10528264   IMP             T       Os12g0207000    female sterile  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080041      MADS13  reproductive homeotic development trait TO:0002613      PMID:10528264   IMP             T       Os12g0207000    ovules converted to carpels     gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080041      MADS13  flower development trait        TO:0000622      PMID:10528264   IMP             T       Os12g0207000    indeterminate flower growth     gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080015      MADS1           TO:0000225      PMID:16146529   IMP             T       Os03g0215400    reduced stamen number   gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080015      MADS1           TO:0006013      PMID:16146529   IMP             T       Os03g0215400    increased carpel number gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080041      MADS13          TO:0000358      PMID:10528264   IMP             T       Os12g0207000    female sterile  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080041      MADS13          TO:0002613      PMID:10528264   IMP             T       Os12g0207000    ovules converted to carpels     gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080041      MADS13          TO:0000622      PMID:10528264   IMP             T       Os12g0207000    indeterminate flower growth     gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0080041      MADS13                  PMID:10528264   IMP                     Os12g0207000    extra stigmas protruding from carpels   gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080025      MADS18  flowering time trait    TO:0002616      PMID:15299121   IMP             T       Os07g0605200    early flowering gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080025      MADS18  plant height    TO:0000207      PMID:15299121   IMP             T       Os07g0605200    dwarfism        gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080025      MADS18  shoot elongation rate   TO:0000368      PMID:15299121   IMP             T       Os07g0605200    low rate of internonde elongation       gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080025      MADS18  leaf sheath length      TO:0002689      PMID:15299121   IMP             T       Os07g0605200    reduction of length of leaf sheath      gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080021      MADS22  floral organ development trait  TO:0006022      PMID:15682279   IMP             T       Os02g0761000    aberrant floral morphogenesis   gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080021      MADS22  bract anatomy and morphology trait      TO:0000815      PMID:15682279   IMP             T       Os02g0761000    disorganized palea      gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080021      MADS22  glume length    TO:0020033      PMID:15682279   IMP             T       Os02g0761000    elongated glume gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080021      MADS22  floret number per spikelet      TO:0006033      PMID:15682279   IMP             T       Os02g0761000    Two-floret spikelet     gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080019      MDP1    seminal root length     TO:0000586      PMID:16827922   IMP             T       Os03g0186600    shortened primary roots gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080019      MDP1    coleoptile length       TO:0001007      PMID:16827922   IMP             T       Os03g0186600    elongated coleoptiles   gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080019      MDP1    leaf lamina joint bending       TO:0002688      PMID:16827922   IMP             T       Os03g0186600    enhanced lamina joint inclinations      gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080019      MEL1    meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:17675402   IMP             T       Os03g0800200    chromosome condensation arrested in early meiotic stage gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080019      MEL1    plant cell anatomy and morphology trait TO:0002683      PMID:17675402   IMP             T       Os03g0800200    irregularly sized pollen mother cell in anther  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080019      MEL1    plant cell anatomy and morphology trait TO:0002683      PMID:17675402   IMP             T       Os03g0800200    multinucleated pollen mother cell in anther     gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080019      MEL1    plant cell anatomy and morphology trait TO:0002683      PMID:17675402   IMP             T       Os03g0800200    vacuolated pollen mother cell in anther gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080008      MOC1    tillering ability       TO:0000329      PMID:12687001   IMP             T       Os06g0610300    Complete loss of tiller formation       gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0061178      MSP1    microsporocyte number   TO:0000726      PMID:12897248   IMP             T       Os01g0917500    excessive number of sporocytes  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080025      MADS18          TO:0002616      PMID:15299121   IMP             T       Os07g0605200    early flowering gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080025      MADS18          TO:0000207      PMID:15299121   IMP             T       Os07g0605200    dwarfism        gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080025      MADS18          TO:0000368      PMID:15299121   IMP             T       Os07g0605200    low rate of internonde elongation       gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080025      MADS18          TO:0002689      PMID:15299121   IMP             T       Os07g0605200    reduction of length of leaf sheath      gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080021      MADS22          TO:0006022      PMID:15682279   IMP             T       Os02g0761000    aberrant floral morphogenesis   gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080021      MADS22          TO:0000815      PMID:15682279   IMP             T       Os02g0761000    disorganized palea      gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080021      MADS22          TO:0020033      PMID:15682279   IMP             T       Os02g0761000    elongated glume gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080021      MADS22          TO:0006033      PMID:15682279   IMP             T       Os02g0761000    Two-floret spikelet     gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080019      MDP1            TO:0000586      PMID:16827922   IMP             T       Os03g0186600    shortened primary roots gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080019      MDP1            TO:0001007      PMID:16827922   IMP             T       Os03g0186600    elongated coleoptiles   gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080019      MDP1            TO:0002688      PMID:16827922   IMP             T       Os03g0186600    enhanced lamina joint inclinations      gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080019      MEL1            TO:0000729      PMID:17675402   IMP             T       Os03g0800200    chromosome condensation arrested in early meiotic stage gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080019      MEL1            TO:0002683      PMID:17675402   IMP             T       Os03g0800200    irregularly sized pollen mother cell in anther  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080019      MEL1            TO:0002683      PMID:17675402   IMP             T       Os03g0800200    multinucleated pollen mother cell in anther     gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080019      MEL1            TO:0002683      PMID:17675402   IMP             T       Os03g0800200    vacuolated pollen mother cell in anther gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080008      MOC1            TO:0000329      PMID:12687001   IMP             T       Os06g0610300    Complete loss of tiller formation       gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0061178      MSP1            TO:0000726      PMID:12897248   IMP             T       Os01g0917500    excessive number of sporocytes  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0061178      MSP1                    PMID:12897248   IMP                     Os01g0917500    disordered anther walls gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0061178      MSP1                    PMID:12897248   IMP                     Os01g0917500    loss of tapetum layer   gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0061178      MSP1    cell growth and development trait       TO:0002686      PMID:12897248   IMP             T       Os01g0917500    arrest of pollen mother cell development        gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0061178      MSP1    male sterility  TO:0000437      PMID:12897248   IMP             T       Os01g0917500    male sterile    gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080011      OSNOP   pollen free     TO:0000245      PMID:15952069   IMP             T       Os06g0607900    Pollen-less at flowering stage  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100119      PAIR1   meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    chromosomes become entangled during prophase 1  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100119      PAIR1   meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    chromosomes compact adhered to a nucleolus      gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100119      PAIR1   meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    chromosomes form sphere adhered to a nucleolus  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100119      PAIR1   meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    homologous pairing failed to occur      gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100119      PAIR1   male sterility  TO:0000437      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    complete sterility of male gametes      gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100119      PAIR1   female sterility        TO:0000358      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    complete sterility of female gametes    gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100119      PAIR1   meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    at anaphase I uneven spore production   gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100119      PAIR1   meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    at telophase 1 uneven spore production  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100120      PAIR2   sterility or fertility trait    TO:0000392      PMID:14758540   IMP             T       Os09g0506800    sterile gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100120      PAIR2   meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:14758540   IMP             T       Os09g0506800    Loss of homologous chromosome pairing   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      PLA1    basic vegetative phase  TO:0000461      PMID: 25243048  IMP             T       Os10g0403000    leaves differentiate faster in vegetative phase gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      PLA1    panicle number  TO:0000152      PMID: 25243048  IMP             T       Os10g0403000    panicle development disturbed   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      PLA1    shoot apical meristem development       TO:0006020      PMID: 25243048  IMP             T       Os10g0403000    larger shoot apical meristem    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0061182      PLA2    plastochron     TO:0000735      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    shortened plastochron   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0061182      PLA2    plant height    TO:0000207      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    dwarfism        gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0061182      PLA2    leaf size       TO:0002637      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    reduction of leaf size  gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0061182      PLA2    tiller number   TO:0000346      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    reduction of tiller number      gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0061182      PLA2    leaf growth and development trait       TO:0000655      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    acceleration of leaf maturation gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0061182      PLA2    shoot system growth and development trait       TO:0000654      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    ectopic shoot formation gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080013      PNH1    leaf growth and development trait       TO:0000655      PMID:12000455   IMP             T       Os06g0597400    malformed leaves        gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080013      PNH1    vascular leaf anatomy and morphology trait      TO:0000419      PMID:12000455   IMP             T       Os06g0597400    altered vascular arrangement    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080013      PNH1    plant structure anatomy and morphology trait    TO:0000839      PMID:12000455   IMP             T       Os06g0597400    abnormal internal structure     gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080061      PROG1   growth and development trait    TO:0000357      PMID:18820699   IMP             T       Os07g0153600    erect growth    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080061      PROG1   grain number    TO:0002759      PMID:18820699   IMP             T       Os07g0153600    greater grain number    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      PSD     relative growth rate    TO:0000515      PMID: 18850055  IMP             T       Os07g0613300    slow growth     gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      PSD     inflorescence development trait TO:0000621      PMID: 18850055  IMP             T       Os07g0613300    delayed panicle heading gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      PSD     fertility related trait TO:0000420      PMID: 18850055  IMP             T       Os07g0613300    reduced fertility       gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101187      PSS1    sterility or fertility trait    TO:0000392      PMID:17279367   IMP             T       Os08g0117000    pollen semi-sterility   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0061178      MSP1            TO:0002686      PMID:12897248   IMP             T       Os01g0917500    arrest of pollen mother cell development        gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0061178      MSP1            TO:0000437      PMID:12897248   IMP             T       Os01g0917500    male sterile    gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080011      OSNOP           TO:0000245      PMID:15952069   IMP             T       Os06g0607900    Pollen-less at flowering stage  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100119      PAIR1           TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    chromosomes become entangled during prophase 1  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100119      PAIR1           TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    chromosomes compact adhered to a nucleolus      gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100119      PAIR1           TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    chromosomes form sphere adhered to a nucleolus  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100119      PAIR1           TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    homologous pairing failed to occur      gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100119      PAIR1           TO:0000437      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    complete sterility of male gametes      gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100119      PAIR1           TO:0000358      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    complete sterility of female gametes    gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100119      PAIR1           TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    at anaphase I uneven spore production   gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100119      PAIR1           TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    at telophase 1 uneven spore production  gene    taxon:4530      20150427        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100120      PAIR2           TO:0000392      PMID:14758540   IMP             T       Os09g0506800    sterile gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100120      PAIR2           TO:0000729      PMID:14758540   IMP             T       Os09g0506800    Loss of homologous chromosome pairing   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      PLA1            TO:0000461      PMID: 25243048  IMP             T       Os10g0403000    leaves differentiate faster in vegetative phase gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      PLA1            TO:0000152      PMID: 25243048  IMP             T       Os10g0403000    panicle development disturbed   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      PLA1            TO:0006020      PMID: 25243048  IMP             T       Os10g0403000    larger shoot apical meristem    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0061182      PLA2            TO:0000735      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    shortened plastochron   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0061182      PLA2            TO:0000207      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    dwarfism        gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0061182      PLA2            TO:0002637      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    reduction of leaf size  gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0061182      PLA2            TO:0000346      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    reduction of tiller number      gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0061182      PLA2            TO:0000655      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    acceleration of leaf maturation gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0061182      PLA2            TO:0000654      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    ectopic shoot formation gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080013      PNH1            TO:0000655      PMID:12000455   IMP             T       Os06g0597400    malformed leaves        gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080013      PNH1            TO:0000419      PMID:12000455   IMP             T       Os06g0597400    altered vascular arrangement    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080013      PNH1            TO:0000839      PMID:12000455   IMP             T       Os06g0597400    abnormal internal structure     gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080061      PROG1           TO:0000357      PMID:18820699   IMP             T       Os07g0153600    erect growth    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080061      PROG1           TO:0002759      PMID:18820699   IMP             T       Os07g0153600    greater grain number    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      PSD             TO:0000515      PMID: 18850055  IMP             T       Os07g0613300    slow growth     gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      PSD             TO:0000621      PMID: 18850055  IMP             T       Os07g0613300    delayed panicle heading gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      PSD             TO:0000420      PMID: 18850055  IMP             T       Os07g0613300    reduced fertility       gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101187      PSS1            TO:0000392      PMID:17279367   IMP             T       Os08g0117000    pollen semi-sterility   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0101187      PSS1                    PMID:17279367   IMP                     Os08g0117000    anther indehiscence unaffected by growth duration       gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101187      PSS1    meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:17279367   IMP             T       Os08g0117000    female gamete normal    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100117      RCN1    days to heading TO:0000137      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    delayed heading gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100117      RCN1    leaf number     TO:0000241      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    increased leaf number in short-day conditions   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100117      RCN1    leaf number     TO:0000241      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    increased leaf number in long-day conditions    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100117      RCN1    inflorescence anatomy and morphology trait      TO:0000373      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    altered inflorescence morphology        gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100117      RCN1    primary branch number   TO:0000547      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    increased number of primary branches in inflorescence   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100117      RCN1    secondary branch number TO:0000557      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    increased number of secondary branches in inflorescence gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100117      RCN1    floret number   TO:0000670      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    increased number of florets     gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100118      RCN2    days to heading TO:0000137      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    delay in heading        gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100118      RCN2    leaf number     TO:0000241      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    increased number of leaves in short-day conditions      gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100118      RCN2    leaf number     TO:0000241      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    increased number of leaves in long-day conditions       gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100118      RCN2    inflorescence anatomy and morphology trait      TO:0000373      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    altered inflorescence morphology        gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100118      RCN2    primary branch number   TO:0000547      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    increased number of primary branches    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100118      RCN2    secondary branch number TO:0000557      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    increased number of secondary branches  gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0100118      RCN2    floret number   TO:0000670      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    increased number of florets     gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080028      REH1    root development trait  TO:0000656      PMID:16085936   IMP             T       Os02g0743400    Adventitious root development inhibited gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080028      REH1    tiller number   TO:0000346      PMID:16085936   IMP             T       Os02g0743400    altered tiller number   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080028      REH1    root to shoot ratio     TO:0000278      PMID:16085936   IMP             T       Os02g0743400    altered root to shoot ratio     gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080028      REH1    root number     TO:0000084      PMID:16085936   IMP             T       Os02g0743400    decrease advititious root number        gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080028      REH1    plant structure growth and development trait    TO:0000928      PMID:16085936   IMP             T       Os02g0743400    arrest of primordia emergence   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060839      SBE3    amylose content TO:0000196      PMID:8360192    IMP             T       Os02g0528200    exceptionally high levels of amylose    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      SCR     cell cycle trait        TO:0000728      PMID: 26023934  IMP             T       Os12g0122000    asymmetric cell division        gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060842      SD1     plant height    TO:0000207      PMID:11961544   IMP             T       Os01g0883800    semi-dwarf      gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060842      SD1     lodging incidence       TO:0000068      PMID:11961544   IMP             T       Os01g0883800    resistant to lodging at high fertilizer level   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060842      SD1     yield trait     TO:0000371      PMID:11961544   IMP             T       Os01g0883800    high yielding   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060842      SD1     cell cycle trait        TO:0000728      PMID:11961544   IMP             T       Os01g0883800    inhibition of cell division during elongation of internode      gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060842      SD1     enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:11961544   IMP             T       Os01g0883800    Defective in biosynthetic enzyme GA20ox-2 that catalyzed the conversion of GA53 to GA20 gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      SDR4    seed dormancy   TO:0000253      PMID: 26205956  IMP             T       Os07g0585700    pronounced seed dormancy        gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      SDR4    percent germination     TO:0010001      PMID: 26205956  IMP             T       Os07g0585700    seeds unable to germinate under favorable conditions    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060864      SE5     plant height    TO:0000207      PMID:10849355   IMP             T       Os06g0603000    Semi-dwarf      gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101187      PSS1            TO:0000729      PMID:17279367   IMP             T       Os08g0117000    female gamete normal    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100117      RCN1            TO:0000137      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    delayed heading gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100117      RCN1            TO:0000241      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    increased leaf number in short-day conditions   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100117      RCN1            TO:0000241      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    increased leaf number in long-day conditions    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100117      RCN1            TO:0000373      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    altered inflorescence morphology        gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100117      RCN1            TO:0000547      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    increased number of primary branches in inflorescence   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100117      RCN1            TO:0000557      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    increased number of secondary branches in inflorescence gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100117      RCN1            TO:0000670      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    increased number of florets     gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100118      RCN2            TO:0000137      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    delay in heading        gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100118      RCN2            TO:0000241      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    increased number of leaves in short-day conditions      gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100118      RCN2            TO:0000241      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    increased number of leaves in long-day conditions       gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100118      RCN2            TO:0000373      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    altered inflorescence morphology        gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100118      RCN2            TO:0000547      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    increased number of primary branches    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100118      RCN2            TO:0000557      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    increased number of secondary branches  gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0100118      RCN2            TO:0000670      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    increased number of florets     gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080028      REH1            TO:0000656      PMID:16085936   IMP             T       Os02g0743400    Adventitious root development inhibited gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080028      REH1            TO:0000346      PMID:16085936   IMP             T       Os02g0743400    altered tiller number   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080028      REH1            TO:0000278      PMID:16085936   IMP             T       Os02g0743400    altered root to shoot ratio     gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080028      REH1            TO:0000084      PMID:16085936   IMP             T       Os02g0743400    decrease advititious root number        gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080028      REH1            TO:0000928      PMID:16085936   IMP             T       Os02g0743400    arrest of primordia emergence   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060839      SBE3            TO:0000196      PMID:8360192    IMP             T       Os02g0528200    exceptionally high levels of amylose    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      SCR             TO:0000728      PMID: 26023934  IMP             T       Os12g0122000    asymmetric cell division        gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060842      SD1             TO:0000207      PMID:11961544   IMP             T       Os01g0883800    semi-dwarf      gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060842      SD1             TO:0000068      PMID:11961544   IMP             T       Os01g0883800    resistant to lodging at high fertilizer level   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060842      SD1             TO:0000371      PMID:11961544   IMP             T       Os01g0883800    high yielding   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060842      SD1             TO:0000728      PMID:11961544   IMP             T       Os01g0883800    inhibition of cell division during elongation of internode      gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060842      SD1             TO:0000599      PMID:11961544   IMP             T       Os01g0883800    Defective in biosynthetic enzyme GA20ox-2 that catalyzed the conversion of GA53 to GA20 gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      SDR4            TO:0000253      PMID: 26205956  IMP             T       Os07g0585700    pronounced seed dormancy        gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      SDR4            TO:0010001      PMID: 26205956  IMP             T       Os07g0585700    seeds unable to germinate under favorable conditions    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060864      SE5             TO:0000207      PMID:10849355   IMP             T       Os06g0603000    Semi-dwarf      gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0060864      SE5                     PMID:10849355   IMP                     Os06g0603000    few stems       gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060864      SE5     leaf color      TO:0000326      PMID:10849355   IMP             T       Os06g0603000    yellow leaves   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060864      SE5     days to flowering trait TO:0000344      PMID:10849355   IMP             T       Os06g0603000    early flowering gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0061191      SGR     chlorophyll content on intact leaf      TO:0012002      PMID:17513504   IMP             T       Os09g0532000    high chlorophyll content in leaves      gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060880      SHL2    shoot apical meristem development       TO:0006020      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    shoot apical meristem of the plant embryo is lacking    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060880      SHL2    coleoptile anatomy and morphology trait TO:0000753      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    coleoptile  of the plant embryo is lacking      gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060880      SHL2    plant embryo anatomy and morphology trait       TO:0000064      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    epiblast of the plant embryo is lacking gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060880      SHL2    shoot apical meristem development       TO:0006020      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    shoot apical meristem of the mature plant embryo is lacking     gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060880      SHL2    coleoptile anatomy and morphology trait TO:0000753      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    coleoptile  of the mature plant embryo is lacking       gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060880      SHL2    leaf width      TO:0000370      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    seedlings narrow leaves gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060880      SHL2    leaf size       TO:0002637      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    seedlings small leaves. gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060880      SHL2    seedling vigor  TO:0000280      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    Seedlings withered      gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060882      SHL4    shoot apical meristem development       TO:0006020      PMID:10409508   IMP             T       Os03g0449200    shoot apical meristem not differentiated        gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060882      SHL4    shoot system growth and development trait       TO:0000654      PMID:10409508   IMP             T       Os03g0449200    shoot fails to grow     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060864      SE5             TO:0000326      PMID:10849355   IMP             T       Os06g0603000    yellow leaves   gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060864      SE5             TO:0000344      PMID:10849355   IMP             T       Os06g0603000    early flowering gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0061191      SGR             TO:0012002      PMID:17513504   IMP             T       Os09g0532000    high chlorophyll content in leaves      gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060880      SHL2            TO:0006020      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    shoot apical meristem of the plant embryo is lacking    gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060880      SHL2            TO:0000753      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    coleoptile  of the plant embryo is lacking      gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060880      SHL2            TO:0000064      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    epiblast of the plant embryo is lacking gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060880      SHL2            TO:0006020      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    shoot apical meristem of the mature plant embryo is lacking     gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060880      SHL2            TO:0000753      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    coleoptile  of the mature plant embryo is lacking       gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060880      SHL2            TO:0000370      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    seedlings narrow leaves gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060880      SHL2            TO:0002637      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    seedlings small leaves. gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060880      SHL2            TO:0000280      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    Seedlings withered      gene    taxon:4530      20150429        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060882      SHL4            TO:0006020      PMID:10409508   IMP             T       Os03g0449200    shoot apical meristem not differentiated        gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060882      SHL4            TO:0000654      PMID:10409508   IMP             T       Os03g0449200    shoot fails to grow     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0060882      SHL4                    PMID:10409508   IMP                     Os03g0449200    coleoptile absent       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0060882      SHL4                    PMID:10409508   IMP                     Os03g0449200    epiblast absent gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0060882      SHL4                    PMID:10409508   IMP                     Os03g0449200    scutellum normal        gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0060882      SHL4                    PMID:10409508   IMP                     Os03g0449200    radicle normal  gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060882      SHL4    root development trait  TO:0000656      PMID:10409508   IMP             T       Os03g0449200    roots grow normally     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060883      SHO1    shoot apical meristem development       TO:0006020      GR_REF:1477     IMP             T       Os04g0509300    malformed shoot apical meristem gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060883      SHO1    plastochron     TO:0000735      GR_REF:1477     IMP             T       Os04g0509300    short plastochron       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060883      SHO1    leaf shape      TO:0000492      GR_REF:1477     IMP             T       Os04g0509300    aberrant leaves gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060883      SHO1    leaf number     TO:0000241      GR_REF:1477     IMP             T       Os04g0509300    increased leaf production       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060883      SHO1    leaf shape      TO:0000492      GR_REF:1477     IMP             T       Os04g0509300    leaves thread-like (short/narrow)       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060883      SHO1    shoot apical meristem development       TO:0006020      GR_REF:1477     IMP             T       Os04g0509300    shoot apical meristem flat      gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060883      SHO1    cell cycle trait        TO:0000728      GR_REF:1477     IMP             T       Os04g0509300    disorganized cell division in shoot meristem    gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060936      SL1     lemma morphology trait  TO:1000023      GR_REF:6472     IMP             T       Os01g0129200    degenerated lemma       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060936      SL1     palea morphology trait  TO:1000024      GR_REF:6472     IMP             T       Os01g0129200    degenerated palea       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060936      SL1     sterility or fertility trait    TO:0000392      GR_REF:6472     IMP             T       Os01g0129200    stamen nonfunctional    gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060936      SL1     male sterility  TO:0000437      GR_REF:6472     IMP             T       Os01g0129200    male sterile    gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060936      SL1     stamen anatomy and morphology trait     TO:0000215      GR_REF:6472     IMP             T       Os01g0129200    stamens malformed       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060936      SL1     reproductive homeotic development trait TO:0002613      GR_REF:6472     IMP             T       Os01g0129200    stamens transformed to pistils  gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060936      SL1     floret anatomy and morphology trait     TO:0000274      GR_REF:6472     IMP             T       Os01g0129200    Mutant floret has 3 ovaries     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060936      SL1     fertility related trait TO:0000420      GR_REF:6472     IMP             T       Os01g0129200    female fertile  gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060897      SLR     shoot system anatomy and morphology trait       TO:0000077      PMID:11340177   IMP             T       Os03g0707600    slender shoots  gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060897      SLR     internode length        TO:0000145      PMID:11340177   IMP             T       Os03g0707600    basal internodes elongated      gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060897      SLR     root number     TO:0000084      PMID:11340177   IMP             T       Os03g0707600    reduced root number     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060897      SLR     root length     TO:0000227      PMID:11340177   IMP             T       Os03g0707600    reduced root length     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060897      SLR     plant cell length       TO:0020107      PMID:11340177   IMP             T       Os03g0707600    increased cell length at leaf sheath    gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080036      SNB     floral bract number     TO:0006026      PMID:17144896   IMP             T       Os07g0235800    multiple rudimentary bracts     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080036      SNB     bract anatomy and morphology trait      TO:0000815      PMID:17144896   IMP             T       Os07g0235800    rudimentary bract       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080036      SNB     phyllotaxy      TO:0006014      PMID:17144896   IMP             T       Os07g0235800    bracts in alternative phyllotaxy        gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080036      SNB     anatomy and morphology trait    TO:0000017      PMID:17144896   IMP             T       Os07g0235800    interfered with subsequent floral architecture  gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060900      SP1     panicle length  TO:0000040      GR_REF:1712     IMP             T       Os11g0235200    short panicle   gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060900      SP1     primary branch number   TO:0000547      GR_REF:1712     IMP             T       Os11g0235200    absence of primary branches in lower part of ear axis   gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060900      SP1     spikelets per panicle length    TO:0000565      GR_REF:1712     IMP             T       Os11g0235200    spikelets per panicle decreased gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060900      SP1     primary branch number   TO:0000547      GR_REF:1712     IMP             T       Os11g0235200    primary branches per panicle reduced    gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060900      SP1     secondary branch number TO:0000557      GR_REF:1712     IMP             T       Os11g0235200    secondary branches per primary branch reduced   gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060900      SP1     relative spikelet number        TO:0001033      GR_REF:1712     IMP             T       Os11g0235200    number of spikelets per primary branch reduced  gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060900      SP1     relative spikelet number        TO:0001033      GR_REF:1712     IMP             T       Os11g0235200    number of spikelets per secondary branch reduced        gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080031      SPK     protein content TO:0000598      PMID:8325505    IMP             T       Os10G0539600    decreased amount of proteins    gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080031      SPK     protein composition related trait       TO:0000490      PMID:8325505    IMP             T       Os10G0539600    altered protein composition     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080031      SPK     endosperm storage protein content       TO:0002653      PMID:8325505    IMP             T       Os10G0539600    lacks seed storage      gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060912      SPL11   leaf lamina color       TO:0000299      PMID:10939258   IMP             T       Os12g0570000    rust colored spots over entire leaf blade during tillering      gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060912      SPL11   leaf midrib color       TO:0000720      PMID:10939258   IMP             T       Os12g0570000    rust colored spots most concentrated along midrib       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0060908      SPL7    leaf color      TO:0000326      PMID:12032317   IMP             T       Os05g0530400    reddish brown spots on leaves   gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080023      SPY     internode length        TO:0000145      PMID:17052323   IMP             T       Os08g0559300    elongation of lower internodes  gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080023      SPY     leaf lamina joint bending       TO:0002688      PMID:17052323   IMP             T       Os08g0559300    increased lamina joint bending  gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      STAR1   aluminum sensitivity    TO:0000354      PMID: 24253199  IMP             T       Os06g0695800    Sensitive to aluminum   gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060882      SHL4            TO:0000656      PMID:10409508   IMP             T       Os03g0449200    roots grow normally     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060883      SHO1            TO:0006020      GR_REF:1477     IMP             T       Os04g0509300    malformed shoot apical meristem gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060883      SHO1            TO:0000735      GR_REF:1477     IMP             T       Os04g0509300    short plastochron       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060883      SHO1            TO:0000492      GR_REF:1477     IMP             T       Os04g0509300    aberrant leaves gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060883      SHO1            TO:0000241      GR_REF:1477     IMP             T       Os04g0509300    increased leaf production       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060883      SHO1            TO:0000492      GR_REF:1477     IMP             T       Os04g0509300    leaves thread-like (short/narrow)       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060883      SHO1            TO:0006020      GR_REF:1477     IMP             T       Os04g0509300    shoot apical meristem flat      gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060883      SHO1            TO:0000728      GR_REF:1477     IMP             T       Os04g0509300    disorganized cell division in shoot meristem    gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060936      SL1             TO:1000023      GR_REF:6472     IMP             T       Os01g0129200    degenerated lemma       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060936      SL1             TO:1000024      GR_REF:6472     IMP             T       Os01g0129200    degenerated palea       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060936      SL1             TO:0000392      GR_REF:6472     IMP             T       Os01g0129200    stamen nonfunctional    gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060936      SL1             TO:0000437      GR_REF:6472     IMP             T       Os01g0129200    male sterile    gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060936      SL1             TO:0000215      GR_REF:6472     IMP             T       Os01g0129200    stamens malformed       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060936      SL1             TO:0002613      GR_REF:6472     IMP             T       Os01g0129200    stamens transformed to pistils  gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060936      SL1             TO:0000274      GR_REF:6472     IMP             T       Os01g0129200    Mutant floret has 3 ovaries     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060936      SL1             TO:0000420      GR_REF:6472     IMP             T       Os01g0129200    female fertile  gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060897      SLR             TO:0000077      PMID:11340177   IMP             T       Os03g0707600    slender shoots  gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060897      SLR             TO:0000145      PMID:11340177   IMP             T       Os03g0707600    basal internodes elongated      gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060897      SLR             TO:0000084      PMID:11340177   IMP             T       Os03g0707600    reduced root number     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060897      SLR             TO:0000227      PMID:11340177   IMP             T       Os03g0707600    reduced root length     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060897      SLR             TO:0020107      PMID:11340177   IMP             T       Os03g0707600    increased cell length at leaf sheath    gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080036      SNB             TO:0006026      PMID:17144896   IMP             T       Os07g0235800    multiple rudimentary bracts     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080036      SNB             TO:0000815      PMID:17144896   IMP             T       Os07g0235800    rudimentary bract       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080036      SNB             TO:0006014      PMID:17144896   IMP             T       Os07g0235800    bracts in alternative phyllotaxy        gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080036      SNB             TO:0000017      PMID:17144896   IMP             T       Os07g0235800    interfered with subsequent floral architecture  gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060900      SP1             TO:0000040      GR_REF:1712     IMP             T       Os11g0235200    short panicle   gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060900      SP1             TO:0000547      GR_REF:1712     IMP             T       Os11g0235200    absence of primary branches in lower part of ear axis   gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060900      SP1             TO:0000565      GR_REF:1712     IMP             T       Os11g0235200    spikelets per panicle decreased gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060900      SP1             TO:0000547      GR_REF:1712     IMP             T       Os11g0235200    primary branches per panicle reduced    gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060900      SP1             TO:0000557      GR_REF:1712     IMP             T       Os11g0235200    secondary branches per primary branch reduced   gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060900      SP1             TO:0001033      GR_REF:1712     IMP             T       Os11g0235200    number of spikelets per primary branch reduced  gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060900      SP1             TO:0001033      GR_REF:1712     IMP             T       Os11g0235200    number of spikelets per secondary branch reduced        gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080031      SPK             TO:0000598      PMID:8325505    IMP             T       Os10G0539600    decreased amount of proteins    gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080031      SPK             TO:0000490      PMID:8325505    IMP             T       Os10G0539600    altered protein composition     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080031      SPK             TO:0002653      PMID:8325505    IMP             T       Os10G0539600    lacks seed storage      gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060912      SPL11           TO:0000299      PMID:10939258   IMP             T       Os12g0570000    rust colored spots over entire leaf blade during tillering      gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060912      SPL11           TO:0000720      PMID:10939258   IMP             T       Os12g0570000    rust colored spots most concentrated along midrib       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0060908      SPL7            TO:0000326      PMID:12032317   IMP             T       Os05g0530400    reddish brown spots on leaves   gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080023      SPY             TO:0000145      PMID:17052323   IMP             T       Os08g0559300    elongation of lower internodes  gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080023      SPY             TO:0002688      PMID:17052323   IMP             T       Os08g0559300    increased lamina joint bending  gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      STAR1           TO:0000354      PMID: 24253199  IMP             T       Os06g0695800    Sensitive to aluminum   gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0101258      TatC                    PMID:11244106   IMP                     Os01g0501700    pale green shoot        gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101258      TatC    leaf color      TO:0000326      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    pale green leaves       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101258      TatC    chlorophyll content     TO:0000495      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    shoot reduction in total chlorophyll    gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101258      TatC    chlorophyll-a content   TO:0000293      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    shoot reduction of chlorophyll-a        gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101258      TatC    chlorophyll-b content   TO:0000295      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    shoot reduction of chlorophyll-b        gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101258      TatC    chlorophyll content     TO:0000495      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    leaf reduction in total chlorophyll     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101258      TatC    chlorophyll-a content   TO:0000293      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    leaf reduction of chlorophyll-a gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101258      TatC    chlorophyll-b content   TO:0000295      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    leaf reduction of chlorophyll-b gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101258      TatC    abscisic acid content   TO:0002667      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    basal level of abscisic acid (ABA) accumulation after 30minutes of drought treatment compared to rapid  accumulation of ABA after 30 min of drought treatment in wild type plants.      gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101258      TatC            TO:0000326      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    pale green leaves       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101258      TatC            TO:0000495      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    shoot reduction in total chlorophyll    gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101258      TatC            TO:0000293      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    shoot reduction of chlorophyll-a        gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101258      TatC            TO:0000295      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    shoot reduction of chlorophyll-b        gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101258      TatC            TO:0000495      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    leaf reduction in total chlorophyll     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101258      TatC            TO:0000293      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    leaf reduction of chlorophyll-a gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101258      TatC            TO:0000295      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    leaf reduction of chlorophyll-b gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101258      TatC            TO:0002667      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    basal level of abscisic acid (ABA) accumulation after 30minutes of drought treatment compared to rapid  accumulation of ABA after 30 min of drought treatment in wild type plants.      gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0101258      TatC                    PMID:11244106   IMP                     Os01g0501700    increased water loss from detached leaves       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080012      TB1     inflorescence branching TO:0000050      PMID:12581309   IMP             T       Os03g0706500    reduced lateral branching       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0020145      TDR     male sterility  TO:0000437      PMID:16896230   IMP             T       Os02g0120500    male sterile    gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0020145      TDR     plant organ growth and development trait        TO:0000927      PMID:16896230   IMP             T       Os02g0120500    abnormal stamen development     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0010807      TPC1    plant height    TO:0000207      PMID:15111725   IMP             T       Os01g0678500    Semidwarf       gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080007      UDT1    meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:16141453   IMP             T       Os07g0549600    tapeta failed to differentiate during meiotic stage     gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080007      UDT1    meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:16141453   IMP             T       Os07g0549600    tapeta became vacuolated during meiotic phase   gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080007      UDT1    meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:16141453   IMP             T       Os07g0549600    meiocytes did not develop to microspores        gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080007      UDT1    pollen free     TO:0000245      PMID:16141453   IMP             T       Os07g0549600    anther locules didn't contain pollen grains     gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      VP1     embryo development trait        TO:0000620      PMID: 20805329  IMP             T       Os01g0911700    arrest of embryo growth gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      WAF1    embryo development trait        TO:0000620      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    abnormal embryo development     gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080012      TB1             TO:0000050      PMID:12581309   IMP             T       Os03g0706500    reduced lateral branching       gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0020145      TDR             TO:0000437      PMID:16896230   IMP             T       Os02g0120500    male sterile    gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0020145      TDR             TO:0000927      PMID:16896230   IMP             T       Os02g0120500    abnormal stamen development     gene    taxon:4530      20150501        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0010807      TPC1            TO:0000207      PMID:15111725   IMP             T       Os01g0678500    Semidwarf       gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080007      UDT1            TO:0000729      PMID:16141453   IMP             T       Os07g0549600    tapeta failed to differentiate during meiotic stage     gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080007      UDT1            TO:0000729      PMID:16141453   IMP             T       Os07g0549600    tapeta became vacuolated during meiotic phase   gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080007      UDT1            TO:0000729      PMID:16141453   IMP             T       Os07g0549600    meiocytes did not develop to microspores        gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080007      UDT1            TO:0000245      PMID:16141453   IMP             T       Os07g0549600    anther locules didn't contain pollen grains     gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      VP1             TO:0000620      PMID: 20805329  IMP             T       Os01g0911700    arrest of embryo growth gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      WAF1            TO:0000620      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    abnormal embryo development     gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0000000      WAF1                    PMID: 20805329  IMP                     Os07g0164000    incomplete penetrance of seedling lethality     gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      WAF1    leaf anatomy and morphology trait       TO:0000748      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    abnormal leaf morphology        gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      WAF1    root length     TO:0000227      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    short roots     gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      WAF1    lateral root number     TO:0001013      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    few lateral roots       gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      WAF1    panicle length  TO:0000040      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    short panicle   gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      WAF1    inflorescence bract length      TO:0000817      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    elongated bracts        gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      WAF1    spikelet anatomy and morphology trait   TO:0000657      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    abnormal spikelet morphology    gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      WAF1    floral organ number     TO:0006038      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    reduced floral organ number     gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-!GR_gene       GR:0000000      WAF1    sterility related trait TO:0000485      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    sterile gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080022      WDA1    fat and essential oil composition related trait TO:0000491      PMID:17138699   IMP             T       Os10g0471100    defects in very-long-chain fatty acids in anther        gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080022      WDA1    inflorescence waxiness  TO:0000787      PMID:17138699   IMP             T       Os10g0471100    epicuticular wax absent on anther       gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      WAF1            TO:0000748      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    abnormal leaf morphology        gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      WAF1            TO:0000227      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    short roots     gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      WAF1            TO:0001013      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    few lateral roots       gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      WAF1            TO:0000040      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    short panicle   gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      WAF1            TO:0000817      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    elongated bracts        gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      WAF1            TO:0000657      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    abnormal spikelet morphology    gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      WAF1            TO:0006038      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    reduced floral organ number     gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+!GR_gene       GR:0000000      WAF1            TO:0000485      PMID: 20805329  IMP             T       Os07g0164000    sterile gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080022      WDA1            TO:0000491      PMID:17138699   IMP             T       Os10g0471100    defects in very-long-chain fatty acids in anther        gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080022      WDA1            TO:0000787      PMID:17138699   IMP             T       Os10g0471100    epicuticular wax absent on anther       gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0080022      WDA1                    PMID:17138699   IMP                     Os10g0471100    microspore development retarded gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0080022      WDA1                    PMID:17138699   IMP                     Os10g0471100    defective pollen exine formation in anthers     gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
 !GR_gene       GR:0080022      WDA1                    PMID:17138699   IMP                     Os10g0471100    primary alcohol levels reduced  gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080014      YAB1    stamen number   TO:0000225      PMID:15604733   IMP             T       Os07g0160100    produced additional stamens     gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0080014      YAB1    carpel number   TO:0006013      PMID:15604733   IMP             T       Os07g0160100    produced additional carpels     gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101186      ZEP1    leaf rolling    TO:0000085      PMID:11244106   IMP             T       Os04g0448900    wilty   gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101186      ZEP1    germination rate        TO:0000430      PMID:11244106   IMP             T       Os04g0448900    precocious germination  gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
-GR_gene        GR:0101186      ZEP1    abscisic acid content   TO:0002667      PMID:11244106   IMP             T       Os04g0448900    low abscisic acid levels        gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080014      YAB1            TO:0000225      PMID:15604733   IMP             T       Os07g0160100    produced additional stamens     gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0080014      YAB1            TO:0006013      PMID:15604733   IMP             T       Os07g0160100    produced additional carpels     gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101186      ZEP1            TO:0000085      PMID:11244106   IMP             T       Os04g0448900    wilty   gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101186      ZEP1            TO:0000430      PMID:11244106   IMP             T       Os04g0448900    precocious germination  gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
+GR_gene        GR:0101186      ZEP1            TO:0002667      PMID:11244106   IMP             T       Os04g0448900    low abscisic acid levels        gene    taxon:4530      20150504        Planteome:Ethan_Johnson         
index 2f5432641bffce1678e03f7398972bcbe6dda206..8fd98619fa4a4633f412fdde339531c99e07f7af 100644 (file)
-!gaf-version: 2.0
-!DB    DB_Object_ID     DB_Object_Symbol       Qualifier       TOid    PMID:25774204    Evidence       With(or)From    Aspect  DB_Object_Name  DB_Object_Synonym        DB_Object_Type Taxon   Date    Assigned_by             
-SGN_gene       197     b       beta-carotene content   TO:0002695      PMID:25774204   IMP             T       Solyc06g074240  high fruit beta-carotene        gene    taxon:4081      20150710        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       197     b       lycopene content        TO:0002699      PMID:25774204   IMP             T       Solyc06g074240  low fruit lycopene      gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       197     b       lycopene content        TO:0002699      PMID:25774204   IMP             T       Solyc06g074240  high fruit lycopene     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+!gaf-version: 2.0                      
+!DB    DB_Object_ID     DB_Object_Symbol               TOid    PMID:25774204    Evidence       With(or)From    Aspect  DB_Object_Name  DB_Object_Synonym        DB_Object_Type Taxon   Date    Assigned_by             
+SGN_gene       197     b               TO:0002695      PMID:25774204   IMP             T       Solyc06g074240  high fruit beta-carotene        gene    taxon:4081      20150710        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       197     b               TO:0002699      PMID:25774204   IMP             T       Solyc06g074240  low fruit lycopene      gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       197     b               TO:0002699      PMID:25774204   IMP             T       Solyc06g074240  high fruit lycopene     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      197     b                       PMID:25774204   IMP                     Solyc06g074240  tawny-orange corolla    gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       187     bsr4    bacterial disease resistance    TO:0000315      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g007850  resistance to bacterial spot    gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       187     bsr4            TO:0000315      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g007850  resistance to bacterial spot    gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      187     bsr4                    PMID:25774204   IMP                     Solyc05g007850  HR response against Xanthomonas campestris pv. vesicatoria      gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       799     det1    fruit color     TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g056340  mature green fruits are dark green (enhanced pigment)   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       799     det1    fruit color     TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g056340  immature green fruits are dark green    gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       799     det1    pigment content TO:0000494      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g056340  mature red fruits have enhanced pigment gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       799     det1            TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g056340  mature green fruits are dark green (enhanced pigment)   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       799     det1            TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g056340  immature green fruits are dark green    gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       799     det1            TO:0000494      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g056340  mature red fruits have enhanced pigment gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      5560    gamybl1                 PMID:25774204   IMP                     Solyc01g009070  no seed germination     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       5560    gamybl1 gibberellic acid content        TO:0002675      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g009070  gibberellin deficiency  gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       5560    gamybl1         TO:0002675      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g009070  gibberellin deficiency  gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      961     man4                    PMID:25774204   IMP                     Solyc01g008710  Inactive mannosidase in the fruit       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      292     y                       PMID:25774204   IMP                     Solyc01g079620  Decreased naringenin chalcone   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       292     y       epicarp color   TO:0002620      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g079620  Colorless fruit epidermis       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       292     y               TO:0002620      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g079620  Colorless fruit epidermis       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      8308    CD2                     PMID:25774204   IMP                     Solyc01g091630  Decreased cutin gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       253     chln    leaf vein color TO:0000719      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g100490  yellow leaf veins       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       253     chln    plant height    TO:0000207      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g100490  small plant size        gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       253     chln    leaf chlorosis  TO:0006060      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g100490  chlorotic upper leaves  gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       253     chln            TO:0000719      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g100490  yellow leaf veins       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       253     chln            TO:0000207      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g100490  small plant size        gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       253     chln            TO:0006060      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g100490  chlorotic upper leaves  gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      662     Gr                      PMID:25774204   IMP                     Solyc01g104340  green fruit flesh       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       662     Gr      lycopene content        TO:0002699      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g104340  decreased fruit lycopene        gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       662     Gr      ethylene sensitivity    TO:0000173      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g104340  reduced ethylene sensitivity in fruits  gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       662     Gr      leaf senescence TO:0000249      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g104340  delayed petal senescence        gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       662     Gr              TO:0002699      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g104340  decreased fruit lycopene        gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       662     Gr              TO:0000173      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g104340  reduced ethylene sensitivity in fruits  gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       662     Gr              TO:0000249      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g104340  delayed petal senescence        gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      662     Gr                      PMID:25774204   IMP                     Solyc01g104340  Delayed floral abscission       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       662     Gr      fruit growth and development trait      TO:0000929      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g104340  fruit softening inhibited       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1515    ddb1    chlorophyll content     TO:0000495      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g021650  chlorophyll increased   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1515    ddb1    carotenoid content      TO:0000496      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g021650  carotenoids increased   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       662     Gr              TO:0000929      PMID:25774204   IMP             T       Solyc01g104340  fruit softening inhibited       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1515    ddb1            TO:0000495      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g021650  chlorophyll increased   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1515    ddb1            TO:0000496      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g021650  carotenoids increased   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      1515    ddb1                    PMID:25774204   IMP                     Solyc02g021650  ascorbic acid increased gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      1515    ddb1                    PMID:25774204   IMP                     Solyc02g021650  increased plastid number        gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1515    ddb1    plastid development trait       TO:0002714      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g021650  increased plastid size  gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1515    ddb1    leaf color      TO:0000326      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g021650  dark green leaves       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1515    ddb1    fruit color     TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g021650  deep red fruits gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1515    ddb1            TO:0002714      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g021650  increased plastid size  gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1515    ddb1            TO:0000326      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g021650  dark green leaves       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1515    ddb1            TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g021650  deep red fruits gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      301     s                       PMID:25774204   IMP                     Solyc02g077390  compound inflorescence  gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       5483    LeT6    leaf midvein anatomy and morphology trait       TO:0000822      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g081120  midvein foreshortened   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       5483    LeT6    leaf vein size  TO:0000821      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g081120  lateral vein foreshortened      gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       5483    LeT6    petiole size    TO:0000768      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g081120  petiole foreshortened   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       5483    LeT6    vascular leaf anatomy and morphology trait      TO:0000419      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g081120  crumpled leaf   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       5483    LeT6            TO:0000822      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g081120  midvein foreshortened   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       5483    LeT6            TO:0000821      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g081120  lateral vein foreshortened      gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       5483    LeT6            TO:0000768      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g081120  petiole foreshortened   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       5483    LeT6            TO:0000419      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g081120  crumpled leaf   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      5483    LeT6                    PMID:25774204   IMP                     Solyc02g081120  Leaves 3-4 pinnately compound with clavate segments     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       5483    LeT6    internode length        TO:0000145      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g081120  Shortened internodes    gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       128     an      flower shape    TO:0000859      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g081670  flowers greatly changed gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       5483    LeT6            TO:0000145      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g081120  Shortened internodes    gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       128     an              TO:0000859      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g081670  flowers greatly changed gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      128     an                      PMID:25774204   IMP                     Solyc02g081670  compound inflorescence  gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1094    o       fruit shape     TO:0002628      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g085500  ovate fruit     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1094    o       fruit shape     TO:0002628      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g085500  pear shaped fruit       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1094    o               TO:0002628      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g085500  ovate fruit     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1094    o               TO:0002628      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g085500  pear shaped fruit       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      8213    CER6                    PMID:25774204   IMP                     Solyc02g085870  Increased water loss    gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      428     d                       PMID:25774204   IMP                     Solyc02g089160  All parts foreshortened gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       428     d       leaf color      TO:0000326      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g089160  leaves dark     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       428     d               TO:0000326      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g089160  leaves dark     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      428     d                       PMID:25774204   IMP                     Solyc02g089160  leaves rugose   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      428     d                       PMID:25774204   IMP                     Solyc02g089160  All parts extremely foreshortened       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      428     d                       PMID:25774204   IMP                     Solyc02g089160  All parts shortened     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1599    psy1    fruit color     TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g031860  yellow color of ripe fruit flesh        gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1599    psy1    fruit color     TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g031860  yellow fruit flesh      gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1599    psy1    flower color    TO:0000537      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g031860  lighter yellow flowers  gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1599    psy1    fruit color     TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g031860  reddish color of ripe fruit flesh       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1599    psy1            TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g031860  yellow color of ripe fruit flesh        gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1599    psy1            TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g031860  yellow fruit flesh      gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1599    psy1            TO:0000537      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g031860  lighter yellow flowers  gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1599    psy1            TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g031860  reddish color of ripe fruit flesh       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      4476    zep                     PMID:25774204   IMP                     Solyc02g090890  wilty   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       4476    zep     abscisic acid content   TO:0002667      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g090890  abscisic acid deficiency        gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       4476    zep             TO:0002667      PMID:25774204   IMP             T       Solyc02g090890  abscisic acid deficiency        gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      199     CrtR-b2                 PMID:25774204   IMP                     Solyc03g007960  buff color corolla      gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1418    sucr    sucrose content TO:0000328      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g083910  mature fruit accumulates sucrose        gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1418    sucr            TO:0000328      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g083910  mature fruit accumulates sucrose        gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      120     asc                     PMID:25774204   IMP                     Solyc03g114600  resistant to alternaria stem canker     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      532     fa                      PMID:25774204   IMP                     Solyc03g118160  giant   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      532     fa                      PMID:25774204   IMP                     Solyc03g118160  vegetative      gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       532     fa      inflorescence branching TO:0000050      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g118160  highly ramified inflorescence   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       532     fa      sterility related trait TO:0000485      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g118160  completely sterile      gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       431     div     plant height    TO:0000207      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g119060  small plant     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       532     fa              TO:0000050      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g118160  highly ramified inflorescence   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       532     fa              TO:0000485      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g118160  completely sterile      gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       431     div             TO:0000207      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g119060  small plant     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      431     div                     PMID:25774204   IMP                     Solyc03g119060  squarrose plant gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       431     div     leaf color      TO:0000326      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g119060  intercostally yellowish leaves  gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       431     div     leaf color      TO:0000326      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g119060  ventrally purple leaves gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       996     SlMlo1  fungal disease resistance       TO:0000439      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g049090  resistance to powdery mildew    gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       347     cu3     plant height    TO:0000207      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g051510  Dwarf   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       347     cu3     hypocotyl anatomy and morphology trait  TO:0000757      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g051510  short and thick hypocotyls      gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       347     cu3     fertility related trait TO:0000420      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g051510  reduced fertility.      gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       347     cu3     cotyledon anatomy and morphology trait  TO:0000749      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g051510  curled cotyledons       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       431     div             TO:0000326      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g119060  intercostally yellowish leaves  gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       431     div             TO:0000326      PMID:25774204   IMP             T       Solyc03g119060  ventrally purple leaves gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       996     SlMlo1          TO:0000439      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g049090  resistance to powdery mildew    gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       347     cu3             TO:0000207      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g051510  Dwarf   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       347     cu3             TO:0000757      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g051510  short and thick hypocotyls      gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       347     cu3             TO:0000420      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g051510  reduced fertility.      gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       347     cu3             TO:0000749      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g051510  curled cotyledons       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      347     cu3                     PMID:25774204   IMP                     Solyc04g051510  dense leaves    gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       347     cu3     leaf curling    TO:0002681      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g051510  curly leaves    gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       347     cu3     plant height    TO:0000207      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g051510  reduced height to 50%   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       8373    ORR     fruit ripening trait    TO:0002633      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g057980  orange ripening gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       347     cu3             TO:0002681      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g051510  curly leaves    gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       347     cu3             TO:0000207      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g051510  reduced height to 50%   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       8373    ORR             TO:0002633      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g057980  orange ripening gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      463     e                       PMID:25774204   IMP                     Solyc04g076850  few fused leaf segments gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       463     e       leaf midvein anatomy and morphology trait       TO:0000822      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g076850  distorted midvein       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       463     e               TO:0000822      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g076850  distorted midvein       gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      463     e                       PMID:25774204   IMP                     Solyc04g076850  entire or broad leaflets        gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       463     e       sepal anatomy and morphology trait      TO:0000864      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g076850  asymmetrical sepals     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       463     e       leaf anatomy and morphology trait       TO:0000748      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g076850  simple leaves   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       463     e       plant trait     TO:0000387      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g076850  multifusion phenotype   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       463     e               TO:0000864      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g076850  asymmetrical sepals     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       463     e               TO:0000748      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g076850  simple leaves   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       463     e               TO:0000387      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g076850  multifusion phenotype   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      4495    cwp1                    PMID:25774204   IMP                     Solyc04g082520  dehydration of fruits   gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      4495    cwp1                    PMID:25774204   IMP                     Solyc04g082520  microfissuring of fruit cuticle gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       900     lyr     leaf shape      TO:0000492      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g009380  first leaves entire (simple)    gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       900     lyr     leaf shape      TO:0000492      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g009380  other leaves fan shaped gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       900     lyr     female sterility        TO:0000358      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g009380  female sterile  gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1296    mc      sepal size      TO:0002604      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g012020  Sepal large     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1296    mc      sepal anatomy and morphology trait      TO:0000864      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g012020  Leaf-like sepal gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       900     lyr             TO:0000492      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g009380  first leaves entire (simple)    gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       900     lyr             TO:0000492      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g009380  other leaves fan shaped gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       900     lyr             TO:0000358      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g009380  female sterile  gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1296    mc              TO:0002604      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g012020  Sepal large     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1296    mc              TO:0000864      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g012020  Leaf-like sepal gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      1296    mc                      PMID:25774204   IMP                     Solyc05g012020  pedicel joint enlarged  gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1296    mc      inflorescence anatomy and morphology trait      TO:0000373      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g012020  inflorescence indeterminate     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       541     Fen     bacterial disease resistance    TO:0000315      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g013290  resistance to Pseudomonas syringae      gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1238    Pto     bacterial disease resistance    TO:0000315      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g013300  resistance to Pseudomonas syringae      gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1238    Pto     insecticide sensitivity TO:0000182      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g013300  fenthion sensitivity    gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1296    rin     fruit color     TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g056620  Fruits green at maturity        gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1296    rin     fruit color     TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g056620  Fruits turning bright yellow,   gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1296    rin     fruit ripening trait    TO:0002633      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g056620  retarded ripening       gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1296    mc              TO:0000373      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g012020  inflorescence indeterminate     gene    taxon:4081      20150713        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       541     Fen             TO:0000315      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g013290  resistance to Pseudomonas syringae      gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1238    Pto             TO:0000315      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g013300  resistance to Pseudomonas syringae      gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1238    Pto             TO:0000182      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g013300  fenthion sensitivity    gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1296    rin             TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g056620  Fruits green at maturity        gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1296    rin             TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g056620  Fruits turning bright yellow,   gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1296    rin             TO:0002633      PMID:25774204   IMP             T       Solyc05g056620  retarded ripening       gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      271     cf2                     PMID:25774204   IMP                     solyc06g008300  Resistant to Cladosporium fulvum        gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      1322    sp                      PMID:25774204   IMP                     Solyc06g074350  indeterminate growth habit      gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      1322    sp                      PMID:25774204   IMP                     Solyc06g074350  determinate habit       gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-!SGN_gene      43107   Cul1    self-incompatibility            PMID:25774204   IMP             T       Solyc06g084520  pollen rejection        gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+!SGN_gene      43107   Cul1                    PMID:25774204   IMP             T       Solyc06g084520  pollen rejection        gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      43107   Cul1                    PMID:25774204   IMP                     Solyc06g084520  compatibility on styles gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1068    not     leaf color      TO:0000326      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g056570  green-yellow leaves     gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1068    not     leaf anatomy and morphology trait       TO:0000748      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g056570  delicate leaves gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1068    not     leaf rolling    TO:0000085      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g056570  wilts in hot weather    gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1068    not     leaf rolling    TO:0000085      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g056570  wilts in dry weather    gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1068    not             TO:0000326      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g056570  green-yellow leaves     gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1068    not             TO:0000748      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g056570  delicate leaves gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1068    not             TO:0000085      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g056570  wilts in hot weather    gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1068    not             TO:0000085      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g056570  wilts in dry weather    gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      483     etr2                    PMID:25774204   IMP                     Solyc07g056580  delayed abscission      gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       483     etr2    internode length        TO:0000145      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g056580  shorter internode length        gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       780     ls      basal axillary branch number    TO:0020024      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g066250  Few or no axillary branches     gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       483     etr2            TO:0000145      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g056580  shorter internode length        gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       780     ls              TO:0020024      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g066250  Few or no axillary branches     gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      780     ls                      PMID:25774204   IMP                     Solyc07g066250  corolla suppressed      gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       780     ls      male sterility  TO:0000437      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g066250  partially male sterile  gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       661     gf      fruit color     TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc08g080090  ripe fruit purplish-brown color.        gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       762     lin5    sugar content   TO:0000333      PMID:25774204   IMP             T       Solyc09g010080  high fruit sugar        gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1164    phyA    red light sensitivity   TO:0000158      PMID:25774204   IMP             T       Solyc10g044670  far red light insensitive       gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       111013  sun     fruit length    TO:0002626      PMID:25774204   IMP             T       Solyc10g079240  elongated fruit shape   gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       246     crtiso  fruit color     TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc10g081650  fruit flesh orange      gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       780     ls              TO:0000437      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g066250  partially male sterile  gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       661     gf              TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc08g080090  ripe fruit purplish-brown color.        gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       762     lin5            TO:0000333      PMID:25774204   IMP             T       Solyc09g010080  high fruit sugar        gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1164    phyA            TO:0000158      PMID:25774204   IMP             T       Solyc10g044670  far red light insensitive       gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       111013  sun             TO:0002626      PMID:25774204   IMP             T       Solyc10g079240  elongated fruit shape   gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       246     crtiso          TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc10g081650  fruit flesh orange      gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      246     crtiso                  PMID:25774204   IMP                     Solyc10g081650  stamens orange  gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      246     crtiso                  PMID:25774204   IMP                     Solyc10g081650  yellowish growing point gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       246     crtiso  leaf color      TO:0000326      PMID:25774204   IMP             T       Solyc10g081650  light green foliage     gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       246     crtiso          TO:0000326      PMID:25774204   IMP             T       Solyc10g081650  light green foliage     gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      246     crtiso                  PMID:25774204   IMP                     Solyc10g081650  yellowing near growing point    gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       755     j       plant height    TO:0000207      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g010570  higher plant    gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       755     j       internode length        TO:0000145      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g010570  long internodes gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       755     j       fruit weight    TO:0002746      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g010570  heavier fruits  gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       755     j       seed number     TO:0000445      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g010570  less seeds      gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       755     j       inflorescence branch anatomy and morphology trait       TO:0000784      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g010570  Jointless pedicels      gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       755     j               TO:0000207      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g010570  higher plant    gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       755     j               TO:0000145      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g010570  long internodes gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       755     j               TO:0002746      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g010570  heavier fruits  gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       755     j               TO:0000445      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g010570  less seeds      gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       755     j               TO:0000784      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g010570  Jointless pedicels      gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      755     j                       PMID:25774204   IMP                     Solyc11g010570  proliferated inflorescence. Growth rate increased       gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      4504    GAI                     PMID:25774204   IMP                     Solyc11g011260  suppressed axillary bud development     gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1187    ptox    chlorophyll content     TO:0000495      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g011990  incomplete chlorophyll deficiency       gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       717     i2      fungal disease resistance       TO:0000439      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g071430  Resistance to Fusarium oxysporum        gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       538     fas     carpel anatomy and morphology trait     TO:0006012      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g071810  unfused carpels gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1187    ptox            TO:0000495      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g011990  incomplete chlorophyll deficiency       gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       717     i2              TO:0000439      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g071430  Resistance to Fusarium oxysporum        gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       538     fas             TO:0006012      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g071810  unfused carpels gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      538     fas                     PMID:25774204   IMP                     Solyc11g071810  Fruits many-loculed     gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       391     del     fruit color     TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc12g008980  reddish-orange mature fruit color       gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       391     del             TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc12g008980  reddish-orange mature fruit color       gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      391     del                     PMID:25774204   IMP                     Solyc12g008980  lycopene inhibition     gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       391     del     carotene content        TO:0000289      PMID:25774204   IMP             T       Solyc12g008980  increased delta-carotene        gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1605    yg2     leaf chlorosis  TO:0006060      PMID:25774204   IMP             T       Solyc12g009470  Foliage chlorotic yellow-green  gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1605    yg2     hypocotyl anatomy and morphology trait  TO:0000757      PMID:25774204   IMP             T       Solyc12g009470  long hypocotyls gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1605    yg2     leaf color      TO:0000326      PMID:25774204   IMP             T       Solyc12g009470  All foliar parts yellow gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       391     del             TO:0000289      PMID:25774204   IMP             T       Solyc12g008980  increased delta-carotene        gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1605    yg2             TO:0006060      PMID:25774204   IMP             T       Solyc12g009470  Foliage chlorotic yellow-green  gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1605    yg2             TO:0000757      PMID:25774204   IMP             T       Solyc12g009470  long hypocotyls gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1605    yg2             TO:0000326      PMID:25774204   IMP             T       Solyc12g009470  All foliar parts yellow gene    taxon:4081      20150714        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      482     etr1                    PMID:25774204   IMP                     Solyc12g011330  Delayed abscission      gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       482     etr1    internode length        TO:0000145      PMID:25774204   IMP             T       Solyc12g011330  Shorter internode length        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       482     etr1            TO:0000145      PMID:25774204   IMP             T       Solyc12g011330  Shorter internode length        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      482     etr1                    PMID:25774204   IMP                     Solyc12g011330  Reduced auxin movement  gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       277     cf9     fungal disease resistance       TO:0000439      PMID:25774204   IMP             T       AJ002236        Resistance to Cladosporium fulvum       gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       687     hero    nematode damage resistance      TO:0000384      PMID:25774204   IMP             T       AJ457051        Resistance to potato cyst nematode      gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       43154   HT-A    self-incompatibility    TO:0000310      PMID:25774204   IMP             T       AB066584        self-incompatibility    gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       43154   HT-A    gametophytic incompatibility    TO:0000049      PMID:25774204   IMP             T       AB066582        gametophytic self-incompatibility.      gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       277     cf9             TO:0000439      PMID:25774204   IMP             T       AJ002236        Resistance to Cladosporium fulvum       gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       687     hero            TO:0000384      PMID:25774204   IMP             T       AJ457051        Resistance to potato cyst nematode      gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       43154   HT-A            TO:0000310      PMID:25774204   IMP             T       AB066584        self-incompatibility    gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       43154   HT-A            TO:0000049      PMID:25774204   IMP             T       AB066582        gametophytic self-incompatibility.      gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      881     lc                      PMID:25774204   IMP                     JF284938        Reduced locule number   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      881     lc                      PMID:25774204   IMP                     JF285116        High locule number      gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1305    Mi1-2   nematode damage resistance      TO:0000384      PMID:25774204   IMP             T       SGN-U564276     High-level root-knot nematode resistance        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1305    Mi1-2   aphid resistance        TO:0006067      PMID:25774204   IMP             T       SGN-U564276     Resistance to potato aphids     gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1305    Mi1-2           TO:0000384      PMID:25774204   IMP             T       SGN-U564276     High-level root-knot nematode resistance        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1305    Mi1-2           TO:0006067      PMID:25774204   IMP             T       SGN-U564276     Resistance to potato aphids     gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      1305    Mi1-2                   PMID:25774204   IMP             T       SGN-U564276     Resistance to potato whitefly   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1345    sit     plant height    TO:0000207      PMID:25774204   IMP             T       HQ317907        Smaller plant   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1345    sit     leaf height     TO:0000541      PMID:25774204   IMP             T       HQ317907        very short leaves       gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1345    sit     leaf curling    TO:0002681      PMID:25774204   IMP             T       HQ317907        leaves down curled      gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1345    sit     leaf necrosis   TO:0000652      PMID:25774204   IMP             T       HQ317907        becoming necrotic       gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1345    sit     abscisic acid content   TO:0002667      PMID:25774204   IMP             T       HQ317908        Abscisic acid deficient gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1345    sit             TO:0000207      PMID:25774204   IMP             T       HQ317907        Smaller plant   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1345    sit             TO:0000541      PMID:25774204   IMP             T       HQ317907        very short leaves       gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1345    sit             TO:0002681      PMID:25774204   IMP             T       HQ317907        leaves down curled      gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1345    sit             TO:0000652      PMID:25774204   IMP             T       HQ317907        becoming necrotic       gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1345    sit             TO:0002667      PMID:25774204   IMP             T       HQ317908        Abscisic acid deficient gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      1345    sit                     PMID:25774204   IMP                     HQ317908        wilty   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      1462    tm2                     PMID:25774204   IMP                     FJ817603        High-level tobacco mosaic virus resistance      gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      111014  wo                      PMID:25774204   IMP                     Solyc02g080490  All parts densely pubescent     gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      111014  wo                      PMID:25774204   IMP                     Solyc02g080490  wooly   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      212     bl                      PMID:25774204   IMP                     Solyc11g069030  Determinate habit       gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      212     bl                      PMID:25774204   IMP                     Solyc11g069030  strongly uprolled pinnae        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       212     bl      flower shape    TO:0000859      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g069030  fasciated flowers       gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       212     bl      fruit shape     TO:0002628      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g069030  fasciated fruits        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       212     bl      stem anatomy and morphology trait       TO:0000361      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g069030  Stem terminating in first inflorescence gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       212     bl              TO:0000859      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g069030  fasciated flowers       gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       212     bl              TO:0002628      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g069030  fasciated fruits        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       212     bl              TO:0000361      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g069030  Stem terminating in first inflorescence gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      212     bl                      PMID:25774204   IMP                     Solyc11g069030  midribs may develop adventitious shoots gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      212     bl                      PMID:25774204   IMP                     Solyc11g069030  Determinant growth      gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       212     bl      sepal anatomy and morphology trait      TO:0000864      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g069030  leafy calyx     gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       212     bl      sepal anatomy and morphology trait      TO:0000864      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g069030  enlarged calyx  gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       212     bl      inflorescence anatomy and morphology trait      TO:0000373      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g069030  few flowered inflorescence      gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1045    nr      fruit ripening trait    TO:0002633      PMID:25774204   IMP             T       Solyc09g075440  Fruits ripen slowly     gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1045    nr      fruit color     TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc09g075440  Fruits dirty orange color       gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1046    Nr2     fruit color     TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc09g075440  Fruit flesh turns slowly to yellowish green     gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1046    Nr2     fruit firmness  TO:0002634      PMID:25774204   IMP             T       Solyc09g075440  fruit flesh firm        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       555     flc     leaf color      TO:0000326      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g066480  yellowish leaves        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       555     flc     leaf rolling    TO:0000085      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g066480  overwilting leaves      gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       555     flc     leaf height     TO:0000541      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g066480  short leaves    gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       212     bl              TO:0000864      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g069030  leafy calyx     gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       212     bl              TO:0000864      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g069030  enlarged calyx  gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       212     bl              TO:0000373      PMID:25774204   IMP             T       Solyc11g069030  few flowered inflorescence      gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1045    nr              TO:0002633      PMID:25774204   IMP             T       Solyc09g075440  Fruits ripen slowly     gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1045    nr              TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc09g075440  Fruits dirty orange color       gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1046    Nr2             TO:0002617      PMID:25774204   IMP             T       Solyc09g075440  Fruit flesh turns slowly to yellowish green     gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1046    Nr2             TO:0002634      PMID:25774204   IMP             T       Solyc09g075440  fruit flesh firm        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       555     flc             TO:0000326      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g066480  yellowish leaves        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       555     flc             TO:0000085      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g066480  overwilting leaves      gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       555     flc             TO:0000541      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g066480  short leaves    gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      555     flc                     PMID:25774204   IMP                     Solyc07g066480  nearly unbranched plant and later spreading     gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      555     flc                     PMID:25774204   IMP                     Solyc07g066480  erect plant     gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       555     flc     plant height    TO:0000207      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g066480  small plant     gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       539     fer     leaf chlorosis  TO:0006060      PMID:25774204   IMP             T       Solyc06g051550  Severe chlorosis beginning in first true leaves gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       539     fer     mineral and ion transport trait TO:0020096      PMID:25774204   IMP             T       Solyc06g051550  faulty iron transport in xylem  gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       776     la      leaf anatomy and morphology trait       TO:0000748      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062680  simple leaves   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       776     la      leaf anatomy and morphology trait       TO:0000748      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062680  entire leaves   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       776     la      leaf size       TO:0002637      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062680  small leaves    gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       776     la      leaf length     TO:0000135      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062680  elongated leaves        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       776     la      stem width      TO:0001035      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062680  slender stems   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       776     la      inflorescence branching TO:0000050      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062680  excessively branched    gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       776     la      fruit size      TO:0002625      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062680  small fruits    gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       8229    GOB     leaf anatomy and morphology trait       TO:0000748      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062840  simple leaves   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       8229    GOB     shoot apical meristem development       TO:0006020      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062840  shoot apical meristem terminates        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1465    APS1    gravity response trait  TO:0002693      PMID:25774204   IMP             T               In seedlings, roots grow agravitropicaly for first 4-5 days after germination, then gradually re-orientation towards gravity.   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1465    APS1    gravity response trait  TO:0002693      PMID:25774204   IMP             T       APS1    Shoots show mild agravitropism throughout life of plant.        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1465    APS1    fruit size      TO:0002625      PMID:25774204   IMP             T       APS1    Fruit size slightly reduced.    gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       555     flc             TO:0000207      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g066480  small plant     gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       539     fer             TO:0006060      PMID:25774204   IMP             T       Solyc06g051550  Severe chlorosis beginning in first true leaves gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       539     fer             TO:0020096      PMID:25774204   IMP             T       Solyc06g051550  faulty iron transport in xylem  gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       776     la              TO:0000748      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062680  simple leaves   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       776     la              TO:0000748      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062680  entire leaves   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       776     la              TO:0002637      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062680  small leaves    gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       776     la              TO:0000135      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062680  elongated leaves        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       776     la              TO:0001035      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062680  slender stems   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       776     la              TO:0000050      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062680  excessively branched    gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       776     la              TO:0002625      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062680  small fruits    gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       8229    GOB             TO:0000748      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062840  simple leaves   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       8229    GOB             TO:0006020      PMID:25774204   IMP             T       Solyc07g062840  shoot apical meristem terminates        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1465    APS1            TO:0002693      PMID:25774204   IMP             T               In seedlings, roots grow agravitropicaly for first 4-5 days after germination, then gradually re-orientation towards gravity.   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1465    APS1            TO:0002693      PMID:25774204   IMP             T       APS1    Shoots show mild agravitropism throughout life of plant.        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1465    APS1            TO:0002625      PMID:25774204   IMP             T       APS1    Fruit size slightly reduced.    gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      1465    APS1                    PMID:25774204   IMP                     APS1    Root tips do not stain for starch using Lugol's iodine solution.        gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      1465    APS1                    PMID:25774204   IMP                     APS1    leaves do not stain for starch using Lugol's iodine solution.   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      1465    APS1                    PMID:25774204   IMP                     APS1    fruit do not stain for starch using Lugol's iodine solution.    gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      1465    APS1                    PMID:25774204   IMP                     APS1    stems do not stain for starch using Lugol's iodine solution.    gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1465    APS1    starch content  TO:0000696      PMID:25774204   IMP             T       APS1    Starch levels in mature green fruit below detection limit of spectrophotometric assay.  gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       1465    APS1    sugar content   TO:0000333      PMID:25774204   IMP             T       APS1    BRIX levels slightly lower than wild type.      gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       20827   rdr6    leaf width      TO:0000370      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g014870  slender leaves  gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       20827   rdr6    plant height    TO:0000207      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g014870  dwarfed plant   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       20827   rdr6    petal width     TO:0002606      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g014870  slender petals  gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
-SGN_gene       20827   rdr6    leaf shape      TO:0000492      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g014870  shoestring leaves       gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1465    APS1            TO:0000696      PMID:25774204   IMP             T       APS1    Starch levels in mature green fruit below detection limit of spectrophotometric assay.  gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       1465    APS1            TO:0000333      PMID:25774204   IMP             T       APS1    BRIX levels slightly lower than wild type.      gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       20827   rdr6            TO:0000370      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g014870  slender leaves  gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       20827   rdr6            TO:0000207      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g014870  dwarfed plant   gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       20827   rdr6            TO:0002606      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g014870  slender petals  gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
+SGN_gene       20827   rdr6            TO:0000492      PMID:25774204   IMP             T       Solyc04g014870  shoestring leaves       gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
 !SGN_gene      20827   rdr6                    PMID:25774204   IMP                     Solyc04g014870  no leaf blade expansion gene    taxon:4081      20150715        Planteome:Ethan_Johnson         
index c273203e4ac929755c5ea9269e61713b6f24e2a3..ab363f484f7445e038609eddb8ed3f63d1982241 100644 (file)
-!gaf-version: 2.0
-!DB    DB_Object_ID     DB_Object_Symbol       Qualifier       TOid    DB:Reference     Evidence       With(or)From    Aspect  DB_Object_Name  DB_Object_Synonym        DB_Object_Type Taxon   Date    Assigned_by             
-MaizeGDB       104331  ns2     internode length        TO:0000145      PMID:17571927   IMP             T       NM_001111772.1  extremely shortened internodes  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       104331  ns2     plant height    TO:0000207      PMID:17571927   IMP             T       NM_001111772.1  Plants are reduced in height    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       104331  ns2     stem elongation TO:0006036      PMID:17571927   IMP             T       NM_001111772.1  Plants (stems) do not elongate in response to gibberellins.     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       106358  crs2    leaf color      TO:0000326      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G132021   Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       111820  abph1   leaf anatomy and morphology trait       TO:0000748      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G035688   Two leaves at each node, in decussate phyllotaxy.       gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       112957  bsd2    chloroplast development trait   TO:0002715      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G062788   chloroplasts contain rudimentary lamellae       gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       112957  bsd2    seedling cotyledon color        TO:0000750      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G062788   seedling leaves red fluorescence under long-wave uv     gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       112957  bsd2    seedling growth and development trait   TO:0000949      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G062788   seedling dies after endosperm is used up        gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       113518  ms26    anther shape    TO:0000214      PMID:24112765   IMP             T       GRMZM2G091822   Anthers shriveled       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       113518  ms26    male sterility  TO:0000437      PMID:24112765   IMP             T       GRMZM2G091822   Male sterile    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       113518  ms26    pollen free     TO:0000245      PMID:24112765   IMP             T       GRMZM2G091822   Pollen absent or aborted.       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       114025  rtcs1   lateral root number     TO:0001013      PMID:23843603   IMP             T       GRMZM2G092542   few or no secondary roots       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12000   a1      aleurone layer color    TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G026930   Aleurone layer is colored       gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12000   a1      aleurone layer color    TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G026930   no color in aleurone    gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12000   a1      anther color    TO:0000187      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G026930   anthers are green       gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12000   a1      anthocyanin content     TO:0000071      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G026930   lack of anthocyanins in aleurone        gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12000   a1      pericarp color  TO:0000707      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G026930   The pericarp is brown   gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12000   a1      seedling vigor  TO:0000280      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G026930   seedling dies   gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12000   a1      style color     TO:0000676      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G026930   silks are green gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12006   a2      aleurone layer color    TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G345717   Aleurone layer is colored       gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12006   a2      anther color    TO:0000187      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G345717   anthers are green       gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12028   ae1     endosperm quality       TO:0000587      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G032628   kernel is sweet at milk stage; typical of su1   gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12028   ae1     enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G032628   starch debranching enzyme I absent in developing endosperm      gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12028   ae1     wrinkled seed   TO:0000718      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G032628   kernel is wrinkled, hard and translucent when dry       gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12029   afd1    anther shape    TO:0000214      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G059037   Anthers shriveled       gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12029   afd1    male sterility  TO:0000437      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G059037   Male sterile    gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12029   afd1    pollen free     TO:0000245      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G059037   Pollen absent or aborted.       gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+!gaf-version: 2.0                      
+!DB    DB_Object_ID     DB_Object_Symbol               TOid    DB:Reference     Evidence       With(or)From    Aspect  DB_Object_Name  DB_Object_Synonym        DB_Object_Type Taxon   Date    Assigned_by             
+MaizeGDB       104331  ns2             TO:0000145      PMID:17571927   IMP             T       NM_001111772.1  extremely shortened internodes  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       104331  ns2             TO:0000207      PMID:17571927   IMP             T       NM_001111772.1  Plants are reduced in height    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       104331  ns2             TO:0006036      PMID:17571927   IMP             T       NM_001111772.1  Plants (stems) do not elongate in response to gibberellins.     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       106358  crs2            TO:0000326      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G132021   Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       111820  abph1           TO:0000748      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G035688   Two leaves at each node, in decussate phyllotaxy.       gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       112957  bsd2            TO:0002715      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G062788   chloroplasts contain rudimentary lamellae       gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       112957  bsd2            TO:0000750      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G062788   seedling leaves red fluorescence under long-wave uv     gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       112957  bsd2            TO:0000949      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G062788   seedling dies after endosperm is used up        gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       113518  ms26            TO:0000214      PMID:24112765   IMP             T       GRMZM2G091822   Anthers shriveled       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       113518  ms26            TO:0000437      PMID:24112765   IMP             T       GRMZM2G091822   Male sterile    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       113518  ms26            TO:0000245      PMID:24112765   IMP             T       GRMZM2G091822   Pollen absent or aborted.       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       114025  rtcs1           TO:0001013      PMID:23843603   IMP             T       GRMZM2G092542   few or no secondary roots       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12000   a1              TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G026930   Aleurone layer is colored       gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12000   a1              TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G026930   no color in aleurone    gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12000   a1              TO:0000187      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G026930   anthers are green       gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12000   a1              TO:0000071      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G026930   lack of anthocyanins in aleurone        gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12000   a1              TO:0000707      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G026930   The pericarp is brown   gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12000   a1              TO:0000280      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G026930   seedling dies   gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12000   a1              TO:0000676      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G026930   silks are green gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12006   a2              TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G345717   Aleurone layer is colored       gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12006   a2              TO:0000187      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G345717   anthers are green       gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12028   ae1             TO:0000587      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G032628   kernel is sweet at milk stage; typical of su1   gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12028   ae1             TO:0000599      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G032628   starch debranching enzyme I absent in developing endosperm      gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12028   ae1             TO:0000718      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G032628   kernel is wrinkled, hard and translucent when dry       gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12029   afd1            TO:0000214      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G059037   Anthers shriveled       gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12029   afd1            TO:0000437      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G059037   Male sterile    gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12029   afd1            TO:0000245      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G059037   Pollen absent or aborted.       gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12048   an1                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   Producing both bisexual and male flowers on the same plant. Synonym: andromonoecious.   gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12048   an1     flower development trait        TO:0000622      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   Ear florets are hermaphroditic; most easily observed in unfertilized ear.       gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12048   an1     internode length        TO:0000145      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   internode elongation reduced    gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12048   an1     leaf length     TO:0000135      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   short leaves    gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12048   an1     leaf width      TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   broad leaves    gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12048   an1     leaf width      TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   leaf width excess       gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12048   an1     phyllotaxy      TO:0006014      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   compact leaves  gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12048   an1     plant height    TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   Dwarf   gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12048   an1     plant height    TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   The plant is shorter    gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12048   an1     tassel branch number    TO:0000813      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   tassel branches few     gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12065   b1      aleurone layer color    TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G172795   Aleurone layer is colored       gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12065   b1      anthocyanin content     TO:0000071      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G172795   anthocyanin pigmented sectors in aleurone       gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12065   b1      anthocyanin content     TO:0000071      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G172795   blotches of anthocyanin pigmentation due to cell to cell variability in the levels of anthocyanin production.   gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12065   b1      stem color      TO:0000056      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G172795   striped stems   gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12065   b1      variegated leaf TO:0000069      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G172795   striped leaves  gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12048   an1             TO:0000622      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   Ear florets are hermaphroditic; most easily observed in unfertilized ear.       gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12048   an1             TO:0000145      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   internode elongation reduced    gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12048   an1             TO:0000135      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   short leaves    gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12048   an1             TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   broad leaves    gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12048   an1             TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   leaf width excess       gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12048   an1             TO:0006014      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   compact leaves  gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12048   an1             TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   Dwarf   gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12048   an1             TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   The plant is shorter    gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12048   an1             TO:0000813      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G081554   tassel branches few     gene    taxon:4577      20150527        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12065   b1              TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G172795   Aleurone layer is colored       gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12065   b1              TO:0000071      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G172795   anthocyanin pigmented sectors in aleurone       gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12065   b1              TO:0000071      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G172795   blotches of anthocyanin pigmentation due to cell to cell variability in the levels of anthocyanin production.   gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12065   b1              TO:0000056      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G172795   striped stems   gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12065   b1              TO:0000069      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G172795   striped leaves  gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12070   bd1                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G307119   pistils abort, no silks gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12070   bd1                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G307119   silks absent    gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12070   bd1     fascicled ear   TO:0000715      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G307119   ear is branched gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12077   bk2     leaf shattering TO:0000108      PMID:17932309   IMP             T       GRMZM2G109326   leaves shatter after moderate winds     gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12077   bk2     plant structure anatomy and morphology trait    TO:0000839      PMID:17932309   IMP             T       GRMZM2G109326   brittle plant parts after 4-leaf stage  gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12070   bd1             TO:0000715      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G307119   ear is branched gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12077   bk2             TO:0000108      PMID:17932309   IMP             T       GRMZM2G109326   leaves shatter after moderate winds     gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12077   bk2             TO:0000839      PMID:17932309   IMP             T       GRMZM2G109326   brittle plant parts after 4-leaf stage  gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12079   bm1                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G844562   brown pigment in vascular bundles of the sheath, midribs, and blades    gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12079   bm1     cob color       TO:0000924      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G844562   brown pigment in vascular bundles of cob        gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12079   bm1     leaf midrib color       TO:0000720      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G844562   brown pigment first visible as a reddish-brown pigmentation of the midrib at the 4-6 leaf stage.        gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12079   bm1     lignin content  TO:0000731      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G844562   The amount of lignin in the leaves is reduced   gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12079   bm1     root color      TO:0000065      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G844562   brown pigment in vascular bundles of roots      gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12079   bm1             TO:0000924      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G844562   brown pigment in vascular bundles of cob        gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12079   bm1             TO:0000720      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G844562   brown pigment first visible as a reddish-brown pigmentation of the midrib at the 4-6 leaf stage.        gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12079   bm1             TO:0000731      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G844562   The amount of lignin in the leaves is reduced   gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12079   bm1             TO:0000065      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G844562   brown pigment in vascular bundles of roots      gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12081   bm3                     PMID:21423772   IMP             T       AC196475.3_FG004        brown pigment in vascular bundles of the sheath, midribs, and blades    gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12081   bm3     cob color       TO:0000924      PMID:21423772   IMP             T       AC196475.3_FG004        brown pigment in vascular bundles of cob        gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12081   bm3     leaf midrib color       TO:0000720      PMID:21423772   IMP             T       AC196475.3_FG004        brown pigment first visible as a reddish-brown pigmentation of the midrib at the 4-6 leaf stage.        gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12081   bm3     lignin content  TO:0000731      PMID:21423772   IMP             T       AC196475.3_FG004        The amount of lignin in the leaves is reduced   gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12081   bm3     root color      TO:0000065      PMID:21423772   IMP             T       AC196475.3_FG004        brown pigment in vascular bundles of roots      gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12091   T1      brittle endosperm       TO:0000713      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144081   mature kernel brittle   gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12091   T1      brittle endosperm       TO:0000713      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144081   texture of endosperm is brittle gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12091   T1      endosperm color TO:0000487      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144081   endosperm is opaque     gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12091   T1      fruit shape     TO:0002628      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144081   mature kernel angular   gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12091   T1      shrunken endosperm      TO:0000100      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144081   endosperm collapsed     gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12091   T1      shrunken endosperm      TO:0000100      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144081   mature kernel collapsed gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12081   bm3             TO:0000924      PMID:21423772   IMP             T       AC196475.3_FG004        brown pigment in vascular bundles of cob        gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12081   bm3             TO:0000720      PMID:21423772   IMP             T       AC196475.3_FG004        brown pigment first visible as a reddish-brown pigmentation of the midrib at the 4-6 leaf stage.        gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12081   bm3             TO:0000731      PMID:21423772   IMP             T       AC196475.3_FG004        The amount of lignin in the leaves is reduced   gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12081   bm3             TO:0000065      PMID:21423772   IMP             T       AC196475.3_FG004        brown pigment in vascular bundles of roots      gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12091   T1              TO:0000713      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144081   mature kernel brittle   gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12091   T1              TO:0000713      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144081   texture of endosperm is brittle gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12091   T1              TO:0000487      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144081   endosperm is opaque     gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12091   T1              TO:0002628      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144081   mature kernel angular   gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12091   T1              TO:0000100      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144081   endosperm collapsed     gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12091   T1              TO:0000100      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144081   mature kernel collapsed gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12092   T2                      PMID:25600571   IMP             T       GRMZM2G068506   No mRNA is produced from the T2 gene    gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12098   bz1     aleurone layer color    TO:0000943      PMID:25201957   IMP             T       GRMZM2G165390   Aleurone color is bronze        gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12098   bz1     fluorescence related trait      TO:0012006      PMID:25201957   IMP             T       GRMZM2G165390   Shedding tassels viewed under UV light show bright yellow fluorescence in the anthers   gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12098   bz1     plant color     TO:0000708      PMID:25201957   IMP             T       GRMZM2G165390   Whole plant color can be bronze gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12099   bz2     aleurone layer color    TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G016241   Aleurone color is bronze        gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12099   bz2     plant color     TO:0000708      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G016241   Whole plant color can be bronze gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12101   c1      aleurone layer appearance       TO:0000944      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G005066   aleurone layer mottled  gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12101   c1      aleurone layer color    TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G005066   Aleurone layer is colored       gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12102   c2      aleurone layer appearance       TO:0000944      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G422750   aleurone layer mottled  gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12115   cg1     basal tiller number     TO:0001004      PMID:21987797   IMP             T       GRMZM2G022489   Plant produces many lateral branches (tillers) at its base.     gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12115   cg1     basic vegetative phase  TO:0000461      PMID:21987797   IMP             T       GRMZM2G022489   often vegetative leaves in the ear and tassle   gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12115   cg1     ear length      TO:0000431      PMID:21987797   IMP             T       GRMZM2G022489   highly reduced ears     gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12115   cg1     leaf width      TO:0000370      PMID:21987797   IMP             T       GRMZM2G022489   narrow leaves   gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12115   cg1     tassel inflorescence anatomy and morphology trait       TO:0000788      PMID:21987797   IMP             T       GRMZM2G022489   highly reduced tassel   gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12115   cg1     tillering ability       TO:0000329      PMID:21987797   IMP             T       GRMZM2G022489   extreme tillering       gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12098   bz1             TO:0000943      PMID:25201957   IMP             T       GRMZM2G165390   Aleurone color is bronze        gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12098   bz1             TO:0012006      PMID:25201957   IMP             T       GRMZM2G165390   Shedding tassels viewed under UV light show bright yellow fluorescence in the anthers   gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12098   bz1             TO:0000708      PMID:25201957   IMP             T       GRMZM2G165390   Whole plant color can be bronze gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12099   bz2             TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G016241   Aleurone color is bronze        gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12099   bz2             TO:0000708      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G016241   Whole plant color can be bronze gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12101   c1              TO:0000944      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G005066   aleurone layer mottled  gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12101   c1              TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G005066   Aleurone layer is colored       gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12102   c2              TO:0000944      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G422750   aleurone layer mottled  gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12115   cg1             TO:0001004      PMID:21987797   IMP             T       GRMZM2G022489   Plant produces many lateral branches (tillers) at its base.     gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12115   cg1             TO:0000461      PMID:21987797   IMP             T       GRMZM2G022489   often vegetative leaves in the ear and tassle   gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12115   cg1             TO:0000431      PMID:21987797   IMP             T       GRMZM2G022489   highly reduced ears     gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12115   cg1             TO:0000370      PMID:21987797   IMP             T       GRMZM2G022489   narrow leaves   gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12115   cg1             TO:0000788      PMID:21987797   IMP             T       GRMZM2G022489   highly reduced tassel   gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12115   cg1             TO:0000329      PMID:21987797   IMP             T       GRMZM2G022489   extreme tillering       gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12141   d3                      PMID:25774204   IMP             T       GRMZM2G093195   andromonoecious gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12141   d3      internode length        TO:0000145      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G093195   internode elongation reduced    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12141   d3      leaf height     TO:0000541      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G093195   short leaves    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12141   d3      leaf size       TO:0002637      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G093195   compact leaves  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12141   d3      leaf width      TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G093195   broad leaves    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12141   d3      plant height    TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G093195   The plant is shorter    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12141   d3              TO:0000145      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G093195   internode elongation reduced    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12141   d3              TO:0000541      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G093195   short leaves    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12141   d3              TO:0002637      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G093195   compact leaves  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12141   d3              TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G093195   broad leaves    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12141   d3              TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G093195   The plant is shorter    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12143   d8                      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   Plant does not reposnd to giberellin    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12143   d8                      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   Producing both bisexual and male flowers on the same plant. Synonym: andromonoecious.   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12143   d8                      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   anthers in the ears     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12143   d8      floret anatomy and morphology trait     TO:0000274      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   Ear florets are hermaphroditic; most easily observed in unfertilized ear.       gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12143   d8      leaf height     TO:0000541      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   short leaves    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12143   d8      leaf size       TO:0002637      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   compact leaves  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12143   d8      leaf width      TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   broad leaves    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12143   d8      leaf width      TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   leaf width excess       gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12143   d8      plant height    TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   Dwarf   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12143   d8      plant height    TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   whole plant short       gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12143   d8      tassel branch number    TO:0000813      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   tassel branches few     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12143   d8      tassel inflorescence circumference      TO:0000796      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   compact tassel  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12143   d8      tiller number   TO:0000346      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   Plant produces many lateral branches (tillers) at its base.     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12143   d8              TO:0000274      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   Ear florets are hermaphroditic; most easily observed in unfertilized ear.       gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12143   d8              TO:0000541      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   short leaves    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12143   d8              TO:0002637      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   compact leaves  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12143   d8              TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   broad leaves    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12143   d8              TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   leaf width excess       gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12143   d8              TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   Dwarf   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12143   d8              TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   whole plant short       gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12143   d8              TO:0000813      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   tassel branches few     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12143   d8              TO:0000796      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   compact tassel  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12143   d8              TO:0000346      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G144744   Plant produces many lateral branches (tillers) at its base.     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12144   d9                      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024973   andromonoecious gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12144   d9                      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024973   anthers in the ears     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12144   d9      leaf height     TO:0000541      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024973   short leaves    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12144   d9      leaf size       TO:0002637      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024973   compact leaves  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12144   d9      leaf width      TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024973   broad leaves    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12144   d9      plant height    TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024973   whole plant short       gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12144   d9      tassel inflorescence circumference      TO:0000796      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024973   compact tassel  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12148   dek1    chalky endosperm        TO:0000266      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   endosperm has a soft, chalk-like texture        gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12148   dek1    endosperm anatomy and morphology trait  TO:0000575      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   abnormal endosperm      gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12148   dek1    endosperm color TO:0000487      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   endosperm reduced yellow color  gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12148   dek1    floury endosperm        TO:0000104      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   endosperm opaque appearance     gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12148   dek1    floury endosperm        TO:0000104      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   floury kernel   gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12148   dek1    fruit color     TO:0002617      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   colorless kernel        gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12148   dek1    fruit shape     TO:0002628      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   round kernel    gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12148   dek1    fruit size      TO:0002625      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   Generally a reduced size kernel gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12148   dek1    grain shape     TO:0002730      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   thin kernel     gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12197   du1     enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G141399   starch debranching enzyme I absent in developing endosperm      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12197   du1     sugary endosperm        TO:0000099      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G141399   kernel is sweet at milk stage; typical of su1   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12197   du1     wrinkled seed   TO:0000718      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G141399   kernel is wrinkled, hard and translucent when dry       gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       1219936 spi1    kernel number per ear   TO:0000937      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G025222   The number of kernals on the cob is reduced     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       1219936 spi1    tassel branch number    TO:0000813      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G025222   number of tassel spikelets greatly reduced      gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       12144   d9              TO:0000541      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024973   short leaves    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12144   d9              TO:0002637      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024973   compact leaves  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12144   d9              TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024973   broad leaves    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12144   d9              TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024973   whole plant short       gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12144   d9              TO:0000796      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024973   compact tassel  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12148   dek1            TO:0000266      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   endosperm has a soft, chalk-like texture        gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12148   dek1            TO:0000575      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   abnormal endosperm      gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12148   dek1            TO:0000487      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   endosperm reduced yellow color  gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12148   dek1            TO:0000104      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   endosperm opaque appearance     gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12148   dek1            TO:0000104      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   floury kernel   gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12148   dek1            TO:0002617      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   colorless kernel        gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12148   dek1            TO:0002628      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   round kernel    gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12148   dek1            TO:0002625      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   Generally a reduced size kernel gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12148   dek1            TO:0002730      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   thin kernel     gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12197   du1             TO:0000599      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G141399   starch debranching enzyme I absent in developing endosperm      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12197   du1             TO:0000099      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G141399   kernel is sweet at milk stage; typical of su1   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12197   du1             TO:0000718      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G141399   kernel is wrinkled, hard and translucent when dry       gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       1219936 spi1            TO:0000937      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G025222   The number of kernals on the cob is reduced     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       1219936 spi1            TO:0000813      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G025222   number of tassel spikelets greatly reduced      gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
 !MaizeGDB      12218   et1                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G157574   surface of kernel strewn with small pits or indentations        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12218   et1     enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G157574   starch debranching enzyme I absent in developing endosperm      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12218   et1     floury endosperm        TO:0000104      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G157574   interior floury gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12218   et1     sugary endosperm        TO:0000099      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G157574   kernel is sweet at milk stage; typical of su1   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12218   et1     wrinkled seed   TO:0000718      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G157574   kernel is wrinkled, hard and translucent when dry       gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12225   fl2     chalky endosperm        TO:0000266      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G397687   endosperm has a soft, chalk-like texture        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12225   fl2     endosperm color TO:0000487      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G397687   endosperm reduced yellow color  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12225   fl2     glutinous endosperm     TO:0000098      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G397687   endosperm is opaque     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12225   fl2     glutinous endosperm     TO:0000098      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G397687   endosperm opaque appearance     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12229   g2      chloroplast development trait   TO:0002715      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G087804   Chloroplasts in bundle sheath cells are less membranous than normal.    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12229   g2      chloroplast development trait   TO:0002715      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G087804   Chloroplasts in bundle sheath cells are smaller than normal.    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12229   g2      leaf sheath color       TO:0002724      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G087804   distinct yellow cast on sheath  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12229   g2      plant color     TO:0000708      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G087804   plant with distinct yellow cast gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12229   g2      variegated leaf TO:0000069      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G087804   Normal green along veins (vascular bundles); tissue between the veins is pale green or grayish green, giving the leaf a striped appearance      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12242   gl1     inflorescence waxiness  TO:0000787      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G114642   Cuticular wax on epidermis of juvenile leaves is altered        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12242   gl1     leaf gloss      TO:0000709      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G114642   Juvenile leaves have a glossy surface   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12247   gl15    inflorescence waxiness  TO:0000787      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G160730   Cuticular wax on epidermis of juvenile leaves is altered        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12247   gl15    leaf gloss      TO:0000709      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G160730   Juvenile leaves have a glossy surface   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12252   gl2     inflorescence waxiness  TO:0000787      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G098239   Cuticular wax on epidermis of juvenile leaves is altered        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12252   gl2     leaf gloss      TO:0000709      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G098239   Juvenile leaves have a glossy surface   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12263   gl8     inflorescence waxiness  TO:0000787      PMID:21423772   IMP             T       AC205703.4_FG006        Cuticular wax on epidermis of juvenile leaves is altered        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12263   gl8     leaf gloss      TO:0000709      PMID:21423772   IMP             T       AC205703.4_FG006        Juvenile leaves have a glossy surface   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12290   hcf106  fluorescence related trait      TO:0012006      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM5G898735   seedling leaves red fluorescence under long-wave uv     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12327   hm1     fungal disease resistance       TO:0000439      PMID:24847713   IMP             T       GRMZM5G881887   resistant to Cochliobolus carbonum      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12327   hm1     fungal disease resistance       TO:0000439      PMID:24847713   IMP             T       GRMZM5G881887   resistant to Colletotrichum graminicola gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12328   hm2     fungal disease resistance       TO:0000439      PMID:24847713   IMP             T       GRMZM2G086773   resistant to Cochliobolus carbonum      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       1232891 wtf1    leaf color      TO:0000326      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G403797   Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       1232893 why1    leaf color      TO:0000326      PMID:25599833   IMP             T       GRMZM2G155662   Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       1232899 ppr5    leaf color      TO:0000326      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G025409   Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12218   et1             TO:0000599      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G157574   starch debranching enzyme I absent in developing endosperm      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12218   et1             TO:0000104      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G157574   interior floury gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12218   et1             TO:0000099      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G157574   kernel is sweet at milk stage; typical of su1   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12218   et1             TO:0000718      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G157574   kernel is wrinkled, hard and translucent when dry       gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12225   fl2             TO:0000266      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G397687   endosperm has a soft, chalk-like texture        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12225   fl2             TO:0000487      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G397687   endosperm reduced yellow color  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12225   fl2             TO:0000098      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G397687   endosperm is opaque     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12225   fl2             TO:0000098      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G397687   endosperm opaque appearance     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12229   g2              TO:0002715      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G087804   Chloroplasts in bundle sheath cells are less membranous than normal.    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12229   g2              TO:0002715      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G087804   Chloroplasts in bundle sheath cells are smaller than normal.    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12229   g2              TO:0002724      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G087804   distinct yellow cast on sheath  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12229   g2              TO:0000708      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G087804   plant with distinct yellow cast gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12229   g2              TO:0000069      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G087804   Normal green along veins (vascular bundles); tissue between the veins is pale green or grayish green, giving the leaf a striped appearance      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12242   gl1             TO:0000787      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G114642   Cuticular wax on epidermis of juvenile leaves is altered        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12242   gl1             TO:0000709      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G114642   Juvenile leaves have a glossy surface   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12247   gl15            TO:0000787      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G160730   Cuticular wax on epidermis of juvenile leaves is altered        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12247   gl15            TO:0000709      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G160730   Juvenile leaves have a glossy surface   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12252   gl2             TO:0000787      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G098239   Cuticular wax on epidermis of juvenile leaves is altered        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12252   gl2             TO:0000709      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G098239   Juvenile leaves have a glossy surface   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12263   gl8             TO:0000787      PMID:21423772   IMP             T       AC205703.4_FG006        Cuticular wax on epidermis of juvenile leaves is altered        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12263   gl8             TO:0000709      PMID:21423772   IMP             T       AC205703.4_FG006        Juvenile leaves have a glossy surface   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12290   hcf106          TO:0012006      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM5G898735   seedling leaves red fluorescence under long-wave uv     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12327   hm1             TO:0000439      PMID:24847713   IMP             T       GRMZM5G881887   resistant to Cochliobolus carbonum      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12327   hm1             TO:0000439      PMID:24847713   IMP             T       GRMZM5G881887   resistant to Colletotrichum graminicola gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12328   hm2             TO:0000439      PMID:24847713   IMP             T       GRMZM2G086773   resistant to Cochliobolus carbonum      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       1232891 wtf1            TO:0000326      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G403797   Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       1232893 why1            TO:0000326      PMID:25599833   IMP             T       GRMZM2G155662   Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       1232899 ppr5            TO:0000326      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G025409   Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      1233612 emp4                    PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G092198   loose pericarp  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      1233612 emp4                    PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G092198   small embryo    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       1233612 emp4    fruit anatomy and morphology trait      TO:0002629      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G092198   kernel is angular       gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       1233612 emp4    shrunken endosperm      TO:0000100      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G092198   endosperm much reduced  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       1233612 emp4    shrunken endosperm      TO:0000100      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G092198   kernel is collapsed     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       1233612 emp4            TO:0002629      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G092198   kernel is angular       gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       1233612 emp4            TO:0000100      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G092198   endosperm much reduced  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       1233612 emp4            TO:0000100      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G092198   kernel is collapsed     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12340   ig1                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G118250   aborted kernel  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12340   ig1                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G118250   kernel with loose pericarp      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12340   ig1     fertility related trait TO:0000420      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G118250   Male flowers have reduced fertility     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12340   ig1     fruit anatomy and morphology trait      TO:0002629      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G118250   kernel with loose pericarp      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12340   ig1     seed size       TO:0000391      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G118250   kernal smaller in size  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12341   ij1     leaf color      TO:0000326      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G004583   Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12341   ij1     variegated leaf TO:0000069      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G004583   Leaf is mostly white, with short, thin, green, longitudinal stripes (in the direction of the lateral veins),    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12340   ig1             TO:0000420      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G118250   Male flowers have reduced fertility     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12340   ig1             TO:0002629      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G118250   kernel with loose pericarp      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12340   ig1             TO:0000391      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G118250   kernal smaller in size  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12341   ij1             TO:0000326      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G004583   Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12341   ij1             TO:0000069      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G004583   Leaf is mostly white, with short, thin, green, longitudinal stripes (in the direction of the lateral veins),    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12352   kn1                     PMID:24218490   IMP             T       GRMZM2G017087   The number of ovules that develop into a seed is reduced        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12352   kn1     leaf vein anatomy and morphology trait  TO:0000820      PMID:24218490   IMP             T       GRMZM2G017087   Scattered proliferations of tissue at veins on leaf, leading to a bumpy, irregular appearance.  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12352   kn1     spikelet number TO:0000456      PMID:24218490   IMP             T       GRMZM2G017087   number of tassel spikelets greatly reduced      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12352   kn1     sterility or fertility trait    TO:0000392      PMID:24218490   IMP             T       GRMZM2G017087   pollen nonfunctional    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12386   lg1     auricleless     TO:0000226      PMID:25516601   IMP             T       GRMZM2G036297   auricle of the leaf missing     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12386   lg1     leaf attitude   TO:0000824      PMID:25516601   IMP             T       GRMZM2G036297   leaves upright  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12387   lg2     auricleless     TO:0000226      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G060216   auricle of the leaf missing     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12387   lg2     leaf attitude   TO:0000824      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G060216   leaves upright  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12352   kn1             TO:0000820      PMID:24218490   IMP             T       GRMZM2G017087   Scattered proliferations of tissue at veins on leaf, leading to a bumpy, irregular appearance.  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12352   kn1             TO:0000456      PMID:24218490   IMP             T       GRMZM2G017087   number of tassel spikelets greatly reduced      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12352   kn1             TO:0000392      PMID:24218490   IMP             T       GRMZM2G017087   pollen nonfunctional    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12386   lg1             TO:0000226      PMID:25516601   IMP             T       GRMZM2G036297   auricle of the leaf missing     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12386   lg1             TO:0000824      PMID:25516601   IMP             T       GRMZM2G036297   leaves upright  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12387   lg2             TO:0000226      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G060216   auricle of the leaf missing     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12387   lg2             TO:0000824      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G060216   leaves upright  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12388   lg3                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G087741   more ligule     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12388   lg3     auricleless     TO:0000226      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G087741   auricle of the leaf missing     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12388   lg3     leaf attitude   TO:0000824      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G087741   leaves upright  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12389   lg4     auricleless     TO:0000226      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G094241   auricle of the leaf missing     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12389   lg4     leaf attitude   TO:0000824      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G094241   leaves upright  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12388   lg3             TO:0000226      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G087741   auricle of the leaf missing     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12388   lg3             TO:0000824      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G087741   leaves upright  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12389   lg4             TO:0000226      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G094241   auricle of the leaf missing     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12389   lg4             TO:0000824      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G094241   leaves upright  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12391   lls1                    PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G339563   Leaves have elliptical lesions  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12391   lls1                    PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G339563   Leaves have round lesions       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12391   lls1                    PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G339563   Premature plant death   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12391   lls1    chlorophyll content     TO:0000495      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G339563   Chlorotic leaf lesion   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12391   lls1    leaf necrosis   TO:0000652      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G339563   necrotic leaf lesions   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12391   lls1    leaf senescence TO:0000249      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G339563   Premature leaf senescence       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12469   na1     anatomy and morphology trait    TO:0000017      PMID:22106275   IMP             T       JN020030.1      erect plant     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12469   na1     plant growth hormone sensitivity        TO:0000401      PMID:22106275   IMP             T       JN020030.1      no response to gibberellins     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12469   na1     plant height    TO:0000207      PMID:22106275   IMP             T       JN020030.1      short plant     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12495   o2      glutinous endosperm     TO:0000098      PMID:23586588   IMP             T       GRMZM2G015534   endosperm is opaque     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12515   oy1     variegated leaf TO:0000069      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G419806   Normal green along veins (vascular bundles); tissue between the veins is pale green or grayish green, giving the leaf a striped appearance      gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12517   p1      style color     TO:0000676      PMID:25250036   IMP             T       GRMZM2G084799   Silks brown sooner than normal  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12391   lls1            TO:0000495      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G339563   Chlorotic leaf lesion   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12391   lls1            TO:0000652      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G339563   necrotic leaf lesions   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12391   lls1            TO:0000249      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G339563   Premature leaf senescence       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12469   na1             TO:0000017      PMID:22106275   IMP             T       JN020030.1      erect plant     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12469   na1             TO:0000401      PMID:22106275   IMP             T       JN020030.1      no response to gibberellins     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12469   na1             TO:0000207      PMID:22106275   IMP             T       JN020030.1      short plant     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12495   o2              TO:0000098      PMID:23586588   IMP             T       GRMZM2G015534   endosperm is opaque     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12515   oy1             TO:0000069      PMID:25725436   IMP             T       GRMZM2G419806   Normal green along veins (vascular bundles); tissue between the veins is pale green or grayish green, giving the leaf a striped appearance      gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12517   p1              TO:0000676      PMID:25250036   IMP             T       GRMZM2G084799   Silks brown sooner than normal  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12553   pl1                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G701063   striped stems   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12553   pl1     anthocyanin content     TO:0000071      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G701063   blotches of anthocyanin pigmentation due to cell to cell variability in the levels of anthocyanin production.   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12553   pl1     anthocyanin content     TO:0000071      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G701063   cell to cell variability in the levels of anthocyanin production.       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12553   pl1     endosperm color TO:0000487      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G701063   Aleuron has blotches of anthocyanin pigmentation        gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12553   pl1     variegated leaf TO:0000069      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G701063   striped leaves  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12562   ps1     cotyledon       TO:0000750      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G849107   pink coloration of scutellum    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       12562   ps1     endosperm color TO:0000487      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G849107   pink coloration of endosperm    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       12562   ps1     leaf color      TO:0000326      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G849107   Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12562   ps1     vivipary        TO:0000619      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G849107   viviparous embryo       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       12573   tan1    cell cycle trait        TO:0000728      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G039113   irregular cell division placement in leaf epidermis (results in irregularly shaped cells)       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12573   tan1    leaf height     TO:0000541      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G039113   leaves short    gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12573   tan1    plant height    TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G039113   plant short     gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12576   r1      aleurone layer appearance       TO:0000944      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   aleurone layer mottled  gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12576   r1      aleurone layer color    TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   Aleurone layer is colored       gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12576   r1      aleurone layer color    TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   Aleurone layer is colored       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12576   r1      anther color    TO:0000187      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   anthers are green       gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12576   r1      anther color    TO:0000187      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   pale pink to red anthers        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12576   r1      anther color    TO:0000187      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   red anthers     gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12576   r1      anthocyanin content     TO:0000071      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   Anthocyanin pigment in pericarp.        gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12576   r1      anthocyanin content     TO:0000071      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   Strong anthocyanin on leaf blade after 4-6 leaf stage   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12576   r1      pericarp color  TO:0000707      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   Anthocyanin pigment in pericarp.        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12577   ra1     spikelet anatomy and morphology trait   TO:0000657      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G003927   abnormality in spikelet gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12578   ra2     spikelet anatomy and morphology trait   TO:0000657      PMID:21423772   IMP             T       AC233943.1_FG002        abnormality in spikelet gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12579   ra3     fascicled ear   TO:0000715      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G014729   ear is branched gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12595   rf2     anther shape    TO:0000214      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G058675   Anthers shriveled       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12595   rf2     male sterility  TO:0000437      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G058675   Male sterile    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12595   rf2     pollen free     TO:0000245      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G058675   Pollen absent or aborted.       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12553   pl1             TO:0000071      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G701063   blotches of anthocyanin pigmentation due to cell to cell variability in the levels of anthocyanin production.   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12553   pl1             TO:0000071      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G701063   cell to cell variability in the levels of anthocyanin production.       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12553   pl1             TO:0000487      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G701063   Aleuron has blotches of anthocyanin pigmentation        gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12553   pl1             TO:0000069      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G701063   striped leaves  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12562   ps1             TO:0000750      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G849107   pink coloration of scutellum    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       12562   ps1             TO:0000487      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G849107   pink coloration of endosperm    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       12562   ps1             TO:0000326      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G849107   Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12562   ps1             TO:0000619      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G849107   viviparous embryo       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       12573   tan1            TO:0000728      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G039113   irregular cell division placement in leaf epidermis (results in irregularly shaped cells)       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12573   tan1            TO:0000541      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G039113   leaves short    gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12573   tan1            TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G039113   plant short     gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12576   r1              TO:0000944      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   aleurone layer mottled  gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12576   r1              TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   Aleurone layer is colored       gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12576   r1              TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   Aleurone layer is colored       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12576   r1              TO:0000187      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   anthers are green       gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12576   r1              TO:0000187      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   pale pink to red anthers        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12576   r1              TO:0000187      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   red anthers     gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12576   r1              TO:0000071      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   Anthocyanin pigment in pericarp.        gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12576   r1              TO:0000071      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   Strong anthocyanin on leaf blade after 4-6 leaf stage   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12576   r1              TO:0000707      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G822829   Anthocyanin pigment in pericarp.        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12577   ra1             TO:0000657      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G003927   abnormality in spikelet gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12578   ra2             TO:0000657      PMID:21423772   IMP             T       AC233943.1_FG002        abnormality in spikelet gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12579   ra3             TO:0000715      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G014729   ear is branched gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12595   rf2             TO:0000214      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G058675   Anthers shriveled       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12595   rf2             TO:0000437      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G058675   Male sterile    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12595   rf2             TO:0000245      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G058675   Pollen absent or aborted.       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12602   rgd1                    PMID:25774204   IMP             T       GRMZM2G020187   leaf blade absent       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
 !MaizeGDB      12602   rgd1                    PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G020187   difficulty emerging     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       12602   rgd1    leaf shape      TO:0000492      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G020187   seedling leaves divided gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12602   rgd1    leaf width      TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G020187   seedling leaves narrow  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       12602   rgd1    leaf width      TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G020187   seedling leaves thread-like     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       12609   rp1     disease resistance      TO:0000112      PMID:25805314   IMP             T       AC152495.1_FG002        Plants are partially resistance to Puccinia polysora    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       12609   rp1     disease resistance      TO:0000112      PMID:25805314   IMP             T       AC152495.1_FG002        Plants are partially resistance to Puccinia sorghi      gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       12609   rp1     disease resistance      TO:0000112      PMID:25805314   IMP             T       AC152495.1_FG002        resistant to Puccinia sorghi    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       12616   rs1     leaf sheath anatomy and morphology trait        TO:0000835      PMID:24218490   IMP             T       GRMZM2G028041   leaf sheath is rough    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       12616   rs1     leaf vein anatomy and morphology trait  TO:0000820      PMID:24218490   IMP             T       GRMZM2G028041   Scattered proliferations of tissue at veins on leaf, leading to a bumpy, irregular appearance.  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       12617   rs2     leaf sheath anatomy and morphology trait        TO:0000835      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G403620   leaf sheath is rough    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12617   rs2     ligule anatomy and morphology trait     TO:0002748      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G403620   abnormality of ligule   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12664   su1     enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G138060   starch debranching enzyme I absent in developing endosperm      gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12664   su1     sugary endosperm        TO:0000099      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G138060   kernel is sweet at milk stage; typical of su1   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12664   su1     wrinkled seed   TO:0000718      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G138060   kernel is wrinkled, hard and translucent when dry       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12665   su2     enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G348551   starch debranching enzyme I absent in developing endosperm      gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12665   su2     glutinous endosperm     TO:0000098      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G348551   endosperm is opaque     gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12665   su2     sugary endosperm        TO:0000099      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G348551   kernel is sweet at milk stage; typical of su1   gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12665   su2     wrinkled seed   TO:0000718      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G348551   kernel is wrinkled, hard and translucent when dry       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12671   tb1     tiller number   TO:0000346      PMID:25909039   IMP             T       AC233950.1_FG002        Plant produces many lateral branches (tillers) at its base.     gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12673   te1     tassel inflorescence anatomy and morphology trait       TO:0000788      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G085113   abnormality of the tassel       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12602   rgd1            TO:0000492      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G020187   seedling leaves divided gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12602   rgd1            TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G020187   seedling leaves narrow  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       12602   rgd1            TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G020187   seedling leaves thread-like     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       12609   rp1             TO:0000112      PMID:25805314   IMP             T       AC152495.1_FG002        Plants are partially resistance to Puccinia polysora    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       12609   rp1             TO:0000112      PMID:25805314   IMP             T       AC152495.1_FG002        Plants are partially resistance to Puccinia sorghi      gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       12609   rp1             TO:0000112      PMID:25805314   IMP             T       AC152495.1_FG002        resistant to Puccinia sorghi    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       12616   rs1             TO:0000835      PMID:24218490   IMP             T       GRMZM2G028041   leaf sheath is rough    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       12616   rs1             TO:0000820      PMID:24218490   IMP             T       GRMZM2G028041   Scattered proliferations of tissue at veins on leaf, leading to a bumpy, irregular appearance.  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       12617   rs2             TO:0000835      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G403620   leaf sheath is rough    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12617   rs2             TO:0002748      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G403620   abnormality of ligule   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12664   su1             TO:0000599      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G138060   starch debranching enzyme I absent in developing endosperm      gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12664   su1             TO:0000099      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G138060   kernel is sweet at milk stage; typical of su1   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12664   su1             TO:0000718      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G138060   kernel is wrinkled, hard and translucent when dry       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12665   su2             TO:0000599      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G348551   starch debranching enzyme I absent in developing endosperm      gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12665   su2             TO:0000098      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G348551   endosperm is opaque     gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12665   su2             TO:0000099      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G348551   kernel is sweet at milk stage; typical of su1   gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12665   su2             TO:0000718      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G348551   kernel is wrinkled, hard and translucent when dry       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12671   tb1             TO:0000346      PMID:25909039   IMP             T       AC233950.1_FG002        Plant produces many lateral branches (tillers) at its base.     gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12673   te1             TO:0000788      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G085113   abnormality of the tassel       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12690   ts1                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G104843   seeds in tassel gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12690   ts1                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G104843   silks in tassel gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12690   ts1     floret anatomy and morphology trait     TO:0000274      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G104843   defective floret        gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12690   ts1     tassel inflorescence anatomy and morphology trait       TO:0000788      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G104843   abnormality of the tassel       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12690   ts1             TO:0000274      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G104843   defective floret        gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12690   ts1             TO:0000788      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G104843   abnormality of the tassel       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12691   ts2                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G455809   seeds in tassel gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12691   ts2                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G455809   silks in tassel gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12691   ts2     tassel inflorescence anatomy and morphology trait       TO:0000788      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G455809   abnormality of the tassel       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12691   ts2             TO:0000788      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G455809   abnormality of the tassel       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12692   ts4                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G803935   seeds in tassel gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12692   ts4                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G803935   silks in tassel gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12692   ts4     tassel inflorescence anatomy and morphology trait       TO:0000788      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G803935   abnormality of the tassel       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12692   ts4             TO:0000788      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G803935   abnormality of the tassel       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12694   ts6                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G862109   seeds in tassel gene    taxon:4577      20150622        !               
 !MaizeGDB      12694   ts6                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G862109   silks in tassel gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12694   ts6     embryo development trait        TO:0000620      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G862109   The embryo develops on the wrong side of the kernel     gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12694   ts6     tassel inflorescence anatomy and morphology trait       TO:0000788      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G862109   abnormality of the tassel       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12694   ts6             TO:0000620      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G862109   The embryo develops on the wrong side of the kernel     gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12694   ts6             TO:0000788      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G862109   abnormality of the tassel       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      12696   tu1                     PMID:24980907   IMP             T       NM_001111678.1  kernels completely enclosed in long glumes      gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12696   tu1     glume anatomy and morphology trait      TO:0000869      PMID:24980907   IMP             T       NM_001111678.1  tassel glumes coarse    gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12696   tu1     glume anatomy and morphology trait      TO:0000869      PMID:24980907   IMP             T       NM_001111678.1  tassel glumes large     gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12731   vp1     vivipary        TO:0000619      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G133398   kernels germinate while still on the ear        gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12733   vp5     leaf color      TO:0000326      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G410515   Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12733   vp5     vivipary        TO:0000619      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G410515   kernels germinate while still on the ear        gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12735   vp8     vivipary        TO:0000619      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G010353   kernels germinate while still on the ear        gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12768   wx1     amylopectin content     TO:0000097      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024993   Amylopectin in endosperm.       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       12768   wx1     amylopectin content     TO:0000097      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024993   Amylopectin in pollen.  gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12696   tu1             TO:0000869      PMID:24980907   IMP             T       NM_001111678.1  tassel glumes coarse    gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12696   tu1             TO:0000869      PMID:24980907   IMP             T       NM_001111678.1  tassel glumes large     gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12731   vp1             TO:0000619      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G133398   kernels germinate while still on the ear        gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12733   vp5             TO:0000326      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G410515   Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12733   vp5             TO:0000619      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G410515   kernels germinate while still on the ear        gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12735   vp8             TO:0000619      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G010353   kernels germinate while still on the ear        gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12768   wx1             TO:0000097      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024993   Amylopectin in endosperm.       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       12768   wx1             TO:0000097      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024993   Amylopectin in pollen.  gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      133880  mop1                    PMID:24786611   IMP             T       GRMZM2G042443   Reduction of gene silencing     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      133880  mop1                    PMID:24786611   IMP             T       GRMZM2G042443   reduction of small RNAs gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       223331  les22   variegated leaf necrosis        TO:0000070      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G044074   necrotic or chlorotic lesions   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       2365883 rel2    kernel number per ear   TO:0000937      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G042992   Ear with few kernels if any     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       223331  les22           TO:0000070      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G044074   necrotic or chlorotic lesions   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       2365883 rel2            TO:0000937      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G042992   Ear with few kernels if any     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      25017   cr4                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G051637   seedling which has an irregular shape   gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       25017   cr4     aleurone layer appearance       TO:0000944      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G051637   irregular-shaped patches of color and non-color in the aleurone tissue with distinct borders    gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       25017   cr4     leaf shape      TO:0000492      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G051637   leaves crinkled gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       25017   cr4     leaf width      TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G051637   leaves broad    gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       25017   cr4     plant height    TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G051637   plant short     gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       25017   cr4     portion of plant tissue anatomy and morphology trait    TO:0000843      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G051637   Scattered proliferations of tissue at veins on leaf, leading to a bumpy, irregular appearance.  gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       25017   cr4     tassel inflorescence anatomy and morphology trait       TO:0000788      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G051637   compact tassel  gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       25058   dsc1    pericarp anatomy and morphology trait   TO:0000945      PMID:21423772   IMP             T       chr4:47715993   kernel surface opaque   gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       25058   dsc1    pericarp texture        TO:0002623      PMID:21423772   IMP             T       chr4:47715993   surface of kernel covered with many small irregularities giving it a rough texture      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       25058   dsc1    wrinkled seed   TO:0000718      PMID:21423772   IMP             T       chr4:47715993   kernel surface like crumpled paper      gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       25017   cr4             TO:0000944      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G051637   irregular-shaped patches of color and non-color in the aleurone tissue with distinct borders    gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       25017   cr4             TO:0000492      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G051637   leaves crinkled gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       25017   cr4             TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G051637   leaves broad    gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       25017   cr4             TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G051637   plant short     gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       25017   cr4             TO:0000843      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G051637   Scattered proliferations of tissue at veins on leaf, leading to a bumpy, irregular appearance.  gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       25017   cr4             TO:0000788      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G051637   compact tassel  gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       25058   dsc1            TO:0000945      PMID:21423772   IMP             T       chr4:47715993   kernel surface opaque   gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       25058   dsc1            TO:0002623      PMID:21423772   IMP             T       chr4:47715993   surface of kernel covered with many small irregularities giving it a rough texture      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       25058   dsc1            TO:0000718      PMID:21423772   IMP             T       chr4:47715993   kernel surface like crumpled paper      gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      256276  dwf1                    PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G057000   andromonoecious gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       256276  dwf1    leaf height     TO:0000541      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G057000   short leaves    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       256276  dwf1    leaf size       TO:0002637      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G057000   compact leaves  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       256276  dwf1    leaf width      TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G057000   broad leaves    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       25995   crp1    seedling cotyledon color        TO:0000750      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G083950   seedling leaves red fluorescence under long-wave uv     gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       25995   crp1    seedling growth and development trait   TO:0000949      PMID:25774204   IMP             T       GRMZM2G083950   seedling dies after endosperm is used up        gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       256276  dwf1            TO:0000541      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G057000   short leaves    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       256276  dwf1            TO:0002637      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G057000   compact leaves  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       256276  dwf1            TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G057000   broad leaves    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       25995   crp1            TO:0000750      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G083950   seedling leaves red fluorescence under long-wave uv     gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       25995   crp1            TO:0000949      PMID:25774204   IMP             T       GRMZM2G083950   seedling dies after endosperm is used up        gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      274903  dcd1                    PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G083459   stomata abnormal        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       274903  dcd1    mitotic cell cycle trait        TO:0000730      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G083459   Leaf epidermis cell division asymmetric gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       274903  dcd1    plant cell shape        TO:0002682      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G083459   cork cells abnormal     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       274903  dcd1    plant cell shape        TO:0002682      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G083459   silica cells abnormal   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       30011   rld1    leaf anatomy and morphology trait       TO:0000748      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G109987   adaxial traits on the abaxial side of the leaves        gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       30011   rld1    leaf rolling    TO:0000085      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G109987   leaves are rolled       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       274903  dcd1            TO:0000730      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G083459   Leaf epidermis cell division asymmetric gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       274903  dcd1            TO:0002682      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G083459   cork cells abnormal     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       274903  dcd1            TO:0002682      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G083459   silica cells abnormal   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       30011   rld1            TO:0000748      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G109987   adaxial traits on the abaxial side of the leaves        gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       30011   rld1            TO:0000085      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G109987   leaves are rolled       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      30023   vp10                    PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G067176   seedling leaves stuck together  gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      30023   vp10                    PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G067176   tassels stuck together  gene    taxon:4577      20150622        !!              
 !MaizeGDB      30023   vp10                    PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G067176   top leaves stuck together       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       30023   vp10    aleurone layer color    TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G067176   Aleurone layer is colored       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       30023   vp10    seedling vigor  TO:0000280      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G067176   seedling dies after endosperm is used up        gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       30023   vp10    vivipary        TO:0000619      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G067176   kernels germinate while still on the ear        gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       30023   vp10            TO:0000943      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G067176   Aleurone layer is colored       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       30023   vp10            TO:0000280      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G067176   seedling dies after endosperm is used up        gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       30023   vp10            TO:0000619      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G067176   kernels germinate while still on the ear        gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      308904  fea2                    PMID:23377180   IMP             T       GRMZM2G104925   Ear tip flattened       gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       308904  fea2    ear diameter    TO:0000433      PMID:23377180   IMP             T       GRMZM2G104925   Ear broadened   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       308904  fea2    fascicled ear   TO:0000715      PMID:23377180   IMP             T       GRMZM2G104925   Ear meristem overproliferation  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       308904  fea2    kernel row number per ear       TO:0000687      PMID:23377180   IMP             T       GRMZM2G104925   increase in the number of rows of seeds on the ear; ear floret numbers increased        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       41310   zfl2    inflorescence development trait TO:0000621      PMID:24381105   IMP             T       GRMZM2G180190   defective ear   gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       41310   zfl2    tassel inflorescence anatomy and morphology trait       TO:0000788      PMID:24381105   IMP             T       GRMZM2G180190   abnormality of the tassel       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       308904  fea2            TO:0000433      PMID:23377180   IMP             T       GRMZM2G104925   Ear broadened   gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       308904  fea2            TO:0000715      PMID:23377180   IMP             T       GRMZM2G104925   Ear meristem overproliferation  gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       308904  fea2            TO:0000687      PMID:23377180   IMP             T       GRMZM2G104925   increase in the number of rows of seeds on the ear; ear floret numbers increased        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       41310   zfl2            TO:0000621      PMID:24381105   IMP             T       GRMZM2G180190   defective ear   gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       41310   zfl2            TO:0000788      PMID:24381105   IMP             T       GRMZM2G180190   abnormality of the tassel       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      41343   bde1                    PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G160565   multiple silks per floret in ear        gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       41343   bde1    inflorescence anatomy and morphology trait      TO:0000373      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G160565   proliferation of irregular growth on ear        gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       41343   bde1    tassel inflorescence anatomy and morphology trait       TO:0000788      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G160565   silks in the tassel     gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       415181  sbe3    leaf senescence duration        TO:0012012      PMID:21508184   IMP             T       GRMZM2G073054   leaves senesc earleir than normal sibs  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       41343   bde1            TO:0000373      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G160565   proliferation of irregular growth on ear        gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       41343   bde1            TO:0000788      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G160565   silks in the tassel     gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       415181  sbe3            TO:0012012      PMID:21508184   IMP             T       GRMZM2G073054   leaves senesc earleir than normal sibs  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      60438   bif2                    PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G171822   ear meristem absent     gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       60438   bif2    inflorescence branching TO:0000050      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G171822   Inflorescence branches absent   gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       60468   dlf1    flowering time trait    TO:0002616      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G067921   mature plant 7-10 days later in flowering than normal   gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       60468   dlf1    node number     TO:0000634      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G067921   4-6 more nodes and leaves than normal.  gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       60468   dlf1    plant height    TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   mature plant 2-3 feet taller than normal.       gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       60513   rth1    root hair length        TO:0002665      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G099056   root hairs fail to elongate     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       60513   rth1    root shape      TO:0002710      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G099056   general term to describe abnormality in root system     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       60515   rth3    root hair length        TO:0002665      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G377215   root hair decreased length      gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       60515   rth3    root hair length        TO:0002665      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G377215   root hairs fail to elongate     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       60537   tsh1    tassel inflorescence anatomy and morphology trait       TO:0000788      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G325850   abnormality of the tassel       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       60438   bif2            TO:0000050      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G171822   Inflorescence branches absent   gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       60468   dlf1            TO:0002616      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G067921   mature plant 7-10 days later in flowering than normal   gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       60468   dlf1            TO:0000634      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G067921   4-6 more nodes and leaves than normal.  gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       60468   dlf1            TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G321753   mature plant 2-3 feet taller than normal.       gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       60513   rth1            TO:0002665      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G099056   root hairs fail to elongate     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       60513   rth1            TO:0002710      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G099056   general term to describe abnormality in root system     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       60515   rth3            TO:0002665      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G377215   root hair decreased length      gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       60515   rth3            TO:0002665      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G377215   root hairs fail to elongate     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       60537   tsh1            TO:0000788      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G325850   abnormality of the tassel       gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      61077   ns1                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G069028   Plants (stems) do not elongate in response to gibberellins.     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       61077   ns1     internode length        TO:0000145      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G069028   internode elongation reduced    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       61077   ns1     leaf width      TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G069028   leaves are very narrow along their whole length gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       61077   ns1     plant height    TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G069028   Plants are reduced in height    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       61077   ns1     vascular leaf anatomy and morphology trait      TO:0000419      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G069028   The margin domain of both blade and sheath is missing   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       61077   ns1             TO:0000145      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G069028   internode elongation reduced    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       61077   ns1             TO:0000370      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G069028   leaves are very narrow along their whole length gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       61077   ns1             TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G069028   Plants are reduced in height    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       61077   ns1             TO:0000419      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G069028   The margin domain of both blade and sheath is missing   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      61653   si1                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G139073   multiple silks per floret in ear        gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      61653   si1                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G139073   seeds in tassel gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      61653   si1                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G139073   silks in tassel gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
@@ -319,26 +319,26 @@ MaizeGDB  61077   ns1     vascular leaf anatomy and morphology trait      TO:0000419      PMID:21
 !MaizeGDB      64424   gn1                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G452178   seedling distorted      gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      64424   gn1                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G452178   seedling twisted        gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      64424   gn1                     PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G452178   silks in the tassel     gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       64424   gn1     internode length        TO:0000145      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G452178   internode elongation reduced    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       64424   gn1     plant height    TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G452178   The plant is shorter    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       854977  brk1    plant cell anatomy and morphology trait TO:0002683      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G842058   Leaf blade epidermal cell lobes blocked gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       854977  brk1    plant cell shape        TO:0002682      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G842058   Leaf blade epidermal cell shape abnormal        gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       854977  brk1    plant cell shape        TO:0002682      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G842058   Leaf blade epidermal cell shape rectangular     gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       854977  brk1    plant cell shape        TO:0002682      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G842058   Stomatal subsidiary cells are abnormal  gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       86035   mac1    cell growth and development trait       TO:0002686      PMID:25713378   IMP             T       GRMZM2G027522   More archesporial cells in developing anthers   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       86035   mac1    cell growth and development trait       TO:0002686      PMID:25713378   IMP             T       GRMZM2G027522   More archesporial cells in developing ovules.   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       86035   mac1    sterility related trait TO:0000485      PMID:25713378   IMP             T       GRMZM2G027522   Male and female sterile.        gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       870601  sgo1    anther shape    TO:0000214      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G074082   Anthers shriveled       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       870601  sgo1    male sterility  TO:0000437      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G074082   Male sterile    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       870601  sgo1    pollen abortion type    TO:0000218      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G074082   Pollen absent or aborted.       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
-MaizeGDB       871231  pac1    endosperm color TO:0000487      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G058292   Reduced pigmentation in aleurone        gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       886495  sal1    aleurone layer anatomy and morphology trait     TO:0000942      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G117935   multiple cell layers in the aleurone tissue     gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       64424   gn1             TO:0000145      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G452178   internode elongation reduced    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       64424   gn1             TO:0000207      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G452178   The plant is shorter    gene    taxon:4577      20150618        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       854977  brk1            TO:0002683      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G842058   Leaf blade epidermal cell lobes blocked gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       854977  brk1            TO:0002682      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G842058   Leaf blade epidermal cell shape abnormal        gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       854977  brk1            TO:0002682      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G842058   Leaf blade epidermal cell shape rectangular     gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       854977  brk1            TO:0002682      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM5G842058   Stomatal subsidiary cells are abnormal  gene    taxon:4577      20150529        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       86035   mac1            TO:0002686      PMID:25713378   IMP             T       GRMZM2G027522   More archesporial cells in developing anthers   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       86035   mac1            TO:0002686      PMID:25713378   IMP             T       GRMZM2G027522   More archesporial cells in developing ovules.   gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       86035   mac1            TO:0000485      PMID:25713378   IMP             T       GRMZM2G027522   Male and female sterile.        gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       870601  sgo1            TO:0000214      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G074082   Anthers shriveled       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       870601  sgo1            TO:0000437      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G074082   Male sterile    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       870601  sgo1            TO:0000218      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G074082   Pollen absent or aborted.       gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       871231  pac1            TO:0000487      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G058292   Reduced pigmentation in aleurone        gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       886495  sal1            TO:0000942      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G117935   multiple cell layers in the aleurone tissue     gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      9017732 cf1                     PMID:25774204   IMP             T       GRMZM2G026117   Leaves develop irregular nonclonal, yellow_green sectors, which leads to an appearance similar to military camouflage. Sectors can turn necrotic.       gene    taxon:4577      20150616        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       9018083 vp15    vivipary        TO:0000619      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G121468   kernels germinate while still on the ear        gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       9019783 caf2    leaf color      TO:0000326      PMID:25725436   IMP             T       AC199526.5_FG003        Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       941309  rnc1    leaf color      TO:0000326      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G035820   Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
+MaizeGDB       9018083 vp15            TO:0000619      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G121468   kernels germinate while still on the ear        gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       9019783 caf2            TO:0000326      PMID:25725436   IMP             T       AC199526.5_FG003        Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150617        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       941309  rnc1            TO:0000326      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G035820   Seedling leaves are white.      gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Austin_Meier          
 !MaizeGDB      969623  mwp1                    PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G082264   ligule on outside of leaf at base of auricle    gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
 !MaizeGDB      969623  mwp1                    PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G082264   sometimes upper leaves may be crinkly (cr) or wab-like (wavy auricle in blade-like)     gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       969623  mwp1    leaf sheath auricle pubescence  TO:0002716      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G082264   may have hairy sheaths  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       969623  mwp1    ligule anatomy and morphology trait     TO:0002748      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G082264   ligules on abaxial leaf surface gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
-MaizeGDB       97589   vp14    vivipary        TO:0000619      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G014392   kernels germinate while still on the ear        gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       969623  mwp1            TO:0002716      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G082264   may have hairy sheaths  gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       969623  mwp1            TO:0002748      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G082264   ligules on abaxial leaf surface gene    taxon:4577      20150619        Planteome:Ethan_Johnson         
+MaizeGDB       97589   vp14            TO:0000619      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G014392   kernels germinate while still on the ear        gene    taxon:4577      20150622        Planteome:Ethan_Johnson