Hello!

To see the file structure, click on "tree".

Note that updates take place every 10 minutes, commits may not be seen immediately.
projects / associations / .git / commitdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | patch | inline | side by side (parent: 098a857)
Fix missing aspect for some terms
authorelserj <elserj@localhost>
Thu, 30 Mar 2023 20:18:07 +0000 (20:18 +0000)
committerelserj <elserj@localhost>
Thu, 30 Mar 2023 20:18:07 +0000 (20:18 +0000)
svn path=/; revision=1012

go-associations/go_gene_Oryza_Gramene.assoc patch | blob | history

diff --git a/go-associations/go_gene_Oryza_Gramene.assoc b/go-associations/go_gene_Oryza_Gramene.assoc
index cb0a2dc58bbc7d9e7c51f4db156583d704fdae62..a9af0edc5eba2f242465d5c7afb1266ef08cd5d6 100644 (file)
--- a/go-associations/go_gene_Oryza_Gramene.assoc
+++ b/go-associations/go_gene_Oryza_Gramene.assoc
@@ -54,16 +54,16 @@ GR_gene     GR:0060719      RA              GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR A     bh
 GR_gene        GR:0060719      RA              GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR A     bhlh13|basic helix loop helix 13|OsbHLH013|OsbHLH13|Ra|Rice R gene (Anthocyanin biosynthesis)-a|LOC_Os04g47080  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0060719      RA              GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR A     bhlh13|basic helix loop helix 13|OsbHLH013|OsbHLH13|Ra|Rice R gene (Anthocyanin biosynthesis)-a|LOC_Os04g47080  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0060719      RA              GO:0009812      GR_REF:0        IMP             P       TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR A     bhlh13|basic helix loop helix 13|OsbHLH013|OsbHLH13|Ra|Rice R gene (Anthocyanin biosynthesis)-a|LOC_Os04g47080  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0060719      RA              GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR A     bhlh13,basic helix loop helix 13,OsbHLH013,OsbHLH13,Ra,Rice R gene (Anthocyanin biosynthesis)-a,Ra,Rice R gene (Anthocyanin biosynthesis)-a,LOC_Os04g47080      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0060719      RA              GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR A     bhlh13,basic helix loop helix 13,OsbHLH013,OsbHLH13,Ra,Rice R gene (Anthocyanin biosynthesis)-a,Ra,Rice R gene (Anthocyanin biosynthesis)-a,LOC_Os04g47080      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0060719      RA              GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR A     bhlh13|basic helix loop helix 13|OsbHLH013|OsbHLH13|Ra|Rice R gene (Anthocyanin biosynthesis)-a|LOC_Os04g47080  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0060720      RB              GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR B     bhlh165|basic/helix-loop-helix 165|basic helix loop helix 165|OsbHLH165|Rb|Rice R gene-b|LOC_Os01g39580 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0060720      RB              GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR B     bhlh165|basic/helix-loop-helix 165|basic helix loop helix 165|OsbHLH165|Rb|Rice R gene-b|LOC_Os01g39580 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0060720      RB              GO:0009812      GR_REF:0        IMP             P       TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR B     bhlh165|basic/helix-loop-helix 165|basic helix loop helix 165|OsbHLH165|Rb|Rice R gene-b|LOC_Os01g39580 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0060720      RB              GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR B     bhlh165,basic/helix-loop-helix 165,basic helix loop helix 165,OsbHLH165,Rb,Rice R gene-b,Rb,Rice R gene-b,LOC_Os01g39580        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0060720      RB              GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR B     bhlh165,basic/helix-loop-helix 165,basic helix loop helix 165,OsbHLH165,Rb,Rice R gene-b,Rb,Rice R gene-b,LOC_Os01g39580        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0060720      RB              GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR B     bhlh165|basic/helix-loop-helix 165|basic helix loop helix 165|OsbHLH165|Rb|Rice R gene-b|LOC_Os01g39580 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0060724      RC              GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       BROWN PERICARP AND SEED COAT    Basic Helix-Loop-Helix protein|basic/helix-loop-helix 17|basic helix loop helix 17|OsbHLH017|OsbHLH17|Rc|Brown pericarp and seed coat|LOC_Os07g11020    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0060724      RC              GO:0009812      GR_REF:0        IMP             P       BROWN PERICARP AND SEED COAT    Basic Helix-Loop-Helix protein|basic/helix-loop-helix 17|basic helix loop helix 17|OsbHLH017|OsbHLH17|Rc|Brown pericarp and seed coat|LOC_Os07g11020    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0060724      RC              GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     BROWN PERICARP AND SEED COAT    Basic Helix-Loop-Helix protein,basic/helix-loop-helix 17,basic helix loop helix 17,OsbHLH017,OsbHLH17,Rc,Brown pericarp and seed coat,Rc,Brown pericarp and seed coat,LOC_Os07g11020    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0060724      RC              GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       BROWN PERICARP AND SEED COAT    Basic Helix-Loop-Helix protein,basic/helix-loop-helix 17,basic helix loop helix 17,OsbHLH017,OsbHLH17,Rc,Brown pericarp and seed coat,Rc,Brown pericarp and seed coat,LOC_Os07g11020    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0060724      RC              GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       BROWN PERICARP AND SEED COAT    Basic Helix-Loop-Helix protein|basic/helix-loop-helix 17|basic helix loop helix 17|OsbHLH017|OsbHLH17|Rc|Brown pericarp and seed coat|LOC_Os07g11020    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0060724      RC              GO:0046283      GR_REF:0        IMP             P       BROWN PERICARP AND SEED COAT    Basic Helix-Loop-Helix protein|basic/helix-loop-helix 17|basic helix loop helix 17|OsbHLH017|OsbHLH17|Rc|Brown pericarp and seed coat|LOC_Os07g11020    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0060733      RD              GO:0009812      GR_REF:0        IMP             P       RED PERICARP AND SEED COAT      Rd|Red pericarp and seed coat   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -1015,7 +1015,7 @@ GR_gene   GR:0060995      VP1             GO:0007275      GR_REF:0        IMP             P       VIVIPAROUS 1    OsVp1|Vp1|Vivipa
 GR_gene        GR:0060995      VP1             GO:0009737      GR_REF:0        IMP             P       VIVIPAROUS 1    OsVp1|Vp1|Viviparous-1|LOC_Os01g68370   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0060995      VP1             GO:0009738      GR_REF:0        IMP             P       VIVIPAROUS 1    OsVp1|Vp1|Viviparous-1|LOC_Os01g68370   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0060995      VP1             GO:0009790      GR_REF:0        IMP             P       VIVIPAROUS 1    OsVp1|Vp1|Viviparous-1|LOC_Os01g68370   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0060995      VP1             GO:0045892      GR_REF:0        IMP                     VIVIPAROUS 1    OsVp1,Vp1,Viviparous-1,Vp1,Viviparous-1,LOC_Os01g68370  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0060995      VP1             GO:0045892      GR_REF:0        IMP             P       VIVIPAROUS 1    OsVp1,Vp1,Viviparous-1,Vp1,Viviparous-1,LOC_Os01g68370  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0060995      VP1             GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       VIVIPAROUS 1    OsVp1|Vp1|Viviparous-1|LOC_Os01g68370   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0060995      VP1             GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       VIVIPAROUS 1    OsVp1|Vp1|Viviparous-1|LOC_Os01g68370   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0060995      VP1             GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       VIVIPAROUS 1    OsVp1|Vp1|Viviparous-1|LOC_Os01g68370   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -1045,7 +1045,7 @@ GR_gene   GR:0061011      XA1             GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. OR
 GR_gene        GR:0061011      XA1             GO:0006915      GR_REF:0        IMP             P       XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ORYZAE RESISTANCE 1  RXa1|Xe|Xanthomonas campestris pv. oryzae resistance-1|Xa1|Xa-1|Xanthomonas oryzae pv. oryzae resistance-1|LOC_Os04g53120       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0061011      XA1             GO:0006952      GR_REF:0        IMP             P       XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ORYZAE RESISTANCE 1  RXa1|Xe|Xanthomonas campestris pv. oryzae resistance-1|Xa1|Xa-1|Xanthomonas oryzae pv. oryzae resistance-1|LOC_Os04g53120       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0061011      XA1             GO:0017111      GR_REF:0        IMP             F       XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ORYZAE RESISTANCE 1  RXa1|Xe|Xanthomonas campestris pv. oryzae resistance-1|Xa1|Xa-1|Xanthomonas oryzae pv. oryzae resistance-1|LOC_Os04g53120       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0061015      XA5             GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ORYZAE RESISTANCE 5  rXa5,xa5,Xanthomonas campestris pv. oryzae resistance-5,xa5,Xanthomonas oryzae pv. oryzae resistance-5,xa5,Xanthomonas oryzae pv. oryzae resistance-5,LOC_Os05g01710    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0061015      XA5             GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ORYZAE RESISTANCE 5  rXa5,xa5,Xanthomonas campestris pv. oryzae resistance-5,xa5,Xanthomonas oryzae pv. oryzae resistance-5,xa5,Xanthomonas oryzae pv. oryzae resistance-5,LOC_Os05g01710    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0061015      XA5             GO:0003743      GR_REF:0        IMP             F       XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ORYZAE RESISTANCE 5  rXa5|xa5|Xanthomonas campestris pv. oryzae resistance-5|Xanthomonas oryzae pv. oryzae resistance-5|LOC_Os05g01710       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0061015      XA5             GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ORYZAE RESISTANCE 5  rXa5|xa5|Xanthomonas campestris pv. oryzae resistance-5|Xanthomonas oryzae pv. oryzae resistance-5|LOC_Os05g01710       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0061015      XA5             GO:0005672      GR_REF:0        IMP             C       XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ORYZAE RESISTANCE 5  rXa5|xa5|Xanthomonas campestris pv. oryzae resistance-5|Xanthomonas oryzae pv. oryzae resistance-5|LOC_Os05g01710       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -1251,7 +1251,7 @@ GR_gene   GR:0061179      OSH1            GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       Rice KNOX gene-1        LOC_Os03g51
 GR_gene        GR:0061179      OSH1            GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       Rice KNOX gene-1        LOC_Os03g51690  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0061179      OSH1            GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       Rice KNOX gene-1        LOC_Os03g51690  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0061179      OSH1            GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       Rice KNOX gene-1        LOC_Os03g51690  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0061179      OSH1            GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     Rice KNOX gene-1        LOC_Os03g51690  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0061179      OSH1            GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       Rice KNOX gene-1        LOC_Os03g51690  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0061179      OSH1            GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       Rice KNOX gene-1        LOC_Os03g51690  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0061179      OSH1            GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       Rice KNOX gene-1        LOC_Os03g51690  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0061182      PLA2            GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       PLASTOCHRON2    plt2|pla2|LHD2|LEAFY HEAD2|LOC_Os01g68000       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -3613,7 +3613,7 @@ GR_gene   GR:0100299      ccsA            GO:0016023      GR_REF:0        IMP             C       cytochrome c biogenesis prot
 GR_gene        GR:0100299      ccsA            GO:0017004      GR_REF:0        IMP             P       cytochrome c biogenesis protein Orf321|ycf5|LOC_Osp1g00900      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0100299      ccsA            GO:0032940      GR_REF:0        IMP             P       cytochrome c biogenesis protein Orf321|ycf5|LOC_Osp1g00900      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0100300      petA            GO:0005506      GR_REF:0        IMP             F       cytochrome f    LOC_Osp1g00480  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0100300      petA            GO:0016020      GR_REF:0        IMP                     cytochrome f    LOC_Osp1g00480  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0100300      petA            GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       cytochrome f    LOC_Osp1g00480  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0100300      petA            GO:0006810      GR_REF:0        IMP             P       cytochrome f    LOC_Osp1g00480  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0100300      petA            GO:0009055      GR_REF:0        IMP             F       cytochrome f    LOC_Osp1g00480  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0100300      petA            GO:0009507      GR_REF:0        IMP             C       cytochrome f    LOC_Osp1g00480  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -3959,7 +3959,7 @@ GR_gene   GR:0100351      psbH            GO:0042301      GR_REF:0        IMP             F       photosystem II phosphoprotei
 GR_gene        GR:0100351      psbH            GO:0050821      GR_REF:0        IMP             P       photosystem II phosphoprotein   PSII 10kDa phosphoprotein|LOC_Osp1g00620        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0100352      psbA            GO:0005164      GR_REF:0        IMP             F       Photosystem II protein D1       D1|LOC_Osp1g00110       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0100352      psbA            GO:0005506      GR_REF:0        IMP             F       Photosystem II protein D1       D1|LOC_Osp1g00110       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0100352      psbA            GO:0016020      GR_REF:0        IMP                     Photosystem II protein D1       D1,LOC_Osp1g00110       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0100352      psbA            GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       Photosystem II protein D1       D1,LOC_Osp1g00110       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0100352      psbA            GO:0006810      GR_REF:0        IMP             P       Photosystem II protein D1       D1|LOC_Osp1g00110       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0100352      psbA            GO:0006955      GR_REF:0        IMP             P       Photosystem II protein D1       D1|LOC_Osp1g00110       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0100352      psbA            GO:0009055      GR_REF:0        IMP             F       Photosystem II protein D1       D1|LOC_Osp1g00110       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -3980,7 +3980,7 @@ GR_gene   GR:0100352      psbA            GO:0045156      GR_REF:0        IMP             F       Photosystem II protein D1       D1
 GR_gene        GR:0100352      psbA            GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       Photosystem II protein D1       D1|LOC_Osp1g00110       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0100352      psbA            GO:0055114      GR_REF:0        IMP             P       Photosystem II protein D1       D1|LOC_Osp1g00110       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0100353      psbD            GO:0005506      GR_REF:0        IMP             F       photosystem II protein D2       D2|LOC_Osp1g00170       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0100353      psbD            GO:0016020      GR_REF:0        IMP                     photosystem II protein D2       D2,LOC_Osp1g00170       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0100353      psbD            GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       photosystem II protein D2       D2,LOC_Osp1g00170       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0100353      psbD            GO:0006810      GR_REF:0        IMP             P       photosystem II protein D2       D2|LOC_Osp1g00170       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0100353      psbD            GO:0009055      GR_REF:0        IMP             F       photosystem II protein D2       D2|LOC_Osp1g00170       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0100353      psbD            GO:0009507      GR_REF:0        IMP             C       photosystem II protein D2       D2|LOC_Osp1g00170       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -5425,7 +5425,7 @@ GR_gene   GR:0020141      bhlh1           GO:0004601      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 1        ba
 GR_gene        GR:0020141      bhlh1           GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 1        basic helix loop helix 1|OsbHLH001|OsbHLH1|bhlh001|LOC_Os01g70310       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020141      bhlh1           GO:0006979      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 1        basic helix loop helix 1|OsbHLH001|OsbHLH1|bhlh001|LOC_Os01g70310       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020141      bhlh1           GO:0020037      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 1        basic helix loop helix 1|OsbHLH001|OsbHLH1|bhlh001|LOC_Os01g70310       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020141      bhlh1           GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 1        basic helix loop helix 1,OsbHLH001,OsbHLH1,bhlh001,LOC_Os01g70310       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020141      bhlh1           GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 1        basic helix loop helix 1,OsbHLH001,OsbHLH1,bhlh001,LOC_Os01g70310       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020141      bhlh1           GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 1        basic helix loop helix 1|OsbHLH001|OsbHLH1|bhlh001|LOC_Os01g70310       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0020141      bhlh1           GO:0055114      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 1        basic helix loop helix 1|OsbHLH001|OsbHLH1|bhlh001|LOC_Os01g70310       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020142      bhlh2           GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 2        basic helix loop helix 2|OsbHLH002|OsbHLH2|LOC_Os11g32100       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -5433,14 +5433,14 @@ GR_gene GR:0020142      bhlh2           GO:0004990      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 2        ba
 GR_gene        GR:0020142      bhlh2           GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 2        basic helix loop helix 2|OsbHLH002|OsbHLH2|LOC_Os11g32100       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020142      bhlh2           GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 2        basic helix loop helix 2|OsbHLH002|OsbHLH2|LOC_Os11g32100       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020142      bhlh2           GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 2        basic helix loop helix 2|OsbHLH002|OsbHLH2|LOC_Os11g32100       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020142      bhlh2           GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 2        basic helix loop helix 2,OsbHLH002,OsbHLH2,LOC_Os11g32100       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020142      bhlh2           GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 2        basic helix loop helix 2,OsbHLH002,OsbHLH2,LOC_Os11g32100       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020142      bhlh2           GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 2        basic helix loop helix 2|OsbHLH002|OsbHLH2|LOC_Os11g32100       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020143      bhlh3           GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 3        basic helix loop helix 3|OsbHLH003|OsbHLH3|LOC_Os03g04310       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020143      bhlh3           GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 3        basic helix loop helix 3,OsbHLH003,OsbHLH3,LOC_Os03g04310       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020143      bhlh3           GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 3        basic helix loop helix 3,OsbHLH003,OsbHLH3,LOC_Os03g04310       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020143      bhlh3           GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 3        basic helix loop helix 3|OsbHLH003|OsbHLH3|LOC_Os03g04310       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020144      bhlh4           GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 4        basic helix loop helix 4|OsbHLH004|OsbHLH4|LOC_Os10g39750       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020144      bhlh4           GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 4        basic helix loop helix 4|OsbHLH004|OsbHLH4|LOC_Os10g39750       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020144      bhlh4           GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 4        basic helix loop helix 4,OsbHLH004,OsbHLH4,LOC_Os10g39750       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020144      bhlh4           GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 4        basic helix loop helix 4,OsbHLH004,OsbHLH4,LOC_Os10g39750       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020144      bhlh4           GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 4        basic helix loop helix 4|OsbHLH004|OsbHLH4|LOC_Os10g39750       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080004      WRKY71          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       Transcription factor WRKY71     OsWRKY71|LOC_Os02g08440 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080004      WRKY71          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       Transcription factor WRKY71     OsWRKY71|LOC_Os02g08440 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -5455,57 +5455,57 @@ GR_gene GR:0080004      WRKY71          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       Transcription factor WRKY7
 GR_gene        GR:0080004      WRKY71          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       Transcription factor WRKY71     OsWRKY71|LOC_Os02g08440 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020145      tdr             GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       Tapetum degeneration retardation        basic helix loop helix 5|OsbHLH005|OsbHLH5|basic/helix-loop-helix 5|bhlh5|LOC_Os02g02820        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020145      tdr             GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       Tapetum degeneration retardation        basic helix loop helix 5|OsbHLH005|OsbHLH5|basic/helix-loop-helix 5|bhlh5|LOC_Os02g02820        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020145      tdr             GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     Tapetum degeneration retardation        basic helix loop helix 5,OsbHLH005,OsbHLH5,basic/helix-loop-helix 5,bhlh5,LOC_Os02g02820        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020145      tdr             GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       Tapetum degeneration retardation        basic helix loop helix 5,OsbHLH005,OsbHLH5,basic/helix-loop-helix 5,bhlh5,LOC_Os02g02820        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020145      tdr             GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       Tapetum degeneration retardation        basic helix loop helix 5|OsbHLH005|OsbHLH5|basic/helix-loop-helix 5|bhlh5|LOC_Os02g02820        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020145      tdr             GO:0048653      GR_REF:0        IMP             P       Tapetum degeneration retardation        basic helix loop helix 5|OsbHLH005|OsbHLH5|basic/helix-loop-helix 5|bhlh5|LOC_Os02g02820        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020145      tdr             GO:0048654      GR_REF:0        IMP             P       Tapetum degeneration retardation        basic helix loop helix 5|OsbHLH005|OsbHLH5|basic/helix-loop-helix 5|bhlh5|LOC_Os02g02820        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020145      tdr             GO:0048657      GR_REF:0        IMP             P       Tapetum degeneration retardation        basic helix loop helix 5|OsbHLH005|OsbHLH5|basic/helix-loop-helix 5|bhlh5|LOC_Os02g02820        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020146      bhlh6           GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 6        RERJ1|basic helix loop helix 6|OsbHLH006|OsbHLH6|LOC_Os04g23550 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020146      bhlh6           GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 6        RERJ1,basic helix loop helix 6,OsbHLH006,OsbHLH6,LOC_Os04g23550 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020146      bhlh6           GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 6        RERJ1,basic helix loop helix 6,OsbHLH006,OsbHLH6,LOC_Os04g23550 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020146      bhlh6           GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 6        RERJ1|basic helix loop helix 6|OsbHLH006|OsbHLH6|LOC_Os04g23550 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020147      bhlh7           GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 7        basic helix loop helix 7|OsbHLH007|OsbHLH7|OSJNBB0013O03.11|LOC_Os04g23440      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020147      bhlh7           GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 7        basic helix loop helix 7|OsbHLH007|OsbHLH7|OSJNBB0013O03.11|LOC_Os04g23440      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020147      bhlh7           GO:0009055      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 7        basic helix loop helix 7|OsbHLH007|OsbHLH7|OSJNBB0013O03.11|LOC_Os04g23440      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020147      bhlh7           GO:0022900      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 7        basic helix loop helix 7|OsbHLH007|OsbHLH7|OSJNBB0013O03.11|LOC_Os04g23440      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020147      bhlh7           GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 7        basic helix loop helix 7,OsbHLH007,OsbHLH7,OSJNBB0013O03.11,LOC_Os04g23440      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020147      bhlh7           GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 7        basic helix loop helix 7,OsbHLH007,OsbHLH7,OSJNBB0013O03.11,LOC_Os04g23440      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020147      bhlh7           GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 7        basic helix loop helix 7|OsbHLH007|OsbHLH7|OSJNBB0013O03.11|LOC_Os04g23440      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020148      bhlh8           GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 8        basic helix loop helix 8|OsbHLH008|OsbHLH8|LOC_Os01g13460       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020148      bhlh8           GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 8        basic helix loop helix 8,OsbHLH008,OsbHLH8,LOC_Os01g13460       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020148      bhlh8           GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 8        basic helix loop helix 8,OsbHLH008,OsbHLH8,LOC_Os01g13460       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020148      bhlh8           GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 8        basic helix loop helix 8|OsbHLH008|OsbHLH8|LOC_Os01g13460       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020149      bhlh9           GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 9        basic helix loop helix 9|OsbHLH009|OsbHLH9|MYC transcription factor|putative|LOC_Os10g42430     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020149      bhlh9           GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 9        basic helix loop helix 9,OsbHLH009,OsbHLH9,MYC transcription factor,putative,LOC_Os10g42430     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020149      bhlh9           GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 9        basic helix loop helix 9,OsbHLH009,OsbHLH9,MYC transcription factor,putative,LOC_Os10g42430     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020149      bhlh9           GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 9        basic helix loop helix 9|OsbHLH009|OsbHLH9|MYC transcription factor|putative|LOC_Os10g42430     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020150      bhlh10          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 10       basic helix loop helix 10|OsbHLH010|OsbHLH10|LOC_Os01g50940     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020150      bhlh10          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 10       basic helix loop helix 10,OsbHLH010,OsbHLH10,LOC_Os01g50940     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020150      bhlh10          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 10       basic helix loop helix 10,OsbHLH010,OsbHLH10,LOC_Os01g50940     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020150      bhlh10          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 10       basic helix loop helix 10|OsbHLH010|OsbHLH10|LOC_Os01g50940     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020151      bhlh11          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 11       Phaseolin G-box binding protein PG1-like|basic helix loop helix 11|OsbHLH011|OsbHLH11|OJ1521_G02.36|P0623F08.11|LOC_Os08g43070  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020151      bhlh11          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 11       Phaseolin G-box binding protein PG1-like|basic helix loop helix 11|OsbHLH011|OsbHLH11|OJ1521_G02.36|P0623F08.11|LOC_Os08g43070  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020151      bhlh11          GO:0016068      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 11       Phaseolin G-box binding protein PG1-like|basic helix loop helix 11|OsbHLH011|OsbHLH11|OJ1521_G02.36|P0623F08.11|LOC_Os08g43070  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020151      bhlh11          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 11       Phaseolin G-box binding protein PG1-like,basic helix loop helix 11,OsbHLH011,OsbHLH11,OJ1521_G02.36,P0623F08.11,LOC_Os08g43070  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020151      bhlh11          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 11       Phaseolin G-box binding protein PG1-like,basic helix loop helix 11,OsbHLH011,OsbHLH11,OJ1521_G02.36,P0623F08.11,LOC_Os08g43070  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020151      bhlh11          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 11       Phaseolin G-box binding protein PG1-like|basic helix loop helix 11|OsbHLH011|OsbHLH11|OJ1521_G02.36|P0623F08.11|LOC_Os08g43070  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020151      bhlh11          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 11       Phaseolin G-box binding protein PG1-like|basic helix loop helix 11|OsbHLH011|OsbHLH11|OJ1521_G02.36|P0623F08.11|LOC_Os08g43070  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020151      bhlh11          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 11       Phaseolin G-box binding protein PG1-like|basic helix loop helix 11|OsbHLH011|OsbHLH11|OJ1521_G02.36|P0623F08.11|LOC_Os08g43070  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020151      bhlh11          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 11       Phaseolin G-box binding protein PG1-like|basic helix loop helix 11|OsbHLH011|OsbHLH11|OJ1521_G02.36|P0623F08.11|LOC_Os08g43070  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020151      bhlh11          GO:0051260      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 11       Phaseolin G-box binding protein PG1-like|basic helix loop helix 11|OsbHLH011|OsbHLH11|OJ1521_G02.36|P0623F08.11|LOC_Os08g43070  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020152      bhlh12          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 12       basic helix loop helix 12|OsbHLH012|OsbHLH12|LOC_Os01g39480     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020152      bhlh12          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 12       basic helix loop helix 12,OsbHLH012,OsbHLH12,LOC_Os01g39480     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020152      bhlh12          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 12       basic helix loop helix 12,OsbHLH012,OsbHLH12,LOC_Os01g39480     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020152      bhlh12          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 12       basic helix loop helix 12|OsbHLH012|OsbHLH12|LOC_Os01g39480     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020153      bhlh14          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 14       basic helix loop helix 14|OsbHLH014|OsbHLH14|LOC_Os11g15210     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020153      bhlh14          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 14       basic helix loop helix 14|OsbHLH014|OsbHLH14|LOC_Os11g15210     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020153      bhlh14          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 14       basic helix loop helix 14,OsbHLH014,OsbHLH14,LOC_Os11g15210     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020153      bhlh14          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 14       basic helix loop helix 14,OsbHLH014,OsbHLH14,LOC_Os11g15210     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020153      bhlh14          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 14       basic helix loop helix 14|OsbHLH014|OsbHLH14|LOC_Os11g15210     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020154      bhlh15          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 15       basic helix loop helix 15|OsbHLH015|OsbHLH15|OSJNBA0065O17.4|LOC_Os04g47040     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020154      bhlh15          GO:0016068      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 15       basic helix loop helix 15|OsbHLH015|OsbHLH15|OSJNBA0065O17.4|LOC_Os04g47040     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020154      bhlh15          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 15       basic helix loop helix 15,OsbHLH015,OsbHLH15,OSJNBA0065O17.4,LOC_Os04g47040     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020154      bhlh15          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 15       basic helix loop helix 15,OsbHLH015,OsbHLH15,OSJNBA0065O17.4,LOC_Os04g47040     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020154      bhlh15          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 15       basic helix loop helix 15|OsbHLH015|OsbHLH15|OSJNBA0065O17.4|LOC_Os04g47040     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020155      bhlh16          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 16       basic helix loop helix 16|OsbHLH016|OsbHLH16|LOC_Os04g47059     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020155      bhlh16          GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 16       basic helix loop helix 16|OsbHLH016|OsbHLH16|LOC_Os04g47059     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020155      bhlh16          GO:0016068      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 16       basic helix loop helix 16|OsbHLH016|OsbHLH16|LOC_Os04g47059     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020155      bhlh16          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 16       basic helix loop helix 16,OsbHLH016,OsbHLH16,LOC_Os04g47059     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020155      bhlh16          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 16       basic helix loop helix 16,OsbHLH016,OsbHLH16,LOC_Os04g47059     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020155      bhlh16          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 16       basic helix loop helix 16|OsbHLH016|OsbHLH16|LOC_Os04g47059     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020156      bhlh18          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 18       basic helix loop helix 18|OsbHLH018|OsbHLH18|Putative symbiotic ammonium transport protein|OSJNBa0013A09.16|LOC_Os03g51580      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020156      bhlh18          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 18       basic helix loop helix 18|OsbHLH018|OsbHLH18|Putative symbiotic ammonium transport protein|OSJNBa0013A09.16|LOC_Os03g51580      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020156      bhlh18          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 18       basic helix loop helix 18,OsbHLH018,OsbHLH18,Putative symbiotic ammonium transport protein,OSJNBa0013A09.16,LOC_Os03g51580      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020156      bhlh18          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 18       basic helix loop helix 18,OsbHLH018,OsbHLH18,Putative symbiotic ammonium transport protein,OSJNBa0013A09.16,LOC_Os03g51580      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020156      bhlh18          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 18       basic helix loop helix 18|OsbHLH018|OsbHLH18|Putative symbiotic ammonium transport protein|OSJNBa0013A09.16|LOC_Os03g51580      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020156      bhlh18          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 18       basic helix loop helix 18|OsbHLH018|OsbHLH18|Putative symbiotic ammonium transport protein|OSJNBa0013A09.16|LOC_Os03g51580      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020156      bhlh18          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 18       basic helix loop helix 18|OsbHLH018|OsbHLH18|Putative symbiotic ammonium transport protein|OSJNBa0013A09.16|LOC_Os03g51580      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -5513,132 +5513,132 @@ GR_gene       GR:0020156      bhlh18          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 18
 GR_gene        GR:0020157      bhlh19          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 19       basic helix loop helix 19|OsbHLH019|OsbHLH19|OJ1203D03.3|Putative bHLH transcription factor|LOC_Os03g12760      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020157      bhlh19          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 19       basic helix loop helix 19|OsbHLH019|OsbHLH19|OJ1203D03.3|Putative bHLH transcription factor|LOC_Os03g12760      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020157      bhlh19          GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 19       basic helix loop helix 19|OsbHLH019|OsbHLH19|OJ1203D03.3|Putative bHLH transcription factor|LOC_Os03g12760      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020157      bhlh19          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 19       basic helix loop helix 19,OsbHLH019,OsbHLH19,OJ1203D03.3,Putative bHLH transcription factor,LOC_Os03g12760      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020157      bhlh19          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 19       basic helix loop helix 19,OsbHLH019,OsbHLH19,OJ1203D03.3,Putative bHLH transcription factor,LOC_Os03g12760      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020157      bhlh19          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 19       basic helix loop helix 19|OsbHLH019|OsbHLH19|OJ1203D03.3|Putative bHLH transcription factor|LOC_Os03g12760      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020158      bhlh20          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 20       basic helix loop helix 20|OsbHLH020|OsbHLH20|OSJNBB0113I20.8|Putative ammonium transporter|LOC_Os03g46860       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020158      bhlh20          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 20       basic helix loop helix 20|OsbHLH020|OsbHLH20|OSJNBB0113I20.8|Putative ammonium transporter|LOC_Os03g46860       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020158      bhlh20          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 20       basic helix loop helix 20,OsbHLH020,OsbHLH20,OSJNBB0113I20.8,Putative ammonium transporter,LOC_Os03g46860       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020158      bhlh20          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 20       basic helix loop helix 20,OsbHLH020,OsbHLH20,OSJNBB0113I20.8,Putative ammonium transporter,LOC_Os03g46860       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020158      bhlh20          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 20       basic helix loop helix 20|OsbHLH020|OsbHLH20|OSJNBB0113I20.8|Putative ammonium transporter|LOC_Os03g46860       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020159      bhlh21          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 21       Hypothetical protein|basic helix loop helix 21|OsbHLH021|OsbHLH21|LOC_Os12g43620        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020159      bhlh21          GO:0004974      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 21       Hypothetical protein|basic helix loop helix 21|OsbHLH021|OsbHLH21|LOC_Os12g43620        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020159      bhlh21          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 21       Hypothetical protein|basic helix loop helix 21|OsbHLH021|OsbHLH21|LOC_Os12g43620        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020159      bhlh21          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 21       Hypothetical protein|basic helix loop helix 21|OsbHLH021|OsbHLH21|LOC_Os12g43620        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020159      bhlh21          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 21       Hypothetical protein|basic helix loop helix 21|OsbHLH021|OsbHLH21|LOC_Os12g43620        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020159      bhlh21          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 21       Hypothetical protein,basic helix loop helix 21,OsbHLH021,OsbHLH21,LOC_Os12g43620        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020159      bhlh21          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 21       Hypothetical protein,basic helix loop helix 21,OsbHLH021,OsbHLH21,LOC_Os12g43620        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020159      bhlh21          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 21       Hypothetical protein|basic helix loop helix 21|OsbHLH021|OsbHLH21|LOC_Os12g43620        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020159      bhlh21          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 21       Hypothetical protein|basic helix loop helix 21|OsbHLH021|OsbHLH21|LOC_Os12g43620        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020159      bhlh21          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 21       Hypothetical protein|basic helix loop helix 21|OsbHLH021|OsbHLH21|LOC_Os12g43620        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020159      bhlh21          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 21       Hypothetical protein|basic helix loop helix 21|OsbHLH021|OsbHLH21|LOC_Os12g43620        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020160      bhlh22          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 22       Putative ammonium transporter|OSJNBB0113I20.1|basic helix loop helix 22|OsbHLH0022|OsbHLH22|LOC_Os03g46790      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020160      bhlh22          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 22       Putative ammonium transporter|OSJNBB0113I20.1|basic helix loop helix 22|OsbHLH0022|OsbHLH22|LOC_Os03g46790      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020160      bhlh22          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 22       Putative ammonium transporter,OSJNBB0113I20.1,basic helix loop helix 22,OsbHLH0022,OsbHLH22,LOC_Os03g46790      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020160      bhlh22          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 22       Putative ammonium transporter,OSJNBB0113I20.1,basic helix loop helix 22,OsbHLH0022,OsbHLH22,LOC_Os03g46790      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020160      bhlh22          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 22       Putative ammonium transporter|OSJNBB0113I20.1|basic helix loop helix 22|OsbHLH0022|OsbHLH22|LOC_Os03g46790      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020161      bhlh23          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 23       basic helix loop helix 23|OsbHLH0023|OsbHLH23|LOC_Os10g01530    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020161      bhlh23          GO:0004365      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 23       basic helix loop helix 23|OsbHLH0023|OsbHLH23|LOC_Os10g01530    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020161      bhlh23          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 23       basic helix loop helix 23|OsbHLH0023|OsbHLH23|LOC_Os10g01530    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020161      bhlh23          GO:0006006      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 23       basic helix loop helix 23|OsbHLH0023|OsbHLH23|LOC_Os10g01530    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020161      bhlh23          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 23       basic helix loop helix 23,OsbHLH0023,OsbHLH23,LOC_Os10g01530    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020161      bhlh23          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 23       basic helix loop helix 23,OsbHLH0023,OsbHLH23,LOC_Os10g01530    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020161      bhlh23          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 23       basic helix loop helix 23|OsbHLH0023|OsbHLH23|LOC_Os10g01530    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020161      bhlh23          GO:0051287      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 23       basic helix loop helix 23|OsbHLH0023|OsbHLH23|LOC_Os10g01530    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020162      bhlh24          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 24       B1112D09.4 protein|basic helix loop helix 24|OsbHLH0024|OsbHLH24|LOC_Os01g39330 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020162      bhlh24          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 24       B1112D09.4 protein,basic helix loop helix 24,OsbHLH0024,OsbHLH24,LOC_Os01g39330 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020162      bhlh24          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 24       B1112D09.4 protein,basic helix loop helix 24,OsbHLH0024,OsbHLH24,LOC_Os01g39330 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020162      bhlh24          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 24       B1112D09.4 protein|basic helix loop helix 24|OsbHLH0024|OsbHLH24|LOC_Os01g39330 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020163      bhlh25          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 25       P0498B01.36|basic helix loop helix 25|OsbHLH0025|OsbHLH25|LOC_Os01g09990        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020163      bhlh25          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 25       P0498B01.36|basic helix loop helix 25|OsbHLH0025|OsbHLH25|LOC_Os01g09990        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020163      bhlh25          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 25       P0498B01.36|basic helix loop helix 25|OsbHLH0025|OsbHLH25|LOC_Os01g09990        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020163      bhlh25          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 25       P0498B01.36|basic helix loop helix 25|OsbHLH0025|OsbHLH25|LOC_Os01g09990        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020163      bhlh25          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 25       P0498B01.36,basic helix loop helix 25,OsbHLH0025,OsbHLH25,LOC_Os01g09990        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020163      bhlh25          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 25       P0498B01.36,basic helix loop helix 25,OsbHLH0025,OsbHLH25,LOC_Os01g09990        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020163      bhlh25          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 25       P0498B01.36|basic helix loop helix 25|OsbHLH0025|OsbHLH25|LOC_Os01g09990        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020164      bhlh26          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 26       P0498B01.25|basic helix loop helix 26|OsbHLH0026|OsbHLH26|LOC_Os01g09930        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020164      bhlh26          GO:0016068      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 26       P0498B01.25|basic helix loop helix 26|OsbHLH0026|OsbHLH26|LOC_Os01g09930        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020164      bhlh26          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 26       P0498B01.25,basic helix loop helix 26,OsbHLH0026,OsbHLH26,LOC_Os01g09930        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020164      bhlh26          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 26       P0498B01.25,basic helix loop helix 26,OsbHLH0026,OsbHLH26,LOC_Os01g09930        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020164      bhlh26          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 26       P0498B01.25|basic helix loop helix 26|OsbHLH0026|OsbHLH26|LOC_Os01g09930        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020164      bhlh26          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 26       P0498B01.25|basic helix loop helix 26|OsbHLH0026|OsbHLH26|LOC_Os01g09930        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020164      bhlh26          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 26       P0498B01.25|basic helix loop helix 26|OsbHLH0026|OsbHLH26|LOC_Os01g09930        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020164      bhlh26          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 26       P0498B01.25|basic helix loop helix 26|OsbHLH0026|OsbHLH26|LOC_Os01g09930        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020165      bhlh27          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 27       basic helix loop helix 27|OsbHLH0027|OsbHLH27|LOC_Os01g09900    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020165      bhlh27          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 27       basic helix loop helix 27,OsbHLH0027,OsbHLH27,LOC_Os01g09900    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020165      bhlh27          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 27       basic helix loop helix 27,OsbHLH0027,OsbHLH27,LOC_Os01g09900    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020165      bhlh27          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 27       basic helix loop helix 27|OsbHLH0027|OsbHLH27|LOC_Os01g09900    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020165      bhlh27          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 27       basic helix loop helix 27|OsbHLH0027|OsbHLH27|LOC_Os01g09900    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020165      bhlh27          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 27       basic helix loop helix 27|OsbHLH0027|OsbHLH27|LOC_Os01g09900    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020165      bhlh27          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 27       basic helix loop helix 27|OsbHLH0027|OsbHLH27|LOC_Os01g09900    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020166      bhlh28          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 28       basic helix loop helix 28|OsbHLH0028|OsbHLH28|LOC_Os05g11070    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020166      bhlh28          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 28       basic helix loop helix 28,OsbHLH0028,OsbHLH28,LOC_Os05g11070    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020166      bhlh28          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 28       basic helix loop helix 28,OsbHLH0028,OsbHLH28,LOC_Os05g11070    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020166      bhlh28          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 28       basic helix loop helix 28|OsbHLH0028|OsbHLH28|LOC_Os05g11070    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020167      bhlh29          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 29       B1131G07.17|basic helix loop helix 29|OsbHLH0029|OsbHLH29|LOC_Os02g12820        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020167      bhlh29          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 29       B1131G07.17,basic helix loop helix 29,OsbHLH0029,OsbHLH29,LOC_Os02g12820        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020167      bhlh29          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 29       B1131G07.17,basic helix loop helix 29,OsbHLH0029,OsbHLH29,LOC_Os02g12820        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020167      bhlh29          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 29       B1131G07.17|basic helix loop helix 29|OsbHLH0029|OsbHLH29|LOC_Os02g12820        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020168      bhlh30          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 30       P0610D01.7|basic helix loop helix 30|OsbHLH0030|OsbHLH30|LOC_Os06g37410 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020168      bhlh30          GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 30       P0610D01.7|basic helix loop helix 30|OsbHLH0030|OsbHLH30|LOC_Os06g37410 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020168      bhlh30          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 30       P0610D01.7,basic helix loop helix 30,OsbHLH0030,OsbHLH30,LOC_Os06g37410 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020168      bhlh30          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 30       P0610D01.7,basic helix loop helix 30,OsbHLH0030,OsbHLH30,LOC_Os06g37410 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020168      bhlh30          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 30       P0610D01.7|basic helix loop helix 30|OsbHLH0030|OsbHLH30|LOC_Os06g37410 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020169      bhlh31          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 31       P0605H02.26|basic helix loop helix 31|OsbHLH0031|OsbHLH31|LOC_Os08g38210        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020169      bhlh31          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 31       P0605H02.26,basic helix loop helix 31,OsbHLH0031,OsbHLH31,LOC_Os08g38210        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020169      bhlh31          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 31       P0605H02.26,basic helix loop helix 31,OsbHLH0031,OsbHLH31,LOC_Os08g38210        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020169      bhlh31          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 31       P0605H02.26|basic helix loop helix 31|OsbHLH0031|OsbHLH31|LOC_Os08g38210        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020170      bhlh32          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 32       OSJNBa0026C08.39-1|basic helix loop helix 32|OsbHLH0032|OsbHLH32|LOC_Os09g29930 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020170      bhlh32          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 32       OSJNBa0026C08.39-1,basic helix loop helix 32,OsbHLH0032,OsbHLH32,LOC_Os09g29930 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020170      bhlh32          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 32       OSJNBa0026C08.39-1,basic helix loop helix 32,OsbHLH0032,OsbHLH32,LOC_Os09g29930 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020170      bhlh32          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 32       OSJNBa0026C08.39-1|basic helix loop helix 32|OsbHLH0032|OsbHLH32|LOC_Os09g29930 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020171      bhlh33          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 33       P0039A07.22|Putative zinc finger protein|basic helix loop helix 33|OsbHLH033|OsbHLH33|LOC_Os01g65080    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020171      bhlh33          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 33       P0039A07.22|Putative zinc finger protein|basic helix loop helix 33|OsbHLH033|OsbHLH33|LOC_Os01g65080    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020171      bhlh33          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 33       P0039A07.22|Putative zinc finger protein|basic helix loop helix 33|OsbHLH033|OsbHLH33|LOC_Os01g65080    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020171      bhlh33          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 33       P0039A07.22,Putative zinc finger protein,basic helix loop helix 33,OsbHLH033,OsbHLH33,LOC_Os01g65080    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020171      bhlh33          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 33       P0039A07.22,Putative zinc finger protein,basic helix loop helix 33,OsbHLH033,OsbHLH33,LOC_Os01g65080    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020171      bhlh33          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 33       P0039A07.22|Putative zinc finger protein|basic helix loop helix 33|OsbHLH033|OsbHLH33|LOC_Os01g65080    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020172      bhlh34          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 34       BHLH protein-like|B1121A12.20|basic helix loop helix 34|OsbHLH034|OsbHLH34|LOC_Os02g49480       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020172      bhlh34          GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 34       BHLH protein-like|B1121A12.20|basic helix loop helix 34|OsbHLH034|OsbHLH34|LOC_Os02g49480       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020172      bhlh34          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 34       BHLH protein-like,B1121A12.20,basic helix loop helix 34,OsbHLH034,OsbHLH34,LOC_Os02g49480       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020172      bhlh34          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 34       BHLH protein-like,B1121A12.20,basic helix loop helix 34,OsbHLH034,OsbHLH34,LOC_Os02g49480       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020172      bhlh34          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 34       BHLH protein-like|B1121A12.20|basic helix loop helix 34|OsbHLH034|OsbHLH34|LOC_Os02g49480       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020173      bhlh35          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 35       basic helix loop helix 35|OsbHLH035|OsbHLH35|ESTs C26093|C11622|LOC_Os01g06640  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020173      bhlh35          GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 35       basic helix loop helix 35|OsbHLH035|OsbHLH35|ESTs C26093|C11622|LOC_Os01g06640  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020173      bhlh35          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 35       basic helix loop helix 35,OsbHLH035,OsbHLH35,ESTs C26093,C11622,LOC_Os01g06640  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020173      bhlh35          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 35       basic helix loop helix 35,OsbHLH035,OsbHLH35,ESTs C26093,C11622,LOC_Os01g06640  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020173      bhlh35          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 35       basic helix loop helix 35|OsbHLH035|OsbHLH35|ESTs C26093|C11622|LOC_Os01g06640  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020174      bhlh36          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 36       basic helix loop helix 36|OsbHLH036|OsbHLH36|Hypothetical protein OSJNBb0099P06.13|HypotheticalproteinOSJNBa0027N19.3|OSJNBa0027N19.3|OSJNBb0099P06.13|LOC_Os05g07120   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020174      bhlh36          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 36       basic helix loop helix 36|OsbHLH036|OsbHLH36|Hypothetical protein OSJNBb0099P06.13|HypotheticalproteinOSJNBa0027N19.3|OSJNBa0027N19.3|OSJNBb0099P06.13|LOC_Os05g07120   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020174      bhlh36          GO:0016597      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 36       basic helix loop helix 36|OsbHLH036|OsbHLH36|Hypothetical protein OSJNBb0099P06.13|HypotheticalproteinOSJNBa0027N19.3|OSJNBa0027N19.3|OSJNBb0099P06.13|LOC_Os05g07120   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020174      bhlh36          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 36       basic helix loop helix 36,OsbHLH036,OsbHLH36,Hypothetical protein OSJNBb0099P06.13,HypotheticalproteinOSJNBa0027N19.3,OSJNBa0027N19.3,OSJNBb0099P06.13,LOC_Os05g07120   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020174      bhlh36          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 36       basic helix loop helix 36,OsbHLH036,OsbHLH36,Hypothetical protein OSJNBb0099P06.13,HypotheticalproteinOSJNBa0027N19.3,OSJNBa0027N19.3,OSJNBb0099P06.13,LOC_Os05g07120   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020174      bhlh36          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 36       basic helix loop helix 36|OsbHLH036|OsbHLH36|Hypothetical protein OSJNBb0099P06.13|HypotheticalproteinOSJNBa0027N19.3|OSJNBa0027N19.3|OSJNBb0099P06.13|LOC_Os05g07120   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020175      bhlh37          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 37       basic helix loop helix 37|OsbHLH037|OsbHLH37|P0665D10.15 protein|P0665D10.15|LOC_Os01g11910     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020175      bhlh37          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 37       basic helix loop helix 37,OsbHLH037,OsbHLH37,P0665D10.15 protein,P0665D10.15,LOC_Os01g11910     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020175      bhlh37          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 37       basic helix loop helix 37,OsbHLH037,OsbHLH37,P0665D10.15 protein,P0665D10.15,LOC_Os01g11910     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020175      bhlh37          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 37       basic helix loop helix 37|OsbHLH037|OsbHLH37|P0665D10.15 protein|P0665D10.15|LOC_Os01g11910     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020176      bhlh38          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 38       basic helix loop helix 38|OsbHLH038|OsbHLH38|DNA-binding protein-like|P0431A03.9|LOC_Os08g33590 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020176      bhlh38          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 38       basic helix loop helix 38|OsbHLH038|OsbHLH38|DNA-binding protein-like|P0431A03.9|LOC_Os08g33590 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020176      bhlh38          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 38       basic helix loop helix 38,OsbHLH038,OsbHLH38,DNA-binding protein-like,P0431A03.9,LOC_Os08g33590 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020176      bhlh38          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 38       basic helix loop helix 38,OsbHLH038,OsbHLH38,DNA-binding protein-like,P0431A03.9,LOC_Os08g33590 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020176      bhlh38          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 38       basic helix loop helix 38|OsbHLH038|OsbHLH38|DNA-binding protein-like|P0431A03.9|LOC_Os08g33590 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020177      bhlh39          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 39       DNA binding protein-like|OJ1294_G06.8|basic helix loop helix 39|OsbHLH039|OsbHLH39|LOC_Os09g24490       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020177      bhlh39          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 39       DNA binding protein-like,OJ1294_G06.8,basic helix loop helix 39,OsbHLH039,OsbHLH39,LOC_Os09g24490       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020177      bhlh39          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 39       DNA binding protein-like,OJ1294_G06.8,basic helix loop helix 39,OsbHLH039,OsbHLH39,LOC_Os09g24490       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020177      bhlh39          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 39       DNA binding protein-like|OJ1294_G06.8|basic helix loop helix 39|OsbHLH039|OsbHLH39|LOC_Os09g24490       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020178      bhlh40          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 40       basic helix loop helix 40|OsbHLH040|OsbHLH40|LOC_Os03g15440     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020178      bhlh40          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 40       basic helix loop helix 40|OsbHLH040|OsbHLH40|LOC_Os03g15440     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020178      bhlh40          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 40       basic helix loop helix 40,OsbHLH040,OsbHLH40,LOC_Os03g15440     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020178      bhlh40          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 40       basic helix loop helix 40,OsbHLH040,OsbHLH40,LOC_Os03g15440     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020178      bhlh40          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 40       basic helix loop helix 40|OsbHLH040|OsbHLH40|LOC_Os03g15440     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020179      bhlh41          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 41       Putative DNA binding protein|OSJNBb0033J23.9|basic helix loop helix 41|OsbHLH041|OsbHLH41|LOC_Os03g59670        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020179      bhlh41          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 41       Putative DNA binding protein|OSJNBb0033J23.9|basic helix loop helix 41|OsbHLH041|OsbHLH41|LOC_Os03g59670        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020179      bhlh41          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 41       Putative DNA binding protein,OSJNBb0033J23.9,basic helix loop helix 41,OsbHLH041,OsbHLH41,LOC_Os03g59670        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020179      bhlh41          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 41       Putative DNA binding protein,OSJNBb0033J23.9,basic helix loop helix 41,OsbHLH041,OsbHLH41,LOC_Os03g59670        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020179      bhlh41          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 41       Putative DNA binding protein|OSJNBb0033J23.9|basic helix loop helix 41|OsbHLH041|OsbHLH41|LOC_Os03g59670        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020180      bhlh42          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 42       BHLH protein family-like|OJ1666_A04.16|basic helix loop helix 42|OsbHLH042|OsbHLH42|LOC_Os08g37290      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020180      bhlh42          GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 42       BHLH protein family-like|OJ1666_A04.16|basic helix loop helix 42|OsbHLH042|OsbHLH42|LOC_Os08g37290      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020180      bhlh42          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 42       BHLH protein family-like,OJ1666_A04.16,basic helix loop helix 42,OsbHLH042,OsbHLH42,LOC_Os08g37290      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020180      bhlh42          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 42       BHLH protein family-like,OJ1666_A04.16,basic helix loop helix 42,OsbHLH042,OsbHLH42,LOC_Os08g37290      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020180      bhlh42          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 42       BHLH protein family-like|OJ1666_A04.16|basic helix loop helix 42|OsbHLH042|OsbHLH42|LOC_Os08g37290      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020180      bhlh42          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 42       BHLH protein family-like|OJ1666_A04.16|basic helix loop helix 42|OsbHLH042|OsbHLH42|LOC_Os08g37290      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020180      bhlh42          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 42       BHLH protein family-like|OJ1666_A04.16|basic helix loop helix 42|OsbHLH042|OsbHLH42|LOC_Os08g37290      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020180      bhlh42          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 42       BHLH protein family-like|OJ1666_A04.16|basic helix loop helix 42|OsbHLH042|OsbHLH42|LOC_Os08g37290      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020181      bhlh43          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 43       OSJNBb0019B14.23|BHLH-like protein|basic helix loop helix 43|OsbHLH043|OsbHLH43|LOC_Os09g28900  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020181      bhlh43          GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 43       OSJNBb0019B14.23|BHLH-like protein|basic helix loop helix 43|OsbHLH043|OsbHLH43|LOC_Os09g28900  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020181      bhlh43          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 43       OSJNBb0019B14.23,BHLH-like protein,basic helix loop helix 43,OsbHLH043,OsbHLH43,LOC_Os09g28900  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020181      bhlh43          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 43       OSJNBb0019B14.23,BHLH-like protein,basic helix loop helix 43,OsbHLH043,OsbHLH43,LOC_Os09g28900  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020181      bhlh43          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 43       OSJNBb0019B14.23|BHLH-like protein|basic helix loop helix 43|OsbHLH043|OsbHLH43|LOC_Os09g28900  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020182      bhlh44          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 44       OJ1217B09.8|Hypothetical protein|basic helix loop helix 44|OsbHLH044|OsbHLH44|LOC_Os03g08930    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020182      bhlh44          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 44       OJ1217B09.8|Hypothetical protein|basic helix loop helix 44|OsbHLH044|OsbHLH44|LOC_Os03g08930    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020182      bhlh44          GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 44       OJ1217B09.8|Hypothetical protein|basic helix loop helix 44|OsbHLH044|OsbHLH44|LOC_Os03g08930    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020182      bhlh44          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 44       OJ1217B09.8,Hypothetical protein,basic helix loop helix 44,OsbHLH044,OsbHLH44,LOC_Os03g08930    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020182      bhlh44          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 44       OJ1217B09.8,Hypothetical protein,basic helix loop helix 44,OsbHLH044,OsbHLH44,LOC_Os03g08930    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020182      bhlh44          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 44       OJ1217B09.8|Hypothetical protein|basic helix loop helix 44|OsbHLH044|OsbHLH44|LOC_Os03g08930    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020183      bhlh45          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 45       basic helix loop helix 43|OsbHLH043|OsbHLH43|LOC_Os10g23050     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020183      bhlh45          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 45       basic helix loop helix 43|OsbHLH043|OsbHLH43|LOC_Os10g23050     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020183      bhlh45          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 45       basic helix loop helix 43,OsbHLH043,OsbHLH43,LOC_Os10g23050     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020183      bhlh45          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 45       basic helix loop helix 43,OsbHLH043,OsbHLH43,LOC_Os10g23050     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020183      bhlh45          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 45       basic helix loop helix 43|OsbHLH043|OsbHLH43|LOC_Os10g23050     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020184      bhlh46          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 46       OJ1595_D08.4|P0676H02.22|basic helix loop helix 46|OsbHLH046|OsbHLH46|LOC_Os09g29360    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020184      bhlh46          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 46       OJ1595_D08.4|P0676H02.22|basic helix loop helix 46|OsbHLH046|OsbHLH46|LOC_Os09g29360    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020184      bhlh46          GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 46       OJ1595_D08.4|P0676H02.22|basic helix loop helix 46|OsbHLH046|OsbHLH46|LOC_Os09g29360    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020184      bhlh46          GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 46       OJ1595_D08.4|P0676H02.22|basic helix loop helix 46|OsbHLH046|OsbHLH46|LOC_Os09g29360    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020184      bhlh46          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 46       OJ1595_D08.4,P0676H02.22,basic helix loop helix 46,OsbHLH046,OsbHLH46,LOC_Os09g29360    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020184      bhlh46          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 46       OJ1595_D08.4,P0676H02.22,basic helix loop helix 46,OsbHLH046,OsbHLH46,LOC_Os09g29360    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020184      bhlh46          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 46       OJ1595_D08.4|P0676H02.22|basic helix loop helix 46|OsbHLH046|OsbHLH46|LOC_Os09g29360    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020184      bhlh46          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 46       OJ1595_D08.4|P0676H02.22|basic helix loop helix 46|OsbHLH046|OsbHLH46|LOC_Os09g29360    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020184      bhlh46          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 46       OJ1595_D08.4|P0676H02.22|basic helix loop helix 46|OsbHLH046|OsbHLH46|LOC_Os09g29360    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -5650,19 +5650,19 @@ GR_gene GR:0080005      FOR1            GO:0032940      GR_REF:0        IMP             P       floral organ regulator 1        OsF
 GR_gene        GR:0080005      FOR1            GO:0048833      GR_REF:0        IMP             P       floral organ regulator 1        OsFOR1|LOC_Os07g38130   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020185      bhlh47          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 47       basic helix loop helix 47|OsbHLH047|OsbHLH47|OJ1111_H02.23|Putative basic-helix-loop-helix (BHLH)transcription factor|P0419H09.4|LOC_Os08g37730 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020185      bhlh47          GO:0016023      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 47       basic helix loop helix 47|OsbHLH047|OsbHLH47|OJ1111_H02.23|Putative basic-helix-loop-helix (BHLH)transcription factor|P0419H09.4|LOC_Os08g37730 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020185      bhlh47          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 47       basic helix loop helix 47,OsbHLH047,OsbHLH47,OJ1111_H02.23,Putative basic-helix-loop-helix (BHLH)transcription factor,P0419H09.4,LOC_Os08g37730 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020185      bhlh47          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 47       basic helix loop helix 47,OsbHLH047,OsbHLH47,OJ1111_H02.23,Putative basic-helix-loop-helix (BHLH)transcription factor,P0419H09.4,LOC_Os08g37730 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020185      bhlh47          GO:0032940      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 47       basic helix loop helix 47|OsbHLH047|OsbHLH47|OJ1111_H02.23|Putative basic-helix-loop-helix (BHLH)transcription factor|P0419H09.4|LOC_Os08g37730 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020185      bhlh47          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 47       basic helix loop helix 47|OsbHLH047|OsbHLH47|OJ1111_H02.23|Putative basic-helix-loop-helix (BHLH)transcription factor|P0419H09.4|LOC_Os08g37730 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020186      bhlh48          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 48       basic helix loop helix 48|OsbHLH048|OsbHLH48|Hypothetical protein P0471A11.43|P0471A11.43|LOC_Os02g52190        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020186      bhlh48          GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 48       basic helix loop helix 48|OsbHLH048|OsbHLH48|Hypothetical protein P0471A11.43|P0471A11.43|LOC_Os02g52190        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020186      bhlh48          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 48       basic helix loop helix 48,OsbHLH048,OsbHLH48,Hypothetical protein P0471A11.43,P0471A11.43,LOC_Os02g52190        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020186      bhlh48          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 48       basic helix loop helix 48,OsbHLH048,OsbHLH48,Hypothetical protein P0471A11.43,P0471A11.43,LOC_Os02g52190        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020186      bhlh48          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 48       basic helix loop helix 48|OsbHLH048|OsbHLH48|Hypothetical protein P0471A11.43|P0471A11.43|LOC_Os02g52190        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020187      bhlh50          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 50       OSJNBA0086O06.20|OSJNBa0086O06.20 protein|OsbHLH050|OsbHLH50|basic helix loop helix 50|LOC_Os04g50090   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020187      bhlh50          GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 50       OSJNBA0086O06.20|OSJNBa0086O06.20 protein|OsbHLH050|OsbHLH50|basic helix loop helix 50|LOC_Os04g50090   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020187      bhlh50          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 50       OSJNBA0086O06.20,OSJNBa0086O06.20 protein,OsbHLH050,OsbHLH50,basic helix loop helix 50,LOC_Os04g50090   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020187      bhlh50          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 50       OSJNBA0086O06.20,OSJNBa0086O06.20 protein,OsbHLH050,OsbHLH50,basic helix loop helix 50,LOC_Os04g50090   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020187      bhlh50          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 50       OSJNBA0086O06.20|OSJNBa0086O06.20 protein|OsbHLH050|OsbHLH50|basic helix loop helix 50|LOC_Os04g50090   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020188      bhlh49          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 49       basic helix loop helix 49|OsbHLH049|OsbHLH49|Putative basic-helix-loop-helix transcription factor|OJ1148_D05.9|LOC_Os02g46560   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020188      bhlh49          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 49       basic helix loop helix 49,OsbHLH049,OsbHLH49,Putative basic-helix-loop-helix transcription factor,OJ1148_D05.9,LOC_Os02g46560   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020188      bhlh49          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 49       basic helix loop helix 49,OsbHLH049,OsbHLH49,Putative basic-helix-loop-helix transcription factor,OJ1148_D05.9,LOC_Os02g46560   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020188      bhlh49          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 49       basic helix loop helix 49|OsbHLH049|OsbHLH49|Putative basic-helix-loop-helix transcription factor|OJ1148_D05.9|LOC_Os02g46560   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020188      bhlh49          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 49       basic helix loop helix 49|OsbHLH049|OsbHLH49|Putative basic-helix-loop-helix transcription factor|OJ1148_D05.9|LOC_Os02g46560   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020188      bhlh49          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 49       basic helix loop helix 49|OsbHLH049|OsbHLH49|Putative basic-helix-loop-helix transcription factor|OJ1148_D05.9|LOC_Os02g46560   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -5672,11 +5672,11 @@ GR_gene GR:0020189      bhlh51          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 51
 GR_gene        GR:0020189      bhlh51          GO:0005743      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 51       basic helix loop helix 51|OsbHLH051|OsbHLH51|Putative peroxisomal Ca-dependent solute carrier|OSJNBa0009C07.13|LOC_Os05g50900   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020189      bhlh51          GO:0006810      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 51       basic helix loop helix 51|OsbHLH051|OsbHLH51|Putative peroxisomal Ca-dependent solute carrier|OSJNBa0009C07.13|LOC_Os05g50900   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020189      bhlh51          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 51       basic helix loop helix 51|OsbHLH051|OsbHLH51|Putative peroxisomal Ca-dependent solute carrier|OSJNBa0009C07.13|LOC_Os05g50900   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020189      bhlh51          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 51       basic helix loop helix 51,OsbHLH051,OsbHLH51,Putative peroxisomal Ca-dependent solute carrier,OSJNBa0009C07.13,LOC_Os05g50900   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020189      bhlh51          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 51       basic helix loop helix 51,OsbHLH051,OsbHLH51,Putative peroxisomal Ca-dependent solute carrier,OSJNBa0009C07.13,LOC_Os05g50900   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020189      bhlh51          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 51       basic helix loop helix 51|OsbHLH051|OsbHLH51|Putative peroxisomal Ca-dependent solute carrier|OSJNBa0009C07.13|LOC_Os05g50900   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020190      bhlh52          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 52       basic helix loop helix 52|OsbHLH052|OsbHLH52|Hypothetical protein OJ1126B12.2|OJ1126B12.2|LOC_Os03g03000        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020190      bhlh52          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 52       basic helix loop helix 52|OsbHLH052|OsbHLH52|Hypothetical protein OJ1126B12.2|OJ1126B12.2|LOC_Os03g03000        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020190      bhlh52          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 52       basic helix loop helix 52,OsbHLH052,OsbHLH52,Hypothetical protein OJ1126B12.2,OJ1126B12.2,LOC_Os03g03000        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020190      bhlh52          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 52       basic helix loop helix 52,OsbHLH052,OsbHLH52,Hypothetical protein OJ1126B12.2,OJ1126B12.2,LOC_Os03g03000        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020190      bhlh52          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 52       basic helix loop helix 52|OsbHLH052|OsbHLH52|Hypothetical protein OJ1126B12.2|OJ1126B12.2|LOC_Os03g03000        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0080006      RTS             GO:0008565      GR_REF:0        IMP             F       rice tapetum-specific   RTS2|LOC_Os01g70440     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080006      RTS             GO:0016023      GR_REF:0        IMP             C       rice tapetum-specific   RTS2|LOC_Os01g70440     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -5684,7 +5684,7 @@ GR_gene   GR:0080006      RTS             GO:0032940      GR_REF:0        IMP             P       rice tapetum-specific   RTS2|LO
 GR_gene        GR:0080006      RTS             GO:0048656      GR_REF:0        IMP             P       rice tapetum-specific   RTS2|LOC_Os01g70440     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080006      RTS             GO:0048658      GR_REF:0        IMP             P       rice tapetum-specific   RTS2|LOC_Os01g70440     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020191      bhlh53          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 53       P0613F08.25|basic helix loop helix 53|OsbHLH053|OsbHLH53|LOC_Os02g15760 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020191      bhlh53          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 53       P0613F08.25,basic helix loop helix 53,OsbHLH053,OsbHLH53,LOC_Os02g15760 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020191      bhlh53          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 53       P0613F08.25,basic helix loop helix 53,OsbHLH053,OsbHLH53,LOC_Os02g15760 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020191      bhlh53          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 53       P0613F08.25|basic helix loop helix 53|OsbHLH053|OsbHLH53|LOC_Os02g15760 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020191      bhlh53          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 53       P0613F08.25|basic helix loop helix 53|OsbHLH053|OsbHLH53|LOC_Os02g15760 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020191      bhlh53          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 53       P0613F08.25|basic helix loop helix 53|OsbHLH053|OsbHLH53|LOC_Os02g15760 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -5693,23 +5693,23 @@ GR_gene GR:0020192      bhlh54          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 54
 GR_gene        GR:0020192      bhlh54          GO:0004879      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 54       basic helix loop helix 54|OsbHLH054|OsbHLH54|OSJNBa0043B22.14|LOC_Os06g33450    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020192      bhlh54          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 54       basic helix loop helix 54|OsbHLH054|OsbHLH54|OSJNBa0043B22.14|LOC_Os06g33450    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020192      bhlh54          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 54       basic helix loop helix 54|OsbHLH054|OsbHLH54|OSJNBa0043B22.14|LOC_Os06g33450    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020192      bhlh54          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 54       basic helix loop helix 54,OsbHLH054,OsbHLH54,OSJNBa0043B22.14,LOC_Os06g33450    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020192      bhlh54          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 54       basic helix loop helix 54,OsbHLH054,OsbHLH54,OSJNBa0043B22.14,LOC_Os06g33450    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020192      bhlh54          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 54       basic helix loop helix 54|OsbHLH054|OsbHLH54|OSJNBa0043B22.14|LOC_Os06g33450    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080007      UDT1            GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       undeveloped Tapetum1    Udt1|LOC_Os07g36460     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0080007      UDT1            GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     undeveloped Tapetum1    Udt1,LOC_Os07g36460     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0080007      UDT1            GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       undeveloped Tapetum1    Udt1,LOC_Os07g36460     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080007      UDT1            GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       undeveloped Tapetum1    Udt1|LOC_Os07g36460     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080007      UDT1            GO:0048656      GR_REF:0        IMP             P       undeveloped Tapetum1    Udt1|LOC_Os07g36460     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080007      UDT1            GO:0048658      GR_REF:0        IMP             P       undeveloped Tapetum1    Udt1|LOC_Os07g36460     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020193      bhlh55          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 55       basic helix loop helix 55|OsbHLH055|OsbHLH55|Hypothetical protein OSJNBb0086G17.12|OSJNBb0086G17.12|LOC_Os05g51820      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020193      bhlh55          GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 55       basic helix loop helix 55|OsbHLH055|OsbHLH55|Hypothetical protein OSJNBb0086G17.12|OSJNBb0086G17.12|LOC_Os05g51820      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020193      bhlh55          GO:0016068      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 55       basic helix loop helix 55|OsbHLH055|OsbHLH55|Hypothetical protein OSJNBb0086G17.12|OSJNBb0086G17.12|LOC_Os05g51820      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020193      bhlh55          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 55       basic helix loop helix 55,OsbHLH055,OsbHLH55,Hypothetical protein OSJNBb0086G17.12,OSJNBb0086G17.12,LOC_Os05g51820      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020193      bhlh55          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 55       basic helix loop helix 55,OsbHLH055,OsbHLH55,Hypothetical protein OSJNBb0086G17.12,OSJNBb0086G17.12,LOC_Os05g51820      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020193      bhlh55          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 55       basic helix loop helix 55|OsbHLH055|OsbHLH55|Hypothetical protein OSJNBb0086G17.12|OSJNBb0086G17.12|LOC_Os05g51820      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080008      MOC1            GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       Monoculm 1      LOC_Os06g40780  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080008      MOC1            GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       Monoculm 1      LOC_Os06g40780  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080008      MOC1            GO:0007275      GR_REF:0        IMP             P       Monoculm 1      LOC_Os06g40780  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080008      MOC1            GO:0010014      GR_REF:0        IMP             P       Monoculm 1      LOC_Os06g40780  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0080008      MOC1            GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     Monoculm 1      LOC_Os06g40780  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0080008      MOC1            GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       Monoculm 1      LOC_Os06g40780  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080008      MOC1            GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       Monoculm 1      LOC_Os06g40780  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080009      Lsi1            GO:0005215      GR_REF:0        IMP             F       Low silicon rice 1      LOC_Os02g51110  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080009      Lsi1            GO:0005886      GR_REF:0        IMP             C       Low silicon rice 1      LOC_Os02g51110  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -5721,14 +5721,14 @@ GR_gene GR:0080009      Lsi1            GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       Low silicon rice 1      LOC_Os02g
 GR_gene        GR:0080009      Lsi1            GO:0048226      GR_REF:0        IMP             C       Low silicon rice 1      LOC_Os02g51110  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020194      bhlh56          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 56       P0431G06.12|basic helix loop helix 56|OsbHLH056|OsbHLH56|BHLH transcription factor-like|LOC_Os01g72370  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020194      bhlh56          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 56       P0431G06.12|basic helix loop helix 56|OsbHLH056|OsbHLH56|BHLH transcription factor-like|LOC_Os01g72370  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020194      bhlh56          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 56       P0431G06.12,basic helix loop helix 56,OsbHLH056,OsbHLH56,BHLH transcription factor-like,LOC_Os01g72370  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020194      bhlh56          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 56       P0431G06.12,basic helix loop helix 56,OsbHLH056,OsbHLH56,BHLH transcription factor-like,LOC_Os01g72370  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020194      bhlh56          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 56       P0431G06.12|basic helix loop helix 56|OsbHLH056|OsbHLH56|BHLH transcription factor-like|LOC_Os01g72370  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020195      bhlh57          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 57       basic helix loop helix 57|OsbHLH057|OsbHLH57|LOC_Os07g35870     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020195      bhlh57          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 57       basic helix loop helix 57,OsbHLH057,OsbHLH57,LOC_Os07g35870     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020195      bhlh57          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 57       basic helix loop helix 57,OsbHLH057,OsbHLH57,LOC_Os07g35870     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020195      bhlh57          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 57       basic helix loop helix 57|OsbHLH057|OsbHLH57|LOC_Os07g35870     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020196      bhlh58          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 58       basic helix loop helix 58|OsbHLH058|OsbHLH58|OJ1651_D06.8|LOC_Os05g38140        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020196      bhlh58          GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 58       basic helix loop helix 58|OsbHLH058|OsbHLH58|OJ1651_D06.8|LOC_Os05g38140        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020196      bhlh58          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 58       basic helix loop helix 58,OsbHLH058,OsbHLH58,OJ1651_D06.8,LOC_Os05g38140        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020196      bhlh58          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 58       basic helix loop helix 58,OsbHLH058,OsbHLH58,OJ1651_D06.8,LOC_Os05g38140        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020196      bhlh58          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 58       basic helix loop helix 58|OsbHLH058|OsbHLH58|OJ1651_D06.8|LOC_Os05g38140        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0800010      AID1            GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       Anther Indehiscence1    OsAID1|LOC_Os06g08290   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0800010      AID1            GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       Anther Indehiscence1    OsAID1|LOC_Os06g08290   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -5743,14 +5743,14 @@ GR_gene GR:0800010      AID1            GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       Anther Indehiscence1    OsAID1|
 GR_gene        GR:0800010      AID1            GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       Anther Indehiscence1    OsAID1|LOC_Os06g08290   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0800010      AID1            GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       Anther Indehiscence1    OsAID1|LOC_Os06g08290   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020197      bhlh59          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 59       basic helix loop helix 59|OsbHLH059|OsbHLH59|OJ1442_E05.19|LOC_Os02g02480       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020197      bhlh59          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 59       basic helix loop helix 59,OsbHLH059,OsbHLH59,OJ1442_E05.19,LOC_Os02g02480       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020197      bhlh59          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 59       basic helix loop helix 59,OsbHLH059,OsbHLH59,OJ1442_E05.19,LOC_Os02g02480       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020197      bhlh59          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 59       basic helix loop helix 59|OsbHLH059|OsbHLH59|OJ1442_E05.19|LOC_Os02g02480       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020198      bhlh60          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 60       basic helix loop helix 60|OsbHLH060|OsbHLH60|OJ1119_D01.9|LOC_Os08g04390        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020198      bhlh60          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 60       basic helix loop helix 60,OsbHLH060,OsbHLH60,OJ1119_D01.9,LOC_Os08g04390        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020198      bhlh60          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 60       basic helix loop helix 60,OsbHLH060,OsbHLH60,OJ1119_D01.9,LOC_Os08g04390        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020198      bhlh60          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 60       basic helix loop helix 60|OsbHLH060|OsbHLH60|OJ1119_D01.9|LOC_Os08g04390        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020199      bhlh61          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 61       basic helix loop helix 61|OsbHLH061|OsbHLH61|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|expressed|LOC_Os11g38870    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020199      bhlh61          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 61       basic helix loop helix 61|OsbHLH061|OsbHLH61|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|expressed|LOC_Os11g38870    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020199      bhlh61          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 61       basic helix loop helix 61,OsbHLH061,OsbHLH61,Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein,expressed,LOC_Os11g38870    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020199      bhlh61          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 61       basic helix loop helix 61,OsbHLH061,OsbHLH61,Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein,expressed,LOC_Os11g38870    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020199      bhlh61          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 61       basic helix loop helix 61|OsbHLH061|OsbHLH61|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|expressed|LOC_Os11g38870    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080011      nop             GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       no pollen       Osnop|LOC_Os06g40570    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080011      nop             GO:0006955      GR_REF:0        IMP             P       no pollen       Osnop|LOC_Os06g40570    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -5760,20 +5760,20 @@ GR_gene GR:0080011      nop             GO:0019722      GR_REF:0        IMP             P       no pollen       Osnop|LOC_Os06g4057
 GR_gene        GR:0080011      nop             GO:0019882      GR_REF:0        IMP             P       no pollen       Osnop|LOC_Os06g40570    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080011      nop             GO:0048015      GR_REF:0        IMP             P       no pollen       Osnop|LOC_Os06g40570    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020200      bhlh62          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 62       basic helix loop helix 62|OsbHLH062|OsbHLH62|Amelogenin-like protein|P0011H09.105|P0506F02.119|LOC_Os07g43530   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020200      bhlh62          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 62       basic helix loop helix 62,OsbHLH062,OsbHLH62,Amelogenin-like protein,P0011H09.105,P0506F02.119,LOC_Os07g43530   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020200      bhlh62          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 62       basic helix loop helix 62,OsbHLH062,OsbHLH62,Amelogenin-like protein,P0011H09.105,P0506F02.119,LOC_Os07g43530   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020200      bhlh62          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 62       basic helix loop helix 62|OsbHLH062|OsbHLH62|Amelogenin-like protein|P0011H09.105|P0506F02.119|LOC_Os07g43530   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080012      TB1             GO:0007049      GR_REF:0        IMP             P       TEOSINTE BRANCHED 1     OsTB1|Fine culm 1|fc1|LOC_Os03g49880    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0080012      TB1             GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     TEOSINTE BRANCHED 1     OsTB1,Fine culm 1,fc1,LOC_Os03g49880    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0080012      TB1             GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       TEOSINTE BRANCHED 1     OsTB1,Fine culm 1,fc1,LOC_Os03g49880    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080012      TB1             GO:0048831      GR_REF:0        IMP             P       TEOSINTE BRANCHED 1     OsTB1|Fine culm 1|fc1|LOC_Os03g49880    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020201      bhlh63          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 63       basic helix loop helix 63|OsbHLH063|OsbHLH63|Putative amelogenin|OSJNBA0013O08.3|LOC_Os03g26210 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020201      bhlh63          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 63       basic helix loop helix 63|OsbHLH063|OsbHLH63|Putative amelogenin|OSJNBA0013O08.3|LOC_Os03g26210 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020201      bhlh63          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 63       basic helix loop helix 63,OsbHLH063,OsbHLH63,Putative amelogenin,OSJNBA0013O08.3,LOC_Os03g26210 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020201      bhlh63          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 63       basic helix loop helix 63,OsbHLH063,OsbHLH63,Putative amelogenin,OSJNBA0013O08.3,LOC_Os03g26210 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020201      bhlh63          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 63       basic helix loop helix 63|OsbHLH063|OsbHLH63|Putative amelogenin|OSJNBA0013O08.3|LOC_Os03g26210 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020202      bhlh64          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 64       basic helix loop helix 64|OsbHLH064|OsbHLH64|OSJNBa0065F08.2|Basic helix-loop-helix-like protein|LOC_Os02g23823 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020202      bhlh64          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 64       basic helix loop helix 64,OsbHLH064,OsbHLH64,OSJNBa0065F08.2,Basic helix-loop-helix-like protein,LOC_Os02g23823 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020202      bhlh64          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 64       basic helix loop helix 64,OsbHLH064,OsbHLH64,OSJNBa0065F08.2,Basic helix-loop-helix-like protein,LOC_Os02g23823 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020202      bhlh64          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 64       basic helix loop helix 64|OsbHLH064|OsbHLH64|OSJNBa0065F08.2|Basic helix-loop-helix-like protein|LOC_Os02g23823 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020203      bhlh65          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 65       basic helix loop helix 65|OsbHLH065|OsbHLH65|OJ990528_30.12|OJ990528_30.12 protein|OSJNBb0091E11.4 protein|LOC_Os04g41570       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020203      bhlh65          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 65       basic helix loop helix 65,OsbHLH065,OsbHLH65,OJ990528_30.12,OJ990528_30.12 protein,OSJNBb0091E11.4 protein,LOC_Os04g41570       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020203      bhlh65          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 65       basic helix loop helix 65,OsbHLH065,OsbHLH65,OJ990528_30.12,OJ990528_30.12 protein,OSJNBb0091E11.4 protein,LOC_Os04g41570       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020203      bhlh65          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 65       basic helix loop helix 65|OsbHLH065|OsbHLH65|OJ990528_30.12|OJ990528_30.12 protein|OSJNBb0091E11.4 protein|LOC_Os04g41570       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080013      PNH1            GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       PINHEAD1        OsPNH1|LOC_Os06g39640   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080013      PNH1            GO:0003743      GR_REF:0        IMP             F       PINHEAD1        OsPNH1|LOC_Os06g39640   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -5792,50 +5792,50 @@ GR_gene GR:0080014      YAB1            GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       YABBY1  OsYAB1|LOC_Os07g06620
 GR_gene        GR:0080014      YAB1            GO:0048833      GR_REF:0        IMP             P       YABBY1  OsYAB1|LOC_Os07g06620   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020204      bhlh66          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 66       Putative ethylene-responsive protein|basic helix loop helix 66|OsbHLH066|OsbHLH66|LOC_Os03g55220        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020204      bhlh66          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 66       Putative ethylene-responsive protein|basic helix loop helix 66|OsbHLH066|OsbHLH66|LOC_Os03g55220        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020204      bhlh66          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 66       Putative ethylene-responsive protein,basic helix loop helix 66,OsbHLH066,OsbHLH66,LOC_Os03g55220        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020204      bhlh66          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 66       Putative ethylene-responsive protein,basic helix loop helix 66,OsbHLH066,OsbHLH66,LOC_Os03g55220        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020204      bhlh66          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 66       Putative ethylene-responsive protein|basic helix loop helix 66|OsbHLH066|OsbHLH66|LOC_Os03g55220        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020204      bhlh66          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 66       Putative ethylene-responsive protein|basic helix loop helix 66|OsbHLH066|OsbHLH66|LOC_Os03g55220        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020204      bhlh66          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 66       Putative ethylene-responsive protein|basic helix loop helix 66|OsbHLH066|OsbHLH66|LOC_Os03g55220        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020204      bhlh66          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 66       Putative ethylene-responsive protein|basic helix loop helix 66|OsbHLH066|OsbHLH66|LOC_Os03g55220        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020205      bhlh67          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 67       Hypothetical protein OSJNBa0017K09.4|OSJNBa0017K09.4|basic helix loop helix 67|OsbHLH067|OsbHLH67|LOC_Os05g42180        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020205      bhlh67          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 67       Hypothetical protein OSJNBa0017K09.4,OSJNBa0017K09.4,basic helix loop helix 67,OsbHLH067,OsbHLH67,LOC_Os05g42180        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020205      bhlh67          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 67       Hypothetical protein OSJNBa0017K09.4,OSJNBa0017K09.4,basic helix loop helix 67,OsbHLH067,OsbHLH67,LOC_Os05g42180        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020205      bhlh67          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 67       Hypothetical protein OSJNBa0017K09.4|OSJNBa0017K09.4|basic helix loop helix 67|OsbHLH067|OsbHLH67|LOC_Os05g42180        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020205      bhlh67          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 67       Hypothetical protein OSJNBa0017K09.4|OSJNBa0017K09.4|basic helix loop helix 67|OsbHLH067|OsbHLH67|LOC_Os05g42180        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020205      bhlh67          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 67       Hypothetical protein OSJNBa0017K09.4|OSJNBa0017K09.4|basic helix loop helix 67|OsbHLH067|OsbHLH67|LOC_Os05g42180        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020205      bhlh67          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 67       Hypothetical protein OSJNBa0017K09.4|OSJNBa0017K09.4|basic helix loop helix 67|OsbHLH067|OsbHLH67|LOC_Os05g42180        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020206      bhlh68          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 68       OSJNBb0015D13.17|OSJNBb0015D13.17 protein|basic helix loop helix 68|OsbHLH068|OsbHLH68|LOC_Os04g53990   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020206      bhlh68          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 68       OSJNBb0015D13.17,OSJNBb0015D13.17 protein,basic helix loop helix 68,OsbHLH068,OsbHLH68,LOC_Os04g53990   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020206      bhlh68          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 68       OSJNBb0015D13.17,OSJNBb0015D13.17 protein,basic helix loop helix 68,OsbHLH068,OsbHLH68,LOC_Os04g53990   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020206      bhlh68          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 68       OSJNBb0015D13.17|OSJNBb0015D13.17 protein|basic helix loop helix 68|OsbHLH068|OsbHLH68|LOC_Os04g53990   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020207      bhlh68          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 68       basic helix loop helix 68|OsbHLH068|OsbHLH68|LOC_Os01g57580     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020207      bhlh68          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 68       basic helix loop helix 68|OsbHLH068|OsbHLH68|LOC_Os01g57580     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020207      bhlh68          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 68       basic helix loop helix 68|OsbHLH068|OsbHLH68|LOC_Os01g57580     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020207      bhlh68          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 68       basic helix loop helix 68,OsbHLH068,OsbHLH68,LOC_Os01g57580     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020207      bhlh68          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 68       basic helix loop helix 68,OsbHLH068,OsbHLH68,LOC_Os01g57580     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020207      bhlh68          GO:0045028      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 68       basic helix loop helix 68|OsbHLH068|OsbHLH68|LOC_Os01g57580     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020207      bhlh68          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 68       basic helix loop helix 68|OsbHLH068|OsbHLH68|LOC_Os01g57580     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020208      bhlh70          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 70       basic helix loop helix 70|OsbHLH070|OsbHLH70|LOC_Os08g08160     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020208      bhlh70          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 70       basic helix loop helix 70,OsbHLH070,OsbHLH70,LOC_Os08g08160     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020208      bhlh70          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 70       basic helix loop helix 70,OsbHLH070,OsbHLH70,LOC_Os08g08160     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020208      bhlh70          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 70       basic helix loop helix 70|OsbHLH070|OsbHLH70|LOC_Os08g08160     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020209      bhlh71          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 71       P0005A05.10|Putative ethylene-responsive protein|basic helix loop helix 71|OsbHLH071|OsbHLH71|LOC_Os01g01600    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020209      bhlh71          GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 71       P0005A05.10|Putative ethylene-responsive protein|basic helix loop helix 71|OsbHLH071|OsbHLH71|LOC_Os01g01600    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020209      bhlh71          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 71       P0005A05.10,Putative ethylene-responsive protein,basic helix loop helix 71,OsbHLH071,OsbHLH71,LOC_Os01g01600    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020209      bhlh71          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 71       P0005A05.10,Putative ethylene-responsive protein,basic helix loop helix 71,OsbHLH071,OsbHLH71,LOC_Os01g01600    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020209      bhlh71          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 71       P0005A05.10|Putative ethylene-responsive protein|basic helix loop helix 71|OsbHLH071|OsbHLH71|LOC_Os01g01600    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020210      bhlh72          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 72       Ethylene-responsive family protein-like|OSJNBa0055M07.9|basic helix loop helix 72|OsbHLH072|OsbHLH72|LOC_Os02g17680     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020210      bhlh72          GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 72       Ethylene-responsive family protein-like|OSJNBa0055M07.9|basic helix loop helix 72|OsbHLH072|OsbHLH72|LOC_Os02g17680     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020210      bhlh72          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 72       Ethylene-responsive family protein-like,OSJNBa0055M07.9,basic helix loop helix 72,OsbHLH072,OsbHLH72,LOC_Os02g17680     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020210      bhlh72          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 72       Ethylene-responsive family protein-like,OSJNBa0055M07.9,basic helix loop helix 72,OsbHLH072,OsbHLH72,LOC_Os02g17680     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020210      bhlh72          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 72       Ethylene-responsive family protein-like|OSJNBa0055M07.9|basic helix loop helix 72|OsbHLH072|OsbHLH72|LOC_Os02g17680     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020211      bhlh73          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 73       basic helix loop helix 73|OsbHLH073|OsbHLH73|Hypothetical protein P0499F10.3|LOC_Os05g14010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020211      bhlh73          GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 73       basic helix loop helix 73|OsbHLH073|OsbHLH73|Hypothetical protein P0499F10.3|LOC_Os05g14010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020211      bhlh73          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 73       basic helix loop helix 73,OsbHLH073,OsbHLH73,Hypothetical protein P0499F10.3,LOC_Os05g14010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020211      bhlh73          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 73       basic helix loop helix 73,OsbHLH073,OsbHLH73,Hypothetical protein P0499F10.3,LOC_Os05g14010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020211      bhlh73          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 73       basic helix loop helix 73|OsbHLH073|OsbHLH73|Hypothetical protein P0499F10.3|LOC_Os05g14010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020211      bhlh73          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 73       basic helix loop helix 73|OsbHLH073|OsbHLH73|Hypothetical protein P0499F10.3|LOC_Os05g14010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020211      bhlh73          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 73       basic helix loop helix 73|OsbHLH073|OsbHLH73|Hypothetical protein P0499F10.3|LOC_Os05g14010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020211      bhlh73          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 73       basic helix loop helix 73|OsbHLH073|OsbHLH73|Hypothetical protein P0499F10.3|LOC_Os05g14010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020212      bhlh74          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 74       basic helix loop helix 74|OsbHLH074|OsbHLH74|Hypothetical protein P0485D09.22|Hypothetical protein P0431F01.5|P0431F01.5|P0485D09.22|LOC_Os01g13000     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020212      bhlh74          GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 74       basic helix loop helix 74|OsbHLH074|OsbHLH74|Hypothetical protein P0485D09.22|Hypothetical protein P0431F01.5|P0431F01.5|P0485D09.22|LOC_Os01g13000     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020212      bhlh74          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 74       basic helix loop helix 74,OsbHLH074,OsbHLH74,Hypothetical protein P0485D09.22,Hypothetical protein P0431F01.5,P0431F01.5,P0485D09.22,LOC_Os01g13000     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020212      bhlh74          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 74       basic helix loop helix 74,OsbHLH074,OsbHLH74,Hypothetical protein P0485D09.22,Hypothetical protein P0431F01.5,P0431F01.5,P0485D09.22,LOC_Os01g13000     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020212      bhlh74          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 74       basic helix loop helix 74|OsbHLH074|OsbHLH74|Hypothetical protein P0485D09.22|Hypothetical protein P0431F01.5|P0431F01.5|P0485D09.22|LOC_Os01g13000     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020213      bhlh75          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 75       basic helix loop helix 75|OsbHLH075|OsbHLH75|OSJNBa0017B10.16 protein|OSJNBA0017B10.16|LOC_Os04g47810   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020213      bhlh75          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 75       basic helix loop helix 75,OsbHLH075,OsbHLH75,OSJNBa0017B10.16 protein,OSJNBA0017B10.16,LOC_Os04g47810   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020213      bhlh75          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 75       basic helix loop helix 75,OsbHLH075,OsbHLH75,OSJNBa0017B10.16 protein,OSJNBA0017B10.16,LOC_Os04g47810   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020213      bhlh75          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 75       basic helix loop helix 75|OsbHLH075|OsbHLH75|OSJNBa0017B10.16 protein|OSJNBA0017B10.16|LOC_Os04g47810   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080015      MADS1           GO:0001708      GR_REF:0        IMP             P       MADS1   OsMADS1|lhs1|nsr|naked seed rice|leafy hull sterile 1|LOC_Os03g11614    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080015      MADS1           GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       MADS1   OsMADS1|lhs1|nsr|naked seed rice|leafy hull sterile 1|LOC_Os03g11614    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -5854,7 +5854,7 @@ GR_gene   GR:0080015      MADS1           GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       MADS1   OsMADS1|lhs1|nsr|nake
 GR_gene        GR:0080015      MADS1           GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       MADS1   OsMADS1|lhs1|nsr|naked seed rice|leafy hull sterile 1|LOC_Os03g11614    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080015      MADS1           GO:0045595      GR_REF:0        IMP             P       MADS1   OsMADS1|lhs1|nsr|naked seed rice|leafy hull sterile 1|LOC_Os03g11614    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020214      bhlh76          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 76       basic helix loop helix 76|OsbHLH076|OsbHLH76|LOC_Os02g45010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020214      bhlh76          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 76       basic helix loop helix 76,OsbHLH076,OsbHLH76,LOC_Os02g45010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020214      bhlh76          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 76       basic helix loop helix 76,OsbHLH076,OsbHLH76,LOC_Os02g45010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020214      bhlh76          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 76       basic helix loop helix 76|OsbHLH076|OsbHLH76|LOC_Os02g45010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020214      bhlh76          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 76       basic helix loop helix 76|OsbHLH076|OsbHLH76|LOC_Os02g45010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020214      bhlh76          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 76       basic helix loop helix 76|OsbHLH076|OsbHLH76|LOC_Os02g45010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -5863,153 +5863,153 @@ GR_gene       GR:0020215      bhlh77          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 77
 GR_gene        GR:0020215      bhlh77          GO:0004879      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 77       basic helix loop helix 77|OsbHLH077|OsbHLH77|BHLH transcription factor-like protein|OJ1103_E04.27|P0675B10.17|P0675B10.17 protein|LOC_Os07g28890        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020215      bhlh77          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 77       basic helix loop helix 77|OsbHLH077|OsbHLH77|BHLH transcription factor-like protein|OJ1103_E04.27|P0675B10.17|P0675B10.17 protein|LOC_Os07g28890        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020215      bhlh77          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 77       basic helix loop helix 77|OsbHLH077|OsbHLH77|BHLH transcription factor-like protein|OJ1103_E04.27|P0675B10.17|P0675B10.17 protein|LOC_Os07g28890        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020215      bhlh77          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 77       basic helix loop helix 77,OsbHLH077,OsbHLH77,BHLH transcription factor-like protein,OJ1103_E04.27,P0675B10.17,P0675B10.17 protein,LOC_Os07g28890        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020215      bhlh77          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 77       basic helix loop helix 77,OsbHLH077,OsbHLH77,BHLH transcription factor-like protein,OJ1103_E04.27,P0675B10.17,P0675B10.17 protein,LOC_Os07g28890        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020215      bhlh77          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 77       basic helix loop helix 77|OsbHLH077|OsbHLH77|BHLH transcription factor-like protein|OJ1103_E04.27|P0675B10.17|P0675B10.17 protein|LOC_Os07g28890        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020216      bhlh78          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 78       basic helix loop helix 78|OsbHLH078|OsbHLH78|LOC_Os03g17130     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020216      bhlh78          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 78       basic helix loop helix 78,OsbHLH078,OsbHLH78,LOC_Os03g17130     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020216      bhlh78          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 78       basic helix loop helix 78,OsbHLH078,OsbHLH78,LOC_Os03g17130     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020216      bhlh78          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 78       basic helix loop helix 78|OsbHLH078|OsbHLH78|LOC_Os03g17130     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020217      bhlh79          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 79       basic helix loop helix 79|OsbHLH079|OsbHLH79|Putative bHLH transcription factor|P0680A05.9|LOC_Os02g47660       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020217      bhlh79          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 79       basic helix loop helix 79,OsbHLH079,OsbHLH79,Putative bHLH transcription factor,P0680A05.9,LOC_Os02g47660       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020217      bhlh79          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 79       basic helix loop helix 79,OsbHLH079,OsbHLH79,Putative bHLH transcription factor,P0680A05.9,LOC_Os02g47660       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020217      bhlh79          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 79       basic helix loop helix 79|OsbHLH079|OsbHLH79|Putative bHLH transcription factor|P0680A05.9|LOC_Os02g47660       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020218      bhlh80          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 80       basic helix loop helix 80|OsbHLH080|OsbHLH80|BHLH transcription factor-like protein|P0665C04.20|OSJNBa0033D24.39|LOC_Os08g42470 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020218      bhlh80          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 80       basic helix loop helix 80,OsbHLH080,OsbHLH80,BHLH transcription factor-like protein,P0665C04.20,OSJNBa0033D24.39,LOC_Os08g42470 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020218      bhlh80          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 80       basic helix loop helix 80,OsbHLH080,OsbHLH80,BHLH transcription factor-like protein,P0665C04.20,OSJNBa0033D24.39,LOC_Os08g42470 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020218      bhlh80          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 80       basic helix loop helix 80|OsbHLH080|OsbHLH80|BHLH transcription factor-like protein|P0665C04.20|OSJNBa0033D24.39|LOC_Os08g42470 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020218      bhlh80          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 80       basic helix loop helix 80|OsbHLH080|OsbHLH80|BHLH transcription factor-like protein|P0665C04.20|OSJNBa0033D24.39|LOC_Os08g42470 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020218      bhlh80          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 80       basic helix loop helix 80|OsbHLH080|OsbHLH80|BHLH transcription factor-like protein|P0665C04.20|OSJNBa0033D24.39|LOC_Os08g42470 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020218      bhlh80          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 80       basic helix loop helix 80|OsbHLH080|OsbHLH80|BHLH transcription factor-like protein|P0665C04.20|OSJNBa0033D24.39|LOC_Os08g42470 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020219      bhlh81          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 81       basic helix loop helix 81|OsbHLH081|OsbHLH81|LOC_Os09g33580     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020219      bhlh81          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 81       basic helix loop helix 81,OsbHLH081,OsbHLH81,LOC_Os09g33580     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020219      bhlh81          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 81       basic helix loop helix 81,OsbHLH081,OsbHLH81,LOC_Os09g33580     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020219      bhlh81          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 81       basic helix loop helix 81|OsbHLH081|OsbHLH81|LOC_Os09g33580     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020220      bhlh82          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 82       basic helix loop helix 82|OsbHLH082|OsbHLH82    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020220      bhlh82          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 82       basic helix loop helix 82,OsbHLH082,OsbHLH82    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020220      bhlh82          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 82       basic helix loop helix 82,OsbHLH082,OsbHLH82    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020220      bhlh82          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 82       basic helix loop helix 82|OsbHLH082|OsbHLH82    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020221      bhlh83          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 83       basic helix loop helix 83|OsbHLH083|OsbHLH83|Hypothetical protein P0668H12.5|P0668H12.5|LOC_Os05g01256  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020221      bhlh83          GO:0005783      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 83       basic helix loop helix 83|OsbHLH083|OsbHLH83|Hypothetical protein P0668H12.5|P0668H12.5|LOC_Os05g01256  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020221      bhlh83          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 83       basic helix loop helix 83|OsbHLH083|OsbHLH83|Hypothetical protein P0668H12.5|P0668H12.5|LOC_Os05g01256  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020221      bhlh83          GO:0016023      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 83       basic helix loop helix 83|OsbHLH083|OsbHLH83|Hypothetical protein P0668H12.5|P0668H12.5|LOC_Os05g01256  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020221      bhlh83          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 83       basic helix loop helix 83,OsbHLH083,OsbHLH83,Hypothetical protein P0668H12.5,P0668H12.5,LOC_Os05g01256  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020221      bhlh83          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 83       basic helix loop helix 83,OsbHLH083,OsbHLH83,Hypothetical protein P0668H12.5,P0668H12.5,LOC_Os05g01256  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020221      bhlh83          GO:0032940      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 83       basic helix loop helix 83|OsbHLH083|OsbHLH83|Hypothetical protein P0668H12.5|P0668H12.5|LOC_Os05g01256  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020221      bhlh83          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 83       basic helix loop helix 83|OsbHLH083|OsbHLH83|Hypothetical protein P0668H12.5|P0668H12.5|LOC_Os05g01256  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020222      bhlh84          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 84       basic helix loop helix 84|OsbHLH084|OsbHLH84|OSJNBB0011H13.2|LOC_Os03g51910     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020222      bhlh84          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 84       basic helix loop helix 84|OsbHLH084|OsbHLH84|OSJNBB0011H13.2|LOC_Os03g51910     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020222      bhlh84          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 84       basic helix loop helix 84,OsbHLH084,OsbHLH84,OSJNBB0011H13.2,LOC_Os03g51910     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020222      bhlh84          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 84       basic helix loop helix 84,OsbHLH084,OsbHLH84,OSJNBB0011H13.2,LOC_Os03g51910     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020222      bhlh84          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 84       basic helix loop helix 84|OsbHLH084|OsbHLH84|OSJNBB0011H13.2|LOC_Os03g51910     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020223      bhlh85          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 85       basic helix loop helix 85|OsbHLH085|OsbHLH85|TA1 protein-like|OSJNBa0026C08.22|LOC_Os09g29830   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020223      bhlh85          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 85       basic helix loop helix 85,OsbHLH085,OsbHLH85,TA1 protein-like,OSJNBa0026C08.22,LOC_Os09g29830   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020223      bhlh85          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 85       basic helix loop helix 85,OsbHLH085,OsbHLH85,TA1 protein-like,OSJNBa0026C08.22,LOC_Os09g29830   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020223      bhlh85          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 85       basic helix loop helix 85|OsbHLH085|OsbHLH85|TA1 protein-like|OSJNBa0026C08.22|LOC_Os09g29830   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020224      bhlh86          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 86       basic helix loop helix 86|OsbHLH086|OsbHLH86|P0038C05.31-|Putative TA1 protein|LOC_Os06g16400   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020224      bhlh86          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 86       basic helix loop helix 86,OsbHLH086,OsbHLH86,P0038C05.31-,Putative TA1 protein,LOC_Os06g16400   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020224      bhlh86          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 86       basic helix loop helix 86,OsbHLH086,OsbHLH86,P0038C05.31-,Putative TA1 protein,LOC_Os06g16400   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020224      bhlh86          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 86       basic helix loop helix 86|OsbHLH086|OsbHLH86|P0038C05.31-|Putative TA1 protein|LOC_Os06g16400   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020225      bhlh87          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 87       basic helix loop helix 87|OsbHLH087|OsbHLH87|P0028A08.20|LOC_Os08g38080 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020225      bhlh87          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 87       basic helix loop helix 87,OsbHLH087,OsbHLH87,P0028A08.20,LOC_Os08g38080 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020225      bhlh87          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 87       basic helix loop helix 87,OsbHLH087,OsbHLH87,P0028A08.20,LOC_Os08g38080 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020225      bhlh87          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 87       basic helix loop helix 87|OsbHLH087|OsbHLH87|P0028A08.20|LOC_Os08g38080 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020226      bhlh88          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 88       basic helix loop helix 88|OsbHLH088|OsbHLH88|OJ1017C11.10|Hypothetical protein OJ1017C11.10|LOC_Os03g12940      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020226      bhlh88          GO:0004252      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 88       basic helix loop helix 88|OsbHLH088|OsbHLH88|OJ1017C11.10|Hypothetical protein OJ1017C11.10|LOC_Os03g12940      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020226      bhlh88          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 88       basic helix loop helix 88|OsbHLH088|OsbHLH88|OJ1017C11.10|Hypothetical protein OJ1017C11.10|LOC_Os03g12940      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020226      bhlh88          GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 88       basic helix loop helix 88|OsbHLH088|OsbHLH88|OJ1017C11.10|Hypothetical protein OJ1017C11.10|LOC_Os03g12940      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020226      bhlh88          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 88       basic helix loop helix 88|OsbHLH088|OsbHLH88|OJ1017C11.10|Hypothetical protein OJ1017C11.10|LOC_Os03g12940      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020226      bhlh88          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 88       basic helix loop helix 88,OsbHLH088,OsbHLH88,OJ1017C11.10,Hypothetical protein OJ1017C11.10,LOC_Os03g12940      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020226      bhlh88          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 88       basic helix loop helix 88,OsbHLH088,OsbHLH88,OJ1017C11.10,Hypothetical protein OJ1017C11.10,LOC_Os03g12940      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020226      bhlh88          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 88       basic helix loop helix 88|OsbHLH088|OsbHLH88|OJ1017C11.10|Hypothetical protein OJ1017C11.10|LOC_Os03g12940      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020227      bhlh89          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 89       basic helix loop helix 89|OsbHLH089|OsbHLH89|Hypothetical protein OSJNBa0087C10.10|OSJNBA0087C10.10|LOC_Os03g58830      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020227      bhlh89          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 89       basic helix loop helix 89,OsbHLH089,OsbHLH89,Hypothetical protein OSJNBa0087C10.10,OSJNBA0087C10.10,LOC_Os03g58830      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020227      bhlh89          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 89       basic helix loop helix 89,OsbHLH089,OsbHLH89,Hypothetical protein OSJNBa0087C10.10,OSJNBA0087C10.10,LOC_Os03g58830      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020227      bhlh89          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 89       basic helix loop helix 89|OsbHLH089|OsbHLH89|Hypothetical protein OSJNBa0087C10.10|OSJNBA0087C10.10|LOC_Os03g58830      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020228      bhlh90          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 90       basic helix loop helix 90|OsbHLH090|OsbHLH90|P0004D12.24|LOC_Os01g68700 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020228      bhlh90          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 90       basic helix loop helix 90,OsbHLH090,OsbHLH90,P0004D12.24,LOC_Os01g68700 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020228      bhlh90          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 90       basic helix loop helix 90,OsbHLH090,OsbHLH90,P0004D12.24,LOC_Os01g68700 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020228      bhlh90          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 90       basic helix loop helix 90|OsbHLH090|OsbHLH90|P0004D12.24|LOC_Os01g68700 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020229      bhlh91          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 91       basic helix loop helix 91|OsbHLH091|OsbHLH91|BHLH transcription factor(GBOF-1)-like|OJ1191_A10.7|LOC_Os08g41320 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020229      bhlh91          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 91       basic helix loop helix 91,OsbHLH091,OsbHLH91,BHLH transcription factor(GBOF-1)-like,OJ1191_A10.7,LOC_Os08g41320 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020229      bhlh91          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 91       basic helix loop helix 91,OsbHLH091,OsbHLH91,BHLH transcription factor(GBOF-1)-like,OJ1191_A10.7,LOC_Os08g41320 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020229      bhlh91          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 91       basic helix loop helix 91|OsbHLH091|OsbHLH91|BHLH transcription factor(GBOF-1)-like|OJ1191_A10.7|LOC_Os08g41320 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020229      bhlh91          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 91       basic helix loop helix 91|OsbHLH091|OsbHLH91|BHLH transcription factor(GBOF-1)-like|OJ1191_A10.7|LOC_Os08g41320 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020229      bhlh91          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 91       basic helix loop helix 91|OsbHLH091|OsbHLH91|BHLH transcription factor(GBOF-1)-like|OJ1191_A10.7|LOC_Os08g41320 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020229      bhlh91          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 91       basic helix loop helix 91|OsbHLH091|OsbHLH91|BHLH transcription factor(GBOF-1)-like|OJ1191_A10.7|LOC_Os08g41320 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020230      bhlh92          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 92       basic helix loop helix 92|OsbHLH092|OsbHLH92|LOC_Os09g32510     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020230      bhlh92          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 92       basic helix loop helix 92,OsbHLH092,OsbHLH92,LOC_Os09g32510     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020230      bhlh92          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 92       basic helix loop helix 92,OsbHLH092,OsbHLH92,LOC_Os09g32510     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020230      bhlh92          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 92       basic helix loop helix 92|OsbHLH092|OsbHLH92|LOC_Os09g32510     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020231      bhlh93          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 93       basic helix loop helix 93|OsbHLH093|OsbHLH93|OSJNBA0038P21.14|LOC_Os04g28280    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020231      bhlh93          GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 93       basic helix loop helix 93|OsbHLH093|OsbHLH93|OSJNBA0038P21.14|LOC_Os04g28280    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020231      bhlh93          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 93       basic helix loop helix 93,OsbHLH093,OsbHLH93,OSJNBA0038P21.14,LOC_Os04g28280    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020231      bhlh93          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 93       basic helix loop helix 93,OsbHLH093,OsbHLH93,OSJNBA0038P21.14,LOC_Os04g28280    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020231      bhlh93          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 93       basic helix loop helix 93|OsbHLH093|OsbHLH93|OSJNBA0038P21.14|LOC_Os04g28280    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020232      bhlh94          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 94       basic helix loop helix 94|OsbHLH094|OsbHLH94|LOC_Os07g09590     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020232      bhlh94          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 94       basic helix loop helix 94,OsbHLH094,OsbHLH94,LOC_Os07g09590     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020232      bhlh94          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 94       basic helix loop helix 94,OsbHLH094,OsbHLH94,LOC_Os07g09590     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020232      bhlh94          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 94       basic helix loop helix 94|OsbHLH094|OsbHLH94|LOC_Os07g09590     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020233      bhlh95          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 95       basic helix loop helix 95|OsbHLH095|OsbHLH95|P0417G12.19|P0429G06.36|LOC_Os06g41060     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020233      bhlh95          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 95       basic helix loop helix 95,OsbHLH095,OsbHLH95,P0417G12.19,P0429G06.36,LOC_Os06g41060     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020233      bhlh95          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 95       basic helix loop helix 95,OsbHLH095,OsbHLH95,P0417G12.19,P0429G06.36,LOC_Os06g41060     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020233      bhlh95          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 95       basic helix loop helix 95|OsbHLH095|OsbHLH95|P0417G12.19|P0429G06.36|LOC_Os06g41060     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020234      bhlh96          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 96       Putative bHLH transcription factor PTF1|basic helix loop helix 96|OsbHLH096|OsbHLH96|P0698A06.26-2|LOC_Os06g09370       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020234      bhlh96          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 96       Putative bHLH transcription factor PTF1,basic helix loop helix 96,OsbHLH096,OsbHLH96,P0698A06.26-2,LOC_Os06g09370       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020234      bhlh96          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 96       Putative bHLH transcription factor PTF1,basic helix loop helix 96,OsbHLH096,OsbHLH96,P0698A06.26-2,LOC_Os06g09370       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020234      bhlh96          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 96       Putative bHLH transcription factor PTF1|basic helix loop helix 96|OsbHLH096|OsbHLH96|P0698A06.26-2|LOC_Os06g09370       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020235      bhlh97          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 97       basic helix loop helix 97|OsbHLH097|OsbHLH97|P0020C11.18|Putative bHLH transcription factor PTF1|LOC_Os02g35660 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020235      bhlh97          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 97       basic helix loop helix 97,OsbHLH097,OsbHLH97,P0020C11.18,Putative bHLH transcription factor PTF1,LOC_Os02g35660 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020235      bhlh97          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 97       basic helix loop helix 97,OsbHLH097,OsbHLH97,P0020C11.18,Putative bHLH transcription factor PTF1,LOC_Os02g35660 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020235      bhlh97          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 97       basic helix loop helix 97|OsbHLH097|OsbHLH97|P0020C11.18|Putative bHLH transcription factor PTF1|LOC_Os02g35660 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020236      bhlh98          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 98       basic helix loop helix 98|OsbHLH098|OsbHLH98|Hypothetical protein OSJNBa0094F01.11|OSJNBa0094F01.11|LOC_Os03g58330      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020236      bhlh98          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 98       basic helix loop helix 98,OsbHLH098,OsbHLH98,Hypothetical protein OSJNBa0094F01.11,OSJNBa0094F01.11,LOC_Os03g58330      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020236      bhlh98          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 98       basic helix loop helix 98,OsbHLH098,OsbHLH98,Hypothetical protein OSJNBa0094F01.11,OSJNBa0094F01.11,LOC_Os03g58330      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020236      bhlh98          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 98       basic helix loop helix 98|OsbHLH098|OsbHLH98|Hypothetical protein OSJNBa0094F01.11|OSJNBa0094F01.11|LOC_Os03g58330      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020237      bhlh99          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 99       basic helix loop helix 99|OsbHLH099|OsbHLH99|LOC_Os07g08440     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020237      bhlh99          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 99       basic helix loop helix 99,OsbHLH099,OsbHLH99,LOC_Os07g08440     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020237      bhlh99          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 99       basic helix loop helix 99,OsbHLH099,OsbHLH99,LOC_Os07g08440     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020237      bhlh99          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 99       basic helix loop helix 99|OsbHLH099|OsbHLH99|LOC_Os07g08440     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020238      bhlh100         GO:0003735      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 100      basic helix loop helix 100|OsbHLH100|BHLH transcription factor PTF1-like protein|P0014G10.34|LOC_Os09g25040     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020238      bhlh100         GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 100      basic helix loop helix 100|OsbHLH100|BHLH transcription factor PTF1-like protein|P0014G10.34|LOC_Os09g25040     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020238      bhlh100         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 100      basic helix loop helix 100|OsbHLH100|BHLH transcription factor PTF1-like protein|P0014G10.34|LOC_Os09g25040     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020238      bhlh100         GO:0005840      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 100      basic helix loop helix 100|OsbHLH100|BHLH transcription factor PTF1-like protein|P0014G10.34|LOC_Os09g25040     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020238      bhlh100         GO:0006412      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 100      basic helix loop helix 100|OsbHLH100|BHLH transcription factor PTF1-like protein|P0014G10.34|LOC_Os09g25040     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020238      bhlh100         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 100      basic helix loop helix 100,OsbHLH100,BHLH transcription factor PTF1-like protein,P0014G10.34,LOC_Os09g25040     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020238      bhlh100         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 100      basic helix loop helix 100,OsbHLH100,BHLH transcription factor PTF1-like protein,P0014G10.34,LOC_Os09g25040     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020238      bhlh100         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 100      basic helix loop helix 100|OsbHLH100|BHLH transcription factor PTF1-like protein|P0014G10.34|LOC_Os09g25040     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020239      bhlh101         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 101      basic helix loop helix 101|OsbHLH101|OSJNBa0058K23.6 protein|OSJNBa0058K23.6|LOC_Os04g52770     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020239      bhlh101         GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 101      basic helix loop helix 101|OsbHLH101|OSJNBa0058K23.6 protein|OSJNBa0058K23.6|LOC_Os04g52770     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020239      bhlh101         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 101      basic helix loop helix 101,OsbHLH101,OSJNBa0058K23.6 protein,OSJNBa0058K23.6,LOC_Os04g52770     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020239      bhlh101         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 101      basic helix loop helix 101,OsbHLH101,OSJNBa0058K23.6 protein,OSJNBa0058K23.6,LOC_Os04g52770     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020239      bhlh101         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 101      basic helix loop helix 101|OsbHLH101|OSJNBa0058K23.6 protein|OSJNBa0058K23.6|LOC_Os04g52770     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020240      bhlh102         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 102      basic helix loop helix 102|OsbHLH102|LOC_Os12g41650     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020240      bhlh102         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 102      basic helix loop helix 102|OsbHLH102|LOC_Os12g41650     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020240      bhlh102         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 102      basic helix loop helix 102,OsbHLH102,LOC_Os12g41650     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020240      bhlh102         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 102      basic helix loop helix 102,OsbHLH102,LOC_Os12g41650     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020240      bhlh102         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 102      basic helix loop helix 102|OsbHLH102|LOC_Os12g41650     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020241      bhlh103         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 103      basic helix loop helix 103|OsbHLH103|OSJNBb0029I19.4|LOC_Os03g43810     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020241      bhlh103         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 103      basic helix loop helix 103|OsbHLH103|OSJNBb0029I19.4|LOC_Os03g43810     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020241      bhlh103         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 103      basic helix loop helix 103,OsbHLH103,OSJNBb0029I19.4,LOC_Os03g43810     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020241      bhlh103         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 103      basic helix loop helix 103,OsbHLH103,OSJNBb0029I19.4,LOC_Os03g43810     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020241      bhlh103         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 103      basic helix loop helix 103|OsbHLH103|OSJNBb0029I19.4|LOC_Os03g43810     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020242      bhlh104         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 104      basic helix loop helix 104|OsbHLH104|OJ1343_B12.3|OJ1351_C05.28|LOC_Os07g05010  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020242      bhlh104         GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 104      basic helix loop helix 104|OsbHLH104|OJ1343_B12.3|OJ1351_C05.28|LOC_Os07g05010  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020242      bhlh104         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 104      basic helix loop helix 104,OsbHLH104,OJ1343_B12.3,OJ1351_C05.28,LOC_Os07g05010  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020242      bhlh104         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 104      basic helix loop helix 104,OsbHLH104,OJ1343_B12.3,OJ1351_C05.28,LOC_Os07g05010  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020242      bhlh104         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 104      basic helix loop helix 104|OsbHLH104|OJ1343_B12.3|OJ1351_C05.28|LOC_Os07g05010  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020243      bhlh105         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 105      basic helix loop helix 105|OsbHLH105|Putative BP-5 protein|P0498A12.33|LOC_Os01g18290   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020243      bhlh105         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 105      basic helix loop helix 105,OsbHLH105,Putative BP-5 protein,P0498A12.33,LOC_Os01g18290   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020243      bhlh105         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 105      basic helix loop helix 105,OsbHLH105,Putative BP-5 protein,P0498A12.33,LOC_Os01g18290   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020243      bhlh105         GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 105      basic helix loop helix 105|OsbHLH105|Putative BP-5 protein|P0498A12.33|LOC_Os01g18290   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020243      bhlh105         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 105      basic helix loop helix 105|OsbHLH105|Putative BP-5 protein|P0498A12.33|LOC_Os01g18290   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020243      bhlh105         GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 105      basic helix loop helix 105|OsbHLH105|Putative BP-5 protein|P0498A12.33|LOC_Os01g18290   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020243      bhlh105         GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 105      basic helix loop helix 105|OsbHLH105|Putative BP-5 protein|P0498A12.33|LOC_Os01g18290   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020244      bhlh106         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 106      basic helix loop helix 106|OsbHLH106|Hypothetical protein OSJNBa0069I13.11|OSJNBa0069I13.11|LOC_Os05g04770      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020244      bhlh106         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 106      basic helix loop helix 106,OsbHLH106,Hypothetical protein OSJNBa0069I13.11,OSJNBa0069I13.11,LOC_Os05g04770      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020244      bhlh106         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 106      basic helix loop helix 106,OsbHLH106,Hypothetical protein OSJNBa0069I13.11,OSJNBa0069I13.11,LOC_Os05g04770      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020244      bhlh106         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 106      basic helix loop helix 106|OsbHLH106|Hypothetical protein OSJNBa0069I13.11|OSJNBa0069I13.11|LOC_Os05g04770      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020245      bhlh107         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 107      basic helix loop helix 107|OsbHLH107|Putative SPATULA|OSJNBA0049O12.18|LOC_Os02g56140   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020245      bhlh107         GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 107      basic helix loop helix 107|OsbHLH107|Putative SPATULA|OSJNBA0049O12.18|LOC_Os02g56140   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020245      bhlh107         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 107      basic helix loop helix 107,OsbHLH107,Putative SPATULA,OSJNBA0049O12.18,LOC_Os02g56140   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020245      bhlh107         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 107      basic helix loop helix 107,OsbHLH107,Putative SPATULA,OSJNBA0049O12.18,LOC_Os02g56140   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020245      bhlh107         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 107      basic helix loop helix 107|OsbHLH107|Putative SPATULA|OSJNBA0049O12.18|LOC_Os02g56140   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020246      bhlh108         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 108      basic helix loop helix 108|OsbHLH108|Basic helix-loop-helix protein SPATULA-like|OSJNBa0015I14.14|LOC_Os06g06900        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020246      bhlh108         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 108      basic helix loop helix 108,OsbHLH108,Basic helix-loop-helix protein SPATULA-like,OSJNBa0015I14.14,LOC_Os06g06900        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020246      bhlh108         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 108      basic helix loop helix 108,OsbHLH108,Basic helix-loop-helix protein SPATULA-like,OSJNBa0015I14.14,LOC_Os06g06900        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020246      bhlh108         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 108      basic helix loop helix 108|OsbHLH108|Basic helix-loop-helix protein SPATULA-like|OSJNBa0015I14.14|LOC_Os06g06900        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020247      bhlh109         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 109      basic helix loop helix 109|OsbHLH109|LOC_Os01g67480     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020247      bhlh109         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 109      basic helix loop helix 109,OsbHLH109,LOC_Os01g67480     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020247      bhlh109         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 109      basic helix loop helix 109,OsbHLH109,LOC_Os01g67480     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020247      bhlh109         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 109      basic helix loop helix 109|OsbHLH109|LOC_Os01g67480     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020248      bhlh110         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 110      basic helix loop helix 110|OsbHLH110|Hypothetical protein OJ1669_F01.28|OJ1669_F01.28|LOC_Os02g39140    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020248      bhlh110         GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 110      basic helix loop helix 110|OsbHLH110|Hypothetical protein OJ1669_F01.28|OJ1669_F01.28|LOC_Os02g39140    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020248      bhlh110         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 110      basic helix loop helix 110,OsbHLH110,Hypothetical protein OJ1669_F01.28,OJ1669_F01.28,LOC_Os02g39140    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020248      bhlh110         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 110      basic helix loop helix 110,OsbHLH110,Hypothetical protein OJ1669_F01.28,OJ1669_F01.28,LOC_Os02g39140    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020248      bhlh110         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 110      basic helix loop helix 110|OsbHLH110|Hypothetical protein OJ1669_F01.28|OJ1669_F01.28|LOC_Os02g39140    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020249      bhlh111         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 111      basic helix loop helix 111|OsbHLH111|OSJNBa0084K20.3 protein|OSJNBA0084K20.3|LOC_Os04g41229     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020249      bhlh111         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 111      basic helix loop helix 111,OsbHLH111,OSJNBa0084K20.3 protein,OSJNBA0084K20.3,LOC_Os04g41229     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020249      bhlh111         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 111      basic helix loop helix 111,OsbHLH111,OSJNBa0084K20.3 protein,OSJNBA0084K20.3,LOC_Os04g41229     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020249      bhlh111         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 111      basic helix loop helix 111|OsbHLH111|OSJNBa0084K20.3 protein|OSJNBA0084K20.3|LOC_Os04g41229     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020250      bhlh112         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 112      basic helix loop helix 112|OsbHLH112|Transcription factor RAU1|RAU1|LOC_Os08g39630      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020250      bhlh112         GO:0016068      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 112      basic helix loop helix 112|OsbHLH112|Transcription factor RAU1|RAU1|LOC_Os08g39630      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020250      bhlh112         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 112      basic helix loop helix 112,OsbHLH112,Transcription factor RAU1,RAU1,LOC_Os08g39630      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020250      bhlh112         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 112      basic helix loop helix 112,OsbHLH112,Transcription factor RAU1,RAU1,LOC_Os08g39630      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020250      bhlh112         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 112      basic helix loop helix 112|OsbHLH112|Transcription factor RAU1|RAU1|LOC_Os08g39630      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020251      bhlh113         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 113      basic helix loop helix 113|OsbHLH113|Putative DNA-binding protein|LOC_Os10g40740        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020251      bhlh113         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 113      basic helix loop helix 113|OsbHLH113|Putative DNA-binding protein|LOC_Os10g40740        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020251      bhlh113         GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 113      basic helix loop helix 113|OsbHLH113|Putative DNA-binding protein|LOC_Os10g40740        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020251      bhlh113         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 113      basic helix loop helix 113,OsbHLH113,Putative DNA-binding protein,LOC_Os10g40740        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020251      bhlh113         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 113      basic helix loop helix 113,OsbHLH113,Putative DNA-binding protein,LOC_Os10g40740        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020251      bhlh113         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 113      basic helix loop helix 113|OsbHLH113|Putative DNA-binding protein|LOC_Os10g40740        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020252      bhlh114         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 114      basic helix loop helix 114|OsbHLH114|Basic helix-loop-helix (BHLH)-like|OJ1695_H09.18|OJ1004_E04.3|LOC_Os02g55250       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020252      bhlh114         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 114      basic helix loop helix 114,OsbHLH114,Basic helix-loop-helix (BHLH)-like,OJ1695_H09.18,OJ1004_E04.3,LOC_Os02g55250       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020252      bhlh114         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 114      basic helix loop helix 114,OsbHLH114,Basic helix-loop-helix (BHLH)-like,OJ1695_H09.18,OJ1004_E04.3,LOC_Os02g55250       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020252      bhlh114         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 114      basic helix loop helix 114|OsbHLH114|Basic helix-loop-helix (BHLH)-like|OJ1695_H09.18|OJ1004_E04.3|LOC_Os02g55250       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020253      bhlh115         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 115      basic helix loop helix 115|OsbHLH115|LOC_Os06g08500     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020253      bhlh115         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 115      basic helix loop helix 115,OsbHLH115,LOC_Os06g08500     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020253      bhlh115         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 115      basic helix loop helix 115,OsbHLH115,LOC_Os06g08500     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020253      bhlh115         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 115      basic helix loop helix 115|OsbHLH115|LOC_Os06g08500     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020254      bhlh116         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 116      basic helix loop helix 116|OsbHLH116|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g40730      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020254      bhlh116         GO:0004938      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 116      basic helix loop helix 116|OsbHLH116|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g40730      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -6017,27 +6017,27 @@ GR_gene GR:0020254      bhlh116         GO:0004969      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 11
 GR_gene        GR:0020254      bhlh116         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 116      basic helix loop helix 116|OsbHLH116|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g40730      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020254      bhlh116         GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 116      basic helix loop helix 116|OsbHLH116|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g40730      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020254      bhlh116         GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 116      basic helix loop helix 116|OsbHLH116|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g40730      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020254      bhlh116         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 116      basic helix loop helix 116,OsbHLH116,Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein,LOC_Os12g40730      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020254      bhlh116         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 116      basic helix loop helix 116,OsbHLH116,Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein,LOC_Os12g40730      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020254      bhlh116         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 116      basic helix loop helix 116|OsbHLH116|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g40730      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020255      bhlh117         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 117      basic helix loop helix 117|OsbHLH117|BHLH transcription-like|P0002B05.13|P0697C12.40|LOC_Os01g38610     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020255      bhlh117         GO:0005856      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 117      basic helix loop helix 117|OsbHLH117|BHLH transcription-like|P0002B05.13|P0697C12.40|LOC_Os01g38610     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020255      bhlh117         GO:0007160      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 117      basic helix loop helix 117|OsbHLH117|BHLH transcription-like|P0002B05.13|P0697C12.40|LOC_Os01g38610     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020255      bhlh117         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 117      basic helix loop helix 117,OsbHLH117,BHLH transcription-like,P0002B05.13,P0697C12.40,LOC_Os01g38610     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020255      bhlh117         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 117      basic helix loop helix 117,OsbHLH117,BHLH transcription-like,P0002B05.13,P0697C12.40,LOC_Os01g38610     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020255      bhlh117         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 117      basic helix loop helix 117|OsbHLH117|BHLH transcription-like|P0002B05.13|P0697C12.40|LOC_Os01g38610     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020256      bhlh118         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 118      basic helix loop helix 118|OsbHLH118|BHLH transcription factor-like|P0692C11.28|LOC_Os01g51140  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020256      bhlh118         GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 118      basic helix loop helix 118|OsbHLH118|BHLH transcription factor-like|P0692C11.28|LOC_Os01g51140  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020256      bhlh118         GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 118      basic helix loop helix 118|OsbHLH118|BHLH transcription factor-like|P0692C11.28|LOC_Os01g51140  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020256      bhlh118         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 118      basic helix loop helix 118,OsbHLH118,BHLH transcription factor-like,P0692C11.28,LOC_Os01g51140  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020256      bhlh118         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 118      basic helix loop helix 118,OsbHLH118,BHLH transcription factor-like,P0692C11.28,LOC_Os01g51140  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020256      bhlh118         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 118      basic helix loop helix 118|OsbHLH118|BHLH transcription factor-like|P0692C11.28|LOC_Os01g51140  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0020256      bhlh118         GO:0055114      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 118      basic helix loop helix 118|OsbHLH118|BHLH transcription factor-like|P0692C11.28|LOC_Os01g51140  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020257      bhlh119         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 119      basic helix loop helix 119|OsbHLH119|Hypothetical protein OJ1362_G11.11|OJ1362_G11.11|LOC_Os05g46370    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020257      bhlh119         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 119      basic helix loop helix 119,OsbHLH119,Hypothetical protein OJ1362_G11.11,OJ1362_G11.11,LOC_Os05g46370    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020257      bhlh119         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 119      basic helix loop helix 119,OsbHLH119,Hypothetical protein OJ1362_G11.11,OJ1362_G11.11,LOC_Os05g46370    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020257      bhlh119         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 119      basic helix loop helix 119|OsbHLH119|Hypothetical protein OJ1362_G11.11|OJ1362_G11.11|LOC_Os05g46370    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020258      bhlh120         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 120      basic helix loop helix 120|OsbHLH120|Basic helix-loop-helix (BHLH)-like protein|B1342C04.6|P0025H07.25|LOC_Os09g28210   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020258      bhlh120         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 120      basic helix loop helix 120,OsbHLH120,Basic helix-loop-helix (BHLH)-like protein,B1342C04.6,P0025H07.25,LOC_Os09g28210   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020258      bhlh120         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 120      basic helix loop helix 120,OsbHLH120,Basic helix-loop-helix (BHLH)-like protein,B1342C04.6,P0025H07.25,LOC_Os09g28210   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020258      bhlh120         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 120      basic helix loop helix 120|OsbHLH120|Basic helix-loop-helix (BHLH)-like protein|B1342C04.6|P0025H07.25|LOC_Os09g28210   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020259      bhlh121         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 121      basic helix loop helix 121|OsbHLH121|BHLH protein family-like|P0461F06.33|LOC_Os08g36740        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020259      bhlh121         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 121      basic helix loop helix 121,OsbHLH121,BHLH protein family-like,P0461F06.33,LOC_Os08g36740        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020259      bhlh121         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 121      basic helix loop helix 121,OsbHLH121,BHLH protein family-like,P0461F06.33,LOC_Os08g36740        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020259      bhlh121         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 121      basic helix loop helix 121|OsbHLH121|BHLH protein family-like|P0461F06.33|LOC_Os08g36740        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0100887      P100-B10                GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       small interfering RNA P100-B10          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0100887      P100-B10                GO:0006306      GR_REF:0        IMP             P       small interfering RNA P100-B10          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -7280,13 +7280,13 @@ GR_gene GR:0080016      DWARF4          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       DWARF4  OsDWARF4|LOC_Os03g1
 GR_gene        GR:0080016      DWARF4          GO:0048366      GR_REF:0        IMP             P       DWARF4  OsDWARF4|LOC_Os03g12660 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0080016      DWARF4          GO:0055114      GR_REF:0        IMP             P       DWARF4  OsDWARF4|LOC_Os03g12660 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020260      bhlh122         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 122      basic helix loop helix 122|OsbHLH122|P0021C04.13|LOC_Os06g10820 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020260      bhlh122         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 122      basic helix loop helix 122,OsbHLH122,P0021C04.13,LOC_Os06g10820 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020260      bhlh122         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 122      basic helix loop helix 122,OsbHLH122,P0021C04.13,LOC_Os06g10820 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020260      bhlh122         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 122      basic helix loop helix 122|OsbHLH122|P0021C04.13|LOC_Os06g10820 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020261      bhlh123         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 123      basic helix loop helix 123|OsbHLH123|LOC_Os01g61480     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020261      bhlh123         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 123      basic helix loop helix 123|OsbHLH123|LOC_Os01g61480     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020261      bhlh123         GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 123      basic helix loop helix 123|OsbHLH123|LOC_Os01g61480     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020261      bhlh123         GO:0007275      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 123      basic helix loop helix 123|OsbHLH123|LOC_Os01g61480     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020261      bhlh123         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 123      basic helix loop helix 123,OsbHLH123,LOC_Os01g61480     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020261      bhlh123         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 123      basic helix loop helix 123,OsbHLH123,LOC_Os01g61480     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020261      bhlh123         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 123      basic helix loop helix 123|OsbHLH123|LOC_Os01g61480     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020262      bhlh124         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic helix loop helix 124, OsbHLH124   basic helix loop helix 124|OsbHLH124|LOC_Os08g01700     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020262      bhlh124         GO:0004879      GR_REF:0        IMP             F       basic helix loop helix 124, OsbHLH124   basic helix loop helix 124|OsbHLH124|LOC_Os08g01700     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -7294,57 +7294,57 @@ GR_gene GR:0020262      bhlh124         GO:0005198      GR_REF:0        IMP             F       basic helix loop helix 12
 GR_gene        GR:0020262      bhlh124         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic helix loop helix 124, OsbHLH124   basic helix loop helix 124|OsbHLH124|LOC_Os08g01700     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020262      bhlh124         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic helix loop helix 124, OsbHLH124   basic helix loop helix 124|OsbHLH124|LOC_Os08g01700     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020262      bhlh124         GO:0019028      GR_REF:0        IMP             C       basic helix loop helix 124, OsbHLH124   basic helix loop helix 124|OsbHLH124|LOC_Os08g01700     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020262      bhlh124         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic helix loop helix 124, OsbHLH124   basic helix loop helix 124,OsbHLH124,LOC_Os08g01700     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020262      bhlh124         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic helix loop helix 124, OsbHLH124   basic helix loop helix 124,OsbHLH124,LOC_Os08g01700     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020262      bhlh124         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic helix loop helix 124, OsbHLH124   basic helix loop helix 124|OsbHLH124|LOC_Os08g01700     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020263      bhlh125         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 125      basic helix loop helix 125|OsbHLH125|Hypothetical protein P0439B06.24|LOC_Os01g02110    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020263      bhlh125         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 125      basic helix loop helix 125,OsbHLH125,Hypothetical protein P0439B06.24,LOC_Os01g02110    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020263      bhlh125         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 125      basic helix loop helix 125,OsbHLH125,Hypothetical protein P0439B06.24,LOC_Os01g02110    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020263      bhlh125         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 125      basic helix loop helix 125|OsbHLH125|Hypothetical protein P0439B06.24|LOC_Os01g02110    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020264      bhlh126         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 126      basic helix loop helix 126|OsbHLH126|OJ1038_A06.9|OJ1311_H06.19|LOC_Os02g48060  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020264      bhlh126         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 126      basic helix loop helix 126,OsbHLH126,OJ1038_A06.9,OJ1311_H06.19,LOC_Os02g48060  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020264      bhlh126         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 126      basic helix loop helix 126,OsbHLH126,OJ1038_A06.9,OJ1311_H06.19,LOC_Os02g48060  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020264      bhlh126         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 126      basic helix loop helix 126|OsbHLH126|OJ1038_A06.9|OJ1311_H06.19|LOC_Os02g48060  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020265      bhlh127         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 127      basic helix loop helix 127|OsbHLH127|B1089G05.30|LOC_Os06g30090 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020265      bhlh127         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 127      basic helix loop helix 127,OsbHLH127,B1089G05.30,LOC_Os06g30090 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020265      bhlh127         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 127      basic helix loop helix 127,OsbHLH127,B1089G05.30,LOC_Os06g30090 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020265      bhlh127         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 127      basic helix loop helix 127|OsbHLH127|B1089G05.30|LOC_Os06g30090 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020266      bhlh128         GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       basic helix loop helix 120, OsbHLH128   basic helix loop helix 128|OsbHLH128|LOC_Os07g13000     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020266      bhlh128         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic helix loop helix 120, OsbHLH128   basic helix loop helix 128|OsbHLH128|LOC_Os07g13000     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020266      bhlh128         GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       basic helix loop helix 120, OsbHLH128   basic helix loop helix 128|OsbHLH128|LOC_Os07g13000     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020266      bhlh128         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic helix loop helix 120, OsbHLH128   basic helix loop helix 128,OsbHLH128,LOC_Os07g13000     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020266      bhlh128         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic helix loop helix 120, OsbHLH128   basic helix loop helix 128,OsbHLH128,LOC_Os07g13000     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020266      bhlh128         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic helix loop helix 120, OsbHLH128   basic helix loop helix 128|OsbHLH128|LOC_Os07g13000     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020267      bhlh129         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 129      basic helix loop helix 129|OsbHLH129|LOC_Os03g10770     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020267      bhlh129         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 129      basic helix loop helix 129|OsbHLH129|LOC_Os03g10770     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020267      bhlh129         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 129      basic helix loop helix 129,OsbHLH129,LOC_Os03g10770     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020267      bhlh129         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 129      basic helix loop helix 129,OsbHLH129,LOC_Os03g10770     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020267      bhlh129         GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 129      basic helix loop helix 129|OsbHLH129|LOC_Os03g10770     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020267      bhlh129         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 129      basic helix loop helix 129|OsbHLH129|LOC_Os03g10770     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020267      bhlh129         GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 129      basic helix loop helix 129|OsbHLH129|LOC_Os03g10770     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020267      bhlh129         GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 129      basic helix loop helix 129|OsbHLH129|LOC_Os03g10770     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020268      bhlh130         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 130      basic helix loop helix 130|OsbHLH130|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g39850      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020268      bhlh130         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 130      basic helix loop helix 130|OsbHLH130|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g39850      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020268      bhlh130         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 130      basic helix loop helix 130,OsbHLH130,Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein,LOC_Os12g39850      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020268      bhlh130         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 130      basic helix loop helix 130,OsbHLH130,Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein,LOC_Os12g39850      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020268      bhlh130         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 130      basic helix loop helix 130|OsbHLH130|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g39850      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020269      bhlh131         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 131      basic helix loop helix 131|OsbHLH131|OSJNBa0063J18.7|Putative transcription factor|LOC_Os03g42100       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020269      bhlh131         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 131      basic helix loop helix 131|OsbHLH131|OSJNBa0063J18.7|Putative transcription factor|LOC_Os03g42100       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020269      bhlh131         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 131      basic helix loop helix 131,OsbHLH131,OSJNBa0063J18.7,Putative transcription factor,LOC_Os03g42100       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020269      bhlh131         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 131      basic helix loop helix 131,OsbHLH131,OSJNBa0063J18.7,Putative transcription factor,LOC_Os03g42100       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020269      bhlh131         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 131      basic helix loop helix 131|OsbHLH131|OSJNBa0063J18.7|Putative transcription factor|LOC_Os03g42100       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020270      bhlh132         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 132      basic helix loop helix 132|OsbHLH132|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os11g41640      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020270      bhlh132         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 132      basic helix loop helix 132|OsbHLH132|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os11g41640      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020270      bhlh132         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 132      basic helix loop helix 132,OsbHLH132,Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein,LOC_Os11g41640      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020270      bhlh132         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 132      basic helix loop helix 132,OsbHLH132,Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein,LOC_Os11g41640      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020270      bhlh132         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 132      basic helix loop helix 132|OsbHLH132|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os11g41640      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020271      bhlh133         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 133      basic helix loop helix 133|OsbHLH133|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g32400      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020271      bhlh133         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 133      basic helix loop helix 133|OsbHLH133|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g32400      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020271      bhlh133         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 133      basic helix loop helix 133,OsbHLH133,Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein,LOC_Os12g32400      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020271      bhlh133         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 133      basic helix loop helix 133,OsbHLH133,Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein,LOC_Os12g32400      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020271      bhlh133         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 133      basic helix loop helix 133|OsbHLH133|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g32400      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020272      bhlh134         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 134      basic helix loop helix 134|OsbHLH134|Putative transcription factor|OSJNBA0002J24.23|LOC_Os03g55550      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020272      bhlh134         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 134      basic helix loop helix 134|OsbHLH134|Putative transcription factor|OSJNBA0002J24.23|LOC_Os03g55550      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020272      bhlh134         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 134      basic helix loop helix 134,OsbHLH134,Putative transcription factor,OSJNBA0002J24.23,LOC_Os03g55550      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020272      bhlh134         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 134      basic helix loop helix 134,OsbHLH134,Putative transcription factor,OSJNBA0002J24.23,LOC_Os03g55550      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020272      bhlh134         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 134      basic helix loop helix 134|OsbHLH134|Putative transcription factor|OSJNBA0002J24.23|LOC_Os03g55550      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020273      bhlh135         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 135      basic helix loop helix 135|OsbHLH135|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|expressed|LOC_Os12g40590    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020273      bhlh135         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 135      basic helix loop helix 135|OsbHLH135|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|expressed|LOC_Os12g40590    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020273      bhlh135         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 135      basic helix loop helix 135,OsbHLH135,Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein,expressed,LOC_Os12g40590    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020273      bhlh135         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 135      basic helix loop helix 135,OsbHLH135,Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein,expressed,LOC_Os12g40590    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020273      bhlh135         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 135      basic helix loop helix 135|OsbHLH135|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|expressed|LOC_Os12g40590    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020274      bhlh136         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 136      basic helix loop helix 136|OsbHLH136|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g40710      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020274      bhlh136         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 136      basic helix loop helix 136|OsbHLH136|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g40710      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020274      bhlh136         GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 136      basic helix loop helix 136|OsbHLH136|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g40710      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020274      bhlh136         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 136      basic helix loop helix 136,OsbHLH136,Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein,LOC_Os12g40710      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020274      bhlh136         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 136      basic helix loop helix 136,OsbHLH136,Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein,LOC_Os12g40710      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020274      bhlh136         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 136      basic helix loop helix 136|OsbHLH136|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g40710      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080018      BLE3            GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       OsBLE3  LOC_Os05g15630  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080018      BLE3            GO:0007275      GR_REF:0        IMP             P       OsBLE3  LOC_Os05g15630  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -7356,7 +7356,7 @@ GR_gene   GR:0080018      BLE3            GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       OsBLE3  LOC_Os05g15630  gene    t
 GR_gene        GR:0080018      BLE3            GO:0035264      GR_REF:0        IMP             P       OsBLE3  LOC_Os05g15630  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020275      bhlh137         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 137      basic helix loop helix 137|OsbHLH137|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g40630      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020275      bhlh137         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 137      basic helix loop helix 137|OsbHLH137|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g40630      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020275      bhlh137         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 137      basic helix loop helix 137,OsbHLH137,Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein,LOC_Os12g40630      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020275      bhlh137         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 137      basic helix loop helix 137,OsbHLH137,Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein,LOC_Os12g40630      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020275      bhlh137         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 137      basic helix loop helix 137|OsbHLH137|Helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein|LOC_Os12g40630      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080019      MDP1            GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       MADS-domain-containing protein 1        OsMDP1|OsMADS47|LOC_Os03g08754  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080019      MDP1            GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       MADS-domain-containing protein 1        OsMDP1|OsMADS47|LOC_Os03g08754  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -7486,7 +7486,7 @@ GR_gene   GR:0101181      Raffinose synthase 1            GO:0006012      GR_REF:0        IMP             P       Rfs1    Raffino
 GR_gene        GR:0101181      Raffinose synthase 1            GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       Rfs1    Raffinose synthase|seed imbibition protein 1|Sip1|galactinol-sucrose galactosyltransferase|1-alpha-D-galactosyl-myo-inositol:sucrose 6-alpha-D-galactosyltransferase|alkaline alpha galactosidase I|LOC_Os01g07530      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0101181      Raffinose synthase 1            GO:0047274      GR_REF:0        IMP             F       Rfs1    Raffinose synthase|seed imbibition protein 1|Sip1|galactinol-sucrose galactosyltransferase|1-alpha-D-galactosyl-myo-inositol:sucrose 6-alpha-D-galactosyltransferase|alkaline alpha galactosidase I|LOC_Os01g07530      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0101182      Lti6A           GO:0003674      GR_REF:0        IMP             F       Low temperature induced 6A      OsLti6A|Hydrophobic protein LTI6A|LOC_Os07g44180        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0101182      Lti6A           GO:0016020      GR_REF:0        IMP                     Low temperature induced 6A      OsLti6A,Hydrophobic protein LTI6A,LOC_Os07g44180        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0101182      Lti6A           GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       Low temperature induced 6A      OsLti6A,Hydrophobic protein LTI6A,LOC_Os07g44180        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0101182      Lti6A           GO:0005886      GR_REF:0        IMP             C       Low temperature induced 6A      OsLti6A|Hydrophobic protein LTI6A|LOC_Os07g44180        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0101182      Lti6A           GO:0009409      GR_REF:0        IMP             P       Low temperature induced 6A      OsLti6A|Hydrophobic protein LTI6A|LOC_Os07g44180        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0101182      Lti6A           GO:0009414      GR_REF:0        IMP             P       Low temperature induced 6A      OsLti6A|Hydrophobic protein LTI6A|LOC_Os07g44180        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -7497,7 +7497,7 @@ GR_gene   GR:0101182      Lti6A           GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       Low temperature induced 6A
 GR_gene        GR:0101182      Lti6A           GO:0016023      GR_REF:0        IMP             C       Low temperature induced 6A      OsLti6A|Hydrophobic protein LTI6A|LOC_Os07g44180        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0101182      Lti6A           GO:0032940      GR_REF:0        IMP             P       Low temperature induced 6A      OsLti6A|Hydrophobic protein LTI6A|LOC_Os07g44180        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0101183      Lti6B           GO:0003674      GR_REF:0        IMP             F       Low temperature induced 6B      OsLti6BA|Hydrophobic protein LTI6B|Low temperature-induced protein 6B|drought-induced hydrophobic|DRR2|early drought induced protein|R1G1B|LOC_Os05g04700       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0101183      Lti6B           GO:0016020      GR_REF:0        IMP                     Low temperature induced 6B      OsLti6BA,Hydrophobic protein LTI6B,Low temperature-induced protein 6B,drought-induced hydrophobic,DRR2,early drought induced protein,R1G1B,LOC_Os05g04700       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0101183      Lti6B           GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       Low temperature induced 6B      OsLti6BA,Hydrophobic protein LTI6B,Low temperature-induced protein 6B,drought-induced hydrophobic,DRR2,early drought induced protein,R1G1B,LOC_Os05g04700       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0101183      Lti6B           GO:0005886      GR_REF:0        IMP             C       Low temperature induced 6B      OsLti6BA|Hydrophobic protein LTI6B|Low temperature-induced protein 6B|drought-induced hydrophobic|DRR2|early drought induced protein|R1G1B|LOC_Os05g04700       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0101183      Lti6B           GO:0009409      GR_REF:0        IMP             P       Low temperature induced 6B      OsLti6BA|Hydrophobic protein LTI6B|Low temperature-induced protein 6B|drought-induced hydrophobic|DRR2|early drought induced protein|R1G1B|LOC_Os05g04700       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0101183      Lti6B           GO:0009414      GR_REF:0        IMP             P       Low temperature induced 6B      OsLti6BA|Hydrophobic protein LTI6B|Low temperature-induced protein 6B|drought-induced hydrophobic|DRR2|early drought induced protein|R1G1B|LOC_Os05g04700       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -7574,54 +7574,54 @@ GR_gene GR:0101186      Zep1            GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       Zeaxanthin epoxidase 1  OsAba
 GR_gene        GR:0101186      Zep1            GO:0022900      GR_REF:0        IMP             P       Zeaxanthin epoxidase 1  OsAba1|Aba2|OsAba2|OsZep1|Zep|OsZep|Aba1|LOC_Os04g37619 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0101186      Zep1            GO:0055114      GR_REF:0        IMP             P       Zeaxanthin epoxidase 1  OsAba1|Aba2|OsAba2|OsZep1|Zep|OsZep|Aba1|LOC_Os04g37619 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020276      bhlh138         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 138      basic helix loop helix 138|OsbHLH138|OSJNBa0065F09.5|LOC_Os03g27390     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020276      bhlh138         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 138      basic helix loop helix 138,OsbHLH138,OSJNBa0065F09.5,LOC_Os03g27390     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020276      bhlh138         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 138      basic helix loop helix 138,OsbHLH138,OSJNBa0065F09.5,LOC_Os03g27390     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020276      bhlh138         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 138      basic helix loop helix 138|OsbHLH138|OSJNBa0065F09.5|LOC_Os03g27390     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020277      bhlh139         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 139      basic helix loop helix 139|OsbHLH139|P0572D06.2|LOC_Os02g21090  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020277      bhlh139         GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 139      basic helix loop helix 139|OsbHLH139|P0572D06.2|LOC_Os02g21090  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020277      bhlh139         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 139      basic helix loop helix 139,OsbHLH139,P0572D06.2,LOC_Os02g21090  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020277      bhlh139         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 139      basic helix loop helix 139,OsbHLH139,P0572D06.2,LOC_Os02g21090  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020277      bhlh139         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 139      basic helix loop helix 139|OsbHLH139|P0572D06.2|LOC_Os02g21090  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020278      bhlh140         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 140      basic helix loop helix 140|OsbHLH140|Hypothetical protein OSJNBa0027H16.21|OSJNBa0027H16.21|LOC_Os03g39432      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020278      bhlh140         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 140      basic helix loop helix 140|OsbHLH140|Hypothetical protein OSJNBa0027H16.21|OSJNBa0027H16.21|LOC_Os03g39432      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020278      bhlh140         GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 140      basic helix loop helix 140|OsbHLH140|Hypothetical protein OSJNBa0027H16.21|OSJNBa0027H16.21|LOC_Os03g39432      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020278      bhlh140         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 140      basic helix loop helix 140,OsbHLH140,Hypothetical protein OSJNBa0027H16.21,OSJNBa0027H16.21,LOC_Os03g39432      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020278      bhlh140         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 140      basic helix loop helix 140,OsbHLH140,Hypothetical protein OSJNBa0027H16.21,OSJNBa0027H16.21,LOC_Os03g39432      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020278      bhlh140         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 140      basic helix loop helix 140|OsbHLH140|Hypothetical protein OSJNBa0027H16.21|OSJNBa0027H16.21|LOC_Os03g39432      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020279      bhlh141         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 141      basic helix loop helix 141|OsbHLH141|OSJNBA0083N12.3|OSJNBA0093F12.24|LOC_Os04g51070    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020279      bhlh141         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 141      basic helix loop helix 141,OsbHLH141,OSJNBA0083N12.3,OSJNBA0093F12.24,LOC_Os04g51070    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020279      bhlh141         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 141      basic helix loop helix 141,OsbHLH141,OSJNBA0083N12.3,OSJNBA0093F12.24,LOC_Os04g51070    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020279      bhlh141         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 141      basic helix loop helix 141|OsbHLH141|OSJNBA0083N12.3|OSJNBA0093F12.24|LOC_Os04g51070    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020280      bhlh142         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 142      basic helix loop helix 142|OsbHLH142|P0706B05.43|LOC_Os01g18870 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020280      bhlh142         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 142      basic helix loop helix 142,OsbHLH142,P0706B05.43,LOC_Os01g18870 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020280      bhlh142         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 142      basic helix loop helix 142,OsbHLH142,P0706B05.43,LOC_Os01g18870 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020280      bhlh142         GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 142      basic helix loop helix 142|OsbHLH142|P0706B05.43|LOC_Os01g18870 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020280      bhlh142         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 142      basic helix loop helix 142|OsbHLH142|P0706B05.43|LOC_Os01g18870 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020280      bhlh142         GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 142      basic helix loop helix 142|OsbHLH142|P0706B05.43|LOC_Os01g18870 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020280      bhlh142         GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 142      basic helix loop helix 142|OsbHLH142|P0706B05.43|LOC_Os01g18870 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020281      bhlh143         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 143      basic helix loop helix 143|OsbHLH143|LOC_Os09g31300     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020281      bhlh143         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 143      basic helix loop helix 143,OsbHLH143,LOC_Os09g31300     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020281      bhlh143         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 143      basic helix loop helix 143,OsbHLH143,LOC_Os09g31300     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020281      bhlh143         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 143      basic helix loop helix 143|OsbHLH143|LOC_Os09g31300     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020282      bhlh144         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 144      basic helix loop helix 144|OsbHLH144|LOC_Os04g35010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020282      bhlh144         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 144      basic helix loop helix 144,OsbHLH144,LOC_Os04g35010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020282      bhlh144         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 144      basic helix loop helix 144,OsbHLH144,LOC_Os04g35010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020282      bhlh144         GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 144      basic helix loop helix 144|OsbHLH144|LOC_Os04g35010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020282      bhlh144         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 144      basic helix loop helix 144|OsbHLH144|LOC_Os04g35010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020282      bhlh144         GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 144      basic helix loop helix 144|OsbHLH144|LOC_Os04g35010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020282      bhlh144         GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 144      basic helix loop helix 144|OsbHLH144|LOC_Os04g35010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020283      bhlh145         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 145      basic helix loop helix 145|OsbHLH145|OSJNBA0042L16.11|LOC_Os04g35000    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020283      bhlh145         GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 145      basic helix loop helix 145|OsbHLH145|OSJNBA0042L16.11|LOC_Os04g35000    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020283      bhlh145         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 145      basic helix loop helix 145,OsbHLH145,OSJNBA0042L16.11,LOC_Os04g35000    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020283      bhlh145         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 145      basic helix loop helix 145,OsbHLH145,OSJNBA0042L16.11,LOC_Os04g35000    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020283      bhlh145         GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 145      basic helix loop helix 145|OsbHLH145|OSJNBA0042L16.11|LOC_Os04g35000    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020283      bhlh145         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 145      basic helix loop helix 145|OsbHLH145|OSJNBA0042L16.11|LOC_Os04g35000    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020283      bhlh145         GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 145      basic helix loop helix 145|OsbHLH145|OSJNBA0042L16.11|LOC_Os04g35000    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020283      bhlh145         GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 145      basic helix loop helix 145|OsbHLH145|OSJNBA0042L16.11|LOC_Os04g35000    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020284      bhlh146         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 146      basic helix loop helix 146|OsbHLH146|Hypothetical protein OSJNBa0051E21.18|LOC_Os02g34320       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020284      bhlh146         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 146      basic helix loop helix 146,OsbHLH146,Hypothetical protein OSJNBa0051E21.18,LOC_Os02g34320       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020284      bhlh146         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 146      basic helix loop helix 146,OsbHLH146,Hypothetical protein OSJNBa0051E21.18,LOC_Os02g34320       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020284      bhlh146         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 146      basic helix loop helix 146|OsbHLH146|Hypothetical protein OSJNBa0051E21.18|LOC_Os02g34320       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020285      bhlh147         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 147      basic helix loop helix 147|OsbHLH147|Hypothetical protein OSJNBa0051E21.28|OSJNBa0051E21.28|LOC_Os02g34370      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020285      bhlh147         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 147      basic helix loop helix 147,OsbHLH147,Hypothetical protein OSJNBa0051E21.28,OSJNBa0051E21.28,LOC_Os02g34370      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020285      bhlh147         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 147      basic helix loop helix 147,OsbHLH147,Hypothetical protein OSJNBa0051E21.28,OSJNBa0051E21.28,LOC_Os02g34370      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020285      bhlh147         GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 147      basic helix loop helix 147|OsbHLH147|Hypothetical protein OSJNBa0051E21.28|OSJNBa0051E21.28|LOC_Os02g34370      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020285      bhlh147         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 147      basic helix loop helix 147|OsbHLH147|Hypothetical protein OSJNBa0051E21.28|OSJNBa0051E21.28|LOC_Os02g34370      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020285      bhlh147         GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 147      basic helix loop helix 147|OsbHLH147|Hypothetical protein OSJNBa0051E21.28|OSJNBa0051E21.28|LOC_Os02g34370      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020285      bhlh147         GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 147      basic helix loop helix 147|OsbHLH147|Hypothetical protein OSJNBa0051E21.28|OSJNBa0051E21.28|LOC_Os02g34370      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020286      bhlh148         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 148      basic helix loop helix 148|OsbHLH148|Putative helix-loop-helix DNA-binding protein|OJ1365_D05.18|LOC_Os03g53020 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020286      bhlh148         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 148      basic helix loop helix 148|OsbHLH148|Putative helix-loop-helix DNA-binding protein|OJ1365_D05.18|LOC_Os03g53020 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020286      bhlh148         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 148      basic helix loop helix 148,OsbHLH148,Putative helix-loop-helix DNA-binding protein,OJ1365_D05.18,LOC_Os03g53020 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020286      bhlh148         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 148      basic helix loop helix 148,OsbHLH148,Putative helix-loop-helix DNA-binding protein,OJ1365_D05.18,LOC_Os03g53020 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020286      bhlh148         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 148      basic helix loop helix 148|OsbHLH148|Putative helix-loop-helix DNA-binding protein|OJ1365_D05.18|LOC_Os03g53020 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080025      MADS18          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       MADS box gene 18        OsMADS18|OsMADS2|FDRMADS7|OsMADS28|LOC_Os07g41370       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080025      MADS18          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       MADS box gene 18        OsMADS18|OsMADS2|FDRMADS7|OsMADS28|LOC_Os07g41370       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -7638,34 +7638,34 @@ GR_gene GR:0080025      MADS18          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       MADS box gene 18        OsMADS18|
 GR_gene        GR:0080025      MADS18          GO:0048830      GR_REF:0        IMP             P       MADS box gene 18        OsMADS18|OsMADS2|FDRMADS7|OsMADS28|LOC_Os07g41370       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020287      bhlh149         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 149      basic helix loop helix 149|OsbHLH149|P0505D12.13|LOC_Os01g64560 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020287      bhlh149         GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 149      basic helix loop helix 149|OsbHLH149|P0505D12.13|LOC_Os01g64560 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020287      bhlh149         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 149      basic helix loop helix 149,OsbHLH149,P0505D12.13,LOC_Os01g64560 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020287      bhlh149         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 149      basic helix loop helix 149,OsbHLH149,P0505D12.13,LOC_Os01g64560 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020287      bhlh149         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 149      basic helix loop helix 149|OsbHLH149|P0505D12.13|LOC_Os01g64560 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020288      bhlh150         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 150      basic helix loop helix 150|OsbHLH150|LOC_Os12g06330     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020288      bhlh150         GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 150      basic helix loop helix 150|OsbHLH150|LOC_Os12g06330     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020288      bhlh150         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 150      basic helix loop helix 150,OsbHLH150,LOC_Os12g06330     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020288      bhlh150         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 150      basic helix loop helix 150,OsbHLH150,LOC_Os12g06330     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020288      bhlh150         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 150      basic helix loop helix 150|OsbHLH150|LOC_Os12g06330     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020289      bhlh151         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic helix loop helix 151, OsbHLH151   basic helix loop helix 151|OsbHLH151|LOC_Os11g06010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020289      bhlh151         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic helix loop helix 151, OsbHLH151   basic helix loop helix 151,OsbHLH151,LOC_Os11g06010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020289      bhlh151         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic helix loop helix 151, OsbHLH151   basic helix loop helix 151,OsbHLH151,LOC_Os11g06010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020289      bhlh151         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic helix loop helix 151, OsbHLH151   basic helix loop helix 151|OsbHLH151|LOC_Os11g06010     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020290      bhlh152         GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 152      basic helix loop helix 152|OsbHLH152|LOC_Os03g56950     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020290      bhlh152         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 152      basic helix loop helix 152|OsbHLH152|LOC_Os03g56950     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020290      bhlh152         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 152      basic helix loop helix 152,OsbHLH152,LOC_Os03g56950     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020290      bhlh152         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 152      basic helix loop helix 152,OsbHLH152,LOC_Os03g56950     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020290      bhlh152         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 152      basic helix loop helix 152|OsbHLH152|LOC_Os03g56950     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020291      bhlh153         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 153      basic helix loop helix 153|OsbHLH153|LOC_Os03g07540     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020291      bhlh153         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 153      basic helix loop helix 153,OsbHLH153,LOC_Os03g07540     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020291      bhlh153         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 153      basic helix loop helix 153,OsbHLH153,LOC_Os03g07540     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020291      bhlh153         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 153      basic helix loop helix 153|OsbHLH153|LOC_Os03g07540     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020292      bhlh154         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 154      basic helix loop helix 154|OsbHLH154|H0423H10.9|LOC_Os04g54900  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020292      bhlh154         GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 154      basic helix loop helix 154|OsbHLH154|H0423H10.9|LOC_Os04g54900  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020292      bhlh154         GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 154      basic helix loop helix 154|OsbHLH154|H0423H10.9|LOC_Os04g54900  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020292      bhlh154         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 154      basic helix loop helix 154,OsbHLH154,H0423H10.9,LOC_Os04g54900  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020292      bhlh154         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 154      basic helix loop helix 154,OsbHLH154,H0423H10.9,LOC_Os04g54900  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020292      bhlh154         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 154      basic helix loop helix 154|OsbHLH154|H0423H10.9|LOC_Os04g54900  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020293      bhlh155         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 155      basic helix loop helix 155|OsbHLH155|Hypothetical protein P0548E04.5|P0535F09.38|P0548E04.5|LOC_Os06g50900      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020293      bhlh155         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 155      basic helix loop helix 155,OsbHLH155,Hypothetical protein P0548E04.5,P0535F09.38,P0548E04.5,LOC_Os06g50900      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020293      bhlh155         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 155      basic helix loop helix 155,OsbHLH155,Hypothetical protein P0548E04.5,P0535F09.38,P0548E04.5,LOC_Os06g50900      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020293      bhlh155         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 155      basic helix loop helix 155|OsbHLH155|Hypothetical protein P0548E04.5|P0535F09.38|P0548E04.5|LOC_Os06g50900      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020294      bhlh156         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 156      basic helix loop helix 156|OsbHLH156|OSJNBa0072D21.7 protein|OSJNBA0072D21.7|LOC_Os04g31290     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020294      bhlh156         GO:0016023      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 156      basic helix loop helix 156|OsbHLH156|OSJNBa0072D21.7 protein|OSJNBA0072D21.7|LOC_Os04g31290     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020294      bhlh156         GO:0016068      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 156      basic helix loop helix 156|OsbHLH156|OSJNBa0072D21.7 protein|OSJNBA0072D21.7|LOC_Os04g31290     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020294      bhlh156         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 156      basic helix loop helix 156,OsbHLH156,OSJNBa0072D21.7 protein,OSJNBA0072D21.7,LOC_Os04g31290     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020294      bhlh156         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 156      basic helix loop helix 156,OsbHLH156,OSJNBa0072D21.7 protein,OSJNBA0072D21.7,LOC_Os04g31290     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020294      bhlh156         GO:0032940      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 156      basic helix loop helix 156|OsbHLH156|OSJNBa0072D21.7 protein|OSJNBA0072D21.7|LOC_Os04g31290     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020294      bhlh156         GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 156      basic helix loop helix 156|OsbHLH156|OSJNBa0072D21.7 protein|OSJNBA0072D21.7|LOC_Os04g31290     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020294      bhlh156         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 156      basic helix loop helix 156|OsbHLH156|OSJNBa0072D21.7 protein|OSJNBA0072D21.7|LOC_Os04g31290     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -7674,23 +7674,23 @@ GR_gene GR:0020294      bhlh156         GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 15
 GR_gene        GR:0020295      bhlh157         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 157      basic helix loop helix 157|OsbHLH157|Hypothetical protein P0544B02.8|P0544B02.8|LOC_Os02g08220  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020295      bhlh157         GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 157      basic helix loop helix 157|OsbHLH157|Hypothetical protein P0544B02.8|P0544B02.8|LOC_Os02g08220  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020295      bhlh157         GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 157      basic helix loop helix 157|OsbHLH157|Hypothetical protein P0544B02.8|P0544B02.8|LOC_Os02g08220  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020295      bhlh157         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 157      basic helix loop helix 157,OsbHLH157,Hypothetical protein P0544B02.8,P0544B02.8,LOC_Os02g08220  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020295      bhlh157         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 157      basic helix loop helix 157,OsbHLH157,Hypothetical protein P0544B02.8,P0544B02.8,LOC_Os02g08220  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020295      bhlh157         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 157      basic helix loop helix 157|OsbHLH157|Hypothetical protein P0544B02.8|P0544B02.8|LOC_Os02g08220  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020296      bhlh158         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 158      basic helix loop helix 158|OsbHLH158|Hypothetical protein OSJNBa0085J13.15|OSJNBa0085J13.15|LOC_Os06g44320      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020296      bhlh158         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 158      basic helix loop helix 158,OsbHLH158,Hypothetical protein OSJNBa0085J13.15,OSJNBa0085J13.15,LOC_Os06g44320      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020296      bhlh158         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 158      basic helix loop helix 158,OsbHLH158,Hypothetical protein OSJNBa0085J13.15,OSJNBa0085J13.15,LOC_Os06g44320      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020296      bhlh158         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 158      basic helix loop helix 158|OsbHLH158|Hypothetical protein OSJNBa0085J13.15|OSJNBa0085J13.15|LOC_Os06g44320      gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020297      bhlh159         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 159      basic helix loop helix 159|OsbHLH159|LOC_Os05g06520     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020297      bhlh159         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 159      basic helix loop helix 159,OsbHLH159,LOC_Os05g06520     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020297      bhlh159         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 159      basic helix loop helix 159,OsbHLH159,LOC_Os05g06520     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020297      bhlh159         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 159      basic helix loop helix 159|OsbHLH159|LOC_Os05g06520     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020298      bhlh160         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 160      basic helix loop helix 160|OsbHLH160|LOC_Os11g02054     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020298      bhlh160         GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 160      basic helix loop helix 160|OsbHLH160|LOC_Os11g02054     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020298      bhlh160         GO:0016597      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 160      basic helix loop helix 160|OsbHLH160|LOC_Os11g02054     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020298      bhlh160         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 160      basic helix loop helix 160,OsbHLH160,LOC_Os11g02054     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020298      bhlh160         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 160      basic helix loop helix 160,OsbHLH160,LOC_Os11g02054     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020298      bhlh160         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 160      basic helix loop helix 160|OsbHLH160|LOC_Os11g02054     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020299      bhlh161         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 161      basic helix loop helix 161|OsbHLH161|LOC_Os12g02020     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020299      bhlh161         GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 161      basic helix loop helix 161|OsbHLH161|LOC_Os12g02020     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020299      bhlh161         GO:0016597      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 161      basic helix loop helix 161|OsbHLH161|LOC_Os12g02020     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020299      bhlh161         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 161      basic helix loop helix 161,OsbHLH161,LOC_Os12g02020     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020299      bhlh161         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 161      basic helix loop helix 161,OsbHLH161,LOC_Os12g02020     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020299      bhlh161         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 161      basic helix loop helix 161|OsbHLH161|LOC_Os12g02020     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080026      RAD             GO:0000287      GR_REF:0        IMP             F       RAD     OsRAD|OsGEN-L|OsGEN-like|LOC_Os09g35000 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080026      RAD             GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       RAD     OsRAD|OsGEN-L|OsGEN-like|LOC_Os09g35000 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -7708,14 +7708,14 @@ GR_gene GR:0080026      RAD             GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       RAD     OsRAD|OsGEN-L|OsGEN-like|
 GR_gene        GR:0080026      RAD             GO:0048256      GR_REF:0        IMP             F       RAD     OsRAD|OsGEN-L|OsGEN-like|LOC_Os09g35000 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020300      bhlh162         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 162      basic helix loop helix 162|OsbHLH162|Hypothetical protein OSJNBa0053E01.1|OSJNBa0053E01.1|LOC_Os05g27090        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020300      bhlh162         GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 162      basic helix loop helix 162|OsbHLH162|Hypothetical protein OSJNBa0053E01.1|OSJNBa0053E01.1|LOC_Os05g27090        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020300      bhlh162         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 162      basic helix loop helix 162,OsbHLH162,Hypothetical protein OSJNBa0053E01.1,OSJNBa0053E01.1,LOC_Os05g27090        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020300      bhlh162         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 162      basic helix loop helix 162,OsbHLH162,Hypothetical protein OSJNBa0053E01.1,OSJNBa0053E01.1,LOC_Os05g27090        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020300      bhlh162         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 162      basic helix loop helix 162|OsbHLH162|Hypothetical protein OSJNBa0053E01.1|OSJNBa0053E01.1|LOC_Os05g27090        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020301      bhlh163         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 163      basic helix loop helix 163|OsbHLH163|Hypothetical protein OJ1167_G06.116|LOC_Os07g47960 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020301      bhlh163         GO:0005739      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 163      basic helix loop helix 163|OsbHLH163|Hypothetical protein OJ1167_G06.116|LOC_Os07g47960 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020301      bhlh163         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 163      basic helix loop helix 163,OsbHLH163,Hypothetical protein OJ1167_G06.116,LOC_Os07g47960 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020301      bhlh163         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 163      basic helix loop helix 163,OsbHLH163,Hypothetical protein OJ1167_G06.116,LOC_Os07g47960 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020301      bhlh163         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 163      basic helix loop helix 163|OsbHLH163|Hypothetical protein OJ1167_G06.116|LOC_Os07g47960 gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020302      bhlh164         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 164      basic helix loop helix 164|OsbHLH164    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020302      bhlh164         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 164      basic helix loop helix 164,OsbHLH164    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020302      bhlh164         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 164      basic helix loop helix 164,OsbHLH164    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020302      bhlh164         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 164      basic helix loop helix 164|OsbHLH164    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080027      HTD1            GO:0009733      GR_REF:0        IMP             P       High-Tillering Dwarf1   OsCCD7|LOC_Os04g46470   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080027      HTD1            GO:0010223      GR_REF:0        IMP             P       High-Tillering Dwarf1   OsCCD7|LOC_Os04g46470   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -7723,11 +7723,11 @@ GR_gene GR:0080027      HTD1            GO:0016121      GR_REF:0        IMP             P       High-Tillering Dwarf1   OsCCD7
 GR_gene        GR:0080027      HTD1            GO:0045549      GR_REF:0        IMP             F       High-Tillering Dwarf1   OsCCD7|LOC_Os04g46470   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020303      bhlh166         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 166      basic helix loop helix 166|OsbHLH166|LOC_Os03g21970     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020303      bhlh166         GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 166      basic helix loop helix 166|OsbHLH166|LOC_Os03g21970     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020303      bhlh166         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 166      basic helix loop helix 166,OsbHLH166,LOC_Os03g21970     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020303      bhlh166         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 166      basic helix loop helix 166,OsbHLH166,LOC_Os03g21970     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020303      bhlh166         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 166      basic helix loop helix 166|OsbHLH166|LOC_Os03g21970     gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020304      bhlh166         GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 166      basic helix loop helix 166|OsbHLH166|Putative MYC-related DNA binding protein|P0498F03.15|LOC_Os09g34330        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020304      bhlh166         GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       basic/helix-loop-helix 166      basic helix loop helix 166|OsbHLH166|Putative MYC-related DNA binding protein|P0498F03.15|LOC_Os09g34330        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0020304      bhlh166         GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     basic/helix-loop-helix 166      basic helix loop helix 166,OsbHLH166,Putative MYC-related DNA binding protein,P0498F03.15,LOC_Os09g34330        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0020304      bhlh166         GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       basic/helix-loop-helix 166      basic helix loop helix 166,OsbHLH166,Putative MYC-related DNA binding protein,P0498F03.15,LOC_Os09g34330        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0020304      bhlh166         GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       basic/helix-loop-helix 166      basic helix loop helix 166|OsbHLH166|Putative MYC-related DNA binding protein|P0498F03.15|LOC_Os09g34330        gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080028      REH1            GO:0005215      GR_REF:0        IMP             F       rice EIR1-like  OsPIN1|PIN-FORMED|PIN1|LOC_Os02g50960   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080028      REH1            GO:0006810      GR_REF:0        IMP             P       rice EIR1-like  OsPIN1|PIN-FORMED|PIN1|LOC_Os02g50960   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -8825,7 +8825,7 @@ GR_gene   GR:0080053      DMAS1           GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       Deoxymugineic acid synthase
 !GR_gene       GR:0080053      DMAS1           GO:0055114      GR_REF:0        IMP             P       Deoxymugineic acid synthase1    OsDMAS1|LOC_Os03g13390  gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080061      PROG1           GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       PROSTRATE GROWTH 1              gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080061      PROG1           GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       PROSTRATE GROWTH 1              gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0080061      PROG1           GO:0001228      GR_REF:0        IMP                     PROSTRATE GROWTH 1              gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0080061      PROG1           GO:0001228      GR_REF:0        IMP             F       PROSTRATE GROWTH 1              gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080061      PROG1           GO:0048873      GR_REF:0        IMP             P       PROSTRATE GROWTH 1              gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080062      GIF1            GO:0004553      GR_REF:0        IMP             F       GRAIN INCOMPLETE FILLING 1      OsCIN2|LOC_Os04g33740   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080062      GIF1            GO:0004564      GR_REF:0        IMP             F       GRAIN INCOMPLETE FILLING 1      OsCIN2|LOC_Os04g33740   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -8835,7 +8835,7 @@ GR_gene   GR:0080062      GIF1            GO:0005618      GR_REF:0        IMP             C       GRAIN INCOMPLETE FILLING 1      O
 GR_gene        GR:0080062      GIF1            GO:0005975      GR_REF:0        IMP             P       GRAIN INCOMPLETE FILLING 1      OsCIN2|LOC_Os04g33740   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080062      GIF1            GO:0005986      GR_REF:0        IMP             P       GRAIN INCOMPLETE FILLING 1      OsCIN2|LOC_Os04g33740   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080062      GIF1            GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       GRAIN INCOMPLETE FILLING 1      OsCIN2|LOC_Os04g33740   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0080062      GIF1            GO:0005987      GR_REF:0        IMP                     GRAIN INCOMPLETE FILLING 1      OsCIN2,OsCIN2,LOC_Os04g33740    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0080062      GIF1            GO:0005987      GR_REF:0        IMP             P       GRAIN INCOMPLETE FILLING 1      OsCIN2,OsCIN2,LOC_Os04g33740    gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080062      GIF1            GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       GRAIN INCOMPLETE FILLING 1      OsCIN2|LOC_Os04g33740   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080062      GIF1            GO:0016798      GR_REF:0        IMP             F       GRAIN INCOMPLETE FILLING 1      OsCIN2|LOC_Os04g33740   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080062      GIF1            GO:0048046      GR_REF:0        IMP             C       GRAIN INCOMPLETE FILLING 1      OsCIN2|LOC_Os04g33740   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -8843,7 +8843,7 @@ GR_gene   GR:0080063      SaM             GO:0009556      GR_REF:0        IMP             P       SaM     SaM+|SaM-       gene    taxon:4530
 GR_gene        GR:0080063      SaM             GO:0019789      GR_REF:0        IMP             F       SaM     SaM+|SaM-       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080064      SaF             GO:0009556      GR_REF:0        IMP             P       SaF     SaF+|SaF-       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0080064      SaF             GO:0016829      GR_REF:0        IMP             F       SaF     SaF+|SaF-       gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0090001      SOC1            GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     SUPPRESSOR OF OVEREXPRESSION OF CO 1    OsSOC1,OsSOC1   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0090001      SOC1            GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       SUPPRESSOR OF OVEREXPRESSION OF CO 1    OsSOC1,OsSOC1   gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126364      LOC_Os01g09760          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g09760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118998      LOC_Os01g56720          GO:0004519      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g56720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118998      LOC_Os01g56720          GO:0005102      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g56720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -9078,7 +9078,7 @@ GR_gene   GR:0148317      LOC_Os01g13600          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g13600          ge
 GR_gene        GR:0148317      LOC_Os01g13600          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g13600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148317      LOC_Os01g13600          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g13600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148317      LOC_Os01g13600          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g13600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0148317      LOC_Os01g13600          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g13600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0148317      LOC_Os01g13600          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g13600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120051      LOC_Os01g40910          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g40910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018556       LOC_Os01g34450          GO:0004664      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g34450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018556       LOC_Os01g34450          GO:0009094      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g34450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -9211,11 +9211,11 @@ GR_gene GR:0145889      LOC_Os01g20160          GO:0015886      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g20160          ge
 GR_gene        GR:0145889      LOC_Os01g20160          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g20160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145889      LOC_Os01g20160          GO:0017004      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g20160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114740      LOC_Os01g32750          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g32750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0114740      LOC_Os01g32750          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g32750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0114740      LOC_Os01g32750          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g32750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114740      LOC_Os01g32750          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g32750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114740      LOC_Os01g32750          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g32750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114740      LOC_Os01g32750          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g32750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0114740      LOC_Os01g32750          GO:0140223      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g32750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0114740      LOC_Os01g32750          GO:0140223      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g32750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114740      LOC_Os01g32750          GO:0051090      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g32750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129664      LOC_Os01g33730          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g33730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015665       LOC_Os01g46380          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g46380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -9354,7 +9354,7 @@ GR_gene   GR:012478       LOC_Os01g02240          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g02240          gen
 GR_gene        GR:0157892      LOC_Os01g33400          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g33400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157892      LOC_Os01g33400          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g33400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157892      LOC_Os01g33400          GO:0016597      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g33400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0157892      LOC_Os01g33400          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g33400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0157892      LOC_Os01g33400          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g33400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157892      LOC_Os01g33400          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g33400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142962      LOC_Os01g66860          GO:0004672      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g66860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142962      LOC_Os01g66860          GO:0004674      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g66860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -9527,7 +9527,7 @@ GR_gene   GR:018103       LOC_Os01g57100          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g57100          gen
 GR_gene        GR:018103       LOC_Os01g57100          GO:0006468      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g57100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018103       LOC_Os01g57100          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g57100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018103       LOC_Os01g57100          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g57100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:019669       LOC_Os01g08780          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g08780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:019669       LOC_Os01g08780          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g08780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118399      LOC_Os01g16090          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g16090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118399      LOC_Os01g16090          GO:0003735      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g16090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118399      LOC_Os01g16090          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g16090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -10739,7 +10739,7 @@ GR_gene GR:0153863      LOC_Os01g38960          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g38960          ge
 GR_gene        GR:0153863      LOC_Os01g38960          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g38960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153863      LOC_Os01g38960          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g38960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148938      LOC_Os01g43680          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g43680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0148938      LOC_Os01g43680          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g43680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0148938      LOC_Os01g43680          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g43680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148938      LOC_Os01g43680          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g43680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128759      LOC_Os01g24550          GO:0004197      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g24550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128759      LOC_Os01g24550          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g24550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -10850,7 +10850,7 @@ GR_gene GR:014457       LOC_Os01g18120          GO:0006694      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g18120          gen
 GR_gene        GR:014457       LOC_Os01g18120          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g18120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014457       LOC_Os01g18120          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g18120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014457       LOC_Os01g18120          GO:0009058      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g18120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:014457       LOC_Os01g18120          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g18120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:014457       LOC_Os01g18120          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g18120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014457       LOC_Os01g18120          GO:0044237      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g18120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:014457       LOC_Os01g18120          GO:0050662      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g18120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018946       LOC_Os01g62410          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g62410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -11189,7 +11189,7 @@ GR_gene GR:0117821      LOC_Os01g39380          GO:0006810      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g39380          ge
 GR_gene        GR:0120238      LOC_Os01g42030          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g42030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120238      LOC_Os01g42030          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g42030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120238      LOC_Os01g42030          GO:0017111      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g42030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0129584      LOC_Os01g18880          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g18880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0129584      LOC_Os01g18880          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g18880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129584      LOC_Os01g18880          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g18880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129584      LOC_Os01g18880          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g18880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013671       LOC_Os01g16180          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g16180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -11530,7 +11530,7 @@ GR_gene GR:0117376      LOC_Os01g17990          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g17990          ge
 GR_gene        GR:0117376      LOC_Os01g17990          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g17990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117376      LOC_Os01g17990          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g17990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117376      LOC_Os01g17990          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g17990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0117376      LOC_Os01g17990          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g17990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0117376      LOC_Os01g17990          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g17990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155709      LOC_Os01g60140          GO:0006812      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g60140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0155709      LOC_Os01g60140          GO:0015299      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g60140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155709      LOC_Os01g60140          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g60140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -11552,7 +11552,7 @@ GR_gene GR:0132385      LOC_Os01g61920          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g61920          ge
 GR_gene        GR:0132385      LOC_Os01g61920          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g61920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132385      LOC_Os01g61920          GO:0006334      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g61920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132385      LOC_Os01g61920          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g61920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0132385      LOC_Os01g61920          GO:0140223      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g61920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0132385      LOC_Os01g61920          GO:0140223      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g61920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118618      LOC_Os01g19030          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g19030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118618      LOC_Os01g19030          GO:0004252      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g19030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118618      LOC_Os01g19030          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g19030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -11565,7 +11565,7 @@ GR_gene GR:0150635      LOC_Os01g08190          GO:0007165      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g08190          ge
 GR_gene        GR:0150635      LOC_Os01g08190          GO:0008601      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g08190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150635      LOC_Os01g08190          GO:0015986      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g08190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150635      LOC_Os01g08190          GO:0016820      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g08190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0150635      LOC_Os01g08190          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g08190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0150635      LOC_Os01g08190          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g08190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150635      LOC_Os01g08190          GO:0033178      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g08190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110546      LOC_Os01g74230          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g74230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110546      LOC_Os01g74230          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g74230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -11636,7 +11636,7 @@ GR_gene GR:0135804      LOC_Os01g19694          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g19694          ge
 GR_gene        GR:0135804      LOC_Os01g19694          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g19694          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135804      LOC_Os01g19694          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g19694          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135804      LOC_Os01g19694          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g19694          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0135804      LOC_Os01g19694          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g19694          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0135804      LOC_Os01g19694          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g19694          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135804      LOC_Os01g19694          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g19694          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121283      LOC_Os01g06510          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g06510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121283      LOC_Os01g06510          GO:0004812      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g06510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -12698,7 +12698,7 @@ GR_gene GR:0154883      LOC_Os01g63940          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g63940          ge
 GR_gene        GR:0154883      LOC_Os01g63940          GO:0003743      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g63940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154883      LOC_Os01g63940          GO:0005669      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g63940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154883      LOC_Os01g63940          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g63940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0154883      LOC_Os01g63940          GO:0140223      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g63940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0154883      LOC_Os01g63940          GO:0140223      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g63940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115421      LOC_Os01g22710          GO:0003735      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g22710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115421      LOC_Os01g22710          GO:0005215      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g22710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115421      LOC_Os01g22710          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g22710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -13070,7 +13070,7 @@ GR_gene GR:0150306      LOC_Os01g55549          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g55549          ge
 GR_gene        GR:0150306      LOC_Os01g55549          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g55549          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150306      LOC_Os01g55549          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g55549          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150306      LOC_Os01g55549          GO:0016068      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g55549          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0150306      LOC_Os01g55549          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g55549          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0150306      LOC_Os01g55549          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g55549          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150306      LOC_Os01g55549          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g55549          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150306      LOC_Os01g55549          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g55549          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126745      LOC_Os01g69210          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g69210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -13150,7 +13150,7 @@ GR_gene GR:0124187      LOC_Os01g22180          GO:0006333      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g22180          ge
 GR_gene        GR:0124187      LOC_Os01g22180          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g22180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124187      LOC_Os01g22180          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g22180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124187      LOC_Os01g22180          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g22180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0136582      LOC_Os01g48600          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g48600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0136582      LOC_Os01g48600          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g48600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0136582      LOC_Os01g48600          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g48600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111415      LOC_Os01g38680          GO:0005215      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g38680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111415      LOC_Os01g38680          GO:0006810      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g38680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -14699,7 +14699,7 @@ GR_gene GR:0123134      LOC_Os01g47610          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g47610          ge
 GR_gene        GR:0120060      LOC_Os01g07360          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g07360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120060      LOC_Os01g07360          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g07360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143350      LOC_Os01g72900          GO:0006950      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g72900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0141720      LOC_Os01g36930          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g36930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0141720      LOC_Os01g36930          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g36930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141720      LOC_Os01g36930          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g36930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141720      LOC_Os01g36930          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g36930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141720      LOC_Os01g36930          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g36930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -14754,7 +14754,7 @@ GR_gene GR:014206       LOC_Os01g63270          GO:0030170      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g63270          gen
 GR_gene        GR:0157318      LOC_Os01g01620          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g01620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0138643      LOC_Os01g05810          GO:0036374      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g05810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137254      LOC_Os01g43950          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g43950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0137254      LOC_Os01g43950          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g43950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0137254      LOC_Os01g43950          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g43950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137254      LOC_Os01g43950          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g43950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017470       LOC_Os01g41260          GO:0016829      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g41260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120745      LOC_Os01g66640          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g66640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -14804,7 +14804,7 @@ GR_gene GR:0155877      LOC_Os01g56690          GO:0005576      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g56690          ge
 GR_gene        GR:0155877      LOC_Os01g56690          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g56690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155877      LOC_Os01g56690          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g56690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155877      LOC_Os01g56690          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g56690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0155877      LOC_Os01g56690          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g56690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0155877      LOC_Os01g56690          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g56690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155877      LOC_Os01g56690          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g56690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141879      LOC_Os01g71810          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g71810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141879      LOC_Os01g71810          GO:0004553      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g71810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -15970,7 +15970,7 @@ GR_gene GR:0157700      LOC_Os01g13590          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g13590          ge
 GR_gene        GR:0157700      LOC_Os01g13590          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g13590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157700      LOC_Os01g13590          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g13590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157700      LOC_Os01g13590          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g13590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0157700      LOC_Os01g13590          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g13590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0157700      LOC_Os01g13590          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g13590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147936      LOC_Os01g35710          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g35710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147936      LOC_Os01g35710          GO:0003723      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g35710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147936      LOC_Os01g35710          GO:0003964      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g35710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -16433,7 +16433,7 @@ GR_gene GR:0137560      LOC_Os01g01660          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g01660          ge
 GR_gene        GR:0137560      LOC_Os01g01660          GO:0005576      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g01660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137560      LOC_Os01g01660          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g01660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137560      LOC_Os01g01660          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g01660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0137560      LOC_Os01g01660          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g01660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0137560      LOC_Os01g01660          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g01660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137560      LOC_Os01g01660          GO:0044237      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g01660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0137560      LOC_Os01g01660          GO:0050662      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g01660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013031       LOC_Os01g05970          GO:0000785      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g05970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -16945,7 +16945,7 @@ GR_gene GR:0152433      LOC_Os01g70400          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g70400          ge
 GR_gene        GR:0152433      LOC_Os01g70400          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g70400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141247      LOC_Os01g14110          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g14110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141247      LOC_Os01g14110          GO:0016068      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g14110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0141247      LOC_Os01g14110          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g14110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0141247      LOC_Os01g14110          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g14110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141247      LOC_Os01g14110          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g14110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135740      LOC_Os01g66720          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g66720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135740      LOC_Os01g66720          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g66720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -17189,7 +17189,7 @@ GR_gene GR:0127416      LOC_Os01g73320          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g73320          ge
 GR_gene        GR:0127416      LOC_Os01g73320          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g73320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127416      LOC_Os01g73320          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g73320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127915      LOC_Os01g23630          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g23630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0127915      LOC_Os01g23630          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g23630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0127915      LOC_Os01g23630          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g23630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127915      LOC_Os01g23630          GO:0005667      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g23630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127915      LOC_Os01g23630          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g23630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120887      LOC_Os01g01115          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g01115          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -17429,7 +17429,7 @@ GR_gene GR:0129068      LOC_Os01g62820          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g62820          ge
 GR_gene        GR:0129068      LOC_Os01g62820          GO:0003743      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g62820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129068      LOC_Os01g62820          GO:0005669      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g62820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129068      LOC_Os01g62820          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g62820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0129068      LOC_Os01g62820          GO:0140223      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g62820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0129068      LOC_Os01g62820          GO:0140223      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g62820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0138529      LOC_Os01g34790          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g34790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0138529      LOC_Os01g34790          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g34790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0138529      LOC_Os01g34790          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g34790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -17645,7 +17645,7 @@ GR_gene GR:0150699      LOC_Os01g17000          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g17000          ge
 GR_gene        GR:0129324      LOC_Os01g53390          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g53390          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129324      LOC_Os01g53390          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g53390          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129324      LOC_Os01g53390          GO:0016758      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g53390          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0117333      LOC_Os01g56490          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g56490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0117333      LOC_Os01g56490          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g56490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117333      LOC_Os01g56490          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g56490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117333      LOC_Os01g56490          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g56490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117333      LOC_Os01g56490          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g56490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -18580,7 +18580,7 @@ GR_gene GR:0157279      LOC_Os01g58240          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g58240          ge
 GR_gene        GR:0157279      LOC_Os01g58240          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g58240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157279      LOC_Os01g58240          GO:0042802      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g58240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157279      LOC_Os01g58240          GO:0043086      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g58240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0129011      LOC_Os01g08200          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g08200          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0129011      LOC_Os01g08200          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g08200          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129011      LOC_Os01g08200          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g08200          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129011      LOC_Os01g08200          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g08200          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129011      LOC_Os01g08200          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g08200          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -18654,7 +18654,7 @@ GR_gene GR:0126489      LOC_Os01g01650          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g01650          ge
 GR_gene        GR:0126489      LOC_Os01g01650          GO:0005576      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g01650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126489      LOC_Os01g01650          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g01650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126489      LOC_Os01g01650          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g01650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0126489      LOC_Os01g01650          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g01650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0126489      LOC_Os01g01650          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g01650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118040      LOC_Os01g40800          GO:0016627      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g40800          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012782       LOC_Os01g39134          GO:0005509      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g39134          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156446      LOC_Os01g64540          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g64540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -18904,7 +18904,7 @@ GR_gene GR:0126455      LOC_Os01g53930          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g53930          ge
 GR_gene        GR:0126455      LOC_Os01g53930          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g53930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126455      LOC_Os01g53930          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g53930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126455      LOC_Os01g53930          GO:0016773      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g53930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0126455      LOC_Os01g53930          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g53930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0126455      LOC_Os01g53930          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g53930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126455      LOC_Os01g53930          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g53930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126969      LOC_Os01g02290          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g02290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126969      LOC_Os01g02290          GO:0004672      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g02290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -19623,7 +19623,7 @@ GR_gene GR:0143259      LOC_Os01g55640          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g55640          ge
 GR_gene        GR:0143259      LOC_Os01g55640          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g55640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143259      LOC_Os01g55640          GO:0016567      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g55640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143259      LOC_Os01g55640          GO:0016881      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g55640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0141818      LOC_Os01g43040          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g43040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0141818      LOC_Os01g43040          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g43040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141818      LOC_Os01g43040          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g43040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141818      LOC_Os01g43040          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g43040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141818      LOC_Os01g43040          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g43040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -20879,7 +20879,7 @@ GR_gene GR:0141382      LOC_Os01g25880          GO:0015937      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g25880          ge
 GR_gene        GR:0141382      LOC_Os01g25880          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g25880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141382      LOC_Os01g25880          GO:0016773      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g25880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151635      LOC_Os01g01870          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g01870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0151635      LOC_Os01g01870          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g01870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0151635      LOC_Os01g01870          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g01870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151635      LOC_Os01g01870          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g01870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135321      LOC_Os01g55040          GO:0000148      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g55040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135321      LOC_Os01g55040          GO:0003843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g55040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -20981,7 +20981,7 @@ GR_gene GR:0124302      LOC_Os01g64150          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g64150          ge
 GR_gene        GR:0111130      LOC_Os01g18080          GO:0004872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g18080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111130      LOC_Os01g18080          GO:0005199      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g18080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111130      LOC_Os01g18080          GO:0045735      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g18080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0114467      LOC_Os01g73890          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g73890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0114467      LOC_Os01g73890          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g73890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114467      LOC_Os01g73890          GO:0005672      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g73890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114467      LOC_Os01g73890          GO:0006367      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g73890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150075      LOC_Os01g49340          GO:0004969      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g49340          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -21137,7 +21137,7 @@ GR_gene GR:0112543      LOC_Os01g58950          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g58950          ge
 GR_gene        GR:0132339      LOC_Os01g50060          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g50060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132339      LOC_Os01g50060          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g50060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132339      LOC_Os01g50060          GO:0030170      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g50060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0136795      LOC_Os01g56550          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g56550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0136795      LOC_Os01g56550          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g56550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0136795      LOC_Os01g56550          GO:0003743      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g56550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0136795      LOC_Os01g56550          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g56550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0136795      LOC_Os01g56550          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g56550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -21320,7 +21320,7 @@ GR_gene GR:0118092      LOC_Os01g62920          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g62920          ge
 GR_gene        GR:0118092      LOC_Os01g62920          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g62920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118092      LOC_Os01g62920          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g62920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118092      LOC_Os01g62920          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g62920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0118092      LOC_Os01g62920          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g62920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0118092      LOC_Os01g62920          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g62920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118092      LOC_Os01g62920          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g62920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118092      LOC_Os01g62920          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g62920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121109      LOC_Os01g40900          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g40900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -21837,7 +21837,7 @@ GR_gene GR:0116242      LOC_Os01g57890          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g57890          ge
 GR_gene        GR:0116242      LOC_Os01g57890          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g57890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116242      LOC_Os01g57890          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g57890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116242      LOC_Os01g57890          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g57890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0116242      LOC_Os01g57890          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g57890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0116242      LOC_Os01g57890          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g57890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116242      LOC_Os01g57890          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g57890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116242      LOC_Os01g57890          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g57890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146222      LOC_Os01g54650          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g54650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -21868,7 +21868,7 @@ GR_gene GR:013083       LOC_Os01g60410          GO:0019787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g60410          gen
 GR_gene        GR:013083       LOC_Os01g60410          GO:0019941      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g60410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013083       LOC_Os01g60410          GO:0043687      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g60410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013083       LOC_Os01g60410          GO:0051246      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g60410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0157024      LOC_Os01g51890          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g51890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0157024      LOC_Os01g51890          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g51890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113278      LOC_Os01g57040          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g57040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113278      LOC_Os01g57040          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g57040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113278      LOC_Os01g57040          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g57040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -21882,7 +21882,7 @@ GR_gene GR:0114822      LOC_Os01g45570          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g45570          ge
 GR_gene        GR:0114822      LOC_Os01g45570          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g45570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114822      LOC_Os01g45570          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g45570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114822      LOC_Os01g45570          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g45570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0114822      LOC_Os01g45570          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g45570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0114822      LOC_Os01g45570          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g45570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114822      LOC_Os01g45570          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g45570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114822      LOC_Os01g45570          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g45570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013265       LOC_Os01g15910          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g15910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -22098,7 +22098,7 @@ GR_gene GR:0114843      LOC_Os01g70525          GO:0009239      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g70525          ge
 GR_gene        GR:0114843      LOC_Os01g70525          GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g70525          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0114843      LOC_Os01g70525          GO:0055114      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g70525          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111760      LOC_Os01g64660          GO:0000287      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g64660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0111760      LOC_Os01g64660          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g64660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0111760      LOC_Os01g64660          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g64660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111760      LOC_Os01g64660          GO:0005737      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g64660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111760      LOC_Os01g64660          GO:0005975      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g64660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111760      LOC_Os01g64660          GO:0006810      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g64660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -22268,7 +22268,7 @@ GR_gene GR:018131       LOC_Os01g05900          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g05900          gen
 GR_gene        GR:018131       LOC_Os01g05900          GO:0005694      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g05900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018131       LOC_Os01g05900          GO:0006334      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g05900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112159      LOC_Os01g48810          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g48810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0112159      LOC_Os01g48810          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g48810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0112159      LOC_Os01g48810          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g48810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112159      LOC_Os01g48810          GO:0003743      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g48810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112159      LOC_Os01g48810          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g48810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112159      LOC_Os01g48810          GO:0006367      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g48810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -22360,7 +22360,7 @@ GR_gene GR:0150822      LOC_Os01g70140          GO:0019941      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g70140          ge
 GR_gene        GR:0150822      LOC_Os01g70140          GO:0043687      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g70140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150822      LOC_Os01g70140          GO:0051246      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g70140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012131       LOC_Os01g01840          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os01g01840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:012131       LOC_Os01g01840          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g01840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:012131       LOC_Os01g01840          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g01840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012131       LOC_Os01g01840          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g01840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143344      LOC_Os01g02900          GO:0016757      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g02900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148488      LOC_Os01g39800          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g39800          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -23521,7 +23521,7 @@ GR_gene GR:0153725      LOC_Os01g13610          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g13610          ge
 GR_gene        GR:0153725      LOC_Os01g13610          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g13610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153725      LOC_Os01g13610          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g13610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153725      LOC_Os01g13610          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g13610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0153725      LOC_Os01g13610          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g13610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0153725      LOC_Os01g13610          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g13610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153725      LOC_Os01g13610          GO:0044237      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g13610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0153725      LOC_Os01g13610          GO:0050662      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g13610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137489      LOC_Os01g13480          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g13480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -23910,7 +23910,7 @@ GR_gene GR:0155880      LOC_Os01g69030          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g69030          ge
 GR_gene        GR:0155880      LOC_Os01g69030          GO:0009058      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g69030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155880      LOC_Os01g69030          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g69030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155880      LOC_Os01g69030          GO:0016757      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g69030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0155880      LOC_Os01g69030          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os01g69030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0155880      LOC_Os01g69030          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g69030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155880      LOC_Os01g69030          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g69030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155880      LOC_Os01g69030          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os01g69030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155880      LOC_Os01g69030          GO:0046524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os01g69030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -24466,7 +24466,7 @@ GR_gene GR:016223       LOC_Os02g13970          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g13970          gen
 GR_gene        GR:016223       LOC_Os02g13970          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g13970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016223       LOC_Os02g13970          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g13970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016223       LOC_Os02g13970          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g13970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:016223       LOC_Os02g13970          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g13970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:016223       LOC_Os02g13970          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g13970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131911      LOC_Os02g12970          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g12970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131911      LOC_Os02g12970          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g12970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131911      LOC_Os02g12970          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g12970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -24739,7 +24739,7 @@ GR_gene GR:016318       LOC_Os02g05700          GO:0019941      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g05700          gen
 GR_gene        GR:016318       LOC_Os02g05700          GO:0048511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g05700          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016318       LOC_Os02g05700          GO:0050896      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g05700          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115450      LOC_Os02g51320          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g51320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0115450      LOC_Os02g51320          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g51320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0115450      LOC_Os02g51320          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g51320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115450      LOC_Os02g51320          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g51320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131195      LOC_Os02g38080          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g38080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131195      LOC_Os02g38080          GO:0004672      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g38080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -25143,7 +25143,7 @@ GR_gene GR:0153952      LOC_Os02g22070          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g22070          ge
 GR_gene        GR:0153952      LOC_Os02g22070          GO:0005840      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g22070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153952      LOC_Os02g22070          GO:0006412      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g22070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114169      LOC_Os02g54120          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g54120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0114169      LOC_Os02g54120          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g54120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0114169      LOC_Os02g54120          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g54120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114169      LOC_Os02g54120          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g54120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121258      LOC_Os02g43194          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g43194          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121258      LOC_Os02g43194          GO:0004030      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g43194          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -25167,7 +25167,7 @@ GR_gene GR:0113591      LOC_Os02g43330          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g43330          ge
 GR_gene        GR:0113591      LOC_Os02g43330          GO:0006265      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g43330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113591      LOC_Os02g43330          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g43330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113591      LOC_Os02g43330          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g43330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0113591      LOC_Os02g43330          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g43330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0113591      LOC_Os02g43330          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g43330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113591      LOC_Os02g43330          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g43330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113591      LOC_Os02g43330          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g43330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118443      LOC_Os02g16600          GO:0005249      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g16600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -25222,7 +25222,7 @@ GR_gene GR:0132726      LOC_Os02g18140          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g18140          ge
 GR_gene        GR:0132726      LOC_Os02g18140          GO:0006915      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g18140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132726      LOC_Os02g18140          GO:0006952      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g18140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132726      LOC_Os02g18140          GO:0017111      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g18140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0132726      LOC_Os02g18140          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g18140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0132726      LOC_Os02g18140          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g18140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132726      LOC_Os02g18140          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g18140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151402      LOC_Os02g05820          GO:0004672      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g05820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151402      LOC_Os02g05820          GO:0004674      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g05820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -25563,7 +25563,7 @@ GR_gene GR:015361       LOC_Os02g16450          GO:0005525      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g16450          gen
 GR_gene        GR:015361       LOC_Os02g16450          GO:0005737      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g16450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122184      LOC_Os02g56390          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g56390          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122184      LOC_Os02g56390          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g56390          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:017289       LOC_Os02g43760          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g43760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:017289       LOC_Os02g43760          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g43760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017289       LOC_Os02g43760          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g43760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017289       LOC_Os02g43760          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g43760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144521      LOC_Os02g15000          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g15000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -25824,7 +25824,7 @@ GR_gene GR:0145015      LOC_Os02g05640          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g05640          ge
 GR_gene        GR:0145015      LOC_Os02g05640          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g05640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145015      LOC_Os02g05640          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g05640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145015      LOC_Os02g05640          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g05640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0145015      LOC_Os02g05640          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g05640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0145015      LOC_Os02g05640          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g05640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145015      LOC_Os02g05640          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g05640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145015      LOC_Os02g05640          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g05640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118611      LOC_Os02g38940          GO:0004497      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g38940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -26023,7 +26023,7 @@ GR_gene GR:0114189      LOC_Os02g04510          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g04510          ge
 GR_gene        GR:0114189      LOC_Os02g04510          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g04510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114189      LOC_Os02g04510          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g04510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114189      LOC_Os02g04510          GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g04510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0114189      LOC_Os02g04510          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g04510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0114189      LOC_Os02g04510          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g04510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132646      LOC_Os02g09930          GO:0005794      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g09930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132646      LOC_Os02g09930          GO:0071555      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g09930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132646      LOC_Os02g09930          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g09930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -26611,7 +26611,7 @@ GR_gene GR:0111954      LOC_Os02g32670          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g32670          ge
 GR_gene        GR:0111954      LOC_Os02g32670          GO:0017111      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g32670          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111934      LOC_Os02g15550          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g15550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111934      LOC_Os02g15550          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g15550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0116465      LOC_Os02g56170          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g56170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0116465      LOC_Os02g56170          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g56170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116465      LOC_Os02g56170          GO:0006790      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g56170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116465      LOC_Os02g56170          GO:0008441      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g56170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012934       LOC_Os02g26810          GO:0004497      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g26810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -26644,7 +26644,7 @@ GR_gene GR:0134699      LOC_Os02g28680          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g28680          ge
 GR_gene        GR:0134699      LOC_Os02g28680          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g28680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141845      LOC_Os02g27430          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g27430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141845      LOC_Os02g27430          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g27430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0141845      LOC_Os02g27430          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g27430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0141845      LOC_Os02g27430          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g27430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141845      LOC_Os02g27430          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g27430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130157      LOC_Os02g47870          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g47870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130157      LOC_Os02g47870          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g47870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -26661,7 +26661,7 @@ GR_gene GR:0152574      LOC_Os02g57180          GO:0006694      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g57180          ge
 GR_gene        GR:0152574      LOC_Os02g57180          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g57180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152574      LOC_Os02g57180          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g57180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152574      LOC_Os02g57180          GO:0008831      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g57180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0152574      LOC_Os02g57180          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g57180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0152574      LOC_Os02g57180          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g57180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152574      LOC_Os02g57180          GO:0044237      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g57180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152574      LOC_Os02g57180          GO:0045226      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g57180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0152574      LOC_Os02g57180          GO:0050662      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g57180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -28609,7 +28609,7 @@ GR_gene GR:0146383      LOC_Os02g09359          GO:0004872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g09359          ge
 GR_gene        GR:0146383      LOC_Os02g09359          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g09359          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146383      LOC_Os02g09359          GO:0006468      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g09359          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146383      LOC_Os02g09359          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g09359          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0152533      LOC_Os02g26550          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g26550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0152533      LOC_Os02g26550          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g26550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152533      LOC_Os02g26550          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g26550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152533      LOC_Os02g26550          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g26550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016580       LOC_Os02g49490          GO:0000785      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g49490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -28743,7 +28743,7 @@ GR_gene GR:0125596      LOC_Os02g35770          GO:0005737      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g35770          ge
 GR_gene        GR:0125596      LOC_Os02g35770          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g35770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125596      LOC_Os02g35770          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g35770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125596      LOC_Os02g35770          GO:0006457      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g35770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0125596      LOC_Os02g35770          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g35770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0125596      LOC_Os02g35770          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g35770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125596      LOC_Os02g35770          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g35770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125596      LOC_Os02g35770          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g35770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142357      LOC_Os02g20660          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g20660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -28781,7 +28781,7 @@ GR_gene GR:0158308      LOC_Os02g10660          GO:0043169      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g10660          ge
 GR_gene        GR:0115771      LOC_Os02g05550          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g05550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115771      LOC_Os02g05550          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g05550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115771      LOC_Os02g05550          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g05550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:012919       LOC_Os02g07350          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g07350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:012919       LOC_Os02g07350          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g07350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012919       LOC_Os02g07350          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g07350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012919       LOC_Os02g07350          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g07350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012919       LOC_Os02g07350          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g07350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -29277,7 +29277,7 @@ GR_gene GR:0142599      LOC_Os02g26720          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g26720          ge
 GR_gene        GR:0142599      LOC_Os02g26720          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g26720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142599      LOC_Os02g26720          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g26720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142599      LOC_Os02g26720          GO:0032957      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g26720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0142599      LOC_Os02g26720          GO:0051766      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g26720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0142599      LOC_Os02g26720          GO:0051766      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g26720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142599      LOC_Os02g26720          GO:0047325      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g26720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016857       LOC_Os02g35440          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g35440          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016857       LOC_Os02g35440          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g35440          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -29693,7 +29693,7 @@ GR_gene GR:0149799      LOC_Os02g58270          GO:0005506      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g58270          ge
 GR_gene        GR:0149799      LOC_Os02g58270          GO:0009055      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g58270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149799      LOC_Os02g58270          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g58270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151259      LOC_Os02g54870          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g54870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0151259      LOC_Os02g54870          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g54870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0151259      LOC_Os02g54870          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g54870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151259      LOC_Os02g54870          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g54870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015222       LOC_Os02g42940          GO:0005198      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g42940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154927      LOC_Os02g12850          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g12850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -30105,7 +30105,7 @@ GR_gene GR:0131523      LOC_Os02g02100          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g02100          ge
 GR_gene        GR:0135794      LOC_Os02g37230          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g37230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135794      LOC_Os02g37230          GO:0005737      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g37230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135794      LOC_Os02g37230          GO:0006457      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g37230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:017944       LOC_Os02g36400          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g36400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:017944       LOC_Os02g36400          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g36400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017944       LOC_Os02g36400          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g36400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017944       LOC_Os02g36400          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g36400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017944       LOC_Os02g36400          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g36400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -30258,7 +30258,7 @@ GR_gene GR:0140902      LOC_Os02g55720          GO:0007049      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g55720          ge
 GR_gene        GR:0140902      LOC_Os02g55720          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g55720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140902      LOC_Os02g55720          GO:0051301      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g55720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017063       LOC_Os02g13670          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g13670          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:017063       LOC_Os02g13670          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g13670          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:017063       LOC_Os02g13670          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g13670          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017063       LOC_Os02g13670          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g13670          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114112      LOC_Os02g16510          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g16510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111104      LOC_Os02g43640          GO:0004937      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g43640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -30602,7 +30602,7 @@ GR_gene GR:019863       LOC_Os02g08544          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g08544          gen
 GR_gene        GR:019863       LOC_Os02g08544          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g08544          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019863       LOC_Os02g08544          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g08544          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019863       LOC_Os02g08544          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g08544          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:019863       LOC_Os02g08544          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g08544          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:019863       LOC_Os02g08544          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g08544          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019863       LOC_Os02g08544          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g08544          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019863       LOC_Os02g08544          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g08544          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019863       LOC_Os02g08544          GO:0051260      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g08544          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -30742,7 +30742,7 @@ GR_gene GR:0123067      LOC_Os02g29260          GO:0004553      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g29260          ge
 GR_gene        GR:0123067      LOC_Os02g29260          GO:0005975      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g29260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123067      LOC_Os02g29260          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g29260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123067      LOC_Os02g29260          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g29260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0137461      LOC_Os02g57630          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g57630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0137461      LOC_Os02g57630          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g57630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137461      LOC_Os02g57630          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g57630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137461      LOC_Os02g57630          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g57630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137461      LOC_Os02g57630          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g57630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -31156,7 +31156,7 @@ GR_gene GR:0149114      LOC_Os02g45250          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g45250          ge
 GR_gene        GR:0149114      LOC_Os02g45250          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g45250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149114      LOC_Os02g45250          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g45250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149114      LOC_Os02g45250          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g45250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0149114      LOC_Os02g45250          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g45250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0149114      LOC_Os02g45250          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g45250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149114      LOC_Os02g45250          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g45250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149114      LOC_Os02g45250          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g45250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147525      LOC_Os02g25900          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g25900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -32327,7 +32327,7 @@ GR_gene GR:0148101      LOC_Os02g54020          GO:0004386      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g54020          ge
 GR_gene        GR:0148101      LOC_Os02g54020          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g54020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148101      LOC_Os02g54020          GO:0006310      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g54020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148101      LOC_Os02g54020          GO:0008026      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g54020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0115921      LOC_Os02g46650          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g46650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0115921      LOC_Os02g46650          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g46650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115921      LOC_Os02g46650          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g46650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112807      LOC_Os02g17090          GO:0004252      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g17090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112807      LOC_Os02g17090          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g17090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -32639,7 +32639,7 @@ GR_gene GR:0140482      LOC_Os02g58520          GO:0005509      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g58520          ge
 GR_gene        GR:0140482      LOC_Os02g58520          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g58520          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140482      LOC_Os02g58520          GO:0006468      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g58520          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140482      LOC_Os02g58520          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g58520          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0116867      LOC_Os02g55180          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g55180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0116867      LOC_Os02g55180          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g55180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116867      LOC_Os02g55180          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g55180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116867      LOC_Os02g55180          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g55180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116867      LOC_Os02g55180          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g55180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -32779,7 +32779,7 @@ GR_gene GR:0142832      LOC_Os02g50840          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g50840          ge
 GR_gene        GR:0142832      LOC_Os02g50840          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g50840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142832      LOC_Os02g50840          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g50840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142832      LOC_Os02g50840          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g50840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0142832      LOC_Os02g50840          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g50840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0142832      LOC_Os02g50840          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g50840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140894      LOC_Os02g14530          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g14530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140894      LOC_Os02g14530          GO:0004672      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g14530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140894      LOC_Os02g14530          GO:0004674      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g14530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -33498,7 +33498,7 @@ GR_gene GR:0118559      LOC_Os02g24604          GO:0009579      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g24604          ge
 GR_gene        GR:0118559      LOC_Os02g24604          GO:0015979      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g24604          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118559      LOC_Os02g24604          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g24604          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017131       LOC_Os02g45170          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g45170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:017131       LOC_Os02g45170          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g45170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:017131       LOC_Os02g45170          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g45170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017131       LOC_Os02g45170          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g45170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133872      LOC_Os02g11770          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g11770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133872      LOC_Os02g11770          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g11770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -33646,7 +33646,7 @@ GR_gene GR:0119981      LOC_Os02g43430          GO:0004674      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g43430          ge
 GR_gene        GR:0119981      LOC_Os02g43430          GO:0004713      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g43430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0119981      LOC_Os02g43430          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g43430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0119981      LOC_Os02g43430          GO:0006468      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g43430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0125042      LOC_Os02g08370          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g08370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0125042      LOC_Os02g08370          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g08370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125042      LOC_Os02g08370          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g08370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125042      LOC_Os02g08370          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g08370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125042      LOC_Os02g08370          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g08370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -34116,7 +34116,7 @@ GR_gene GR:0135167      LOC_Os02g19380          GO:0005576      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g19380          ge
 GR_gene        GR:0116927      LOC_Os02g35160          GO:0003723      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g35160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116927      LOC_Os02g35160          GO:0003743      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g35160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116927      LOC_Os02g35160          GO:0006413      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g35160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:018257       LOC_Os02g14730          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g14730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:018257       LOC_Os02g14730          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g14730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018257       LOC_Os02g14730          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g14730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018257       LOC_Os02g14730          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g14730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018257       LOC_Os02g14730          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g14730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -34324,7 +34324,7 @@ GR_gene GR:0135943      LOC_Os02g47610          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g47610          ge
 GR_gene        GR:0135943      LOC_Os02g47610          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g47610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135943      LOC_Os02g47610          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g47610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135943      LOC_Os02g47610          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g47610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0135943      LOC_Os02g47610          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g47610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0135943      LOC_Os02g47610          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g47610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135458      LOC_Os02g46380          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g46380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135458      LOC_Os02g46380          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g46380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141870      LOC_Os02g28330          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g28330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -34566,7 +34566,7 @@ GR_gene GR:019538       LOC_Os02g45120          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g45120          gen
 GR_gene        GR:019538       LOC_Os02g45120          GO:0003899      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g45120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019538       LOC_Os02g45120          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g45120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019538       LOC_Os02g45120          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g45120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:019538       LOC_Os02g45120          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g45120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:019538       LOC_Os02g45120          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g45120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019538       LOC_Os02g45120          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g45120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019538       LOC_Os02g45120          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g45120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139275      LOC_Os02g10070          GO:0004108      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g10070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -34575,7 +34575,7 @@ GR_gene GR:0139275      LOC_Os02g10070          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g10070          ge
 GR_gene        GR:0139275      LOC_Os02g10070          GO:0044262      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g10070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139275      LOC_Os02g10070          GO:0046912      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g10070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145165      LOC_Os02g51590          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g51590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0145165      LOC_Os02g51590          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g51590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0145165      LOC_Os02g51590          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g51590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145165      LOC_Os02g51590          GO:0006096      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g51590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145165      LOC_Os02g51590          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g51590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145165      LOC_Os02g51590          GO:0016853      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g51590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -34979,7 +34979,7 @@ GR_gene GR:0121866      LOC_Os02g50850          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g50850          ge
 GR_gene        GR:0121866      LOC_Os02g50850          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g50850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121866      LOC_Os02g50850          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g50850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121866      LOC_Os02g50850          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g50850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0121866      LOC_Os02g50850          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g50850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0121866      LOC_Os02g50850          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g50850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124841      LOC_Os02g07170          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g07170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124841      LOC_Os02g07170          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g07170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120322      LOC_Os02g49140          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g49140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -34999,7 +34999,7 @@ GR_gene GR:0118538      LOC_Os02g03280          GO:0043066      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g03280          ge
 GR_gene        GR:0118538      LOC_Os02g03280          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g03280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118538      LOC_Os02g03280          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g03280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118538      LOC_Os02g03280          GO:0043066      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g03280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0157538      LOC_Os02g51600          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g51600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0157538      LOC_Os02g51600          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g51600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016174       LOC_Os02g55270          GO:0004721      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g55270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016174       LOC_Os02g55270          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g55270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016174       LOC_Os02g55270          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g55270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -35014,7 +35014,7 @@ GR_gene GR:0122733      LOC_Os02g20120          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g20120          ge
 GR_gene        GR:0122733      LOC_Os02g20120          GO:0008483      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g20120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122733      LOC_Os02g20120          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g20120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016611       LOC_Os02g46930          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g46930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0153626      LOC_Os02g27620          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g27620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0153626      LOC_Os02g27620          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g27620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140356      LOC_Os02g56690          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g56690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140356      LOC_Os02g56690          GO:0003854      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g56690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140356      LOC_Os02g56690          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g56690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -35141,7 +35141,7 @@ GR_gene GR:019141       LOC_Os02g06360          GO:0016853      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g06360          gen
 GR_gene        GR:0142659      LOC_Os02g33320          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g33320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142659      LOC_Os02g33320          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g33320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152531      LOC_Os02g36510          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g36510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0152531      LOC_Os02g36510          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g36510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0152531      LOC_Os02g36510          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g36510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153118      LOC_Os02g55030          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g55030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019064       LOC_Os02g35730          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g35730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019064       LOC_Os02g35730          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g35730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -35311,7 +35311,7 @@ GR_gene GR:0126870      LOC_Os02g58620          GO:0017153      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g58620          ge
 GR_gene        GR:0155864      LOC_Os02g21500          GO:0004939      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g21500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155864      LOC_Os02g21500          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g21500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155864      LOC_Os02g21500          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g21500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0145373      LOC_Os02g32540          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g32540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0145373      LOC_Os02g32540          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g32540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145373      LOC_Os02g32540          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g32540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145373      LOC_Os02g32540          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g32540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018367       LOC_Os02g33000          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g33000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -35524,7 +35524,7 @@ GR_gene GR:0125182      LOC_Os02g49700          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g49700          ge
 GR_gene        GR:0125182      LOC_Os02g49700          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g49700          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125182      LOC_Os02g49700          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g49700          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125182      LOC_Os02g49700          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g49700          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0125182      LOC_Os02g49700          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g49700          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0125182      LOC_Os02g49700          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g49700          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125182      LOC_Os02g49700          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g49700          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125182      LOC_Os02g49700          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g49700          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147908      LOC_Os02g01480          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g01480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -35835,7 +35835,7 @@ GR_gene GR:0120987      LOC_Os02g42040          GO:0016070      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g42040          ge
 GR_gene        GR:0121444      LOC_Os02g49070          GO:0008060      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g49070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121444      LOC_Os02g49070          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g49070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121444      LOC_Os02g49070          GO:0043087      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g49070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:016657       LOC_Os02g07970          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g07970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:016657       LOC_Os02g07970          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g07970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016657       LOC_Os02g07970          GO:0005672      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g07970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016657       LOC_Os02g07970          GO:0006367      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g07970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132649      LOC_Os02g57640          GO:0003723      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g57640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -35850,7 +35850,7 @@ GR_gene GR:0111047      LOC_Os02g45940          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g45940          ge
 GR_gene        GR:0111047      LOC_Os02g45940          GO:0005694      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g45940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111047      LOC_Os02g45940          GO:0006334      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g45940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111047      LOC_Os02g45940          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g45940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0111047      LOC_Os02g45940          GO:0140223      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g45940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0111047      LOC_Os02g45940          GO:0140223      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g45940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013202       LOC_Os02g07650          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g07650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013202       LOC_Os02g07650          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g07650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137972      LOC_Os02g58560          GO:0000148      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g58560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -36458,7 +36458,7 @@ GR_gene GR:0150632      LOC_Os02g13310          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g13310          ge
 GR_gene        GR:0150632      LOC_Os02g13310          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g13310          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150632      LOC_Os02g13310          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g13310          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150632      LOC_Os02g13310          GO:0016773      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g13310          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0150632      LOC_Os02g13310          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g13310          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0150632      LOC_Os02g13310          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g13310          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150632      LOC_Os02g13310          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g13310          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150632      LOC_Os02g13310          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g13310          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155479      LOC_Os02g21340          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g21340          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -36757,7 +36757,7 @@ GR_gene GR:0118528      LOC_Os02g07575          GO:0006952      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g07575          ge
 GR_gene        GR:012212       LOC_Os02g43750          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g43750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012212       LOC_Os02g43750          GO:0005669      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os02g43750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012212       LOC_Os02g43750          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os02g43750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:012212       LOC_Os02g43750          GO:0140223      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os02g43750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:012212       LOC_Os02g43750          GO:0140223      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g43750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131827      LOC_Os02g16980          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g16980          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131827      LOC_Os02g16980          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g16980          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131827      LOC_Os02g16980          GO:0003723      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os02g16980          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -37493,7 +37493,7 @@ GR_gene GR:013963       LOC_Os03g18470          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g18470          gen
 GR_gene        GR:013963       LOC_Os03g18470          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g18470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013963       LOC_Os03g18470          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g18470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013963       LOC_Os03g18470          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g18470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:013963       LOC_Os03g18470          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g18470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:013963       LOC_Os03g18470          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g18470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124601      LOC_Os03g38540          GO:0005542      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g38540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124601      LOC_Os03g38540          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g38540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124601      LOC_Os03g38540          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g38540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -37593,7 +37593,7 @@ GR_gene GR:0133407      LOC_Os03g62120          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g62120          ge
 GR_gene        GR:0133407      LOC_Os03g62120          GO:0031072      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g62120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120075      LOC_Os03g28260          GO:0006950      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g28260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120075      LOC_Os03g28260          GO:0016068      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g28260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0152766      LOC_Os03g06460          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g06460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0152766      LOC_Os03g06460          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g06460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155542      LOC_Os03g11040          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g11040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155542      LOC_Os03g11040          GO:0007049      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g11040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155542      LOC_Os03g11040          GO:0051301      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g11040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -38344,7 +38344,7 @@ GR_gene GR:0140286      LOC_Os03g08960          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g08960          ge
 GR_gene        GR:0140286      LOC_Os03g08960          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g08960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140286      LOC_Os03g08960          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g08960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140286      LOC_Os03g08960          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g08960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0140286      LOC_Os03g08960          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g08960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0140286      LOC_Os03g08960          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g08960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140286      LOC_Os03g08960          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g08960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140286      LOC_Os03g08960          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g08960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140286      LOC_Os03g08960          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g08960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -38427,7 +38427,7 @@ GR_gene GR:0126046      LOC_Os03g30670          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g30670          ge
 GR_gene        GR:0126046      LOC_Os03g30670          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g30670          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013101       LOC_Os03g62440          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g62440          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013101       LOC_Os03g62440          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g62440          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0134849      LOC_Os03g57270          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g57270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0134849      LOC_Os03g57270          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g57270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134849      LOC_Os03g57270          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g57270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134849      LOC_Os03g57270          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g57270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151587      LOC_Os03g46260          GO:0009055      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g46260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -38535,7 +38535,7 @@ GR_gene GR:0140194      LOC_Os03g40180          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g40180          ge
 GR_gene        GR:0140194      LOC_Os03g40180          GO:0005840      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g40180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140194      LOC_Os03g40180          GO:0006412      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g40180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140194      LOC_Os03g40180          GO:0030529      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g40180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0126866      LOC_Os03g46560          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g46560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0126866      LOC_Os03g46560          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g46560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126866      LOC_Os03g46560          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g46560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126866      LOC_Os03g46560          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g46560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130228      LOC_Os03g47770          GO:0019787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -38687,7 +38687,7 @@ GR_gene GR:0124241      LOC_Os03g01190          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g01190          ge
 GR_gene        GR:0124241      LOC_Os03g01190          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g01190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124241      LOC_Os03g01190          GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g01190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0124241      LOC_Os03g01190          GO:0055114      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g01190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:017963       LOC_Os03g42810          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g42810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:017963       LOC_Os03g42810          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g42810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128589      LOC_Os03g33012          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g33012          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128589      LOC_Os03g33012          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g33012          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128589      LOC_Os03g33012          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g33012          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -39011,7 +39011,7 @@ GR_gene GR:018677       LOC_Os03g14530          GO:0005840      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g14530          gen
 GR_gene        GR:018677       LOC_Os03g14530          GO:0006412      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g14530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018677       LOC_Os03g14530          GO:0015935      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g14530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118253      LOC_Os03g17140          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g17140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0118253      LOC_Os03g17140          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g17140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0118253      LOC_Os03g17140          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g17140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118253      LOC_Os03g17140          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g17140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0131125      LOC_Os03g55830          GO:0004871      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g55830          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131125      LOC_Os03g55830          GO:0004872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g55830          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -39363,7 +39363,7 @@ GR_gene GR:0131524      LOC_Os03g40400          GO:0006950      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g40400          ge
 GR_gene        GR:0131524      LOC_Os03g40400          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g40400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122454      LOC_Os03g22480          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g22480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122454      LOC_Os03g22480          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g22480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0111930      LOC_Os03g50320          GO:0016307      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g50320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0111930      LOC_Os03g50320          GO:0016307      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g50320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111930      LOC_Os03g50320          GO:0004430      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g50320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111930      LOC_Os03g50320          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g50320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111930      LOC_Os03g50320          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g50320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -39826,7 +39826,7 @@ GR_gene GR:0146543      LOC_Os03g47016          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47016          ge
 GR_gene        GR:0146543      LOC_Os03g47016          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47016          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146543      LOC_Os03g47016          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g47016          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146543      LOC_Os03g47016          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g47016          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0146543      LOC_Os03g47016          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g47016          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0146543      LOC_Os03g47016          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47016          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146543      LOC_Os03g47016          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47016          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146543      LOC_Os03g47016          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g47016          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0136334      LOC_Os03g59190          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g59190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -39897,7 +39897,7 @@ GR_gene GR:0124911      LOC_Os03g31992          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g31992          ge
 GR_gene        GR:0124911      LOC_Os03g31992          GO:0004523      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g31992          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124523      LOC_Os03g53910          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g53910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157510      LOC_Os03g22880          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g22880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:016446       LOC_Os03g08350          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g08350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:016446       LOC_Os03g08350          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g08350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016446       LOC_Os03g08350          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g08350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016446       LOC_Os03g08350          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g08350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151631      LOC_Os03g57960          GO:0045735      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g57960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -40479,7 +40479,7 @@ GR_gene GR:0152952      LOC_Os03g07450          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g07450          ge
 GR_gene        GR:0152952      LOC_Os03g07450          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g07450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152952      LOC_Os03g07450          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g07450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152952      LOC_Os03g07450          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g07450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0152952      LOC_Os03g07450          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g07450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0152952      LOC_Os03g07450          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g07450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152952      LOC_Os03g07450          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g07450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152952      LOC_Os03g07450          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g07450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017772       LOC_Os03g44140          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g44140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -40677,7 +40677,7 @@ GR_gene GR:0144410      LOC_Os03g47036          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47036          ge
 GR_gene        GR:0144410      LOC_Os03g47036          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47036          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144410      LOC_Os03g47036          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g47036          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144410      LOC_Os03g47036          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g47036          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0144410      LOC_Os03g47036          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g47036          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0144410      LOC_Os03g47036          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47036          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144410      LOC_Os03g47036          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47036          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019083       LOC_Os03g46170          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g46170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019083       LOC_Os03g46170          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g46170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -40900,7 +40900,7 @@ GR_gene GR:015258       LOC_Os03g03164          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g03164          gen
 GR_gene        GR:015258       LOC_Os03g03164          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g03164          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015258       LOC_Os03g03164          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g03164          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015258       LOC_Os03g03164          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g03164          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:015258       LOC_Os03g03164          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g03164          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:015258       LOC_Os03g03164          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g03164          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015258       LOC_Os03g03164          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g03164          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015258       LOC_Os03g03164          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g03164          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015258       LOC_Os03g03164          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g03164          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -41303,7 +41303,7 @@ GR_gene GR:0120313      LOC_Os03g01230          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g01230          ge
 GR_gene        GR:0120313      LOC_Os03g01230          GO:0003899      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g01230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120313      LOC_Os03g01230          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g01230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120313      LOC_Os03g01230          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g01230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0120313      LOC_Os03g01230          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g01230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0120313      LOC_Os03g01230          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g01230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120313      LOC_Os03g01230          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g01230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139263      LOC_Os03g24020          GO:0003735      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g24020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139263      LOC_Os03g24020          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g24020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -41915,7 +41915,7 @@ GR_gene GR:0120206      LOC_Os03g03260          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g03260          ge
 GR_gene        GR:0120206      LOC_Os03g03260          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g03260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120206      LOC_Os03g03260          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g03260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120206      LOC_Os03g03260          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g03260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0120206      LOC_Os03g03260          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g03260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0120206      LOC_Os03g03260          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g03260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120206      LOC_Os03g03260          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g03260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120206      LOC_Os03g03260          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g03260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123876      LOC_Os03g22180          GO:0003735      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g22180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -42099,7 +42099,7 @@ GR_gene GR:0121563      LOC_Os03g51610          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g51610          ge
 GR_gene        GR:0121563      LOC_Os03g51610          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g51610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121563      LOC_Os03g51610          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g51610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121563      LOC_Os03g51610          GO:0032957      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g51610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0121563      LOC_Os03g51610          GO:0051766      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g51610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0121563      LOC_Os03g51610          GO:0051766      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g51610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121563      LOC_Os03g51610          GO:0047325      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g51610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144959      LOC_Os03g61720          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g61720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144959      LOC_Os03g61720          GO:0016746      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g61720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -42152,7 +42152,7 @@ GR_gene GR:0151537      LOC_Os03g05740          GO:0007165      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g05740          ge
 GR_gene        GR:0151537      LOC_Os03g05740          GO:0007264      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g05740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151537      LOC_Os03g05740          GO:0008134      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g05740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151537      LOC_Os03g05740          GO:0015031      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g05740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0158397      LOC_Os03g44430          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g44430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0158397      LOC_Os03g44430          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g44430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0158397      LOC_Os03g44430          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g44430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0158397      LOC_Os03g44430          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g44430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131331      LOC_Os03g41840          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g41840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -42291,7 +42291,7 @@ GR_gene GR:0121042      LOC_Os03g56140          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g56140          ge
 GR_gene        GR:0121042      LOC_Os03g56140          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g56140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121042      LOC_Os03g56140          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g56140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121042      LOC_Os03g56140          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g56140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0121042      LOC_Os03g56140          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g56140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0121042      LOC_Os03g56140          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g56140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121042      LOC_Os03g56140          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g56140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121042      LOC_Os03g56140          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g56140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127832      LOC_Os03g36330          GO:0000785      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g36330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -42370,7 +42370,7 @@ GR_gene GR:0132707      LOC_Os03g02780          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g02780          ge
 GR_gene        GR:0132707      LOC_Os03g02780          GO:0005694      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g02780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132707      LOC_Os03g02780          GO:0006334      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g02780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132707      LOC_Os03g02780          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g02780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0132707      LOC_Os03g02780          GO:0140223      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g02780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0132707      LOC_Os03g02780          GO:0140223      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g02780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111490      LOC_Os03g33230          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g33230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111490      LOC_Os03g33230          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g33230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111490      LOC_Os03g33230          GO:0003723      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g33230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -42942,7 +42942,7 @@ GR_gene GR:0128131      LOC_Os03g56110          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g56110          ge
 GR_gene        GR:0128131      LOC_Os03g56110          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g56110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128131      LOC_Os03g56110          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g56110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128131      LOC_Os03g56110          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g56110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0128131      LOC_Os03g56110          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g56110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0128131      LOC_Os03g56110          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g56110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128131      LOC_Os03g56110          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g56110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128131      LOC_Os03g56110          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g56110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016103       LOC_Os03g63720          GO:0000175      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g63720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -43135,7 +43135,7 @@ GR_gene GR:0152893      LOC_Os03g46420          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g46420          ge
 GR_gene        GR:0110554      LOC_Os03g11530          GO:0003993      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g11530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110554      LOC_Os03g11530          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g11530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110554      LOC_Os03g11530          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g11530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0117484      LOC_Os03g09260          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g09260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0117484      LOC_Os03g09260          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g09260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117484      LOC_Os03g09260          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g09260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117484      LOC_Os03g09260          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g09260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117484      LOC_Os03g09260          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g09260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -43196,7 +43196,7 @@ GR_gene GR:0126199      LOC_Os03g21540          GO:0006468      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g21540          ge
 GR_gene        GR:0126199      LOC_Os03g21540          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g21540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151597      LOC_Os03g50380          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g50380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151597      LOC_Os03g50380          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g50380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0151597      LOC_Os03g50380          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g50380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0151597      LOC_Os03g50380          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g50380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151597      LOC_Os03g50380          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g50380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144330      LOC_Os03g36910          GO:0008168      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g36910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144330      LOC_Os03g36910          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g36910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -43320,7 +43320,7 @@ GR_gene GR:0125790      LOC_Os03g15360          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g15360          ge
 GR_gene        GR:0125790      LOC_Os03g15360          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g15360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125790      LOC_Os03g15360          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g15360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125790      LOC_Os03g15360          GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g15360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0125790      LOC_Os03g15360          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g15360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0125790      LOC_Os03g15360          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g15360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125790      LOC_Os03g15360          GO:0033788      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g15360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0125790      LOC_Os03g15360          GO:0055114      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g15360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129726      LOC_Os03g08110          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g08110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -43446,7 +43446,7 @@ GR_gene GR:0133634      LOC_Os03g08624          GO:0006694      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g08624          ge
 GR_gene        GR:0133634      LOC_Os03g08624          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g08624          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133634      LOC_Os03g08624          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g08624          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133634      LOC_Os03g08624          GO:0009058      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g08624          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0133634      LOC_Os03g08624          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g08624          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0133634      LOC_Os03g08624          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g08624          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133634      LOC_Os03g08624          GO:0044237      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g08624          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0133634      LOC_Os03g08624          GO:0050662      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g08624          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154320      LOC_Os03g56241          GO:0003735      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g56241          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -43570,7 +43570,7 @@ GR_gene GR:0153004      LOC_Os03g10210          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g10210          ge
 GR_gene        GR:0153004      LOC_Os03g10210          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g10210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153004      LOC_Os03g10210          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g10210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153004      LOC_Os03g10210          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g10210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0153004      LOC_Os03g10210          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g10210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0153004      LOC_Os03g10210          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g10210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153004      LOC_Os03g10210          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g10210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153004      LOC_Os03g10210          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g10210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129437      LOC_Os03g07480          GO:0005887      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g07480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -43682,7 +43682,7 @@ GR_gene GR:0130373      LOC_Os03g43880          GO:0006629      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g43880          ge
 GR_gene        GR:0130373      LOC_Os03g43880          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g43880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130373      LOC_Os03g43880          GO:0016042      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g43880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130373      LOC_Os03g43880          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g43880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:016864       LOC_Os03g39000          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g39000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:016864       LOC_Os03g39000          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g39000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149216      LOC_Os03g34040          GO:0003723      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g34040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149216      LOC_Os03g34040          GO:0003735      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g34040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149216      LOC_Os03g34040          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g34040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -44127,7 +44127,7 @@ GR_gene GR:0149554      LOC_Os03g22780          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g22780          ge
 GR_gene        GR:0149554      LOC_Os03g22780          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g22780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149554      LOC_Os03g22780          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g22780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149554      LOC_Os03g22780          GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g22780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0149554      LOC_Os03g22780          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g22780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0149554      LOC_Os03g22780          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g22780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149554      LOC_Os03g22780          GO:0044237      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g22780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0149554      LOC_Os03g22780          GO:0050662      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g22780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125413      LOC_Os03g01720          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g01720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -44267,7 +44267,7 @@ GR_gene GR:0147041      LOC_Os03g08000          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g08000          ge
 GR_gene        GR:0147041      LOC_Os03g08000          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g08000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147041      LOC_Os03g08000          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g08000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118791      LOC_Os03g40910          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g40910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0118791      LOC_Os03g40910          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g40910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0118791      LOC_Os03g40910          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g40910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133635      LOC_Os03g16750          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g16750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133635      LOC_Os03g16750          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g16750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133635      LOC_Os03g16750          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g16750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -44684,7 +44684,7 @@ GR_gene GR:0111075      LOC_Os03g34190          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g34190          ge
 GR_gene        GR:0141951      LOC_Os03g18270          GO:0006811      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g18270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141951      LOC_Os03g18270          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g18270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118539      LOC_Os03g16050          GO:0000287      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g16050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0118539      LOC_Os03g16050          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g16050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0118539      LOC_Os03g16050          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g16050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118539      LOC_Os03g16050          GO:0005975      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g16050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118539      LOC_Os03g16050          GO:0009507      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g16050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118539      LOC_Os03g16050          GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g16050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -44809,7 +44809,7 @@ GR_gene GR:0122727      LOC_Os03g06930          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g06930          ge
 GR_gene        GR:0122727      LOC_Os03g06930          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g06930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122727      LOC_Os03g06930          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g06930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122727      LOC_Os03g06930          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g06930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0122727      LOC_Os03g06930          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g06930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0122727      LOC_Os03g06930          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g06930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122727      LOC_Os03g06930          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g06930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122727      LOC_Os03g06930          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g06930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015358       LOC_Os03g32119          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g32119          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -44877,7 +44877,7 @@ GR_gene GR:0151774      LOC_Os03g06010          GO:0071555      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g06010          ge
 GR_gene        GR:0151774      LOC_Os03g06010          GO:0009664      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g06010          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151774      LOC_Os03g06010          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g06010          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015128       LOC_Os03g44944          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g44944          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:015128       LOC_Os03g44944          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g44944          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:015128       LOC_Os03g44944          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g44944          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015128       LOC_Os03g44944          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g44944          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133448      LOC_Os03g24620          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g24620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133448      LOC_Os03g24620          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g24620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -45241,7 +45241,7 @@ GR_gene GR:0125884      LOC_Os03g47740          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47740          ge
 GR_gene        GR:0125884      LOC_Os03g47740          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125884      LOC_Os03g47740          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g47740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125884      LOC_Os03g47740          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g47740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0125884      LOC_Os03g47740          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g47740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0125884      LOC_Os03g47740          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125884      LOC_Os03g47740          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125884      LOC_Os03g47740          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g47740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156247      LOC_Os03g07580          GO:0005643      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g07580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -45290,7 +45290,7 @@ GR_gene GR:0135160      LOC_Os03g51710          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g51710          ge
 GR_gene        GR:0135160      LOC_Os03g51710          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g51710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135160      LOC_Os03g51710          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g51710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135160      LOC_Os03g51710          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g51710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0135160      LOC_Os03g51710          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g51710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0135160      LOC_Os03g51710          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g51710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135160      LOC_Os03g51710          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g51710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135160      LOC_Os03g51710          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g51710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016352       LOC_Os03g08680          GO:0005743      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g08680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -45505,7 +45505,7 @@ GR_gene GR:0116509      LOC_Os03g13000          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g13000          ge
 GR_gene        GR:0116509      LOC_Os03g13000          GO:0006334      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g13000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116509      LOC_Os03g13000          GO:0007264      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g13000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112633      LOC_Os03g45410          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g45410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0112633      LOC_Os03g45410          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g45410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0112633      LOC_Os03g45410          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g45410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112633      LOC_Os03g45410          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g45410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112633      LOC_Os03g45410          GO:0005669      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g45410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112633      LOC_Os03g45410          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g45410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -45576,7 +45576,7 @@ GR_gene GR:016616       LOC_Os03g12840          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g12840          gen
 GR_gene        GR:016616       LOC_Os03g12840          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g12840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016616       LOC_Os03g12840          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g12840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016616       LOC_Os03g12840          GO:0032957      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g12840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:016616       LOC_Os03g12840          GO:0051766      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g12840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:016616       LOC_Os03g12840          GO:0051766      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g12840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016616       LOC_Os03g12840          GO:0047325      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g12840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153352      LOC_Os03g32749          GO:0004190      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g32749          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153352      LOC_Os03g32749          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g32749          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -45870,7 +45870,7 @@ GR_gene GR:0120282      LOC_Os03g23970          GO:0008168      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g23970          ge
 GR_gene        GR:0120282      LOC_Os03g23970          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g23970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120282      LOC_Os03g23970          GO:0017183      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g23970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143266      LOC_Os03g52594          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g52594          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0143266      LOC_Os03g52594          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g52594          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0143266      LOC_Os03g52594          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g52594          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143266      LOC_Os03g52594          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g52594          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142803      LOC_Os03g50800          GO:0008107      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g50800          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142803      LOC_Os03g50800          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g50800          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -45892,7 +45892,7 @@ GR_gene GR:0111192      LOC_Os03g51200          GO:0005694      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g51200          ge
 GR_gene        GR:0111192      LOC_Os03g51200          GO:0006334      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g51200          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155263      LOC_Os03g60130          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g60130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155263      LOC_Os03g60130          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g60130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0155263      LOC_Os03g60130          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g60130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0155263      LOC_Os03g60130          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g60130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155263      LOC_Os03g60130          GO:0032784      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g60130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155263      LOC_Os03g60130          GO:0003746      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g60130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155263      LOC_Os03g60130          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g60130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -45902,7 +45902,7 @@ GR_gene GR:0155263      LOC_Os03g60130          GO:0006354      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g60130          ge
 GR_gene        GR:0155263      LOC_Os03g60130          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g60130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155263      LOC_Os03g60130          GO:0006357      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g60130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155263      LOC_Os03g60130          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g60130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0155263      LOC_Os03g60130          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g60130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0155263      LOC_Os03g60130          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g60130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155263      LOC_Os03g60130          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g60130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134377      LOC_Os03g06270          GO:0016627      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g06270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019556       LOC_Os03g49640          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g49640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -45934,7 +45934,7 @@ GR_gene GR:0110928      LOC_Os03g61280          GO:0016798      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g61280          ge
 GR_gene        GR:0110928      LOC_Os03g61280          GO:0016985      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g61280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110928      LOC_Os03g61280          GO:0043169      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g61280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120677      LOC_Os03g20780          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g20780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0120677      LOC_Os03g20780          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g20780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0120677      LOC_Os03g20780          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g20780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0138561      LOC_Os03g08950          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g08950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0138561      LOC_Os03g08950          GO:0046983      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g08950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0158720      LOC_Os03g10090          GO:0005215      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g10090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -45961,7 +45961,7 @@ GR_gene GR:0117350      LOC_Os03g47230          GO:0008283      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g47230          ge
 GR_gene        GR:0139978      LOC_Os03g23770          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g23770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139978      LOC_Os03g23770          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g23770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141018      LOC_Os03g26630          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g26630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0115468      LOC_Os03g46090          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g46090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0115468      LOC_Os03g46090          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g46090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154570      LOC_Os03g44230          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g44230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154570      LOC_Os03g44230          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g44230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013781       LOC_Os03g21790          GO:0030145      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g21790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -46012,7 +46012,7 @@ GR_gene GR:012888       LOC_Os03g60100          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g60100          gen
 GR_gene        GR:012888       LOC_Os03g60100          GO:0005840      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g60100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012888       LOC_Os03g60100          GO:0006412      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g60100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012888       LOC_Os03g60100          GO:0030529      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g60100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0128123      LOC_Os03g46460          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g46460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0128123      LOC_Os03g46460          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g46460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128123      LOC_Os03g46460          GO:0004689      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g46460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128123      LOC_Os03g46460          GO:0005516      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g46460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128123      LOC_Os03g46460          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g46460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -46210,7 +46210,7 @@ GR_gene GR:0128084      LOC_Os03g10070          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g10070          ge
 GR_gene        GR:0128084      LOC_Os03g10070          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g10070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128084      LOC_Os03g10070          GO:0006413      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g10070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128084      LOC_Os03g10070          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g10070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0128084      LOC_Os03g10070          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g10070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0128084      LOC_Os03g10070          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g10070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0138031      LOC_Os03g21310          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g21310          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0138031      LOC_Os03g21310          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g21310          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0138031      LOC_Os03g21310          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g21310          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -46257,14 +46257,14 @@ GR_gene       GR:0153013      LOC_Os03g52770          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g52770          ge
 GR_gene        GR:0153013      LOC_Os03g52770          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g52770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153013      LOC_Os03g52770          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g52770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121267      LOC_Os03g14720          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g14720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0121267      LOC_Os03g14720          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g14720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0121267      LOC_Os03g14720          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g14720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121267      LOC_Os03g14720          GO:0003743      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g14720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121267      LOC_Os03g14720          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g14720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121267      LOC_Os03g14720          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g14720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121267      LOC_Os03g14720          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g14720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121267      LOC_Os03g14720          GO:0006367      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g14720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121267      LOC_Os03g14720          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g14720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0121267      LOC_Os03g14720          GO:0001228      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g14720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0121267      LOC_Os03g14720          GO:0001228      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g14720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121267      LOC_Os03g14720          GO:0045893      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g14720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142027      LOC_Os03g11734          GO:0006855      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g11734          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142027      LOC_Os03g11734          GO:0015238      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g11734          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -47229,7 +47229,7 @@ GR_gene GR:0115515      LOC_Os03g47730          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47730          ge
 GR_gene        GR:0115515      LOC_Os03g47730          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115515      LOC_Os03g47730          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g47730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115515      LOC_Os03g47730          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g47730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0115515      LOC_Os03g47730          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g47730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0115515      LOC_Os03g47730          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115515      LOC_Os03g47730          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g47730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115515      LOC_Os03g47730          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115515      LOC_Os03g47730          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g47730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -47310,7 +47310,7 @@ GR_gene GR:0157565      LOC_Os03g32590          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g32590          ge
 GR_gene        GR:0157565      LOC_Os03g32590          GO:0003743      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g32590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157565      LOC_Os03g32590          GO:0005669      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g32590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157565      LOC_Os03g32590          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g32590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0157565      LOC_Os03g32590          GO:0140223      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g32590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0157565      LOC_Os03g32590          GO:0140223      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g32590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116042      LOC_Os03g46750          GO:0005789      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g46750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116042      LOC_Os03g46750          GO:0006506      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g46750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116042      LOC_Os03g46750          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g46750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -47997,7 +47997,7 @@ GR_gene GR:0148208      LOC_Os03g17850          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g17850          ge
 GR_gene        GR:012955       LOC_Os03g47790          GO:0000159      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g47790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012955       LOC_Os03g47790          GO:0007165      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g47790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012955       LOC_Os03g47790          GO:0008601      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:012787       LOC_Os03g06950          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g06950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:012787       LOC_Os03g06950          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g06950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012787       LOC_Os03g06950          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g06950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012787       LOC_Os03g06950          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g06950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012787       LOC_Os03g06950          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g06950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -48035,7 +48035,7 @@ GR_gene GR:0144394      LOC_Os03g53960          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g53960          ge
 GR_gene        GR:0144394      LOC_Os03g53960          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g53960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017157       LOC_Os03g56782          GO:0005179      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g56782          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017157       LOC_Os03g56782          GO:0005576      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g56782          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0129585      LOC_Os03g07930          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g07930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0129585      LOC_Os03g07930          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g07930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129585      LOC_Os03g07930          GO:0005673      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g07930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129585      LOC_Os03g07930          GO:0006367      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g07930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013396       LOC_Os03g47280          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g47280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -48082,7 +48082,7 @@ GR_gene GR:015453       LOC_Os03g12860          GO:0004879      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g12860          gen
 GR_gene        GR:015453       LOC_Os03g12860          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g12860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015453       LOC_Os03g12860          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g12860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015453       LOC_Os03g12860          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g12860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:015453       LOC_Os03g12860          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g12860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:015453       LOC_Os03g12860          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g12860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015453       LOC_Os03g12860          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g12860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015453       LOC_Os03g12860          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g12860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015453       LOC_Os03g12860          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g12860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -48119,7 +48119,7 @@ GR_gene GR:0133345      LOC_Os03g51310          GO:0006278      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g51310          ge
 GR_gene        GR:0133345      LOC_Os03g51310          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g51310          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133345      LOC_Os03g51310          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g51310          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125565      LOC_Os03g19780          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g19780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0125565      LOC_Os03g19780          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g19780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0125565      LOC_Os03g19780          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g19780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125565      LOC_Os03g19780          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g19780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135843      LOC_Os03g58204          GO:0003735      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g58204          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135843      LOC_Os03g58204          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g58204          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -48400,7 +48400,7 @@ GR_gene GR:0125514      LOC_Os03g09820          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g09820          ge
 GR_gene        GR:0125514      LOC_Os03g09820          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g09820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125514      LOC_Os03g09820          GO:0006413      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g09820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125514      LOC_Os03g09820          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g09820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0125514      LOC_Os03g09820          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g09820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0125514      LOC_Os03g09820          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g09820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125514      LOC_Os03g09820          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g09820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148108      LOC_Os03g59660          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g59660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148108      LOC_Os03g59660          GO:0006810      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g59660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -49290,7 +49290,7 @@ GR_gene GR:0121006      LOC_Os03g28110          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g28110          ge
 GR_gene        GR:0121006      LOC_Os03g28110          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g28110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121006      LOC_Os03g28110          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g28110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115987      LOC_Os03g44380          GO:0016702      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g44380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0123138      LOC_Os03g57950          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g57950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0123138      LOC_Os03g57950          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g57950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125545      LOC_Os03g29150          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g29150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125545      LOC_Os03g29150          GO:0003854      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g29150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125545      LOC_Os03g29150          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g29150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -49334,7 +49334,7 @@ GR_gene GR:0145425      LOC_Os03g21980          GO:0003723      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g21980          ge
 GR_gene        GR:0145425      LOC_Os03g21980          GO:0009451      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g21980          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145425      LOC_Os03g21980          GO:0009982      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g21980          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135261      LOC_Os03g44900          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g44900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0135261      LOC_Os03g44900          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g44900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0135261      LOC_Os03g44900          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g44900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135261      LOC_Os03g44900          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g44900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135487      LOC_Os03g02050          GO:0006810      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g02050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135487      LOC_Os03g02050          GO:0006869      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g02050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -49531,7 +49531,7 @@ GR_gene GR:0120261      LOC_Os03g14560          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g14560          ge
 !GR_gene       GR:0120261      LOC_Os03g14560          GO:0055114      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g14560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153987      LOC_Os03g49250          GO:0016998      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g49250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125804      LOC_Os03g07510          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g07510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0125804      LOC_Os03g07510          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g07510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0125804      LOC_Os03g07510          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g07510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125804      LOC_Os03g07510          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g07510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111723      LOC_Os03g24900          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g24900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111723      LOC_Os03g24900          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g24900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -50286,7 +50286,7 @@ GR_gene GR:0120688      LOC_Os03g44950          GO:0004879      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g44950          ge
 GR_gene        GR:0120688      LOC_Os03g44950          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g44950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120688      LOC_Os03g44950          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g44950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120688      LOC_Os03g44950          GO:0016068      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g44950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0120688      LOC_Os03g44950          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g44950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0120688      LOC_Os03g44950          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g44950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120688      LOC_Os03g44950          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g44950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120688      LOC_Os03g44950          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g44950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120688      LOC_Os03g44950          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g44950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -50299,7 +50299,7 @@ GR_gene GR:0157782      LOC_Os03g52239          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g52239          ge
 GR_gene        GR:0157782      LOC_Os03g52239          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g52239          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157782      LOC_Os03g52239          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g52239          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157782      LOC_Os03g52239          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g52239          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0157782      LOC_Os03g52239          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g52239          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0157782      LOC_Os03g52239          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g52239          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157782      LOC_Os03g52239          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g52239          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157782      LOC_Os03g52239          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g52239          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150603      LOC_Os03g61070          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g61070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -50447,7 +50447,7 @@ GR_gene GR:0121516      LOC_Os03g11050          GO:0009058      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g11050          ge
 GR_gene        GR:0121516      LOC_Os03g11050          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g11050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121516      LOC_Os03g11050          GO:0016779      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g11050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018674       LOC_Os03g20790          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g20790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:018674       LOC_Os03g20790          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g20790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:018674       LOC_Os03g20790          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g20790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118787      LOC_Os03g18380          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g18380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118787      LOC_Os03g18380          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g18380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118787      LOC_Os03g18380          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g18380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -50522,7 +50522,7 @@ GR_gene GR:0126733      LOC_Os03g23980          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g23980          ge
 GR_gene        GR:0126733      LOC_Os03g23980          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g23980          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126733      LOC_Os03g23980          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g23980          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126733      LOC_Os03g23980          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g23980          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0126733      LOC_Os03g23980          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g23980          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0126733      LOC_Os03g23980          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g23980          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126733      LOC_Os03g23980          GO:0044237      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g23980          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0126733      LOC_Os03g23980          GO:0050662      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g23980          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146487      LOC_Os03g58110          GO:0004872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g58110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -50669,7 +50669,7 @@ GR_gene GR:0132356      LOC_Os03g06940          GO:0048046      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g06940          ge
 GR_gene        GR:0114569      LOC_Os03g45290          GO:0005198      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g45290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140187      LOC_Os03g56840          GO:0005525      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g56840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140187      LOC_Os03g56840          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g56840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0150704      LOC_Os03g13520          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g13520          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0150704      LOC_Os03g13520          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g13520          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152315      LOC_Os03g50610          GO:0005198      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g50610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152315      LOC_Os03g50610          GO:0019028      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os03g50610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152315      LOC_Os03g50610          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g50610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -51006,7 +51006,7 @@ GR_gene GR:013546       LOC_Os03g50450          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g50450          gen
 GR_gene        GR:013546       LOC_Os03g50450          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g50450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013546       LOC_Os03g50450          GO:0006468      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g50450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013546       LOC_Os03g50450          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g50450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:012442       LOC_Os03g09080          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os03g09080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:012442       LOC_Os03g09080          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g09080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012442       LOC_Os03g09080          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os03g09080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012442       LOC_Os03g09080          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g09080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012442       LOC_Os03g09080          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os03g09080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -51208,7 +51208,7 @@ GR_gene GR:0120013      LOC_Os04g48070          GO:0005945      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g48070          ge
 GR_gene        GR:0120013      LOC_Os04g48070          GO:0006096      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g48070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120013      LOC_Os04g48070          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g48070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120013      LOC_Os04g48070          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g48070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0120013      LOC_Os04g48070          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g48070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0120013      LOC_Os04g48070          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g48070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120013      LOC_Os04g48070          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g48070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120013      LOC_Os04g48070          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g48070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147031      LOC_Os04g37630          GO:0005215      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g37630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -51482,7 +51482,7 @@ GR_gene GR:0130866      LOC_Os04g22200          GO:0005351      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g22200          ge
 GR_gene        GR:0130866      LOC_Os04g22200          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g22200          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130866      LOC_Os04g22200          GO:0009401      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g22200          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148552      LOC_Os04g56500          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g56500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0148552      LOC_Os04g56500          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g56500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0148552      LOC_Os04g56500          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g56500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148552      LOC_Os04g56500          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g56500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125196      LOC_Os04g39489          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g39489          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125196      LOC_Os04g39489          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g39489          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -52148,7 +52148,7 @@ GR_gene GR:0145246      LOC_Os04g14170          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g14170          ge
 GR_gene        GR:0145246      LOC_Os04g14170          GO:0006333      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g14170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157603      LOC_Os04g30450          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g30450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157603      LOC_Os04g30450          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g30450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0157603      LOC_Os04g30450          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g30450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0157603      LOC_Os04g30450          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g30450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157603      LOC_Os04g30450          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g30450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148063      LOC_Os04g39930          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g39930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148063      LOC_Os04g39930          GO:0004672      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g39930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -52597,7 +52597,7 @@ GR_gene GR:0110067      LOC_Os04g54660          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g54660          ge
 GR_gene        GR:0110067      LOC_Os04g54660          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g54660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110067      LOC_Os04g54660          GO:0004523      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g54660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110067      LOC_Os04g54660          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g54660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0131754      LOC_Os04g24710          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g24710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0131754      LOC_Os04g24710          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g24710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131754      LOC_Os04g24710          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g24710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131754      LOC_Os04g24710          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g24710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145775      LOC_Os04g53230          GO:0004047      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g53230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -53959,7 +53959,7 @@ GR_gene GR:0117221      LOC_Os04g51630          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g51630          ge
 GR_gene        GR:0117221      LOC_Os04g51630          GO:0005840      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g51630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117221      LOC_Os04g51630          GO:0006412      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g51630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117221      LOC_Os04g51630          GO:0015934      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g51630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0117221      LOC_Os04g51630          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g51630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0117221      LOC_Os04g51630          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g51630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117221      LOC_Os04g51630          GO:0030529      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g51630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013105       LOC_Os04g13330          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g13330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013105       LOC_Os04g13330          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g13330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -54068,7 +54068,7 @@ GR_gene GR:0129442      LOC_Os04g50930          GO:0005215      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g50930          ge
 GR_gene        GR:0129442      LOC_Os04g50930          GO:0006857      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g50930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129442      LOC_Os04g50930          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g50930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133719      LOC_Os04g31850          GO:0016627      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g31850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0143331      LOC_Os04g16680          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g16680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0143331      LOC_Os04g16680          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g16680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143331      LOC_Os04g16680          GO:0005975      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g16680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143331      LOC_Os04g16680          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g16680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143331      LOC_Os04g16680          GO:0042578      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g16680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -54824,7 +54824,7 @@ GR_gene GR:0139590      LOC_Os04g50150          GO:0016068      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g50150          ge
 GR_gene        GR:0154199      LOC_Os04g43130          GO:0003697      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g43130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154199      LOC_Os04g43130          GO:0005576      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g43130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0154199      LOC_Os04g43130          GO:0009405      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g43130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0154199      LOC_Os04g43130          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g43130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0154199      LOC_Os04g43130          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g43130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151183      LOC_Os04g35500          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g35500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151183      LOC_Os04g35500          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g35500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151183      LOC_Os04g35500          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g35500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -55211,7 +55211,7 @@ GR_gene GR:0132168      LOC_Os04g53540          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g53540          ge
 GR_gene        GR:0132168      LOC_Os04g53540          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g53540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132168      LOC_Os04g53540          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g53540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132168      LOC_Os04g53540          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g53540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0132168      LOC_Os04g53540          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g53540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0132168      LOC_Os04g53540          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g53540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132168      LOC_Os04g53540          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g53540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132168      LOC_Os04g53540          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g53540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012082       LOC_Os04g12900          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g12900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -55350,7 +55350,7 @@ GR_gene GR:0137079      LOC_Os04g34610          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g34610          ge
 GR_gene        GR:0137079      LOC_Os04g34610          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g34610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137079      LOC_Os04g34610          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g34610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157295      LOC_Os04g38400          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g38400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0157295      LOC_Os04g38400          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g38400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0157295      LOC_Os04g38400          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g38400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142423      LOC_Os04g34960          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g34960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142423      LOC_Os04g34960          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g34960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142423      LOC_Os04g34960          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g34960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -57239,7 +57239,7 @@ GR_gene GR:0118561      LOC_Os04g46350          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g46350          ge
 GR_gene        GR:0118561      LOC_Os04g46350          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g46350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118561      LOC_Os04g46350          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g46350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118561      LOC_Os04g46350          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g46350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0118561      LOC_Os04g46350          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g46350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0118561      LOC_Os04g46350          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g46350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118561      LOC_Os04g46350          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g46350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118561      LOC_Os04g46350          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g46350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151905      LOC_Os04g36620          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g36620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -58369,7 +58369,7 @@ GR_gene GR:0130458      LOC_Os04g40530          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g40530          ge
 GR_gene        GR:0130458      LOC_Os04g40530          GO:0008168      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g40530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018186       LOC_Os04g56730          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g56730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018186       LOC_Os04g56730          GO:0016480      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g56730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:018186       LOC_Os04g56730          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g56730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:018186       LOC_Os04g56730          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g56730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129810      LOC_Os04g39220          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g39220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140370      LOC_Os04g54110          GO:0004672      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g54110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140370      LOC_Os04g54110          GO:0004674      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g54110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -58667,7 +58667,7 @@ GR_gene GR:0129863      LOC_Os04g31040          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g31040          ge
 GR_gene        GR:0129863      LOC_Os04g31040          GO:0009507      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g31040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129863      LOC_Os04g31040          GO:0046422      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g31040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0129863      LOC_Os04g31040          GO:0055114      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g31040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0151958      LOC_Os04g55360          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g55360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0151958      LOC_Os04g55360          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g55360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151958      LOC_Os04g55360          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g55360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151958      LOC_Os04g55360          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g55360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112169      LOC_Os04g44670          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g44670          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -59206,7 +59206,7 @@ GR_gene GR:013839       LOC_Os04g50880          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g50880          gen
 GR_gene        GR:013839       LOC_Os04g50880          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g50880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013839       LOC_Os04g50880          GO:0016773      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g50880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013839       LOC_Os04g50880          GO:0017111      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g50880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:013839       LOC_Os04g50880          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g50880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:013839       LOC_Os04g50880          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g50880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013839       LOC_Os04g50880          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g50880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013839       LOC_Os04g50880          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g50880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013839       LOC_Os04g50880          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g50880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -59838,7 +59838,7 @@ GR_gene GR:013895       LOC_Os04g10100          GO:0006333      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g10100          gen
 GR_gene        GR:013895       LOC_Os04g10100          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g10100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013895       LOC_Os04g10100          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g10100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013895       LOC_Os04g10100          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g10100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0134640      LOC_Os04g23580          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g23580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0134640      LOC_Os04g23580          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g23580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134640      LOC_Os04g23580          GO:0008375      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g23580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134640      LOC_Os04g23580          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g23580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127309      LOC_Os04g16990          GO:0003723      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g16990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -59855,7 +59855,7 @@ GR_gene GR:0125968      LOC_Os04g45810          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g45810          ge
 GR_gene        GR:0125968      LOC_Os04g45810          GO:0006265      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g45810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125968      LOC_Os04g45810          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g45810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125968      LOC_Os04g45810          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g45810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0125968      LOC_Os04g45810          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g45810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0125968      LOC_Os04g45810          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g45810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125968      LOC_Os04g45810          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g45810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125968      LOC_Os04g45810          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g45810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125115      LOC_Os04g43420          GO:0006457      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g43420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -60722,7 +60722,7 @@ GR_gene GR:0147940      LOC_Os04g01590          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g01590          ge
 GR_gene        GR:0147940      LOC_Os04g01590          GO:0016813      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g01590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147940      LOC_Os04g01590          GO:0030145      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g01590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147940      LOC_Os04g01590          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g01590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:012446       LOC_Os04g46190          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g46190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:012446       LOC_Os04g46190          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g46190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012446       LOC_Os04g46190          GO:0005164      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g46190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012446       LOC_Os04g46190          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g46190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012446       LOC_Os04g46190          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g46190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -61820,7 +61820,7 @@ GR_gene GR:0114413      LOC_Os04g20474          GO:0016758      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g20474          ge
 GR_gene        GR:019213       LOC_Os04g33760          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g33760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019213       LOC_Os04g33760          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g33760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019213       LOC_Os04g33760          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g33760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0116456      LOC_Os04g58350          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g58350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0116456      LOC_Os04g58350          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g58350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116456      LOC_Os04g58350          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g58350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116456      LOC_Os04g58350          GO:0006281      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g58350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116456      LOC_Os04g58350          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g58350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -61909,7 +61909,7 @@ GR_gene GR:017665       LOC_Os04g47580          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g47580          gen
 GR_gene        GR:017665       LOC_Os04g47580          GO:0007049      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g47580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017665       LOC_Os04g47580          GO:0007067      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g47580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017665       LOC_Os04g47580          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g47580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:017665       LOC_Os04g47580          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g47580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:017665       LOC_Os04g47580          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g47580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017665       LOC_Os04g47580          GO:0051301      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g47580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124245      LOC_Os04g12720          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g12720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124245      LOC_Os04g12720          GO:0016758      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g12720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -62388,7 +62388,7 @@ GR_gene GR:0137211      LOC_Os04g15610          GO:0003964      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g15610          ge
 GR_gene        GR:0137211      LOC_Os04g15610          GO:0004523      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g15610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137211      LOC_Os04g15610          GO:0006278      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g15610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137211      LOC_Os04g15610          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g15610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:018888       LOC_Os04g34984          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g34984          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:018888       LOC_Os04g34984          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g34984          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018888       LOC_Os04g34984          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g34984          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018888       LOC_Os04g34984          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g34984          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018888       LOC_Os04g34984          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g34984          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -62601,7 +62601,7 @@ GR_gene GR:0158152      LOC_Os04g41100          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g41100          ge
 GR_gene        GR:0158152      LOC_Os04g41100          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g41100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140802      LOC_Os04g08170          GO:0007165      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g08170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016360       LOC_Os04g34570          GO:0036374      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g34570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:017138       LOC_Os04g37950          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g37950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:017138       LOC_Os04g37950          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g37950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017138       LOC_Os04g37950          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g37950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017138       LOC_Os04g37950          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g37950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017138       LOC_Os04g37950          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g37950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -63121,7 +63121,7 @@ GR_gene GR:0132250      LOC_Os04g24600          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g24600          ge
 GR_gene        GR:0132250      LOC_Os04g24600          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g24600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132250      LOC_Os04g24600          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g24600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132250      LOC_Os04g24600          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g24600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0115185      LOC_Os04g57190          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g57190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0115185      LOC_Os04g57190          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g57190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115185      LOC_Os04g57190          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g57190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115185      LOC_Os04g57190          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g57190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0119901      LOC_Os04g51230          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g51230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -63149,7 +63149,7 @@ GR_gene GR:0129972      LOC_Os04g41260          GO:0009055      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g41260          ge
 GR_gene        GR:0129972      LOC_Os04g41260          GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g41260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0129972      LOC_Os04g41260          GO:0055114      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g41260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131995      LOC_Os04g54950          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g54950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0131995      LOC_Os04g54950          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g54950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0131995      LOC_Os04g54950          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g54950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131995      LOC_Os04g54950          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g54950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147443      LOC_Os04g32560          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g32560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147443      LOC_Os04g32560          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g32560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -63462,7 +63462,7 @@ GR_gene GR:019023       LOC_Os04g49420          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g49420          gen
 GR_gene        GR:019023       LOC_Os04g49420          GO:0005694      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g49420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019023       LOC_Os04g49420          GO:0006334      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g49420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019023       LOC_Os04g49420          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g49420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:019023       LOC_Os04g49420          GO:0140223      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g49420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:019023       LOC_Os04g49420          GO:0140223      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g49420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012032       LOC_Os04g14010          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g14010          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012032       LOC_Os04g14010          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g14010          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012032       LOC_Os04g14010          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g14010          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -63493,7 +63493,7 @@ GR_gene GR:0130617      LOC_Os04g53240          GO:0015031      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g53240          ge
 GR_gene        GR:0130617      LOC_Os04g53240          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g53240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130617      LOC_Os04g53240          GO:0019941      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g53240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130617      LOC_Os04g53240          GO:0031410      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g53240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0118118      LOC_Os04g46170          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os04g46170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0118118      LOC_Os04g46170          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g46170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118118      LOC_Os04g46170          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os04g46170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118118      LOC_Os04g46170          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os04g46170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018384       LOC_Os04g46010          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os04g46010          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -64427,8 +64427,8 @@ GR_gene GR:0110009      LOC_Os05g23940          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g23940          ge
 GR_gene        GR:0110009      LOC_Os05g23940          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g23940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110009      LOC_Os05g23940          GO:0006413      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g23940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110009      LOC_Os05g23940          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g23940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0110009      LOC_Os05g23940          GO:0001228      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g23940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0110009      LOC_Os05g23940          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g23940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0110009      LOC_Os05g23940          GO:0001228      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g23940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0110009      LOC_Os05g23940          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g23940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110009      LOC_Os05g23940          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g23940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110009      LOC_Os05g23940          GO:0045893      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g23940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112954      LOC_Os05g38750          GO:0004974      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g38750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -64615,7 +64615,7 @@ GR_gene GR:0133072      LOC_Os05g03450          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g03450          ge
 GR_gene        GR:0133072      LOC_Os05g03450          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g03450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133072      LOC_Os05g03450          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g03450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133072      LOC_Os05g03450          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g03450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0141756      LOC_Os05g22670          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g22670          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0141756      LOC_Os05g22670          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g22670          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141756      LOC_Os05g22670          GO:0005672      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g22670          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141756      LOC_Os05g22670          GO:0006367      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g22670          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154088      LOC_Os05g51680          GO:0005576      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g51680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -64635,7 +64635,7 @@ GR_gene GR:0137861      LOC_Os05g15150          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g15150          ge
 GR_gene        GR:0137861      LOC_Os05g15150          GO:0005737      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g15150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137861      LOC_Os05g15150          GO:0006412      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g15150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137861      LOC_Os05g15150          GO:0006418      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g15150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:019984       LOC_Os05g41000          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g41000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:019984       LOC_Os05g41000          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g41000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122519      LOC_Os05g39690          GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g39690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0122519      LOC_Os05g39690          GO:0055114      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g39690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0159328      LOC_Os05g39080          GO:0004672      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g39080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -64730,7 +64730,7 @@ GR_gene GR:0130947      LOC_Os05g48810          GO:0006457      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g48810          ge
 GR_gene        GR:0130947      LOC_Os05g48810          GO:0006950      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g48810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130947      LOC_Os05g48810          GO:0031072      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g48810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130947      LOC_Os05g48810          GO:0051082      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g48810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0126851      LOC_Os05g43480          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g43480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0126851      LOC_Os05g43480          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g43480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126851      LOC_Os05g43480          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g43480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016074       LOC_Os05g32220          GO:0003723      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g32220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016074       LOC_Os05g32220          GO:0003735      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g32220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -64778,7 +64778,7 @@ GR_gene GR:0128637      LOC_Os05g34210          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g34210          ge
 GR_gene        GR:0128637      LOC_Os05g34210          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g34210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128637      LOC_Os05g34210          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g34210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128637      LOC_Os05g34210          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g34210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0128637      LOC_Os05g34210          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g34210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0128637      LOC_Os05g34210          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g34210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123000      LOC_Os05g20250          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g20250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123000      LOC_Os05g20250          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g20250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017571       LOC_Os05g23860          GO:0005093      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g23860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -65453,7 +65453,7 @@ GR_gene GR:017805       LOC_Os05g38760          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g38760          gen
 GR_gene        GR:017805       LOC_Os05g38760          GO:0005694      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g38760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017805       LOC_Os05g38760          GO:0006334      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g38760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017805       LOC_Os05g38760          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g38760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:017805       LOC_Os05g38760          GO:0140223      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g38760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:017805       LOC_Os05g38760          GO:0140223      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g38760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155900      LOC_Os05g07000          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g07000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155900      LOC_Os05g07000          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g07000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155900      LOC_Os05g07000          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g07000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -65768,7 +65768,7 @@ GR_gene GR:0131026      LOC_Os05g20200          GO:0007155      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g20200          ge
 GR_gene        GR:0131026      LOC_Os05g20200          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g20200          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131026      LOC_Os05g20200          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g20200          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131026      LOC_Os05g20200          GO:0015629      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g20200          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0153577      LOC_Os05g49610          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g49610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0153577      LOC_Os05g49610          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g49610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153577      LOC_Os05g49610          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g49610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153577      LOC_Os05g49610          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g49610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132262      LOC_Os05g48030          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g48030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -66997,7 +66997,7 @@ GR_gene GR:0137731      LOC_Os05g50580          GO:0004180      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g50580          ge
 GR_gene        GR:0137731      LOC_Os05g50580          GO:0004185      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g50580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137731      LOC_Os05g50580          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g50580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124928      LOC_Os05g16490          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g16490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0155472      LOC_Os05g36270          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g36270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0155472      LOC_Os05g36270          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g36270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155472      LOC_Os05g36270          GO:0005975      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g36270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155472      LOC_Os05g36270          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g36270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155472      LOC_Os05g36270          GO:0042578      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g36270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -67084,7 +67084,7 @@ GR_gene GR:0143025      LOC_Os05g45660          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g45660          ge
 GR_gene        GR:0143025      LOC_Os05g45660          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g45660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143025      LOC_Os05g45660          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g45660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149855      LOC_Os05g43460          GO:0045892      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g43460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0149855      LOC_Os05g43460          GO:0045892      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g43460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0149855      LOC_Os05g43460          GO:0045892      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g43460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149855      LOC_Os05g43460          GO:0046677      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g43460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0136302      LOC_Os05g14930          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g14930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120946      LOC_Os05g51750          GO:0004190      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g51750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -67123,7 +67123,7 @@ GR_gene GR:0113853      LOC_Os05g03884          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g03884          ge
 GR_gene        GR:0113853      LOC_Os05g03884          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g03884          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113853      LOC_Os05g03884          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g03884          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113853      LOC_Os05g03884          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g03884          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0113853      LOC_Os05g03884          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g03884          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0113853      LOC_Os05g03884          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g03884          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113853      LOC_Os05g03884          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g03884          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113853      LOC_Os05g03884          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g03884          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152572      LOC_Os05g41450          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g41450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -68038,7 +68038,7 @@ GR_gene GR:0158101      LOC_Os05g50840          GO:0006810      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g50840          ge
 GR_gene        GR:0158101      LOC_Os05g50840          GO:0006839      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g50840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0158101      LOC_Os05g50840          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g50840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0158101      LOC_Os05g50840          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g50840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0158101      LOC_Os05g50840          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g50840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0158101      LOC_Os05g50840          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g50840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0158101      LOC_Os05g50840          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g50840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015614       LOC_Os05g09040          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g09040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015614       LOC_Os05g09040          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g09040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -68467,7 +68467,7 @@ GR_gene GR:0128363      LOC_Os05g38740          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g38740          ge
 GR_gene        GR:0128363      LOC_Os05g38740          GO:0005694      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g38740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128363      LOC_Os05g38740          GO:0006334      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g38740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128363      LOC_Os05g38740          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g38740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0128363      LOC_Os05g38740          GO:0140223      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g38740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0128363      LOC_Os05g38740          GO:0140223      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g38740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146081      LOC_Os05g06650          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g06650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146081      LOC_Os05g06650          GO:0004252      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g06650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146081      LOC_Os05g06650          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g06650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -68580,7 +68580,7 @@ GR_gene GR:0157751      LOC_Os05g22750          GO:0016032      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g22750          ge
 GR_gene        GR:0126614      LOC_Os05g03400          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g03400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126614      LOC_Os05g03400          GO:0006139      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g03400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126614      LOC_Os05g03400          GO:0016773      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g03400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0156390      LOC_Os05g43450          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g43450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0156390      LOC_Os05g43450          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g43450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156390      LOC_Os05g43450          GO:0003743      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g43450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156390      LOC_Os05g43450          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g43450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156390      LOC_Os05g43450          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g43450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -68944,7 +68944,7 @@ GR_gene GR:0141204      LOC_Os05g47480          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g47480          ge
 GR_gene        GR:0141204      LOC_Os05g47480          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g47480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141204      LOC_Os05g47480          GO:0006413      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g47480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141204      LOC_Os05g47480          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g47480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0141204      LOC_Os05g47480          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g47480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0141204      LOC_Os05g47480          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g47480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141204      LOC_Os05g47480          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g47480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125622      LOC_Os05g20050          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g20050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125622      LOC_Os05g20050          GO:0003924      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g20050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -68999,7 +68999,7 @@ GR_gene GR:0137069      LOC_Os05g38120          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g38120          ge
 GR_gene        GR:0137069      LOC_Os05g38120          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g38120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137069      LOC_Os05g38120          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g38120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137069      LOC_Os05g38120          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g38120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0137069      LOC_Os05g38120          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g38120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0137069      LOC_Os05g38120          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g38120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137069      LOC_Os05g38120          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g38120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137069      LOC_Os05g38120          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g38120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015370       LOC_Os05g05820          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g05820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -70508,7 +70508,7 @@ GR_gene GR:016703       LOC_Os05g34270          GO:0004872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g34270          gen
 GR_gene        GR:016703       LOC_Os05g34270          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g34270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016703       LOC_Os05g34270          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g34270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016703       LOC_Os05g34270          GO:0006468      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g34270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0125188      LOC_Os05g02350          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g02350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0125188      LOC_Os05g02350          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g02350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131381      LOC_Os05g49140          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g49140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131381      LOC_Os05g49140          GO:0004672      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g49140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131381      LOC_Os05g49140          GO:0004674      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g49140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -72030,7 +72030,7 @@ GR_gene GR:0127611      LOC_Os05g15600          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g15600          ge
 GR_gene        GR:0127611      LOC_Os05g15600          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g15600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127611      LOC_Os05g15600          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g15600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127611      LOC_Os05g15600          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g15600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0127611      LOC_Os05g15600          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g15600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0127611      LOC_Os05g15600          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g15600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129288      LOC_Os05g38820          GO:0000786      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g38820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129288      LOC_Os05g38820          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g38820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129288      LOC_Os05g38820          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g38820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -72132,7 +72132,7 @@ GR_gene GR:019103       LOC_Os05g40420          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g40420          gen
 GR_gene        GR:019103       LOC_Os05g40420          GO:0030145      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g40420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019103       LOC_Os05g40420          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g40420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013560       LOC_Os05g40790          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g40790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:013560       LOC_Os05g40790          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g40790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:013560       LOC_Os05g40790          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g40790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013560       LOC_Os05g40790          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g40790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133380      LOC_Os05g01230          GO:0000151      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g01230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133380      LOC_Os05g01230          GO:0004842      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g01230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -72883,7 +72883,7 @@ GR_gene GR:0138874      LOC_Os05g46270          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g46270          ge
 GR_gene        GR:0138874      LOC_Os05g46270          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g46270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125856      LOC_Os05g16970          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g16970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125856      LOC_Os05g16970          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g16970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0142345      LOC_Os05g45900          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g45900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0142345      LOC_Os05g45900          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g45900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117768      LOC_Os05g17360          GO:0000785      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g17360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117768      LOC_Os05g17360          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g17360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117768      LOC_Os05g17360          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g17360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -73219,7 +73219,7 @@ GR_gene GR:0118599      LOC_Os05g39050          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g39050          ge
 GR_gene        GR:0118599      LOC_Os05g39050          GO:0005694      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g39050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118599      LOC_Os05g39050          GO:0006334      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g39050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118599      LOC_Os05g39050          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g39050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0118599      LOC_Os05g39050          GO:0140223      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g39050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0118599      LOC_Os05g39050          GO:0140223      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g39050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157173      LOC_Os05g02240          GO:0004952      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g02240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157173      LOC_Os05g02240          GO:0006810      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g02240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157173      LOC_Os05g02240          GO:0006812      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g02240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -73847,7 +73847,7 @@ GR_gene GR:0157272      LOC_Os05g40060          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g40060          ge
 GR_gene        GR:0157272      LOC_Os05g40060          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g40060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133069      LOC_Os05g21090          GO:0004190      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g21090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133069      LOC_Os05g21090          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g21090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0149978      LOC_Os05g08810          GO:0016307      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g08810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0149978      LOC_Os05g08810          GO:0016307      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g08810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149978      LOC_Os05g08810          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g08810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149978      LOC_Os05g08810          GO:0005942      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g08810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149978      LOC_Os05g08810          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g08810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -74478,7 +74478,7 @@ GR_gene GR:0127971      LOC_Os05g04740          GO:0005249      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g04740          ge
 GR_gene        GR:0127971      LOC_Os05g04740          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g04740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127971      LOC_Os05g04740          GO:0006813      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g04740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127971      LOC_Os05g04740          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os05g04740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0127971      LOC_Os05g04740          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os05g04740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0127971      LOC_Os05g04740          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g04740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127971      LOC_Os05g04740          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os05g04740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137379      LOC_Os05g16370          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g16370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137379      LOC_Os05g16370          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os05g16370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -75248,7 +75248,7 @@ GR_gene GR:0153049      LOC_Os06g43350          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g43350          ge
 GR_gene        GR:0125184      LOC_Os06g06110          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g06110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125184      LOC_Os06g06110          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g06110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141544      LOC_Os06g18960          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g18960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0141544      LOC_Os06g18960          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g18960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0141544      LOC_Os06g18960          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g18960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141544      LOC_Os06g18960          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g18960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154455      LOC_Os06g43870          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g43870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154455      LOC_Os06g43870          GO:0004519      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g43870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -75364,7 +75364,7 @@ GR_gene GR:012187       LOC_Os06g48750          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g48750          gen
 GR_gene        GR:0159309      LOC_Os06g17070          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g17070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0159309      LOC_Os06g17070          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g17070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120074      LOC_Os06g12210          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g12210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0120074      LOC_Os06g12210          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g12210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0120074      LOC_Os06g12210          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g12210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120074      LOC_Os06g12210          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g12210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116475      LOC_Os06g37090          GO:0016627      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g37090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146811      LOC_Os06g34240          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g34240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -75675,7 +75675,7 @@ GR_gene GR:0123798      LOC_Os06g42490          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g42490          ge
 GR_gene        GR:0123798      LOC_Os06g42490          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g42490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123798      LOC_Os06g42490          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g42490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123798      LOC_Os06g42490          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g42490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0123798      LOC_Os06g42490          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g42490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0123798      LOC_Os06g42490          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g42490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018513       LOC_Os06g19350          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g19350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144104      LOC_Os06g11250          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g11250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144104      LOC_Os06g11250          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g11250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -76526,7 +76526,7 @@ GR_gene GR:0117240      LOC_Os06g43860          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g43860          ge
 GR_gene        GR:0117240      LOC_Os06g43860          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g43860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117240      LOC_Os06g43860          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g43860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117240      LOC_Os06g43860          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g43860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0117240      LOC_Os06g43860          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g43860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0117240      LOC_Os06g43860          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g43860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117240      LOC_Os06g43860          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g43860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117240      LOC_Os06g43860          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g43860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113686      LOC_Os06g37690          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g37690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -76882,7 +76882,7 @@ GR_gene GR:0115754      LOC_Os06g46434          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g46434          ge
 GR_gene        GR:0115754      LOC_Os06g46434          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g46434          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115754      LOC_Os06g46434          GO:0017004      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g46434          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141553      LOC_Os06g21730          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g21730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0113982      LOC_Os06g45370          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g45370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0113982      LOC_Os06g45370          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g45370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113982      LOC_Os06g45370          GO:0005975      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g45370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113982      LOC_Os06g45370          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g45370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113982      LOC_Os06g45370          GO:0042578      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g45370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -76898,7 +76898,7 @@ GR_gene GR:0142315      LOC_Os06g42980          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g42980          ge
 GR_gene        GR:0154553      LOC_Os06g10600          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g10600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154553      LOC_Os06g10600          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g10600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154553      LOC_Os06g10600          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g10600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0154553      LOC_Os06g10600          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g10600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0154553      LOC_Os06g10600          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g10600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154553      LOC_Os06g10600          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g10600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149070      LOC_Os06g02380          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g02380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149070      LOC_Os06g02380          GO:0001539      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g02380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -77315,7 +77315,7 @@ GR_gene GR:0158443      LOC_Os06g28550          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g28550          ge
 GR_gene        GR:0158443      LOC_Os06g28550          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g28550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0158443      LOC_Os06g28550          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g28550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0158443      LOC_Os06g28550          GO:0009431      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g28550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0158443      LOC_Os06g28550          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g28550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0158443      LOC_Os06g28550          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g28550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156058      LOC_Os06g16940          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g16940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156058      LOC_Os06g16940          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g16940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124542      LOC_Os06g39704          GO:0009507      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g39704          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -77436,7 +77436,7 @@ GR_gene GR:0119837      LOC_Os06g39040          GO:0044237      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g39040          ge
 GR_gene        GR:0118355      LOC_Os06g24950          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g24950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118355      LOC_Os06g24950          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g24950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118355      LOC_Os06g24950          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g24950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:017414       LOC_Os06g11920          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g11920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:017414       LOC_Os06g11920          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g11920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148870      LOC_Os06g49060          GO:0005200      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g49060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112555      LOC_Os06g12480          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g12480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112555      LOC_Os06g12480          GO:0046983      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g12480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -77840,7 +77840,7 @@ GR_gene GR:0117787      LOC_Os06g10920          GO:0016757      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g10920          ge
 GR_gene        GR:0117787      LOC_Os06g10920          GO:0042546      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g10920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125163      LOC_Os06g40440          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g40440          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113024      LOC_Os06g44380          GO:0003735      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g44380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0113024      LOC_Os06g44380          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g44380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0113024      LOC_Os06g44380          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g44380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113024      LOC_Os06g44380          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g44380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113024      LOC_Os06g44380          GO:0005840      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g44380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113024      LOC_Os06g44380          GO:0006412      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g44380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -78215,7 +78215,7 @@ GR_gene GR:0129958      LOC_Os06g01934          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g01934          ge
 GR_gene        GR:0129958      LOC_Os06g01934          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g01934          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129958      LOC_Os06g01934          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g01934          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129958      LOC_Os06g01934          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g01934          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0129958      LOC_Os06g01934          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g01934          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0129958      LOC_Os06g01934          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g01934          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129958      LOC_Os06g01934          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g01934          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129958      LOC_Os06g01934          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g01934          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014453       LOC_Os06g35010          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g35010          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -80025,7 +80025,7 @@ GR_gene GR:0145144      LOC_Os06g26150          GO:0004190      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g26150          ge
 GR_gene        GR:0145144      LOC_Os06g26150          GO:0006278      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g26150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145144      LOC_Os06g26150          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g26150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145144      LOC_Os06g26150          GO:0016032      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g26150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0116900      LOC_Os06g15550          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g15550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0116900      LOC_Os06g15550          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g15550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116900      LOC_Os06g15550          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g15550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116900      LOC_Os06g15550          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g15550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111063      LOC_Os06g32944          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g32944          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -80203,7 +80203,7 @@ GR_gene GR:015853       LOC_Os06g27770          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g27770          gen
 GR_gene        GR:015853       LOC_Os06g27770          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g27770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015853       LOC_Os06g27770          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g27770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015853       LOC_Os06g27770          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g27770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:015853       LOC_Os06g27770          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g27770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:015853       LOC_Os06g27770          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g27770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015853       LOC_Os06g27770          GO:0044237      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g27770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:015853       LOC_Os06g27770          GO:0050662      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g27770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134783      LOC_Os06g05350          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g05350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -80389,7 +80389,7 @@ GR_gene GR:0157464      LOC_Os06g48290          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g48290          ge
 GR_gene        GR:0157464      LOC_Os06g48290          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g48290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157464      LOC_Os06g48290          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g48290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157464      LOC_Os06g48290          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g48290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0157464      LOC_Os06g48290          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g48290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0157464      LOC_Os06g48290          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g48290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157464      LOC_Os06g48290          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g48290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157464      LOC_Os06g48290          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g48290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146632      LOC_Os06g01610          GO:0004197      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g01610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -80624,7 +80624,7 @@ GR_gene GR:0142311      LOC_Os06g04870          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g04870          ge
 GR_gene        GR:0142311      LOC_Os06g04870          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g04870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142311      LOC_Os06g04870          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g04870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142311      LOC_Os06g04870          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g04870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0142311      LOC_Os06g04870          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g04870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0142311      LOC_Os06g04870          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g04870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142311      LOC_Os06g04870          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g04870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142311      LOC_Os06g04870          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g04870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142311      LOC_Os06g04870          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g04870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -81622,7 +81622,7 @@ GR_gene GR:0141055      LOC_Os06g37660          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g37660          ge
 GR_gene        GR:0141055      LOC_Os06g37660          GO:0030145      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g37660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141055      LOC_Os06g37660          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g37660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123661      LOC_Os06g44030          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g44030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0123661      LOC_Os06g44030          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g44030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0123661      LOC_Os06g44030          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g44030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123661      LOC_Os06g44030          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g44030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121552      LOC_Os06g04370          GO:0004672      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g04370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121552      LOC_Os06g04370          GO:0004674      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g04370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -82273,7 +82273,7 @@ GR_gene GR:0134895      LOC_Os06g47870          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g47870          ge
 GR_gene        GR:0134895      LOC_Os06g47870          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g47870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134895      LOC_Os06g47870          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g47870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134895      LOC_Os06g47870          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g47870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0134895      LOC_Os06g47870          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g47870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0134895      LOC_Os06g47870          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g47870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141407      LOC_Os06g27850          GO:0004601      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g27850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141407      LOC_Os06g27850          GO:0005506      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g27850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141407      LOC_Os06g27850          GO:0005509      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g27850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -82337,7 +82337,7 @@ GR_gene GR:0146220      LOC_Os06g04850          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g04850          ge
 GR_gene        GR:0146220      LOC_Os06g04850          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g04850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146220      LOC_Os06g04850          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g04850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146220      LOC_Os06g04850          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g04850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0146220      LOC_Os06g04850          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g04850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0146220      LOC_Os06g04850          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g04850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146220      LOC_Os06g04850          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g04850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146220      LOC_Os06g04850          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g04850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137637      LOC_Os06g03790          GO:0003735      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g03790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -83345,7 +83345,7 @@ GR_gene GR:0132536      LOC_Os06g16060          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g16060          ge
 GR_gene        GR:0132536      LOC_Os06g16060          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g16060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132536      LOC_Os06g16060          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g16060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157677      LOC_Os06g07550          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g07550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0157677      LOC_Os06g07550          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g07550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0157677      LOC_Os06g07550          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g07550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157677      LOC_Os06g07550          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g07550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110460      LOC_Os06g17480          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g17480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110460      LOC_Os06g17480          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g17480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -84396,7 +84396,7 @@ GR_gene GR:0142998      LOC_Os06g49120          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g49120          ge
 GR_gene        GR:0142998      LOC_Os06g49120          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g49120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142998      LOC_Os06g49120          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g49120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142998      LOC_Os06g49120          GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g49120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0142998      LOC_Os06g49120          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g49120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0142998      LOC_Os06g49120          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g49120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012386       LOC_Os06g11320          GO:0003755      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g11320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012386       LOC_Os06g11320          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g11320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012386       LOC_Os06g11320          GO:0006457      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g11320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -84877,7 +84877,7 @@ GR_gene GR:019483       LOC_Os06g24350          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g24350          gen
 GR_gene        GR:019483       LOC_Os06g24350          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g24350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019483       LOC_Os06g24350          GO:0015629      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g24350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149828      LOC_Os06g02040          GO:0009790      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g02040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0149202      LOC_Os06g08530          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g08530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0149202      LOC_Os06g08530          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g08530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149202      LOC_Os06g08530          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g08530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149202      LOC_Os06g08530          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g08530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149202      LOC_Os06g08530          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g08530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -86018,7 +86018,7 @@ GR_gene GR:0137751      LOC_Os06g36680          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g36680          ge
 GR_gene        GR:0137751      LOC_Os06g36680          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g36680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137751      LOC_Os06g36680          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g36680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137751      LOC_Os06g36680          GO:0016773      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g36680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0137751      LOC_Os06g36680          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g36680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0137751      LOC_Os06g36680          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g36680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137751      LOC_Os06g36680          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g36680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137751      LOC_Os06g36680          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g36680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137751      LOC_Os06g36680          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g36680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -86236,7 +86236,7 @@ GR_gene GR:0156342      LOC_Os06g47630          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g47630          ge
 GR_gene        GR:0156342      LOC_Os06g47630          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g47630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156342      LOC_Os06g47630          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g47630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156342      LOC_Os06g47630          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g47630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0156342      LOC_Os06g47630          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os06g47630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0156342      LOC_Os06g47630          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g47630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115658      LOC_Os06g38294          GO:0005215      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os06g38294          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115658      LOC_Os06g38294          GO:0006857      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os06g38294          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115658      LOC_Os06g38294          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os06g38294          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -86554,7 +86554,7 @@ GR_gene GR:0124535      LOC_Os07g30950          GO:0020037      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g30950          ge
 GR_gene        GR:019070       LOC_Os07g27140          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g27140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019070       LOC_Os07g27140          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g27140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135480      LOC_Os07g12210          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g12210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0135480      LOC_Os07g12210          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g12210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0135480      LOC_Os07g12210          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g12210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111032      LOC_Os07g28650          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g28650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111032      LOC_Os07g28650          GO:0046983      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g28650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120907      LOC_Os07g01540          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g01540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -86658,7 +86658,7 @@ GR_gene GR:0134457      LOC_Os07g32080          GO:0006413      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g32080          ge
 GR_gene        GR:0134457      LOC_Os07g32080          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g32080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134457      LOC_Os07g32080          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g32080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134457      LOC_Os07g32080          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g32080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0134457      LOC_Os07g32080          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g32080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0134457      LOC_Os07g32080          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g32080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134457      LOC_Os07g32080          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g32080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133008      LOC_Os07g28740          GO:0000785      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g28740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133008      LOC_Os07g28740          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g28740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -87141,7 +87141,7 @@ GR_gene GR:018464       LOC_Os07g42395          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g42395          gen
 GR_gene        GR:018464       LOC_Os07g42395          GO:0003899      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g42395          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018464       LOC_Os07g42395          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g42395          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018464       LOC_Os07g42395          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g42395          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:018464       LOC_Os07g42395          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g42395          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:018464       LOC_Os07g42395          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g42395          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018464       LOC_Os07g42395          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g42395          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0159001      LOC_Os07g36720          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g36720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0159001      LOC_Os07g36720          GO:0003723      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g36720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -87234,7 +87234,7 @@ GR_gene GR:0123684      LOC_Os07g03770          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g03770          ge
 GR_gene        GR:0123684      LOC_Os07g03770          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g03770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123684      LOC_Os07g03770          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g03770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123684      LOC_Os07g03770          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g03770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0123684      LOC_Os07g03770          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g03770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0123684      LOC_Os07g03770          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g03770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123684      LOC_Os07g03770          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g03770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123684      LOC_Os07g03770          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g03770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134119      LOC_Os07g16780          GO:0000785      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g16780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -87876,7 +87876,7 @@ GR_gene GR:0124906      LOC_Os07g02100          GO:0050660      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g02100          ge
 GR_gene        GR:0124906      LOC_Os07g02100          GO:0050661      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g02100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015325       LOC_Os07g09040          GO:0006457      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g09040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015325       LOC_Os07g09040          GO:0016853      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g09040          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0143755      LOC_Os07g37220          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g37220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0143755      LOC_Os07g37220          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g37220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143755      LOC_Os07g37220          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g37220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143755      LOC_Os07g37220          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g37220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143755      LOC_Os07g37220          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g37220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -87993,9 +87993,9 @@ GR_gene GR:0147127      LOC_Os07g44820          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g44820          ge
 GR_gene        GR:0147127      LOC_Os07g44820          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g44820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147127      LOC_Os07g44820          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g44820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147127      LOC_Os07g44820          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g44820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0147127      LOC_Os07g44820          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g44820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0147127      LOC_Os07g44820          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g44820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123407      LOC_Os07g01130          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g01130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0123407      LOC_Os07g01130          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g01130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0123407      LOC_Os07g01130          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g01130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123407      LOC_Os07g01130          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g01130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123407      LOC_Os07g01130          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g01130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123407      LOC_Os07g01130          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g01130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -88269,7 +88269,7 @@ GR_gene GR:0135710      LOC_Os07g13710          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g13710          ge
 GR_gene        GR:0136603      LOC_Os07g05150          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g05150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0136603      LOC_Os07g05150          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g05150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141807      LOC_Os07g48900          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g48900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0141807      LOC_Os07g48900          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g48900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0141807      LOC_Os07g48900          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g48900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141807      LOC_Os07g48900          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g48900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145308      LOC_Os07g01530          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g01530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145308      LOC_Os07g01530          GO:0006915      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g01530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -88651,7 +88651,7 @@ GR_gene GR:0127624      LOC_Os07g24350          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g24350          ge
 GR_gene        GR:0127624      LOC_Os07g24350          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g24350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127624      LOC_Os07g24350          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g24350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127624      LOC_Os07g24350          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g24350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0127624      LOC_Os07g24350          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g24350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0127624      LOC_Os07g24350          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g24350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127624      LOC_Os07g24350          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g24350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127624      LOC_Os07g24350          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g24350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125430      LOC_Os07g10100          GO:0016032      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g10100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -88978,7 +88978,7 @@ GR_gene GR:013188       LOC_Os07g02130          GO:0009055      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g02130          gen
 GR_gene        GR:013188       LOC_Os07g02130          GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g02130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013188       LOC_Os07g02130          GO:0050660      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g02130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013188       LOC_Os07g02130          GO:0050661      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g02130          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0141203      LOC_Os07g37230          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g37230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0141203      LOC_Os07g37230          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g37230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115047      LOC_Os07g16630          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g16630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115047      LOC_Os07g16630          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g16630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115047      LOC_Os07g16630          GO:0004190      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g16630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -89103,7 +89103,7 @@ GR_gene GR:0144650      LOC_Os07g36980          GO:0004713      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g36980          ge
 GR_gene        GR:0144650      LOC_Os07g36980          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g36980          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144650      LOC_Os07g36980          GO:0006468      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g36980          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110019      LOC_Os07g48630          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g48630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0110019      LOC_Os07g48630          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g48630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0110019      LOC_Os07g48630          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g48630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130511      LOC_Os07g47100          GO:0005249      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g47100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130511      LOC_Os07g47100          GO:0006810      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g47100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130511      LOC_Os07g47100          GO:0006811      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g47100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -89822,7 +89822,7 @@ GR_gene GR:015499       LOC_Os07g34240          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g34240          gen
 GR_gene        GR:0115418      LOC_Os07g39750          GO:0006629      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g39750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115418      LOC_Os07g39750          GO:0016788      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g39750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134029      LOC_Os07g17160          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g17160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0134029      LOC_Os07g17160          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g17160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0134029      LOC_Os07g17160          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g17160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0159242      LOC_Os07g06470          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g06470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0159242      LOC_Os07g06470          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g06470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0159242      LOC_Os07g06470          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g06470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -89941,7 +89941,7 @@ GR_gene GR:0110787      LOC_Os07g25990          GO:0006333      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g25990          ge
 GR_gene        GR:0155817      LOC_Os07g16370          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g16370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155817      LOC_Os07g16370          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g16370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110547      LOC_Os07g44090          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g44090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0110547      LOC_Os07g44090          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g44090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0110547      LOC_Os07g44090          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g44090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110547      LOC_Os07g44090          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g44090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110547      LOC_Os07g44090          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g44090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141921      LOC_Os07g12900          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g12900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -90348,7 +90348,7 @@ GR_gene GR:0124239      LOC_Os07g23800          GO:0006412      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g23800          ge
 GR_gene        GR:0114353      LOC_Os07g24620          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g24620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114353      LOC_Os07g24620          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g24620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147903      LOC_Os07g06950          GO:0003690      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g06950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0147903      LOC_Os07g06950          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g06950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0147903      LOC_Os07g06950          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g06950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147903      LOC_Os07g06950          GO:0006265      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g06950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147903      LOC_Os07g06950          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g06950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147903      LOC_Os07g06950          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g06950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -90457,7 +90457,7 @@ GR_gene GR:0111306      LOC_Os07g42470          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g42470          ge
 GR_gene        GR:0111306      LOC_Os07g42470          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g42470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111306      LOC_Os07g42470          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g42470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0119611      LOC_Os07g39940          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g39940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0119611      LOC_Os07g39940          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g39940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0119611      LOC_Os07g39940          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g39940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0119611      LOC_Os07g39940          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g39940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125549      LOC_Os07g25930          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g25930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125549      LOC_Os07g25930          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g25930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -91339,7 +91339,7 @@ GR_gene GR:0113389      LOC_Os07g32120          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g32120          ge
 GR_gene        GR:0113389      LOC_Os07g32120          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g32120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113389      LOC_Os07g32120          GO:0006413      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g32120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113389      LOC_Os07g32120          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g32120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0113389      LOC_Os07g32120          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g32120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0113389      LOC_Os07g32120          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g32120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018918       LOC_Os07g30670          GO:0005506      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g30670          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018918       LOC_Os07g30670          GO:0009055      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g30670          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018918       LOC_Os07g30670          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g30670          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -92443,7 +92443,7 @@ GR_gene GR:017867       LOC_Os07g02060          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g02060          gen
 GR_gene        GR:017867       LOC_Os07g02060          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g02060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017867       LOC_Os07g02060          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g02060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017867       LOC_Os07g02060          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g02060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:017633       LOC_Os07g07950          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g07950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:017633       LOC_Os07g07950          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g07950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150522      LOC_Os07g18730          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g18730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150522      LOC_Os07g18730          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g18730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150522      LOC_Os07g18730          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g18730          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -92494,7 +92494,7 @@ GR_gene GR:014776       LOC_Os07g39320          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g39320          gen
 GR_gene        GR:014776       LOC_Os07g39320          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g39320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014776       LOC_Os07g39320          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g39320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014776       LOC_Os07g39320          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g39320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:014776       LOC_Os07g39320          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g39320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:014776       LOC_Os07g39320          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g39320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014776       LOC_Os07g39320          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g39320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014776       LOC_Os07g39320          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g39320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152614      LOC_Os07g03780          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g03780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -93127,7 +93127,7 @@ GR_gene GR:0141159      LOC_Os07g24970          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g24970          ge
 GR_gene        GR:0141159      LOC_Os07g24970          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g24970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141159      LOC_Os07g24970          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g24970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112563      LOC_Os07g33160          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g33160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0147157      LOC_Os07g09330          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g09330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0147157      LOC_Os07g09330          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g09330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129045      LOC_Os07g20450          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g20450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018031       LOC_Os07g44170          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g44170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018031       LOC_Os07g44170          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g44170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -94068,7 +94068,7 @@ GR_gene GR:0112760      LOC_Os07g30760          GO:0016757      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g30760          ge
 GR_gene        GR:0112760      LOC_Os07g30760          GO:0016758      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g30760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133648      LOC_Os07g12630          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g12630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133648      LOC_Os07g12630          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g12630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0133648      LOC_Os07g12630          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g12630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0133648      LOC_Os07g12630          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g12630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133648      LOC_Os07g12630          GO:0032784      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g12630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133648      LOC_Os07g12630          GO:0003746      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g12630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133648      LOC_Os07g12630          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g12630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -94078,7 +94078,7 @@ GR_gene GR:0133648      LOC_Os07g12630          GO:0006354      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g12630          ge
 GR_gene        GR:0133648      LOC_Os07g12630          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g12630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133648      LOC_Os07g12630          GO:0006357      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g12630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133648      LOC_Os07g12630          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g12630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0133648      LOC_Os07g12630          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g12630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0133648      LOC_Os07g12630          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g12630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133648      LOC_Os07g12630          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g12630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110575      LOC_Os07g18120          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g18120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110575      LOC_Os07g18120          GO:0005506      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g18120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -94539,7 +94539,7 @@ GR_gene GR:0122994      LOC_Os07g33880          GO:0006412      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g33880          ge
 GR_gene        GR:0122994      LOC_Os07g33880          GO:0030529      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g33880          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122546      LOC_Os07g20170          GO:0003779      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g20170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122546      LOC_Os07g20170          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g20170          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0124825      LOC_Os07g06610          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g06610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0124825      LOC_Os07g06610          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g06610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124825      LOC_Os07g06610          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g06610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124825      LOC_Os07g06610          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g06610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124825      LOC_Os07g06610          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g06610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -94611,7 +94611,7 @@ GR_gene GR:0114209      LOC_Os07g36500          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g36500          ge
 GR_gene        GR:0114209      LOC_Os07g36500          GO:0005694      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g36500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114209      LOC_Os07g36500          GO:0006334      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g36500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114209      LOC_Os07g36500          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g36500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0114209      LOC_Os07g36500          GO:0140223      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g36500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0114209      LOC_Os07g36500          GO:0140223      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g36500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145223      LOC_Os07g41510          GO:0000785      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g41510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145223      LOC_Os07g41510          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g41510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145223      LOC_Os07g41510          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g41510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -95087,14 +95087,14 @@ GR_gene       GR:0129606      LOC_Os07g48180          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g48180          ge
 GR_gene        GR:0129606      LOC_Os07g48180          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g48180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129606      LOC_Os07g48180          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g48180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129606      LOC_Os07g48180          GO:0046983      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g48180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0142120      LOC_Os07g46660          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g46660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0142120      LOC_Os07g46660          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g46660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142120      LOC_Os07g46660          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g46660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142120      LOC_Os07g46660          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g46660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142120      LOC_Os07g46660          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g46660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142120      LOC_Os07g46660          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g46660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142120      LOC_Os07g46660          GO:0019941      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g46660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019590       LOC_Os07g10520          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os07g10520          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:019590       LOC_Os07g10520          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os07g10520          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:019590       LOC_Os07g10520          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g10520          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019590       LOC_Os07g10520          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os07g10520          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131994      LOC_Os07g28540          GO:0016627      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g28540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0136122      LOC_Os07g42750          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os07g42750          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -96857,7 +96857,7 @@ GR_gene GR:0116248      LOC_Os08g31410          GO:0008271      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g31410          ge
 GR_gene        GR:0116248      LOC_Os08g31410          GO:0008272      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g31410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116248      LOC_Os08g31410          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g31410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116248      LOC_Os08g31410          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g31410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0126127      LOC_Os08g41270          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g41270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0126127      LOC_Os08g41270          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0123255      LOC_Os08g13970          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g13970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140539      LOC_Os08g32580          GO:0003723      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g32580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140539      LOC_Os08g32580          GO:0003964      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g32580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -96890,7 +96890,7 @@ GR_gene GR:0154222      LOC_Os08g32085          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g32085          ge
 GR_gene        GR:0154222      LOC_Os08g32085          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g32085          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154222      LOC_Os08g32085          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g32085          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154222      LOC_Os08g32085          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g32085          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0154222      LOC_Os08g32085          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g32085          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0154222      LOC_Os08g32085          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g32085          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154222      LOC_Os08g32085          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g32085          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154222      LOC_Os08g32085          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g32085          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112856      LOC_Os08g35190          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g35190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -97038,7 +97038,7 @@ GR_gene GR:0141029      LOC_Os08g17500          GO:0006694      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g17500          ge
 GR_gene        GR:0141029      LOC_Os08g17500          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g17500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141029      LOC_Os08g17500          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g17500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141029      LOC_Os08g17500          GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g17500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0141029      LOC_Os08g17500          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g17500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0141029      LOC_Os08g17500          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g17500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141029      LOC_Os08g17500          GO:0044237      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g17500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0141029      LOC_Os08g17500          GO:0050662      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g17500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0138432      LOC_Os08g07950          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g07950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -97093,7 +97093,7 @@ GR_gene GR:0110779      LOC_Os08g24540          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g24540          ge
 GR_gene        GR:0110779      LOC_Os08g24540          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g24540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115429      LOC_Os08g20480          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g20480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115429      LOC_Os08g20480          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g20480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0145970      LOC_Os08g41610          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g41610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0145970      LOC_Os08g41610          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145970      LOC_Os08g41610          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g41610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145970      LOC_Os08g41610          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145970      LOC_Os08g41610          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41610          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -97749,7 +97749,7 @@ GR_gene GR:0135708      LOC_Os08g09900          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g09900          ge
 GR_gene        GR:0135708      LOC_Os08g09900          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g09900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135708      LOC_Os08g09900          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g09900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135708      LOC_Os08g09900          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g09900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0135708      LOC_Os08g09900          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g09900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0135708      LOC_Os08g09900          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g09900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135708      LOC_Os08g09900          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g09900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135708      LOC_Os08g09900          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g09900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135708      LOC_Os08g09900          GO:0046983      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g09900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -98027,7 +98027,7 @@ GR_gene GR:0158405      LOC_Os08g29180          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g29180          ge
 GR_gene        GR:013657       LOC_Os08g41860          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g41860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013657       LOC_Os08g41860          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013657       LOC_Os08g41860          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g41860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0122302      LOC_Os08g41560          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g41560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0122302      LOC_Os08g41560          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122302      LOC_Os08g41560          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g41560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122302      LOC_Os08g41560          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g41560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122302      LOC_Os08g41560          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -98916,7 +98916,7 @@ GR_gene GR:0131430      LOC_Os08g15298          GO:0009579      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g15298          ge
 GR_gene        GR:0131430      LOC_Os08g15298          GO:0015979      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g15298          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131430      LOC_Os08g15298          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g15298          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131430      LOC_Os08g15298          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g15298          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0111903      LOC_Os08g41630          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g41630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0111903      LOC_Os08g41630          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111903      LOC_Os08g41630          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g41630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111903      LOC_Os08g41630          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111903      LOC_Os08g41630          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -99140,7 +99140,7 @@ GR_gene GR:0156474      LOC_Os08g15060          GO:0006950      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g15060          ge
 GR_gene        GR:017139       LOC_Os08g13890          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g13890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017139       LOC_Os08g13890          GO:0004518      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g13890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145895      LOC_Os08g39830          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g39830          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0145895      LOC_Os08g39830          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g39830          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0145895      LOC_Os08g39830          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g39830          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131038      LOC_Os08g45260          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g45260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131038      LOC_Os08g45260          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g45260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124862      LOC_Os08g25430          GO:0004672      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g25430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -99508,7 +99508,7 @@ GR_gene GR:0152812      LOC_Os08g32080          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g32080          ge
 GR_gene        GR:0152812      LOC_Os08g32080          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g32080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152812      LOC_Os08g32080          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g32080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152812      LOC_Os08g32080          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g32080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0152812      LOC_Os08g32080          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g32080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0152812      LOC_Os08g32080          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g32080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152812      LOC_Os08g32080          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g32080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152812      LOC_Os08g32080          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g32080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117167      LOC_Os08g37345          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g37345          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -100016,7 +100016,7 @@ GR_gene       GR:0137118      LOC_Os08g19650          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g19650          ge
 GR_gene        GR:0137118      LOC_Os08g19650          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g19650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137118      LOC_Os08g19650          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g19650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137118      LOC_Os08g19650          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g19650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0137118      LOC_Os08g19650          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g19650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0137118      LOC_Os08g19650          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g19650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137118      LOC_Os08g19650          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g19650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137118      LOC_Os08g19650          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g19650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128180      LOC_Os08g38630          GO:0004872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g38630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -100950,7 +100950,7 @@ GR_gene       GR:0116131      LOC_Os08g35600          GO:0006468      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g35600          ge
 GR_gene        GR:0157630      LOC_Os08g14580          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g14580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157630      LOC_Os08g14580          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g14580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157630      LOC_Os08g14580          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g14580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0116508      LOC_Os08g41840          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g41840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0116508      LOC_Os08g41840          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g41840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116508      LOC_Os08g41840          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g41840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116508      LOC_Os08g41840          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g41840          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125065      LOC_Os08g06110          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g06110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -101322,7 +101322,7 @@ GR_gene       GR:0118168      LOC_Os08g04870          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g04870          ge
 GR_gene        GR:0118168      LOC_Os08g04870          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g04870          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140904      LOC_Os08g20330          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g20330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0140904      LOC_Os08g20330          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g20330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:016783       LOC_Os08g41580          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g41580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:016783       LOC_Os08g41580          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016783       LOC_Os08g41580          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g41580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016783       LOC_Os08g41580          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g41580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016783       LOC_Os08g41580          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -101627,7 +101627,7 @@ GR_gene       GR:0139389      LOC_Os08g37580          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g37580          ge
 GR_gene        GR:0139389      LOC_Os08g37580          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g37580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139389      LOC_Os08g37580          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g37580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139389      LOC_Os08g37580          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g37580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0139389      LOC_Os08g37580          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g37580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0139389      LOC_Os08g37580          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g37580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139389      LOC_Os08g37580          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g37580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139389      LOC_Os08g37580          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g37580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115043      LOC_Os08g43270          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g43270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -101697,7 +101697,7 @@ GR_gene       GR:0145515      LOC_Os08g08820          GO:0036374      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g08820          ge
 GR_gene        GR:0145515      LOC_Os08g08820          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g08820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145515      LOC_Os08g08820          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g08820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145515      LOC_Os08g08820          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g08820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0145515      LOC_Os08g08820          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g08820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0145515      LOC_Os08g08820          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g08820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145515      LOC_Os08g08820          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g08820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145515      LOC_Os08g08820          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g08820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014044       LOC_Os08g18210          GO:0003723      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g18210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -101781,7 +101781,7 @@ GR_gene       GR:0158849      LOC_Os08g15280          GO:0009536      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g15280          ge
 GR_gene        GR:0158849      LOC_Os08g15280          GO:0015979      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g15280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0158849      LOC_Os08g15280          GO:0020037      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g15280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0158849      LOC_Os08g15280          GO:0042651      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g15280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0118002      LOC_Os08g41530          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g41530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0118002      LOC_Os08g41530          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118002      LOC_Os08g41530          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g41530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118002      LOC_Os08g41530          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118002      LOC_Os08g41530          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -102085,7 +102085,7 @@ GR_gene       GR:0137826      LOC_Os08g22110          GO:0006278      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g22110          ge
 GR_gene        GR:0137826      LOC_Os08g22110          GO:0006333      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g22110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137826      LOC_Os08g22110          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g22110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137826      LOC_Os08g22110          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g22110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0128490      LOC_Os08g25460          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g25460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0128490      LOC_Os08g25460          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g25460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128490      LOC_Os08g25460          GO:0005673      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g25460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128490      LOC_Os08g25460          GO:0006367      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g25460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013247       LOC_Os08g44330          GO:0003755      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g44330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -102171,7 +102171,7 @@ GR_gene       GR:017262       LOC_Os08g36790          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g36790          gen
 GR_gene        GR:017262       LOC_Os08g36790          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g36790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017262       LOC_Os08g36790          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g36790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017262       LOC_Os08g36790          GO:0009738      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g36790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:017262       LOC_Os08g36790          GO:0000976      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g36790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:017262       LOC_Os08g36790          GO:0000976      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g36790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017262       LOC_Os08g36790          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g36790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017262       LOC_Os08g36790          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g36790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017262       LOC_Os08g36790          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g36790          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -102327,7 +102327,7 @@ GR_gene       GR:0152026      LOC_Os08g43050          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g43050          ge
 GR_gene        GR:0152026      LOC_Os08g43050          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g43050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152026      LOC_Os08g43050          GO:0006915      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g43050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152026      LOC_Os08g43050          GO:0006952      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g43050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0141516      LOC_Os08g21590          GO:0016307      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g21590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0141516      LOC_Os08g21590          GO:0016307      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g21590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141516      LOC_Os08g21590          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g21590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141516      LOC_Os08g21590          GO:0005942      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g21590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141516      LOC_Os08g21590          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g21590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -102964,7 +102964,7 @@ GR_gene       GR:0134511      LOC_Os08g34280          GO:0006694      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g34280          ge
 GR_gene        GR:0134511      LOC_Os08g34280          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g34280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134511      LOC_Os08g34280          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g34280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134511      LOC_Os08g34280          GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g34280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0134511      LOC_Os08g34280          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g34280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0134511      LOC_Os08g34280          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g34280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134511      LOC_Os08g34280          GO:0044237      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g34280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0134511      LOC_Os08g34280          GO:0050662      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g34280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130695      LOC_Os08g06240          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g06240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -103251,7 +103251,7 @@ GR_gene       GR:0146403      LOC_Os08g42020          GO:0005667      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g42020          ge
 GR_gene        GR:0146403      LOC_Os08g42020          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g42020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146403      LOC_Os08g42020          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g42020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146403      LOC_Os08g42020          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g42020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0146403      LOC_Os08g42020          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g42020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0146403      LOC_Os08g42020          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g42020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143355      LOC_Os08g36520          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g36520          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143355      LOC_Os08g36520          GO:0004190      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g36520          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143355      LOC_Os08g36520          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g36520          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -103392,7 +103392,7 @@ GR_gene       GR:0137316      LOC_Os08g29720          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g29720          ge
 GR_gene        GR:0114884      LOC_Os08g31960          GO:0005215      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g31960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114884      LOC_Os08g31960          GO:0006857      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g31960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114884      LOC_Os08g31960          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g31960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0130742      LOC_Os08g37350          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g37350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0130742      LOC_Os08g37350          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g37350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130742      LOC_Os08g37350          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g37350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130742      LOC_Os08g37350          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g37350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130742      LOC_Os08g37350          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g37350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -103523,7 +103523,7 @@ GR_gene       GR:019643       LOC_Os08g13690          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g13690          gen
 GR_gene        GR:019643       LOC_Os08g13690          GO:0005840      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g13690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019643       LOC_Os08g13690          GO:0006412      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g13690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019643       LOC_Os08g13690          GO:0015934      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g13690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:019643       LOC_Os08g13690          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g13690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:019643       LOC_Os08g13690          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g13690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019643       LOC_Os08g13690          GO:0030529      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g13690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135244      LOC_Os08g07970          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g07970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135244      LOC_Os08g07970          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g07970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -103607,7 +103607,7 @@ GR_gene       GR:0113175      LOC_Os08g22910          GO:0004190      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g22910          ge
 GR_gene        GR:0113175      LOC_Os08g22910          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g22910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148504      LOC_Os08g12900          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g12900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111922      LOC_Os08g16030          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g16030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0111922      LOC_Os08g16030          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g16030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0111922      LOC_Os08g16030          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g16030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111922      LOC_Os08g16030          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g16030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114469      LOC_Os08g08460          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g08460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114469      LOC_Os08g08460          GO:0003723      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g08460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -103688,7 +103688,7 @@ GR_gene       GR:0146187      LOC_Os08g36220          GO:0005840      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g36220          ge
 GR_gene        GR:0146187      LOC_Os08g36220          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g36220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146187      LOC_Os08g36220          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g36220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146187      LOC_Os08g36220          GO:0006412      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g36220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0146187      LOC_Os08g36220          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g36220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0146187      LOC_Os08g36220          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g36220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146187      LOC_Os08g36220          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g36220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146187      LOC_Os08g36220          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g36220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146187      LOC_Os08g36220          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g36220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -104046,7 +104046,7 @@ GR_gene       GR:0119356      LOC_Os08g44000          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g44000          ge
 GR_gene        GR:0119356      LOC_Os08g44000          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g44000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0119356      LOC_Os08g44000          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g44000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0119356      LOC_Os08g44000          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g44000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0119356      LOC_Os08g44000          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g44000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0119356      LOC_Os08g44000          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g44000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0119356      LOC_Os08g44000          GO:0044237      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g44000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0119356      LOC_Os08g44000          GO:0050662      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g44000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130116      LOC_Os08g39330          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g39330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -104097,7 +104097,7 @@ GR_gene       GR:0148539      LOC_Os08g01090          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g01090          ge
 GR_gene        GR:0148539      LOC_Os08g01090          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g01090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148539      LOC_Os08g01090          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g01090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148539      LOC_Os08g01090          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g01090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0148539      LOC_Os08g01090          GO:0000976      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g01090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0148539      LOC_Os08g01090          GO:0000976      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g01090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148539      LOC_Os08g01090          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g01090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014676       LOC_Os08g24570          GO:0000785      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g24570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014676       LOC_Os08g24570          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g24570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -104824,7 +104824,7 @@ GR_gene       GR:0124179      LOC_Os08g40620          GO:0043087      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g40620          ge
 GR_gene        GR:0151185      LOC_Os08g30270          GO:0046983      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g30270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141478      LOC_Os08g20320          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g20320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141478      LOC_Os08g20320          GO:0004523      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g20320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0137269      LOC_Os08g41550          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g41550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0137269      LOC_Os08g41550          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137269      LOC_Os08g41550          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g41550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137269      LOC_Os08g41550          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137269      LOC_Os08g41550          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -104838,7 +104838,7 @@ GR_gene       GR:0110135      LOC_Os08g04190          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g04190          ge
 GR_gene        GR:0110135      LOC_Os08g04190          GO:0006807      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g04190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110135      LOC_Os08g04190          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g04190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110135      LOC_Os08g04190          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g04190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0110135      LOC_Os08g04190          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g04190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0110135      LOC_Os08g04190          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g04190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110135      LOC_Os08g04190          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g04190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110135      LOC_Os08g04190          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g04190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151201      LOC_Os08g05450          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g05450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -104923,7 +104923,7 @@ GR_gene       GR:0158609      LOC_Os08g21020          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g21020          ge
 GR_gene        GR:0158609      LOC_Os08g21020          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g21020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111410      LOC_Os08g17680          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g17680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127821      LOC_Os08g31950          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g31950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0127821      LOC_Os08g31950          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g31950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0127821      LOC_Os08g31950          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g31950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127821      LOC_Os08g31950          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g31950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130418      LOC_Os08g01760          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g01760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130418      LOC_Os08g01760          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g01760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -105077,7 +105077,7 @@ GR_gene       GR:0133053      LOC_Os08g35810          GO:0004523      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g35810          ge
 GR_gene        GR:0133053      LOC_Os08g35810          GO:0006278      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g35810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133053      LOC_Os08g35810          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g35810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133053      LOC_Os08g35810          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g35810          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0111089      LOC_Os08g41620          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g41620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0111089      LOC_Os08g41620          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111089      LOC_Os08g41620          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g41620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111089      LOC_Os08g41620          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111089      LOC_Os08g41620          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -105155,7 +105155,7 @@ GR_gene       GR:0129140      LOC_Os08g42000          GO:0015031      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g42000          ge
 GR_gene        GR:0151074      LOC_Os08g23290          GO:0004872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g23290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151074      LOC_Os08g23290          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g23290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151074      LOC_Os08g23290          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g23290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0128965      LOC_Os08g32960          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g32960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0128965      LOC_Os08g32960          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g32960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152237      LOC_Os08g36500          GO:0005506      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g36500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152237      LOC_Os08g36500          GO:0009055      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g36500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152237      LOC_Os08g36500          GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g36500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -105292,7 +105292,7 @@ GR_gene       GR:0147685      LOC_Os08g38560          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g38560          ge
 GR_gene        GR:0147685      LOC_Os08g38560          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g38560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147685      LOC_Os08g38560          GO:0006468      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g38560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0147685      LOC_Os08g38560          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g38560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0114814      LOC_Os08g41540          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g41540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0114814      LOC_Os08g41540          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114814      LOC_Os08g41540          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g41540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114814      LOC_Os08g41540          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114814      LOC_Os08g41540          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g41540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -105463,7 +105463,7 @@ GR_gene       GR:0143083      LOC_Os08g42920          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g42920          ge
 GR_gene        GR:0143083      LOC_Os08g42920          GO:0005840      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g42920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143083      LOC_Os08g42920          GO:0006412      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g42920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143083      LOC_Os08g42920          GO:0015934      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os08g42920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0143083      LOC_Os08g42920          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os08g42920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0143083      LOC_Os08g42920          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g42920          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144174      LOC_Os08g04150          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g04150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144174      LOC_Os08g04150          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g04150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144174      LOC_Os08g04150          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os08g04150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -106137,7 +106137,7 @@ GR_gene       GR:015801       LOC_Os08g14860          GO:0008121      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os08g14860          gen
 GR_gene        GR:0145688      LOC_Os09g38540          GO:0005507      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g38540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145688      LOC_Os09g38540          GO:0009055      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g38540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116118      LOC_Os09g20940          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g20940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0116118      LOC_Os09g20940          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g20940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0116118      LOC_Os09g20940          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g20940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116118      LOC_Os09g20940          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g20940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013385       LOC_Os09g36320          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g36320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013385       LOC_Os09g36320          GO:0004672      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g36320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -106509,7 +106509,7 @@ GR_gene       GR:0113144      LOC_Os09g34270          GO:0016758      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g34270          ge
 GR_gene        GR:0152633      LOC_Os09g23470          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g23470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152633      LOC_Os09g23470          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g23470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152633      LOC_Os09g23470          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g23470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0127543      LOC_Os09g39970          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g39970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0127543      LOC_Os09g39970          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g39970          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143988      LOC_Os09g26260          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g26260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143988      LOC_Os09g26260          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g26260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143988      LOC_Os09g26260          GO:0017111      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g26260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -107173,7 +107173,7 @@ GR_gene       GR:0131410      LOC_Os09g38020          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g38020          ge
 GR_gene        GR:0131410      LOC_Os09g38020          GO:0005694      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g38020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131410      LOC_Os09g38020          GO:0006334      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g38020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131410      LOC_Os09g38020          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g38020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0131410      LOC_Os09g38020          GO:0140223      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g38020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0131410      LOC_Os09g38020          GO:0140223      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g38020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112343      LOC_Os09g39490          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g39490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112343      LOC_Os09g39490          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g39490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112343      LOC_Os09g39490          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g39490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -107231,7 +107231,7 @@ GR_gene       GR:0123949      LOC_Os09g14510          GO:0007031      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g14510          ge
 GR_gene        GR:014021       LOC_Os09g16370          GO:0004190      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g16370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014021       LOC_Os09g16370          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g16370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149750      LOC_Os09g21210          GO:0016998      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g21210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0149750      LOC_Os09g21210          GO:0052736      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g21210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0149750      LOC_Os09g21210          GO:0052736      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g21210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133293      LOC_Os09g16449          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g16449          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133293      LOC_Os09g16449          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g16449          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133293      LOC_Os09g16449          GO:0016887      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g16449          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -107297,7 +107297,7 @@ GR_gene       GR:0146676      LOC_Os09g34300          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g34300          ge
 GR_gene        GR:0146676      LOC_Os09g34300          GO:0006955      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g34300          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146676      LOC_Os09g34300          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g34300          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146676      LOC_Os09g34300          GO:0032957      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g34300          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0146676      LOC_Os09g34300          GO:0051766      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g34300          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0146676      LOC_Os09g34300          GO:0051766      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g34300          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146676      LOC_Os09g34300          GO:0047325      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g34300          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0158969      LOC_Os09g23150          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g23150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0119692      LOC_Os09g08470          GO:0000785      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g08470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -107479,7 +107479,7 @@ GR_gene       GR:0122898      LOC_Os09g04160          GO:0033178      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g04160          ge
 GR_gene        GR:018781       LOC_Os09g31310          GO:0008080      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g31310          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018781       LOC_Os09g31310          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g31310          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018781       LOC_Os09g31310          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g31310          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0154874      LOC_Os09g26180          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g26180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0154874      LOC_Os09g26180          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g26180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154874      LOC_Os09g26180          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g26180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154874      LOC_Os09g26180          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g26180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133302      LOC_Os09g36960          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g36960          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -107583,7 +107583,7 @@ GR_gene       GR:014321       LOC_Os09g03140          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g03140          gen
 GR_gene        GR:014321       LOC_Os09g03140          GO:0016758      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g03140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019430       LOC_Os09g39230          GO:0004664      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g39230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019430       LOC_Os09g39230          GO:0009094      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g39230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0142443      LOC_Os09g37580          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g37580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0142443      LOC_Os09g37580          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g37580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142443      LOC_Os09g37580          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g37580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142443      LOC_Os09g37580          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g37580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142443      LOC_Os09g37580          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g37580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -107721,7 +107721,7 @@ GR_gene       GR:0139817      LOC_Os09g36440          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g36440          ge
 GR_gene        GR:0139817      LOC_Os09g36440          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g36440          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139817      LOC_Os09g36440          GO:0006413      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g36440          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139817      LOC_Os09g36440          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g36440          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0139817      LOC_Os09g36440          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g36440          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0139817      LOC_Os09g36440          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g36440          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139817      LOC_Os09g36440          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g36440          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139817      LOC_Os09g36440          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g36440          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017140       LOC_Os09g19940          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g19940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -109122,7 +109122,7 @@ GR_gene       GR:0133050      LOC_Os09g13570          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g13570          ge
 GR_gene        GR:0133050      LOC_Os09g13570          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g13570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133050      LOC_Os09g13570          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g13570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133050      LOC_Os09g13570          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g13570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0133050      LOC_Os09g13570          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g13570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0133050      LOC_Os09g13570          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g13570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133050      LOC_Os09g13570          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g13570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133050      LOC_Os09g13570          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g13570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133050      LOC_Os09g13570          GO:0046983      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g13570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -109275,7 +109275,7 @@ GR_gene       GR:0112874      LOC_Os09g29460          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g29460          ge
 GR_gene        GR:0112874      LOC_Os09g29460          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g29460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112874      LOC_Os09g29460          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g29460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112874      LOC_Os09g29460          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g29460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0112874      LOC_Os09g29460          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g29460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0112874      LOC_Os09g29460          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g29460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112874      LOC_Os09g29460          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g29460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112874      LOC_Os09g29460          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g29460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112874      LOC_Os09g29460          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g29460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -109351,7 +109351,7 @@ GR_gene       GR:0143413      LOC_Os09g16510          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g16510          ge
 GR_gene        GR:0143413      LOC_Os09g16510          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g16510          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155979      LOC_Os09g11290          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g11290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155979      LOC_Os09g11290          GO:0016758      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g11290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0134140      LOC_Os09g28940          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g28940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0134140      LOC_Os09g28940          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g28940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134140      LOC_Os09g28940          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g28940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134140      LOC_Os09g28940          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g28940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134140      LOC_Os09g28940          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g28940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -109375,7 +109375,7 @@ GR_gene       GR:0157520      LOC_Os09g17800          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g17800          ge
 GR_gene        GR:0144118      LOC_Os09g39420          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g39420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144118      LOC_Os09g39420          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g39420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144118      LOC_Os09g39420          GO:0016568      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g39420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0144118      LOC_Os09g39420          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g39420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0144118      LOC_Os09g39420          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g39420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144118      LOC_Os09g39420          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g39420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143779      LOC_Os09g10540          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g10540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143779      LOC_Os09g10540          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g10540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -109764,7 +109764,7 @@ GR_gene       GR:012722       LOC_Os09g39850          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g39850          gen
 GR_gene        GR:012722       LOC_Os09g39850          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g39850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012722       LOC_Os09g39850          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g39850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012722       LOC_Os09g39850          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g39850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:012439       LOC_Os09g24250          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g24250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:012439       LOC_Os09g24250          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g24250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012439       LOC_Os09g24250          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g24250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012439       LOC_Os09g24250          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g24250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012439       LOC_Os09g24250          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g24250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -110182,7 +110182,7 @@ GR_gene       GR:015151       LOC_Os09g27450          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g27450          gen
 GR_gene        GR:015151       LOC_Os09g27450          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g27450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015151       LOC_Os09g27450          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g27450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015151       LOC_Os09g27450          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g27450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:015151       LOC_Os09g27450          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g27450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:015151       LOC_Os09g27450          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g27450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015151       LOC_Os09g27450          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g27450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015151       LOC_Os09g27450          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g27450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015151       LOC_Os09g27450          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g27450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -110335,7 +110335,7 @@ GR_gene       GR:0114150      LOC_Os09g25150          GO:0006694      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g25150          ge
 GR_gene        GR:0114150      LOC_Os09g25150          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g25150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114150      LOC_Os09g25150          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g25150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114150      LOC_Os09g25150          GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g25150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0114150      LOC_Os09g25150          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g25150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0114150      LOC_Os09g25150          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g25150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114150      LOC_Os09g25150          GO:0044237      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g25150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0114150      LOC_Os09g25150          GO:0050662      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g25150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015884       LOC_Os09g08660          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g08660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -110715,7 +110715,7 @@ GR_gene       GR:015931       LOC_Os09g26340          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g26340          gen
 GR_gene        GR:015931       LOC_Os09g26340          GO:0005694      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g26340          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015931       LOC_Os09g26340          GO:0006334      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g26340          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015931       LOC_Os09g26340          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g26340          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:015931       LOC_Os09g26340          GO:0140223      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g26340          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:015931       LOC_Os09g26340          GO:0140223      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g26340          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124035      LOC_Os09g05100          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g05100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124035      LOC_Os09g05100          GO:0008483      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g05100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124035      LOC_Os09g05100          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g05100          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -110793,7 +110793,7 @@ GR_gene       GR:0128213      LOC_Os09g28710          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g28710          ge
 GR_gene        GR:0128213      LOC_Os09g28710          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g28710          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151919      LOC_Os09g23660          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g23660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0151919      LOC_Os09g23660          GO:0045454      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g23660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0135759      LOC_Os09g32440          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g32440          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0135759      LOC_Os09g32440          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g32440          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130751      LOC_Os09g30412          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g30412          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130751      LOC_Os09g30412          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g30412          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130751      LOC_Os09g30412          GO:0005737      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g30412          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -111028,7 +111028,7 @@ GR_gene       GR:0152877      LOC_Os09g37060          GO:0007165      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g37060          ge
 GR_gene        GR:0152877      LOC_Os09g37060          GO:0008083      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g37060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152877      LOC_Os09g37060          GO:0008601      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g37060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152877      LOC_Os09g37060          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g37060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0112750      LOC_Os09g15400          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g15400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0112750      LOC_Os09g15400          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g15400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148486      LOC_Os09g27210          GO:0004607      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g27210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148486      LOC_Os09g27210          GO:0006629      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g27210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148486      LOC_Os09g27210          GO:0016746      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g27210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -111051,7 +111051,7 @@ GR_gene       GR:0129164      LOC_Os09g27500          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g27500          ge
 !GR_gene       GR:0129164      LOC_Os09g27500          GO:0055114      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g27500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134408      LOC_Os09g24660          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g24660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134408      LOC_Os09g24660          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g24660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0134408      LOC_Os09g24660          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g24660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0134408      LOC_Os09g24660          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g24660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134408      LOC_Os09g24660          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g24660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124055      LOC_Os09g29500          GO:0004969      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g29500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124055      LOC_Os09g29500          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g29500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -111271,7 +111271,7 @@ GR_gene       GR:0135699      LOC_Os09g35760          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g35760          ge
 GR_gene        GR:0135699      LOC_Os09g35760          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g35760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135699      LOC_Os09g35760          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g35760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135699      LOC_Os09g35760          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g35760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0135699      LOC_Os09g35760          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g35760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0135699      LOC_Os09g35760          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g35760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135699      LOC_Os09g35760          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g35760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135699      LOC_Os09g35760          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g35760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114123      LOC_Os09g18550          GO:0004872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g18550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -111468,7 +111468,7 @@ GR_gene       GR:0116264      LOC_Os09g09910          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g09910          ge
 GR_gene        GR:0116264      LOC_Os09g09910          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g09910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116264      LOC_Os09g09910          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g09910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016985       LOC_Os09g25860          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g25860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:016985       LOC_Os09g25860          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g25860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:016985       LOC_Os09g25860          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g25860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016985       LOC_Os09g25860          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g25860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0119795      LOC_Os09g04740          GO:0000785      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g04740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0119795      LOC_Os09g04740          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g04740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -111740,7 +111740,7 @@ GR_gene       GR:0135143      LOC_Os09g14940          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g14940          ge
 GR_gene        GR:0135143      LOC_Os09g14940          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g14940          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012846       LOC_Os09g32380          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g32380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012846       LOC_Os09g32380          GO:0046983      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g32380          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0110208      LOC_Os09g32740          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g32740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0110208      LOC_Os09g32740          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g32740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110208      LOC_Os09g32740          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g32740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110208      LOC_Os09g32740          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g32740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110208      LOC_Os09g32740          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g32740          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -111789,7 +111789,7 @@ GR_gene       GR:0129046      LOC_Os09g35910          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g35910          ge
 GR_gene        GR:0129046      LOC_Os09g35910          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g35910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129046      LOC_Os09g35910          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g35910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129046      LOC_Os09g35910          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g35910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0129046      LOC_Os09g35910          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g35910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0129046      LOC_Os09g35910          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g35910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129046      LOC_Os09g35910          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g35910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129046      LOC_Os09g35910          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g35910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139591      LOC_Os09g12600          GO:0005215      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g12600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -111889,7 +111889,7 @@ GR_gene       GR:0148030      LOC_Os09g10950          GO:0005198      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g10950          ge
 GR_gene        GR:0148030      LOC_Os09g10950          GO:0007155      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g10950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148030      LOC_Os09g10950          GO:0015629      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g10950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137306      LOC_Os09g31400          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g31400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0137306      LOC_Os09g31400          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g31400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0137306      LOC_Os09g31400          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g31400          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112808      LOC_Os09g38800          GO:0004672      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g38800          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112808      LOC_Os09g38800          GO:0004674      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g38800          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112808      LOC_Os09g38800          GO:0004713      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g38800          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -112864,7 +112864,7 @@ GR_gene       GR:0116594      LOC_Os09g33450          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g33450          ge
 GR_gene        GR:0116594      LOC_Os09g33450          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g33450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116594      LOC_Os09g33450          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g33450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155534      LOC_Os09g31025          GO:0005509      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g31025          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0119677      LOC_Os09g23140          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g23140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0119677      LOC_Os09g23140          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g23140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124780      LOC_Os09g38340          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g38340          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124780      LOC_Os09g38340          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g38340          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0110562      LOC_Os09g35770          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g35770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -113361,7 +113361,7 @@ GR_gene       GR:0134261      LOC_Os09g21180          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g21180          ge
 GR_gene        GR:0134261      LOC_Os09g21180          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g21180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134261      LOC_Os09g21180          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g21180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134261      LOC_Os09g21180          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g21180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0134261      LOC_Os09g21180          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g21180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0134261      LOC_Os09g21180          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g21180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134261      LOC_Os09g21180          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g21180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134261      LOC_Os09g21180          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g21180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0113605      LOC_Os09g09370          GO:0004871      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g09370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -113578,7 +113578,7 @@ GR_gene       GR:0128861      LOC_Os09g13575          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g13575          ge
 GR_gene        GR:0128861      LOC_Os09g13575          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g13575          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128861      LOC_Os09g13575          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g13575          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128861      LOC_Os09g13575          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g13575          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0128861      LOC_Os09g13575          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g13575          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0128861      LOC_Os09g13575          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g13575          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128861      LOC_Os09g13575          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g13575          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128861      LOC_Os09g13575          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g13575          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128861      LOC_Os09g13575          GO:0046983      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g13575          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -113712,7 +113712,7 @@ GR_gene       GR:0135347      LOC_Os09g30280          GO:0016757      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g30280          ge
 GR_gene        GR:0137084      LOC_Os09g11270          GO:0005578      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g11270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137084      LOC_Os09g11270          GO:0008237      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g11270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0137084      LOC_Os09g11270          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g11270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0152953      LOC_Os09g29760          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os09g29760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0152953      LOC_Os09g29760          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os09g29760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152953      LOC_Os09g29760          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os09g29760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152953      LOC_Os09g29760          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g29760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132891      LOC_Os09g07290          GO:0006629      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os09g07290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -114193,7 +114193,7 @@ GR_gene       GR:012849       LOC_Os10g18010          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g18010          gen
 GR_gene        GR:012849       LOC_Os10g18010          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g18010          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012849       LOC_Os10g18010          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g18010          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012849       LOC_Os10g18010          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g18010          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:012849       LOC_Os10g18010          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g18010          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:012849       LOC_Os10g18010          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g18010          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150367      LOC_Os10g17690          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g17690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150367      LOC_Os10g17690          GO:0006915      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g17690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150367      LOC_Os10g17690          GO:0006952      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g17690          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -114252,7 +114252,7 @@ GR_gene       GR:0150666      LOC_Os10g39030          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g39030          ge
 GR_gene        GR:0150666      LOC_Os10g39030          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g39030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150666      LOC_Os10g39030          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g39030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150666      LOC_Os10g39030          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g39030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0150666      LOC_Os10g39030          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g39030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0150666      LOC_Os10g39030          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g39030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150666      LOC_Os10g39030          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g39030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150666      LOC_Os10g39030          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g39030          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0134429      LOC_Os10g42720          GO:0004366      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g42720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -114532,7 +114532,7 @@ GR_gene       GR:0157321      LOC_Os10g42550          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g42550          ge
 GR_gene        GR:0157321      LOC_Os10g42550          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g42550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157321      LOC_Os10g42550          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g42550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157321      LOC_Os10g42550          GO:0032957      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g42550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0157321      LOC_Os10g42550          GO:0051766      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g42550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0157321      LOC_Os10g42550          GO:0051766      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g42550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157321      LOC_Os10g42550          GO:0047325      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g42550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124638      LOC_Os10g41930          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g41930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124638      LOC_Os10g41930          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g41930          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -115466,7 +115466,7 @@ GR_gene       GR:0113045      LOC_Os10g27350          GO:0007155      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g27350          ge
 GR_gene        GR:0113045      LOC_Os10g27350          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g27350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113045      LOC_Os10g27350          GO:0015629      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g27350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113045      LOC_Os10g27350          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g27350          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0146786      LOC_Os10g36680          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g36680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0146786      LOC_Os10g36680          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g36680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146786      LOC_Os10g36680          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g36680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146786      LOC_Os10g36680          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g36680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0119392      LOC_Os10g32290          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g32290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -115847,7 +115847,7 @@ GR_gene       GR:016432       LOC_Os10g26500          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g26500          gen
 GR_gene        GR:016432       LOC_Os10g26500          GO:0006457      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g26500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016432       LOC_Os10g26500          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g26500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016432       LOC_Os10g26500          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g26500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:016432       LOC_Os10g26500          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g26500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:016432       LOC_Os10g26500          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g26500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016432       LOC_Os10g26500          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g26500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016432       LOC_Os10g26500          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g26500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0136850      LOC_Os10g37680          GO:0005198      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g37680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -115860,7 +115860,7 @@ GR_gene       GR:019432       LOC_Os10g39410          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g39410          gen
 GR_gene        GR:019432       LOC_Os10g39410          GO:0005694      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g39410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019432       LOC_Os10g39410          GO:0006334      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g39410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019432       LOC_Os10g39410          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g39410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:019432       LOC_Os10g39410          GO:0140223      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g39410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:019432       LOC_Os10g39410          GO:0140223      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g39410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133699      LOC_Os10g31950          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g31950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133699      LOC_Os10g31950          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g31950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133699      LOC_Os10g31950          GO:0016746      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g31950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -116228,7 +116228,7 @@ GR_gene       GR:0141746      LOC_Os10g33650          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g33650          ge
 GR_gene        GR:0141746      LOC_Os10g33650          GO:0006468      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g33650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141746      LOC_Os10g33650          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g33650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111275      LOC_Os10g26460          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g26460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0111275      LOC_Os10g26460          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g26460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0111275      LOC_Os10g26460          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g26460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111275      LOC_Os10g26460          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g26460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116889      LOC_Os10g08260          GO:0004497      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g08260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116889      LOC_Os10g08260          GO:0005506      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g08260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -116605,7 +116605,7 @@ GR_gene       GR:0130440      LOC_Os10g21342          GO:0030529      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g21342          ge
 GR_gene        GR:0131499      LOC_Os10g03570          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g03570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131499      LOC_Os10g03570          GO:0006915      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g03570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131499      LOC_Os10g03570          GO:0006952      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g03570          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:012083       LOC_Os10g07270          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g07270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:012083       LOC_Os10g07270          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g07270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012083       LOC_Os10g07270          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g07270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012083       LOC_Os10g07270          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g07270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012083       LOC_Os10g07270          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g07270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -116689,7 +116689,7 @@ GR_gene       GR:018925       LOC_Os10g01320          GO:0004523      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g01320          gen
 GR_gene        GR:018925       LOC_Os10g01320          GO:0006278      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g01320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:018925       LOC_Os10g01320          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g01320          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0159040      LOC_Os10g26410          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g26410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0159040      LOC_Os10g26410          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g26410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0159040      LOC_Os10g26410          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g26410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0159040      LOC_Os10g26410          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g26410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131652      LOC_Os10g17680          GO:0003779      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g17680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131652      LOC_Os10g17680          GO:0005737      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g17680          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -116976,7 +116976,7 @@ GR_gene       GR:0128878      LOC_Os10g01480          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g01480          ge
 GR_gene        GR:0128878      LOC_Os10g01480          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g01480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128878      LOC_Os10g01480          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g01480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128878      LOC_Os10g01480          GO:0032957      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g01480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0128878      LOC_Os10g01480          GO:0051766      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g01480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0128878      LOC_Os10g01480          GO:0051766      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g01480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128878      LOC_Os10g01480          GO:0047325      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g01480          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121101      LOC_Os10g04429          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g04429          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121101      LOC_Os10g04429          GO:0016747      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g04429          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -118614,7 +118614,7 @@ GR_gene       GR:0142484      LOC_Os10g01470          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g01470          ge
 GR_gene        GR:0142484      LOC_Os10g01470          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g01470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142484      LOC_Os10g01470          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g01470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142484      LOC_Os10g01470          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g01470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0142484      LOC_Os10g01470          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g01470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0142484      LOC_Os10g01470          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g01470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142484      LOC_Os10g01470          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g01470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142484      LOC_Os10g01470          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g01470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143254      LOC_Os10g11230          GO:0005199      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g11230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -118683,7 +118683,7 @@ GR_gene       GR:0112862      LOC_Os10g18026          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g18026          ge
 GR_gene        GR:0112862      LOC_Os10g18026          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g18026          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112862      LOC_Os10g18026          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g18026          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112862      LOC_Os10g18026          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g18026          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0112862      LOC_Os10g18026          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g18026          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0112862      LOC_Os10g18026          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g18026          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015783       LOC_Os10g21950          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g21950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015783       LOC_Os10g21950          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g21950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015783       LOC_Os10g21950          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g21950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -118841,7 +118841,7 @@ GR_gene       GR:0135024      LOC_Os10g01044          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g01044          ge
 GR_gene        GR:0135024      LOC_Os10g01044          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g01044          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135024      LOC_Os10g01044          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g01044          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135024      LOC_Os10g01044          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g01044          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0135024      LOC_Os10g01044          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g01044          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0135024      LOC_Os10g01044          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g01044          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135024      LOC_Os10g01044          GO:0044237      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g01044          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0135024      LOC_Os10g01044          GO:0050662      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g01044          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150148      LOC_Os10g10890          GO:0005215      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g10890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -119082,7 +119082,7 @@ GR_gene       GR:0122705      LOC_Os10g23090          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g23090          ge
 GR_gene        GR:0122705      LOC_Os10g23090          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g23090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122705      LOC_Os10g23090          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g23090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122705      LOC_Os10g23090          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g23090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0122705      LOC_Os10g23090          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g23090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0122705      LOC_Os10g23090          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g23090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122705      LOC_Os10g23090          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g23090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122705      LOC_Os10g23090          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g23090          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135958      LOC_Os10g07572          GO:0000785      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g07572          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -119805,7 +119805,7 @@ GR_gene       GR:0145507      LOC_Os10g42490          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g42490          ge
 GR_gene        GR:0145507      LOC_Os10g42490          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g42490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145507      LOC_Os10g42490          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g42490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145507      LOC_Os10g42490          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g42490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0145507      LOC_Os10g42490          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g42490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0145507      LOC_Os10g42490          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g42490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145507      LOC_Os10g42490          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g42490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145507      LOC_Os10g42490          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g42490          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012354       LOC_Os10g42650          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g42650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -119910,7 +119910,7 @@ GR_gene       GR:015632       LOC_Os10g10270          GO:0003746      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g10270          gen
 GR_gene        GR:015632       LOC_Os10g10270          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g10270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015632       LOC_Os10g10270          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g10270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015632       LOC_Os10g10270          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g10270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:015632       LOC_Os10g10270          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g10270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:015632       LOC_Os10g10270          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g10270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0138586      LOC_Os10g18060          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g18060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0138586      LOC_Os10g18060          GO:0003723      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g18060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0138586      LOC_Os10g18060          GO:0003964      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g18060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -120375,8 +120375,8 @@ GR_gene       GR:015898       LOC_Os10g41230          GO:0004879      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g41230          gen
 GR_gene        GR:015898       LOC_Os10g41230          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g41230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015898       LOC_Os10g41230          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g41230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015898       LOC_Os10g41230          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g41230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:015898       LOC_Os10g41230          GO:0001228      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g41230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:015898       LOC_Os10g41230          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g41230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:015898       LOC_Os10g41230          GO:0001228      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g41230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:015898       LOC_Os10g41230          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g41230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015898       LOC_Os10g41230          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g41230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015898       LOC_Os10g41230          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g41230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116134      LOC_Os10g25590          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g25590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -120658,14 +120658,14 @@ GR_gene     GR:0127125      LOC_Os10g32124          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g32124          ge
 GR_gene        GR:0127125      LOC_Os10g32124          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g32124          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156811      LOC_Os10g32590          GO:0006950      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g32590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156151      LOC_Os10g10990          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g10990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0156151      LOC_Os10g10990          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g10990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0156151      LOC_Os10g10990          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g10990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156151      LOC_Os10g10990          GO:0003743      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g10990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156151      LOC_Os10g10990          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g10990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156151      LOC_Os10g10990          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g10990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156151      LOC_Os10g10990          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g10990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156151      LOC_Os10g10990          GO:0006367      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g10990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156151      LOC_Os10g10990          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g10990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0156151      LOC_Os10g10990          GO:0001228      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g10990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0156151      LOC_Os10g10990          GO:0001228      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g10990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0156151      LOC_Os10g10990          GO:0045893      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g10990          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113240      LOC_Os10g21850          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g21850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113240      LOC_Os10g21850          GO:0003723      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g21850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -120787,7 +120787,7 @@ GR_gene       GR:0123963      LOC_Os10g04860          GO:0051536      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g04860          ge
 GR_gene        GR:0123963      LOC_Os10g04860          GO:0051537      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g04860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0123963      LOC_Os10g04860          GO:0055114      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g04860          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013651       LOC_Os10g29660          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g29660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:013651       LOC_Os10g29660          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g29660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:013651       LOC_Os10g29660          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g29660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013651       LOC_Os10g29660          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g29660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013651       LOC_Os10g29660          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g29660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013651       LOC_Os10g29660          GO:0005669      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g29660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -121858,7 +121858,7 @@ GR_gene       GR:013052       LOC_Os10g10260          GO:0003746      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g10260          gen
 GR_gene        GR:013052       LOC_Os10g10260          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g10260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013052       LOC_Os10g10260          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g10260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013052       LOC_Os10g10260          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g10260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:013052       LOC_Os10g10260          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g10260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:013052       LOC_Os10g10260          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g10260          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142768      LOC_Os10g37280          GO:0004143      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g37280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142768      LOC_Os10g37280          GO:0007205      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g37280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142768      LOC_Os10g37280          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g37280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -122511,7 +122511,7 @@ GR_gene       GR:0118235      LOC_Os10g08540          GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g08540          ge
 GR_gene        GR:0118235      LOC_Os10g08540          GO:0020037      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g08540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118235      LOC_Os10g08540          GO:0046872      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g08540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0118235      LOC_Os10g08540          GO:0055114      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g08540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0126815      LOC_Os10g25770          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g25770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0126815      LOC_Os10g25770          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g25770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126815      LOC_Os10g25770          GO:0003743      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g25770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126815      LOC_Os10g25770          GO:0005673      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g25770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126815      LOC_Os10g25770          GO:0006367      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g25770          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -122635,7 +122635,7 @@ GR_gene       GR:0117228      LOC_Os10g38600          GO:0005737      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os10g38600          ge
 GR_gene        GR:0117228      LOC_Os10g38600          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os10g38600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117228      LOC_Os10g38600          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g38600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146645      LOC_Os10g02276          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g02276          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:015972       LOC_Os10g28660          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os10g28660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:015972       LOC_Os10g28660          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g28660          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0138744      LOC_Os10g25565          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g25565          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0138744      LOC_Os10g25565          GO:0003774      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g25565          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0138744      LOC_Os10g25565          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os10g25565          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -123144,7 +123144,7 @@ GR_gene       GR:0138978      LOC_Os11g12010          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g12010          ge
 GR_gene        GR:0157663      LOC_Os11g36530          GO:0006457      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g36530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157663      LOC_Os11g36530          GO:0031072      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g36530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157663      LOC_Os11g36530          GO:0051082      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g36530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0119437      LOC_Os11g34160          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g34160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0119437      LOC_Os11g34160          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g34160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0119437      LOC_Os11g34160          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g34160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0119437      LOC_Os11g34160          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g34160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143082      LOC_Os11g04540          GO:0008146      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g04540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -123238,7 +123238,7 @@ GR_gene       GR:0143892      LOC_Os11g18620          GO:0004190      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g18620          ge
 GR_gene        GR:0143892      LOC_Os11g18620          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g18620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143892      LOC_Os11g18620          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g18620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154453      LOC_Os11g03820          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g03820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0154453      LOC_Os11g03820          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g03820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0154453      LOC_Os11g03820          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g03820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154453      LOC_Os11g03820          GO:0004672      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g03820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154453      LOC_Os11g03820          GO:0004674      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g03820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154453      LOC_Os11g03820          GO:0004713      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g03820          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -123784,7 +123784,7 @@ GR_gene       GR:0116038      LOC_Os11g10050          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g10050          ge
 GR_gene        GR:0116038      LOC_Os11g10050          GO:0019001      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g10050          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117101      LOC_Os11g08080          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g08080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117101      LOC_Os11g08080          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g08080          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:019156       LOC_Os11g40450          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g40450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:019156       LOC_Os11g40450          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g40450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:019156       LOC_Os11g40450          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g40450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142706      LOC_Os11g41900          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g41900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0142706      LOC_Os11g41900          GO:0016746      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g41900          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -124848,7 +124848,7 @@ GR_gene       GR:0115758      LOC_Os11g43580          GO:0009055      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g43580          ge
 GR_gene        GR:0115758      LOC_Os11g43580          GO:0015035      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g43580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115758      LOC_Os11g43580          GO:0022900      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g43580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115758      LOC_Os11g43580          GO:0045454      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g43580          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0112468      LOC_Os11g10420          GO:0016307      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g10420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0112468      LOC_Os11g10420          GO:0016307      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g10420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112468      LOC_Os11g10420          GO:0004430      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g10420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112468      LOC_Os11g10420          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g10420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112468      LOC_Os11g10420          GO:0016301      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g10420          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -125363,7 +125363,7 @@ GR_gene       GR:0129029      LOC_Os11g30470          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g30470          ge
 GR_gene        GR:0132170      LOC_Os11g31550          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g31550          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125001      LOC_Os11g34270          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g34270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125001      LOC_Os11g34270          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g34270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0125001      LOC_Os11g34270          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g34270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0125001      LOC_Os11g34270          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g34270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125001      LOC_Os11g34270          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g34270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125001      LOC_Os11g34270          GO:0005694      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g34270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125001      LOC_Os11g34270          GO:0006259      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g34270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -125439,7 +125439,7 @@ GR_gene       GR:0144939      LOC_Os11g19610          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g19610          ge
 GR_gene        GR:0154482      LOC_Os11g02120          GO:0004969      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g02120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154482      LOC_Os11g02120          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g02120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0154482      LOC_Os11g02120          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g02120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0115416      LOC_Os11g04240          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g04240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0115416      LOC_Os11g04240          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g04240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115416      LOC_Os11g04240          GO:0003743      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g04240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115416      LOC_Os11g04240          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g04240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115416      LOC_Os11g04240          GO:0005673      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g04240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -126458,7 +126458,7 @@ GR_gene       GR:0135903      LOC_Os11g06020          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g06020          ge
 GR_gene        GR:0135903      LOC_Os11g06020          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g06020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135903      LOC_Os11g06020          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g06020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135903      LOC_Os11g06020          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g06020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0135903      LOC_Os11g06020          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g06020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0135903      LOC_Os11g06020          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g06020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135903      LOC_Os11g06020          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g06020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135903      LOC_Os11g06020          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g06020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149083      LOC_Os11g26120          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g26120          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -126541,7 +126541,7 @@ GR_gene       GR:0141349      LOC_Os11g06650          GO:0003746      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g06650          ge
 GR_gene        GR:0141349      LOC_Os11g06650          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g06650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141349      LOC_Os11g06650          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g06650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141349      LOC_Os11g06650          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g06650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0141349      LOC_Os11g06650          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g06650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0141349      LOC_Os11g06650          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g06650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017777       LOC_Os11g48070          GO:0006629      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g48070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017777       LOC_Os11g48070          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g48070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:017777       LOC_Os11g48070          GO:0016788      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g48070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -127764,7 +127764,7 @@ GR_gene       GR:0132889      LOC_Os11g27600          GO:0005198      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g27600          ge
 GR_gene        GR:0132889      LOC_Os11g27600          GO:0019028      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g27600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118776      LOC_Os11g39000          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g39000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118776      LOC_Os11g39000          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g39000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0118776      LOC_Os11g39000          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g39000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0118776      LOC_Os11g39000          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g39000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118776      LOC_Os11g39000          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g39000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012686       LOC_Os11g06220          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g06220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012686       LOC_Os11g06220          GO:0006915      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g06220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -127912,7 +127912,7 @@ GR_gene       GR:014187       LOC_Os11g01439          GO:0007155      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g01439          gen
 GR_gene        GR:014187       LOC_Os11g01439          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g01439          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014187       LOC_Os11g01439          GO:0015629      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g01439          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014187       LOC_Os11g01439          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g01439          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:014187       LOC_Os11g01439          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g01439          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:014187       LOC_Os11g01439          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g01439          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014187       LOC_Os11g01439          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g01439          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0136472      LOC_Os11g17230          GO:0000785      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g17230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0136472      LOC_Os11g17230          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g17230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -128073,7 +128073,7 @@ GR_gene       GR:0133456      LOC_Os11g32290          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g32290          ge
 GR_gene        GR:0133456      LOC_Os11g32290          GO:0005840      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g32290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133456      LOC_Os11g32290          GO:0006412      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g32290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133456      LOC_Os11g32290          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g32290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0126729      LOC_Os11g28365          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g28365          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0126729      LOC_Os11g28365          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g28365          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0126729      LOC_Os11g28365          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g28365          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135864      LOC_Os11g38530          GO:0004969      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g38530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135864      LOC_Os11g38530          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g38530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -129013,7 +129013,7 @@ GR_gene       GR:0131527      LOC_Os11g26270          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g26270          ge
 GR_gene        GR:0131527      LOC_Os11g26270          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g26270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128275      LOC_Os11g38456          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g38456          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128275      LOC_Os11g38456          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g38456          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0112431      LOC_Os11g36470          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g36470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0112431      LOC_Os11g36470          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g36470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112431      LOC_Os11g36470          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g36470          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122112      LOC_Os11g16450          GO:0005506      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g16450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122112      LOC_Os11g16450          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g16450          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -129634,7 +129634,7 @@ GR_gene       GR:0118295      LOC_Os11g16410          GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g16410          ge
 !GR_gene       GR:0118295      LOC_Os11g16410          GO:0055114      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g16410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149395      LOC_Os11g27500          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g27500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149395      LOC_Os11g27500          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g27500          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0121887      LOC_Os11g28360          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g28360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0121887      LOC_Os11g28360          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g28360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121887      LOC_Os11g28360          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g28360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121887      LOC_Os11g28360          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g28360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121887      LOC_Os11g28360          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g28360          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -129964,7 +129964,7 @@ GR_gene       GR:0159249      LOC_Os11g36510          GO:0006278      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g36510          ge
 GR_gene        GR:016863       LOC_Os11g30110          GO:0005524      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g30110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016863       LOC_Os11g30110          GO:0006915      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g30110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016863       LOC_Os11g30110          GO:0006952      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g30110          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0139230      LOC_Os11g04230          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g04230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0139230      LOC_Os11g04230          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g04230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139230      LOC_Os11g04230          GO:0003743      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g04230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139230      LOC_Os11g04230          GO:0005673      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g04230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139230      LOC_Os11g04230          GO:0006367      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g04230          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -130050,7 +130050,7 @@ GR_gene       GR:0152960      LOC_Os11g39720          GO:0000785      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g39720          ge
 GR_gene        GR:0152960      LOC_Os11g39720          GO:0003682      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g39720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152960      LOC_Os11g39720          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g39720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0152960      LOC_Os11g39720          GO:0006333      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g39720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0155904      LOC_Os11g38630          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g38630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0155904      LOC_Os11g38630          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g38630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155904      LOC_Os11g38630          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g38630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118093      LOC_Os11g12430          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g12430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157342      LOC_Os11g27760          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g27760          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -131122,7 +131122,7 @@ GR_gene       GR:0128018      LOC_Os11g19060          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g19060          ge
 GR_gene        GR:0128018      LOC_Os11g19060          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g19060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0128018      LOC_Os11g19060          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g19060          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111945      LOC_Os11g38640          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g38640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0111945      LOC_Os11g38640          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g38640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0111945      LOC_Os11g38640          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g38640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111945      LOC_Os11g38640          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g38640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111945      LOC_Os11g38640          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g38640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0111945      LOC_Os11g38640          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g38640          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -131278,7 +131278,7 @@ GR_gene       GR:015291       LOC_Os11g43400          GO:0046983      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g43400          gen
 GR_gene        GR:0141276      LOC_Os11g22010          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g22010          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141276      LOC_Os11g22010          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g22010          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141276      LOC_Os11g22010          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g22010          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:012854       LOC_Os11g44540          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g44540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:012854       LOC_Os11g44540          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g44540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012854       LOC_Os11g44540          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g44540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122530      LOC_Os11g08150          GO:0000785      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g08150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0122530      LOC_Os11g08150          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g08150          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -131516,7 +131516,7 @@ GR_gene       GR:0131424      LOC_Os11g25560          GO:0005249      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g25560          ge
 GR_gene        GR:0131424      LOC_Os11g25560          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g25560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131424      LOC_Os11g25560          GO:0006813      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g25560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131424      LOC_Os11g25560          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g25560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0131424      LOC_Os11g25560          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os11g25560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0131424      LOC_Os11g25560          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g25560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131424      LOC_Os11g25560          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os11g25560          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148959      LOC_Os11g27410          GO:0000785      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os11g27410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148959      LOC_Os11g27410          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os11g27410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -133047,7 +133047,7 @@ GR_gene       GR:0112644      LOC_Os12g37370          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g37370          ge
 GR_gene        GR:0112644      LOC_Os12g37370          GO:0003899      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g37370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112644      LOC_Os12g37370          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g37370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112644      LOC_Os12g37370          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g37370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0112644      LOC_Os12g37370          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g37370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0112644      LOC_Os12g37370          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g37370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0112644      LOC_Os12g37370          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g37370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113348      LOC_Os12g44160          GO:0009055      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g44160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113348      LOC_Os12g44160          GO:0016491      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g44160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -133135,7 +133135,7 @@ GR_gene       GR:0143508      LOC_Os12g41720          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g41720          ge
 GR_gene        GR:0143508      LOC_Os12g41720          GO:0016042      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g41720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143508      LOC_Os12g41720          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g41720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012181       LOC_Os12g39070          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g39070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:012181       LOC_Os12g39070          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g39070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:012181       LOC_Os12g39070          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g39070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012181       LOC_Os12g39070          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g39070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012181       LOC_Os12g39070          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g39070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:012181       LOC_Os12g39070          GO:0005669      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g39070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -133772,7 +133772,7 @@ GR_gene       GR:0142098      LOC_Os12g18420          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g18420          ge
 GR_gene        GR:0132348      LOC_Os12g22630          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g22630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132348      LOC_Os12g22630          GO:0005199      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g22630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132348      LOC_Os12g22630          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g22630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0157214      LOC_Os12g03630          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g03630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0157214      LOC_Os12g03630          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g03630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157214      LOC_Os12g03630          GO:0005622      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g03630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0157214      LOC_Os12g03630          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g03630          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141584      LOC_Os12g42370          GO:0005525      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g42370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -134553,7 +134553,7 @@ GR_gene       GR:0119849      LOC_Os12g30020          GO:0006352      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g30020          ge
 GR_gene        GR:0119849      LOC_Os12g30020          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g30020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0119849      LOC_Os12g30020          GO:0007049      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g30020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0119849      LOC_Os12g30020          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g30020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0119849      LOC_Os12g30020          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g30020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0119849      LOC_Os12g30020          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g30020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0119849      LOC_Os12g30020          GO:0051301      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g30020          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155077      LOC_Os12g10190          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g10190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155077      LOC_Os12g10190          GO:0004672      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g10190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -135138,7 +135138,7 @@ GR_gene       GR:0118710      LOC_Os12g16290          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g16290          ge
 GR_gene        GR:0118710      LOC_Os12g16290          GO:0006813      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g16290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118710      LOC_Os12g16290          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g16290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0118710      LOC_Os12g16290          GO:0008324      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g16290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0118710      LOC_Os12g16290          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g16290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0118710      LOC_Os12g16290          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g16290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132441      LOC_Os12g11330          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g11330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132441      LOC_Os12g11330          GO:0004879      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g11330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0132441      LOC_Os12g11330          GO:0005198      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g11330          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -135287,7 +135287,7 @@ GR_gene       GR:0143696      LOC_Os12g34012          GO:0015232      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g34012          ge
 GR_gene        GR:0143696      LOC_Os12g34012          GO:0015886      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g34012          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143696      LOC_Os12g34012          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g34012          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0143696      LOC_Os12g34012          GO:0017004      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g34012          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0145469      LOC_Os12g42600          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g42600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0145469      LOC_Os12g42600          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g42600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145469      LOC_Os12g42600          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g42600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145469      LOC_Os12g42600          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g42600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145469      LOC_Os12g42600          GO:0008234      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g42600          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -136040,7 +136040,7 @@ GR_gene       GR:0119184      LOC_Os12g25470          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g25470          ge
 GR_gene        GR:015378       LOC_Os12g01449          GO:0005179      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g01449          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015378       LOC_Os12g01449          GO:0005576      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g01449          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015378       LOC_Os12g01449          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g01449          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:015378       LOC_Os12g01449          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g01449          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:015378       LOC_Os12g01449          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g01449          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:015378       LOC_Os12g01449          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g01449          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116233      LOC_Os12g32140          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g32140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0116233      LOC_Os12g32140          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g32140          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -136327,7 +136327,7 @@ GR_gene       GR:0120010      LOC_Os12g03460          GO:0018024      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g03460          ge
 GR_gene        GR:0120010      LOC_Os12g03460          GO:0042719      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g03460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120010      LOC_Os12g03460          GO:0045039      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g03460          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150543      LOC_Os12g35070          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g35070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0150543      LOC_Os12g35070          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g35070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0150543      LOC_Os12g35070          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g35070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0150543      LOC_Os12g35070          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g35070          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0158549      LOC_Os12g08980          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g08980          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0158549      LOC_Os12g08980          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g08980          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -136372,7 +136372,7 @@ GR_gene       GR:0113770      LOC_Os12g24780          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g24780          ge
 GR_gene        GR:0113770      LOC_Os12g24780          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g24780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0113770      LOC_Os12g24780          GO:0016032      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g24780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131726      LOC_Os12g08280          GO:0000287      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g08280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0131726      LOC_Os12g08280          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g08280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0131726      LOC_Os12g08280          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g08280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131726      LOC_Os12g08280          GO:0006790      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g08280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131726      LOC_Os12g08280          GO:0008441      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g08280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131726      LOC_Os12g08280          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g08280          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -136576,7 +136576,7 @@ GR_gene       GR:0115956      LOC_Os12g16240          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g16240          ge
 GR_gene        GR:0115956      LOC_Os12g16240          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g16240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115956      LOC_Os12g16240          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g16240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0115956      LOC_Os12g16240          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g16240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0115956      LOC_Os12g16240          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g16240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0115956      LOC_Os12g16240          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g16240          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121650      LOC_Os12g27994          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g27994          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0121650      LOC_Os12g27994          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g27994          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153152      LOC_Os12g33859          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g33859          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -136604,7 +136604,7 @@ GR_gene       GR:0124009      LOC_Os12g16410          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g16410          ge
 GR_gene        GR:0124009      LOC_Os12g16410          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g16410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124009      LOC_Os12g16410          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g16410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124009      LOC_Os12g16410          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g16410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0124009      LOC_Os12g16410          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g16410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0124009      LOC_Os12g16410          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g16410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0124009      LOC_Os12g16410          GO:0044237      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g16410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 !GR_gene       GR:0124009      LOC_Os12g16410          GO:0050662      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g16410          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0114488      LOC_Os12g40780          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g40780          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -136775,7 +136775,7 @@ GR_gene       GR:0127199      LOC_Os12g36890          GO:0016740      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g36890          ge
 GR_gene        GR:0127199      LOC_Os12g36890          GO:0016757      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g36890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127199      LOC_Os12g36890          GO:0016760      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g36890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0127199      LOC_Os12g36890          GO:0030244      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g36890          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0144564      LOC_Os12g30540          GO:0004843      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g30540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0144564      LOC_Os12g30540          GO:0004843      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g30540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144564      LOC_Os12g30540          GO:0006511      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g30540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144564      LOC_Os12g30540          GO:0008233      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g30540          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0141355      LOC_Os12g42210          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g42210          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -137497,7 +137497,7 @@ GR_gene       GR:0159366      LOC_Os12g08620          GO:0006278      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g08620          ge
 GR_gene        GR:0159366      LOC_Os12g08620          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g08620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0159366      LOC_Os12g08620          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g08620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148672      LOC_Os12g08025          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g08025          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0148672      LOC_Os12g08025          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g08025          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0148672      LOC_Os12g08025          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g08025          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0148672      LOC_Os12g08025          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g08025          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131991      LOC_Os12g22590          GO:0000785      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g22590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0131991      LOC_Os12g22590          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g22590          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -137540,7 +137540,7 @@ GR_gene       GR:0145037      LOC_Os12g06850          GO:0003746      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g06850          ge
 GR_gene        GR:0145037      LOC_Os12g06850          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g06850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145037      LOC_Os12g06850          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g06850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0145037      LOC_Os12g06850          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g06850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0145037      LOC_Os12g06850          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g06850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0145037      LOC_Os12g06850          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g06850          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014237       LOC_Os12g01200          GO:0000166      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g01200          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014237       LOC_Os12g01200          GO:0004672      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g01200          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014237       LOC_Os12g01200          GO:0004674      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g01200          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -137618,7 +137618,7 @@ GR_gene       GR:0130149      LOC_Os12g16250          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g16250          ge
 GR_gene        GR:0130149      LOC_Os12g16250          GO:0006813      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g16250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130149      LOC_Os12g16250          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g16250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0130149      LOC_Os12g16250          GO:0008324      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g16250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0130149      LOC_Os12g16250          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g16250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0130149      LOC_Os12g16250          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g16250          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133564      LOC_Os12g12370          GO:0004952      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g12370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133564      LOC_Os12g12370          GO:0007186      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g12370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133564      LOC_Os12g12370          GO:0016021      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g12370          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -137733,7 +137733,7 @@ GR_gene       GR:0112684      LOC_Os12g03290          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g03290          ge
 GR_gene        GR:0112684      LOC_Os12g03290          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g03290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013243       LOC_Os12g31430          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g31430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013243       LOC_Os12g31430          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g31430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:013243       LOC_Os12g31430          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g31430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:013243       LOC_Os12g31430          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g31430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:013243       LOC_Os12g31430          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g31430          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014832       LOC_Os12g09000          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g09000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:014832       LOC_Os12g09000          GO:0004789      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g09000          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -137756,7 +137756,7 @@ GR_gene       GR:0144446      LOC_Os12g12180          GO:0004190      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g12180          ge
 GR_gene        GR:0144446      LOC_Os12g12180          GO:0006508      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g12180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144446      LOC_Os12g12180          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g12180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0144446      LOC_Os12g12180          GO:0015074      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g12180          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0129833      LOC_Os12g08270          GO:0052745      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g08270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0129833      LOC_Os12g08270          GO:0052745      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g08270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129833      LOC_Os12g08270          GO:0006790      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g08270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0129833      LOC_Os12g08270          GO:0008441      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g08270          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0117456      LOC_Os12g24300          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g24300          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -138146,7 +138146,7 @@ GR_gene       GR:0139283      LOC_Os12g36530          GO:0006629      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g36530          ge
 GR_gene        GR:0139283      LOC_Os12g36530          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g36530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139283      LOC_Os12g36530          GO:0016042      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g36530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0139283      LOC_Os12g36530          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g36530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0135157      LOC_Os12g04595          GO:0006366      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g04595          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0135157      LOC_Os12g04595          GO:0006366      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g04595          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135157      LOC_Os12g04595          GO:0005673      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g04595          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0135157      LOC_Os12g04595          GO:0006367      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g04595          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153092      LOC_Os12g22190          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g22190          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -138411,7 +138411,7 @@ GR_gene       GR:0125606      LOC_Os12g39290          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g39290          ge
 GR_gene        GR:0125606      LOC_Os12g39290          GO:0005515      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g39290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125606      LOC_Os12g39290          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g39290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125606      LOC_Os12g39290          GO:0006350      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g39290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0125606      LOC_Os12g39290          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g39290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0125606      LOC_Os12g39290          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g39290          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133753      LOC_Os12g36160          GO:0042309      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g36160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133753      LOC_Os12g36160          GO:0050825      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g36160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0133753      LOC_Os12g36160          GO:0050826      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g36160          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -139357,7 +139357,7 @@ GR_gene       GR:016760       LOC_Os12g43950          GO:0003677      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g43950          gen
 GR_gene        GR:016760       LOC_Os12g43950          GO:0003700      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g43950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016760       LOC_Os12g43950          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g43950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016760       LOC_Os12g43950          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g43950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:016760       LOC_Os12g43950          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g43950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:016760       LOC_Os12g43950          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g43950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016760       LOC_Os12g43950          GO:0043565      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g43950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:016760       LOC_Os12g43950          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g43950          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155049      LOC_Os12g43720          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g43720          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -140110,7 +140110,7 @@ GR_gene       GR:0155252      LOC_Os12g16220          GO:0003824      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g16220          ge
 GR_gene        GR:0155252      LOC_Os12g16220          GO:0005488      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g16220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155252      LOC_Os12g16220          GO:0006808      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g16220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0155252      LOC_Os12g16220          GO:0008152      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g16220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0155252      LOC_Os12g16220          GO:0001227      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g16220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0155252      LOC_Os12g16220          GO:0001227      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g16220          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149524      LOC_Os12g31650          GO:0003676      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g31650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0149524      LOC_Os12g31650          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g31650          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0125766      LOC_Os12g32620          GO:0008270      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g32620          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
@@ -140296,7 +140296,7 @@ GR_gene       GR:0120970      LOC_Os12g03530          GO:0016787      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g03530          ge
 GR_gene        GR:0120970      LOC_Os12g03530          GO:0046373      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g03530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0120970      LOC_Os12g03530          GO:0046556      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g03530          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153484      LOC_Os12g06335          GO:0005634      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g06335          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
-GR_gene        GR:0153484      LOC_Os12g06335          GO:0140110      GR_REF:0        IMP                     LOC_Os12g06335          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_gene        GR:0153484      LOC_Os12g06335          GO:0140110      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g06335          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0153484      LOC_Os12g06335          GO:0006355      GR_REF:0        IMP             P       LOC_Os12g06335          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146370      LOC_Os12g38910          GO:0016020      GR_REF:0        IMP             C       LOC_Os12g38910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
 GR_gene        GR:0146370      LOC_Os12g38910          GO:0016798      GR_REF:0        IMP             F       LOC_Os12g38910          gene    taxon:4530      20130731        Gramene         
Planteome associations