Cleaning up spurious annotations

Fixed a few more references

Updating references

Updating references

Moving duplicated QTL files to a subfolder

Adding new Oat QTL annotations from GrainGenes

Fixed taxon ID

Adding new files and fixing synonyms

Fixing synonyms

Fixed DB ID for QTL

Fixing blank references

Changed evidence code from IMP to IC

Fixing publication xrefs

Replaced Gramene ref GR_REF:11453 with GR_REF:11089

Moved annotations on Unknown exp to field study

Changed evidence code from IMP to IC

Replaced incorrect GR_REF:5870 with GR_REF:11453

Removed annotation to unknown exposure PECO:0007403

Fix one more obsolete and fix aspect for it

Fix incorrect aspects

Missed subfolders with last obsolete replace

Replace obsoletes with replacement or parent terms

Merge branch 'main' of https://gitlab.cqls.oregonstate.edu/jaiswal-lab/associations

Added header to make it easier to read

Add missing DB obj symbol (column 3) for a couple

Remove extra spaces from publications columns

Remove blank line

Had DOS formatting, ran dos2unix to clean up

Reassigning annotations

Moved annotations to TO:0000439 fungal disease response

Moving annotations to TO:0000604

Fixing references

Updating mappings

Moving annotations to new TO terms

Moving files

Moving duplicate QTL files to new folder so they won't be loaded

Moving annotations

Moving annotations

Fixed Xrefs

Fixing xref

Moving annotations, cleaning up synonyms

Moving annotations, cleaning up synonyms

reassigning annotations to study conditions

Update obsolete GO annotations

Fixing evidence codes

Update po_miRNA_Oryza_miRBase.assoc

Cleaning up annotation extensions

cleaning up names

Cleaning up synonym field

Updating mappings

Reassigning annotations to better fit the definitions

Move 4 annotations to parent term

Fixed 2 annotations

Moved annotations to TO:0000170 elongation under submergence

Update to_qtl_glycine_SoyBase.assoc

Moved 31 annotations from  TO:0000114 flooding related trait to TO:0000524 submergence tolerance

Moved 2 annotations to TO:0000286

Moved 2 annotations to grain tenderness

Update to_qtl_Setaria_italica_Gramene.assoc

Moved annotations from  cauline axillary branch number to stem branch number

Renamed axillary branch number

Moved annotation to TO:0000031  silicon response

Moved annotations to TO:0000437 plant male sterility

Fixing synonyms

Fixed conflicted changes

Fixed line length

Fixed line length

Noved i annotation to TO:0000580

Fixed annotations

Removed duplicated lines

Moved annotations from pollen sterility (TO:0000053) to TO:0000437 male sterility

Moved annotations, fixed duplicated synonyms and refs

Moved two annotations to TO:0000036

Adding curator xref

Removed a few more duplicated synonyms

Removed duplicated synonyms

Moved annotations from TO:0000042 to parent term TO:0000035 incompatibility trait

Moved annotations from TO:0000036 and TO:0000046 to  parent term TO:0000035  hybrid incompatibility

Fixed typo

Moved 1 annotation to grain quality  TO:0000162

Removed annotation to incorrect term

Filled in ref column

Added missing line return

Adding new file for Triticeae QTLs

Fixing filename

Fixed database name

Adding new file of oat QTLs from GrainGenes

Moved 3 QTLs to TO:0000631

Removed 4 duplicated lines

Adding more barley QTLs, fixing annotations

Added line return at the end

Adding more annotations

Fixed typo

Adding test file of GrainGenes QTLs

Change all obsoleted GO terms with known replacements

Updated annotations to insect responses

Replaced 1 TO term, removed by mistake

Updated annotations to insect traits

Remove extra tab

Removed redundant annotation to parent term

Removed 10 annotated QTL as we have no evidence to support them

Moved IRRI germplasm files to a new folder