Hello!

To see the file structure, click on "tree".

Note that updates take place every 10 minutes, commits may not be seen immediately.
Adding additional annotations
authorcooperl <cooperl@localhost>
Mon, 9 Sep 2024 18:57:48 +0000 (18:57 +0000)
committercooperl <cooperl@localhost>
Mon, 9 Sep 2024 18:57:48 +0000 (18:57 +0000)
svn path=/; revision=1063

po-associations/po_gene_Oryza_Zhang_2021.assoc

index a9f3af5d277d1f0f3ee59ef38dfa1f9eaf679648..4e69778bcff341c4b02bec7464270ce97f7817ad 100644 (file)
@@ -157,3 +157,68 @@ RAP-DB     Os01g0950000    OsGSTU41                PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       T
 RAP-DB Os10g0535800    Os10g0535800            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Protein of unknown function; Cys-rich domain containing protein.                gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
 RAP-DB Os05g0542800    OsPGL9          PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Polygalacturonases-Like 9       PGL9    gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
 RAP-DB Os10g0579600    OsPTR10         PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       PROTEIN TRANSPORTER 10  PTR10|OsNPF7.7|NPF7.7|OsNPF7.7-1|OsNPF7.7-2     gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os05g0591600    LOGL8           PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       LONELY GUY LIKE PHOSPHORIBOHYDROLASE 8          gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os03g0748600    Os03g0748600            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Conserved hypothetical protein          gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os04g0613900    OsHAK11         PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       High-affinity Potassium(K+) Transporter 11              gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os08g0549900    Os08g0549900            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Os08g0549900            gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os02g0190300    OsABCB9         PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       ABC transporter superfamily ABCB subgroup member 9      OsPGP9|OsISC33  gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os02g0767300    Os2ODD15                PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       2-oxoglutarate-dependent dioxygenase 15 FLS|2-ODD15|Os2-ODD15|2ODD15    gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os01g0649200    OsGELP18                PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       GDSL esterase/lipase protein 18 OsGELP18a|OsGELP18b     gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os02g0114900    OsWD40-34               PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       DWD motif- containing protein 72        OsRUP   gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os03g0798500    OsWRKY6         PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Rice WRKY gene6 WRKY-6  gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os09g0425900    OsSAP           PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       senescence associated protein   OsTET13 gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os06g0158000    OsLACS3         PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       long-chain acyl-CoA synthetase 3                gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os12g0198200    OsPP2C77                PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       protein phosphatase 2C77        PP2C77|OsPP129  gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os06g0692100    Os06g0692100            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Protein kinase, catalytic domain containing protein             gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os10g0579800    PTR     PTR     PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       peptide transporter             gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os01g0595400    Os01g0595400            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Protein of unknown function; DUF538 family protein              gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os08g0256000    Os08g0256000            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Conserved hypothetical protein          gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os01g0342900    Os01g0342900            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Similar to Adenosine monophosphate binding protein 1; AMPBP1            gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os07g0684800    ONAC015         PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       NAC domain-containing protein 015       ONAC15|ONAC069|ONAC69   gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os09g0442100    OsRLCK272               PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Receptor-like Cytoplasmic Kinase 272            gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os08g0239300    Os08g0239300            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Dienelactone hydrolase domain containing protein.               gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os09g0240500    OsSultr4;1              PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Similar to Sulfate transporter 4.1, chloroplast precursor (AST82).      OsSul4;1|OsSultr4;1(a)|OsSultr4;1(b)|OsSultr4;1(c)|OsSultr4;1(d)        gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os01g0580800    Os01g0580800            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Similar to submergence induced protein SI397.           gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os03g0390200    OsSAPK1         PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       stress/ABA-activated protein kinase 1           gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os04g0538900    OsGLYI5         PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       glyoxalase I-5          gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os12g0577600    Os12g0577600            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Protein of unknown function; DUF1336 domain containing protein          gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os04g0508800    OsRFP           PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       RING-type E3 ubiquitin ligase 317               gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os04g0617700    Os04g0617700            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Similar to H0313F03.6 protein           gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os07g0442900    Os07g0442900            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Uncharacterised protein family UPF0497          gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os05g0463900    OsHECT5         PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       HECT-type E3 ubiquitin ligase 5         gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os09g0323000    OsUGE4          PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       UDP-glucose epimerase 4         gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os06g0187300    OsRING403               PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       RING-type E3 ubiquitin ligase 403               gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os05g0344400    Os05g0344400            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Uncharacterised protein family UPF0497          gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os10g0524700    Os10g0524700            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Cytochrome P450 family protein          gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os11g0157400    OsExo70A3               PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       exocyst subunit EXO70 family protein A3 OsEXO70A3|OrysaA3_Exo70 gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os01g0614900    OsATG7          PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       AUTOPHAGY ASSOCIATED GENE 7     Atg7    gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os02g0770800    OsNR2           PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       NADH/NADPH-dependent NO3-reductase 2    OsNIA1|OsNia1|NIA1|Nia1|NR      gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os01g0173600    OsGLYI1         PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase domain containing protein           gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os05g0421600    ONAC088         PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       NAC domain-containing protein 088       ONAC88  gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os07g0659300    Os07g0659300            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Conserved hypothetical protein          gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os06g0146600    Os06g0146600            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Hypothetical protein            gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os10g0405600    OsPFK10         PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       phosphofructokinase 10  PFK10   gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os02g0638200    Os02g0638200            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Similar to OSIGBa0115K01-H0319F09.22 protein            gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os06g0151700    OsRLCK196               PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Receptor-like Cytoplasmic Kinase 196            gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os09g0572700    OsUCL33         PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       uclacyanin-like protein 33              gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os01g0292200    OsCIPK01                PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Serine/threonine protein kinase domain containing protein.      CIPK1|OsCIPK1   gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os12g0154700    OsGLP12-1               PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Germin-like protein 12-1                gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os05g0256500    OsMRLK23                PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       MALECTIN/MALECTIN-LIKE RECEPTOR-LIKE KINASE 23          gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os01g0332100    OsNIN2          PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       neutral/alkaline invertase 2    CytINV  gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os02g0787700    Os02g0787700            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Hypothetical protein            gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os09g0426000    OsUMAMIT13              PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Protein of unknown function DUF6, transmembrane domain containing protein.              gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os04g0399300    OsNUDX6         PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Nudix Hydrolase 6               gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os03g0374400    Os03g0374400            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       SNARE associated Golgi protein domain containing protein                gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os07g0134600    Os07g0134600            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Serine/threonine protein kinase domain containing protein.              gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os05g0312600    OsCML21         PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       calmodulin-like protein 21              gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os05g0443400    Os05g0443400            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Similar to Glucan endo-1, 3-beta-glucosidase 7          gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os05g0478400    OsWRKY48                PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Rice WRKY gene48                gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os02g0196600    OsHMA7          PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       heavy metal ATPase 7    osHMA4, HMA7    gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os05g0533500    OsSAT1;3                PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       serine acetyltransferase 1;3            gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os12g0568200    OsMT1c          PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       type 1 metallothionein c        MT1c|OsMT-I-4b|MT-I-4b|OsMT1f|MT1f|MT1Lc|OsMT1Lc        gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os04g0589700    OsPUB35         PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       plant U-box-containing protein 35               gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os02g0773200    OsUSP14         PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       universal stress protein 14             gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os08g0390700    Os08g0390700            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Similar to 2-oxoglutarate-dependent oxygenase           gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os05g0242000    Os05g0242000            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Protein of unknown function DUF247, plant family protein                gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os04g0654400    Os04g0654400            PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       Eggshell protein family protein         gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl              
+RAP-DB Os09g0454600    OsPT19          PO:0000263      DOI:10.1038/s41467-021-22352-4  HEP             A       phosphate transporter 19                gene    NCBITaxon:39947 20240906        PO:cooperl