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authorcooperl <cooperl@localhost>
Tue, 5 Nov 2024 22:05:35 +0000 (22:05 +0000)
committercooperl <cooperl@localhost>
Tue, 5 Nov 2024 22:05:35 +0000 (22:05 +0000)
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po-associations/po_anatomy_gene_oryza_poc.assoc patch | blob | history

diff --git a/po-associations/po_anatomy_gene_oryza_poc.assoc b/po-associations/po_anatomy_gene_oryza_poc.assoc
index 710ef7a813f68e197d83d1d164093c3663ebe15b..5f2ee9601ef54bc24b343dfca135d3ceac4539bd 100644 (file)
--- a/po-associations/po_anatomy_gene_oryza_poc.assoc
+++ b/po-associations/po_anatomy_gene_oryza_poc.assoc
@@ -5447,7 +5447,7 @@ RAP-DB    Os02g0298200    Os02g0298200            PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os02g0298900    Os02g0298900            PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Non-protein coding transcript, uncharacterized transcript       expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130)     
 RAP-DB Os02g0302500    Os02g0302500            PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Hypothetical protein    hypothetical protein    gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130)     
 RAP-DB Os02g0304800    Os02g0304800            PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Protein prenyltransferase domain containing protein     PPR repeat domain containing protein, putative, expressed       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130)     
-RAP-DB Os02g0306400area        Os02g0306400area                PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       OsNAAT1 mRNA for nicotianamine aminotransferase Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130)     
+RAP-DB Os02g0306400    Os02g0306400            PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       OsNAAT1 mRNA for nicotianamine aminotransferase Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130)     
 RAP-DB Os02g0307300    Os02g0307300            PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  conserved hypothetical protein  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130)     
 RAP-DB Os02g0307800    Os02g0307800            PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Conserved hypothetical protein  expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130)     
 RAP-DB Os02g0309600    Os02g0309600            PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Integrase, catalytic region domain containing protein   Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130)     
@@ -11452,14 +11452,14 @@ RAP-DB        Os11g0542100    Os11g0542100            PO:0000032      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os11g0547300    Os11g0547300            PO:0000032      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001029)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0557400    Os11g0557400            PO:0000032      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Hypothetical protein    Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001029)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0560000    Os11g0560000            PO:0000032      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Hv1LRR2 disease resistance protein RPM1, putative       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001029)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB Os11g0597400area        Os11g0597400area                PO:0000032      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001029)|participates_in(PO:0007130) 
+RAP-DB Os11g0597400    Os11g0597400            PO:0000032      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001029)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0600000    Os11g0600000            PO:0000032      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Retrotransposon gag protein family protein      Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001029)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0603000    Os11g0603000            PO:0000032      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH domain containing protein       helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001029)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0608000    Os11g0608000            PO:0000032      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Hypothetical protein    expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001029)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0625700    Os11g0625700            PO:0000032      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Hypothetical protein    expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001029)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0635000    Os11g0635000            PO:0000032      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Hypothetical protein    expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001029)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0643100    Os11g0643100            PO:0000032      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Transferase family protein      transferase family protein, putative, expressed gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001029)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB Os11g0645800area        Os11g0645800area                PO:0000032      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001029)|participates_in(PO:0007130) 
+RAP-DB Os11g0645800    Os11g0645800            PO:0000032      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001029)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0646300    Os11g0646300            PO:0000032      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Hypothetical protein    Leucine Rich Repeat family protein      gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001029)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0647000    Os11g0647000            PO:0000032      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  retrotransposon protein, putative, unclassified gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001029)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0661600    Os11g0661600            PO:0000032      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Peroxidase precursor (EC 11117) peroxidase precursor, putative, expressed       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001029)|participates_in(PO:0007130) 
@@ -15659,7 +15659,7 @@ RAP-DB  Os11g0638900    Os11g0638900            PO:0025281      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os11g0640600    Os11g0640600            PO:0025281      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Disease resistance protein family protein       Leucine Rich Repeat family protein, expressed   gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001015)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0640700    Os11g0640700            PO:0025281      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Bacterial luciferase-like family protein        Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001015)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0641200    Os11g0641200            PO:0025281      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Cyclin-like F-box domain containing protein     F-box/LRR-repeat protein 3, putative, expressed gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001015)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB Os11g0647000area        Os11g0647000area                PO:0025281      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001015)|participates_in(PO:0007130) 
+RAP-DB Os11g0647000    Os11g0647000            PO:0025281      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001015)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0655100    Os11g0655100            PO:0025281      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Hypothetical protein    Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001015)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0656500    Os11g0656500            PO:0025281      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Viral coat and capsid protein family protein    retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed      gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001015)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0657400    Os11g0657400            PO:0025281      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Atrophin family protein retrotransposon protein, putative, unclassified gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001015)|participates_in(PO:0007130) 
@@ -23466,7 +23466,7 @@ RAP-DB  Os11g0582400    Os11g0582400            PO:0009009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os11g0585700    Os11g0585700            PO:0009009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       50S ribosomal protein L4        ribosomal protein L4, putative, expressed       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007631)|participates_in(PO:0007042) 
 RAP-DB Os11g0590600    Os11g0590600            PO:0009009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007631)|participates_in(PO:0007042) 
 RAP-DB Os11g0594200    Os11g0594200            PO:0009009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Notchless-related       notchless protein, putative, expressed  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007631)|participates_in(PO:0007042) 
-RAP-DB Os11g0598500area        Os11g0598500area                PO:0009009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007631)|participates_in(PO:0007042) 
+RAP-DB Os11g0598500    Os11g0598500            PO:0009009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007631)|participates_in(PO:0007042) 
 RAP-DB Os11g0602400    Os11g0602400            PO:0009009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       tRNA intron endonuclease, catalytic C-terminal domain containing protein        tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, putative, expressed    gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007631)|participates_in(PO:0007042) 
 RAP-DB Os11g0602600    Os11g0602600            PO:0009009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       40S ribosomal protein S9        40S ribosomal protein S9-2, putative, expressed gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007631)|participates_in(PO:0007042) 
 RAP-DB Os11g0605800    Os11g0605800            PO:0009009      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Non-protein coding transcript, uncharacterized transcript       hypothetical protein    gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007631)|participates_in(PO:0007042) 
@@ -29509,7 +29509,7 @@ RAP-DB  Os11g0591800    Os11g0591800            PO:0009005      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os11g0593000    Os11g0593000            PO:0009005      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Phosphoesterase family protein  phosphoesterase family protein, putative, expressed     gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0597400    Os11g0597400            PO:0009005      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130) 
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 RAP-DB Os11g0607900    Os11g0607900            PO:0009005      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Protein kinase domain containing protein        jacalin-like lectin domain containing protein, expressed        gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os11g0608300    Os11g0608300            PO:0009005      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Barley stem rust resistance protein     cysteine-rich receptor-like protein kinase 7 precursor, putative, expressed     gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130) 
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