Hello!

To see the file structure, click on "tree".

Note that updates take place every 10 minutes, commits may not be seen immediately.
projects / associations / .git / commitdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | patch | inline | side by side (parent: 59d5685)
Fix taxon id column to use NCBI ids rather than gramenes. Also, updated to latest...
authorelserj <elserj@localhost>
Fri, 18 Sep 2015 21:35:58 +0000 (21:35 +0000)
committerelserj <elserj@localhost>
Fri, 18 Sep 2015 21:35:58 +0000 (21:35 +0000)
svn path=/; revision=548

eo-associations/eo_diversity_arabidopsis.assoc patch | blob | history
eo-associations/eo_diversity_rice.assoc patch | blob | history

diff --git a/eo-associations/eo_diversity_arabidopsis.assoc b/eo-associations/eo_diversity_arabidopsis.assoc
index 63403673babdb26d1f77c844c098ce41b5dae1c1..4650dc4829028696c8550bdbdd40bf7105daa53f 100644 (file)
--- a/eo-associations/eo_diversity_arabidopsis.assoc
+++ b/eo-associations/eo_diversity_arabidopsis.assoc
@@ -1,108 +1,101 @@
-!DB    DB_Object_ID    DB_Object_Symbol        Qualifier       GOid    DB:Reference    Evidence        With(or)From    Aspect  DB_Object_Name  DB_Object_Synonym       DB_Object_Type  Taxon   Date    Assigned_by
-GR_diversity_arabidopsis       1       LD              EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       LD              Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       2       LDV             EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       LDV             Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       3       SD              EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       SD              Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       4       SDV             EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       SDV             Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       5       FT10            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       FT10            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       6       FT16            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       FT16            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       7       FT22            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       FT22            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       8       Seed Dormancy           EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Seed Dormancy           Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       9       Emco5           EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Emco5           Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       10      Emwa1           EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Emwa1           Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       11      Emoy*           EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Emoy*           Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       12      Hiks1           EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Hiks1           Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       13      Noco2           EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Noco2           Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       14      Li7             EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Li7             Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       15      B11             EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       B11             Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       16      Na23            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Na23            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       17      Mg25            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Mg25            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       18      P31             EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       P31             Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       19      S34             EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       S34             Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       20      K39             EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       K39             Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       21      Ca43            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Ca43            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       22      Mn55            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Mn55            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       23      Fe56            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Fe56            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       24      Co59            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Co59            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       25      Ni60            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Ni60            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       26      Cu65            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Cu65            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       27      Zn66            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Zn66            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       28      As75            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       As75            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       29      Se82            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Se82            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       30      Mo98            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Mo98            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       31      Cd114           EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Cd114           Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       32      avrPphB         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       avrPphB         Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       33      avrRpm1         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       avrRpm1         Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       34      avrRpt2         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       avrRpt2         Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       35      avrB            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       avrB            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       36      0W              EO:0007269      GR_REF:0        SM              E       0W              Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       37      2W              EO:0007269      GR_REF:0        SM              E       2W              Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       38      4W              EO:0007269      GR_REF:0        SM              E       4W              Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       39      8W              EO:0007269      GR_REF:0        SM              E       8W              Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       40      FLC             EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       FLC             Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       41      FRI             EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       FRI             Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       42      8W GH FT                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       8W GH FT                Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       43      8W GH LN                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       8W GH LN                Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       44      0W GH FT                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       0W GH FT                Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       45      0W GH LN                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       0W GH LN                Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       46      FT Field                EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       FT Field                Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       47      FT Diameter Field               EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       FT Diameter Field               Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       48      FT GH           EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       FT GH           Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       49      FT Duration GH          EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       FT Duration GH          Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       50      LC Duration GH          EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       LC Duration GH          Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       51      LFS GH          EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       LFS GH          Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       52      MT GH           EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       MT GH           Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       53      RP GH           EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       RP GH           Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       54      At1             EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       At1             Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       55      At1 CFU2                EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       At1 CFU2                Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       56      As              EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       As              Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       57      As CFU2         EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       As CFU2         Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       58      Bs              EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       Bs              Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       59      Bs CFU2         EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       Bs CFU2         Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       60      At2             EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       At2             Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       61      At2 CFU2                EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       At2 CFU2                Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       62      As2             EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       As2             Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       63      As2 CFU2                EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       As2 CFU2                Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       64      FW              EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       FW              Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       65      DW              EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       DW              Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       66      LES             EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       LES             Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       67      YEL             EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       YEL             Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       68      LY              EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       LY              Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       69      LN10            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       LN10            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       70      LN16            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       LN16            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       71      LN22            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       LN22            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       72      Silique 16              EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Silique 16              Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       73      Silique 22              EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Silique 22              Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       74      Germ 10         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Germ 10         Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       75      Germ 16         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Germ 16         Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       76      Germ 22         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Germ 22         Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       77      Width 10                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Width 10                Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       78      Width 16                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Width 16                Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       79      Width 22                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Width 22                Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       80      Chlorosis 10            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Chlorosis 10            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       81      Chlorosis 16            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Chlorosis 16            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       82      Chlorosis 22            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Chlorosis 22            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       83      Anthocyanin 10          EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Anthocyanin 10          Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       84      Anthocyanin 16          EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Anthocyanin 16          Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       85      Anthocyanin 22          EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Anthocyanin 22          Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       86      Leaf serr 10            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Leaf serr 10            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       87      Leaf serr 16            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Leaf serr 16            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       88      Leaf serr 22            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Leaf serr 22            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       89      Leaf roll 10            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Leaf roll 10            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       90      Leaf roll 16            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Leaf roll 16            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       91      Leaf roll 22            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Leaf roll 22            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       92      Rosette Erect 22                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Rosette Erect 22                Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       93      Hypocotyl length                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Hypocotyl length                Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       94      Trichome avg C          EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Trichome avg C          Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       95      Trichome avg JA         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Trichome avg JA         Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       96      Aphid number            EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       Aphid number            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       97      Bacterial titer         EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       Bacterial titer         Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       98      Seedling Growth         EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       Seedling Growth         Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       99      Vern Growth             EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       Vern Growth             Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       100     After Vern Growth               EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       After Vern Growth               Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       101     Secondary Dormancy              EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Secondary Dormancy              Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       102     Germ in dark            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Germ in dark            Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       103     DSDS50          EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       DSDS50          Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       104     Seed bank 133-91                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Seed bank 133-91                Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       105     Storage 7 days          EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Storage 7 days          Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       106     Storage 28 days         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Storage 28 days         Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       107     Storage 56 days         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Storage 56 days         Arabidopsis Diversity Environment       GR_tax:078880   20121108        GR
+!gaf-version: 2.0
+!db    db_object_id    db_object_symbol        qualifier       term_accession  db_reference    evidence_code   with    aspect  db_object_name  db_object_synonym       db_object_type  taxon   date    assigned_by     annotation_extension    gene_product_form_id
+GR_diversity_arabidopsis_trait 1       LD              EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       LD              Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 2       LDV             EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       LDV             Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 3       SD              EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       SD              Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 4       SDV             EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       SDV             Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 5       FT10            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       FT10            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 6       FT16            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       FT16            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 7       FT22            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       FT22            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 8       Seed Dormancy           EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Seed Dormancy           Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 9       Emco5           EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Emco5           Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 10      Emwa1           EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Emwa1           Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 11      Emoy*           EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Emoy*           Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 12      Hiks1           EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Hiks1           Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 13      Noco2           EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Noco2           Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 14      Li7             EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Li7             Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 15      B11             EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       B11             Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 16      Na23            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Na23            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 17      Mg25            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Mg25            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 18      P31             EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       P31             Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 19      S34             EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       S34             Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 20      K39             EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       K39             Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 21      Ca43            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Ca43            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 22      Mn55            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Mn55            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 23      Fe56            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Fe56            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 24      Co59            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Co59            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 25      Ni60            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Ni60            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 26      Cu65            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Cu65            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 27      Zn66            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Zn66            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 28      As75            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       As75            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 29      Se82            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Se82            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 30      Mo98            EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Mo98            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 31      Cd114           EO:0007049      GR_REF:0        SM              E       Cd114           Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 32      avrPphB         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       avrPphB         Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 33      avrRpm1         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       avrRpm1         Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 34      avrRpt2         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       avrRpt2         Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 35      avrB            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       avrB            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 36      0W              EO:0007269      GR_REF:0        SM              E       0W              Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 37      2W              EO:0007269      GR_REF:0        SM              E       2W              Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 38      4W              EO:0007269      GR_REF:0        SM              E       4W              Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 39      8W              EO:0007269      GR_REF:0        SM              E       8W              Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 42      8W GH FT                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       8W GH FT                Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 43      8W GH LN                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       8W GH LN                Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 44      0W GH FT                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       0W GH FT                Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 45      0W GH LN                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       0W GH LN                Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 46      FT Field                EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       FT Field                Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 47      FT Diameter Field               EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       FT Diameter Field               Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 48      FT GH           EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       FT GH           Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 50      LC Duration GH          EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       LC Duration GH          Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 51      LFS GH          EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       LFS GH          Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 52      MT GH           EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       MT GH           Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 53      RP GH           EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       RP GH           Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 54      At1             EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       At1             Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 55      At1 CFU2                EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       At1 CFU2                Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 56      As              EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       As              Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 57      As CFU2         EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       As CFU2         Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 58      Bs              EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       Bs              Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 59      Bs CFU2         EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       Bs CFU2         Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 60      At2             EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       At2             Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 61      At2 CFU2                EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       At2 CFU2                Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 62      As2             EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       As2             Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 63      As2 CFU2                EO:0007246      GR_REF:0        SM              E       As2 CFU2                Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 64      FW              EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       FW              Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 65      DW              EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       DW              Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 66      LES             EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       LES             Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 67      YEL             EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       YEL             Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 68      LY              EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       LY              Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 69      LN10            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       LN10            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 70      LN16            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       LN16            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 71      LN22            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       LN22            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 72      Silique 16              EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Silique 16              Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 73      Silique 22              EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Silique 22              Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 74      Germ 10         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Germ 10         Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 75      Germ 16         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Germ 16         Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 76      Germ 22         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Germ 22         Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 77      Width 10                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Width 10                Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 78      Width 16                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Width 16                Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 79      Width 22                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Width 22                Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 80      Chlorosis 10            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Chlorosis 10            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 81      Chlorosis 16            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Chlorosis 16            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 82      Chlorosis 22            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Chlorosis 22            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 83      Anthocyanin 10          EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Anthocyanin 10          Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 84      Anthocyanin 16          EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Anthocyanin 16          Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 85      Anthocyanin 22          EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Anthocyanin 22          Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 86      Leaf serr 10            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Leaf serr 10            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 87      Leaf serr 16            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Leaf serr 16            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 88      Leaf serr 22            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Leaf serr 22            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 89      Leaf roll 10            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Leaf roll 10            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 90      Leaf roll 16            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Leaf roll 16            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 91      Leaf roll 22            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Leaf roll 22            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 92      Rosette Erect 22                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Rosette Erect 22                Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 93      Hypocotyl length                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Hypocotyl length                Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 94      Trichome avg C          EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Trichome avg C          Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 95      Trichome avg JA         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Trichome avg JA         Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 101     Secondary Dormancy              EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Secondary Dormancy              Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 102     Germ in dark            EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Germ in dark            Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 103     DSDS50          EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       DSDS50          Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 104     Seed bank 133-91                EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Seed bank 133-91                Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 105     Storage 7 days          EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Storage 7 days          Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 106     Storage 28 days         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Storage 28 days         Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
+GR_diversity_arabidopsis_trait 107     Storage 56 days         EO:0007403      GR_REF:0        SM              E       Storage 56 days         Arabidopsis Diversity Environment       taxon:3702      20130731        Gramene         
diff --git a/eo-associations/eo_diversity_rice.assoc b/eo-associations/eo_diversity_rice.assoc
index 9b0a1da4bc2f429f3c41785e8cef3206ce75ac6a..92c7da23ef70fb08f99c9aa4cf1d864e85bbcfbf 100644 (file)
--- a/eo-associations/eo_diversity_rice.assoc
+++ b/eo-associations/eo_diversity_rice.assoc
@@ -1,78 +1,37 @@
-!DB    DB_Object_ID    DB_Object_Symbol        Qualifier       GOid    DB:Reference    Evidence        With(or)From    Aspect  DB_Object_Name  DB_Object_Synonym       DB_Object_Type  Taxon   Date    Assigned_by
-GR_diversity_rice      1       Panicle number                  GR_REF:0        SM              E       Panicle number          Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      2       Germination rate                        GR_REF:0        SM              E       Germination rate                Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      3       Grains per panicle                      GR_REF:0        SM              E       Grains per panicle              Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      4       100-grain weight                        GR_REF:0        SM              E       100-grain weight                Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      5       Plant height                    GR_REF:0        SM              E       Plant height            Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      6       Awn length                      GR_REF:0        SM              E       Awn length              Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      7       Spikelet number                 GR_REF:0        SM              E       Spikelet number         Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      8       Grain yield per plant                   GR_REF:0        SM              E       Grain yield per plant           Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      9       Days to heading                 GR_REF:0        SM              E       Days to heading         Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      10      Seed set percent                        GR_REF:0        SM              E       Seed set percent                Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      11      Tiller angle                    GR_REF:0        SM              E       Tiller angle            Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      12      Grain shattering                        GR_REF:0        SM              E       Grain shattering                Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      13      Panicle length                  GR_REF:0        SM              E       Panicle length          Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      14      Grains per plant                        GR_REF:0        SM              E       Grains per plant                Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      16      1000-grain weight                       GR_REF:0        SM              E       1000-grain weight               Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      18      Yield per plant                 GR_REF:0        SM              E       Yield per plant         Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      20      Panicles per plant                      GR_REF:0        SM              E       Panicles per plant              Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      21      Percent sterility                       GR_REF:0        SM              E       Percent sterility               Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      22      Number of penetrated roots                      GR_REF:0        SM              E       Number of penetrated roots              Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      23      Number of tillers                       GR_REF:0        SM              E       Number of tillers               Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      24      Number of roots                 GR_REF:0        SM              E       Number of roots         Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      25      Ratio of penetrated to total roots                      GR_REF:0        SM              E       Ratio of penetrated to total roots              Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      26      Leaf lesion number              EO:0007233      GR_REF:0        SM              E       Leaf lesion number              Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      27      Leaf lesion size                EO:0007233      GR_REF:0        SM              E       Leaf lesion size                Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      28      Diseased leaf area              EO:0007233      GR_REF:0        SM              E       Diseased leaf area              Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      29      days to flower          EO:0007078      GR_REF:0        SM              E       days to flower          Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      31      photoperiod sensitivity         EO:0007078      GR_REF:0        SM              E       photoperiod sensitivity         Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      32      bacterial blight disease resistance             EO:0007257      GR_REF:0        SM              E       bacterial blight disease resistance             Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      33      seed length with hull           EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       seed length with hull           Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      34      amylose content         EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       amylose content         Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      35      pericarp color          EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       pericarp color          Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      36      blast disease           EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       blast disease           Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      37      grain length to width ratio                     GR_REF:0        SM              E       grain length to width ratio             Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      38      grain width                     GR_REF:0        SM              E       grain width             Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      39      grain length                    GR_REF:0        SM              E       grain length            Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      41      grain length            EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       grain length            Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      42      days to flower          EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       days to flower          Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      43      grain yield             EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       grain yield             Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      44      days to heading         EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       days to heading         Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      45      days to heading         EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       days to heading         Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      46      grain shattering                EO:0007269      GR_REF:0        SM              E       grain shattering                Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      56      flag leaf length                EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       flag leaf length                Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      57      grain surface area              EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       grain surface area              Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      58      leaf lamina pubescence                  GR_REF:0        SM              E       leaf lamina pubescence          Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      59      blast disease           EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       blast disease           Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      60      flowering time          EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       flowering time          Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      61      unfilled grain number                   GR_REF:0        SM              E       unfilled grain number           Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      62      brown rice ratio                EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       brown rice ratio                Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      63      straighthead            EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       straighthead            Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      64      seed length                     GR_REF:0        SM              E       seed length             Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      65      spikelet fertility              EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       spikelet fertility              Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      66      seed number                     GR_REF:0        SM              E       seed number             Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      67      grain volume            EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       grain volume            Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      68      surface area of grain with hull         EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       surface area of grain with hull         Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      69      volume of grain with hull               EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       volume of grain with hull               Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      70      brown rice protein              EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       brown rice protein              Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      71      hull color              EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       hull color              Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      72      alkali digestion                EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       alkali digestion                Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      73      flag leaf lamina width          EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       flag leaf lamina width          Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      74      floret number per inflorescence                 GR_REF:0        SM              E       floret number per inflorescence         Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      75      primary branch number                   GR_REF:0        SM              E       primary branch number           Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      76      culm angle              EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       culm angle              Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      77      seed length to width ratio              EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       seed length to width ratio              Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      78      awn presence            EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       awn presence            Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      79      grain width             EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       grain width             Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      80      brown rice length               EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       brown rice length               Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      81      seed width                      GR_REF:0        SM              E       seed width              Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      82      pericarp color                  GR_REF:0        SM              E       pericarp color          Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      83      hull color                      GR_REF:0        SM              E       hull color              Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      84      apiculus color                  GR_REF:0        SM              E       apiculus color          Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      85      amylose content                 GR_REF:0        SM              E       amylose content         Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      86      gelatinization temperature                      GR_REF:0        SM              E       gelatinization temperature              Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      87      splikelet number                        GR_REF:0        SM              E       splikelet number                Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      88      grain weight                    GR_REF:0        SM              E       grain weight            Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      89      drought tolerance                       GR_REF:0        SM              E       drought tolerance               Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      90      leaf angle                      GR_REF:0        SM              E       leaf angle              Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
-GR_diversity_rice      91      tiller number                   GR_REF:0        SM              E       tiller number           Rice Diversity Environment      GR_tax:013681   20121108        GR
+!gaf-version: 2.0
+!db    db_object_id    db_object_symbol        qualifier       term_accession  db_reference    evidence_code   with    aspect  db_object_name  db_object_synonym       db_object_type  taxon   date    assigned_by     annotation_extension    gene_product_form_id
+GR_diversity_rice_trait        26      Leaf lesion number              EO:0007233      GR_REF:0        SM              E       Leaf lesion number              Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        27      Leaf lesion size                EO:0007233      GR_REF:0        SM              E       Leaf lesion size                Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        28      Diseased leaf area              EO:0007233      GR_REF:0        SM              E       Diseased leaf area              Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        29      days to flower          EO:0007078      GR_REF:0        SM              E       days to flower          Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        31      photoperiod sensitivity         EO:0007078      GR_REF:0        SM              E       photoperiod sensitivity         Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        32      bacterial blight disease resistance             EO:0007257      GR_REF:0        SM              E       bacterial blight disease resistance             Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        33      seed length with hull           EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       seed length with hull           Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        34      amylose content         EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       amylose content         Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        35      pericarp color          EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       pericarp color          Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        36      blast disease           EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       blast disease           Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        41      grain length            EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       grain length            Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        42      days to flower          EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       days to flower          Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        43      grain yield             EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       grain yield             Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        44      days to heading         EO:0007248      GR_REF:0        SM              E       days to heading         Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        45      days to heading         EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       days to heading         Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        46      grain shattering                EO:0007269      GR_REF:0        SM              E       grain shattering                Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        56      flag leaf length                EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       flag leaf length                Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        57      grain surface area              EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       grain surface area              Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        59      blast disease           EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       blast disease           Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        60      flowering time          EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       flowering time          Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        62      brown rice ratio                EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       brown rice ratio                Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        63      straighthead            EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       straighthead            Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        65      spikelet fertility              EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       spikelet fertility              Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        67      grain volume            EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       grain volume            Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        68      surface area of grain with hull         EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       surface area of grain with hull         Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        69      volume of grain with hull               EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       volume of grain with hull               Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        70      brown rice protein              EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       brown rice protein              Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        71      hull color              EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       hull color              Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        72      alkali digestion                EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       alkali digestion                Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        73      flag leaf lamina width          EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       flag leaf lamina width          Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        76      culm angle              EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       culm angle              Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        77      seed length to width ratio              EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       seed length to width ratio              Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        78      awn presence            EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       awn presence            Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        79      grain width             EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       grain width             Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
+GR_diversity_rice_trait        80      brown rice length               EO:0007256      GR_REF:0        SM              E       brown rice length               Rice Diversity Environment      taxon:4530      20130731        Gramene         
Planteome associations