Hello!

To see the file structure, click on "tree".

Note that updates take place every 10 minutes, commits may not be seen immediately.
Added new test file of Oryzabase genes
authorcooperl09 <cooperl@oregonstate.edu>
Tue, 6 May 2025 19:51:07 +0000 (12:51 -0700)
committercooperl09 <cooperl@oregonstate.edu>
Tue, 6 May 2025 19:51:07 +0000 (12:51 -0700)
to-associations/to_gene_Oryzabase_test.assoc [new file with mode: 0644]

diff --git a/to-associations/to_gene_Oryzabase_test.assoc b/to-associations/to_gene_Oryzabase_test.assoc
new file mode 100644 (file)
index 0000000..4589d12
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,9 @@
+!gaf-version: 2.1\r
+!Database Name/Xref (column 1) Database Object ID (column 2)   Database Object Symbol (column 3)       Qualifier (column 4)    Ontology ID (column 5)  DB:Reference ID (column 6)      Evidence Code (column 7)        With [or] From (column 8)       Aspect (column 9)       DB Object Name (column 10)      DB Object Synonym (column 11)   DB Object Type (column 12)      Taxon (column 13)       Date (column 14)        Assigned By (column 15) Annotation Extension (column 16)        Gene Product Form ID (column 17)\r
+Oryzabase      OB_Gene:769     CL              TO:0000089      DOI:10.1139/g95-073     IMP             T       CLUSTERED SPIKELETS     Cl|Clustered spikelets  gene    taxon:4530      20121108        Oryzabase               \r
+Oryzabase      OB_Gene:769     CL              TO:0000180      DOI:10.1139/g95-073     IMP             T       CLUSTERED SPIKELETS     Cl|Clustered spikelets  gene    taxon:4530      20121108        Oryzabase               \r
+Oryzabase      OB_Gene:769     CL              TO:0000040      DOI:10.1139/g95-073     IMP             T       CLUSTERED SPIKELETS     Cl|Clustered spikelets  gene    taxon:4530      20121108        Oryzabase               \r
+Oryzabase      OB_Gene:8652    ERF91           TO:0000168      DOI:10.1016/j.jplph.2005.11.004 IMP             T       ETHYLENE RESPONSE FACTOR 91     bierf3|BTH-induced ERF transcriptional factor 3|Os02g0654700|LOC_Os02g43790     gene    taxon:4530      20121108        Oryzabase               \r
+Oryzabase      OB_Gene:10577   ERF64           TO:0000168      DOI:10.1016/j.jplph.2005.11.004 IMP             T       ETHYLENE RESPONSE FACTOR 64     bierf4|BTH-induced ERF transcriptional factor 4|OsBIERF4|LOC_Os03g08500 gene    taxon:4530      20121108        Oryzabase               \r
+Oryzabase      OB_Gene:3127    CPS1            TO:0000357      DOI:10.1104/pp.103.033696       IMP             T       ent-copalyl diphosphate synthase 4      ent-copalyl diphosphate synthase 1|Putative kaurene synthase A|OsCPS1|P0444A09.11|LOC_Os02g17780        gene    taxon:4530      20121108        Oryzabase               \r
+Oryzabase      OB_Gene:3127    CPS1            TO:0000599      DOI:10.1104/pp.103.033696       IMP             T       ent-copalyl diphosphate synthase 4      ent-copalyl diphosphate synthase 1|Putative kaurene synthase A|OsCPS1|P0444A09.11|LOC_Os02g17780        gene    taxon:4530      20121108        Oryzabase               
\ No newline at end of file