Hello!

To see the file structure, click on "tree".

Note that updates take place every 10 minutes, commits may not be seen immediately.
Removed lines in TO_IMP_gene_O.sativa.assoc and saved as TO_IMP_gene_O.sativa-new...
authorcooperl <cooperl@localhost>
Tue, 29 Dec 2015 22:29:49 +0000 (22:29 +0000)
committercooperl <cooperl@localhost>
Tue, 29 Dec 2015 22:29:49 +0000 (22:29 +0000)
svn path=/; revision=590

to-associations/Test_PPPP_TO/TO_IMP_gene_O.sativa-new.assoc [new file with mode: 0644]

diff --git a/to-associations/Test_PPPP_TO/TO_IMP_gene_O.sativa-new.assoc b/to-associations/Test_PPPP_TO/TO_IMP_gene_O.sativa-new.assoc
new file mode 100644 (file)
index 0000000..f384ea8
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,306 @@
+!DB    DB_Object_ID     DB_Object_Symbol       Qualifier       TOid    DB:Reference     Evidence       With(or)From    Aspect  DB_Object_Name  DB_Object_Synonym        DB_Object_Type Taxon   Date    Assigned_by\r
+GR_gene        800010  AID1    spikelet sterility      TO:0000436      PMID:15247409   IMP             T       Os06g0181300    spikelet sterility      Gene    taxon:4530      20150413        Ethan Johnson\r
+GR_gene        800010  AID1    tiller number   TO:0000346      PMID:15247409   IMP             T       Os06g0181300    few tillers     Gene    taxon:4530      20150415        Ethan Johnson\r
+GR_gene        800010  AID1    days to flowering       TO:0000344      PMID:15247409   IMP             T       Os06g0181300    late flowering  Gene    taxon:4530      20150415        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60058   APO1    leaf number     TO:0000241      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    increased leaf number   Gene    taxon:4530      20150415        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60058   APO1    primary branching of inflorescence      TO:0000052      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    abnormal panicle phyllotaxy     Gene    taxon:4530      20150415        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60058   APO1    inflorescence branching TO:0000050      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    decreased panicle branching     Gene    taxon:4530      20150415        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60058   APO1    reproductive homeotic development trait TO:0002613      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    homeotic floral transformations Gene    taxon:4530      20150415        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60058   APO1    fertility related trait TO:0000420      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    reduced fertility       Gene    taxon:4530      20150415        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60058   APO1                    PMID:15950602   IMP                     Os06g0665400    smaller rachis meristem Gene    taxon:4530      20150415        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60058   APO1    primary branch number   TO:0000547      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    reduced primary branches        Gene    taxon:4530      20150415        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60058   APO1    spikelet number TO:0000456      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    less than half the number of spikelets  Gene    taxon:4530      20150415        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60058   APO1    secondary branch number TO:0000557      PMID:15950602   IMP             T       Os06g0665400    less than half the number of secondary branches Gene    taxon:4530      20150415        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60068   BC1     leaf flexibility        TO:0000825      PMID:12953108   IMP                     Os03g0416200    leaves brittle at green stage   Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60068   BC1     leaf flexibility        TO:0000825      PMID:12953108   IMP                     Os03g0416200    leaves brittle at mature stage  Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60068   BC1     brittle culm    TO:0000200      PMID:12953108   IMP             T       Os03g0416200    culms brittle at green stage    Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60068   BC1     brittle culm    TO:0000200      PMID:12953108   IMP             T       Os03g0416200    culms brittle at mature stage   Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60068   BC1     grain shattering        TO:0000473      PMID:12953108   IMP             T       Os03g0416200    panicles brittle at green stage Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60068   BC1     grain shattering        TO:0000473      PMID:12953108   IMP             T       Os03g0416200    panicles brittle at mature stage        Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60068   BC1                     PMID:12953108   IMP                     Os03g0416200    low content of alpha-cellulose in cell wall     Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60070   BC3     stem strength   TO:0000051      GR_gene:5651    IMP             T       Os02g0738900    weak culm       Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60070   BC3     brittle culm    TO:0000200      GR_gene:5651    IMP             T       Os02g0738900    brittle culm    Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60070   BC3     panicle size    TO:0006032      GR_gene:5651    IMP             T       Os02g0738900    short emergence of panicles     Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60070   BC3     panicle anatomy and morphology trait    TO:0000847      GR_gene:5651    IMP             T       Os02g0738900    incomplete emergence of panicles        Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60073   BC6                     GR_gene:5933    IMP                     Os09g0422500    all parts of plant are extremely brittle        Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80018   BLE3    root length     TO:0000227      PMID:16808934   IMP             T       Os05g0245300    short roots     Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80018   BLE3    inflorescence branching TO:0000050      PMID:16808934   IMP             T       Os05g0245300    less branching  Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80018   BLE3    plant height    TO:0000207      PMID:16808934   IMP             T       Os05g0245300    Semi-dwarf      Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101269  COIN    cold tolerance  TO:0000303      PMID:17549515   IMP             T       Os01g0104100    tolerance to cold temperature   Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101269  COIN    salt tolerance  TO:0006001      PMID:17549515   IMP             T       Os01g0104100    tolerance to salt       Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101269  COIN    drought tolerance       TO:0000276      PMID:17549515   IMP             T       Os01g0104100    tolerance to drought-like conditions    Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101269  COIN    proline content TO:0006002      PMID:17549515   IMP             T       Os01g0104100    increase in cellular proline content    Gene    taxon:4530      20150417        Ethan Johnson\r
+GR_gene        20064   CPS1    plant height    TO:0000207      PMID:16861806   IMP             T       Os02g0278700    dwarf   Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        20065   CPS2    plant height    TO:0000207      PMID:16861806   IMP             T       Os02g0571100    dwarf   Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        20066   CPS4    plant height    TO:0000207      PMID:16861806   IMP             T       Os04g0178300    dwarfism        Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80030   CPT1    shoot phototropism      TO:0002651      PMID:15598797   IMP             T       Os02g0568200    complete loss of coleoptile phototropism        Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80030   CPT1    root phototropism       TO:0002652      PMID:15598797   IMP             T       Os02g0568200    Reduced root phototropism       Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60184   D1      grain size      TO:0000397      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    small grain     Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60184   D1      plant height    TO:0000207      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    dwarf   Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60184   D1      stem length     TO:0000576      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    short stems     Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60184   D1      leaf height     TO:0000541      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    short leaves    Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60184   D1      leaf size       TO:0002637      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    broad leaves    Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60184   D1      leaf color      TO:0000326      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    dark green leaves       Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60184   D1      panicle axis angle      TO:0000342      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    erect paincles  Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60184   D1      panicle compactness and shape   TO:0020001      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    compact panicles        Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60184   D1      glume width     TO:0020034      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    small glume     Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60184   D1      glume anatomy and morphology trait      TO:0000869      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    round glumes    Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60184   D1      basal internode diameter        TO:0000132      PMID:12237405   IMP             T       Os05g0333200    thick internodes        Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60192   D10     plant height    TO:0000207      GR_gene:5792    IMP             T       Os01g0746400    dwarf   Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60192   D10     tiller number   TO:0000346      GR_gene:5792    IMP             T       Os01g0746400    profuse tillers Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60192   D10                     GR_gene:5792    IMP                     Os01g0746400    slender tillers Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60192   D10     panicle size    TO:0006032      GR_gene:5792    IMP             T       Os01g0746400    small panicles  Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60193   D11     plant height    TO:0000207      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    semidwarf       Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60193   D11     stem internode anatomy and morphology trait     TO:0000756      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    second internode reduced        Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60193   D11     panicle length  TO:0000040      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    long panicles   Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60193   D11     grain number per plant  TO:0000440      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    sparse grain set        Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60193   D11     grain shape     TO:0002730      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    round grains    Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60193   D11     grain size      TO:0000397      PMID:15705958   IMP             T       Os04g0469800    small grains    Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60186   D3      plant height    TO:0000207      PMID:15659436   IMP             T       Os06g0154200    dwarf   Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60186   D3      space per culm  TO:0000560      PMID:15659436   IMP             T       Os06g0154200    Many fine tillers       Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60186   D3      leaf size       TO:0002637      PMID:15659436   IMP             T       Os06g0154200    slender leaves  Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60213   D35     plant height    TO:0000207      PMID:15075394   IMP             T       Os06g0569500    Semi-dwarf      Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60213   D35                     PMID:15075394   IMP                     Os06g0569500    Gibberellin biosynthesis defective      Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60226   D61     plant height    TO:0000207      PMID:11006334   IMP             T       Os01g0718300    dwarf   Gene    taxon:4530      20150420        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101251  DCL1    plant height    TO:0000207      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    dwarfism        Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101251  DCL1    leaf color      TO:0000326      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    dark green leaves       Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101251  DCL1    rolled leaf     TO:0006064      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    rolled leaves   Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101251  DCL1    shoot system anatomy and morphology trait       TO:0000077      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    twisted shoot   Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101251  DCL1    root development trait  TO:0000656      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    abnormal root development       Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101251  DCL1    adventitious root number        TO:0001006      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    few adventitious roots  Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101251  DCL1    chloroplast development trait   TO:0002715      PMID:16126864   IMP             T       Os03g0121901    ectopic chloroplast development in adventitious roots   Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101251  DCL1                    PMID:16126864   IMP                     Os03g0121901    miRNA accumulation in leaves absent     Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60233   DL      leaf attitude   TO:0000824      PMID:14729915   IMP             T       Os03g0215200    drooping leaves Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60233   DL      leaf midvein anatomy and morphology trait       TO:0000822      PMID:14729915   IMP             T       Os03g0215200    loss of midrib formation        Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60233   DL                      PMID:14729915   IMP                     Os03g0215200    abnormal carpel development     Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80029   DOS     leaf senescence TO:0000249      PMID:16778011   IMP             T       Os01g0192000    delayed leaf senescence Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80017   DWARF   stem elongation TO:0006036      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    defects in stem elongation      Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80017   DWARF   leaf elongation rate    TO:0000360      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    defects in leaf elongation      Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80017   DWARF   cell growth and development trait       TO:0002686      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    failure in organization of cells in stem        Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80017   DWARF   cell growth and development trait       TO:0002686      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    failure in organization of cells in leaf        Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80017   DWARF   cell elongation trait   TO:0002687      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    failure in polar elongation of cells in stem    Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80017   DWARF   cell elongation trait   TO:0002687      PMID:12445121   IMP             T       Os03g0602300    failure in polar elongation of cells in leaf    Gene    taxon:4530      20150422        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80016   DWARF4  plant height    TO:0000207      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    slight dwarfism Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80016   DWARF4  leaf erect      TO:0000872      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    erect leaves    Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80016   DWARF4  grain yield trait       TO:0000396      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    enhanced grain yield    Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80016   DWARF4  panicle number  TO:0000152      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    increased panicle number        Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80016   DWARF4  plant height    TO:0000207      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    dwarfism        Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80016   DWARF4  leaf shape      TO:0000492      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    malformed leaves        Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80016   DWARF4  leaf lamina anatomy and morphology trait        TO:0000829      PMID:16369540   IMP             T       Os03g0227700    tortuous leaf blades    Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60320   EUI1    internode length        TO:0000145      PMID:16399803   IMP             T       Os05g0482400    internode doubles in length     Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60320   EUI1    panicle length  TO:0000040      PMID:16399803   IMP             T       Os05g0482400    panicle length increase Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60333   FON1    floral organ number     TO:0006038      PMID:16511358   IMP             T       Os06g0717200    increased floral organ number   Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60333   FON1    plant structure growth and development trait    TO:0000928      PMID:16511358   IMP             T       Os06g0717200    enlarged floral meristem        Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80005   FOR1    floral organ number     TO:0006038      PMID:16511358   IMP             T       Os07g0568700    extra floral organs in spikelet Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60339   FZP     floral organ development trait  TO:0006022      PMID:12835399   IMP             T       Os07g0669500    do not form floret      Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60339   FZP     shoot branching TO:0002639      PMID:12835399   IMP             T       Os07g0669500    produce sequential rounds of branching  Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60339   FZP     glume number    TO:0006029      PMID:12835399   IMP             T       Os07g0669500    produce several rudimentary glumes per branch   Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60366   GH2     lemma and palea color   TO:0000264      PMID:16443696   IMP             T       Os02g0187800    brownish green lemma at panicle exsertion       Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60366   GH2     lemma and palea color   TO:0000264      PMID:16443696   IMP             T       Os02g0187800    brownish green palea at panicle exsertion       Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60366   GH2     hull color      TO:0000706      PMID:16443696   IMP             T       Os02g0187800    golden hull at maturity Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60366   GH2     internode color TO:0000426      PMID:16443696   IMP             T       Os02g0187800    golden internode has intensified color  Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80024   GID2    plant height    TO:0000207      PMID:12649483   IMP             T       Os02g0580300    dwarf   Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80024   GID2    leaf lamina width       TO:0002720      PMID:12649483   IMP             T       Os02g0580300    wide leaf blades        Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80024   GID2    leaf color      TO:0000326      PMID:12649483   IMP             T       Os02g0580300    dark green leaves       Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80024   GID2    sterility related trait TO:0000485      PMID:12649483   IMP             T       Os02g0580300    mutant is sterile       Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80062   GIF1    fruit ripening trait    TO:0002633      PMID:18820698   IMP             T       Os04g0413500    slow grain filling      Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80062   GIF1    chalky endosperm        TO:0000266      PMID:18820698   IMP             T       Os04g0413500    increased grain chalkiness      Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80062   GIF1    dehulled grain weight   TO:0000590      PMID:18820698   IMP             T       Os04g0413500    reduced grain weight    Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80062   GIF1    starch grain shape      TO:0002656      PMID:18820698   IMP             T       Os04g0413500    abnormal starch granules        Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80027   HTD1    plant height    TO:0000207      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    dwarf   Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80027   HTD1    plant phenological trait        TO:0000933      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    bushy   Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80027   HTD1    tillering ability       TO:0000329      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    High tillering due to high release of axillary buds     Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80027   HTD1    auxin sensitivity       TO:0000163      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    independent of IAA      Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80027   HTD1    auxin sensitivity       TO:0000163      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    independent of ABA      Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80027   HTD1    auxin sensitivity       TO:0000163      PMID:17092317   IMP             T       Os04g0550600    independent of GA       Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        20067   KS1     plant height    TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os04g0611800    dwarfism        Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        20068   KS2     plant height    TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os04g0612000    dwarfism        Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        20070   KS4     plant height    TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os04g0179700    dwarfism        Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        20071   KS5     plant height    TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os02g0571300    dwarf   Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        20072   KS6     plant height    TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os02g0571800    dwarf   Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        20073   KS7     plant height    TO:0000207      PMID:17141283   IMP             T       Os02g0570400    dwarf   Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60493   LAX     relative spikelet number        TO:0001033      PMID:7896104    IMP             T       Os01g0831000    sparse setting of spikelets     Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60493   LAX     spikelet anatomy and morphology trait   TO:0000657      PMID:7896104    IMP             T       Os01g0831000    deformed spikelets at low temperatures  Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60493   LAX     temperature response trait      TO:0000432      PMID:7896104    IMP             T       Os01g0831000    absence of spikelet at low temperature  Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101253  Log                     PMID:17287810   IMP                     Os01g0588900    reduced number of active meristematic cells in shoot apical meristem    Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101253  Log     inflorescence development trait TO:0000621      PMID:17287810   IMP             T       Os01g0588900    arrest of inflorescence lateral meristem development    Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101253  Log     primary branch number   TO:0000547      PMID:17287810   IMP             T       Os01g0588900    few inflorescence branches      Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101253  Log     panicle size    TO:0006032      PMID:17287810   IMP             T       Os01g0588900    small panicles  Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101253  Log     meristem identity       TO:0006017      PMID:17287810   IMP             T       Os01g0588900    floral meristem flattens        Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101253  Log     pistil number   TO:0002659      PMID:17287810   IMP             T       Os01g0588900    flower lacks pistil     Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101253  Log                     PMID:17287810   IMP                     Os01g0588900    Defective in the cytokinin activation pathways leading to the active free base form     Gene    taxon:4530      20150424        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80009   LSI1    grain yield trait       TO:0000396      PMID:16572174   IMP             T       Os02g0745100    grain yield is reduced  Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80009   LSI1                    PMID:16572174   IMP                     Os02g0745100    reduced silicon uptake  Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80009   LSI1    animal damage resistance        TO:0000054      PMID:16572174   IMP             T       Os02g0745100    susceptible to pests    Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80009   LSI1    disease resistance      TO:0000112      PMID:16572174   IMP             T       Os02g0745100    susceptible to disease  Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80037   LSI2    growth and development trait    TO:0000357      PMID:17625566   IMP             T       Os03g0107300    reduced growth  Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80037   LSI2    pericarp color  TO:0000707      PMID:17625566   IMP             T       Os03g0107300    grain discoloration     Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80037   LSI2                    PMID:17625566   IMP                     Os03g0107300    low silicon in shoot    Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80037   LSI2                    PMID:17625566   IMP                     Os03g0107300    low silicon in hull     Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80015   MADS1   lemma and palea anatomy and morphology trait    TO:0000079      PMID:16146529   IMP             T       Os03g0215400    leafy lemma     Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80015   MADS1   lemma and palea anatomy and morphology trait    TO:0000079      PMID:16146529   IMP             T       Os03g0215400    leafy palea     Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80015   MADS1                   PMID:16146529   IMP                     Os03g0215400    open hull       Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80015   MADS1   stamen number   TO:0000225      PMID:16146529   IMP             T       Os03g0215400    reduced stamen number   Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80015   MADS1   carpel number   TO:0006013      PMID:16146529   IMP             T       Os03g0215400    increased carpel number Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80041   MADS13  female sterility        TO:0000358      PMID:10528264   IMP             T       Os12g0207000    female sterile  Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80041   MADS13  reproductive homeotic development trait TO:0002613      PMID:10528264   IMP             T       Os12g0207000    ovules converted to carpels     Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80041   MADS13  flower development trait        TO:0000622      PMID:10528264   IMP             T       Os12g0207000    indeterminate flower growth     Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80041   MADS13                  PMID:10528264   IMP                     Os12g0207000    extra stigmas protruding from carpels   Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80025   MADS18  flowering time trait    TO:0002616      PMID:15299121   IMP             T       Os07g0605200    early flowering Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80025   MADS18  plant height    TO:0000207      PMID:15299121   IMP             T       Os07g0605200    dwarfism        Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80025   MADS18  shoot elongation rate   TO:0000368      PMID:15299121   IMP             T       Os07g0605200    low rate of internonde elongation       Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80025   MADS18  leaf sheath length      TO:0002689      PMID:15299121   IMP             T       Os07g0605200    reduction of length of leaf sheath      Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80021   MADS22  floral organ development trait  TO:0006022      PMID:15682279   IMP             T       Os02g0761000    aberrant floral morphogenesis   Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80021   MADS22  bract anatomy and morphology trait      TO:0000815      PMID:15682279   IMP             T       Os02g0761000    disorganized palea      Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80021   MADS22  glume length    TO:0020033      PMID:15682279   IMP             T       Os02g0761000    elongated glume Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80021   MADS22  floret number per spikelet      TO:0006033      PMID:15682279   IMP             T       Os02g0761000    Two-floret spikelet     Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80019   MDP1    seminal root length     TO:0000586      PMID:16827922   IMP             T       Os03g0186600    shortened primary roots Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80019   MDP1    coleoptile length       TO:0001007      PMID:16827922   IMP             T       Os03g0186600    elongated coleoptiles   Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80019   MDP1    leaf lamina joint bending       TO:0002688      PMID:16827922   IMP             T       Os03g0186600    enhanced lamina joint inclinations      Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80019   MEL1    meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:17675402   IMP             T       Os03g0800200    chromosome condensation arrested in early meiotic stage Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80019   MEL1    plant cell anatomy and morphology trait TO:0002683      PMID:17675402   IMP             T       Os03g0800200    irregularly sized pollen mother cell in anther  Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80019   MEL1    plant cell anatomy and morphology trait TO:0002683      PMID:17675402   IMP             T       Os03g0800200    multinucleated pollen mother cell in anther     Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80019   MEL1    plant cell anatomy and morphology trait TO:0002683      PMID:17675402   IMP             T       Os03g0800200    vacuolated pollen mother cell in anther Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80008   MOC1    tillering ability       TO:0000329      PMID:12687001   IMP             T       Os06g0610300    Complete loss of tiller formation       Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        61178   MSP1    microsporocyte number   TO:0000726      PMID:12897248   IMP             T       Os01g0917500    excessive number of sporocytes  Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        61178   MSP1                    PMID:12897248   IMP                     Os01g0917500    disordered anther walls Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        61178   MSP1                    PMID:12897248   IMP                     Os01g0917500    loss of tapetum layer   Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        61178   MSP1    cell growth and development trait       TO:0002686      PMID:12897248   IMP             T       Os01g0917500    arrest of pollen mother cell development        Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        61178   MSP1    male sterility  TO:0000437      PMID:12897248   IMP             T       Os01g0917500    male sterile    Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80011   OSNOP   pollen free     TO:0000245      PMID:15952069   IMP             T       Os06g0607900    Pollen-less at flowering stage  Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100119  PAIR1   meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    chromosomes become entangled during prophase 1  Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100119  PAIR1   meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    chromosomes compact adhered to a nucleolus      Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100119  PAIR1   meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    chromosomes form sphere adhered to a nucleolus  Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100119  PAIR1   meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    homologous pairing failed to occur      Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100119  PAIR1   male sterility  TO:0000437      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    complete sterility of male gametes      Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100119  PAIR1   female sterility        TO:0000358      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    complete sterility of female gametes    Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100119  PAIR1   meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    at anaphase I uneven spore production   Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100119  PAIR1   meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:15031413   IMP             T       Os03g0106300    at telophase 1 uneven spore production  Gene    taxon:4530      20150427        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100120  PAIR2   sterility or fertility trait    TO:0000392      PMID:14758540   IMP             T       Os09g0506800    sterile Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100120  PAIR2   meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:14758540   IMP             T       Os09g0506800    Loss of homologous chromosome pairing   Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        61182   PLA2    plastochron     TO:0000735      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    shortened plastochron   Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        61182   PLA2    plant height    TO:0000207      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    dwarfism        Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        61182   PLA2    leaf size       TO:0002637      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    reduction of leaf size  Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        61182   PLA2    tiller number   TO:0000346      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    reduction of tiller number      Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        61182   PLA2    leaf growth and development trait       TO:0000655      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    acceleration of leaf maturation Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        61182   PLA2    shoot system growth and development trait       TO:0000654      PMID:16461585   IMP             T       Os01g0907900    ectopic shoot formation Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80013   PNH1    leaf growth and development trait       TO:0000655      PMID:12000455   IMP             T       Os06g0597400    malformed leaves        Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80013   PNH1    vascular leaf anatomy and morphology trait      TO:0000419      PMID:12000455   IMP             T       Os06g0597400    altered vascular arrangement    Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80013   PNH1    plant structure anatomy and morphology trait    TO:0000839      PMID:12000455   IMP             T       Os06g0597400    abnormal internal structure     Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80061   PROG1   growth and development trait    TO:0000357      PMID:18820699   IMP             T       Os07g0153600    erect growth    Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80061   PROG1   grain number    TO:0002759      PMID:18820699   IMP             T       Os07g0153600    greater grain number    Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101187  PSS1    sterility or fertility trait    TO:0000392      PMID:17279367   IMP             T       Os08g0117000    pollen semi-sterility   Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101187  PSS1                    PMID:17279367   IMP                     Os08g0117000    anther indehiscence unaffected by growth duration       Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101187  PSS1    meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:17279367   IMP             T       Os08g0117000    female gamete normal    Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100117  RCN1    days to heading TO:0000137      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    delayed heading Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100117  RCN1    leaf number     TO:0000241      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    increased leaf number in short-day conditions   Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100117  RCN1    leaf number     TO:0000241      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    increased leaf number in long-day conditions    Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100117  RCN1    inflorescence anatomy and morphology trait      TO:0000373      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    altered inflorescence morphology        Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100117  RCN1    primary branch number   TO:0000547      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    increased number of primary branches in inflorescence   Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100117  RCN1    secondary branch number TO:0000557      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    increased number of secondary branches in inflorescence Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100117  RCN1    floret number   TO:0000670      PMID:12148532   IMP             T       Os11g0152500    increased number of florets     Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100118  RCN2    days to heading TO:0000137      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    delay in heading        Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100118  RCN2    leaf number     TO:0000241      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    increased number of leaves in short-day conditions      Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100118  RCN2    leaf number     TO:0000241      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    increased number of leaves in long-day conditions       Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100118  RCN2    inflorescence anatomy and morphology trait      TO:0000373      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    altered inflorescence morphology        Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100118  RCN2    primary branch number   TO:0000547      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    increased number of primary branches    Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100118  RCN2    secondary branch number TO:0000557      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    increased number of secondary branches  Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        100118  RCN2    floret number   TO:0000670      PMID:12148532   IMP             T       Os02g0531600    increased number of florets     Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80028   REH1    root development trait  TO:0000656      PMID:16085936   IMP             T       Os02g0743400    Adventitious root development inhibited Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80028   REH1    tiller number   TO:0000346      PMID:16085936   IMP             T       Os02g0743400    altered tiller number   Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80028   REH1    root to shoot ratio     TO:0000278      PMID:16085936   IMP             T       Os02g0743400    altered root to shoot ratio     Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80028   REH1    root number     TO:0000084      PMID:16085936   IMP             T       Os02g0743400    decrease advititious root number        Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80028   REH1    plant structure growth and development trait    TO:0000928      PMID:16085936   IMP             T       Os02g0743400    arrest of primordia emergence   Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60839   SBE3    amylose content TO:0000196      PMID:8360192    IMP             T       Os02g0528200    exceptionally high levels of amylose    Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60842   SD1     plant height    TO:0000207      PMID:11961544   IMP             T       Os01g0883800    semi-dwarf      Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60842   SD1     lodging incidence       TO:0000068      PMID:11961544   IMP             T       Os01g0883800    resistant to lodging at high fertilizer level   Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60842   SD1     yield trait     TO:0000371      PMID:11961544   IMP             T       Os01g0883800    high yielding   Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60842   SD1     cell cycle trait        TO:0000728      PMID:11961544   IMP             T       Os01g0883800    inhibition of cell division during elongation of internode      Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60842   SD1     enzyme activity trait   TO:0000599      PMID:11961544   IMP             T       Os01g0883800    Defective in biosynthetic enzyme GA20ox-2 that catalyzed the conversion of GA53 to GA20 Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60864   SE5     plant height    TO:0000207      PMID:10849355   IMP             T       Os06g0603000    Semi-dwarf      Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60864   SE5                     PMID:10849355   IMP                     Os06g0603000    few stems       Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60864   SE5     leaf color      TO:0000326      PMID:10849355   IMP             T       Os06g0603000    yellow leaves   Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60864   SE5     days to flowering trait TO:0000344      PMID:10849355   IMP             T       Os06g0603000    early flowering Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        61191   SGR     chlorophyll content on intact leaf      TO:0012002      PMID:17513504   IMP             T       Os09g0532000    high chlorophyll content in leaves      Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60880   SHL2    shoot apical meristem development       TO:0006020      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    shoot apical meristem of the plant embryo is lacking    Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60880   SHL2    coleoptile anatomy and morphology trait TO:0000753      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    coleoptile  of the plant embryo is lacking      Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60880   SHL2    plant embryo anatomy and morphology trait       TO:0000064      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    epiblast of the plant embryo is lacking Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60880   SHL2    shoot apical meristem development       TO:0006020      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    shoot apical meristem of the mature plant embryo is lacking     Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60880   SHL2    coleoptile anatomy and morphology trait TO:0000753      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    coleoptile  of the mature plant embryo is lacking       Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60880   SHL2    leaf width      TO:0000370      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    seedlings narrow leaves Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60880   SHL2    leaf size       TO:0002637      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    seedlings small leaves. Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60880   SHL2    seedling vigor  TO:0000280      PMID:10095070   IMP             T       Os01g0527600    Seedlings withered      Gene    taxon:4530      20150429        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60882   SHL4    shoot apical meristem development       TO:0006020      PMID:10409508   IMP             T       Os03g0449200    shoot apical meristem not differentiated        Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60882   SHL4    shoot system growth and development trait       TO:0000654      PMID:10409508   IMP             T       Os03g0449200    shoot fails to grow     Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60882   SHL4                    PMID:10409508   IMP                     Os03g0449200    coleoptile absent       Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60882   SHL4                    PMID:10409508   IMP                     Os03g0449200    epiblast absent Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60882   SHL4                    PMID:10409508   IMP                     Os03g0449200    scutellum normal        Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60882   SHL4                    PMID:10409508   IMP                     Os03g0449200    radicle normal  Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60882   SHL4    root development trait  TO:0000656      PMID:10409508   IMP             T       Os03g0449200    roots grow normally     Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60883   SHO1    shoot apical meristem development       TO:0006020      GR_gene:1477    IMP             T       Os04g0509300    malformed shoot apical meristem Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60883   SHO1    plastochron     TO:0000735      GR_gene:1477    IMP             T       Os04g0509300    short plastochron       Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60883   SHO1    leaf shape      TO:0000492      GR_gene:1477    IMP             T       Os04g0509300    aberrant leaves Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60883   SHO1    leaf number     TO:0000241      GR_gene:1477    IMP             T       Os04g0509300    increased leaf production       Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60883   SHO1    leaf shape      TO:0000492      GR_gene:1477    IMP             T       Os04g0509300    leaves thread-like (short/narrow)       Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60883   SHO1    shoot apical meristem development       TO:0006020      GR_gene:1477    IMP             T       Os04g0509300    shoot apical meristem flat      Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60883   SHO1    cell cycle trait        TO:0000728      GR_gene:1477    IMP             T       Os04g0509300    disorganized cell division in shoot meristem    Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60936   SL1     lemma and palea anatomy and morphology trait    TO:0000079      GR_gene:6472    IMP             T       Os01g0129200    degenerated lemma       Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60936   SL1     lemma and palea anatomy and morphology trait    TO:0000079      GR_gene:6472    IMP             T       Os01g0129200    degenerated palea       Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60936   SL1     sterility or fertility trait    TO:0000392      GR_gene:6472    IMP             T       Os01g0129200    stamen nonfunctional    Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60936   SL1     male sterility  TO:0000437      GR_gene:6472    IMP             T       Os01g0129200    male sterile    Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60936   SL1     stamen anatomy and morphology trait     TO:0000215      GR_gene:6472    IMP             T       Os01g0129200    stamens malformed       Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60936   SL1     reproductive homeotic development trait TO:0002613      GR_gene:6472    IMP             T       Os01g0129200    stamens transformed to pistils  Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60936   SL1     floret anatomy and morphology trait     TO:0000274      GR_gene:6472    IMP             T       Os01g0129200    Mutant floret has 3 ovaries     Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60936   SL1     fertility related trait TO:0000420      GR_gene:6472    IMP             T       Os01g0129200    female fertile  Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60897   SLR     shoot system anatomy and morphology trait       TO:0000077      PMID:11340177   IMP             T       Os03g0707600    slender shoots  Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60897   SLR     internode length        TO:0000145      PMID:11340177   IMP             T       Os03g0707600    basal internodes elongated      Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60897   SLR     root number     TO:0000084      PMID:11340177   IMP             T       Os03g0707600    reduced root number     Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60897   SLR     root length     TO:0000227      PMID:11340177   IMP             T       Os03g0707600    reduced root length     Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60897   SLR     plant cell length       TO:0020107      PMID:11340177   IMP             T       Os03g0707600    increased cell length at leaf sheath    Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80036   SNB     floral bract number     TO:0006026      PMID:17144896   IMP             T       Os07g0235800    multiple rudimentary bracts     Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80036   SNB     bract anatomy and morphology trait      TO:0000815      PMID:17144896   IMP             T       Os07g0235800    rudimentary bract       Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80036   SNB     phyllotaxy      TO:0006014      PMID:17144896   IMP             T       Os07g0235800    bracts in alternative phyllotaxy        Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80036   SNB     anatomy and morphology trait    TO:0000017      PMID:17144896   IMP             T       Os07g0235800    interfered with subsequent floral architecture  Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60900   SP1     panicle length  TO:0000040      GR_gene:1712    IMP             T       Os11g0235200    short panicle   Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60900   SP1     primary branch number   TO:0000547      GR_gene:1712    IMP             T       Os11g0235200    absence of primary branches in lower part of ear axis   Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60900   SP1     spikelets per panicle length    TO:0000565      GR_gene:1712    IMP             T       Os11g0235200    spikelets per panicle decreased Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60900   SP1     primary branch number   TO:0000547      GR_gene:1712    IMP             T       Os11g0235200    primary branches per panicle reduced    Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60900   SP1     secondary branch number TO:0000557      GR_gene:1712    IMP             T       Os11g0235200    secondary branches per primary branch reduced   Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60900   SP1     relative spikelet number        TO:0001033      GR_gene:1712    IMP             T       Os11g0235200    number of spikelets per primary branch reduced  Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60900   SP1     relative spikelet number        TO:0001033      GR_gene:1712    IMP             T       Os11g0235200    number of spikelets per secondary branch reduced        Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80031   SPK     protein content TO:0000598      PMID:8325505    IMP             T       Os10G0539600    decreased amount of proteins    Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80031   SPK     protein composition related trait       TO:0000490      PMID:8325505    IMP             T       Os10G0539600    altered protein composition     Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80031   SPK     endosperm storage protein content       TO:0002653      PMID:8325505    IMP             T       Os10G0539600    lacks seed storage      Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60912   SPL11   leaf lamina color       TO:0000299      PMID:10939258   IMP             T       Os12g0570000    rust colored spots over entire leaf blade during tillering      Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60912   SPL11   leaf midrib color       TO:0000720      PMID:10939258   IMP             T       Os12g0570000    rust colored spots most concentrated along midrib       Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        60908   SPL7    leaf color      TO:0000326      PMID:12032317   IMP             T       Os05g0530400    reddish brown spots on leaves   Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80023   SPY     internode length        TO:0000145      PMID:17052323   IMP             T       Os08g0559300    elongation of lower internodes  Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80023   SPY     leaf lamina joint bending       TO:0002688      PMID:17052323   IMP             T       Os08g0559300    increased lamina joint bending  Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101258  TatC                    PMID:11244106   IMP                     Os01g0501700    pale green shoot        Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101258  TatC    leaf color      TO:0000326      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    pale green leaves       Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101258  TatC    chlorophyll content     TO:0000495      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    shoot reduction in total chlorophyll    Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101258  TatC    chlorophyll-a content   TO:0000293      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    shoot reduction of chlorophyll-a        Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101258  TatC    chlorophyll-b content   TO:0000295      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    shoot reduction of chlorophyll-b        Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101258  TatC    chlorophyll content     TO:0000495      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    leaf reduction in total chlorophyll     Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101258  TatC    chlorophyll-a content   TO:0000293      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    leaf reduction of chlorophyll-a Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101258  TatC    chlorophyll-b content   TO:0000295      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    leaf reduction of chlorophyll-b Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101258  TatC    abscisic acid content   TO:0002667      PMID:11244106   IMP             T       Os01g0501700    basal level of abscisic acid (ABA) accumulation after 30minutes of drought treatment compared to rapid  accumulation of ABA after 30 min of drought treatment in wild type plants.      Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101258  TatC                    PMID:11244106   IMP                     Os01g0501700    increased water loss from detached leaves       Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80012   TB1     inflorescence branching TO:0000050      PMID:12581309   IMP             T       Os03g0706500    reduced lateral branching       Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        20145   TDR     male sterility  TO:0000437      PMID:16896230   IMP             T       Os02g0120500    male sterile    Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        20145   TDR     plant organ growth and development trait        TO:0000927      PMID:16896230   IMP             T       Os02g0120500    abnormal stamen development     Gene    taxon:4530      20150501        Ethan Johnson\r
+GR_gene        10807   TPC1    plant height    TO:0000207      PMID:15111725   IMP             T       Os01g0678500    Semidwarf       Gene    taxon:4530      20150504        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80007   UDT1    meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:16141453   IMP             T       Os07g0549600    tapeta failed to differentiate during meiotic stage     Gene    taxon:4530      20150504        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80007   UDT1    meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:16141453   IMP             T       Os07g0549600    tapeta became vacuolated during meiotic phase   Gene    taxon:4530      20150504        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80007   UDT1    meiotic cell cycle trait        TO:0000729      PMID:16141453   IMP             T       Os07g0549600    meiocytes did not develop to microspores        Gene    taxon:4530      20150504        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80007   UDT1    pollen free     TO:0000245      PMID:16141453   IMP             T       Os07g0549600    anther locules didn't contain pollen grains     Gene    taxon:4530      20150504        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80022   WDA1    fat and essential oil composition related trait TO:0000491      PMID:17138699   IMP             T       Os10g0471100    defects in very-long-chain fatty acids in anther        Gene    taxon:4530      20150504        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80022   WDA1    inflorescence waxiness  TO:0000787      PMID:17138699   IMP             T       Os10g0471100    epicuticular wax absent on anther       Gene    taxon:4530      20150504        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80022   WDA1                    PMID:17138699   IMP                     Os10g0471100    microspore development retarded Gene    taxon:4530      20150504        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80022   WDA1                    PMID:17138699   IMP                     Os10g0471100    defective pollen exine formation in anthers     Gene    taxon:4530      20150504        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80022   WDA1                    PMID:17138699   IMP                     Os10g0471100    primary alcohol levels reduced  Gene    taxon:4530      20150504        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80014   YAB1    stamen number   TO:0000225      PMID:15604733   IMP             T       Os07g0160100    produced additional stamens     Gene    taxon:4530      20150504        Ethan Johnson\r
+GR_gene        80014   YAB1    carpel number   TO:0006013      PMID:15604733   IMP             T       Os07g0160100    produced additional carpels     Gene    taxon:4530      20150504        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101186  ZEP1    leaf rolling    TO:0000085      PMID:11244106   IMP             T       Os04g0448900    wilty   Gene    taxon:4530      20150504        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101186  ZEP1    germination rate        TO:0000430      PMID:11244106   IMP             T       Os04g0448900    precocious germination  Gene    taxon:4530      20150504        Ethan Johnson\r
+GR_gene        101186  ZEP1    abscisic acid content   TO:0002667      PMID:11244106   IMP             T       Os04g0448900    low abscisic acid levels        Gene    taxon:4530      20150504        Ethan Johnson
\ No newline at end of file