Hello!

To see the file structure, click on "tree".

Note that updates take place every 10 minutes, commits may not be seen immediately.
Replace gramene obsolete associations to updated PO terms
authorelserj <elserj@localhost>
Fri, 6 Jan 2012 22:13:55 +0000 (22:13 +0000)
committerelserj <elserj@localhost>
Fri, 6 Jan 2012 22:13:55 +0000 (22:13 +0000)
svn path=/; revision=282

po-associations/po_anatomy_gene_oryza_gramene.assoc
po-associations/po_anatomy_qtl_oryza_gramene.assoc
po-associations/test_cotton/po_anatomy_protein_Gossypium_AgBase.assoc

index 388e5e7885e8776d557a97a0aab38ec8b2d0ce9d..d05fbcec9c8f33acd4f76bb3c05d996b4589cdaa 100644 (file)
@@ -459,81 +459,81 @@ GR_gene   GR:0060161      [CMS-UR89]              PO:0006203      GR_ref:25480|PMID:14617093      IC      Q9FEG8  A
 GR_gene        GR:0060162      [CMS-UR102]             PO:0006203      GR_ref:25480|PMID:14617093      IC      Q9FXW5  A       NA synthase gene 3      OsNAS3  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_gene        GR:0060163      [CMS-UR104]             PO:0006203      GR_ref:12308|PMID:16926158      IC      Q0PCF5  A       Deoxymugineic acid synthase1    OsDMAS1 gene    taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_gene        GR:0060164      [CMS-UR106]             PO:0006215      GR_ref:8348|PMID:15299121       IMP     Q6Z4G0  A       MADS box gene 18        OsMADS18|OsMADS2|FDRMADS7|OsMADS28      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060165      [CMS-VN1]               PO:0006318      GR_ref:6006     IC      Q35294  A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY BO   [cms-bo]|`Chinsurah boro 2' cytoplasm|[cms-bo]|'Chinsurah boro II' cytoplasm    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060168      [cms-Miz4]              PO:0006318      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY DRW21018     [cms-DRW21018]|[cms-DRW21018]|'DRW21018' cytoplasm      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060169      [cms-Miz21]             PO:0006318      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY DRW21030     [cms-DRW21030]|[cms-DRW21030]|'DRW21030' cytoplasm      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060174      CPS             PO:0006318      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY DRW21039     [cms-DRW21039]|[cms-DRW21039]|'DRW21039' cytoplasm      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060860      SE1             PO:0006318      GR_ref:5552     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY IR66707A     Oryza perennis Acc. 104823 cytoplasm|[cms-IR66707A]|Oryza perennis Acc104823 cytoplasm  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060862      SE3             PO:0006318      GR_ref:5870     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY KALINGA      [cms-Kalinga-I]|[cms-Kalinga-I]|Cytoplasmic controlled cold tolerance   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060863      SE4             PO:0006318      GR_ref:5552     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY KHIABORO     [cms-Khiaboro]|`Khiaboro' cytoplasm|[cms-Khiaboro]|'Khiaboro' cytoplasm gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060864      SE5             PO:0006318      GR_ref:6419     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY ID   `Lead rice' cytoplasm|[cms-ld]|[cms-ld]|'Lead rice' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060867      SE8             PO:0006318      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY RPW21111     [cms-DPW21111]|[cms-RPW21111]|'RPW21111' cytoplasm      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0061082      fl16            PO:0006318      GR_ref:5713     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY TA   `TA820' cytoplasm|[cms-TA]|[cms-TA]|'TA820' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060936      SL1             PO:0006318      GR_ref:6358     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR27 [cms-UR27]|`UR27F' cytoplasm|[cms-UR27]|'UR27F' cytoplasm       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060940      SUCINF          PO:0006318      GR_ref:5671     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR89 `UR89F' cytoplasm|[cms-UR89]|[cms-UR89]|'UR89F' cytoplasm       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060965      TRI             PO:0006318      GR_ref:5671     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR102        `UR102F' cytoplasm|[cms-UR102]|[cms-UR102]|'UR102F' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0061051      Z5              PO:0006318      GR_ref:5671     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR104        [cms-UR104]|`UR104F' cytoplasm|[cms-UR104]|'UR104F' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0061238      Fl41            PO:0006318      GR_ref:5671     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR106        [cms-UR106]|`UR106F' cytoplasm|[cms-UR106]|'UR106F' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060530      MORI1           PO:0006318      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY VN 1 [cms-VN1]|[cms-VN1]|'VN1' cytoplasm     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060139      CINF            PO:0006318      GR_ref:6086     TAS             A       'Miz4' cytoplasm        `Miz 4' cytoplasm|[cms-Miz4]    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060140      CINM            PO:0006318      GR_ref:6087     TAS             A       'Miz21' cytoplasm       `Miz 21' cytoplasm|[cms-Miz21]  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060190      D7              PO:0006318      GR_ref:3024     TAS             A       COMPACT PANICLE STERILE cps|compact panicle sterile     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060275      E1              PO:0006318      GR_ref:2258     IC      Q9FE92  A       PHOTOSENSITIVITY 1      Fl|Lm|Hd1|Se1|K|Photoperiod-sensitivity-1|Rs|Lf|Fl1|Flowering date-1    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060277      E3              PO:0006318      GR_ref:5858     TAS             A       PHOTOSENSITIVITY 3      Photoperiod-sensitivity-3|Se3(t)|Fl6|Flowering date-6   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060278      EF1             PO:0006318      GR_ref:3264     TAS             A       PHOTOSENSITIVITY 4      Photoperiod-sensitivity-4|Se4(t)|Fl7|Flowering date-7   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060147      [CMS-CW]                PO:0006318      GR_ref:5164     IC      Q69XJ4  A       PHOTOSENSITIVITY 5      Photoperiod-sensitivity-5|Se5|Fl8|Flowering date-8      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060282      EFX             PO:0006318      GR_ref:6033     TAS             A       PHOTOSENSITIVITY 8      Heading date-2|Hd2|Photoperiod-sensitivity-8|Se8(t)*|Fl11|Flowering date-11     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060283      EFY             PO:0006318      GR_ref:6157     TAS             A       flowering date-16       photoperiod-sensitivity from Patpaku|sepat(t)*  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060284      EF              PO:0006318      GR_ref:6472     TAS             A       STAMENLESS 1    sl1|stl1|stamenless-1   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060442      HD3A            PO:0006318      GR_ref:6248     TAS             A       SUPPRESSOR FOR CROSS-INCOMPATIBILITY CINF       Su Cinf|Suppressor for cross-incompatibility (Cinf)     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060443      HD5             PO:0006318      GR_ref:1725     TAS             A       TRIANGULAR HULL tri|triangular hull     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060444      HD6             PO:0006318      GR_ref:5883     TAS             A       ZEBRA 5 z5|zebra-5      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060484      ISE1            PO:0006318      GR_ref:6429     TAS             A       Flowering date-41       Hd7|Heading date-7      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060500      LH              PO:0006318      GR_ref:6552|PMID:11782419       TAS             A       MORI 1  mori1|juvenile-adult phase change       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060585      OPS             PO:0006318      GR_ref:6248     TAS             A       CROSS-INCOMPATIBILITY IN THE FEMALE REACTION    Lcr|Cinf|Cross-incompatibility in the female reaction   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060143      CLW             PO:0006318      GR_ref:2152     TAS             A       CROSS-INCOMPATIBILITY CARRIED BY T65WX  cross-incompatibility carried by T65wx|cinm|cross-incompatibility carried by T65wx      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060145      [CMS-ARC]               PO:0006318      GR_ref:6242     TAS             A       DWARF HEIEIDAIKOKU OR CLEISTOGAMOUS     dwf7|heieidaikoku or cleistogamous dwarf|d7|dwarf-7     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060151      [CMS-GAM]               PO:0006318      GR_ref:5848     TAS             A       HEADING DATE 1  mEf1|Hd4(t)|Heading date-1|Fl18|Flowering date-18       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060152      [CMS-HL]                PO:0006318      GR_ref:5848     TAS             A       HEADING DATE 3  Heading date-3|Fl20|Flowering date-20   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060158      [CMS-SP]                PO:0006318      GR_ref:4598     TAS             A       EARLINESS 1     Ef2|Earliness-1|Ef1|Fl21|Flowering date-21      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060166      [CMS-WA]                PO:0006318      GR_ref:5681     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY CW   Chinese wild rice cytoplasm|[cms-CW]|[cms-CW]|Chinese wild rice cytoplasm       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060238      DP1             PO:0006318      GR_ref:6363     TAS             A       EARLINESS X     Efx|Earliness-x|Ef5(t)*|Fl27|Flowering date-27  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060240      DP              PO:0006318      GR_ref:3883     TAS             A       EARLINESS Y     Ef6(t)*|Earliness-y|Efy|Fl28|Flowering date-28  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060581      OMS             PO:0006318      GR_ref:365|PMID:9291958 TAS             A       EARLINESS INTRODUCED FROM ORYZA AUSTRALIENSIS   ef(t)*|earliness introduced from Oryza australiensis or O. glaberrima|fl29|flowering date-29    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060239      DP2             PO:0006318      GR_ref:5126     IC      Q93WI9  A       HEADING DATE 3A Hd3a|Heading date-3a|Fl32a|Flowering date-32a   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060287      EG1             PO:0006318      GR_ref:5126     TAS             A       Heading date (QTL)-5(t) Heading date-5|Hd5(t)*|Fl33|Flowering date-33   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060288      eg2             PO:0006318      GR_ref:6371     IC      Q9AQU1  A       Heading date 6  Heading date-6|Hd6(t)*|Fl34|Flowering date-34   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060294      ENSE1           PO:0006318      GR_ref:6312     TAS             A       recessive inhibitor for photoperiod-sensitivity (Se1)   iSe1|fl3|flowering date-3       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060526      MIK             PO:0006318      GR_ref:850      TAS             A       LATE HEADING    Late heading|Lh(t)*|Fl36|Flowering date-36      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0061066      ES1             PO:0006318      GR_ref:3024     TAS             A       OPEN HULL STERILE       ops|open hull sterile   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0061000      wgl             PO:0006318      GR_ref:3024     TAS             A       CLAW SHAPED SPIKELET    clw|claw shaped spikelet        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060058      APO1            PO:0006318      GR_ref:6006     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY ARC  [cms-ARC] [mt]|`ARC13829-26' cytoplasm|[cms-ARC]|ARC13829-26 cytoplasm  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060233      DL              PO:0006318      GR_ref:6006     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY GAM  [cms-GAM]|Gambiaca cytoplasm|[cms-GAM]|Gambiaca cytoplasm       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060052      AN5             PO:0006318      GR_ref:6007     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY HL   [cms-HL]|HL-group cytoplasm|[cms-HL]|HL-group cytoplasm gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0100117      Rcn1            PO:0006318      GR_ref:6006     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY SP   [cms-sp]|`MS577A' cytoplasm|[cms-sp]|MS577A cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0100602      GASR1           PO:0006318      GR_ref:6006     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY WA   WA-group cytoplasm|[cms-WA]|[cms-WA]|WA-group cytoplasm gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0100603      GASR2           PO:0006318      GR_ref:5883     TAS             A       DEPRESSED PALEA 1       pa|dp1|depressed palea-1        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0100758      osa-MIR168a             PO:0006318      GR_ref:2588     TAS             A       DEPRESSED PALEA dp(t)*|depressed palea|dp3|depressed palea-3    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0100759      osa-MIR168b             PO:0006318      GR_ref:5968     TAS             A       OPEN HULL MALE STERILE  oms|open hull male sterile      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080005      FOR1            PO:0006318      GR_ref:5789     TAS             A       DEPRESSED PALEA 2       dp2|depressed palea-2   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080021      MADS22          PO:0006318      GR_ref:5655     TAS             A       EXTRA GLUME 1   eg1|extra glume-1       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080024      GID2            PO:0006318      GR_ref:6092     TAS             A       extra glume-2           gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080025      MADS18          PO:0006318      GR_ref:3838     TAS             A       ENHANCER FOR PHOTOSENSITIVITY   Enhancer for photoperiod-sensitivity (Se1)|EnSe1(t)|Fl2|Flowering date-2        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060193      D11             PO:0006318      GR_ref:6375     TAS             A       MICROSATELLITE-TARGETING TRANSPOSABLE ELEMENT   'Kitaake mutant' minute grain|mik|mi2|minute grain-2    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060594      PAP1            PO:0006318      GR_ref:6099     TAS             A       EXTRUDING STIGMA 1      Es1|Extruding stigma-1  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060756      RI              PO:0006318      GR_ref:5673     TAS             A       spikelet width  spikelet width  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0100117      Rcn1            PO:0006318      GR_ref:6474     TAS             A       ABERRANT PANICLE ORGANIZATION 1 apo1|aberrant panicle organization-1    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0100118      Rcn2            PO:0006318      GR_ref:6295     IC      Q76EJ0  A       DROOPING LEAF   lop|dl|drooping leaf|dl1|drooping leaf-1        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060066      BAMY1           PO:0006318      GR_ref:6099     TAS             A       AWN 5   an5|awn-5       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060067      Bga2            PO:0006318      GR_ref:9520|PMID:12148532       IEP     Q9XGS5  A       Putative phosphatidylethanolamine-binding protein       Putative TFL1/CEN ortholog|Fdr2 gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0100117      Rcn1            PO:0006318      GR_ref:11207|PMID:16905871      IC      Q94HA1  A       GA-stimulated transcript-related gene 1 OsGASR1 gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0100118      Rcn2            PO:0006318      GR_ref:11207|PMID:16905871      IC      Q7X885  A       GA-stimulated transcript-related gene 2 OsGASR2 gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080062      GIF1            PO:0006318      GR_ref:11274|PMID:15685364      TAS             A       micro RNA 168a          gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080036      SNB             PO:0006318      GR_ref:11273|PMID:16126864      TAS             A       micro RNA 168b          gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080025      MADS18          PO:0006318      GR_ref:8170|PMID:14750524       IMP     Q8GT95  A       floral organ regulator 1        OsFOR1  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080004      WRKY71          PO:0006318      GR_ref:11425|PMID:15682279      IMP     Q9XJ66  A       MADS22  OsMADS22|STMADS11-like|RMD1     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080002      FCA             PO:0006318      GR_ref:11456|PMID:14756772      IEP     Q7XAK4  A       GA-insensitive dwarf 2  gid2    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060121      CHL4            PO:0006318      GR_ref:8348|PMID:15299121       IMP     Q6Z4G0  A       MADS box gene 18        OsMADS18|OsMADS2|FDRMADS7|OsMADS28      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060165      [CMS-VN1]               PO:0009082      GR_ref:6006     IC      Q35294  A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY BO   [cms-bo]|`Chinsurah boro 2' cytoplasm|[cms-bo]|'Chinsurah boro II' cytoplasm    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060168      [cms-Miz4]              PO:0009082      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY DRW21018     [cms-DRW21018]|[cms-DRW21018]|'DRW21018' cytoplasm      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060169      [cms-Miz21]             PO:0009082      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY DRW21030     [cms-DRW21030]|[cms-DRW21030]|'DRW21030' cytoplasm      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060174      CPS             PO:0009082      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY DRW21039     [cms-DRW21039]|[cms-DRW21039]|'DRW21039' cytoplasm      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060860      SE1             PO:0009082      GR_ref:5552     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY IR66707A     Oryza perennis Acc. 104823 cytoplasm|[cms-IR66707A]|Oryza perennis Acc104823 cytoplasm  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060862      SE3             PO:0009082      GR_ref:5870     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY KALINGA      [cms-Kalinga-I]|[cms-Kalinga-I]|Cytoplasmic controlled cold tolerance   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060863      SE4             PO:0009082      GR_ref:5552     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY KHIABORO     [cms-Khiaboro]|`Khiaboro' cytoplasm|[cms-Khiaboro]|'Khiaboro' cytoplasm gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060864      SE5             PO:0009082      GR_ref:6419     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY ID   `Lead rice' cytoplasm|[cms-ld]|[cms-ld]|'Lead rice' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060867      SE8             PO:0009082      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY RPW21111     [cms-DPW21111]|[cms-RPW21111]|'RPW21111' cytoplasm      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0061082      fl16            PO:0009082      GR_ref:5713     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY TA   `TA820' cytoplasm|[cms-TA]|[cms-TA]|'TA820' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060936      SL1             PO:0009082      GR_ref:6358     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR27 [cms-UR27]|`UR27F' cytoplasm|[cms-UR27]|'UR27F' cytoplasm       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060940      SUCINF          PO:0009082      GR_ref:5671     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR89 `UR89F' cytoplasm|[cms-UR89]|[cms-UR89]|'UR89F' cytoplasm       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060965      TRI             PO:0009082      GR_ref:5671     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR102        `UR102F' cytoplasm|[cms-UR102]|[cms-UR102]|'UR102F' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0061051      Z5              PO:0009082      GR_ref:5671     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR104        [cms-UR104]|`UR104F' cytoplasm|[cms-UR104]|'UR104F' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0061238      Fl41            PO:0009082      GR_ref:5671     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR106        [cms-UR106]|`UR106F' cytoplasm|[cms-UR106]|'UR106F' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060530      MORI1           PO:0009082      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY VN 1 [cms-VN1]|[cms-VN1]|'VN1' cytoplasm     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060139      CINF            PO:0009082      GR_ref:6086     TAS             A       'Miz4' cytoplasm        `Miz 4' cytoplasm|[cms-Miz4]    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060140      CINM            PO:0009082      GR_ref:6087     TAS             A       'Miz21' cytoplasm       `Miz 21' cytoplasm|[cms-Miz21]  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060190      D7              PO:0009082      GR_ref:3024     TAS             A       COMPACT PANICLE STERILE cps|compact panicle sterile     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060275      E1              PO:0009082      GR_ref:2258     IC      Q9FE92  A       PHOTOSENSITIVITY 1      Fl|Lm|Hd1|Se1|K|Photoperiod-sensitivity-1|Rs|Lf|Fl1|Flowering date-1    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060277      E3              PO:0009082      GR_ref:5858     TAS             A       PHOTOSENSITIVITY 3      Photoperiod-sensitivity-3|Se3(t)|Fl6|Flowering date-6   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060278      EF1             PO:0009082      GR_ref:3264     TAS             A       PHOTOSENSITIVITY 4      Photoperiod-sensitivity-4|Se4(t)|Fl7|Flowering date-7   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060147      [CMS-CW]                PO:0009082      GR_ref:5164     IC      Q69XJ4  A       PHOTOSENSITIVITY 5      Photoperiod-sensitivity-5|Se5|Fl8|Flowering date-8      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060282      EFX             PO:0009082      GR_ref:6033     TAS             A       PHOTOSENSITIVITY 8      Heading date-2|Hd2|Photoperiod-sensitivity-8|Se8(t)*|Fl11|Flowering date-11     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060283      EFY             PO:0009082      GR_ref:6157     TAS             A       flowering date-16       photoperiod-sensitivity from Patpaku|sepat(t)*  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060284      EF              PO:0009082      GR_ref:6472     TAS             A       STAMENLESS 1    sl1|stl1|stamenless-1   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060442      HD3A            PO:0009082      GR_ref:6248     TAS             A       SUPPRESSOR FOR CROSS-INCOMPATIBILITY CINF       Su Cinf|Suppressor for cross-incompatibility (Cinf)     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060443      HD5             PO:0009082      GR_ref:1725     TAS             A       TRIANGULAR HULL tri|triangular hull     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060444      HD6             PO:0009082      GR_ref:5883     TAS             A       ZEBRA 5 z5|zebra-5      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060484      ISE1            PO:0009082      GR_ref:6429     TAS             A       Flowering date-41       Hd7|Heading date-7      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060500      LH              PO:0009082      GR_ref:6552|PMID:11782419       TAS             A       MORI 1  mori1|juvenile-adult phase change       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060585      OPS             PO:0009082      GR_ref:6248     TAS             A       CROSS-INCOMPATIBILITY IN THE FEMALE REACTION    Lcr|Cinf|Cross-incompatibility in the female reaction   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060143      CLW             PO:0009082      GR_ref:2152     TAS             A       CROSS-INCOMPATIBILITY CARRIED BY T65WX  cross-incompatibility carried by T65wx|cinm|cross-incompatibility carried by T65wx      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060145      [CMS-ARC]               PO:0009082      GR_ref:6242     TAS             A       DWARF HEIEIDAIKOKU OR CLEISTOGAMOUS     dwf7|heieidaikoku or cleistogamous dwarf|d7|dwarf-7     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060151      [CMS-GAM]               PO:0009082      GR_ref:5848     TAS             A       HEADING DATE 1  mEf1|Hd4(t)|Heading date-1|Fl18|Flowering date-18       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060152      [CMS-HL]                PO:0009082      GR_ref:5848     TAS             A       HEADING DATE 3  Heading date-3|Fl20|Flowering date-20   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060158      [CMS-SP]                PO:0009082      GR_ref:4598     TAS             A       EARLINESS 1     Ef2|Earliness-1|Ef1|Fl21|Flowering date-21      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060166      [CMS-WA]                PO:0009082      GR_ref:5681     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY CW   Chinese wild rice cytoplasm|[cms-CW]|[cms-CW]|Chinese wild rice cytoplasm       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060238      DP1             PO:0009082      GR_ref:6363     TAS             A       EARLINESS X     Efx|Earliness-x|Ef5(t)*|Fl27|Flowering date-27  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060240      DP              PO:0009082      GR_ref:3883     TAS             A       EARLINESS Y     Ef6(t)*|Earliness-y|Efy|Fl28|Flowering date-28  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060581      OMS             PO:0009082      GR_ref:365|PMID:9291958 TAS             A       EARLINESS INTRODUCED FROM ORYZA AUSTRALIENSIS   ef(t)*|earliness introduced from Oryza australiensis or O. glaberrima|fl29|flowering date-29    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060239      DP2             PO:0009082      GR_ref:5126     IC      Q93WI9  A       HEADING DATE 3A Hd3a|Heading date-3a|Fl32a|Flowering date-32a   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060287      EG1             PO:0009082      GR_ref:5126     TAS             A       Heading date (QTL)-5(t) Heading date-5|Hd5(t)*|Fl33|Flowering date-33   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060288      eg2             PO:0009082      GR_ref:6371     IC      Q9AQU1  A       Heading date 6  Heading date-6|Hd6(t)*|Fl34|Flowering date-34   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060294      ENSE1           PO:0009082      GR_ref:6312     TAS             A       recessive inhibitor for photoperiod-sensitivity (Se1)   iSe1|fl3|flowering date-3       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060526      MIK             PO:0009082      GR_ref:850      TAS             A       LATE HEADING    Late heading|Lh(t)*|Fl36|Flowering date-36      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0061066      ES1             PO:0009082      GR_ref:3024     TAS             A       OPEN HULL STERILE       ops|open hull sterile   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0061000      wgl             PO:0009082      GR_ref:3024     TAS             A       CLAW SHAPED SPIKELET    clw|claw shaped spikelet        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060058      APO1            PO:0009082      GR_ref:6006     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY ARC  [cms-ARC] [mt]|`ARC13829-26' cytoplasm|[cms-ARC]|ARC13829-26 cytoplasm  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060233      DL              PO:0009082      GR_ref:6006     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY GAM  [cms-GAM]|Gambiaca cytoplasm|[cms-GAM]|Gambiaca cytoplasm       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060052      AN5             PO:0009082      GR_ref:6007     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY HL   [cms-HL]|HL-group cytoplasm|[cms-HL]|HL-group cytoplasm gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0100117      Rcn1            PO:0009082      GR_ref:6006     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY SP   [cms-sp]|`MS577A' cytoplasm|[cms-sp]|MS577A cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0100602      GASR1           PO:0009082      GR_ref:6006     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY WA   WA-group cytoplasm|[cms-WA]|[cms-WA]|WA-group cytoplasm gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0100603      GASR2           PO:0009082      GR_ref:5883     TAS             A       DEPRESSED PALEA 1       pa|dp1|depressed palea-1        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0100758      osa-MIR168a             PO:0009082      GR_ref:2588     TAS             A       DEPRESSED PALEA dp(t)*|depressed palea|dp3|depressed palea-3    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0100759      osa-MIR168b             PO:0009082      GR_ref:5968     TAS             A       OPEN HULL MALE STERILE  oms|open hull male sterile      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080005      FOR1            PO:0009082      GR_ref:5789     TAS             A       DEPRESSED PALEA 2       dp2|depressed palea-2   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080021      MADS22          PO:0009082      GR_ref:5655     TAS             A       EXTRA GLUME 1   eg1|extra glume-1       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080024      GID2            PO:0009082      GR_ref:6092     TAS             A       extra glume-2           gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080025      MADS18          PO:0009082      GR_ref:3838     TAS             A       ENHANCER FOR PHOTOSENSITIVITY   Enhancer for photoperiod-sensitivity (Se1)|EnSe1(t)|Fl2|Flowering date-2        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060193      D11             PO:0009082      GR_ref:6375     TAS             A       MICROSATELLITE-TARGETING TRANSPOSABLE ELEMENT   'Kitaake mutant' minute grain|mik|mi2|minute grain-2    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060594      PAP1            PO:0009082      GR_ref:6099     TAS             A       EXTRUDING STIGMA 1      Es1|Extruding stigma-1  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060756      RI              PO:0009082      GR_ref:5673     TAS             A       spikelet width  spikelet width  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0100117      Rcn1            PO:0009082      GR_ref:6474     TAS             A       ABERRANT PANICLE ORGANIZATION 1 apo1|aberrant panicle organization-1    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0100118      Rcn2            PO:0009082      GR_ref:6295     IC      Q76EJ0  A       DROOPING LEAF   lop|dl|drooping leaf|dl1|drooping leaf-1        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060066      BAMY1           PO:0009082      GR_ref:6099     TAS             A       AWN 5   an5|awn-5       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060067      Bga2            PO:0009082      GR_ref:9520|PMID:12148532       IEP     Q9XGS5  A       Putative phosphatidylethanolamine-binding protein       Putative TFL1/CEN ortholog|Fdr2 gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0100117      Rcn1            PO:0009082      GR_ref:11207|PMID:16905871      IC      Q94HA1  A       GA-stimulated transcript-related gene 1 OsGASR1 gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0100118      Rcn2            PO:0009082      GR_ref:11207|PMID:16905871      IC      Q7X885  A       GA-stimulated transcript-related gene 2 OsGASR2 gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080062      GIF1            PO:0009082      GR_ref:11274|PMID:15685364      TAS             A       micro RNA 168a          gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080036      SNB             PO:0009082      GR_ref:11273|PMID:16126864      TAS             A       micro RNA 168b          gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080025      MADS18          PO:0009082      GR_ref:8170|PMID:14750524       IMP     Q8GT95  A       floral organ regulator 1        OsFOR1  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080004      WRKY71          PO:0009082      GR_ref:11425|PMID:15682279      IMP     Q9XJ66  A       MADS22  OsMADS22|STMADS11-like|RMD1     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080002      FCA             PO:0009082      GR_ref:11456|PMID:14756772      IEP     Q7XAK4  A       GA-insensitive dwarf 2  gid2    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060121      CHL4            PO:0009082      GR_ref:8348|PMID:15299121       IMP     Q6Z4G0  A       MADS box gene 18        OsMADS18|OsMADS2|FDRMADS7|OsMADS28      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_gene        GR:0060122      CHL5            PO:0006321      GR_ref:5792     IC      Q6F4F5  A       DWARF SHINKANEAIKOKU OR NOHRIN 28       shinkaneaikoku or nohrin 28 dwarf|dwf10|d8|D11/CYP724B1|OsDWARF11|d11|dwarf-11  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_gene        GR:0060186      D3              PO:0006321      GR_ref:5956     TAS             A       PANICLE PHYTOMER 1      pap1|panicle phytomer-1 gene    taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_gene        GR:0060187      D4              PO:0006321      GR_ref:1712     TAS             A       VERTICILLATE RACHIS     ri|verticillate rachis  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
@@ -545,7 +545,7 @@ GR_gene     GR:0060216      D51             PO:0006322      GR_ref:9520|PMID:12148532       IC      Q9XGS5  A       Putativ
 GR_gene        GR:0060192      D10             PO:0006322      GR_ref:9520|PMID:12148532       IC      Q6ESF8  A       Putative phosphatidylethanolamine-binding protein       Putative TFL1/CEN ortholog      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_gene        GR:0060322      FC1             PO:0006326      GR_ref:25498|PMID:18820698      IC      Q0JDC5  A       GRAIN INCOMPLETE FILLING 1      OsCIN2  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_gene        GR:0060212      D33             PO:0006327      GR_ref:11503|PMID:17144896      IC      Q8H443  A       SUPERNUMERARY BRACT             gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080008      MOC1            PO:0006329      GR_ref:8348|PMID:15299121       IEP     Q6Z4G0  A       MADS box gene 18        OsMADS18|OsMADS2|FDRMADS7|OsMADS28      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080008      MOC1            PO:0000229      GR_ref:8348|PMID:15299121       IEP     Q6Z4G0  A       MADS box gene 18        OsMADS18|OsMADS2|FDRMADS7|OsMADS28      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_gene        GR:0080011      nop             PO:0006339      GR_ref:11288|PMID:15047897      IEP     Q6IEL0  A       Transcription factor WRKY71     OsWRKY71        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_gene        GR:0060226      D61             PO:0006340      GR_ref:11175|PMID:16240176      IEP     Q6K271  A       flowering time control protein  OsFCA|OsFCA-1|OsFCA-gamma       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_gene        GR:0101254      Mtn             PO:0006343      GR_ref:5653     TAS             A       CHLORINA 4      chl4|chlorina-4 gene    taxon:4530      20090923        GR\r
@@ -564,79 +564,79 @@ GR_gene   GR:0080011      nop             PO:0006343      GR_ref:7848|PMID:12687001       IMP     Q84MM9  A       Monocu
 GR_gene        GR:0080022      WDA1            PO:0025195      GR_ref:11261|PMID:15952069      IEP     Q69V64  A       no pollen       Osnop   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_gene        GR:0080042      MEL1            PO:0006347      GR_ref:10034    IC      Q942F3  A       DWARF 61        dm-type dwarf|dwarf-61|d61*|dwf42|BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1|d61|dwarf-61    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_gene        GR:0080042      MEL1            PO:0006347      GR_ref:11518|PMID:16021413      IC      Q9LHZ0  A       methylthioadenosine nucleosidase        OsMTN|MTA nucleosidase|MeSAdo nucleosidase|methylthioadenosine methylthioribohydrolase|Methylthioadenosine/S-adenosyl homocysteine nucleosidase|5'-methylthioadenosine nucleosidase     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0101183      Lti6B           PO:0006384      GR_ref:3024     TAS             A       COMPACT PANICLE STERILE cps|compact panicle sterile     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080022      WDA1            PO:0006384      GR_ref:2434     TAS             A       MULTIPLE PISTIL 2       mp2|multiple pistil-2   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0800010      AID1            PO:0006384      GR_ref:1772|PMID:10852934       IC      Q3ZES6  A       MADS1   OsMADS1|lhs1|nsr|naked seed rice|leafy hull sterile 1   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0800010      AID1            PO:0006441      GR_ref:6472     TAS             A       STAMENLESS 1    sl1|stl1|stamenless-1   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080006      RTS             PO:0006441      GR_ref:6295     IC      Q76EJ0  A       DROOPING LEAF   lop|dl|drooping leaf|dl1|drooping leaf-1        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080007      UDT1            PO:0006441      GR_ref:2434     TAS             A       MULTIPLE PISTIL 2       mp2|multiple pistil-2   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080022      WDA1            PO:0006441      GR_ref:3031     IMP     Q5Z9N5  A       FLORAL ORGAN NUMBER 1   floral organ number-1   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0061178      MSP1            PO:0006441      GR_ref:10120    IEP     Q8RZV7  A       MULTIPLE SPOROCYTE 1    multiple sporocyte|Putative leucin-rich repeat protein kinase|Putative extra sporogenous cells|Msp1|multiple sporogeneous cells-1       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060146      [CMS-BO]                PO:0006441      GR_ref:1772|PMID:10852934       IC      Q3ZES6  A       MADS1   OsMADS1|lhs1|nsr|naked seed rice|leafy hull sterile 1   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060148      [CMS-DRW21018]          PO:0006441      GR_ref:11503|PMID:17144896      IC      Q8H443  A       SUPERNUMERARY BRACT             gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060149      [CMS-DRW21030]          PO:0006442      GR_ref:3024     TAS             A       COMPACT PANICLE STERILE cps|compact panicle sterile     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060150      [CMS-DRW21039]          PO:0006442      GR_ref:11261|PMID:15952069      IMP     Q69V64  A       no pollen       Osnop   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060153      [CMS-IR66707A]          PO:0006442      GR_ref:11440|PMID:17138699      IMP     Q109K1  A       Wax-deficient anther1   Wda1|wda1       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060154      [CMS-KALINGA-I]         PO:0006442      GR_ref:11642|PMID:17675402      IMP     Q851R2  A       MEL1    OsMEL1|OsMEAL1|MEAL1    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060155      [CMS-KHIABORO]          PO:0006444      GR_ref:11642|PMID:17675402      IMP     Q851R2  A       MEL1    OsMEL1|OsMEAL1|MEAL1    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060156      [CMS-ID]                PO:0006445      GR_ref:11450|PMID:17219102      IEP     Q6Q7C9  A       Low temperature induced 6B      OsLti6BA|Hydrophobic protein LTI6B|Low temperature-induced protein 6B|drought-induced hydrophobic|DRR2|early drought induced protein|R1G1B      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060157      [CMS-RPW21111]          PO:0006445      GR_ref:11440|PMID:17138699      IMP     Q109K1  A       Wax-deficient anther1   Wda1|wda1       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060159      [CMS-TA]                PO:0006446      GR_ref:8303|PMID:15247409       IMP     Q6T804  A       Anther Indehiscence1    OsAID1  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060160      [CMS-UR27]              PO:0006449      GR_ref:8303|PMID:15247409       IMP     Q6T804  A       Anther Indehiscence1    OsAID1  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060161      [CMS-UR89]              PO:0006450      GR_ref:11264|PMID:16897470      IMP     Q40629  A       rice tapetum-specific   RTS2    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060162      [CMS-UR102]             PO:0006450      GR_ref:11269|PMID:16141453      IMP     Q58GE3  A       undeveloped Tapetum1    Udt1    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060163      [CMS-UR104]             PO:0006450      GR_ref:11440|PMID:17138699      IMP     Q109K1  A       Wax-deficient anther1   Wda1|wda1       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060164      [CMS-UR106]             PO:0006451      GR_ref:10120    IMP     Q8RZV7  A       MULTIPLE SPOROCYTE 1    multiple sporocyte|Putative leucin-rich repeat protein kinase|Putative extra sporogenous cells|Msp1|multiple sporogeneous cells-1       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060165      [CMS-VN1]               PO:0006452      GR_ref:6006     IC      Q35294  A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY BO   [cms-bo]|`Chinsurah boro 2' cytoplasm|[cms-bo]|'Chinsurah boro II' cytoplasm    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060168      [cms-Miz4]              PO:0006452      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY DRW21018     [cms-DRW21018]|[cms-DRW21018]|'DRW21018' cytoplasm      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060169      [cms-Miz21]             PO:0006452      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY DRW21030     [cms-DRW21030]|[cms-DRW21030]|'DRW21030' cytoplasm      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060147      [CMS-CW]                PO:0006452      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY DRW21039     [cms-DRW21039]|[cms-DRW21039]|'DRW21039' cytoplasm      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060145      [CMS-ARC]               PO:0006452      GR_ref:5552     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY IR66707A     Oryza perennis Acc. 104823 cytoplasm|[cms-IR66707A]|Oryza perennis Acc104823 cytoplasm  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060151      [CMS-GAM]               PO:0006452      GR_ref:5870     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY KALINGA      [cms-Kalinga-I]|[cms-Kalinga-I]|Cytoplasmic controlled cold tolerance   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060152      [CMS-HL]                PO:0006452      GR_ref:5552     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY KHIABORO     [cms-Khiaboro]|`Khiaboro' cytoplasm|[cms-Khiaboro]|'Khiaboro' cytoplasm gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060158      [CMS-SP]                PO:0006452      GR_ref:6419     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY ID   `Lead rice' cytoplasm|[cms-ld]|[cms-ld]|'Lead rice' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060166      [CMS-WA]                PO:0006452      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY RPW21111     [cms-DPW21111]|[cms-RPW21111]|'RPW21111' cytoplasm      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080026      RAD             PO:0006452      GR_ref:5713     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY TA   `TA820' cytoplasm|[cms-TA]|[cms-TA]|'TA820' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060936      SL1             PO:0006452      GR_ref:6358     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR27 [cms-UR27]|`UR27F' cytoplasm|[cms-UR27]|'UR27F' cytoplasm       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060233      DL              PO:0006452      GR_ref:5671     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR89 `UR89F' cytoplasm|[cms-UR89]|[cms-UR89]|'UR89F' cytoplasm       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060532      MP2             PO:0006452      GR_ref:5671     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR102        `UR102F' cytoplasm|[cms-UR102]|[cms-UR102]|'UR102F' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060333      FON1            PO:0006452      GR_ref:5671     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR104        [cms-UR104]|`UR104F' cytoplasm|[cms-UR104]|'UR104F' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080036      SNB             PO:0006452      GR_ref:5671     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR106        [cms-UR106]|`UR106F' cytoplasm|[cms-UR106]|'UR106F' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080050      YSL2            PO:0006452      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY VN 1 [cms-VN1]|[cms-VN1]|'VN1' cytoplasm     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060174      CPS             PO:0006452      GR_ref:6086     TAS             A       'Miz4' cytoplasm        `Miz 4' cytoplasm|[cms-Miz4]    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060182      D1              PO:0006452      GR_ref:6087     TAS             A       'Miz21' cytoplasm       `Miz 21' cytoplasm|[cms-Miz21]  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060183      D2              PO:0006452      GR_ref:5681     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY CW   Chinese wild rice cytoplasm|[cms-CW]|[cms-CW]|Chinese wild rice cytoplasm       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060812      S5              PO:0006452      GR_ref:6006     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY ARC  [cms-ARC] [mt]|`ARC13829-26' cytoplasm|[cms-ARC]|ARC13829-26 cytoplasm  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080041      MADS13          PO:0006452      GR_ref:6006     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY GAM  [cms-GAM]|Gambiaca cytoplasm|[cms-GAM]|Gambiaca cytoplasm       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0061178      MSP1            PO:0006452      GR_ref:6007     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY HL   [cms-HL]|HL-group cytoplasm|[cms-HL]|HL-group cytoplasm gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060812      S5              PO:0006452      GR_ref:6006     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY SP   [cms-sp]|`MS577A' cytoplasm|[cms-sp]|MS577A cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080041      MADS13          PO:0006452      GR_ref:6006     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY WA   WA-group cytoplasm|[cms-WA]|[cms-WA]|WA-group cytoplasm gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0061178      MSP1            PO:0006452      GR_ref:9503|PMID:15792960       IMP     Q64MA3  A       RAD     OsRAD|OsGEN-L|OsGEN-like        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060812      S5              PO:0006455      GR_ref:6472     TAS             A       STAMENLESS 1    sl1|stl1|stamenless-1   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080042      MEL1            PO:0006455      GR_ref:6295     IC      Q76EJ0  A       DROOPING LEAF   lop|dl|drooping leaf|dl1|drooping leaf-1        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060812      S5              PO:0006455      GR_ref:2434     TAS             A       MULTIPLE PISTIL 2       mp2|multiple pistil-2   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060812      S5              PO:0006455      GR_ref:3031     IMP     Q5Z9N5  A       FLORAL ORGAN NUMBER 1   floral organ number-1   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080034      CIN1            PO:0006455      GR_ref:11503|PMID:17144896      IC      Q8H443  A       SUPERNUMERARY BRACT             gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080041      MADS13          PO:0006456      GR_ref:25478|PMID:15255870      IC      Q5TM89  A       yellow stripe 1-like    OsYSL2|YS1-like metal-nicotianamine transporter gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060703      PS1             PO:0006457      GR_ref:3024     TAS             A       COMPACT PANICLE STERILE cps|compact panicle sterile     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060704      PS2             PO:0006457      GR_ref:5546     TAS             A       DWARF DAIKOKU   Dominant lethal from O. longistaminata|Da|Dhl1|Dominant hybrid lethal-1 gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0061066      ES1             PO:0006457      GR_ref:5546     TAS             A       DOMINANT LETHAL 2       Dominant lethal from O. sativa|Db|Dhl2|Dominant hybrid lethal-2 gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080041      MADS13          PO:0006457      GR_ref:456|PMID:7896104 IC      Q69YD9  A       HYBRID STERILITY 5      S5-i|S5-j|S5-n|Hybrid sterility-26|Hst26|Hybrid sterility-5     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080034      CIN1            PO:0006457      GR_ref:2512|PMID:10528264       IEP     Q2QW53  A       MADS13  OcMADS13        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080034      CIN1            PO:0006462      GR_ref:10120    IEP     Q8RZV7  A       MULTIPLE SPOROCYTE 1    multiple sporocyte|Putative leucin-rich repeat protein kinase|Putative extra sporogenous cells|Msp1|multiple sporogeneous cells-1       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080034      CIN1            PO:0006462      GR_ref:456|PMID:7896104 IC      Q69YD9  A       HYBRID STERILITY 5      S5-i|S5-j|S5-n|Hybrid sterility-26|Hst26|Hybrid sterility-5     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080038      TAC1            PO:0006462      GR_ref:2512|PMID:10528264       IEP     Q2QW53  A       MADS13  OcMADS13        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080061      PROG1           PO:0006463      GR_ref:10120    IMP     Q8RZV7  A       MULTIPLE SPOROCYTE 1    multiple sporocyte|Putative leucin-rich repeat protein kinase|Putative extra sporogenous cells|Msp1|multiple sporogeneous cells-1       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080061      PROG1           PO:0006463      GR_ref:456|PMID:7896104 IC      Q69YD9  A       HYBRID STERILITY 5      S5-i|S5-j|S5-n|Hybrid sterility-26|Hst26|Hybrid sterility-5     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080025      MADS18          PO:0006463      GR_ref:11642|PMID:17675402      IMP     Q851R2  A       MEL1    OsMEL1|OsMEAL1|MEAL1    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0080041      MADS13          PO:0006464      GR_ref:456|PMID:7896104 IC      Q69YD9  A       HYBRID STERILITY 5      S5-i|S5-j|S5-n|Hybrid sterility-26|Hst26|Hybrid sterility-5     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0060442      HD3A            PO:0006465      GR_ref:456|PMID:7896104 IC      Q69YD9  A       HYBRID STERILITY 5      S5-i|S5-j|S5-n|Hybrid sterility-26|Hst26|Hybrid sterility-5     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0100907      P103-B2         PO:0006465      GR_ref:6847|PMID:11978873       IC      Q8S922  A       Cell wall invertase 1   OsCIN1  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0100929      P107-E1         PO:0006465      GR_ref:2512|PMID:10528264       IEP     Q2QW53  A       MADS13  OcMADS13        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0100957      P16-C3          PO:0006497      GR_ref:5949     TAS             A       PURPLE STIGMA 1 Ps1|Purple stigma-1(Gaisenmochi)        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0100976      P35-D10         PO:0006497      GR_ref:6193     TAS             A       PURPLE STIGMA 2 Ps1|Ps2|Purple stigma-2 gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0100979      P40-H12         PO:0006497      GR_ref:6099     TAS             A       EXTRUDING STIGMA 1      Es1|Extruding stigma-1  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_gene        GR:0100982      P4-D6           PO:0006508      GR_ref:2512|PMID:10528264       IEP     Q2QW53  A       MADS13  OcMADS13        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0101183      Lti6B           PO:0009062      GR_ref:3024     TAS             A       COMPACT PANICLE STERILE cps|compact panicle sterile     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080022      WDA1            PO:0009062      GR_ref:2434     TAS             A       MULTIPLE PISTIL 2       mp2|multiple pistil-2   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0800010      AID1            PO:0009062      GR_ref:1772|PMID:10852934       IC      Q3ZES6  A       MADS1   OsMADS1|lhs1|nsr|naked seed rice|leafy hull sterile 1   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0800010      AID1            PO:0009029      GR_ref:6472     TAS             A       STAMENLESS 1    sl1|stl1|stamenless-1   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080006      RTS             PO:0009029      GR_ref:6295     IC      Q76EJ0  A       DROOPING LEAF   lop|dl|drooping leaf|dl1|drooping leaf-1        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080007      UDT1            PO:0009029      GR_ref:2434     TAS             A       MULTIPLE PISTIL 2       mp2|multiple pistil-2   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080022      WDA1            PO:0009029      GR_ref:3031     IMP     Q5Z9N5  A       FLORAL ORGAN NUMBER 1   floral organ number-1   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0061178      MSP1            PO:0009029      GR_ref:10120    IEP     Q8RZV7  A       MULTIPLE SPOROCYTE 1    multiple sporocyte|Putative leucin-rich repeat protein kinase|Putative extra sporogenous cells|Msp1|multiple sporogeneous cells-1       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060146      [CMS-BO]                PO:0009029      GR_ref:1772|PMID:10852934       IC      Q3ZES6  A       MADS1   OsMADS1|lhs1|nsr|naked seed rice|leafy hull sterile 1   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060148      [CMS-DRW21018]          PO:0009029      GR_ref:11503|PMID:17144896      IC      Q8H443  A       SUPERNUMERARY BRACT             gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060149      [CMS-DRW21030]          PO:0009066      GR_ref:3024     TAS             A       COMPACT PANICLE STERILE cps|compact panicle sterile     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060150      [CMS-DRW21039]          PO:0009066      GR_ref:11261|PMID:15952069      IMP     Q69V64  A       no pollen       Osnop   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060153      [CMS-IR66707A]          PO:0009066      GR_ref:11440|PMID:17138699      IMP     Q109K1  A       Wax-deficient anther1   Wda1|wda1       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060154      [CMS-KALINGA-I]         PO:0009066      GR_ref:11642|PMID:17675402      IMP     Q851R2  A       MEL1    OsMEL1|OsMEAL1|MEAL1    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060155      [CMS-KHIABORO]          PO:0025202      GR_ref:11642|PMID:17675402      IMP     Q851R2  A       MEL1    OsMEL1|OsMEAL1|MEAL1    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060156      [CMS-ID]                PO:0000002      GR_ref:11450|PMID:17219102      IEP     Q6Q7C9  A       Low temperature induced 6B      OsLti6BA|Hydrophobic protein LTI6B|Low temperature-induced protein 6B|drought-induced hydrophobic|DRR2|early drought induced protein|R1G1B      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060157      [CMS-RPW21111]          PO:0000002      GR_ref:11440|PMID:17138699      IMP     Q109K1  A       Wax-deficient anther1   Wda1|wda1       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060159      [CMS-TA]                PO:0020002      GR_ref:8303|PMID:15247409       IMP     Q6T804  A       Anther Indehiscence1    OsAID1  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060160      [CMS-UR27]              PO:0020101      GR_ref:8303|PMID:15247409       IMP     Q6T804  A       Anther Indehiscence1    OsAID1  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060161      [CMS-UR89]              PO:0009071      GR_ref:11264|PMID:16897470      IMP     Q40629  A       rice tapetum-specific   RTS2    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060162      [CMS-UR102]             PO:0009071      GR_ref:11269|PMID:16141453      IMP     Q58GE3  A       undeveloped Tapetum1    Udt1    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060163      [CMS-UR104]             PO:0009071      GR_ref:11440|PMID:17138699      IMP     Q109K1  A       Wax-deficient anther1   Wda1|wda1       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060164      [CMS-UR106]             PO:0020047      GR_ref:10120    IMP     Q8RZV7  A       MULTIPLE SPOROCYTE 1    multiple sporocyte|Putative leucin-rich repeat protein kinase|Putative extra sporogenous cells|Msp1|multiple sporogeneous cells-1       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060165      [CMS-VN1]               PO:0020048      GR_ref:6006     IC      Q35294  A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY BO   [cms-bo]|`Chinsurah boro 2' cytoplasm|[cms-bo]|'Chinsurah boro II' cytoplasm    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060168      [cms-Miz4]              PO:0020048      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY DRW21018     [cms-DRW21018]|[cms-DRW21018]|'DRW21018' cytoplasm      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060169      [cms-Miz21]             PO:0020048      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY DRW21030     [cms-DRW21030]|[cms-DRW21030]|'DRW21030' cytoplasm      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060147      [CMS-CW]                PO:0020048      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY DRW21039     [cms-DRW21039]|[cms-DRW21039]|'DRW21039' cytoplasm      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060145      [CMS-ARC]               PO:0020048      GR_ref:5552     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY IR66707A     Oryza perennis Acc. 104823 cytoplasm|[cms-IR66707A]|Oryza perennis Acc104823 cytoplasm  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060151      [CMS-GAM]               PO:0020048      GR_ref:5870     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY KALINGA      [cms-Kalinga-I]|[cms-Kalinga-I]|Cytoplasmic controlled cold tolerance   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060152      [CMS-HL]                PO:0020048      GR_ref:5552     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY KHIABORO     [cms-Khiaboro]|`Khiaboro' cytoplasm|[cms-Khiaboro]|'Khiaboro' cytoplasm gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060158      [CMS-SP]                PO:0020048      GR_ref:6419     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY ID   `Lead rice' cytoplasm|[cms-ld]|[cms-ld]|'Lead rice' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060166      [CMS-WA]                PO:0020048      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY RPW21111     [cms-DPW21111]|[cms-RPW21111]|'RPW21111' cytoplasm      gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080026      RAD             PO:0020048      GR_ref:5713     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY TA   `TA820' cytoplasm|[cms-TA]|[cms-TA]|'TA820' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060936      SL1             PO:0020048      GR_ref:6358     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR27 [cms-UR27]|`UR27F' cytoplasm|[cms-UR27]|'UR27F' cytoplasm       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060233      DL              PO:0020048      GR_ref:5671     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR89 `UR89F' cytoplasm|[cms-UR89]|[cms-UR89]|'UR89F' cytoplasm       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060532      MP2             PO:0020048      GR_ref:5671     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR102        `UR102F' cytoplasm|[cms-UR102]|[cms-UR102]|'UR102F' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060333      FON1            PO:0020048      GR_ref:5671     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR104        [cms-UR104]|`UR104F' cytoplasm|[cms-UR104]|'UR104F' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080036      SNB             PO:0020048      GR_ref:5671     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY UR106        [cms-UR106]|`UR106F' cytoplasm|[cms-UR106]|'UR106F' cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080050      YSL2            PO:0020048      GR_ref:5604     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY VN 1 [cms-VN1]|[cms-VN1]|'VN1' cytoplasm     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060174      CPS             PO:0020048      GR_ref:6086     TAS             A       'Miz4' cytoplasm        `Miz 4' cytoplasm|[cms-Miz4]    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060182      D1              PO:0020048      GR_ref:6087     TAS             A       'Miz21' cytoplasm       `Miz 21' cytoplasm|[cms-Miz21]  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060183      D2              PO:0020048      GR_ref:5681     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY CW   Chinese wild rice cytoplasm|[cms-CW]|[cms-CW]|Chinese wild rice cytoplasm       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060812      S5              PO:0020048      GR_ref:6006     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY ARC  [cms-ARC] [mt]|`ARC13829-26' cytoplasm|[cms-ARC]|ARC13829-26 cytoplasm  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080041      MADS13          PO:0020048      GR_ref:6006     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY GAM  [cms-GAM]|Gambiaca cytoplasm|[cms-GAM]|Gambiaca cytoplasm       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0061178      MSP1            PO:0020048      GR_ref:6007     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY HL   [cms-HL]|HL-group cytoplasm|[cms-HL]|HL-group cytoplasm gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060812      S5              PO:0020048      GR_ref:6006     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY SP   [cms-sp]|`MS577A' cytoplasm|[cms-sp]|MS577A cytoplasm   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080041      MADS13          PO:0020048      GR_ref:6006     TAS             A       CYTOPLASMIC MALE STERILITY WA   WA-group cytoplasm|[cms-WA]|[cms-WA]|WA-group cytoplasm gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0061178      MSP1            PO:0020048      GR_ref:9503|PMID:15792960       IMP     Q64MA3  A       RAD     OsRAD|OsGEN-L|OsGEN-like        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060812      S5              PO:0009030      GR_ref:6472     TAS             A       STAMENLESS 1    sl1|stl1|stamenless-1   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080042      MEL1            PO:0009030      GR_ref:6295     IC      Q76EJ0  A       DROOPING LEAF   lop|dl|drooping leaf|dl1|drooping leaf-1        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060812      S5              PO:0009030      GR_ref:2434     TAS             A       MULTIPLE PISTIL 2       mp2|multiple pistil-2   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060812      S5              PO:0009030      GR_ref:3031     IMP     Q5Z9N5  A       FLORAL ORGAN NUMBER 1   floral organ number-1   gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080034      CIN1            PO:0009030      GR_ref:11503|PMID:17144896      IC      Q8H443  A       SUPERNUMERARY BRACT             gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080041      MADS13          PO:0009072      GR_ref:25478|PMID:15255870      IC      Q5TM89  A       yellow stripe 1-like    OsYSL2|YS1-like metal-nicotianamine transporter gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060703      PS1             PO:0020003      GR_ref:3024     TAS             A       COMPACT PANICLE STERILE cps|compact panicle sterile     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060704      PS2             PO:0020003      GR_ref:5546     TAS             A       DWARF DAIKOKU   Dominant lethal from O. longistaminata|Da|Dhl1|Dominant hybrid lethal-1 gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0061066      ES1             PO:0020003      GR_ref:5546     TAS             A       DOMINANT LETHAL 2       Dominant lethal from O. sativa|Db|Dhl2|Dominant hybrid lethal-2 gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080041      MADS13          PO:0020003      GR_ref:456|PMID:7896104 IC      Q69YD9  A       HYBRID STERILITY 5      S5-i|S5-j|S5-n|Hybrid sterility-26|Hst26|Hybrid sterility-5     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080034      CIN1            PO:0020003      GR_ref:2512|PMID:10528264       IEP     Q2QW53  A       MADS13  OcMADS13        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080034      CIN1            PO:0020020      GR_ref:10120    IEP     Q8RZV7  A       MULTIPLE SPOROCYTE 1    multiple sporocyte|Putative leucin-rich repeat protein kinase|Putative extra sporogenous cells|Msp1|multiple sporogeneous cells-1       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080034      CIN1            PO:0020020      GR_ref:456|PMID:7896104 IC      Q69YD9  A       HYBRID STERILITY 5      S5-i|S5-j|S5-n|Hybrid sterility-26|Hst26|Hybrid sterility-5     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080038      TAC1            PO:0020020      GR_ref:2512|PMID:10528264       IEP     Q2QW53  A       MADS13  OcMADS13        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080061      PROG1           PO:0000431      GR_ref:10120    IMP     Q8RZV7  A       MULTIPLE SPOROCYTE 1    multiple sporocyte|Putative leucin-rich repeat protein kinase|Putative extra sporogenous cells|Msp1|multiple sporogeneous cells-1       gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080061      PROG1           PO:0000431      GR_ref:456|PMID:7896104 IC      Q69YD9  A       HYBRID STERILITY 5      S5-i|S5-j|S5-n|Hybrid sterility-26|Hst26|Hybrid sterility-5     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080025      MADS18          PO:0000431      GR_ref:11642|PMID:17675402      IMP     Q851R2  A       MEL1    OsMEL1|OsMEAL1|MEAL1    gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0080041      MADS13          PO:0020019      GR_ref:456|PMID:7896104 IC      Q69YD9  A       HYBRID STERILITY 5      S5-i|S5-j|S5-n|Hybrid sterility-26|Hst26|Hybrid sterility-5     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0060442      HD3A            PO:0020021      GR_ref:456|PMID:7896104 IC      Q69YD9  A       HYBRID STERILITY 5      S5-i|S5-j|S5-n|Hybrid sterility-26|Hst26|Hybrid sterility-5     gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0100907      P103-B2         PO:0020021      GR_ref:6847|PMID:11978873       IC      Q8S922  A       Cell wall invertase 1   OsCIN1  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0100929      P107-E1         PO:0020021      GR_ref:2512|PMID:10528264       IEP     Q2QW53  A       MADS13  OcMADS13        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0100957      P16-C3          PO:0006061      GR_ref:5949     TAS             A       PURPLE STIGMA 1 Ps1|Purple stigma-1(Gaisenmochi)        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0100976      P35-D10         PO:0006061      GR_ref:6193     TAS             A       PURPLE STIGMA 2 Ps1|Ps2|Purple stigma-2 gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0100979      P40-H12         PO:0006061      GR_ref:6099     TAS             A       EXTRUDING STIGMA 1      Es1|Extruding stigma-1  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_gene        GR:0100982      P4-D6           PO:0006043      GR_ref:2512|PMID:10528264       IEP     Q2QW53  A       MADS13  OcMADS13        gene    taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_gene        GR:0100989      P56-H4          PO:0008005      GR_ref:6847|PMID:11978873       IC      Q8S922  A       Cell wall invertase 1   OsCIN1  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_gene        GR:0101075      P86-H10         PO:0008006      GR_ref:6847|PMID:11978873       IC      Q8S922  A       Cell wall invertase 1   OsCIN1  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_gene        GR:0101082      P88-A11         PO:0008007      GR_ref:6847|PMID:11978873       IC      Q8S922  A       Cell wall invertase 1   OsCIN1  gene    taxon:4530      20090923        GR\r
index 9dc38e06e6093b4a778127bc14a25c5f915d6f90..1cffdc6a52f2f5f4165091a8fcac5c23a9440284 100644 (file)
@@ -1020,8 +1020,8 @@ GR_QTL    CQO3    COLDTL          PO:0009011      GR_ref:11453    IC              A       cold tolerance  ctb-2   QTL     taxon
 GR_QTL CQO3    COLDTL          PO:0009049      GR_ref:7827     IMP             A       cold tolerance  ctb-2   QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_QTL CQO3    COLDTL          PO:0009049      GR_ref:7762     IMP             A       cold tolerance  ctb-2   QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_QTL CQO3    COLDTL          PO:0000003      GR_ref:11453    IC              A       cold tolerance  ctb-2   QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_QTL CQO3    COLDTL          PO:0006442      GR_ref:7827     IMP             A       cold tolerance  ctb-2   QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_QTL CQO3    COLDTL          PO:0006442      GR_ref:7762     IMP             A       cold tolerance  ctb-2   QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_QTL CQO3    COLDTL          PO:0009066      GR_ref:7827     IMP             A       cold tolerance  ctb-2   QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_QTL CQO3    COLDTL          PO:0009066      GR_ref:7762     IMP             A       cold tolerance  ctb-2   QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_QTL AQDU008 COLDTL          PO:0000003      GR_ref:11453    IC              A       cold tolerance  qCTS4-1 QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_QTL AQDU008 COLDTL          PO:0009011      GR_ref:11453    IC              A       cold tolerance  qCTS4-1 QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_QTL AQDU002 COLDTL          PO:0000003      GR_ref:11453    IC              A       cold tolerance  qCTS6-2 QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
@@ -1056,8 +1056,8 @@ GR_QTL    CQO1    COLDTL          PO:0009011      GR_ref:11453    IC              A       cold tolerance  ctb-1   QTL     taxon
 GR_QTL CQO1    COLDTL          PO:0009049      GR_ref:7827     IMP             A       cold tolerance  ctb-1   QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_QTL CQO1    COLDTL          PO:0009049      GR_ref:7762     IMP             A       cold tolerance  ctb-1   QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_QTL CQO1    COLDTL          PO:0000003      GR_ref:11453    IC              A       cold tolerance  ctb-1   QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_QTL CQO1    COLDTL          PO:0006442      GR_ref:7827     IMP             A       cold tolerance  ctb-1   QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
-GR_QTL CQO1    COLDTL          PO:0006442      GR_ref:7762     IMP             A       cold tolerance  ctb-1   QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_QTL CQO1    COLDTL          PO:0009066      GR_ref:7827     IMP             A       cold tolerance  ctb-1   QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
+GR_QTL CQO1    COLDTL          PO:0009066      GR_ref:7762     IMP             A       cold tolerance  ctb-1   QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_QTL CQAA10  COLDTL          PO:0000003      GR_ref:11453    IC              A       cold tolerance  qCTS8-1 QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_QTL CQAA10  COLDTL          PO:0009011      GR_ref:11453    IC              A       cold tolerance  qCTS8-1 QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
 GR_QTL CQAA10  COLDTL          PO:0009010      GR_ref:11453    IC              A       cold tolerance  qCTS8-1 QTL     taxon:4530      20090923        GR\r
index b65c2d0df05d6c0ee7a7654be4a1fbb21bdbf16b..457a6413c97e17b13be6d403aa14b61e1a9d5edc 100644 (file)
@@ -16,9 +16,9 @@ AgBase        Q6JX04  CTL1            PO:0004511      PMID:15284492   IEP             A       Chitinase-like protein  GhCTL
 AgBase Q6JX03  CTL2            PO:0004511      PMID:15284492   IEP             A       Chitinase-like protein  GhCTL2  protein taxon:3635      20101203        AgBase                                                                          
 AgBase A9QED9  PEPC2           PO:0004511      PMID:19815688   IDA             A       Phosphoenolpyruvate carboxylase GhPEPC2 protein taxon:3635      20101206        AgBase                                                                          
 AgBase A7TUG4  FSltp4          PO:0004511      PMID:17715150   IEP             A       Lipid transfer protein  Lipid transfer protein 4        protein taxon:3635      20110307        AgBase                                                                          
-AgBase A1XJ49  ADF6            PO:0009032  PMID:19861654       IEP             A       Actin depolymerizing factor 6   GhADF6  protein taxon:3635      20110819        AgBase                                                                          
+AgBase A1XJ49  ADF6            PO:0009032      PMID:19861654   IEP             A       Actin depolymerizing factor 6   GhADF6  protein taxon:3635      20110819        AgBase                                                                          
 AgBase A1XJ44  ADF7            PO:0009066      PMID:19861654   IEP             A       Actin depolymerizing factor 7   GhADF7  protein taxon:3635      20110819        AgBase                                                                          
-AgBase Q4JHK7  ADF8            PO:0009032  PMID:19861654       IEP             A       Actin depolymerizing factor 6   GhADF8|ADF1     protein taxon:3635      20110819        AgBase                                                                          
+AgBase Q4JHK7  ADF8            PO:0009032      PMID:19861654   IEP             A       Actin depolymerizing factor 6   GhADF8|ADF1     protein taxon:3635      20110819        AgBase                                                                          
 AgBase Q2I823  ACS2            PO:0009066      PMID:18826432   IEP             A       ACS-like protein        GhACS2  protein taxon:3635      20110926        AgBase                                                                          
 AgBase Q2I824  ACS1            PO:0009066      PMID:18826432   IEP             A       ACS-like protein        GhACS1  protein taxon:3635      20110926        AgBase                                                                          
 AgBase Q9M6B6  FSltp3          PO:0004511      PMID:10634943   IEP             A       Non-specific lipid-transfer protein             protein taxon:3635      20110928        AgBase