Hello!

To see the file structure, click on "tree".

Note that updates take place every 10 minutes, commits may not be seen immediately.
projects / associations / .git / commitdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | patch | inline | side by side (parent: c3f3eac)
Added new po-anatomy annotations from AgBase to exisitng file.
authorcooperl <cooperl@localhost>
Mon, 17 Dec 2012 20:01:42 +0000 (20:01 +0000)
committercooperl <cooperl@localhost>
Mon, 17 Dec 2012 20:01:42 +0000 (20:01 +0000)
svn path=/; revision=392

po-associations/po_anatomy_protein_Gossypium_AgBase.assoc patch | blob | history

diff --git a/po-associations/po_anatomy_protein_Gossypium_AgBase.assoc b/po-associations/po_anatomy_protein_Gossypium_AgBase.assoc
index 457a6413c97e17b13be6d403aa14b61e1a9d5edc..804cb895e3aef0fceef30168da46cddccc8acc7a 100644 (file)
--- a/po-associations/po_anatomy_protein_Gossypium_AgBase.assoc
+++ b/po-associations/po_anatomy_protein_Gossypium_AgBase.assoc
@@ -34,3 +34,78 @@ AgBase       D5FW81  vacInv2         PO:0004511      PMID:20300865   IEP             A       Vacuolar invertase 2            p
 AgBase D5FW81  vacInv2         PO:0009025      PMID:20300865   IEP             A       Vacuolar invertase 2            protein taxon:3635      20111103        AgBase                                                                          
 AgBase D5FW81  vacInv2         PO:0009005      PMID:20300865   IEP             A       Vacuolar invertase 2            protein taxon:3635      20111103        AgBase                                                                          
 AgBase E3T5W6  VacInv1         PO:0004511      PMID:20300865   IEP             A       Vacuolar invertase 1            protein taxon:3635      20111103        AgBase                                                                          
+AgBase Q43436  MYB1            PO:0020003      PMID:10394903   IEP             A       MYB1    Myb-like transcription factor 1|GhMYB1  protein taxon:3635      20120118        AgBase
+AgBase Q43436  MYB1            PO:0004511      PMID:10394903   IEP             A       MYB1    Myb-like transcription factor 1|GhMYB1  protein taxon:3635      20120118        AgBase
+AgBase O49017  MYB2            PO:0020003      PMID:10394903   IEP             A       MYB-like DNA-binding domain protein     GhMYB2  protein taxon:3635      20120118        AgBase
+AgBase O49017  MYB2            PO:0004511      PMID:10394903   IEP             A       MYB-like DNA-binding domain protein     GhMYB2  protein taxon:3635      20120118        AgBase
+AgBase O49018  MYB3            PO:0020003      PMID:10394903   IEP             A       MYB-like DNA-binding domain protein     GhMYB3  protein taxon:3635      20120118        AgBase
+AgBase O49018  MYB3            PO:0004511      PMID:10394903   IEP             A       MYB-like DNA-binding domain protein     GhMYB3  protein taxon:3635      20120118        AgBase
+AgBase O49021  MYB6            PO:0020003      PMID:10394903   IEP             A       MYB-like DNA-binding domain protein     Myb-like transcription factor 5|MYB5|GhMYB6     protein taxon:3635      20120118        AgBase
+AgBase O49021  MYB6            PO:0004511      PMID:10394903   IEP             A       MYB-like DNA-binding domain protein     Myb-like transcription factor 5|MYB5|GhMYB6     protein taxon:3635      20120118        AgBase
+AgBase C6GFP2  GhATPD1         PO:0004511      PMID:10394903   IEP             A       ATP synthase delta subunit 1            protein taxon:3635      20120120        AgBase
+AgBase Q43436  MYB1            PO:0020003      PMID:10394903   IEP             A       MYB1    Myb-like transcription factor 1|GhMYB1  protein taxon:3635      20120118        AgBase
+AgBase Q43436  MYB1            PO:0004511      PMID:10394903   IEP             A       MYB1    Myb-like transcription factor 1|GhMYB1  protein taxon:3635      20120118        AgBase
+AgBase O49017  MYB2            PO:0020003      PMID:10394903   IEP             A       MYB-like DNA-binding domain protein     GhMYB2  protein taxon:3635      20120118        AgBase
+AgBase O49017  MYB2            PO:0004511      PMID:10394903   IEP             A       MYB-like DNA-binding domain protein     GhMYB2  protein taxon:3635      20120118        AgBase
+AgBase O49018  MYB3            PO:0020003      PMID:10394903   IEP             A       MYB-like DNA-binding domain protein     GhMYB3  protein taxon:3635      20120118        AgBase
+AgBase O49018  MYB3            PO:0004511      PMID:10394903   IEP             A       MYB-like DNA-binding domain protein     GhMYB3  protein taxon:3635      20120118        AgBase
+AgBase O49021  MYB6            PO:0020003      PMID:10394903   IEP             A       MYB-like DNA-binding domain protein     Myb-like transcription factor 5|MYB5|GhMYB6     protein taxon:3635      20120118        AgBase
+AgBase O49021  MYB6            PO:0004511      PMID:10394903   IEP             A       MYB-like DNA-binding domain protein     Myb-like transcription factor 5|MYB5|GhMYB6     protein taxon:3635      20120118        AgBase
+AgBase P17598  CAT1            PO:0020030      PMID:12324611   IDA             A       Catalase isozyme 1      SU1     protein taxon:3635      20120202        AgBase
+AgBase P30567  CAT2            PO:0020030      PMID:12324611   IDA             A       Catalase isozyme 2      Su2     protein taxon:3635      20120202        AgBase
+AgBase C4PBL7  GhVIN1          PO:0004511      PMID:20699399   IDA             A       Vacuolar invertase              protein taxon:3635      20120208        AgBase
+AgBase Q70SX1  myb109          PO:0004511      PMID:14580676   IEP             A       Transcription factor myb109             protein taxon:3635      20120222        AgBase
+AgBase A9PL14  TUA5            PO:0004511      PMID:17761728   IEP             A       Alpha-tubulin   GhTUA5  protein taxon:3635      20120330        AgBase
+AgBase A9PL15  TUA6            PO:0004511      PMID:17761728   IEP             A       Alpha-tubulin   GhTUA6|Alpha-tubulin 6  protein taxon:3635      20120330        AgBase
+AgBase A9PL16  TUA7            PO:0004511      PMID:17761728   IEP             A       Alpha-tubulin   GhTUA7  protein taxon:3635      20120330        AgBase
+AgBase A9PL17  TUA8            PO:0004511      PMID:17761728   IEP             A       Alpha-tubulin   GhTUA8  protein taxon:3635      20120330        AgBase
+AgBase A9PL18  TUA9            PO:0004511      PMID:17761728   IEP             A       Alpha-tubulin   GhTUA9  protein taxon:3635      20120330        AgBase
+AgBase A9PL19  TUA10           PO:0004511      PMID:17761728   IEP             A       Alpha-tubulin   GhTUA10|Alpha-tubulin 10        protein taxon:3635      20120330        AgBase
+AgBase A9PL20  TUA11           PO:0004511      PMID:17761728   IEP             A       Alpha-tubulin   GhTUA11 protein taxon:3635      20120330        AgBase
+AgBase A9PL21  TUA12           PO:0009005      PMID:17761728   IEP             A       Alpha-tubulin   GhTUA12 protein taxon:3635      20120330        AgBase
+AgBase A9PL21  TUA12           PO:0020100      PMID:17761728   IEP             A       Alpha-tubulin   GhTUA12 protein taxon:3635      20120330        AgBase
+AgBase Q8RVP7  pod3            PO:0020030      PMID:14601671   IDA             A       Class III peroxidase            protein taxon:3635      20120419        AgBase
+AgBase Q9XGV6  pod4            PO:0020030      PMID:14601671   IDA             A       Bacterial-induced peroxidase            protein taxon:3635      20120419        AgBase
+AgBase Q8RVP6  pod1            PO:0020030      PMID:14601671   IDA             A       Gaiacol peroxidase              protein taxon:3635      20120419        AgBase
+AgBase Q8RVW0  pod2            PO:0020030      PMID:14601671   IDA             A       Bacterial-induced peroxidase            protein taxon:3635      20120419        AgBase
+AgBase Q8RVP5  pod5            PO:0020030      PMID:14601671   IDA             A       Class III peroxidase            protein taxon:3635      20120419        AgBase
+AgBase Q8RVP4  pod6            PO:0020030      PMID:14601671   IDA             A       Bacterial-induced class III peroxidase          protein taxon:3635      20120419        AgBase
+AgBase Q8RVP3  pod10           PO:0020030      PMID:14601671   IDA             A       Apoplastic anionic gaiacol peroxidase           protein taxon:3635      20120419        AgBase
+AgBase Q08671  pod8            PO:0020030      PMID:18157701   TAS             A       Peroxidase              protein taxon:3635      20120503        AgBase
+AgBase A8W7V9  Ghpod           PO:0025281      PMID:18157701   IEP             A       Class III peroxidase            protein taxon:3635      20120503        AgBase
+AgBase D2D2Z9  GhFAnnx         PO:0004511      PMID:19885739   IEP             A       Annexin         protein taxon:3635      20120504        AgBase
+AgBase O82090  O82090          PO:0004511      PMID:10069831   IEP             A       Annexin O82090_GOSHI|Fiber annexin      protein taxon:3635      20120504        AgBase
+AgBase G1JRK6  G1JRK6          PO:0004511      PMID:21757635   IEP             A       Sucrose synthase isoform C              protein taxon:3635      20120531        AgBase
+AgBase G1JRK6  G1JRK6          PO:0009047      PMID:21757635   IEP             A       Sucrose synthase isoform C              protein taxon:3635      20120531        AgBase
+AgBase D2D329  GhCSD1          PO:0020100      PMID:18425534   IEP             A       Superoxide dismutase [Cu-Zn]            protein taxon:3635      20120605        AgBase
+AgBase D2D329  GhCSD1          PO:0009005      PMID:18425534   IEP             A       Superoxide dismutase [Cu-Zn]            protein taxon:3635      20120605        AgBase
+AgBase D2D329  GhCSD1          PO:0004511      PMID:18425534   IEP             A       Superoxide dismutase [Cu-Zn]            protein taxon:3635      20120605        AgBase
+AgBase B2LYR7  CSD2a           PO:0004511      PMID:18425534   IEP             A       Superoxide dismutase [Cu-Zn]    GhCSD2a protein taxon:3635      20120605        AgBase
+AgBase B2LYR7  CSD2a           PO:0020100      PMID:18425534   IEP             A       Superoxide dismutase [Cu-Zn]    GhCSD2a protein taxon:3635      20120605        AgBase
+AgBase B2LYR7  CSD2a           PO:0009005      PMID:18425534   IEP             A       Superoxide dismutase [Cu-Zn]    GhCSD2a protein taxon:3635      20120605        AgBase
+AgBase B2LYR8  CSD2b           PO:0004511      PMID:18425534   IEP             A       Superoxide dismutase [Cu-Zn]    GhCSD2b protein taxon:3635      20120605        AgBase
+AgBase B2LYR8  CSD2b           PO:0020100      PMID:18425534   IEP             A       Superoxide dismutase [Cu-Zn]    GhCSD2b protein taxon:3635      20120605        AgBase
+AgBase B2LYR8  CSD2b           PO:0009005      PMID:18425534   IEP             A       Superoxide dismutase [Cu-Zn]    GhCSD2b protein taxon:3635      20120605        AgBase
+AgBase B2LYR9  CSD3            PO:0004511      PMID:18425534   IEP             A       Superoxide dismutase [Cu-Zn]    GhCSD3  protein taxon:3635      20120608        AgBase
+AgBase B2LYR9  CSD3            PO:0025034      PMID:18425534   IEP             A       Superoxide dismutase [Cu-Zn]    GhCSD3  protein taxon:3635      20120609        AgBase
+AgBase B2LYS0  CSD3s           PO:0004511      PMID:18425534   IEP             A       Superoxide dismutase [Cu-Zn]    GhCSD3s protein taxon:3635      20120608        AgBase
+AgBase B2LYS0  CSD3s           PO:0025034      PMID:18425534   IEP             A       Superoxide dismutase [Cu-Zn]    GhCSD3s protein taxon:3635      20120609        AgBase
+AgBase Q8RU83  Tub1            PO:0004511      PMID:18596112   IEP             A       Tubulin beta-1  Beta-tubulin|GHTUB1|TUB1        protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase Q8H6N0  BTub1           PO:0004511      PMID:18596112   IEP             A       Beta-tubulin1   GhTUB3  protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase Q8H6N0  BTub1           PO:0025034      PMID:18596112   IEP             A       Beta-tubulin1   GhTUB3  protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase B1PBV9  GhTUB4          PO:0004511      PMID:18596112   IEP             A       Beta-tubulin 4          protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase Q6VAF7  GhTUB5          PO:0004511      PMID:18596112   IEP             A       Tubulin beta-5 chain            protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase B1PBW0  GhTUB8          PO:0004511      PMID:18596112   IEP             A       Beta-tubulin 8          protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase Q6VAF8  GhTUB9          PO:0004511      PMID:18596112   IEP             A       Tubulin beta-3 chain            protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase B1PBW1  GhTUB10         PO:0004511      PMID:18596112   IEP             A       Beta-tubulin 10         protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase Q4TZT6  GhTUB12         PO:0004511      PMID:18596112   IEP             A       Tubulin Q4TZT6_GOSHI|Cultivar CIM707    protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase B1PBW6  GhTUB16         PO:0009005      PMID:18596112   IEP             A       Beta-tubulin 16         protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase B1PBW7  GhTUB17         PO:0009005      PMID:18596112   IEP             A       Beta-tubulin 17         protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase B1PBW7  GhTUB17         PO:0025034      PMID:18596112   IEP             A       Beta-tubulin 17         protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase Q93WZ2  Lox1            PO:0020030      PMID:12366796   IEP             A       Lipoxygenase    GhKLox1 protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase A3F7Q2  A3F7Q2          PO:0020003      PMID:18534861   IEP             A       Benzoquinone reductase          protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase A3F7Q3  A3F7Q3          PO:0020003      PMID:18534861   IEP             A       Benzoquinone reductase          protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase B1NHU0  B1NHU0          PO:0020100      PMID:18392624   IEP             A       Aquaporin PIP1-2                protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase B1NHU0  B1NHU0          PO:0004511      PMID:18392624   IEP             A       Aquaporin PIP1-2                protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase B1NHU1  B1NHU1          PO:0020100      PMID:18392624   IEP             A       Aquaporin PIP1-2                protein taxon:3635      20121010        AgBase
+AgBase B1NHU1  B1NHU1          PO:0004511      PMID:18392624   IEP             A       Aquaporin PIP1-2                protein taxon:3635      20121010        AgBase
Planteome associations