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authorcooperl <cooperl@localhost>
Tue, 19 Nov 2024 17:55:47 +0000 (17:55 +0000)
committercooperl <cooperl@localhost>
Tue, 19 Nov 2024 17:55:47 +0000 (17:55 +0000)
svn path=/; revision=1130

po-associations/po_anatomy_gene_oryza_poc.assoc

index 4fc660a8f86c2e9491c1f0be2c15c577db4fdc59..23f8e8684a847f830af3c514ae4618b1f3f18eec 100644 (file)
@@ -8909,7 +8909,7 @@ RAP-DB    Os12g0237900    Os12g0237900            PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0248900    Os12g0248900            PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130)     
 RAP-DB Os12g0250900    Os12g0250900            PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       BRCT domain containing protein  expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130)     
 RAP-DB Os12g0254400    Os12g0254400            PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Hypothetical protein    expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130)     
-RAP-DB Os12g0257000    Os12g0257000            PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Serine carboxypeptidase I precursor (EC 34165) (Carboxypeptidase C)     OsSCP65 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130)     
+RAP-DB Os12g0257000    OsSCP65         PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Serine carboxypeptidase 65              gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130)     
 RAP-DB Os12g0257500    Os12g0257500            PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Hypothetical protein    expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130)     
 RAP-DB Os12g0263000    Os12g0263000            PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Glutathione synthetase  glutathione synthetase, chloroplast precursor, putative, expressed      gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130)     
 RAP-DB Os12g0264500    Os12g0264500            PO:0020039      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       CoA-thioester hydrolase CHY1 (3-hydroxyisobutyryl-coenzyme A hydrolase) enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein, putative, expressed       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007134)|participates_in(PO:0007130)     
@@ -18262,7 +18262,7 @@ RAP-DB  Os12g0589100    Os12g0589100            PO:0009047      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0591600    Os12g0591600            PO:0009047      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Hypothetical protein    expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0594200    Os12g0594200            PO:0009047      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Hypothetical protein    protein kinase domain containing protein, expressed     gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0596600    Os12g0596600            PO:0009047      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Hypothetical protein    H-BTB9 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with H family conserved sequence, expressed   gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB Os12g0609600    Os12g0609600            PO:0009047      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Hypothetical protein    OsSAUR57 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007130) 
+RAP-DB Os12g0609600    OsSAUR57                PO:0009047      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Small auxin-up RNA 57           gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0610800    Os12g0610800            PO:0009047      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Protein of unknown function DUF588 family protein       membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0611300    Os12g0611300            PO:0009047      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Patatin family protein  PLA IIIA/PLP7, putative, expressed      gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0619000    Os12g0619000            PO:0009047      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       IQ calmodulin-binding region domain containing protein  IQ calmodulin-binding motif domain containing protein, expressed        gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0007010)|participates_in(PO:0007130) 
@@ -20645,7 +20645,7 @@ RAP-DB  Os12g0424700    Os12g0424700            PO:0009066      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IE
 RAP-DB Os12g0425500    Os12g0425500            PO:0009066      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Non-protein coding transcript, uncharacterized transcript       expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001004)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0427000    Os12g0427000            PO:0009066      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  protein kinase domain containing protein, expressed     gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001004)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0428600    Os12g0428600            PO:0009066      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       E3 ubiquitin protein ligase URE-B1 (EC 632-) (Upstream regulatory element binding protein 1) (Fragment) HECT-domain domain containing protein, expressed        gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001004)|participates_in(PO:0007130) 
-RAP-DB Os12g0433700    Os12g0433700            PO:0009066      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  Lg106, putative gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001004)|participates_in(PO:0007130) 
+RAP-DB Os12g0433700    Os12g0433700            PO:0009066      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Lg106-like family protein               gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001004)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0463300    Os12g0463300            PO:0009066      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  Expressed gene  gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001004)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0464300    Os12g0464300            PO:0009066      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       Expressed gene  OsFBX444 - F-box domain containing protein, expressed   gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001004)|participates_in(PO:0007130) 
 RAP-DB Os12g0480100    Os12g0480100            PO:0009066      DOI:10.1371/journal.pone.0026162        IEP     isolated_from_germplasm(Nipponbare)     A       One helix protein (OHP) expressed protein       gene    taxon:39947     20121019        POC:Pankaj_Jaiswal      participates_in(PO:0001004)|participates_in(PO:0007130)