Hello!

To see the file structure, click on "tree".

Note that updates take place every 10 minutes, commits may not be seen immediately.
projects / associations / .git / commitdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | patch | inline | side by side (parent: 865ddca)
Fixed Ethan Johnson! assigned by column.
authorcooperl <cooperl@localhost>
Thu, 31 Dec 2015 19:57:14 +0000 (19:57 +0000)
committercooperl <cooperl@localhost>
Thu, 31 Dec 2015 19:57:14 +0000 (19:57 +0000)
svn path=/; revision=627

to-associations/Test_PPPP_TO/TO_IMP_gene_M.truncatula.assoc patch | blob | history
to-associations/Test_PPPP_TO/TO_IMP_gene_Z.mays.assoc patch | blob | history

diff --git a/to-associations/Test_PPPP_TO/TO_IMP_gene_M.truncatula.assoc b/to-associations/Test_PPPP_TO/TO_IMP_gene_M.truncatula.assoc
index 0dc3ceff4658265ea0d5ff3b3e1f7adefb26ffc9..f2f9fe5f2617de7f7faf8a6a0974844cd9ea21cd 100644 (file)
--- a/to-associations/Test_PPPP_TO/TO_IMP_gene_M.truncatula.assoc
+++ b/to-associations/Test_PPPP_TO/TO_IMP_gene_M.truncatula.assoc
@@ -32,7 +32,7 @@ LIS   CAD48198.1      ENOD40  tissue development trait        TO:0006015      PMID:25774204   IMP             T       C
 LIS    CAR57918.1      MtCCD1  carotene content        TO:0000289      PMID:25774204   IMP             T       CAR57918.1      Apocarotenoid levels abnormal in roots  gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 !LIS   Medtr1g056530   HAP2.1                  PMID:25774204   IMP                     Medtr1g056530   nonfunctional root nodules      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr1g056530   HAP2.1  root nodule anatomy and morphology trait        TO:0000898      PMID:25774204   IMP             T       Medtr1g056530   small root nodules      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-!LIS   Medtr1g090320   LIN                     PMID:25774204   IMP                     Medtr1g090320   aborted infection threads       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson!\r
+!LIS   Medtr1g090320   LIN                     PMID:25774204   IMP                     Medtr1g090320   aborted infection threads       gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 !LIS   Medtr1g090320   LIN                     PMID:25774204   IMP                     Medtr1g090320   decreased rhizobial infection   gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 !LIS   Medtr1g090320   LIN                     PMID:25774204   IMP                     Medtr1g090320   nodule development arrested     gene    taxon:3880      20150702        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr1g101600   CBF4    root length     TO:0000227      PMID:25774204   IMP             T       Medtr1g101600   Higher Primary root length      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
@@ -49,7 +49,7 @@ LIS   Medtr2g035020   GT3 (UGT73F3)   root length     TO:0000227      PMID:25774204   IMP             T       Medt
 LIS    Medtr3g021350   cyp716A12       plant structure growth and development trait    TO:0000928      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g021350   Plant growth stunted    gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr3g098560   SGL1    flower anatomy and morphology trait     TO:0000499      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g098560   fused flowers   gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr3g098560   SGL1    leaf shape      TO:0000492      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g098560   simple, unifoliate (not compound) leaves        gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
-LIS    Medtr3g098560   SGL1    petiole length  TO:0000766      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g098560   Short petiole   gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson!\r
+LIS    Medtr3g098560   SGL1    petiole length  TO:0000766      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g098560   Short petiole   gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 !LIS   Medtr3g099620   bHLH1                   PMID:25774204   IMP                     Medtr3g099620   Nodulation delayed      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr3g099620   bHLH1   plant organ growth and development trait        TO:0000927      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g099620   reduced growth of aboveground plant organs      gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
 LIS    Medtr3g099620   bHLH1   vascular bundle development trait       TO:0020109      PMID:25774204   IMP             T       Medtr3g099620   Assymetrical development of nodule vascular bundles     gene    taxon:3880      20150706        Ethan Johnson\r
diff --git a/to-associations/Test_PPPP_TO/TO_IMP_gene_Z.mays.assoc b/to-associations/Test_PPPP_TO/TO_IMP_gene_Z.mays.assoc
index aa43c63fd46953ff98a644b17643ec208fdda2ac..cbd18831283088142ab8a935789c00b2dec6218c 100644 (file)
--- a/to-associations/Test_PPPP_TO/TO_IMP_gene_Z.mays.assoc
+++ b/to-associations/Test_PPPP_TO/TO_IMP_gene_Z.mays.assoc
@@ -41,7 +41,7 @@ MaizeGDB      12065   b1      anthocyanin content     TO:0000071      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G172
 MaizeGDB       12065   b1      anthocyanin content     TO:0000071      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G172795   blotches of anthocyanin pigmentation due to cell to cell variability in the levels of anthocyanin production.   gene    taxon:4577      20150616        Ethan Johnson\r
 MaizeGDB       12065   b1      stem color      TO:0000056      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G172795   striped stems   gene    taxon:4577      20150616        Ethan Johnson\r
 MaizeGDB       12065   b1      variegated leaf TO:0000069      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G172795   striped leaves  gene    taxon:4577      20150616        Ethan Johnson\r
-!MaizeGDB      12070   bd1                     PMID:21423772   IMP                     GRMZM2G307119   pistils abort, no silks gene    taxon:4577      20150529        Ethan Johnson!\r
+!MaizeGDB      12070   bd1                     PMID:21423772   IMP                     GRMZM2G307119   pistils abort, no silks gene    taxon:4577      20150529        Ethan Johnson\r
 !MaizeGDB      12070   bd1                     PMID:21423772   IMP                     GRMZM2G307119   silks absent    gene    taxon:4577      20150529        Ethan Johnson\r
 MaizeGDB       12070   bd1     fascicled ear   TO:0000715      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G307119   ear is branched gene    taxon:4577      20150529        Ethan Johnson\r
 MaizeGDB       12077   bk2     leaf shattering TO:0000108      PMID:17932309   IMP             T       GRMZM2G109326   leaves shatter after moderate winds     gene    taxon:4577      20150529        Ethan Johnson\r
@@ -254,7 +254,7 @@ MaizeGDB    12733   vp5     vivipary        TO:0000619      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G410515   kernel
 MaizeGDB       12735   vp8     vivipary        TO:0000619      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G010353   kernels germinate while still on the ear        gene    taxon:4577      20150622        \r
 MaizeGDB       12768   wx1     amylopectin content     TO:0000097      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024993   Amylopectin in endosperm.       gene    taxon:4577      20150622        \r
 MaizeGDB       12768   wx1     amylopectin content     TO:0000097      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G024993   Amylopectin in pollen.  gene    taxon:4577      20150622        \r
-!MaizeGDB      133880  mop1                    PMID:24786611   IMP                     GRMZM2G042443   Reduction of gene silencing     gene    taxon:4577      20150619        Ethan Johnson!\r
+!MaizeGDB      133880  mop1                    PMID:24786611   IMP                     GRMZM2G042443   Reduction of gene silencing     gene    taxon:4577      20150619        Ethan Johnson\r
 !MaizeGDB      133880  mop1                    PMID:24786611   IMP                     GRMZM2G042443   reduction of small RNAs gene    taxon:4577      20150619        Ethan Johnson\r
 MaizeGDB       223331  les22   variegated leaf necrosis        TO:0000070      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G044074   necrotic or chlorotic lesions   gene    taxon:4577      20150619        Ethan Johnson\r
 MaizeGDB       2365883 rel2    kernel number per ear   TO:0000937      PMID:21423772   IMP             T       GRMZM2G042992   Ear with few kernels if any     gene    taxon:4577      20150619        Ethan Johnson\r
Planteome associations