Hello!

To see the file structure, click on "tree".

Note that updates take place every 10 minutes, commits may not be seen immediately.
-commented out lines with missing data.
authorcooperl <cooperl@localhost>
Thu, 31 Dec 2015 01:12:43 +0000 (01:12 +0000)
committercooperl <cooperl@localhost>
Thu, 31 Dec 2015 01:12:43 +0000 (01:12 +0000)
svn path=/; revision=617

to-associations/Test_PPPP_TO/TO_IMP_gene_M.truncatula.assoc
to-associations/Test_PPPP_TO/TO_IMP_gene_S.lycopersicum.assoc

index 7a21e9c6e154784b99944e858e2e7e24cdafab69..54af922a54709bd05495076e2078457e29dba2cf 100644 (file)
@@ -3,16 +3,16 @@ LIS   ABE72958.1      CPK3    root nodule number      TO:0000900      25774204        IMP             T       ABE72958.1      Inc
 LIS    ADC33495.1      VPY                     25774204        IMP                     ADC33495.1      Aborted mycorrhizae formation   gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    ADC33495.1      VPY                     25774204        IMP                     ADC33495.1      Rhizobial Infection thread abnormal     gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    ADC33495.1      VPY     root nodule number      TO:0000900      25774204        IMP             T       ADC33495.1      root nodulation decreased       gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      Ovules exposed by unfused carpel edges  gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      abnomal ovules  gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      either sepal-like or petal-like structures      gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      fewer ovules    gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      fused whorl of stamens and petals       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      seed pods absent        gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      small carpel    gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      small flowers   gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      stigma sometimes absent gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      style sometimes absent  gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      Ovules exposed by unfused carpel edges  gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!!LIS  AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      abnomal ovules  gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      either sepal-like or petal-like structures      gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      fewer ovules    gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      fused whorl of stamens and petals       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      seed pods absent        gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      small carpel    gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      small flowers   gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      stigma sometimes absent gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   AFI56799.1      NAM                     25774204        IMP                     AFI56799.1      style sometimes absent  gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    AFI56799.1      NAM     carpel anatomy and morphology trait     TO:0006012      25774204        IMP             T       AFI56799.1      abnormal carpel gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    AFI56799.1      NAM     cotyledon anatomy and morphology trait  TO:0000749      25774204        IMP             T       AFI56799.1      fused cotyledons        gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    AFI56799.1      NAM     embryo shape    TO:0000193      25774204        IMP             T       AFI56799.1      cylindrical embryos     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
@@ -24,97 +24,97 @@ LIS AFI56799.1      NAM     trichome anatomy and morphology trait   TO:0000911      25774204        IMP
 LIS    AFI56799.1      NAM     vascular leaf anatomy and morphology trait      TO:0000419      25774204        IMP             T       AFI56799.1      fused leaflets  gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    AFI56799.1      NAM     vascular leaf anatomy and morphology trait      TO:0000419      25774204        IMP             T       AFI56799.1      malformed juvenile vascular leaves      gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    CAD48198.1      ENOD40  tissue development trait        TO:0006015      25774204        IMP             T       CAD48198.1      Abnormal tissue development     gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    CAI29046.1      MtAOC                   25774204        IMP                     CAI29046.1      Arbuscle formation decreased    gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    CAI29046.1      MtAOC                   25774204        IMP                     CAI29046.1      Arbuscle structure normal       gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    CAI29046.1      MtAOC                   25774204        IMP                     CAI29046.1      Reduced root Jasmonic Acid levels       gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    CAI29046.1      MtAOC                   25774204        IMP                     CAI29046.1      mycorrhizae delayed colonization        gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    CAR57918.1      MtCCD1                  25774204        IMP                     CAR57918.1      Degenerate arbuscles    gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   CAI29046.1      MtAOC                   25774204        IMP                     CAI29046.1      Arbuscle formation decreased    gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   CAI29046.1      MtAOC                   25774204        IMP                     CAI29046.1      Arbuscle structure normal       gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   CAI29046.1      MtAOC                   25774204        IMP                     CAI29046.1      Reduced root Jasmonic Acid levels       gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   CAI29046.1      MtAOC                   25774204        IMP                     CAI29046.1      mycorrhizae delayed colonization        gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   CAR57918.1      MtCCD1                  25774204        IMP                     CAR57918.1      Degenerate arbuscles    gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    CAR57918.1      MtCCD1  carotene content        TO:0000289      25774204        IMP             T       CAR57918.1      Apocarotenoid levels abnormal in roots  gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr1g056530   HAP2.1                  25774204        IMP                     Medtr1g056530   nonfunctional root nodules      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr1g056530   HAP2.1                  25774204        IMP                     Medtr1g056530   nonfunctional root nodules      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr1g056530   HAP2.1  root nodule anatomy and morphology trait        TO:0000898      25774204        IMP             T       Medtr1g056530   small root nodules      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr1g090320   LIN                     25774204        IMP                     Medtr1g090320   aborted infection threads       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr1g090320   LIN                     25774204        IMP                     Medtr1g090320   decreased rhizobial infection   gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr1g090320   LIN                     25774204        IMP                     Medtr1g090320   nodule development arrested     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr1g090320   LIN                     25774204        IMP                     Medtr1g090320   aborted infection threads       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson!\r
+!LIS   Medtr1g090320   LIN                     25774204        IMP                     Medtr1g090320   decreased rhizobial infection   gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr1g090320   LIN                     25774204        IMP                     Medtr1g090320   nodule development arrested     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr1g101600   CBF4    root length     TO:0000227      25774204        IMP             T       Medtr1g101600   Higher Primary root length      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr1g101600   CBF4    salt tolerance  TO:0006001      25774204        IMP             T       Medtr1g101600   Salt-stress tolerance increased gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr2g005870   DMI1                    25774204        IMP                     Medtr2g005870   Infection thread aborted        gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr2g005870   DMI1                    25774204        IMP                     Medtr2g005870   Infection thread aborted        gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr2g005870   DMI1    root nodule number      TO:0000900      25774204        IMP             T       Medtr2g005870   root nodules absent     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)                   25774204        IMP                     Medtr2g035020   Increased isoflavones in roots  gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)                   25774204        IMP                     Medtr2g035020   Reduced saponins in roots       gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)                   25774204        IMP                     Medtr2g035020   Increased isoflavones in roots  gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)                   25774204        IMP                     Medtr2g035020   Reduced saponins in roots       gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)   germination rate        TO:0000430      25774204        IMP             T       Medtr2g035020   Seed germination delayed        gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)   plant structure growth and development trait    TO:0000928      25774204        IMP             T       Medtr2g035020   Plant growth stunted    gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)   root branching  TO:0000257      25774204        IMP             T       Medtr2g035020   Roots less branched     gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)   root length     TO:0000227      25774204        IMP             T       Medtr2g035020   Roots short     gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr3g021350   cyp716A12                       25774204        IMP                     Medtr3g021350   Impaired hemolytic saponin synthesis    gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr3g021350   cyp716A12                       25774204        IMP                     Medtr3g021350   Impaired hemolytic saponin synthesis    gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr3g021350   cyp716A12       plant structure growth and development trait    TO:0000928      25774204        IMP             T       Medtr3g021350   Plant growth stunted    gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr3g098560   SGL1    flower anatomy and morphology trait     TO:0000499      25774204        IMP             T       Medtr3g098560   fused flowers   gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr3g098560   SGL1    leaf shape      TO:0000492      25774204        IMP             T       Medtr3g098560   simple, unifoliate (not compound) leaves        gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr3g098560   SGL1    petiole length  TO:0000766      25774204        IMP             T       Medtr3g098560   Short petiole   gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr3g099620   bHLH1                   25774204        IMP                     Medtr3g099620   Nodulation delayed      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+LIS    Medtr3g098560   SGL1    petiole length  TO:0000766      25774204        IMP             T       Medtr3g098560   Short petiole   gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson!\r
+!LIS   Medtr3g099620   bHLH1                   25774204        IMP                     Medtr3g099620   Nodulation delayed      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr3g099620   bHLH1   plant organ growth and development trait        TO:0000927      25774204        IMP             T       Medtr3g099620   reduced growth of aboveground plant organs      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr3g099620   bHLH1   vascular bundle development trait       TO:0020109      25774204        IMP             T       Medtr3g099620   Assymetrical development of nodule vascular bundles     gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr3g106420   FLOT2                   25774204        IMP                     Medtr3g106420   A decrease in plants that form pink nodules     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr3g106420   FLOT2                   25774204        IMP                     Medtr3g106420   Decreased rhizobial infection   gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr3g106420   FLOT2                   25774204        IMP                     Medtr3g106420   reduced acetylene reduction     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr3g106420   FLOT2                   25774204        IMP                     Medtr3g106420   A decrease in plants that form pink nodules     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr3g106420   FLOT2                   25774204        IMP                     Medtr3g106420   Decreased rhizobial infection   gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr3g106420   FLOT2                   25774204        IMP                     Medtr3g106420   reduced acetylene reduction     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr3g106420   FLOT2   lateral root length     TO:0001012      25774204        IMP             T       Medtr3g106420   Long primary lateral roots      gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr3g106420   FLOT2   root nodule number              25774204        IMP                     Medtr3g106420   More no-nodule plants   gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr3g106420   FLOT2   root nodule number      TO:0000900      25774204        IMP             T       Medtr3g106420   Fewer nodules per plant gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr3g106420   FLOT2   seminal root length     TO:0000586      25774204        IMP             T       Medtr3g106420   Decreased primary root length   gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr3g106430   FLOT4                   25774204        IMP                     Medtr3g106430   A decrease in plants that form pink nodules     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr3g106430   FLOT4                   25774204        IMP                     Medtr3g106430   aborted infection threads       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr3g106430   FLOT4                   25774204        IMP                     Medtr3g106430   decreased rhizobial infection   gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr3g106430   FLOT4                   25774204        IMP                     Medtr3g106430   reduced acetylene reduction     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr3g106430   FLOT4                   25774204        IMP                     Medtr3g106430   A decrease in plants that form pink nodules     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr3g106430   FLOT4                   25774204        IMP                     Medtr3g106430   aborted infection threads       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr3g106430   FLOT4                   25774204        IMP                     Medtr3g106430   decreased rhizobial infection   gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr3g106430   FLOT4                   25774204        IMP                     Medtr3g106430   reduced acetylene reduction     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr3g106430   FLOT4   root nodule number      TO:0000900      25774204        IMP             T       Medtr3g106430   Fewer nodules per plant gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr3g106430   FLOT4   root number     TO:0000084      25774204        IMP             T       Medtr3g106430   Increased secondary roots       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr3g106480   FLOT3   root length     TO:0000227      25774204        IMP             T       Medtr3g106480   Decreased root length   gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr3g106480   FLOT3   root weight     TO:0000279      25774204        IMP             T       Medtr3g106480   Reduced root weight     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr4g070970   SUNN                    25774204        IMP                     Medtr4g070970   Wild type nodulation response to ethylene       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr4g070970   SUNN                    25774204        IMP                     Medtr4g070970   nodulation occurs in abnormal places on root    gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr4g070970   SUNN                    25774204        IMP                     Medtr4g070970   nodulation under high nitrogen  gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr4g070970   SUNN                    25774204        IMP                     Medtr4g070970   Wild type nodulation response to ethylene       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr4g070970   SUNN                    25774204        IMP                     Medtr4g070970   nodulation occurs in abnormal places on root    gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr4g070970   SUNN                    25774204        IMP                     Medtr4g070970   nodulation under high nitrogen  gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr4g070970   SUNN    root length     TO:0000227      25774204        IMP             T       Medtr4g070970   short roots     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr4g070970   SUNN    root nodule number      TO:0000900      25774204        IMP             T       Medtr4g070970   increased number of root nodules        gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr4g084140   MtNAP1                  25774204        IMP                     Medtr4g084140   aborted infection threads       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr4g084140   MtNAP1                  25774204        IMP                     Medtr4g084140   decreased rhizobial infection   gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr4g084140   MtNAP1                  25774204        IMP                     Medtr4g084140   reduced acetylene reduction     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr4g084140   MtNAP1                  25774204        IMP                     Medtr4g084140   aborted infection threads       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr4g084140   MtNAP1                  25774204        IMP                     Medtr4g084140   decreased rhizobial infection   gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr4g084140   MtNAP1                  25774204        IMP                     Medtr4g084140   reduced acetylene reduction     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr4g084140   MtNAP1  enzyme activity trait   TO:0000599      25774204        IMP             T       Medtr4g084140   low nitrogenase activity in nodules     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr4g084140   MtNAP1  root nodule anatomy and morphology trait        TO:0000898      25774204        IMP             T       Medtr4g084140   root nodules undeveloped and small      gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr4g084140   MtNAP1  root nodule number      TO:0000900      25774204        IMP             T       Medtr4g084140   Fewer root nodules      gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr5g011250   ANS                     25774204        IMP                     Medtr5g011250   Reduced seed Oligomeric proanthocyanidin levels gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr5g011250   ANS                     25774204        IMP                     Medtr5g011250   Reduced seed Oligomeric proanthocyanidin levels gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr5g011250   ANS     anthocyanin content     TO:0000071      25774204        IMP             T       Medtr5g011250   Reduced leaf Anthocyanin levels gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr5g014400   PALM1                   25774204        IMP                     Medtr5g014400   Distal lateral leaflets develop similarly to terminal leaflets  gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr5g014400   PALM1                   25774204        IMP                     Medtr5g014400   Rachis length decreased gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr5g014400   PALM1                   25774204        IMP                     Medtr5g014400   Distal lateral leaflets develop similarly to terminal leaflets  gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr5g014400   PALM1                   25774204        IMP                     Medtr5g014400   Rachis length decreased gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr5g014400   PALM1   leaf anatomy and morphology trait       TO:0000748      25774204        IMP             T       Medtr5g014400   Forms dissected leaves  gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr5g014400   PALM1   leaf anatomy and morphology trait       TO:0000748      25774204        IMP             T       Medtr5g014400   Palmate-like pentafoliate leaves        gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr5g014400   PALM1   petiole length  TO:0000766      25774204        IMP             T       Medtr5g014400   Petiole length increased        gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr5g019040   NFP                     25774204        IMP                     Medtr5g019040   Infection thread aborted        gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr5g019040   NFP                     25774204        IMP                     Medtr5g019040   root nodules absent     gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr5g022030   CDPK1                   25774204        IMP                     Medtr5g022030   mycorrhizal symbioses decreased gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr5g019040   NFP                     25774204        IMP                     Medtr5g019040   Infection thread aborted        gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr5g019040   NFP                     25774204        IMP                     Medtr5g019040   root nodules absent     gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr5g022030   CDPK1                   25774204        IMP                     Medtr5g022030   mycorrhizal symbioses decreased gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr5g022030   CDPK1   root cortical cell length       TO:0020108      25774204        IMP             T       Medtr5g022030   reduced root cell length        gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr5g022030   CDPK1   root hair length        TO:0002665      25774204        IMP             T       Medtr5g022030   reduced root hair length        gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr5g022030   CDPK1   root nodule anatomy and morphology trait        TO:0000898      25774204        IMP             T       Medtr5g022030   root nodulation decreased       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr5g026850   CYCLOPS                 25774204        IMP                     Medtr5g026850   inhibited mycorrhizal infection gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr5g026850   CYCLOPS                 25774204        IMP                     Medtr5g026850   inhibited rhizobial infection   gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr5g026850   CYCLOPS                 25774204        IMP                     Medtr5g026850   inhibited mycorrhizal infection gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr5g026850   CYCLOPS                 25774204        IMP                     Medtr5g026850   inhibited rhizobial infection   gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr5g026850   CYCLOPS root nodule anatomy and morphology trait        TO:0000898      25774204        IMP             T       Medtr5g026850   arrested nodule development     gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr5g030920   nork                    25774204        IMP                     Medtr5g030920   mycorrhizal symbioses absent    gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr5g030920   nork                    25774204        IMP                     Medtr5g030920   mycorrhizal symbioses absent    gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr5g030920   nork    root nodule number      TO:0000900      25774204        IMP             T       Medtr5g030920   Root nodules absent in presence of Nod factor   gene    taxon:3880      20150701        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr5g030920   nork    root nodule number      TO:0000900      25774204        IMP             T       Medtr5g030920   Root nodules absent in presence of the rhizobial Sinorhizobium meliloti gene    taxon:3880      20150701        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr5g086120   LYK4                    25774204        IMP                     Medtr5g086120   Infection thread aborted        gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr5g086120   LYK4                    25774204        IMP                     Medtr5g086120   Infection thread aborted        gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr5g086120   LYK4    root nodule number      TO:0000900      25774204        IMP             T       Medtr5g086120   root nodules absent     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr5g086130   LYK3                    25774204        IMP                     Medtr5g086130   Infection thread aborted        gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr5g086130   LYK3                    25774204        IMP                     Medtr5g086130   Infection thread aborted        gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr5g086130   LYK3    root nodule number      TO:0000900      25774204        IMP             T       Medtr5g086130   root nodules absent     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr6g071190   FCL1                    25774204        IMP                     Medtr6g071190   Leaf rachis malformed   gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr6g071190   FCL1                    25774204        IMP                     Medtr6g071190   Leaf rachis malformed   gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr6g071190   FCL1    petiole length  TO:0000766      25774204        IMP             T       Medtr6g071190   Short petiole   gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr6g071190   FCL1    vascular leaf anatomy and morphology trait      TO:0000419      25774204        IMP             T       Medtr6g071190   Fused leaflets  gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr7g084970   FTa1    flowering time trait    TO:0002616      25774204        IMP             T       Medtr7g084970   Delayed flowering       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr7g085040   FTc     flower development trait        TO:0000622      25774204        IMP             T       Medtr7g085040   Flower development normal under long days       gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr7g085810   ERN                     25774204        IMP                     Medtr7g085810   Rhizobial colonization blocked  gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr7g085810   ERN                     25774204        IMP                     Medtr7g085810   Signal transduction for nodulation blocked      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr7g101410   Skl1                    25774204        IMP                     Medtr7g101410   Reduced autocatylic ethylene production gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr7g101410   Skl1                    25774204        IMP                     Medtr7g101410   Reduced inhibition of root growth in response to application of exogenous cytokinin benzyl adenine      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr7g101410   Skl1                    25774204        IMP                     Medtr7g101410   increased mycorrhizal infections        gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr7g101410   Skl1                    25774204        IMP                     Medtr7g101410   increased pathogenic fungal damage      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr7g101410   Skl1                    25774204        IMP                     Medtr7g101410   increased persistant rhizobia infection gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr7g101410   Skl1                    25774204        IMP                     Medtr7g101410   radial swelling of primary infection zone       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr7g085810   ERN                     25774204        IMP                     Medtr7g085810   Rhizobial colonization blocked  gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr7g085810   ERN                     25774204        IMP                     Medtr7g085810   Signal transduction for nodulation blocked      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr7g101410   Skl1                    25774204        IMP                     Medtr7g101410   Reduced autocatylic ethylene production gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr7g101410   Skl1                    25774204        IMP                     Medtr7g101410   Reduced inhibition of root growth in response to application of exogenous cytokinin benzyl adenine      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr7g101410   Skl1                    25774204        IMP                     Medtr7g101410   increased mycorrhizal infections        gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr7g101410   Skl1                    25774204        IMP                     Medtr7g101410   increased pathogenic fungal damage      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr7g101410   Skl1                    25774204        IMP                     Medtr7g101410   increased persistant rhizobia infection gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr7g101410   Skl1                    25774204        IMP                     Medtr7g101410   radial swelling of primary infection zone       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr7g101410   Skl1    gravity response trait  TO:0002693      25774204        IMP             T       Medtr7g101410   No loss of geotropism   gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr7g101410   Skl1    hypocotyl anatomy and morphology trait  TO:0000757      25774204        IMP             T       Medtr7g101410   lack of inhibition of hypocotyl growth  gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr7g101410   Skl1    hypocotyl anatomy and morphology trait  TO:0000757      25774204        IMP             T       Medtr7g101410   reduced apical hook angle       gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
@@ -122,17 +122,17 @@ LIS       Medtr7g101410   Skl1    root development trait  TO:0000656      25774204        IMP             T       Medtr7g
 LIS    Medtr7g101410   Skl1    root hair length        TO:0002665      25774204        IMP             T       Medtr7g101410   reduced ectopic root hairs      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr7g101410   Skl1    root nodule number      TO:0000900      25774204        IMP             T       Medtr7g101410   Absence of nodules      gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr7g101410   Skl1    seedling cotyledon size TO:0000752      25774204        IMP             T       Medtr7g101410   large cotyledons        gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr8g020200   ELF4                    25774204        IMP                     Medtr8g020200   Circadian rhythm abnormal       gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr8g043970   DMI3                    25774204        IMP                     Medtr8g043970   mycorrhizal symbioses absent    gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr8g020200   ELF4                    25774204        IMP                     Medtr8g020200   Circadian rhythm abnormal       gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr8g043970   DMI3                    25774204        IMP                     Medtr8g043970   mycorrhizal symbioses absent    gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr8g043970   DMI3    root nodule number      TO:0000900      25774204        IMP             T       Medtr8g043970   root nodule absent      gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr8g058380   CDC16   auxin sensitivity       TO:0000163      25774204        IMP             T       Medtr8g058380   Reduced auxin sensitivity by roots      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr8g058380   CDC16   root nodule anatomy and morphology trait        TO:0000898      25774204        IMP             T       Medtr8g058380   Increased nodules       gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr8g058710   chitIII-3                       25774204        IMP                     Medtr8g058710   Increased fungal spore germination      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr8g058710   chitIII-3                       25774204        IMP                     Medtr8g058710   Increased fungal spore production       gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr8g058710   chitIII-3                       25774204        IMP                     Medtr8g058710   Increased mycorrhizal infections        gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr8g106150   MtCre1                  25774204        IMP                     Medtr8g106150   aborted infection threads       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr8g106150   MtCre1                  25774204        IMP                     Medtr8g106150   arrested root nodule development        gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr8g106150   MtCre1                  25774204        IMP                     Medtr8g106150   cytokinin response gene not induced by cytokinins       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr8g058710   chitIII-3                       25774204        IMP                     Medtr8g058710   Increased fungal spore germination      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr8g058710   chitIII-3                       25774204        IMP                     Medtr8g058710   Increased fungal spore production       gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr8g058710   chitIII-3                       25774204        IMP                     Medtr8g058710   Increased mycorrhizal infections        gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr8g106150   MtCre1                  25774204        IMP                     Medtr8g106150   aborted infection threads       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr8g106150   MtCre1                  25774204        IMP                     Medtr8g106150   arrested root nodule development        gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
+!LIS   Medtr8g106150   MtCre1                  25774204        IMP                     Medtr8g106150   cytokinin response gene not induced by cytokinins       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr8g106150   MtCre1  cytokinin sensitivity   TO:0000167      25774204        IMP             T       Medtr8g106150   root growth not inhibited by cytokinins gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr8g106150   MtCre1  root nodule number      TO:0000900      25774204        IMP             T       Medtr8g106150   Fewer root nodules      gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr8g106150   MtCre1  root number     TO:0000084      25774204        IMP             T       Medtr8g106150   Increased secondary roots       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
index ccab1d2e85b628ce87c0ccd32a44fcfa8365f3bc..1e9d8281417bca08422f2a35efa3044edff5d298 100644 (file)
@@ -2,66 +2,66 @@
 SGN_gene       197     b       beta-carotene content   TO:0002695              IMP             T       Solyc06g074240  high fruit beta-carotene        gene    taxon:4081      20150710        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       197     b       lycopene content        TO:0002699              IMP             T       Solyc06g074240  low fruit lycopene      gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       197     b       lycopene content        TO:0002699              IMP             T       Solyc06g074240  high fruit lycopene     gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       197     b                               IMP                     Solyc06g074240  tawny-orange corolla    gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      197     b                               IMP                     Solyc06g074240  tawny-orange corolla    gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       187     bsr4    bacterial disease resistance    TO:0000315              IMP             T       Solyc05g007850  resistance to bacterial spot    gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       187     bsr4                            IMP                     Solyc05g007850  HR response against Xanthomonas campestris pv. vesicatoria      gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      187     bsr4                            IMP                     Solyc05g007850  HR response against Xanthomonas campestris pv. vesicatoria      gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       799     det1    fruit color     TO:0002617              IMP             T       Solyc01g056340  mature green fruits are dark green (enhanced pigment)   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       799     det1    fruit color     TO:0002617              IMP             T       Solyc01g056340  immature green fruits are dark green    gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       799     det1    pigment content TO:0000494              IMP             T       Solyc01g056340  mature red fruits have enhanced pigment gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       5560    gamybl1                         IMP                     Solyc01g009070  no seed germination     gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      5560    gamybl1                         IMP                     Solyc01g009070  no seed germination     gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       5560    gamybl1 gibberellic acid content        TO:0002675              IMP             T       Solyc01g009070  gibberellin deficiency  gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       961     man4                            IMP                     Solyc01g008710  Inactive mannosidase in the fruit       gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       292     y                               IMP                     Solyc01g079620  Decreased naringenin chalcone   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      961     man4                            IMP                     Solyc01g008710  Inactive mannosidase in the fruit       gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      292     y                               IMP                     Solyc01g079620  Decreased naringenin chalcone   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       292     y       epicarp color   TO:0002620              IMP             T       Solyc01g079620  Colorless fruit epidermis       gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       8308    CD2                             IMP                     Solyc01g091630  Decreased cutin gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      8308    CD2                             IMP                     Solyc01g091630  Decreased cutin gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       253     chln    leaf vein color TO:0000719              IMP             T       Solyc01g100490  yellow leaf veins       gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       253     chln    plant height    TO:0000207              IMP             T       Solyc01g100490  small plant size        gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       253     chln    leaf chlorosis  TO:0006060              IMP             T       Solyc01g100490  chlorotic upper leaves  gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       662     Gr                              IMP                     Solyc01g104340  green fruit flesh       gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      662     Gr                              IMP                     Solyc01g104340  green fruit flesh       gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       662     Gr      lycopene content        TO:0002699              IMP             T       Solyc01g104340  decreased fruit lycopene        gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       662     Gr      ethylene sensitivity    TO:0000173              IMP             T       Solyc01g104340  reduced ethylene sensitivity in fruits  gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       662     Gr      leaf senescence TO:0000249              IMP             T       Solyc01g104340  delayed petal senescence        gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       662     Gr                              IMP                     Solyc01g104340  Delayed floral abscission       gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      662     Gr                              IMP                     Solyc01g104340  Delayed floral abscission       gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       662     Gr      fruit growth and development trait      TO:0000929              IMP             T       Solyc01g104340  fruit softening inhibited       gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1515    ddb1    chlorophyll content     TO:0000495              IMP             T       Solyc02g021650  chlorophyll increased   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1515    ddb1    carotenoid content      TO:0000496              IMP             T       Solyc02g021650  carotenoids increased   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       1515    ddb1                            IMP                     Solyc02g021650  ascorbic acid increased gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       1515    ddb1                            IMP                     Solyc02g021650  increased plastid number        gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      1515    ddb1                            IMP                     Solyc02g021650  ascorbic acid increased gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      1515    ddb1                            IMP                     Solyc02g021650  increased plastid number        gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1515    ddb1    plastid development trait       TO:0002714              IMP             T       Solyc02g021650  increased plastid size  gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1515    ddb1    leaf color      TO:0000326              IMP             T       Solyc02g021650  dark green leaves       gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1515    ddb1    fruit color     TO:0002617              IMP             T       Solyc02g021650  deep red fruits gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       301     s                               IMP                     Solyc02g077390  compound inflorescence  gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      301     s                               IMP                     Solyc02g077390  compound inflorescence  gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       5483    LeT6    leaf midvein anatomy and morphology trait       TO:0000822              IMP             T       Solyc02g081120  midvein foreshortened   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       5483    LeT6    leaf vein size  TO:0000821              IMP             T       Solyc02g081120  lateral vein foreshortened      gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       5483    LeT6    petiole size    TO:0000768              IMP             T       Solyc02g081120  petiole foreshortened   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       5483    LeT6    vascular leaf anatomy and morphology trait      TO:0000419              IMP             T       Solyc02g081120  crumpled leaf   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       5483    LeT6                            IMP                     Solyc02g081120  Leaves 3-4 pinnately compound with clavate segments     gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      5483    LeT6                            IMP                     Solyc02g081120  Leaves 3-4 pinnately compound with clavate segments     gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       5483    LeT6    internode length        TO:0000145              IMP             T       Solyc02g081120  Shortened internodes    gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       128     an      flower shape    TO:0000859              IMP             T       Solyc02g081670  flowers greatly changed gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       128     an                              IMP                     Solyc02g081670  compound inflorescence  gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      128     an                              IMP                     Solyc02g081670  compound inflorescence  gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1094    o       fruit shape     TO:0002628              IMP             T       Solyc02g085500  ovate fruit     gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1094    o       fruit shape     TO:0002628              IMP             T       Solyc02g085500  pear shaped fruit       gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       8213    CER6                            IMP                     Solyc02g085870  Increased water loss    gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       428     d                               IMP                     Solyc02g089160  All parts foreshortened gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      8213    CER6                            IMP                     Solyc02g085870  Increased water loss    gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      428     d                               IMP                     Solyc02g089160  All parts foreshortened gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       428     d       leaf color      TO:0000326              IMP             T       Solyc02g089160  leaves dark     gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       428     d                               IMP                     Solyc02g089160  leaves rugose   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       428     d                               IMP                     Solyc02g089160  All parts extremely foreshortened       gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       428     d                               IMP                     Solyc02g089160  All parts shortened     gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      428     d                               IMP                     Solyc02g089160  leaves rugose   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      428     d                               IMP                     Solyc02g089160  All parts extremely foreshortened       gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      428     d                               IMP                     Solyc02g089160  All parts shortened     gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1599    psy1    fruit color     TO:0002617              IMP             T       Solyc03g031860  yellow color of ripe fruit flesh        gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1599    psy1    fruit color     TO:0002617              IMP             T       Solyc03g031860  yellow fruit flesh      gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1599    psy1    flower color    TO:0000537              IMP             T       Solyc03g031860  lighter yellow flowers  gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1599    psy1    fruit color     TO:0002617              IMP             T       Solyc03g031860  reddish color of ripe fruit flesh       gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       4476    zep                             IMP                     Solyc02g090890  wilty   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      4476    zep                             IMP                     Solyc02g090890  wilty   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       4476    zep     abscisic acid content   TO:0002667              IMP             T       Solyc02g090890  abscisic acid deficiency        gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       199     CrtR-b2                         IMP                     Solyc03g007960  buff color corolla      gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      199     CrtR-b2                         IMP                     Solyc03g007960  buff color corolla      gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1418    sucr    sucrose content TO:0000328              IMP             T       Solyc03g083910  mature fruit accumulates sucrose        gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       120     asc                             IMP                     Solyc03g114600  resistant to alternaria stem canker     gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       532     fa                              IMP                     Solyc03g118160  giant   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       532     fa                              IMP                     Solyc03g118160  vegetative      gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      120     asc                             IMP                     Solyc03g114600  resistant to alternaria stem canker     gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      532     fa                              IMP                     Solyc03g118160  giant   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      532     fa                              IMP                     Solyc03g118160  vegetative      gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       532     fa      inflorescence branching TO:0000050              IMP             T       Solyc03g118160  highly ramified inflorescence   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       532     fa      sterility related trait TO:0000485              IMP             T       Solyc03g118160  completely sterile      gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       431     div     plant height    TO:0000207              IMP             T       Solyc03g119060  small plant     gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       431     div                             IMP                     Solyc03g119060  squarrose plant gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      431     div                             IMP                     Solyc03g119060  squarrose plant gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       431     div     leaf color      TO:0000326              IMP             T       Solyc03g119060  intercostally yellowish leaves  gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       431     div     leaf color      TO:0000326              IMP             T       Solyc03g119060  ventrally purple leaves gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       996     SlMlo1  fungal disease resistance       TO:0000439              IMP             T       Solyc04g049090  resistance to powdery mildew    gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
@@ -69,24 +69,24 @@ SGN_gene    347     cu3     plant height    TO:0000207              IMP             T       Solyc04g051510  Dwarf   gene    taxon
 SGN_gene       347     cu3     hypocotyl anatomy and morphology trait  TO:0000757              IMP             T       Solyc04g051510  short and thick hypocotyls      gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       347     cu3     fertility related trait TO:0000420              IMP             T       Solyc04g051510  reduced fertility.      gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       347     cu3     cotyledon anatomy and morphology trait  TO:0000749              IMP             T       Solyc04g051510  curled cotyledons       gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       347     cu3                             IMP                     Solyc04g051510  dense leaves    gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      347     cu3                             IMP                     Solyc04g051510  dense leaves    gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       347     cu3     leaf curling    TO:0002681              IMP             T       Solyc04g051510  curly leaves    gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       347     cu3     plant height    TO:0000207              IMP             T       Solyc04g051510  reduced height to 50%   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       8373    ORR     fruit ripening trait    TO:0002633              IMP             T       Solyc04g057980  orange ripening gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       463     e                               IMP                     Solyc04g076850  few fused leaf segments gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      463     e                               IMP                     Solyc04g076850  few fused leaf segments gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       463     e       leaf midvein anatomy and morphology trait       TO:0000822              IMP             T       Solyc04g076850  distorted midvein       gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       463     e                               IMP                     Solyc04g076850  entire or broad leaflets        gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      463     e                               IMP                     Solyc04g076850  entire or broad leaflets        gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       463     e       sepal anatomy and morphology trait      TO:0000864              IMP             T       Solyc04g076850  asymmetrical sepals     gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       463     e       leaf anatomy and morphology trait       TO:0000748              IMP             T       Solyc04g076850  simple leaves   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       463     e       plant trait     TO:0000387              IMP             T       Solyc04g076850  multifusion phenotype   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       4495    cwp1                            IMP                     Solyc04g082520  dehydration of fruits   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       4495    cwp1                            IMP                     Solyc04g082520  microfissuring of fruit cuticle gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      4495    cwp1                            IMP                     Solyc04g082520  dehydration of fruits   gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      4495    cwp1                            IMP                     Solyc04g082520  microfissuring of fruit cuticle gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       900     lyr     leaf shape      TO:0000492              IMP             T       Solyc05g009380  first leaves entire (simple)    gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       900     lyr     leaf shape      TO:0000492              IMP             T       Solyc05g009380  other leaves fan shaped gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       900     lyr     female sterility        TO:0000358              IMP             T       Solyc05g009380  female sterile  gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1296    mc      sepal size      TO:0002604              IMP             T       Solyc05g012020  Sepal large     gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1296    mc      sepal anatomy and morphology trait      TO:0000864              IMP             T       Solyc05g012020  Leaf-like sepal gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       1296    mc                              IMP                     Solyc05g012020  pedicel joint enlarged  gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      1296    mc                              IMP                     Solyc05g012020  pedicel joint enlarged  gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1296    mc      inflorescence anatomy and morphology trait      TO:0000373              IMP             T       Solyc05g012020  inflorescence indeterminate     gene    taxon:4081      20150713        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       541     Fen     bacterial disease resistance    TO:0000315              IMP             T       Solyc05g013290  resistance to Pseudomonas syringae      gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1238    Pto     bacterial disease resistance    TO:0000315              IMP             T       Solyc05g013300  resistance to Pseudomonas syringae      gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
@@ -94,55 +94,55 @@ SGN_gene    1238    Pto     insecticide sensitivity TO:0000182              IMP             T       Solyc05g013300  fent
 SGN_gene       1296    rin     fruit color     TO:0002617              IMP             T       Solyc05g056620  Fruits green at maturity        gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1296    rin     fruit color     TO:0002617              IMP             T       Solyc05g056620  Fruits turning bright yellow,   gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1296    rin     fruit ripening trait    TO:0002633              IMP             T       Solyc05g056620  retarded ripening       gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       271     cf2                             IMP                     solyc06g008300  Resistant to Cladosporium fulvum        gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       1322    sp                              IMP                     Solyc06g074350  indeterminate growth habit      gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       1322    sp                              IMP                     Solyc06g074350  determinate habit       gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      271     cf2                             IMP                     solyc06g008300  Resistant to Cladosporium fulvum        gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      1322    sp                              IMP                     Solyc06g074350  indeterminate growth habit      gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      1322    sp                              IMP                     Solyc06g074350  determinate habit       gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       43107   Cul1    self-incompatibility                    IMP                     Solyc06g084520  pollen rejection        gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       43107   Cul1                            IMP                     Solyc06g084520  compatibility on styles gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      43107   Cul1                            IMP                     Solyc06g084520  compatibility on styles gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1068    not     leaf color      TO:0000326              IMP             T       Solyc07g056570  green-yellow leaves     gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1068    not     leaf anatomy and morphology trait       TO:0000748              IMP             T       Solyc07g056570  delicate leaves gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1068    not     leaf rolling    TO:0000085              IMP             T       Solyc07g056570  wilts in hot weather    gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1068    not     leaf rolling    TO:0000085              IMP             T       Solyc07g056570  wilts in dry weather    gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       483     etr2                            IMP                     Solyc07g056580  delayed abscission      gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      483     etr2                            IMP                     Solyc07g056580  delayed abscission      gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       483     etr2    internode length        TO:0000145              IMP             T       Solyc07g056580  shorter internode length        gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       780     ls      basal axillary branch number    TO:0020024              IMP             T       Solyc07g066250  Few or no axillary branches     gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       780     ls                              IMP                     Solyc07g066250  corolla suppressed      gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      780     ls                              IMP                     Solyc07g066250  corolla suppressed      gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       780     ls      male sterility  TO:0000437              IMP             T       Solyc07g066250  partially male sterile  gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       661     gf      fruit color     TO:0002617              IMP             T       Solyc08g080090  ripe fruit purplish-brown color.        gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       762     lin5    sugar content   TO:0000333              IMP             T       Solyc09g010080  high fruit sugar        gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1164    phyA    red light sensitivity   TO:0000158              IMP             T       Solyc10g044670  far red light insensitive       gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       111013  sun     fruit length    TO:0002626              IMP             T       Solyc10g079240  elongated fruit shape   gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       246     crtiso  fruit color     TO:0002617              IMP             T       Solyc10g081650  fruit flesh orange      gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       246     crtiso                          IMP                     Solyc10g081650  stamens orange  gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       246     crtiso                          IMP                     Solyc10g081650  yellowish growing point gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      246     crtiso                          IMP                     Solyc10g081650  stamens orange  gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      246     crtiso                          IMP                     Solyc10g081650  yellowish growing point gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       246     crtiso  leaf color      TO:0000326              IMP             T       Solyc10g081650  light green foliage     gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       246     crtiso                          IMP                     Solyc10g081650  yellowing near growing point    gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      246     crtiso                          IMP                     Solyc10g081650  yellowing near growing point    gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       755     j       plant height    TO:0000207              IMP             T       Solyc11g010570  higher plant    gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       755     j       internode length        TO:0000145              IMP             T       Solyc11g010570  long internodes gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       755     j       fruit weight    TO:0002746              IMP             T       Solyc11g010570  heavier fruits  gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       755     j       seed number     TO:0000445              IMP             T       Solyc11g010570  less seeds      gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       755     j       inflorescence branch anatomy and morphology trait       TO:0000784              IMP             T       Solyc11g010570  Jointless pedicels      gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       755     j                               IMP                     Solyc11g010570  proliferated inflorescence. Growth rate increased       gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       4504    GAI                             IMP                     Solyc11g011260  suppressed axillary bud development     gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      755     j                               IMP                     Solyc11g010570  proliferated inflorescence. Growth rate increased       gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      4504    GAI                             IMP                     Solyc11g011260  suppressed axillary bud development     gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1187    ptox    chlorophyll content     TO:0000495              IMP             T       Solyc11g011990  incomplete chlorophyll deficiency       gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       717     i2      fungal disease resistance       TO:0000439              IMP             T       Solyc11g071430  Resistance to Fusarium oxysporum        gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       538     fas     carpel anatomy and morphology trait     TO:0006012              IMP             T       Solyc11g071810  unfused carpels gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       538     fas                             IMP                     Solyc11g071810  Fruits many-loculed     gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      538     fas                             IMP                     Solyc11g071810  Fruits many-loculed     gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       391     del     fruit color     TO:0002617              IMP             T       Solyc12g008980  reddish-orange mature fruit color       gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       391     del                             IMP                     Solyc12g008980  lycopene inhibition     gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      391     del                             IMP                     Solyc12g008980  lycopene inhibition     gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       391     del     carotene content        TO:0000289              IMP             T       Solyc12g008980  increased delta-carotene        gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1605    yg2     leaf chlorosis  TO:0006060              IMP             T       Solyc12g009470  Foliage chlorotic yellow-green  gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1605    yg2     hypocotyl anatomy and morphology trait  TO:0000757              IMP             T       Solyc12g009470  long hypocotyls gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1605    yg2     leaf color      TO:0000326              IMP             T       Solyc12g009470  All foliar parts yellow gene    taxon:4081      20150714        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       482     etr1                            IMP                     Solyc12g011330  Delayed abscission      gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      482     etr1                            IMP                     Solyc12g011330  Delayed abscission      gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       482     etr1    internode length        TO:0000145              IMP             T       Solyc12g011330  Shorter internode length        gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       482     etr1                            IMP                     Solyc12g011330  Reduced auxin movement  gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      482     etr1                            IMP                     Solyc12g011330  Reduced auxin movement  gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       277     cf9     fungal disease resistance       TO:0000439              IMP             T       AJ002236        Resistance to Cladosporium fulvum       gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       687     hero    nematode damage resistance      TO:0000384              IMP             T       AJ457051        Resistance to potato cyst nematode      gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       43154   HT-A    self-incompatibility    TO:0000310              IMP             T       AB066584        self-incompatibility    gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       43154   HT-A    gametophytic incompatibility    TO:0000049              IMP             T       AB066582        gametophytic self-incompatibility.      gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       881     lc                              IMP                     JF284938        Reduced locule number   gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       881     lc                              IMP                     JF285116        High locule number      gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      881     lc                              IMP                     JF284938        Reduced locule number   gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      881     lc                              IMP                     JF285116        High locule number      gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1305    Mi1-2   nematode damage resistance      TO:0000384              IMP             T       SGN-U564276     High-level root-knot nematode resistance        gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1305    Mi1-2   aphid resistance        TO:0006067              IMP             T       SGN-U564276     Resistance to potato aphids     gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1305    Mi1-2                           IMP                     SGN-U564276     Resistance to potato whitefly   gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
@@ -151,17 +151,17 @@ SGN_gene  1345    sit     leaf height     TO:0000541              IMP             T       HQ317907        very short leaves       gene
 SGN_gene       1345    sit     leaf curling    TO:0002681              IMP             T       HQ317907        leaves down curled      gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1345    sit     leaf necrosis   TO:0000652              IMP             T       HQ317907        becoming necrotic       gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1345    sit     abscisic acid content   TO:0002667              IMP             T       HQ317908        Abscisic acid deficient gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       1345    sit                             IMP                     HQ317908        wilty   gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       1462    tm2                             IMP                     FJ817603        High-level tobacco mosaic virus resistance      gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       111014  wo                              IMP                     Solyc02g080490  All parts densely pubescent     gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       111014  wo                              IMP                     Solyc02g080490  wooly   gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       212     bl                              IMP                     Solyc11g069030  Determinate habit       gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       212     bl                              IMP                     Solyc11g069030  strongly uprolled pinnae        gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      1345    sit                             IMP                     HQ317908        wilty   gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      1462    tm2                             IMP                     FJ817603        High-level tobacco mosaic virus resistance      gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      111014  wo                              IMP                     Solyc02g080490  All parts densely pubescent     gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      111014  wo                              IMP                     Solyc02g080490  wooly   gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      212     bl                              IMP                     Solyc11g069030  Determinate habit       gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      212     bl                              IMP                     Solyc11g069030  strongly uprolled pinnae        gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       212     bl      flower shape    TO:0000859              IMP             T       Solyc11g069030  fasciated flowers       gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       212     bl      fruit shape     TO:0002628              IMP             T       Solyc11g069030  fasciated fruits        gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       212     bl      stem anatomy and morphology trait       TO:0000361              IMP             T       Solyc11g069030  Stem terminating in first inflorescence gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       212     bl                              IMP                     Solyc11g069030  midribs may develop adventitious shoots gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       212     bl                              IMP                     Solyc11g069030  Determinant growth      gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      212     bl                              IMP                     Solyc11g069030  midribs may develop adventitious shoots gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      212     bl                              IMP                     Solyc11g069030  Determinant growth      gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       212     bl      sepal anatomy and morphology trait      TO:0000864              IMP             T       Solyc11g069030  leafy calyx     gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       212     bl      sepal anatomy and morphology trait      TO:0000864              IMP             T       Solyc11g069030  enlarged calyx  gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       212     bl      inflorescence anatomy and morphology trait      TO:0000373              IMP             T       Solyc11g069030  few flowered inflorescence      gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
@@ -172,8 +172,8 @@ SGN_gene    1046    Nr2     fruit firmness  TO:0002634              IMP             T       Solyc09g075440  fruit flesh f
 SGN_gene       555     flc     leaf color      TO:0000326              IMP             T       Solyc07g066480  yellowish leaves        gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       555     flc     leaf rolling    TO:0000085              IMP             T       Solyc07g066480  overwilting leaves      gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       555     flc     leaf height     TO:0000541              IMP             T       Solyc07g066480  short leaves    gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       555     flc                             IMP                     Solyc07g066480  nearly unbranched plant and later spreading     gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       555     flc                             IMP                     Solyc07g066480  erect plant     gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      555     flc                             IMP                     Solyc07g066480  nearly unbranched plant and later spreading     gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      555     flc                             IMP                     Solyc07g066480  erect plant     gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       555     flc     plant height    TO:0000207              IMP             T       Solyc07g066480  small plant     gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       539     fer     leaf chlorosis  TO:0006060              IMP             T       Solyc06g051550  Severe chlorosis beginning in first true leaves gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       539     fer     mineral and ion transport trait TO:0020096              IMP             T       Solyc06g051550  faulty iron transport in xylem  gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
@@ -189,14 +189,14 @@ SGN_gene  8229    GOB     shoot apical meristem development       TO:0006020              IMP             T       Solyc07g0
 SGN_gene       1465    APS1    gravity response trait  TO:0002693              IMP             T               In seedlings, roots grow agravitropicaly for first 4-5 days after germination, then gradually re-orientation towards gravity.   gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1465    APS1    gravity response trait  TO:0002693              IMP             T       APS1    Shoots show mild agravitropism throughout life of plant.        gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1465    APS1    fruit size      TO:0002625              IMP             T       APS1    Fruit size slightly reduced.    gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       1465    APS1                            IMP                     APS1    Root tips do not stain for starch using Lugol's iodine solution.        gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       1465    APS1                            IMP                     APS1    leaves do not stain for starch using Lugol's iodine solution.   gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       1465    APS1                            IMP                     APS1    fruit do not stain for starch using Lugol's iodine solution.    gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       1465    APS1                            IMP                     APS1    stems do not stain for starch using Lugol's iodine solution.    gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      1465    APS1                            IMP                     APS1    Root tips do not stain for starch using Lugol's iodine solution.        gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      1465    APS1                            IMP                     APS1    leaves do not stain for starch using Lugol's iodine solution.   gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      1465    APS1                            IMP                     APS1    fruit do not stain for starch using Lugol's iodine solution.    gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
+!SGN_gene      1465    APS1                            IMP                     APS1    stems do not stain for starch using Lugol's iodine solution.    gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1465    APS1    starch content  TO:0000696              IMP             T       APS1    Starch levels in mature green fruit below detection limit of spectrophotometric assay.  gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       1465    APS1    sugar content   TO:0000333              IMP             T       APS1    BRIX levels slightly lower than wild type.      gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       20827   rdr6    leaf width      TO:0000370              IMP             T       Solyc04g014870  slender leaves  gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       20827   rdr6    plant height    TO:0000207              IMP             T       Solyc04g014870  dwarfed plant   gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       20827   rdr6    petal width     TO:0002606              IMP             T       Solyc04g014870  slender petals  gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
 SGN_gene       20827   rdr6    leaf shape      TO:0000492              IMP             T       Solyc04g014870  shoestring leaves       gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson\r
-SGN_gene       20827   rdr6                            IMP                     Solyc04g014870  no leaf blade expansion gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson
\ No newline at end of file
+!SGN_gene      20827   rdr6                            IMP                     Solyc04g014870  no leaf blade expansion gene    taxon:4081      20150715        Ethan Johnson
\ No newline at end of file