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authorcooperl <cooperl@localhost>
Mon, 21 Oct 2024 20:02:09 +0000 (20:02 +0000)
committercooperl <cooperl@localhost>
Mon, 21 Oct 2024 20:02:09 +0000 (20:02 +0000)
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M    po-associations/po_growth_gene_oryza_poc.assoc

svn path=/; revision=1101

po-associations/po_growth_gene_oryza_poc.assoc patch | blob | history

diff --git a/po-associations/po_growth_gene_oryza_poc.assoc b/po-associations/po_growth_gene_oryza_poc.assoc
index 05248ed416805b36e7431a2e1986f680202db36f..1b7fdd8b97c22a8c95ed7595a660e8fd7e2d998d 100644 (file)
--- a/po-associations/po_growth_gene_oryza_poc.assoc
+++ b/po-associations/po_growth_gene_oryza_poc.assoc
@@ -3128,7 +3128,6 @@ RAP-DB    Os12g0632000    Os12g0632000            PO:0007633      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0632700    Os12g0632700            PO:0007633      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Malate dehydrogenase, glyoxysomal precursor (EC 1.1.1.37).      lactate/malate dehydrogenase, putative, expressed       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009089)|participates_in(PO:0007042) 
 RAP-DB Os12g0636400    Os12g0636400            PO:0007633      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Epoxide hydrolase family protein.       hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009089)|participates_in(PO:0007042) 
 RAP-DB Os12g0636800    Os12g0636800            PO:0007633      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Ubiquitin-conjugating enzyme 18 (Fragment).     ubiquitin-conjugating enzyme E2 W, putative, expressed  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009089)|participates_in(PO:0007042) 
-RAP-DB osa-miR171a     osa-miR171a             PO:0007633      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009089)|participates_in(PO:0007042)         
 RAP-DB Os01g0100200    Os01g0100200            PO:0007042      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009089)|participates_in(PO:0007633) 
 RAP-DB Os01g0102400    Os01g0102400            PO:0007042      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Histone-fold domain containing protein. histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed     gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009089)|participates_in(PO:0007633) 
 RAP-DB Os01g0102500    Os01g0102500            PO:0007042      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009089)|participates_in(PO:0007633) 
@@ -6257,7 +6256,6 @@ RAP-DB    Os12g0632000    Os12g0632000            PO:0007042      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0632700    Os12g0632700            PO:0007042      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Malate dehydrogenase, glyoxysomal precursor (EC 1.1.1.37).      lactate/malate dehydrogenase, putative, expressed       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009089)|participates_in(PO:0007633) 
 RAP-DB Os12g0636400    Os12g0636400            PO:0007042      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Epoxide hydrolase family protein.       hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009089)|participates_in(PO:0007633) 
 RAP-DB Os12g0636800    Os12g0636800            PO:0007042      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Ubiquitin-conjugating enzyme 18 (Fragment).     ubiquitin-conjugating enzyme E2 W, putative, expressed  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009089)|participates_in(PO:0007633) 
-RAP-DB osa-miR171a     osa-miR171a             PO:0007042      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009089)|participates_in(PO:0007633)         
 RAP-DB Os01g0100400    Os01g0100400            PO:0001083      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Pectinesterase-like protein.    monocopper oxidase, putative, expressed gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009049)|participates_in(PO:0007006) 
 RAP-DB Os01g0101800    Os01g0101800            PO:0001083      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009049)|participates_in(PO:0007006) 
 RAP-DB Os01g0103800    Os01g0103800            PO:0001083      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009049)|participates_in(PO:0007006) 
@@ -7677,8 +7675,6 @@ RAP-DB    Os12g0636100    Os12g0636100            PO:0001083      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0638400    Os12g0638400            PO:0001083      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       PWWP domain containing protein. expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009049)|participates_in(PO:0007006) 
 RAP-DB Os12g0638600    Os12g0638600            PO:0001083      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Hypothetical protein.   expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009049)|participates_in(PO:0007006) 
 RAP-DB Os12g0638800    Os12g0638800            PO:0001083      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       HI0933-like protein family protein.     oxidoreductase, putative, expressed     gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009049)|participates_in(PO:0007006) 
-RAP-DB osa-miR171d     osa-miR171d             PO:0001083      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009049)|participates_in(PO:0007006)         
-RAP-DB osa-miR319a     osa-miR319a             PO:0001083      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009049)|participates_in(PO:0007006)         
 RAP-DB Os01g0100400    Os01g0100400            PO:0007006      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Pectinesterase-like protein.    monocopper oxidase, putative, expressed gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009049)|participates_in(PO:0001083) 
 RAP-DB Os01g0101800    Os01g0101800            PO:0007006      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009049)|participates_in(PO:0001083) 
 RAP-DB Os01g0103800    Os01g0103800            PO:0007006      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009049)|participates_in(PO:0001083) 
@@ -9098,8 +9094,6 @@ RAP-DB    Os12g0636100    Os12g0636100            PO:0007006      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0638400    Os12g0638400            PO:0007006      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       PWWP domain containing protein. expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009049)|participates_in(PO:0001083) 
 RAP-DB Os12g0638600    Os12g0638600            PO:0007006      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Hypothetical protein.   expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009049)|participates_in(PO:0001083) 
 RAP-DB Os12g0638800    Os12g0638800            PO:0007006      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       HI0933-like protein family protein.     oxidoreductase, putative, expressed     gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009049)|participates_in(PO:0001083) 
-RAP-DB osa-miR171d     osa-miR171d             PO:0007006      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009049)|participates_in(PO:0001083)         
-RAP-DB osa-miR319a     osa-miR319a             PO:0007006      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009049)|participates_in(PO:0001083)         
 RAP-DB Os01g0100100    Os01g0100100            PO:0001047      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       RabGAP/TBC domain containing protein.   TBC domain containing protein, expressed        gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009037)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os01g0113000    Os01g0113000            PO:0001047      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Peptidase C48, SUMO/Sentrin/Ubl1 family protein.        conserved hypothetical protein  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009037)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os01g0118600    Os01g0118600            PO:0001047      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Protein of unknown function DUF563 family protein.      glycosyltransferase, putative, expressed        gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009037)|participates_in(PO:0007130) 
@@ -11362,45 +11356,6 @@ RAP-DB Os12g0609100    Os12g0609100            PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0610100    Os12g0610100            PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Expressed gene  expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0000032)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0624400    Os12g0624400            PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Expressed gene  expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0000032)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0634200    Os12g0634200            PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Expressed gene  Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0000032)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR156c     osa-miR156c             PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0000032)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR159c     osa-miR159c             PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0000032)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR159d     osa-miR159d             PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0000032)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR164b     osa-miR164b             PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0000032)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR166h     osa-miR166h             PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0000032)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR167e     osa-miR167e             PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0000032)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR167i     osa-miR167i             PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0000032)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR169c     osa-miR169c             PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0000032)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR171f     osa-miR171f             PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0000032)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR172a     osa-miR172a             PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0000032)|participates_in(PO:0007130) 
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-RAP-DB osa-miR156d     osa-miR156d             PO:0001015      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0025281)|participates_in(PO:0007130)         
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-RAP-DB osa-miR399g     osa-miR399g             PO:0001013      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR408      osa-miR408              PO:0001013      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
 RAP-DB Os01g0112400    Os01g0112400            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Major intrinsic protein family protein. aquaporin protein, putative, expressed  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001013) 
 RAP-DB Os01g0114500    Os01g0114500            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Rust resistance kinase Lr10.    protein kinase domain containing protein        gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001013) 
 RAP-DB Os01g0132200    Os01g0132200            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001013) 
@@ -21752,10 +21594,6 @@ RAP-DB Os12g0503000    Os12g0503000            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0510300    Os12g0510300            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Hypothetical protein.   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001013) 
 RAP-DB Os12g0622200    Os12g0622200            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001013) 
 RAP-DB Os12g0637000    Os12g0637000            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Purple acid phosphatase precursor (EC 3.1.3.2). Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001013) 
-RAP-DB osa-miR156h     osa-miR156h             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001013)         
-RAP-DB osa-miR394      osa-miR394              PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001013)         
-RAP-DB osa-miR399g     osa-miR399g             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001013)         
-RAP-DB osa-miR408      osa-miR408              PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001013)         
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 RAP-DB Os01g0207500    Os01g0207500            PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130) 
@@ -21970,11 +21808,6 @@ RAP-DB Os12g0582900    Os12g0582900            PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
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 RAP-DB Os12g0600600    Os12g0600600            PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Hypothetical protein.   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0633900    Os12g0633900            PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Hypothetical protein.   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR156i     osa-miR156i             PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR164a     osa-miR164a             PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR169o     osa-miR169o             PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR172b     osa-miR172b             PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR439f     osa-miR439f             PO:0001029      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
 RAP-DB Os01g0121200    Os01g0121200            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Zn-finger, RING domain containing protein.      protein binding protein, putative, expressed    gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001029) 
 RAP-DB Os01g0182200    Os01g0182200            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Small basic membrane integral protein ZmSIP1-2. aquaporin protein, putative, expressed  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001029) 
 RAP-DB Os01g0207500    Os01g0207500            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001029) 
@@ -22189,11 +22022,6 @@ RAP-DB Os12g0582900    Os12g0582900            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0597100    Os12g0597100            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Meprin/TRAF-like domain-containing protein (Fragment) (Fragment).       MATH domain containing protein, expressed       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001029) 
 RAP-DB Os12g0600600    Os12g0600600            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Hypothetical protein.   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001029) 
 RAP-DB Os12g0633900    Os12g0633900            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Hypothetical protein.   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001029) 
-RAP-DB osa-miR156i     osa-miR156i             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001029)         
-RAP-DB osa-miR164a     osa-miR164a             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001029)         
-RAP-DB osa-miR169o     osa-miR169o             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001029)         
-RAP-DB osa-miR172b     osa-miR172b             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001029)         
-RAP-DB osa-miR439f     osa-miR439f             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001029)         
 RAP-DB Os01g0116000    Os01g0116000            PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Protein kinase domain containing protein.       protein kinase domain containing protein        gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os01g0153500    Os01g0153500            PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. conserved hypothetical protein  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130) 
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@@ -22409,18 +22237,6 @@ RAP-DB Os12g0607800    Os12g0607800            PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0624900    Os12g0624900            PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Homologous to GATA-binding transcription factors (AT3g60530/T8B10_190) (GATA transcription factor 4).   GATA zinc finger domain containing protein, expressed   gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0626200    Os12g0626200            PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Auxin responsive SAUR protein family protein.   OsSAUR58 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0636500    Os12g0636500            PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Hypothetical protein.   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR162b     osa-miR162b             PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR164c     osa-miR164c             PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR166l     osa-miR166l             PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR167a     osa-miR167a             PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR167c     osa-miR167c             PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR167d     osa-miR167d             PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR167g     osa-miR167g             PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR167h     osa-miR167h             PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR167j     osa-miR167j             PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR171b     osa-miR171b             PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR171g     osa-miR171g             PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR395o     osa-miR395o             PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0007130)         
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 RAP-DB Os01g0153500    Os01g0153500            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. conserved hypothetical protein  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001009) 
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@@ -22636,18 +22452,6 @@ RAP-DB Os12g0607800    Os12g0607800            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
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 RAP-DB Os12g0626200    Os12g0626200            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Auxin responsive SAUR protein family protein.   OsSAUR58 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001009) 
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-RAP-DB osa-miR164c     osa-miR164c             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR166l     osa-miR166l             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR167a     osa-miR167a             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR167c     osa-miR167c             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR167d     osa-miR167d             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR167g     osa-miR167g             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR167h     osa-miR167h             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR167j     osa-miR167j             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR171b     osa-miR171b             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR171g     osa-miR171g             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR395o     osa-miR395o             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009071)|participates_in(PO:0001009)         
 RAP-DB Os01g0100900    Os01g0100900            PO:0007010      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Pyridoxal-dependent decarboxylase family protein.       decarboxylase, putative, expressed      gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009047)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os01g0104900    Os01g0104900            PO:0007010      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Transferase family protein.     transferase family protein, putative, expressed gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009047)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os01g0105700    Os01g0105700            PO:0007010      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH domain containing protein.      ethylene-responsive protein related, putative, expressed        gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009047)|participates_in(PO:0007130) 
@@ -24358,8 +24162,6 @@ RAP-DB  Os12g0634400    Os12g0634400            PO:0007010      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0636000    Os12g0636000            PO:0007010      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Zn-finger, RING domain containing protein.      zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed    gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009047)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0638700    Os12g0638700            PO:0007010      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       N.plumbaginifolia H+-translocating ATPase mRNA. plasma membrane ATPase, putative, expressed     gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009047)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0639800    Os12g0639800            PO:0007010      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Vesicle-associated membrane protein 722 (AtVAMP722) (Synaptobrevin- related protein 1). vesicle-associated membrane protein, putative, expressed        gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009047)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR156k     osa-miR156k             PO:0007010      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009047)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR159b     osa-miR159b             PO:0007010      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009047)|participates_in(PO:0007130)         
 RAP-DB Os01g0100900    Os01g0100900            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Pyridoxal-dependent decarboxylase family protein.       decarboxylase, putative, expressed      gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009047)|participates_in(PO:0007010) 
 RAP-DB Os01g0104900    Os01g0104900            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Transferase family protein.     transferase family protein, putative, expressed gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os01g0105700    Os01g0105700            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH domain containing protein.      ethylene-responsive protein related, putative, expressed        gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007130) 
@@ -26070,8 +25872,6 @@ RAP-DB  Os12g0634400    Os12g0634400            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0636000    Os12g0636000            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Zn-finger, RING domain containing protein.      zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed    gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0638700    Os12g0638700            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       N.plumbaginifolia H+-translocating ATPase mRNA. plasma membrane ATPase, putative, expressed     gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0639800    Os12g0639800            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Vesicle-associated membrane protein 722 (AtVAMP722) (Synaptobrevin- related protein 1). vesicle-associated membrane protein, putative, expressed        gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR156k     osa-miR156k             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR159b     osa-miR159b             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007130)         
 RAP-DB Os01g0100500    Os01g0100500            PO:0001048      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Immunoglobulin-like domain containing protein.  expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009038)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os01g0106300    Os01g0106300            PO:0001048      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Isoflavone reductase homolog IRL (EC 1.3.1.-).  isoflavone reductase homolog IRL, putative, expressed   gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009038)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os01g0113200    Os01g0113200            PO:0001048      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       LRK14.  Ser/Thr receptor-like kinase, putative, expressed       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009038)|participates_in(PO:0007130) 
@@ -26622,7 +26422,6 @@ RAP-DB  Os12g0621100    Os12g0621100            PO:0001048      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0631200    Os12g0631200            PO:0001048      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Zn-finger, cysteine-rich C6HC domain containing protein.        zinc finger, putative, expressed        gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009038)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0638200    Os12g0638200            PO:0001048      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Peptide transporter.    peptide transporter PTR2, putative, expressed   gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009038)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0640900    Os12g0640900            PO:0001048      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Myosin II heavy chain-like family protein.      ATMAP70 protein, putative, expressed    gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009038)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR166c     osa-miR166c             PO:0001048      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009038)|participates_in(PO:0007130)         
 RAP-DB Os01g0100500    Os01g0100500            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Immunoglobulin-like domain containing protein.  expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001048)|participates_in(PO:0009038) 
 RAP-DB Os01g0106300    Os01g0106300            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Isoflavone reductase homolog IRL (EC 1.3.1.-).  isoflavone reductase homolog IRL, putative, expressed   gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001048)|participates_in(PO:0009038) 
 RAP-DB Os01g0113200    Os01g0113200            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       LRK14.  Ser/Thr receptor-like kinase, putative, expressed       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001048)|participates_in(PO:0009038) 
@@ -27173,7 +26972,6 @@ RAP-DB  Os12g0621100    Os12g0621100            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0631200    Os12g0631200            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Zn-finger, cysteine-rich C6HC domain containing protein.        zinc finger, putative, expressed        gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001048)|participates_in(PO:0009038) 
 RAP-DB Os12g0638200    Os12g0638200            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Peptide transporter.    peptide transporter PTR2, putative, expressed   gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001048)|participates_in(PO:0009038) 
 RAP-DB Os12g0640900    Os12g0640900            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Myosin II heavy chain-like family protein.      ATMAP70 protein, putative, expressed    gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001048)|participates_in(PO:0009038) 
-RAP-DB osa-miR166c     osa-miR166c             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001048)|participates_in(PO:0009038)         
 RAP-DB Os01g0119000    Os01g0119000            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Protein of unknown function DUF563 family protein.      glycosyltransferase protein, putative, expressed        gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os01g0125500    Os01g0125500            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Expressed gene  conserved hypothetical protein  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os01g0127900    Os01g0127900            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Mannose-6-phosphate isomerase, type I family protein.   mannose-6-phosphate isomerase, putative, expressed      gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130) 
@@ -28353,7 +28151,6 @@ RAP-DB  Os12g0598900    Os12g0598900            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0612900    Os12g0612900            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Expressed gene  Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0616400    Os12g0616400            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Transcription factor PCF8 (Fragment).   transposon protein, putative, unclassified, expressed   gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0625200    Os12g0625200            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed      gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR156l     osa-miR156l             PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130)         
 RAP-DB Os01g0132600    Os01g0132600            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Expressed gene  Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
 RAP-DB Os01g0132700    Os01g0132700            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Surfeit locus 5 family protein. mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22, putative, expressed     gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
 RAP-DB Os01g0133000    Os01g0133000            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Expressed gene  Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
@@ -28835,7 +28632,6 @@ RAP-DB  Os12g0598900    Os12g0598900            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0612900    Os12g0612900            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Expressed gene  Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
 RAP-DB Os12g0616400    Os12g0616400            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Transcription factor PCF8 (Fragment).   transposon protein, putative, unclassified, expressed   gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
 RAP-DB Os12g0625200    Os12g0625200            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed      gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
-RAP-DB osa-miR156l     osa-miR156l             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004)         
 RAP-DB Os01g0103100    Os01g0103100            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       TGF-beta receptor, type I/II extracellular region family protein.       peptide transporter PTR2, putative, expressed   gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os01g0108000    Os01g0108000            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os01g0110800    Os01g0110800            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Leucine-rich repeat, plant specific containing protein. TOO MANY MOUTHS precursor, putative, expressed  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130) 
@@ -30096,7 +29892,6 @@ RAP-DB  Os12g0597000    Os12g0597000            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0616900    Os12g0616900            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit.       transketolase, putative, expressed      gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0636900    Os12g0636900            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Non-protein coding transcript, unclassifiable transcript.       purple acid phosphatase precursor, putative, expressed  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0640800    Os12g0640800            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog (EC 2.7.1.37) (PRP4 pre- mRNA processing factor 4 homolog) (Pre-mRNA protein kinase).      serine/threonine-protein kinase PRP4, putative, expressed       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR399j     osa-miR399j             PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130)         
 RAP-DB Os01g0109700    Os01g0109700            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Paired amphipathic helix repeat containing protein.     transcriptional repressor, putative, expressed  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
 RAP-DB Os01g0116100    Os01g0116100            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Copia-like retroelement pol polyprotein.        Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
 RAP-DB Os01g0134800    Os01g0134800            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       (1,4)-beta-xylan endohydrolase, isoenzyme X-II (EC 3.2.1.8) (Fragment). glycosyl hydrolase family 10 protein, putative  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
@@ -30873,7 +30668,6 @@ RAP-DB  Os12g0597000    Os12g0597000            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0616900    Os12g0616900            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit.       transketolase, putative, expressed      gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
 RAP-DB Os12g0636900    Os12g0636900            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Non-protein coding transcript, unclassifiable transcript.       purple acid phosphatase precursor, putative, expressed  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
 RAP-DB Os12g0640800    Os12g0640800            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog (EC 2.7.1.37) (PRP4 pre- mRNA processing factor 4 homolog) (Pre-mRNA protein kinase).      serine/threonine-protein kinase PRP4, putative, expressed       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
-RAP-DB osa-miR399j     osa-miR399j             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004)         
 RAP-DB Os01g0101300    Os01g0101300            PO:0001081      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. snurportin-1, putative, expressed       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009009)|participates_in(PO:0007042) 
 RAP-DB Os01g0104000    Os01g0104000            PO:0001081      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       C-type lectin domain containing protein.        TKL_IRAK_C-LEC  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009009)|participates_in(PO:0007042) 
 RAP-DB Os01g0104800    Os01g0104800            PO:0001081      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Sas10/Utp3 family protein.      sas10/Utp3 family protein, expressed    gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009009)|participates_in(PO:0007042) 
@@ -33895,12 +33689,6 @@ RAP-DB Os12g0638100    Os12g0638100            PO:0001081      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0638500    Os12g0638500            PO:0001081      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Hypothetical protein.   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009009)|participates_in(PO:0007042) 
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-RAP-DB osa-miR166g     osa-miR166g             PO:0001081      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009009)|participates_in(PO:0007042)         
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@@ -38612,46 +38394,6 @@ RAP-DB Os12g0623700    Os12g0623700            PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
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 RAP-DB Os12g0628200    Os12g0628200            PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Hypothetical protein.   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0020048)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0631600    Os12g0631600            PO:0001009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Hypothetical protein.   expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0020048)|participates_in(PO:0007130) 
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-RAP-DB osa-miR396a     osa-miR396a             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0020048)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR396c     osa-miR396c             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0020048)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR396d     osa-miR396d             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0020048)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR399a     osa-miR399a             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0020048)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR399f     osa-miR399f             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0020048)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR399h     osa-miR399h             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0020048)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR399i     osa-miR399i             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0020048)|participates_in(PO:0001009)         
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-RAP-DB osa-miR441c     osa-miR441c             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0020048)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR530      osa-miR530              PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0020048)|participates_in(PO:0001009)         
-RAP-DB osa-miR535      osa-miR535              PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0020048)|participates_in(PO:0001009)         
 RAP-DB Os01g0100800    Os01g0100800            PO:0007042      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007042)     
 RAP-DB Os01g0102800    Os01g0102800            PO:0007042      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       SNF2-related domain containing protein. retrotransposon protein, putative, Ty1-copia subclass, expressed        gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007042)     
 RAP-DB Os01g0118300    Os01g0118300            PO:0007042      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Phosphatidyl serine synthase family protein.    phosphatidylserine synthase, putative   gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007042)     
@@ -41387,7 +41089,6 @@ RAP-DB  Os12g0626300    Os12g0626300            PO:0007042      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0628400    Os12g0628400            PO:0007042      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Fatty acid hydroxylase domain containing protein.       fatty acid hydroxylase, putative, expressed     gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007042)     
 RAP-DB Os12g0631800    Os12g0631800            PO:0007042      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Phytoene dehydrogenase-like.    FAD dependent oxidoreductase domain containing protein, expressed       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007042)     
 RAP-DB Os12g0634800    Os12g0634800            PO:0007042      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Conserved hypothetical protein. NUC189 domain containing protein, expressed     gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007042)     
-RAP-DB osa-miR166n     osa-miR166n             PO:0007042      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007042)     
 RAP-DB Os01g0102000    Os01g0102000            PO:0007606      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Phosphoesterase family protein. phosphoesterase family protein, putative, expressed     gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009030)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os01g0109000    Os01g0109000            PO:0007606      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Group 3 LEA (Type I) protein.   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009030)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os01g0110500    Os01g0110500            PO:0007606      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Protein kinase domain containing protein.       retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed      gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009030)|participates_in(PO:0007130) 
@@ -43244,15 +42945,6 @@ RAP-DB Os12g0603900    Os12g0603900            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0605200    Os12g0605200            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Hypothetical protein.   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0633600    Os12g0633600            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Protein of unknown function DUF221 domain containing protein.   early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed    gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0633700    Os12g0633700            PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Expressed gene  expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB osa-miR166d     osa-miR166d             PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR166k     osa-miR166k             PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR171e     osa-miR171e             PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR171i     osa-miR171i             PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR395a     osa-miR395a             PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR395m     osa-miR395m             PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR395t     osa-miR395t             PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR395u     osa-miR395u             PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130)         
-RAP-DB osa-miR416      osa-miR416              PO:0001004      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0007130)         
 RAP-DB Os01g0109300    Os01g0109300            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain containing protein.      HD domain containing protein 2, putative, expressed     gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001004)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os01g0126600    Os01g0126600            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       X1.     transcription factor X1, putative, expressed    gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
 RAP-DB Os01g0131900    Os01g0131900            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Wound-induced protease inhibitor (WIP1).        BBTI11 - Bowman-Birk type bran trypsin inhibitor precursor, putative    gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
@@ -44079,12 +43771,3 @@ RAP-DB Os12g0603900    Os12g0603900            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0605200    Os12g0605200            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Hypothetical protein.   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
 RAP-DB Os12g0633600    Os12g0633600            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Protein of unknown function DUF221 domain containing protein.   early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed    gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
 RAP-DB Os12g0633700    Os12g0633700            PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       Expressed gene  expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
-RAP-DB osa-miR166d     osa-miR166d             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  miRNA   taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
-RAP-DB osa-miR166k     osa-miR166k             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  miRNA   taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
-RAP-DB osa-miR171e     osa-miR171e             PO:0007130      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     G       miRNA   Expressed gene  miRNA   taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0009066)|participates_in(PO:0001004) 
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