Hello!

To see the file structure, click on "tree".

Note that updates take place every 10 minutes, commits may not be seen immediately.
projects / associations / .git / commitdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | patch | inline | side by side (parent: 7d602cf)
Move to_diversity files out of main folder as they are not to be loaded at this point.
authorelserj <elserj@localhost>
Fri, 8 Jan 2016 02:07:47 +0000 (02:07 +0000)
committerelserj <elserj@localhost>
Fri, 8 Jan 2016 02:07:47 +0000 (02:07 +0000)
svn path=/; revision=694

to-associations/test_diversity/to_diversity_arabidopsis.assoc [new file with mode: 0644] patch | blob
to-associations/test_diversity/to_diversity_rice.assoc [new file with mode: 0644] patch | blob
to-associations/to_diversity_arabidopsis.assoc [deleted file] patch | blob | history
to-associations/to_diversity_rice.assoc [deleted file] patch | blob | history

diff --git a/to-associations/test_diversity/to_diversity_arabidopsis.assoc b/to-associations/test_diversity/to_diversity_arabidopsis.assoc
new file mode 100644 (file)
index 0000000..fc1ea43
--- /dev/null
+++ b/to-associations/test_diversity/to_diversity_arabidopsis.assoc
@@ -0,0 +1,108 @@
+!DB    DB_Object_ID    DB_Object_Symbol        Qualifier       GOid    DB:Reference    Evidence        With(or)From    Aspect  DB_Object_Name  DB_Object_Synonym       DB_Object_Type  Taxon   Date    Assigned_by
+GR_diversity_arabidopsis       1       LD              TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       LD              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       2       LDV             TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       LDV             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       3       SD              TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       SD              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       4       SDV             TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       SDV             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       5       FT10            TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       FT10            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       6       FT16            TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       FT16            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       7       FT22            TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       FT22            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       8       Seed Dormancy           TO:0000253      GR_REF:0        SM              T       Seed Dormancy           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       9       Emco5           TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       Emco5           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       10      Emwa1           TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       Emwa1           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       11      Emoy*           TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       Emoy*           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       12      Hiks1           TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       Hiks1           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       13      Noco2           TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       Noco2           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       14      Li7             TO:0006042      GR_REF:0        SM              T       Li7             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       15      B11             TO:0006043      GR_REF:0        SM              T       B11             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       16      Na23            TO:0000526      GR_REF:0        SM              T       Na23            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       17      Mg25            TO:0006044      GR_REF:0        SM              T       Mg25            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       18      P31             TO:0006045      GR_REF:0        SM              T       P31             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       19      S34             TO:0006046      GR_REF:0        SM              T       S34             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       20      K39             TO:0000513      GR_REF:0        SM              T       K39             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       21      Ca43            TO:0006047      GR_REF:0        SM              T       Ca43            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       22      Mn55            TO:0006049      GR_REF:0        SM              T       Mn55            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       23      Fe56            TO:0006049      GR_REF:0        SM              T       Fe56            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       24      Co59            TO:0006050      GR_REF:0        SM              T       Co59            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       25      Ni60            TO:0006051      GR_REF:0        SM              T       Ni60            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       26      Cu65            TO:0006052      GR_REF:0        SM              T       Cu65            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       27      Zn66            TO:0006053      GR_REF:0        SM              T       Zn66            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       28      As75            TO:0006054      GR_REF:0        SM              T       As75            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       29      Se82            TO:0006055      GR_REF:0        SM              T       Se82            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       30      Mo98            TO:0006056      GR_REF:0        SM              T       Mo98            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       31      Cd114           TO:0006059      GR_REF:0        SM              T       Cd114           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       32      avrPphB         TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       avrPphB         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       33      avrRpm1         TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       avrRpm1         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       34      avrRpt2         TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       avrRpt2         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       35      avrB            TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       avrB            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       36      0W              TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       0W              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       37      2W              TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       2W              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       38      4W              TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       4W              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       39      8W              TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       8W              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       40      FLC             TO:0002616      GR_REF:0        SM              T       FLC             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       41      FRI             TO:0002616      GR_REF:0        SM              T       FRI             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       42      8W GH FT                TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       8W GH FT                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       43      8W GH LN                TO:0000241      GR_REF:0        SM              T       8W GH LN                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       44      0W GH FT                TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       0W GH FT                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       45      0W GH LN                TO:0000241      GR_REF:0        SM              T       0W GH LN                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       46      FT Field                TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       FT Field                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       47      FT Diameter Field               TO:0000241      GR_REF:0        SM              T       FT Diameter Field               Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       48      FT GH           TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       FT GH           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       49      FT Duration GH          TO:0000366      GR_REF:0        SM              T       FT Duration GH          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       50      LC Duration GH          TO:0000366      GR_REF:0        SM              T       LC Duration GH          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       51      LFS GH          TO:0000366      GR_REF:0        SM              T       LFS GH          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       52      MT GH           TO:0000366      GR_REF:0        SM              T       MT GH           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       53      RP GH           TO:0000366      GR_REF:0        SM              T       RP GH           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       54      At1             TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       At1             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       55      At1 CFU2                TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       At1 CFU2                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       56      As              TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       As              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       57      As CFU2         TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       As CFU2         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       58      Bs              TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       Bs              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       59      Bs CFU2         TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       Bs CFU2         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       60      At2             TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       At2             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       61      At2 CFU2                TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       At2 CFU2                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       62      As2             TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       As2             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       63      As2 CFU2                TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       As2 CFU2                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       64      FW              TO:0000652      GR_REF:0        SM              T       FW              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       65      DW              TO:0000652      GR_REF:0        SM              T       DW              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       66      LES             TO:0000652      GR_REF:0        SM              T       LES             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       67      YEL             TO:0006060      GR_REF:0        SM              T       YEL             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       68      LY              TO:0000652      GR_REF:0        SM              T       LY              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       69      LN10            TO:0000241      GR_REF:0        SM              T       LN10            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       70      LN16            TO:0000241      GR_REF:0        SM              T       LN16            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       71      LN22            TO:0000241      GR_REF:0        SM              T       LN22            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       72      Silique 16              TO:0002626      GR_REF:0        SM              T       Silique 16              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       73      Silique 22              TO:0002626      GR_REF:0        SM              T       Silique 22              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       74      Germ 10         TO:0006061      GR_REF:0        SM              T       Germ 10         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       75      Germ 16         TO:0006061      GR_REF:0        SM              T       Germ 16         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       76      Germ 22         TO:0006061      GR_REF:0        SM              T       Germ 22         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       77      Width 10                TO:0006062      GR_REF:0        SM              T       Width 10                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       78      Width 16                TO:0006062      GR_REF:0        SM              T       Width 16                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       79      Width 22                TO:0006062      GR_REF:0        SM              T       Width 22                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       80      Chlorosis 10            TO:0006060      GR_REF:0        SM              T       Chlorosis 10            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       81      Chlorosis 16            TO:0006060      GR_REF:0        SM              T       Chlorosis 16            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       82      Chlorosis 22            TO:0006060      GR_REF:0        SM              T       Chlorosis 22            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       83      Anthocyanin 10          TO:0000071      GR_REF:0        SM              T       Anthocyanin 10          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       84      Anthocyanin 16          TO:0000071      GR_REF:0        SM              T       Anthocyanin 16          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       85      Anthocyanin 22          TO:0000071      GR_REF:0        SM              T       Anthocyanin 22          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       86      Leaf serr 10            TO:0006063      GR_REF:0        SM              T       Leaf serr 10            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       87      Leaf serr 16            TO:0006063      GR_REF:0        SM              T       Leaf serr 16            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       88      Leaf serr 22            TO:0006063      GR_REF:0        SM              T       Leaf serr 22            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       89      Leaf roll 10            TO:0006063      GR_REF:0        SM              T       Leaf roll 10            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       90      Leaf roll 16            TO:0006064      GR_REF:0        SM              T       Leaf roll 16            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       91      Leaf roll 22            TO:0006064      GR_REF:0        SM              T       Leaf roll 22            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       92      Rosette Erect 22                TO:0006064      GR_REF:0        SM              T       Rosette Erect 22                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       93      Hypocotyl length                TO:0006065      GR_REF:0        SM              T       Hypocotyl length                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       94      Trichome avg C          TO:0006066      GR_REF:0        SM              T       Trichome avg C          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       95      Trichome avg JA         TO:0006066      GR_REF:0        SM              T       Trichome avg JA         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       96      Aphid number            TO:0006067      GR_REF:0        SM              T       Aphid number            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       97      Bacterial titer         TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       Bacterial titer         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       98      Seedling Growth         TO:0000515      GR_REF:0        SM              T       Seedling Growth         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       99      Vern Growth             TO:0000515      GR_REF:0        SM              T       Vern Growth             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       100     After Vern Growth               TO:0000515      GR_REF:0        SM              T       After Vern Growth               Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       101     Secondary Dormancy              TO:0000202      GR_REF:0        SM              T       Secondary Dormancy              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       102     Germ in dark            TO:0006068      GR_REF:0        SM              T       Germ in dark            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       103     DSDS50          TO:0006069      GR_REF:0        SM              T       DSDS50          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       104     Seed bank 133-91                TO:0000253      GR_REF:0        SM              T       Seed bank 133-91                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       105     Storage 7 days          TO:0000253      GR_REF:0        SM              T       Storage 7 days          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       106     Storage 28 days         TO:0000253      GR_REF:0        SM              T       Storage 28 days         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
+GR_diversity_arabidopsis       107     Storage 56 days         TO:0000253      GR_REF:0        SM              T       Storage 56 days         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
diff --git a/to-associations/test_diversity/to_diversity_rice.assoc b/to-associations/test_diversity/to_diversity_rice.assoc
new file mode 100644 (file)
index 0000000..938cf56
--- /dev/null
+++ b/to-associations/test_diversity/to_diversity_rice.assoc
@@ -0,0 +1,78 @@
+!DB    DB_Object_ID    DB_Object_Symbol        Qualifier       GOid    DB:Reference    Evidence        With(or)From    Aspect  DB_Object_Name  DB_Object_Synonym       DB_Object_Type  Taxon   Date    Assigned_by
+GR_diversity_rice      1       Panicle number          TO:0000152      GR_REF:0        SM              T       Panicle number          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      2       Germination rate                TO:0000430      GR_REF:0        SM              T       Germination rate                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      3       Grains per panicle              TO:0000450      GR_REF:0        SM              T       Grains per panicle              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      4       100-grain weight                TO:0000269      GR_REF:0        SM              T       100-grain weight                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      5       Plant height            TO:0000207      GR_REF:0        SM              T       Plant height            Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      6       Awn length              TO:0000072      GR_REF:0        SM              T       Awn length              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      7       Spikelet number         TO:0000456      GR_REF:0        SM              T       Spikelet number         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      8       Grain yield per plant           TO:0000449      GR_REF:0        SM              T       Grain yield per plant           Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      9       Days to heading         TO:0000137      GR_REF:0        SM              T       Days to heading         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      10      Seed set percent                TO:0000455      GR_REF:0        SM              T       Seed set percent                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      11      Tiller angle            TO:0000567      GR_REF:0        SM              T       Tiller angle            Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      12      Grain shattering                TO:0000473      GR_REF:0        SM              T       Grain shattering                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      13      Panicle length          TO:0000040      GR_REF:0        SM              T       Panicle length          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      14      Grains per plant                TO:0000440      GR_REF:0        SM              T       Grains per plant                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      16      1000-grain weight               TO:0000382      GR_REF:0        SM              T       1000-grain weight               Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      18      Yield per plant         TO:0000449      GR_REF:0        SM              T       Yield per plant         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      20      Panicles per plant              TO:0000152      GR_REF:0        SM              T       Panicles per plant              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      21      Percent sterility               TO:0000180      GR_REF:0        SM              T       Percent sterility               Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      22      Number of penetrated roots              TO:0000083      GR_REF:0        SM              T       Number of penetrated roots              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      23      Number of tillers               TO:0000346      GR_REF:0        SM              T       Number of tillers               Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      24      Number of roots         TO:0000084      GR_REF:0        SM              T       Number of roots         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      25      Ratio of penetrated to total roots              TO:0000510      GR_REF:0        SM              T       Ratio of penetrated to total roots              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      26      Leaf lesion number              TO:0000074      GR_REF:0        SM              T       Leaf lesion number              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      27      Leaf lesion size                TO:0000074      GR_REF:0        SM              T       Leaf lesion size                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      28      Diseased leaf area              TO:0000074      GR_REF:0        SM              T       Diseased leaf area              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      29      days to flower          TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       days to flower          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      31      photoperiod sensitivity         TO:0000229      GR_REF:0        SM              T       photoperiod sensitivity         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      32      bacterial blight disease resistance             TO:0000175      GR_REF:0        SM              T       bacterial blight disease resistance             Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      33      seed length with hull           TO:0002761      GR_REF:0        SM              T       seed length with hull           Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      34      amylose content         TO:0000196      GR_REF:0        SM              T       amylose content         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      35      pericarp color          TO:0000707      GR_REF:0        SM              T       pericarp color          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      36      blast disease           TO:0000074      GR_REF:0        SM              T       blast disease           Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      37      grain length to width ratio             TO:0002731      GR_REF:0        SM              T       grain length to width ratio             Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      38      grain width             TO:0000402      GR_REF:0        SM              T       grain width             Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      39      grain length            TO:0000734      GR_REF:0        SM              T       grain length            Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      41      grain length            TO:0000734      GR_REF:0        SM              T       grain length            Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      42      days to flower          TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       days to flower          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      43      grain yield             TO:0000396      GR_REF:0        SM              T       grain yield             Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      44      days to heading         TO:0000137      GR_REF:0        SM              T       days to heading         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      45      days to heading         TO:0000137      GR_REF:0        SM              T       days to heading         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      46      grain shattering                TO:0000473      GR_REF:0        SM              T       grain shattering                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      56      flag leaf length                TO:0002757      GR_REF:0        SM              T       flag leaf length                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      57      grain surface area              TO:0002741      GR_REF:0        SM              T       grain surface area              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      58      leaf lamina pubescence          TO:0000055      GR_REF:0        SM              T       leaf lamina pubescence          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      59      blast disease           TO:0000074      GR_REF:0        SM              T       blast disease           Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      60      flowering time          TO:0002616      GR_REF:0        SM              T       flowering time          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      61      unfilled grain number           TO:0000028      GR_REF:0        SM              T       unfilled grain number           Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      62      brown rice ratio                TO:0000375      GR_REF:0        SM              T       brown rice ratio                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      63      straighthead            TO:0002735      GR_REF:0        SM              T       straighthead            Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      64      seed length             TO:0000146      GR_REF:0        SM              T       seed length             Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      65      spikelet fertility              TO:0000180      GR_REF:0        SM              T       spikelet fertility              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      66      seed number             TO:0000445      GR_REF:0        SM              T       seed number             Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      67      grain volume            TO:0002743      GR_REF:0        SM              T       grain volume            Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      68      surface area of grain with hull         TO:0002764      GR_REF:0        SM              T       surface area of grain with hull         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      69      volume of grain with hull               TO:0002765      GR_REF:0        SM              T       volume of grain with hull               Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      70      brown rice protein              TO:0000138      GR_REF:0        SM              T       brown rice protein              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      71      hull color              TO:0000706      GR_REF:0        SM              T       hull color              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      72      alkali digestion                TO:0000134      GR_REF:0        SM              T       alkali digestion                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      73      flag leaf lamina width          TO:0002758      GR_REF:0        SM              T       flag leaf lamina width          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      74      floret number per inflorescence         TO:0002738      GR_REF:0        SM              T       floret number per inflorescence         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      75      primary branch number           TO:0000547      GR_REF:0        SM              T       primary branch number           Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      76      culm angle              TO:0000427      GR_REF:0        SM              T       culm angle              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      77      seed length to width ratio              TO:0000411      GR_REF:0        SM              T       seed length to width ratio              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      78      awn presence            TO:0002734      GR_REF:0        SM              T       awn presence            Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      79      grain width             TO:0000402      GR_REF:0        SM              T       grain width             Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      80      brown rice length               TO:0000041      GR_REF:0        SM              T       brown rice length               Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      81      seed width              TO:0000149      GR_REF:0        SM              T       seed width              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      82      pericarp color          TO:0000707      GR_REF:0        SM              T       pericarp color          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      83      hull color              TO:0000706      GR_REF:0        SM              T       hull color              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      84      apiculus color          TO:0000140      GR_REF:0        SM              T       apiculus color          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      85      amylose content         TO:0000196      GR_REF:0        SM              T       amylose content         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      86      gelatinization temperature              TO:0000462      GR_REF:0        SM              T       gelatinization temperature              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      87      splikelet number                TO:0000456      GR_REF:0        SM              T       splikelet number                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      88      grain weight            TO:0000590      GR_REF:0        SM              T       grain weight            Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      89      drought tolerance               TO:0000276      GR_REF:0        SM              T       drought tolerance               Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      90      leaf angle              TO:0000206      GR_REF:0        SM              T       leaf angle              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
+GR_diversity_rice      91      tiller number           TO:0000346      GR_REF:0        SM              T       tiller number           Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
diff --git a/to-associations/to_diversity_arabidopsis.assoc b/to-associations/to_diversity_arabidopsis.assoc
deleted file mode 100644 (file)
index fc1ea43..0000000
--- a/to-associations/to_diversity_arabidopsis.assoc
+++ /dev/null
@@ -1,108 +0,0 @@
-!DB    DB_Object_ID    DB_Object_Symbol        Qualifier       GOid    DB:Reference    Evidence        With(or)From    Aspect  DB_Object_Name  DB_Object_Synonym       DB_Object_Type  Taxon   Date    Assigned_by
-GR_diversity_arabidopsis       1       LD              TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       LD              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       2       LDV             TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       LDV             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       3       SD              TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       SD              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       4       SDV             TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       SDV             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       5       FT10            TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       FT10            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       6       FT16            TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       FT16            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       7       FT22            TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       FT22            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       8       Seed Dormancy           TO:0000253      GR_REF:0        SM              T       Seed Dormancy           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       9       Emco5           TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       Emco5           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       10      Emwa1           TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       Emwa1           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       11      Emoy*           TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       Emoy*           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       12      Hiks1           TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       Hiks1           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       13      Noco2           TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       Noco2           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       14      Li7             TO:0006042      GR_REF:0        SM              T       Li7             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       15      B11             TO:0006043      GR_REF:0        SM              T       B11             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       16      Na23            TO:0000526      GR_REF:0        SM              T       Na23            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       17      Mg25            TO:0006044      GR_REF:0        SM              T       Mg25            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       18      P31             TO:0006045      GR_REF:0        SM              T       P31             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       19      S34             TO:0006046      GR_REF:0        SM              T       S34             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       20      K39             TO:0000513      GR_REF:0        SM              T       K39             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       21      Ca43            TO:0006047      GR_REF:0        SM              T       Ca43            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       22      Mn55            TO:0006049      GR_REF:0        SM              T       Mn55            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       23      Fe56            TO:0006049      GR_REF:0        SM              T       Fe56            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       24      Co59            TO:0006050      GR_REF:0        SM              T       Co59            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       25      Ni60            TO:0006051      GR_REF:0        SM              T       Ni60            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       26      Cu65            TO:0006052      GR_REF:0        SM              T       Cu65            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       27      Zn66            TO:0006053      GR_REF:0        SM              T       Zn66            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       28      As75            TO:0006054      GR_REF:0        SM              T       As75            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       29      Se82            TO:0006055      GR_REF:0        SM              T       Se82            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       30      Mo98            TO:0006056      GR_REF:0        SM              T       Mo98            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       31      Cd114           TO:0006059      GR_REF:0        SM              T       Cd114           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       32      avrPphB         TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       avrPphB         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       33      avrRpm1         TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       avrRpm1         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       34      avrRpt2         TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       avrRpt2         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       35      avrB            TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       avrB            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       36      0W              TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       0W              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       37      2W              TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       2W              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       38      4W              TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       4W              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       39      8W              TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       8W              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       40      FLC             TO:0002616      GR_REF:0        SM              T       FLC             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       41      FRI             TO:0002616      GR_REF:0        SM              T       FRI             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       42      8W GH FT                TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       8W GH FT                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       43      8W GH LN                TO:0000241      GR_REF:0        SM              T       8W GH LN                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       44      0W GH FT                TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       0W GH FT                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       45      0W GH LN                TO:0000241      GR_REF:0        SM              T       0W GH LN                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       46      FT Field                TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       FT Field                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       47      FT Diameter Field               TO:0000241      GR_REF:0        SM              T       FT Diameter Field               Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       48      FT GH           TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       FT GH           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       49      FT Duration GH          TO:0000366      GR_REF:0        SM              T       FT Duration GH          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       50      LC Duration GH          TO:0000366      GR_REF:0        SM              T       LC Duration GH          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       51      LFS GH          TO:0000366      GR_REF:0        SM              T       LFS GH          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       52      MT GH           TO:0000366      GR_REF:0        SM              T       MT GH           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       53      RP GH           TO:0000366      GR_REF:0        SM              T       RP GH           Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       54      At1             TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       At1             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       55      At1 CFU2                TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       At1 CFU2                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       56      As              TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       As              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       57      As CFU2         TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       As CFU2         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       58      Bs              TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       Bs              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       59      Bs CFU2         TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       Bs CFU2         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       60      At2             TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       At2             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       61      At2 CFU2                TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       At2 CFU2                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       62      As2             TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       As2             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       63      As2 CFU2                TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       As2 CFU2                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       64      FW              TO:0000652      GR_REF:0        SM              T       FW              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       65      DW              TO:0000652      GR_REF:0        SM              T       DW              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       66      LES             TO:0000652      GR_REF:0        SM              T       LES             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       67      YEL             TO:0006060      GR_REF:0        SM              T       YEL             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       68      LY              TO:0000652      GR_REF:0        SM              T       LY              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       69      LN10            TO:0000241      GR_REF:0        SM              T       LN10            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       70      LN16            TO:0000241      GR_REF:0        SM              T       LN16            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       71      LN22            TO:0000241      GR_REF:0        SM              T       LN22            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       72      Silique 16              TO:0002626      GR_REF:0        SM              T       Silique 16              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       73      Silique 22              TO:0002626      GR_REF:0        SM              T       Silique 22              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       74      Germ 10         TO:0006061      GR_REF:0        SM              T       Germ 10         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       75      Germ 16         TO:0006061      GR_REF:0        SM              T       Germ 16         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       76      Germ 22         TO:0006061      GR_REF:0        SM              T       Germ 22         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       77      Width 10                TO:0006062      GR_REF:0        SM              T       Width 10                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       78      Width 16                TO:0006062      GR_REF:0        SM              T       Width 16                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       79      Width 22                TO:0006062      GR_REF:0        SM              T       Width 22                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       80      Chlorosis 10            TO:0006060      GR_REF:0        SM              T       Chlorosis 10            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       81      Chlorosis 16            TO:0006060      GR_REF:0        SM              T       Chlorosis 16            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       82      Chlorosis 22            TO:0006060      GR_REF:0        SM              T       Chlorosis 22            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       83      Anthocyanin 10          TO:0000071      GR_REF:0        SM              T       Anthocyanin 10          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       84      Anthocyanin 16          TO:0000071      GR_REF:0        SM              T       Anthocyanin 16          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       85      Anthocyanin 22          TO:0000071      GR_REF:0        SM              T       Anthocyanin 22          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       86      Leaf serr 10            TO:0006063      GR_REF:0        SM              T       Leaf serr 10            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       87      Leaf serr 16            TO:0006063      GR_REF:0        SM              T       Leaf serr 16            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       88      Leaf serr 22            TO:0006063      GR_REF:0        SM              T       Leaf serr 22            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       89      Leaf roll 10            TO:0006063      GR_REF:0        SM              T       Leaf roll 10            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       90      Leaf roll 16            TO:0006064      GR_REF:0        SM              T       Leaf roll 16            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       91      Leaf roll 22            TO:0006064      GR_REF:0        SM              T       Leaf roll 22            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       92      Rosette Erect 22                TO:0006064      GR_REF:0        SM              T       Rosette Erect 22                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       93      Hypocotyl length                TO:0006065      GR_REF:0        SM              T       Hypocotyl length                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       94      Trichome avg C          TO:0006066      GR_REF:0        SM              T       Trichome avg C          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       95      Trichome avg JA         TO:0006066      GR_REF:0        SM              T       Trichome avg JA         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       96      Aphid number            TO:0006067      GR_REF:0        SM              T       Aphid number            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       97      Bacterial titer         TO:0000315      GR_REF:0        SM              T       Bacterial titer         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       98      Seedling Growth         TO:0000515      GR_REF:0        SM              T       Seedling Growth         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       99      Vern Growth             TO:0000515      GR_REF:0        SM              T       Vern Growth             Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       100     After Vern Growth               TO:0000515      GR_REF:0        SM              T       After Vern Growth               Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       101     Secondary Dormancy              TO:0000202      GR_REF:0        SM              T       Secondary Dormancy              Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       102     Germ in dark            TO:0006068      GR_REF:0        SM              T       Germ in dark            Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       103     DSDS50          TO:0006069      GR_REF:0        SM              T       DSDS50          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       104     Seed bank 133-91                TO:0000253      GR_REF:0        SM              T       Seed bank 133-91                Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       105     Storage 7 days          TO:0000253      GR_REF:0        SM              T       Storage 7 days          Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       106     Storage 28 days         TO:0000253      GR_REF:0        SM              T       Storage 28 days         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
-GR_diversity_arabidopsis       107     Storage 56 days         TO:0000253      GR_REF:0        SM              T       Storage 56 days         Arabidopsis Diversity Trait     taxon:3702      20121108        GR
diff --git a/to-associations/to_diversity_rice.assoc b/to-associations/to_diversity_rice.assoc
deleted file mode 100644 (file)
index 938cf56..0000000
--- a/to-associations/to_diversity_rice.assoc
+++ /dev/null
@@ -1,78 +0,0 @@
-!DB    DB_Object_ID    DB_Object_Symbol        Qualifier       GOid    DB:Reference    Evidence        With(or)From    Aspect  DB_Object_Name  DB_Object_Synonym       DB_Object_Type  Taxon   Date    Assigned_by
-GR_diversity_rice      1       Panicle number          TO:0000152      GR_REF:0        SM              T       Panicle number          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      2       Germination rate                TO:0000430      GR_REF:0        SM              T       Germination rate                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      3       Grains per panicle              TO:0000450      GR_REF:0        SM              T       Grains per panicle              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      4       100-grain weight                TO:0000269      GR_REF:0        SM              T       100-grain weight                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      5       Plant height            TO:0000207      GR_REF:0        SM              T       Plant height            Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      6       Awn length              TO:0000072      GR_REF:0        SM              T       Awn length              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      7       Spikelet number         TO:0000456      GR_REF:0        SM              T       Spikelet number         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      8       Grain yield per plant           TO:0000449      GR_REF:0        SM              T       Grain yield per plant           Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      9       Days to heading         TO:0000137      GR_REF:0        SM              T       Days to heading         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      10      Seed set percent                TO:0000455      GR_REF:0        SM              T       Seed set percent                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      11      Tiller angle            TO:0000567      GR_REF:0        SM              T       Tiller angle            Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      12      Grain shattering                TO:0000473      GR_REF:0        SM              T       Grain shattering                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      13      Panicle length          TO:0000040      GR_REF:0        SM              T       Panicle length          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      14      Grains per plant                TO:0000440      GR_REF:0        SM              T       Grains per plant                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      16      1000-grain weight               TO:0000382      GR_REF:0        SM              T       1000-grain weight               Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      18      Yield per plant         TO:0000449      GR_REF:0        SM              T       Yield per plant         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      20      Panicles per plant              TO:0000152      GR_REF:0        SM              T       Panicles per plant              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      21      Percent sterility               TO:0000180      GR_REF:0        SM              T       Percent sterility               Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      22      Number of penetrated roots              TO:0000083      GR_REF:0        SM              T       Number of penetrated roots              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      23      Number of tillers               TO:0000346      GR_REF:0        SM              T       Number of tillers               Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      24      Number of roots         TO:0000084      GR_REF:0        SM              T       Number of roots         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      25      Ratio of penetrated to total roots              TO:0000510      GR_REF:0        SM              T       Ratio of penetrated to total roots              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      26      Leaf lesion number              TO:0000074      GR_REF:0        SM              T       Leaf lesion number              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      27      Leaf lesion size                TO:0000074      GR_REF:0        SM              T       Leaf lesion size                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      28      Diseased leaf area              TO:0000074      GR_REF:0        SM              T       Diseased leaf area              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      29      days to flower          TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       days to flower          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      31      photoperiod sensitivity         TO:0000229      GR_REF:0        SM              T       photoperiod sensitivity         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      32      bacterial blight disease resistance             TO:0000175      GR_REF:0        SM              T       bacterial blight disease resistance             Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      33      seed length with hull           TO:0002761      GR_REF:0        SM              T       seed length with hull           Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      34      amylose content         TO:0000196      GR_REF:0        SM              T       amylose content         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      35      pericarp color          TO:0000707      GR_REF:0        SM              T       pericarp color          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      36      blast disease           TO:0000074      GR_REF:0        SM              T       blast disease           Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      37      grain length to width ratio             TO:0002731      GR_REF:0        SM              T       grain length to width ratio             Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      38      grain width             TO:0000402      GR_REF:0        SM              T       grain width             Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      39      grain length            TO:0000734      GR_REF:0        SM              T       grain length            Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      41      grain length            TO:0000734      GR_REF:0        SM              T       grain length            Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      42      days to flower          TO:0000344      GR_REF:0        SM              T       days to flower          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      43      grain yield             TO:0000396      GR_REF:0        SM              T       grain yield             Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      44      days to heading         TO:0000137      GR_REF:0        SM              T       days to heading         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      45      days to heading         TO:0000137      GR_REF:0        SM              T       days to heading         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      46      grain shattering                TO:0000473      GR_REF:0        SM              T       grain shattering                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      56      flag leaf length                TO:0002757      GR_REF:0        SM              T       flag leaf length                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      57      grain surface area              TO:0002741      GR_REF:0        SM              T       grain surface area              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      58      leaf lamina pubescence          TO:0000055      GR_REF:0        SM              T       leaf lamina pubescence          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      59      blast disease           TO:0000074      GR_REF:0        SM              T       blast disease           Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      60      flowering time          TO:0002616      GR_REF:0        SM              T       flowering time          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      61      unfilled grain number           TO:0000028      GR_REF:0        SM              T       unfilled grain number           Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      62      brown rice ratio                TO:0000375      GR_REF:0        SM              T       brown rice ratio                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      63      straighthead            TO:0002735      GR_REF:0        SM              T       straighthead            Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      64      seed length             TO:0000146      GR_REF:0        SM              T       seed length             Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      65      spikelet fertility              TO:0000180      GR_REF:0        SM              T       spikelet fertility              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      66      seed number             TO:0000445      GR_REF:0        SM              T       seed number             Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      67      grain volume            TO:0002743      GR_REF:0        SM              T       grain volume            Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      68      surface area of grain with hull         TO:0002764      GR_REF:0        SM              T       surface area of grain with hull         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      69      volume of grain with hull               TO:0002765      GR_REF:0        SM              T       volume of grain with hull               Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      70      brown rice protein              TO:0000138      GR_REF:0        SM              T       brown rice protein              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      71      hull color              TO:0000706      GR_REF:0        SM              T       hull color              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      72      alkali digestion                TO:0000134      GR_REF:0        SM              T       alkali digestion                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      73      flag leaf lamina width          TO:0002758      GR_REF:0        SM              T       flag leaf lamina width          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      74      floret number per inflorescence         TO:0002738      GR_REF:0        SM              T       floret number per inflorescence         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      75      primary branch number           TO:0000547      GR_REF:0        SM              T       primary branch number           Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      76      culm angle              TO:0000427      GR_REF:0        SM              T       culm angle              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      77      seed length to width ratio              TO:0000411      GR_REF:0        SM              T       seed length to width ratio              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      78      awn presence            TO:0002734      GR_REF:0        SM              T       awn presence            Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      79      grain width             TO:0000402      GR_REF:0        SM              T       grain width             Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      80      brown rice length               TO:0000041      GR_REF:0        SM              T       brown rice length               Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      81      seed width              TO:0000149      GR_REF:0        SM              T       seed width              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      82      pericarp color          TO:0000707      GR_REF:0        SM              T       pericarp color          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      83      hull color              TO:0000706      GR_REF:0        SM              T       hull color              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      84      apiculus color          TO:0000140      GR_REF:0        SM              T       apiculus color          Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      85      amylose content         TO:0000196      GR_REF:0        SM              T       amylose content         Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      86      gelatinization temperature              TO:0000462      GR_REF:0        SM              T       gelatinization temperature              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      87      splikelet number                TO:0000456      GR_REF:0        SM              T       splikelet number                Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      88      grain weight            TO:0000590      GR_REF:0        SM              T       grain weight            Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      89      drought tolerance               TO:0000276      GR_REF:0        SM              T       drought tolerance               Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      90      leaf angle              TO:0000206      GR_REF:0        SM              T       leaf angle              Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
-GR_diversity_rice      91      tiller number           TO:0000346      GR_REF:0        SM              T       tiller number           Rice Diversity Trait    taxon:4530      20121108        GR
Planteome associations