Hello!

To see the file structure, click on "tree".

Note that updates take place every 10 minutes, commits may not be seen immediately.
Fix line break problems
authorelserj <elserj@localhost>
Tue, 2 Nov 2010 21:56:07 +0000 (21:56 +0000)
committerelserj <elserj@localhost>
Tue, 2 Nov 2010 21:56:07 +0000 (21:56 +0000)
svn path=/; revision=111

po-associations/po_anatomy_germplasm_S.lycopersicum_sgn.assoc

index ef58b41c3fe5a963a28d73470cf4d52e1c6d6d63..52d3faca497f3ab488d293ee12adb65fb5cbaee1 100644 (file)
@@ -7914,19 +7914,6 @@ SGN_germplasm    9982    New Zealand Pear                PO:0009085      SGN_ref:861     IDA             A       Source: sandh
 SGN_germplasm  9982    New Zealand Pear                PO:0009025      SGN_ref:861     IDA             A       Source: sandhillpreservation            germplasm       taxon:4081      20090922        SGN
 SGN_germplasm  9982    New Zealand Pear                PO:0009049      SGN_ref:861     IDA             A       Source: sandhillpreservation            germplasm       taxon:4081      20090922        SGN
 SGN_germplasm  9982    New Zealand Pear                PO:0009001      SGN_ref:861     IDA             A       Source: sandhillpreservation            germplasm       taxon:4081      20090922        SGN
-SGN_germplasm  9984    RNAi-tagl1              PO:0009001      PMID:19880793   IMP             A       The TAGL1 RNAi construct was made using the pHELLSGATE 2 vector\r
-(kindly provided by CSIRO, Plant Industry, Canberra, Australia). TAGL1\r
-cDNA sequences used in the haripin included 252 bp from the C domain\r
-and the subsequent 172 bp of 39 UTR (i.e., bases 594 to 1017 of the full-\r
-length cDNA). The target sequences were PCR ampli&#64257ed from EST clone\r
-cLEG9L5 using gene-speci&#64257c primers cLEG9L5For and cLEG9L5FRev\r
-with addition of the corresponding recombination sequences as de&#64257ned\r
-in the kit for site-speci&#64257c recombination used (Gateway BP Clonase\r
-enzyme mix Invitrogen). The resulting PCR product was gel puri&#64257ed and\r
-cloned into pHELLSGATE 2 via homologous recombination using the kit\r
-above. The resulting construct was sequence con&#64257rmed and transformed\r
-into tomato cv Ailsa Craig by Agrobacterium tumefaciens (strain\r
-ABA4404) as described previously (Vrebalov et al., 2002).\r
-Vrebalov et al., 2009.         germplasm       taxon:4081      20091103        SGN
+SGN_germplasm  9984    RNAi-tagl1              PO:0009001      PMID:19880793   IMP             A       The TAGL1 RNAi construct was made using the pHELLSGATE 2 vector (kindly provided by CSIRO, Plant Industry, Canberra, Australia). TAGL1 cDNA sequences used in the haripin included 252 bp from the C domain and the subsequent 172 bp of 39 UTR (i.e., bases 594 to 1017 of the full-length cDNA). The target sequences were PCR ampli&#64257ed from EST clone cLEG9L5 using gene-speci&#64257c primers cLEG9L5For and cLEG9L5FRev with addition of the corresponding recombination sequences as de&#64257ned in the kit for site-speci&#64257c recombination used (Gateway BP Clonase enzyme mix Invitrogen). The resulting PCR product was gel puri&#64257ed and cloned into pHELLSGATE 2 via homologous recombination using the kit above. The resulting construct was sequence con&#64257rmed and transformed into tomato cv Ailsa Craig by Agrobacterium tumefaciens (strain ABA4404) as described previously (Vrebalov et al., 2002). Vrebalov et al., 2009.              germplasm       taxon:4081      20091103        SGN
 SGN_germplasm  9993    TAGL1-SRDX              PO:0009001      PMID:19891701   IMP             A       A dominant repressor construct was created by generating a translational fusion between the EAR repression domain (SRDX Hiratsu et al., 2003) and the 3' end of the TAGL1 cDNA, introducing TAGL1\96SRDX into pAA100 (using NcoI and SacI sites) containing the E8 promoter (the 35S CaMV in pAA100 was replaced previously by the E8 promoter through BamHI and NcoI cloning), and transfer of the E8::TAGL1-SRDX cassette to pBIN-PLUS (using PacI and AscI sites). Constructs were transformed into cv. MicroTom               germplasm       taxon:4081      20091211        SGN
 SGN_germplasm  4703    LA2922          PO:0009031      PMID:17955175   IMP             A       LA2922 is one of the <i>entire</i> tomato mutants.              germplasm       taxon:4081      20091204        SGN